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人支气管上皮不典型增生与浸润癌组织的比较蛋白质组学研究
被引量：
3
1
作者
吴晓英
陈主初
+5 位作者
肖志强
李萃
汪春年
李建玲
冯雪萍
张鹏飞
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第11期1006-1017,共12页
为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物 ,采用改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 (two dimensionalelectrophoresis,2 DE) ,应用ImageMaster 2D分...
为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物 ,采用改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 (two dimensionalelectrophoresis,2 DE) ,应用ImageMaster 2D分析软件、Student’st 检验识别差异蛋白质点 ,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assistedlaserdesorption/ionizationtime of flightmassspectrometry ,MALDI TOF MS)得到相应的肽质指纹图 (peptidemassfingerprint,PMF) ,搜索数据库鉴定差异蛋白质 .由此获得人支气管上皮不典型增生和浸润癌组织的 2 DE图谱及其凝胶的平均蛋白质点数 (12 73 0 0± 4 3 31,132 6 0 0± 6 6 6 3) ,且两阶段间平均差异蛋白质点数为 5 6 0 0± 8 96 .取 38个差异蛋白质点进行PMF分析 ,鉴定出一些与细胞生长、分化或肿瘤发生等有关的蛋白质 ,随即应用免疫组化检测差异蛋白质EGFR、c Jun、Mdm2在两类组织中的表达 ,其结果也显示了类似的表达差异 .支气管上皮不典型增生恶性转化过程中存在蛋白质的差异表达 ,这些差异蛋白质可能以不同的方式参与了癌变过程 ,且EGFR、c Jun、Mdm2的免疫组化验证结果与质谱结果的一致性表明 。
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关键词
比较蛋白质组学
人支气管上皮
差异表达蛋白质
免疫组化
分子标志物
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职称材料
人支气管上皮蛋白质样品制备方法及其癌变各阶段组织2-DE图谱的建立
2
作者
吴晓英
肖志强
+5 位作者
陈主初
李萃
李建玲
冯雪萍
易红
李茂玉
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期376-381,共6页
目的 :改良、优化支气管上皮组织的蛋白质样品制备方法 ,建立人支气管上皮癌变过程各阶段组织的2 DE图谱 ,为识别鉴定肺鳞癌癌变相关蛋白质奠定基础。方法 :收集、筛选人支气管正常上皮、鳞状化生、不典型增生和上皮浸润癌组织标本。...
目的 :改良、优化支气管上皮组织的蛋白质样品制备方法 ,建立人支气管上皮癌变过程各阶段组织的2 DE图谱 ,为识别鉴定肺鳞癌癌变相关蛋白质奠定基础。方法 :收集、筛选人支气管正常上皮、鳞状化生、不典型增生和上皮浸润癌组织标本。改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质 ,应用固相 pH梯度双向凝胶电泳分离各阶段组织的总蛋白质 ,凝胶经银染显色后 ,用ImageMaster 2D软件分析双向电泳图谱。结果 :应用改良的DOC TCA法提纯的支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 ,可获得分辨率高、重复性好的人支气管上皮组织的双向电泳图谱。正常上皮、鳞状化生、不典型增生和浸润癌 4种组织凝胶的蛋白质点数依次为 1 1 90± 6 3,1 2 2 7± 6 9,1 2 72± 71 ,1 32 6± 82。选取同例鳞状上皮化生组织进行 3次重复性检测 ,3块凝胶的平均蛋白质点数为 1 2 1 6± 75 ,平均匹配点数为 1 0 82± 6 7,匹配率达 89.3% ,且 3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性 ,不同胶间蛋白质点在IEF方向的偏差为 (0 .835± 0 .2 4 7)mm ,在SDS PAGE方向上的偏差为 (0 .92 1± 0 .1 0 4 )mm。结论 :改良的DOC TCA沉淀法是一种较好的支气管上皮组织蛋白质样品制备法 。
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关键词
人支气管上皮
癌前病变
双向凝胶电泳
蛋白质表达谱
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职称材料
题名
人支气管上皮不典型增生与浸润癌组织的比较蛋白质组学研究
被引量：
3
1
作者
吴晓英
陈主初
肖志强
李萃
汪春年
李建玲
冯雪萍
张鹏飞
机构
中南大学
湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室
中南大学
湘雅
医学院
肿瘤研究所
中南大学基础医学院超微结构教研室
中南大学基础医学院超微结构教研室
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004年第11期1006-1017,共12页
基金
国家重点基础研究发展规划项目 ( 973 ) ( 2 0 0 1CB5 10 2 0 7)
教育部跨世纪优秀人才基金项目 (教育部科技函 [2 0 0 2 ] 48号 )
+4 种基金
国家自然科学基金项目 ( 3 0 0 0 0 0 2 8
3 0 2 40 0 5 6
3 0 3 70 64 2 )
湖南省科技厅重大和重点科研项目 ( 0 4XK10 0 1
0 2SSS
文摘
为筛选支气管上皮鳞状不典型增生进展的分子标志物 ,采用改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 (two dimensionalelectrophoresis,2 DE) ,应用ImageMaster 2D分析软件、Student’st 检验识别差异蛋白质点 ,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix assistedlaserdesorption/ionizationtime of flightmassspectrometry ,MALDI TOF MS)得到相应的肽质指纹图 (peptidemassfingerprint,PMF) ,搜索数据库鉴定差异蛋白质 .由此获得人支气管上皮不典型增生和浸润癌组织的 2 DE图谱及其凝胶的平均蛋白质点数 (12 73 0 0± 4 3 31,132 6 0 0± 6 6 6 3) ,且两阶段间平均差异蛋白质点数为 5 6 0 0± 8 96 .取 38个差异蛋白质点进行PMF分析 ,鉴定出一些与细胞生长、分化或肿瘤发生等有关的蛋白质 ,随即应用免疫组化检测差异蛋白质EGFR、c Jun、Mdm2在两类组织中的表达 ,其结果也显示了类似的表达差异 .支气管上皮不典型增生恶性转化过程中存在蛋白质的差异表达 ,这些差异蛋白质可能以不同的方式参与了癌变过程 ,且EGFR、c Jun、Mdm2的免疫组化验证结果与质谱结果的一致性表明 。
关键词
比较蛋白质组学
人支气管上皮
差异表达蛋白质
免疫组化
分子标志物
Keywords
comparative proteomics
bronchial epithelial tissue
differential expression protein
immunohistochemistry
molecular markers
分类号
Q50 [生物学—生物化学]
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
人支气管上皮蛋白质样品制备方法及其癌变各阶段组织2-DE图谱的建立
2
作者
吴晓英
肖志强
陈主初
李萃
李建玲
冯雪萍
易红
李茂玉
机构
中南大学
湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室
中南大学基础医学院超微结构教研室
湘稚
医学院
肿瘤研究所
出处
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第4期376-381,共6页
基金
国家"973"计划(2001CB5102)
教育部跨世纪优秀人才基金([2002]48号)
+5 种基金
国家自然科学基金(30000028
30240056
30370642)
湖南省科委重点科研项目(02SSSY20011)
湖南省自然科学基金(03JJY4029)
湖南省卫生厅重点科研项目(Z02-04)
文摘
目的 :改良、优化支气管上皮组织的蛋白质样品制备方法 ,建立人支气管上皮癌变过程各阶段组织的2 DE图谱 ,为识别鉴定肺鳞癌癌变相关蛋白质奠定基础。方法 :收集、筛选人支气管正常上皮、鳞状化生、不典型增生和上皮浸润癌组织标本。改良的脱氧胆酸 三氯醋酸 (deoxycholate trichloroaeticacid ,DOC TCA)法提纯支气管上皮总蛋白质 ,应用固相 pH梯度双向凝胶电泳分离各阶段组织的总蛋白质 ,凝胶经银染显色后 ,用ImageMaster 2D软件分析双向电泳图谱。结果 :应用改良的DOC TCA法提纯的支气管上皮总蛋白质进行双向电泳 ,可获得分辨率高、重复性好的人支气管上皮组织的双向电泳图谱。正常上皮、鳞状化生、不典型增生和浸润癌 4种组织凝胶的蛋白质点数依次为 1 1 90± 6 3,1 2 2 7± 6 9,1 2 72± 71 ,1 32 6± 82。选取同例鳞状上皮化生组织进行 3次重复性检测 ,3块凝胶的平均蛋白质点数为 1 2 1 6± 75 ,平均匹配点数为 1 0 82± 6 7,匹配率达 89.3% ,且 3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性 ,不同胶间蛋白质点在IEF方向的偏差为 (0 .835± 0 .2 4 7)mm ,在SDS PAGE方向上的偏差为 (0 .92 1± 0 .1 0 4 )mm。结论 :改良的DOC TCA沉淀法是一种较好的支气管上皮组织蛋白质样品制备法 。
关键词
人支气管上皮
癌前病变
双向凝胶电泳
蛋白质表达谱
Keywords
human bronchial epithelium
pre-neoplastic lesions
two dimensional polyacryla mide gel electrophoresis
protein profile
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人支气管上皮不典型增生与浸润癌组织的比较蛋白质组学研究
吴晓英
陈主初
肖志强
李萃
汪春年
李建玲
冯雪萍
张鹏飞
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2004
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
人支气管上皮蛋白质样品制备方法及其癌变各阶段组织2-DE图谱的建立
吴晓英
肖志强
陈主初
李萃
李建玲
冯雪萍
易红
李茂玉
《中南大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2004
0
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