热带药用植物根际放线菌的分离、鉴定及生物活性分析 被引量：13

1

作者 黄小龙 陈吉良 +4 位作者 李建平 林海鹏 庄令 李佳 洪葵 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期121-127,共7页

从海南热带植物园采集12种药用植物的根际土样,采用选择性分离方法,分离得到400株根际放线菌。使用5种活性筛选模型对分离菌株进行生物活性评价,154株放线菌在一个或多个活性筛选模型中显示为阳性,菌株初筛阳性率达38.5%;根据菌株形态... 从海南热带植物园采集12种药用植物的根际土样,采用选择性分离方法,分离得到400株根际放线菌。使用5种活性筛选模型对分离菌株进行生物活性评价,154株放线菌在一个或多个活性筛选模型中显示为阳性,菌株初筛阳性率达38.5%;根据菌株形态特征并结合代谢产物的生物活性,从中挑选出28株菌进行16S rRNA基因序列分析,发现其分属于链霉菌属、诺卡氏菌属、小单孢菌属和野野村菌属。 展开更多

关键词 药用植物 根际 放线菌 生物活性

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中国芭蕉属野生种表型性状和SSR多样性分析 被引量：7

2

作者 冯慧敏 陈友 +2 位作者 李博 邓长娟 武耀廷 《热带作物学报》 CSCD 2011年第4期708-714,共7页

采用表型性状和SSR分子标记2种聚类方法对中国分布的3组12份野生蕉进行多样性分析，表型聚类以芭蕉属种质资源25核心表型性状为依据．将供试材料分为两大类，其中染色体数为10对的红花蕉组分为一组．染色体数为11对的真蕉组和观赏蕉组... 采用表型性状和SSR分子标记2种聚类方法对中国分布的3组12份野生蕉进行多样性分析，表型聚类以芭蕉属种质资源25核心表型性状为依据．将供试材料分为两大类，其中染色体数为10对的红花蕉组分为一组．染色体数为11对的真蕉组和观赏蕉组分为一组。除胍60400分到观赏蕉组外，其他的材料因形态特征的明显差异分为真蕉组和观赏蕉组两个亚类。SSR分子标记采用12对多态性较好的SSR引物，共产生51个多态性条带．供试的12个材料相似系数范围为0．60～0．96，供试材料分为3类，供试的真蕉组材料和M.paracoccinea, M. yunnanensis聚为一组，观赏蕉组的材料聚为一组，红花蕉组的M．coccinea聚为一组。研究结果表明．我同野生蕉种质资源丰富．对其分类需将形态特征与分子标记相结合进行综合分析。 展开更多

关键词 野生蕉 表型性状 SSR 多样性

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香蕉野生种质资源系统分类研究进展 被引量：5

3

作者 冯慧敏 陈友 +2 位作者 邓长娟 李博 武耀廷 《热带农业科学》 2011年第5期38-44,共7页

从形态学标记、细胞学标记、生物化学标记和DNA分子标记等方面介绍了香蕉野生种质资源系统分类的方法,并对世界香蕉野生种质资源系统分类的研究进展进行了综述,旨在为香蕉种质资源研究提供参考,为定性选育香蕉新品种提供理论依据。

关键词 香蕉 野生 种质资源 系统分类

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部分香蕉品种SSR指纹图谱的构建 被引量：24

4

作者 王静毅 陈业渊 +2 位作者 黄秉智 于飞 武耀廷 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期733-738,共6页

采用SSR标记技术构建香蕉品种的分子指纹图谱,为香蕉品种鉴定提供依据。以56份香蕉种质为材料,从199对引物中筛选出5对多态性及稳定性较高的SSR引物进行PCR扩增。5对引物在56个品种中扩增出的多态性带数在11～16个,平均为13.8条;引物的... 采用SSR标记技术构建香蕉品种的分子指纹图谱,为香蕉品种鉴定提供依据。以56份香蕉种质为材料,从199对引物中筛选出5对多态性及稳定性较高的SSR引物进行PCR扩增。5对引物在56个品种中扩增出的多态性带数在11～16个,平均为13.8条;引物的多态信息含量(PIC)在0.8490～0.9022,平均0.8727。依据香蕉SSR带型特征,对每个引物生成的不同带型直接编号,简化香蕉SSR带型记录方法,并利用每个品种的带型编号,建立其DNA分子指纹图谱,5对引物可将56份供试香蕉材料完全区分开。表明SSR标记技术可用以鉴定香蕉种质。 展开更多

关键词 香蕉 SSR带型 指纹图谱

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基于cpSSR分子标记的香蕉种质资源分类 被引量：7

5

作者 李博 冯慧敏 +3 位作者 王静毅 童和林 陈友 武耀廷 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1012-1018,共7页

应用cpSSR分子标记来研究香蕉种质资源分类，用筛选到的16对多态性引物对42份香蕉材料进行扩增．共检测出86个多态性条带，每对引物产生的多态性条带为2～8，平均为5．5，多态信息含量为0．1889～0．7805。在相似系数为0．76时，供试的4... 应用cpSSR分子标记来研究香蕉种质资源分类，用筛选到的16对多态性引物对42份香蕉材料进行扩增．共检测出86个多态性条带，每对引物产生的多态性条带为2～8，平均为5．5，多态信息含量为0．1889～0．7805。在相似系数为0．76时，供试的42份香蕉材料分成3大类群：类群Ⅰ为M.acuminata的全部亚种和供试的所有栽培蕉品种；类群Ⅱ为供试的全部M.balbisiana材料；类群Ⅲ为除了M.acuminata和M.balbisiana外其他全部供试的野生蕉材料。结果表明基于cpSSR分子标记的香蕉种质资源的分类在种间具有较好的区分能力，但是cpSSR分类表现出较大的地理分布的相关性，而与形态特征关系不密切。 展开更多

关键词 香蕉 叶绿体SSR 种质资源 分类

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芭蕉属野生种的地理分布 被引量：8

6

作者 冯慧敏 陈友 +1 位作者 邓长娟 武耀廷 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期361-368,共8页

芭蕉属起源于热带亚热带区域,对芭蕉属野生种质资源的研究始于20世纪40年代。通过检索INIBAP的多个数据库和相关文献,归纳整理出芭蕉属野生种的分布规律,为野生蕉的种质资源保存、利用以及品种鉴定提供一定的理论依据。经分析,目前已经... 芭蕉属起源于热带亚热带区域,对芭蕉属野生种质资源的研究始于20世纪40年代。通过检索INIBAP的多个数据库和相关文献,归纳整理出芭蕉属野生种的分布规律,为野生蕉的种质资源保存、利用以及品种鉴定提供一定的理论依据。经分析,目前已经报道的芭蕉属共有52个野生种,其中真芭蕉组(Eumusa)11个,观赏蕉组(Rhodochlamys)9个,澳蕉组(Australimusa)13个,红花蕉组(Callimusa)18个,不确定组(Incertae sedis)1个。马来西亚、印度尼西亚、巴布亚新几内亚、印度和中国均分布有不同的3组芭蕉属野生种,但马来西亚和印度分布的种数最多,各分布有15种,约占总数的29%,可能是芭蕉属野生种的多样性中心。 展开更多

关键词 芭蕉属 野生种 分类 地理分布

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菠萝微卫星指纹图谱的构建 被引量：10

7

作者 童和林 冯素萍 +5 位作者 贺军虎 王静毅 陈业渊 孙光明 于飞 武耀廷 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期240-245,共6页

初步构建了菠萝种质的SSR指纹图谱,为菠萝种质鉴定提供了依据。从菠萝EST-SSR开发的20对微卫星引物扩增31份不同的菠萝种质,筛选出能够稳定扩增且带型差异明显的SSR引物。挑选5对多态性高、分辨率高、重复性好的SSR引物对,作为标准引物... 初步构建了菠萝种质的SSR指纹图谱,为菠萝种质鉴定提供了依据。从菠萝EST-SSR开发的20对微卫星引物扩增31份不同的菠萝种质,筛选出能够稳定扩增且带型差异明显的SSR引物。挑选5对多态性高、分辨率高、重复性好的SSR引物对,作为标准引物对材料进行扩增。每对引物得到的多态性带数8～15个,平均为11条;引物的多态信息含量(PIC)在0.643 7～0.792 8,平均0.737 3。依据带型特征,建立菠萝DNA分子指纹图谱。 展开更多

关键词 菠萝 SSR 指纹图谱

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广西主要杧果资源遗传关系的SSR分析 被引量：15

8

作者 王静毅 王家保 +3 位作者 武耀廷 黄国弟 周俊岸 李日旺 《热带作物学报》 CSCD 2009年第9期1301-1307,共7页

应用SSR技术,对48个杧果品种(系)的遗传关系进行了检测。14个SSR基因座在48个品种(系)中分别扩增出3～6个等位基因,共获得63个等位基因,等位基因数(A)平均为4.50;有效等位基因数(Ne)平均为2.66,各基因座的多态信息含量(PIC)值在0.1929～... 应用SSR技术,对48个杧果品种(系)的遗传关系进行了检测。14个SSR基因座在48个品种(系)中分别扩增出3～6个等位基因,共获得63个等位基因,等位基因数(A)平均为4.50;有效等位基因数(Ne)平均为2.66,各基因座的多态信息含量(PIC)值在0.1929～0.6863之间,平均0.5337,平均杂合度观测值(Ho)和期望值(He)分别为0.4241和0.5943。品种间的遗传相似系数在0.4559～0.9412之间,平均为0.7053,以桂热杧06-3号与桂热杧06-5号两者之间的相似系数最小,而Keitt与红凯特杧及玉文杧与蜜桃杧之间相似系数最大。UPGMA聚类分析将48个品种分为5大类群。聚类结果表明,在分子水平上,杧果品种间的亲缘关系与胚性无直接关系;且广西本地杧果品种(系)多是象牙杧、青皮杧、吕宋杧或秋杧等的杂交子代或实生后代。 展开更多

关键词 杧果 SSR 遗传关系 聚类分析

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菠萝基因组SSR分子标记的开发 被引量：5

9

作者 童和林 冯素萍 +3 位作者 陈友 陈业渊 孙光明 武耀廷 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期551-555,共5页

实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这8... 实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点,其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个。二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GA/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39/91)。研究未发现三核苷酸及以上的重复单元。36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记。 展开更多

关键词 菠萝 基因组SSR标记 开发 验证

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香蕉品种(系)遗传多样性的SSR分析 被引量：6

10

作者 王静毅 冀小蕊 武耀廷 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第10期5706-5710,共5页

[目的]从分子水平上研究香蕉种质资源的遗传多样性和亲缘关系,建立分子水平香蕉分类系统。[方法]应用SSR技术从分子水平上对32个香蕉品种(系)的遗传关系进行检测。[结果]39对SSR引物在32个品种(系)中扩增带数在4～20个,平均每个SSR座位... [目的]从分子水平上研究香蕉种质资源的遗传多样性和亲缘关系,建立分子水平香蕉分类系统。[方法]应用SSR技术从分子水平上对32个香蕉品种(系)的遗传关系进行检测。[结果]39对SSR引物在32个品种(系)中扩增带数在4～20个,平均每个SSR座位可检测2.78个多态性带,引物的多态信息量(PIC)在0.45～0.91,平均0.80。依据SSR数据计算的品种间遗传距离在3.06%～43.61%,平均30.73%。[结论]香蕉品种之间存在较为丰富的遗传变异。 展开更多

关键词 香蕉 SSR 遗传距离 聚类分析

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耐热小双孢菌212030的初步鉴定及抗菌活性评价 被引量：1

11

作者 徐小雄 林海鹏 +1 位作者 庄令 洪葵 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期364-366,372,共4页

采用腐殖酸培养基,从海南文昌红树林中海芒果的根际土壤分离得到一株小双孢菌212030。该菌株在45℃下的生长速度比在28℃的生长速度要快,属兼性嗜热菌。菌株212030的耐盐度为0～5%,不添加NaCl的时候生长最佳。通过16S rDNA基因序列分析... 采用腐殖酸培养基,从海南文昌红树林中海芒果的根际土壤分离得到一株小双孢菌212030。该菌株在45℃下的生长速度比在28℃的生长速度要快,属兼性嗜热菌。菌株212030的耐盐度为0～5%,不添加NaCl的时候生长最佳。通过16S rDNA基因序列分析,菌株212030与Microbispora amethystogene JCM 3021T的相似率最高,为98.9%。菌株212030发酵液对聚团肠杆菌、金黄色葡萄球菌和耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌均有抑制作用。 展开更多

关键词 耐热小双孢菌 抗菌活性

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