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题名利用RAPD标记分析咖啡种质资源的遗传多样性
被引量：11
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作者
黄丽芳
董云萍
王晓阳
陈鹏
林兴军
范睿
闫林
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机构
中国热带农业科学院香料饮料研究所海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室农业部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2014年第12期2313-2319,共7页
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基金
国家自然科学基金项目(No.31000740)
热带作物种质资源保护项目(No.14RZZY-49)
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文摘
通过引物筛选获得18条RAPD多态性引物,利用该引物对72份咖啡种质资源进行RAPD扩增,共扩增出149条条带,其中多态性条带126条,多态性位点为84.6%。运用UPGMA方法构建了聚类图,在相似系数0.632的水平下可将72份资源聚为3个大类,其中A类群包含了所有的中粒种资源(Coffea canephora Pierre)及一份由云南德宏所选育的中小粒种杂交种(阿拉伯斯塔),共34份咖啡种质资源;B类群包括了6份查理种(Coffea excelsa Chevalier)和大粒种(Coffea liberica Bull ex Hiern);C类群由小粒种(Coffea arabica.Linne)咖啡组成。结果说明咖啡种质的遗传关系种间容易划分,在种的分类水平上存在遗传关系多样性,部分资源的分类学地位与地理来源无相关性。
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关键词
咖啡
RAPD
遗传多样性
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Keywords
Coffee
RAPD
Genetic diversity
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分类号
S571.2
[农业科学—作物学]
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题名芒果实生资源遗传多样性的SSR分析
被引量：15
- 2
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作者
黄丽芳
闫林
范睿
姚全胜
刘洋
雷新涛
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机构
中国热带农业科学院香料饮料研究所海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室农业部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所
中国热带农业科学院湛江实验站
中国热带农业科学院椰子研究所
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出处
《热带作物学报》
CSCD
2011年第10期1828-1832,共5页
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基金
南亚热作专项(No.11RZZY-08)
国家自然科学基金项目(No.30760147)
中国热带农业科学院南亚热带作物研究所中央公益性基本科研业务费(No.1251022011007)
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文摘
利用18对SSR多态性引物对来自中国4个省份的116份芒果种质资源进行SSR-PCR扩增,共扩增出202条条带,其中多态性条带193条,多态性比率为95.54%,PIC平均值为0.57。UPGMA树状聚类图表明,109份芒果实生材料具有丰富的遗传多样性,相似系数在0.6～1.0之间,可分为4个地域性群组,分别是广东和海南土芒、广西百色土芒、广西南宁土芒以及云南小鸡芒。
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关键词
芒果
实生
SSR
遗传多样性
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Keywords
Mango
Seedling
SSR
Genetic diversity
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分类号
S667.7
[农业科学—果树学]
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题名咖啡ISSR与RAPD-PCR反应体系优化
被引量：13
- 3
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作者
闫林
黄丽芳
谭乐和
范睿
王晓阳
陈鹏
董云萍
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机构
中国热带农业科学院香料饮料研究所 海南省热带香辛饮料作物遗传改良与品质调控重点实验室 农业部香辛饮料作物遗传资源利用重点实验室
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2012年第5期854-859,共6页
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基金
国家自然科学基金项目(No.31000740
No.31071475)
公益性行业(农业)科研专项经费项目(No.200903024)
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文摘
以中粒种咖啡部分种质为试材,采用U25(55)均匀设计表,对影响ISSR和RAPD标记的模板DNA、Mg2+、dNTPs、TaqDNA聚合酶和引物浓度5个因素进行优化,分别建立适合于中粒种咖啡ISSR-PCR和RAPD-PCR标记的反应体系。结果表明:2种标记的反应体系相似,20μL的反应体系中含DNA模板20 ng,Mg2+1.5 mmol/L,dNTPs 0.3 mmol/L,Taq酶1.25 U,引物0.6μmol/L。利用所确立的体系对13份中粒种咖啡种质进行扩增,结果条带清晰明亮,多态性好。
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关键词
咖啡
ISSR
RAPD
均匀设计
体系优化
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Keywords
Coffee
ISSR
RAPD
Uniform design
System optimization
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分类号
S571.2
[农业科学—作物学]
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