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基于头发蛋白质组学区分个人特质的方法学探究 被引量:1
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作者 吴晓淋 张涛 +2 位作者 徐平 张亚莉 张振鹏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第1期230-240,共11页
目的头发是一类重要的皮肤附属物,主要由角蛋白和角蛋白相关蛋白等组成。不同种族及性别样本的头发蛋白质组成和占比存在差异,且目前缺乏高效率提取头发蛋白的方法。本文探究基于定量头发蛋白质组学方法,旨在探索该方法区分不同个体的... 目的头发是一类重要的皮肤附属物,主要由角蛋白和角蛋白相关蛋白等组成。不同种族及性别样本的头发蛋白质组成和占比存在差异,且目前缺乏高效率提取头发蛋白的方法。本文探究基于定量头发蛋白质组学方法,旨在探索该方法区分不同个体的可能性。方法以3例头发样本,对样品处理方法和裂解缓冲液进行探究,发展一种名为PLEE(PTM lab for protein extraction from hair with high efficiency)的稳定、高效的头发蛋白质提取方法,对7例人发样本,以PLEE法进行提取,结合胶内消化方法进行蛋白质组学实验,产出蛋白质组学数据,分析个体间的头发蛋白质组成及占比。结果共鉴定274种蛋白质,共有的蛋白质107种,非共有蛋白质种类在57~119,部分样本存在独特鉴定蛋白。使用共鉴定107种蛋白质进行定量蛋白质组分析,通过聚类和主成分分析,可将各样本进行区分,且技术重复样本可聚在一起,表明流程的稳定性。另外,筛选出10个关键蛋白(KRT33A、KRTAP9-6、KRT83、KRTAP7-1、KRT32、BLMH、KRT38、KRTAP11-1、NPAS1、KRTAP4-3)在不同个体之间差异比较大且在同个体中蛋白质鉴定稳定。结论不同个体的头发蛋白质组成存在差异,筛选出的10个蛋白质有望作为区分个体特质的关键蛋白,在个体识别、刑侦方面具有重大的应用潜力。 展开更多
关键词 头发 蛋白质组学 个人特质 PLEE
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有机化学品非动物替代风险评估组学研究进展 被引量:1
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作者 孙翌 李媛 +2 位作者 龙奇 左涛 徐平 《生态毒理学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期162-172,共11页
暴露评估是有机化学品风险评估的关键环节。准确评估有机化学品对动物或人体的危害程度能够有效降低其潜在风险。化学品风险评估的传统方法主要基于动物实验,然而相对于复杂的体内实验,体外细胞毒性实验具有经济、快速、易于量化和可重... 暴露评估是有机化学品风险评估的关键环节。准确评估有机化学品对动物或人体的危害程度能够有效降低其潜在风险。化学品风险评估的传统方法主要基于动物实验,然而相对于复杂的体内实验,体外细胞毒性实验具有经济、快速、易于量化和可重复的优势。基于人类细胞或细胞系的高通量检测和筛选方法,更有利于表征化学品的毒性效应,满足有机化学品管控的需求。随着生命科学步入后基因组学时代,研究的视角更加广泛,借助于基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等组学工具,能够从基因表达的时空分布、蛋白质结构和功能的特性、蛋白质翻译后修饰以及代谢物的动态变化视角为化学品暴露风险评估提供多维度信息。本文从组学角度出发,系统地对近年来国内外有机化学品风险评估的研究进展、组学的研究策略以及组学在有机化学品风险评估中的应用进行了综述和展望,提出组学的联合应用将更加系统全面地探究化学品毒性机制,为我国非动物替代有机化学品暴露风险评估提供技术指引和参考。 展开更多
关键词 有机化学品 体外风险评估 毒性测试 组学技术
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多组学技术在化学物质风险评估非动物替代新途径方法研究中应用进展
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作者 孙翌 左涛 徐平 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期752-758,共7页
近年来,随着组学技术的快速发展,在毒理学领域显示出广阔的应用前景。基于转录组学的非动物替代毒理学新方法也逐渐进入法规化阶段。然而,鉴于单一组学技术在风险评估中存在局限性,且尚未实现从科学研究向监管规范的转变,通过整合多种N... 近年来,随着组学技术的快速发展,在毒理学领域显示出广阔的应用前景。基于转录组学的非动物替代毒理学新方法也逐渐进入法规化阶段。然而,鉴于单一组学技术在风险评估中存在局限性,且尚未实现从科学研究向监管规范的转变,通过整合多种NAMs和不同来源的信息将有助于更精准地完成风险评估。本文系统介绍了目前国内外重点关注的基因组学、蛋白质组学、蛋白质翻译后修饰组学和代谢组学技术及其在化学物质风险评估中的应用展望。 展开更多
关键词 毒理组学 化学物质 体外风险评估 新途径方法
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