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长链非编码RNA AFAP1-AS1促进肿瘤侵袭转移 被引量:3
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作者 曾朝阳 孛昊 +9 位作者 龚朝建 李夏雨 连瑜 荆益州 唐艳艳 陈攀 廖前进 李小玲 熊炜 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第12期1155-1158,共4页
人类基因组计划及其后续的DNA元件百科全书计划(The Encyclopedia of DNA Elements Project,ENCODE)研究成果表明,蛋白质编码基因序列仅占人类基因组序列的1%-3%,人基因组中绝大部分可转录的序列为长链非编码RNA(long non-coding RNA... 人类基因组计划及其后续的DNA元件百科全书计划(The Encyclopedia of DNA Elements Project,ENCODE)研究成果表明,蛋白质编码基因序列仅占人类基因组序列的1%-3%,人基因组中绝大部分可转录的序列为长链非编码RNA(long non-coding RNA,lnc RNAs)[1].Lnc RNA广泛地存在于各种生物中,且随着生物复杂程度的升高,基因组中lnc RNA序列的比例也相应地增大,提示lnc RNA在生物进化过程中可能有着重要意义[2-4]。 展开更多
关键词 非编码RNA 肿瘤侵袭 人类基因组计划 长链 生物进化过程 Elements 基因序列 蛋白质编码
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外泌体环状RNA在肿瘤微环境中的研究进展 被引量:6
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作者 唐梦甜 周菊梅 +5 位作者 廖前进 周钰娟 熊炜 李桂源 唐艳艳 聂少麟 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第2期135-146,共12页
外泌体是细胞分泌的30~150 nm的细胞外囊泡,在肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中介导细胞间通讯.环状RNA(circular RNA,circRNAs)是一类由前体mRNA(precursor mRNA,pre-mRNA)反向剪接生成的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在... 外泌体是细胞分泌的30~150 nm的细胞外囊泡,在肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)中介导细胞间通讯.环状RNA(circular RNA,circRNAs)是一类由前体mRNA(precursor mRNA,pre-mRNA)反向剪接生成的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA),在外泌体中富集且表达稳定.本文主要讨论外泌体起源和circRNAs在外泌体中的分选调控机制,阐述外泌体circRNAs在肿瘤微环境各个阶段中的作用与机制,包括血管生成、EMT、耐药等.最后,本文探讨外泌体circRNAs作为肿瘤标志物和治疗靶点的临床应用前景与价值. 展开更多
关键词 外泌体环状RNA 肿瘤微环境 临床应用前景
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LncRNA作为ceRNA调控肿瘤的发生发展 被引量:20
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作者 连瑜 李夏雨 +5 位作者 唐艳艳 杨丽婷 李小玲 熊炜 李桂源 曾朝阳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2016年第3期219-225,共7页
长链非编码RNA(lncRNA)是长度大于200 bp,不编码蛋白质的内源性RNA分子.近年来的研究表明,lncRNA可以作为一种竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)吸附miRNA,参与靶基因的表达调控,从而在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用.本... 长链非编码RNA(lncRNA)是长度大于200 bp,不编码蛋白质的内源性RNA分子.近年来的研究表明,lncRNA可以作为一种竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)吸附miRNA,参与靶基因的表达调控,从而在肿瘤的发生发展中发挥重要的作用.本文从lncRNA作为ceRNA发挥生物学功能这一角度,概述了相关lncRNA在肿瘤发生发展中的作用及机制.揭秘lncRNA与miRNA在肿瘤发生中的相互作用,将为肿瘤的诊断和治疗提供新思路. 展开更多
关键词 长链非编码RNA MICRORNA 肿瘤发生
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染色质免疫沉淀-测序:全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术 被引量:5
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作者 梁芳 徐柯 +5 位作者 龚朝建 李俏 马健 熊炜 曾朝阳 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第3期216-227,共12页
染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq... 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因调控和表观遗传机制的一种常用手段.本文就该技术的最近研究进展进行综述,并着重介绍ChIP-seq数据分析过程及该技术的实际应用情况. 展开更多
关键词 ChIP—seq 新一代测序技术 基因调控 表观遗传学 数据分析
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肿瘤异质性:精准医学需破解的难题 被引量:16
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作者 涂超峰 綦鹏 +5 位作者 李夏雨 莫勇真 李小玲 熊炜 曾朝阳 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2015年第10期881-890,共10页
肿瘤异质性是恶性肿瘤的重要特征,表现为同一种恶性肿瘤不同患者个体之间或者同一患者体内不同部位肿瘤细胞间从基因型到表型上存在的差异.这种差异可表现为不同的遗传背景、不同的病理类型、不同的分化状态、不同的基因突变谱和转录组... 肿瘤异质性是恶性肿瘤的重要特征,表现为同一种恶性肿瘤不同患者个体之间或者同一患者体内不同部位肿瘤细胞间从基因型到表型上存在的差异.这种差异可表现为不同的遗传背景、不同的病理类型、不同的分化状态、不同的基因突变谱和转录组、蛋白质组表达谱等,体现了恶性肿瘤在演进过程中的高度复杂性和多样性.肿瘤异质性给肿瘤的治疗带来极大的困难,一直是肿瘤发生发展机制研究领域重要的科学问题.本文综述了肿瘤异质性的生物学特征及其可能的形成机制,并对"精准医学"时代如何针对肿瘤异质性设计更为有效的个性化治疗方案进行了思考. 展开更多
关键词 肿瘤 异质性 精准医学
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天然免疫分子乳铁蛋白抑制鼻咽癌的发生发展 被引量:1
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作者 黄宏斌 邓敏 +8 位作者 郑瑛 马健 张文玲 周艳宏 廖前进 熊炜 李小玲 曾朝阳 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第4期319-324,共6页
鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)的发病具有明显的区域和人种聚集性,主要高发于中国南方和东南亚一些国家;鼻咽癌发病还具有明显的家族聚集性,有癌家族史的鼻咽癌患者约占10%,而且大部分发生在一级亲属中.明显的区域和人群聚集... 鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)的发病具有明显的区域和人种聚集性,主要高发于中国南方和东南亚一些国家;鼻咽癌发病还具有明显的家族聚集性,有癌家族史的鼻咽癌患者约占10%,而且大部分发生在一级亲属中.明显的区域和人群聚集以及高比例的家族性发病提示遗传因素在鼻咽癌的发病过程中具有重要作用. 展开更多
关键词 鼻咽癌 乳铁蛋白 免疫分子 发病过程 生发 天然 聚集性 中国南方
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下一代测序在孟德尔型运动障碍中的应用(英文)
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作者 王裕民 潘序雅 +9 位作者 薛丹 李雨薇 张雪莹 邝彪 郑嘉博 邓昊 李小玲 熊炜 曾朝阳 李桂源 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期197-205,共9页
在过去10年中,下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)得到了十分迅速的发展。与传统测序相比,NGS具有高通量和高灵敏性等优点。孟德尔型运动障碍是一类常见的神经疾病。由于样本较少等原因,通过连锁分析等传统方法寻找新的孟... 在过去10年中,下一代测序技术(next generation sequencing,NGS)得到了十分迅速的发展。与传统测序相比,NGS具有高通量和高灵敏性等优点。孟德尔型运动障碍是一类常见的神经疾病。由于样本较少等原因,通过连锁分析等传统方法寻找新的孟德尔型运动障碍尤其是罕见疾病的致病基因已经变得越来越困难,而NGS则可作为发现新的致病基因的理想手段。目前NGS已被应用于多种孟德尔型运动障碍的研究。本文将从基因组和转录组的角度对NGS在孟德尔型运动障碍中的最新应用进行综述,并展望NGS在罕见孟德尔型疾病中的应用。 展开更多
关键词 下一代测序 运动障碍 孟德尔型疾病
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致瘤性DNA病毒的整合机制及致瘤效应 被引量:2
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作者 喻正源 宋亚莉 +5 位作者 龚朝建 曾朝阳 卢建红 李小玲 熊炜 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第4期324-331,共8页
恶性肿瘤是一种严重危害人类生命和健康的疾病,而致瘤性DNA病毒是多种恶性肿瘤的主要致病因子.致瘤性DNA病毒的整合可以使宿主细胞正常组织逐步向炎症组织转变,并可导致癌变.病毒整合可引起宿主细胞基因组不稳定和重排,产生新的融合基因... 恶性肿瘤是一种严重危害人类生命和健康的疾病,而致瘤性DNA病毒是多种恶性肿瘤的主要致病因子.致瘤性DNA病毒的整合可以使宿主细胞正常组织逐步向炎症组织转变,并可导致癌变.病毒整合可引起宿主细胞基因组不稳定和重排,产生新的融合基因,并导致宿主基因表达异常,也是病毒本身得以复制,逃避宿主免疫识别并长期维系自我生存的机制之一.本文综述了目前对致瘤性DNA病毒整合规律以及致瘤性DNA病毒整合致瘤效应的研究和进展,并展望致瘤性DNA病毒整合的研究方向以及在肿瘤发生、发展、诊断和治疗上的应用前景. 展开更多
关键词 致瘤性DNA病毒 整合 肿瘤 基因组 新一代测序技术
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PLUNC蛋白家族在抑制鼻咽上皮“炎.癌”演进中的作用和机制 被引量:2
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作者 魏芳 李夏雨 +9 位作者 李小玲 张文玲 廖前进 曾勇 龚朝建 周鸣 马健 熊炜 沈守荣 曾朝阳 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2014年第1期24-31,共8页
人类鼻咽黏膜表面的分泌物中富含天然免疫蛋白,腭、肺及鼻咽上皮克隆(palate,lung and nasal epithelium clone,PLUNC)蛋白家族成员SPLUNC1和LPLUNC1就是其中的重要组成部分,这两个蛋白在鼻咽上皮相对特异高表达,它们都具有杀菌/渗透增... 人类鼻咽黏膜表面的分泌物中富含天然免疫蛋白,腭、肺及鼻咽上皮克隆(palate,lung and nasal epithelium clone,PLUNC)蛋白家族成员SPLUNC1和LPLUNC1就是其中的重要组成部分,这两个蛋白在鼻咽上皮相对特异高表达,它们都具有杀菌/渗透增强蛋白(bactericidal/permeability-increasing protein,BPI)结构域,可通过BPI结构域与细菌脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)结合从而直接杀灭或抑制细菌生长,也可以有效抑制EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)等致癌微生物对鼻咽上皮的侵袭从而发挥其免疫防御功能.它们还可以通过抑制IL-6等炎症因子的分泌和NF-κB、STAT3等炎症相关通路的激活,阻止鼻咽部的慢性炎症反应及鼻咽上皮的恶性转化.在鼻咽癌细胞中重新表达PLUNC蛋白,可以通过促分裂素原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase,MAPK)或miR-141-PTEN-AKT等信号通路抑制鼻咽癌细胞的增殖,促进鼻咽癌细胞的凋亡.进一步深入研究PLUNC蛋白家族在鼻咽癌发病中的作用机制,对指导鼻咽癌的防治具有重要的意义. 展开更多
关键词 PLUNC蛋白家族 炎症 鼻咽癌
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