单细胞测序技术及其在传染病研究领域中的应用 被引量：5

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作者 马素芳 严景华 《生物产业技术》 2018年第2期85-90,共6页

单细胞测序技术是在单个细胞水平上对基因组或者转录组进行测序,从而分析相同表型细胞的遗传异质性,或获得难以培养微生物的遗传信息。单细胞测序技术的应用已经深刻地改变了我们对一系列生物学现象的理解,包括基因转录、胚胎发育、癌... 单细胞测序技术是在单个细胞水平上对基因组或者转录组进行测序,从而分析相同表型细胞的遗传异质性,或获得难以培养微生物的遗传信息。单细胞测序技术的应用已经深刻地改变了我们对一系列生物学现象的理解,包括基因转录、胚胎发育、癌变。对单细胞测序技术的方法和应用进行了概述,并对其在传染病研究中的应用进行了详细介绍。 展开更多

关键词 单细胞测序 传染病 基因组 转录组 异质性

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热休克蛋白gp96在恶性肿瘤中的研究进展 被引量：2

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作者 钱丽媛 李长菲 +1 位作者 罗云敬 孟颂东 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第9期993-1005,共13页

热休克蛋白90B1又称为糖蛋白96(gp96).gp96属于热休克蛋白90家族,是一种高度保守且普遍存在的糖蛋白.作为一种内质网蛋白,gp96在维持内质网稳态、内质网应激、钙稳态等方面起着重要的调控作用,这些调控网络在肿瘤的发生发展过程中起着... 热休克蛋白90B1又称为糖蛋白96(gp96).gp96属于热休克蛋白90家族,是一种高度保守且普遍存在的糖蛋白.作为一种内质网蛋白,gp96在维持内质网稳态、内质网应激、钙稳态等方面起着重要的调控作用,这些调控网络在肿瘤的发生发展过程中起着重要的作用.gp96作为分子伴侣在稳定和激活客户蛋白等方面有众多报道,其中包括HER2、整合素和Toll样受体等多个客户蛋白.大量研究表明,gp96在肝癌、乳腺癌、胃癌等不同类型的肿瘤中高表达,并在肿瘤的生长、侵袭和转移等方面起着重要的作用.本文从gp96的基本结构和功能及其在肿瘤发生发展中的作用等方面进行综述,并着重阐述细胞膜gp96相关的研究进展.最后,重点介绍基于胞膜gp96结构所设计的选择性小分子抑制剂、抗体和多肽等药物在肿瘤靶向治疗中的潜在应用. 展开更多

关键词 热休克蛋白GP96 分子伴侣 胞膜gp96 肿瘤 靶向治疗

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天山北麓典型水库病毒多样性及其中潜在病原体的分析 被引量：3

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作者 张政 常娜娜 +4 位作者 杜菲 地丽胡玛·阿吉 张成 马正海 毕玉海 《环境科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2264-2272,共9页

为了解天山北麓中段水库中病毒多样性及其功能和潜在危害,选取三屯碑水库(STW)、八一水库(BYW)和蘑菇湖水库(MGW)为典型水库进行病毒宏基因组学分析.水库水样经FeCl 3絮凝和聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)富集获得浓缩病毒颗粒,利... 为了解天山北麓中段水库中病毒多样性及其功能和潜在危害,选取三屯碑水库(STW)、八一水库(BYW)和蘑菇湖水库(MGW)为典型水库进行病毒宏基因组学分析.水库水样经FeCl 3絮凝和聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)富集获得浓缩病毒颗粒,利用病毒宏基因组学方法分析病毒多样性及其功能,挖掘并分析病原体的基因序列.结果表明:①天山北麓中段典型水库STW、BYW和MGW中分别获得病毒序列36784178、32434254和30537928条,形成重叠群15400、11894和30771个.②水库病毒分属9科、26种,在科分类阶元上优势病毒均属于有尾噬菌体目(Caudovirales),BYW和MGW中肌尾噬菌体科(Myoviridae)的相对丰度最高,STW中长尾噬菌体科(Siphoviridae)的相对丰度最高;在种分类阶元上,STW、BYW和MGW中相对丰度最高的病毒分别为链霉菌噬菌体(Streptomyces phages)、微囊藻噬菌体(Microcystis phages)和欧文氏菌噬菌体(Erwinia phages).③病毒功能基因分析表明,噬菌体主要衣壳蛋白和尾蛋白等结构蛋白以及病毒复制和装配相关蛋白编码基因的相对丰度较高.④水库中存在多种植物和动物的致病性病毒,其中MGW中肠病毒相对丰度较高,并从中获得了人类手足口病的病原体——柯萨奇病毒A10(Coxsackievirus A10,CV-A10)的VP1基因序列,其与原始株Kowalik序列一致.研究显示:天山北麓中段水库优势病毒均为噬菌体,病毒复制活跃;不同水库的病毒群落组成存在差异,其与周边环境和人类活动等因素相关;水库中检测出CV-A10等致病性病毒,存在潜在公共卫生风险. 展开更多

关键词 天山北麓 水库 病毒宏基因组学 病毒多样性 柯萨奇病毒A10

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中性粒细胞胞外诱捕网与病原体的相互作用及其机制 被引量：3

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作者 许李锋 张宝戈 +3 位作者 洪锦旋 王绪辉 陈吉龙 李训良 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2021年第4期1388-1395,共8页

中性粒细胞作为机体天然免疫系统的重要组成部分,发挥至关重要的防御病原体感染的作用。中性粒细胞发挥防御作用的机制之一是通过释放中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs)捕获并消灭病原体。然而有些病原体已进... 中性粒细胞作为机体天然免疫系统的重要组成部分,发挥至关重要的防御病原体感染的作用。中性粒细胞发挥防御作用的机制之一是通过释放中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs)捕获并消灭病原体。然而有些病原体已进化出逃避NETs的机制,从而对机体造成持续损伤。此外,NETs的异常状态也会对机体造成一些损伤。近年来,NETs已成为中性粒细胞功能研究的热点,受到了国内外学者的广泛关注。有学者在禽的异嗜性粒细胞中也发现了类似NETs功能的网状结构,并将其命名为异嗜性粒细胞胞外诱捕网(heterophil extracellular traps,HETs)。作者主要对NETs抵御病原体入侵和病原体逃避NETs的机制并引起宿主致病等过程进行综述。 展开更多

关键词 中性粒细胞胞外诱捕网(NETs) 病原体 免疫逃避 免疫损伤

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一株鸭源H11N3亚型禽流感病毒的遗传进化分析及对小鼠的致病性研究 被引量：2

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作者 王辰川 李菁 +7 位作者 文法鑫 陈福再 王露露 张春萍 黄佳承 杨洲 陈吉龙 马树杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期115-121,共7页

为了解H11N3亚型禽流感病毒(AIV)的生物学特性,本研究对2020年在福州市某活禽市场鸭中分离的一株H11N3亚型AIV进行了全基因组测序、遗传进化分析和对BALB/c小鼠的致病性试验。测序结果显示,分离株HA裂解位点为PAIASR↓GLF,符合低致病性... 为了解H11N3亚型禽流感病毒(AIV)的生物学特性,本研究对2020年在福州市某活禽市场鸭中分离的一株H11N3亚型AIV进行了全基因组测序、遗传进化分析和对BALB/c小鼠的致病性试验。测序结果显示,分离株HA裂解位点为PAIASR↓GLF,符合低致病性AIV分子特征;HA蛋白226L和228S突变显示病毒具有结合人源受体(SAα-2,6 Gal)的特征性氨基酸。PB1、PA、NP和M1蛋白均出现对哺乳动物致病性增强的特征性氨基酸。遗传进化分析显示,H11N3 AIV的8个基因节段均属于欧亚分支,其HA基因与A/duck/Fujian/SD061/2017(H11N3)株HA基因序列相似性最高,而NA基因与A/EN/Fujian/02754/2016(H3N3)株NA基因序列相似性最高。该病毒内部基因分别与浙江、福建和云南等地鸭和鸡体内分离的H7N9、H7N7、H1N2、H7N2、H7N7和H9N6等亚型AIV相关基因高度同源。小鼠致病性试验结果显示,该病毒未经适应即可在小鼠鼻甲和肺脏中高效复制,表明该病毒株具备感染哺乳动物的能力。上述结果表明该病毒株为新型重组病毒,对小鼠具有一定致病性,本研究为了解H11N3亚型AIV的生物学特性及其感染的防控提供了参考。 展开更多

关键词 禽流感病毒 H11N3亚型 遗传进化 小鼠致病性

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我国发现的一种引起鸭产蛋下降综合征的新型黄病毒 被引量：38

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作者 胡旭东 路浩 +8 位作者 刘培培 遇秀玲 李爽 王勇月 莫毅诚 张国中 田克恭 高福 苏敬良 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2011年第7期43-47,I0001,共6页

从2010年4月起，中国东南部分省份的部分鸭场发生一种以产蛋严重下降为主要特征的传染病，并迅速蔓延至我国各主要养鸭省市，包括浙江、福建、广东、广西、江西、江苏、山东、河南、河北和北京等。疾病影响包括北京鸭和麻鸭在内的多种... 从2010年4月起，中国东南部分省份的部分鸭场发生一种以产蛋严重下降为主要特征的传染病，并迅速蔓延至我国各主要养鸭省市，包括浙江、福建、广东、广西、江西、江苏、山东、河南、河北和北京等。疾病影响包括北京鸭和麻鸭在内的多种产蛋鸭，感染鸭最突出的临床症状就是采食量下降伴随产蛋率的骤降，产蛋率在5d内可降至10％， 展开更多

关键词 产蛋下降综合征 鸭场 病毒 中国东南部 临床症状 北京鸭 产蛋率 传染病

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脊椎动物Cyclophilin A肽基脯氨酰顺反异构酶活性及遗传变异分析 被引量：3

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作者 任丽倩 刘薇 +2 位作者 李文博 刘文军 孙蕾 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期736-745,共10页

Cyclophilin A(简称CypA)由PPIA(Peptidylprolyl isomerase A)基因编码,是典型的Cyclophilin家族蛋白,具有肽基脯氨酰顺反异构酶活性,在蛋白质的折叠和转运、信号转导、炎症、免疫调节、细胞凋亡及病毒复制等生物学过程中发挥着重要作... Cyclophilin A(简称CypA)由PPIA(Peptidylprolyl isomerase A)基因编码,是典型的Cyclophilin家族蛋白,具有肽基脯氨酰顺反异构酶活性,在蛋白质的折叠和转运、信号转导、炎症、免疫调节、细胞凋亡及病毒复制等生物学过程中发挥着重要作用。本研究重点探讨了不同脊椎动物CypA的肽基脯氨酰顺反异构酶活性及其遗传变异。根据Gen Bank数据库PPIA基因的序列信息,克隆了脊椎动物的PPIA基因并构建其原核表达载体,其中鼠耳蝠(Myotis davidi)和绿头鸭(Anas platyrhynchos)的PPIA基因序列为首次报道。利用大肠杆菌表达GST-Cyp A融合蛋白并进行亲和层析,切除GST标签后再进行分子筛层析,获得纯化的CypA蛋白。利用胰糜蛋白酶偶联法测定CypA的肽基脯氨酰顺反异构酶活性,发现12种脊椎动物CypA的肽基脯氨酰顺反异构酶活性无显著差异。同时,通过一系列遗传变异和分子进化分析,发现12种脊椎动物CypA的酶活位点、CsA结合位点等重要功能域的氨基酸序列完全一致,而且其结构和在染色体中的基因定位也非常保守。研究结果表明,脊椎动物CypA的关键功能域高度保守,这是CypA维持其酶活及生物学功能的有力保障。 展开更多

关键词 脊椎动物 CYCLOPHILIN A 肽基脯氨酰顺反异构酶 分子进化

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长链非编码RNANRAV在抗病毒应答中对干扰素刺激基因(ISG)转录的调控作用 被引量：1

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作者 欧阳晶 朱晓梅 +9 位作者 陈玉海 魏海涛 陈庆煌 池晓娟 祁保民 张连峰 赵屹 高福 汪国顺 陈吉龙 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期219-219,共1页

天然免疫是宿主抵抗病毒的第一道防线。病毒侵染宿主后，宿主的病原识别受体（PRR）鉴别出病毒的核酸或蛋门质组分，激活抗病毒天然免疫应答。一系列天然免疫信号通路被PRR激活，通路下游的转录因子随之活化并进入细胞核，核内各种免疫... 天然免疫是宿主抵抗病毒的第一道防线。病毒侵染宿主后，宿主的病原识别受体（PRR）鉴别出病毒的核酸或蛋门质组分，激活抗病毒天然免疫应答。一系列天然免疫信号通路被PRR激活，通路下游的转录因子随之活化并进入细胞核，核内各种免疫相关基因依次开始转录调控。首先，干扰素大量表达并被分泌至细胞外，随后上百种干扰素刺激基因（ISG）转录表达。 展开更多

关键词 免疫相关基因 免疫应答 转录因子 抗病毒 干扰素 调控作用 非编码 长链

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调控元件与底盘适配性的研发 被引量：2

9

作者 贾晓鹏 高弘 +1 位作者 卓英 张立新 《生物产业技术》 2013年第4期24-29,共6页

合成生物学是21世纪新兴的交叉学科，仅仅十年的发展就取得举世瞩目的成就。然而由于外源元件与底盘适配性研究不够深入，细胞工厂消耗了更多的资源，增加了排放和环境污染，生产效率远远不能满足设计需求。适配性研究的滞后影响了合成... 合成生物学是21世纪新兴的交叉学科，仅仅十年的发展就取得举世瞩目的成就。然而由于外源元件与底盘适配性研究不够深入，细胞工厂消耗了更多的资源，增加了排放和环境污染，生产效率远远不能满足设计需求。适配性研究的滞后影响了合成生物学的深入发展和产业化应用，本文试图从调控元件与底盘适配性的环节探讨突破的可能。 展开更多

关键词 调控元件 适配性 底盘 合成生物学 研发 交叉学科 环境污染 生产效率

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反义RNA寡核苷酸及其与脂质体的复合物对于乙型肝炎病毒的抑制（英文）

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作者 昝琰璐 田波 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第4期362-370,共9页

我们设计合成了特异性靶向乙型肝炎病毒(HBV)mRNA的反义RNA寡核苷酸P-2987、X-60和X-519.在瞬时转染pHBV1.3质粒(含有1.3拷贝的HBV基因组)的HepG2细胞和整合了HBV基因组的HepG2.2.15细胞中,转染2μmol/L的反义RNA寡核苷酸,ELISA和实时定... 我们设计合成了特异性靶向乙型肝炎病毒(HBV)mRNA的反义RNA寡核苷酸P-2987、X-60和X-519.在瞬时转染pHBV1.3质粒(含有1.3拷贝的HBV基因组)的HepG2细胞和整合了HBV基因组的HepG2.2.15细胞中,转染2μmol/L的反义RNA寡核苷酸,ELISA和实时定量PCR结果表明,这3条寡核苷酸可以明显抑制HBV的复制和抗原表达.在HBV转基因鼠中,尾静脉注射反义RNA寡核苷酸,结果表明,肝脏中HBV的复制得到了抑制,但是血清中抗原含量和HBV DNA拷贝数没有明显变化.反义RNA寡核苷酸X-519与脂质体的复合物可以增强其对于HBV在肝脏中复制的抑制作用.在通过高压尾静脉注射pHBV1.3质粒建立的HBV急性感染模型中,反义RNA寡核苷酸X-519可以显著地抑制HBV在肝脏中的复制以及降低血清中病毒抗原水平和DNA拷贝数.上述实验结果说明,X-519及其与脂质体的复合物对于HBV的复制和抗原表达起到明显的抑制作用,可能作为一种潜在的针对HBV的基因治疗药物. 展开更多

关键词 乙型肝炎病毒 反义RNA寡核苷酸 HBV转基因鼠 高压尾静脉注射 反义RNA寡核苷酸与脂质体复合物

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基于结构的抗流感病毒神经氨酸酶抑制剂的设计和研发 被引量：1

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作者 李青 冯恩光 +1 位作者 柳红 高福 《生物产业技术》 2010年第6期42-48,共7页

流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病。2009年暴发的甲型H1N1大流感在世界范围内引起了极大的恐慌并造成了巨大的经济损失.预防和控制新型流感成为科学家们研究的重点和难点。由于抗原变异频繁.疫苗研发滞后.使得针对流感病... 流行性感冒是由流感病毒引起的急性呼吸道传染病。2009年暴发的甲型H1N1大流感在世界范围内引起了极大的恐慌并造成了巨大的经济损失.预防和控制新型流感成为科学家们研究的重点和难点。由于抗原变异频繁.疫苗研发滞后.使得针对流感病毒蛋白保守结构设计的靶向性、广谱药物的研制十分紧迫。流感病毒囊膜蛋白神经氨酸酶精细结构的解析.为设计合成新型抗流感药物提供了基础.对于流感的预防和治疗具有重要意义。文章主要对以结构为基础的抗流感病毒神经氨酸酶抑制剂.如达菲和瑞乐沙等的设计和研发进行回顾总结.强调结构对于靶向性药物设计的重要作用.希望通过此文讨论新药研发的可行方向。 展开更多

关键词 2009甲型H1N1流感病毒 神经氨酸(苷)酶 蛋白晶体结构 抑制剂

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