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香蕉肉桂醇脱氢酶基因的克隆及表达分析 被引量:2
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作者 王卓 徐碧玉 +5 位作者 贾彩红 李健平 刘菊华 张建斌 苗红霞 金志强 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1305-1310,共6页
肉桂醇脱氢酶(CAD)在木质素合成过程中起关键作用。通过RACE(rapid-amplification of cDNA ends)方法从香蕉根系cDNA均一化全长文库中获得一个肉桂醇脱氢酶基因,命名为MaCAD1(GenBank登录号为KF582533)。MaCAD1是香蕉MYB基因编码框全长c... 肉桂醇脱氢酶(CAD)在木质素合成过程中起关键作用。通过RACE(rapid-amplification of cDNA ends)方法从香蕉根系cDNA均一化全长文库中获得一个肉桂醇脱氢酶基因,命名为MaCAD1(GenBank登录号为KF582533)。MaCAD1是香蕉MYB基因编码框全长cDNA,包含一个1 077bp的最大开放阅读框(ORF),编码358个氨基酸。蛋白质序列同源比对发现,其含有完整的醇脱氧酶的典型保守结构域,属于典型的CAD蛋白。系统进化树比对分析表明,MaCAD1与水稻OsCAD6(CAD39907)的亲缘关系较近。组织特异性研究表明MaCAD1基因组成型表达于香蕉各个组织。在耐病和感病品种中,MaCAD1均上调表达,但在耐病品种中MaCAD1在所有时间点相对于对照增加的倍数均高于感病品种,表明MaCAD1基因在香蕉的抗病性中起着重要作用,MaCAD1可以作为一个新的响应枯萎病侵染的标记基因。 展开更多
关键词 香蕉 肉桂醇脱氢酶 基因克隆 表达分析
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香蕉抗坏血酸过氧化物酶基因的克隆及表达分析 被引量:3
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作者 王卓 徐碧玉 +5 位作者 贾彩红 李健平 刘菊华 张建斌 苗红霞 金志强 《热带农业科学》 2015年第12期44-49,共6页
抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)是植物重要的过氧化氢(Hydrogen peroxide,H_2O_2)清除酶之一。通过RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)方法从香蕉根系cDNA均一化全长文库中获得一个抗坏血酸过氧化物酶基因,命名为Ma... 抗坏血酸过氧化物酶(Ascorbate peroxidase,APX)是植物重要的过氧化氢(Hydrogen peroxide,H_2O_2)清除酶之一。通过RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)方法从香蕉根系cDNA均一化全长文库中获得一个抗坏血酸过氧化物酶基因,命名为MaAPX2基因。MaAPX2基因是香蕉APX基因编码框全长cDNA,包含一个750 bp的最大开放阅读框(Open Reading Frame,ORF),编码249个氨基酸的蛋白质。蛋白质序列结构域比对发现,在MaAPX2N端具有典型的APX活性位点(APLMLPLAWHSA)和过氧化物酶近端血红素配体序列(DIVALSGGHTL)的保守结构域,属于典型的APX蛋白。系统进化树比对分析表明,MaAPX2与马蹄莲ZaAPX(AAC08576.1)的亲缘关系较近。组织特异性研究表明,MaAPX2基因组成型表达于香蕉各个组织,在叶片中表达量最大。在耐病和感病品种中,MaAPX2基因均上调表达,但在耐病品种中MaAPX2基因在所有时间点相对于对照增加的倍数均高于感病品种,表明该基因在香蕉的抗病性中起着重要作用。MaAPX2基因可以作为一个新的响应枯萎病侵染的标记基因。 展开更多
关键词 香蕉 抗坏血酸过氧化物酶 基因克隆 表达分析
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香蕉NPR1E基因的克隆及表达分析 被引量:1
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作者 王卓 徐碧玉 +5 位作者 贾彩红 李健平 刘菊华 张建斌 苗红霞 金志强 《热带农业科学》 2015年第6期18-24,28,共8页
NPR1基因可参与调节植物对病原菌的广谱抗性,在植物系统抗性中起着关键的调控作用。通过RACE(rapid-amplification of c DNA ends)方法从香蕉根系中获得NPR1E基因,命名为Ma NPR1E(Gen Bank登录号分别为:KF582550)。Ma NPR1E是香蕉NPR1... NPR1基因可参与调节植物对病原菌的广谱抗性,在植物系统抗性中起着关键的调控作用。通过RACE(rapid-amplification of c DNA ends)方法从香蕉根系中获得NPR1E基因,命名为Ma NPR1E(Gen Bank登录号分别为:KF582550)。Ma NPR1E是香蕉NPR1基因编码框全长c DNA,包含一个1 755 bp的最大开放阅读框,编码一个含584个氨基酸的蛋白质。经蛋白质序列同源比对发现,其含有完整的BTB/POZ结构域、锚蛋白重复ANK序列和NPR1-like-C结构域,属于典型的NPR1蛋白。系统进化树比对分析表明,Ma NPR1E与海枣Pd NPR3(XP_008808341.1)和油棕Eg NPR3(XP_010914123.1)的亲缘关系较近。组织特异性研究表明,该基因组成型表达于香蕉各组织。实时荧光定量PCR分析表明,接种枯萎病菌后Ma NPR1E的表达在感病品种中被抑制,而在抗病品种中被激活;Ma NPR1E的表达受乙烯利和水杨酸的诱导。上述结果表明,Ma NPR1E可能在香蕉抗枯萎病过程中扮演重要的调控角色。 展开更多
关键词 香蕉 MaNPR1E 基因克隆 表达分析
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香蕉延长因子1A(MaEF1A)基因的分离及特征分析
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作者 刘菊华 徐碧玉 +4 位作者 陈敦忠 张静 张建斌 贾彩红 金志强 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期825-830,共6页
采用筛选香蕉果实采后cDNA文库的方法,首次获得了一条长为1 341 bp的cDNA序列,命名为MaEF1A。生物信息学分析结果表明,它与麝香百合延长因子1A 3的mRNA有84%的同源性,与烟草延长因子1A的mRNA有83%的同源性,推测它可能为编码香蕉延长因子... 采用筛选香蕉果实采后cDNA文库的方法,首次获得了一条长为1 341 bp的cDNA序列,命名为MaEF1A。生物信息学分析结果表明,它与麝香百合延长因子1A 3的mRNA有84%的同源性,与烟草延长因子1A的mRNA有83%的同源性,推测它可能为编码香蕉延长因子1A(elongation factor-1 alpha,EF1A)的基因。该基因包含了一个完整的ORF,肽链序列中含有GTP-EFTU、GTP-EFTU-02和GTP-EFTU-03 3个保守结构域。采用RT-PCR的方法对该基因在香蕉不同组织以及果实采后不同时期的表达特征进行了初步的研究。结果表明,该基因在香蕉不同组织以及果实采后各个时期都是差异表达的。该基因在香蕉根和花中的表达量最高,茎叶最低。在香蕉果实采后的表达量开始是呈逐渐升高的趋势,到香蕉果实采后第20天,该基因的表达量达到高峰,随后该基因的表达量就逐渐下降。这一变化过程与香蕉果实采后乙烯释放量的变化进程是一致的。 展开更多
关键词 香蕉 CDNA文库 MaEF1A RT-PCR
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香蕉NPR1基因家族的鉴定及在枯萎病菌胁迫下表达分析 被引量:10
5
作者 任陪娣 谢碧玉 +6 位作者 陈翠 贾彩红 王静毅 张建斌 徐碧玉 王卓 金志强 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1621-1629,共9页
以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析。共鉴定得到15个成员,将其命名为MaNPR1~MaNPR15。理化性质、保守功能结构域、重... 以拟南芥NPR1基因家族成员蛋白序列为查询序列,在香蕉基因组数据库中鉴定香蕉NPR1基因家族成员,并对其进行生物信息学分析及在枯萎病菌侵染下的表达分析。共鉴定得到15个成员,将其命名为MaNPR1~MaNPR15。理化性质、保守功能结构域、重要的氨基酸残基及motif分析结果与其他物种所报道的有较高的一致度。香蕉NPR1基因家族成员种内进化树、基因结构及结构域的分类情况呈现出高度一致,表明了香蕉NPR1基因家族成员间有着明确的分工。种间进化树显示香蕉的NPR1基因分为3个分组,每个分组都含有拟南芥NPR1成员。主栽品种巴西蕉(Musa acuminata Colla.AAA group'Brazilian')易感香蕉枯萎病,从巴西蕉CK及巴西蕉受枯萎病侵染2 d的根系转录组数据中综合表达量及表达趋势选定8个成员,并在巴西蕉与抗(耐)Foc TR4品种GCTCV-119中验证其表达模式。基因MaNPR4及MaNPR11在抗感品种中表现出明显的差异表达,在抗病品种GCTCV-119中随着Foc TR4侵染时间延长表达量不断增加,而在感病品种巴西蕉中表达量呈下降趋势。表明MaNPR4及MaNPR11参与香蕉抗枯萎病过程。本研究结果为进一步利用香蕉NPR1基因进行香蕉抗枯萎病遗传改良奠定基础。 展开更多
关键词 香蕉 NPR1 生物信息学分析 香蕉枯萎病 表达分析
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香蕉几丁质酶基因家族的鉴定及在枯萎病侵染时的表达分析 被引量:1
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作者 林秋妹 王霞 +6 位作者 赵东方 贾彩红 王静毅 刘菊华 徐碧玉 张玄兵 王卓 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期272-280,共9页
几丁质酶(CHi,Chitinase)是一种能够催化真菌细胞壁中几丁质水解的病程相关蛋白,在植物与真菌互作中起着重要的作用。本研究以拟南芥几丁质酶基因的蛋白序列为查询序列,在香蕉A基因组数据库中进行BLASTp比对,鉴定出23个香蕉几丁质酶(MaC... 几丁质酶(CHi,Chitinase)是一种能够催化真菌细胞壁中几丁质水解的病程相关蛋白,在植物与真菌互作中起着重要的作用。本研究以拟南芥几丁质酶基因的蛋白序列为查询序列,在香蕉A基因组数据库中进行BLASTp比对,鉴定出23个香蕉几丁质酶(MaCHi,Musa chitinase)基因家族成员。根据其染色体上的位置,分别命名为MaCHi01~MaCHi23。系统进化树分析表明23个MaCHis可分为糖苷水解酶18(GH18,glycosyl hydrolase 18)和糖苷水解酶19(GH19,glycosyl hydrolase 19)2个亚家族。转录组数据分析表明接种尖孢镰刀菌古巴专化型热带4号生理小种(Foc TR4,Fusarium oxysporum f.sp.cubense tropical race 4)后MaCHi05、MaCHi06、MaCHi07、MaCHi11、MaCHi19和MaCHi20基因在感病品种巴西蕉中显著下调或不表达,在抗病品种GCTCV-119中显著上调。利用RT-qPCR技术对MaCHi05、MaCHi06、MaCHi07、MaCHi11和MaCHi19在抗病和感病品种接种Foc TR4中进行表达分析,结果发现在抗病品种中这些基因的表达都被激活,而在感病品种中没有激活,且在抗病品种中的相对表达量远大于感病品种,表明这些基因以正调控方式参与香蕉抗枯萎病过程。本研究结果为进一步解析MaCHi基因家族成员在香蕉抗枯萎病过程中的功能提供理论参考。 展开更多
关键词 香蕉 几丁质酶基因 表达分析 枯萎病
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