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一种中间代谢途径代谢通量的定量分析方法
被引量：
2
1
作者
张慧敏
朱江峰
+1 位作者
清水和幸
姚善泾
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期301-307,共7页
以13 C标记的碳源 ,用二维核磁共振技术 (1H 13 C ,HMQC)测定代谢中产生的氨基酸标记模式 ,研究对中间代谢途径胞内代谢通量进行定量分析的方法 .通过开发软件包 ,改进同位素分布的数学模型 ,提出了反应映射矩阵 (RMM )等概念 .由简化算...
以13 C标记的碳源 ,用二维核磁共振技术 (1H 13 C ,HMQC)测定代谢中产生的氨基酸标记模式 ,研究对中间代谢途径胞内代谢通量进行定量分析的方法 .通过开发软件包 ,改进同位素分布的数学模型 ,提出了反应映射矩阵 (RMM )等概念 .由简化算法 ,提高程序的执行效率 ,建立了定量分析胞内代谢通量的平台 .代谢模型涉及了糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、几种回补反应。
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关键词
中间代谢途径
代谢通量
定量分析
同位素分布模型
二维核磁共振技术
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职称材料
不同碳源及通气条件下lpdA基因敲除对大肠杆菌代谢的影响
被引量：
2
2
作者
李迈
姚善泾
清水和幸
《化工学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期880-885,共6页
lpdA基因编码的lipoamidedehydrogenase是丙酮酸脱氢酶复合体、α酮戊二酸脱氢酶复合体和甘氨酸裂解多酶体系的组成亚基之一.比较了不同碳源及通气条件下,lpdA基因敲除突变E.coli与野生E.coli的发酵特性,并通过对一些主要的酶活和胞内...
lpdA基因编码的lipoamidedehydrogenase是丙酮酸脱氢酶复合体、α酮戊二酸脱氢酶复合体和甘氨酸裂解多酶体系的组成亚基之一.比较了不同碳源及通气条件下,lpdA基因敲除突变E.coli与野生E.coli的发酵特性,并通过对一些主要的酶活和胞内代谢产物浓度的测量,考察了lpdA基因敲除对E.coli代谢的影响.结果表明:葡萄糖为碳源的有氧条件下,lpdA基因的敲除导致丙酮酸、D乳酸、L谷氨酸的积累,TCA循环的抑制,乙醛酸途径和磷酸戊糖途径中的磷酸葡萄糖脱氢酶的激活.乙酸或丙酮酸为碳源的有氧发酵及葡萄糖为碳源的微氧发酵实验补充了以上的结论.
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关键词
LPDA
大肠杆菌
丙酮酸
D-乳酸
L-谷氨酸
酶活
胞内代谢产物
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职称材料
题名
一种中间代谢途径代谢通量的定量分析方法
被引量：
2
1
作者
张慧敏
朱江峰
清水和幸
姚善泾
机构
浙江
大学
化
学
工
程与
生物
工
程
学
系
九州工业大学生物系统工学系
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003年第2期301-307,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目 (2 0 2 760 65 )~~
文摘
以13 C标记的碳源 ,用二维核磁共振技术 (1H 13 C ,HMQC)测定代谢中产生的氨基酸标记模式 ,研究对中间代谢途径胞内代谢通量进行定量分析的方法 .通过开发软件包 ,改进同位素分布的数学模型 ,提出了反应映射矩阵 (RMM )等概念 .由简化算法 ,提高程序的执行效率 ,建立了定量分析胞内代谢通量的平台 .代谢模型涉及了糖酵解途径、磷酸戊糖途径、三羧酸循环、几种回补反应。
关键词
中间代谢途径
代谢通量
定量分析
同位素分布模型
二维核磁共振技术
Keywords
metablism flux
two-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopy
central metabolism route
isomer distribution model
分类号
Q503 [生物学—生物化学]
Q591 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
不同碳源及通气条件下lpdA基因敲除对大肠杆菌代谢的影响
被引量：
2
2
作者
李迈
姚善泾
清水和幸
机构
浙江
大学
化
学
工
程与
生物
工
程
学
系
九州工业大学生物系统工学系
出处
《化工学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期880-885,共6页
基金
国家自然科学基金项目(20176050).~~
文摘
lpdA基因编码的lipoamidedehydrogenase是丙酮酸脱氢酶复合体、α酮戊二酸脱氢酶复合体和甘氨酸裂解多酶体系的组成亚基之一.比较了不同碳源及通气条件下,lpdA基因敲除突变E.coli与野生E.coli的发酵特性,并通过对一些主要的酶活和胞内代谢产物浓度的测量,考察了lpdA基因敲除对E.coli代谢的影响.结果表明:葡萄糖为碳源的有氧条件下,lpdA基因的敲除导致丙酮酸、D乳酸、L谷氨酸的积累,TCA循环的抑制,乙醛酸途径和磷酸戊糖途径中的磷酸葡萄糖脱氢酶的激活.乙酸或丙酮酸为碳源的有氧发酵及葡萄糖为碳源的微氧发酵实验补充了以上的结论.
关键词
LPDA
大肠杆菌
丙酮酸
D-乳酸
L-谷氨酸
酶活
胞内代谢产物
Keywords
lpdA
E. coli
pyruvate
D-lactate
L-glutamate
enzyme activity
intracellular metabolite concentration
分类号
Q525 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
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1
一种中间代谢途径代谢通量的定量分析方法
张慧敏
朱江峰
清水和幸
姚善泾
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2003
2
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职称材料
2
不同碳源及通气条件下lpdA基因敲除对大肠杆菌代谢的影响
李迈
姚善泾
清水和幸
《化工学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006
2
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职称材料
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