目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有...目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有效成分,与Drugbank收集的慢性荨麻疹小分子药物计算化学描述符进行比较,通过“rule of five”筛选类药性成分,并进一步与慢性荨麻疹小分子药物的功效进行主成分分析,得到潜在活性成分及其靶点;检索GeneCards和OMIM疾病数据库获取慢性荨麻疹疾病靶点,与潜在活性成分靶点通过映射取交集,作为固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的作用靶标,并进行GO和KEGG通路富集分析;同时将作用靶标导入STRING数据库,对靶标间的相互作用进行分析,分析结果导入Cytoscape软件进行MCODE聚类和网络括扑性质分析,得到核心靶标,将核心靶标导入BioGPS数据库,分析核心靶标在皮肤和淋巴结以及CD4+T细胞和CD8+T细胞中的表达丰度,同时对核心靶标进行KEGG通路富集分析。结果检索得到固本抗敏方成分1124个和有关慢性荨麻疹西药小分子药物25种;类药性和主成分分析筛选出潜在活性成分349个,预测得到90个作用靶点;MCODE聚类和网络括扑性质分析得到HIF1A、IL6、MAPK3等10个等核心靶标,这些核心靶标在皮肤、淋巴结、CD4+T细胞、CD8+T细胞均有表达,且与炎症反应等多个生物过程、分子组成和细胞功能有关,其中包含HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等多条信号通路。分子对接结果表明去氧紫草素、yinyanghuoA和9alpha-hydroxyfraxinellone-9-o-beta-d-glucosid等活性成分通过INS、MAPK3、JAK2等靶标调控GBKMF治疗银屑病的治疗机制。结论固本抗敏方治疗慢性荨麻疹具有多成分-多靶点-多通路特点,其作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等信号通路有关。展开更多
目的:系统性分析与评价目前针刺治疗糖尿病肾病(DN)疗效及机制研究的现有证据。方法:在国内外数据库中检索针刺治疗DN涉及机制相关生物标志物的人体或动物随机对照试验及疗效相关meta分析。对纳入文献的腧穴选择、腧穴归经、针刺治疗DN...目的:系统性分析与评价目前针刺治疗糖尿病肾病(DN)疗效及机制研究的现有证据。方法:在国内外数据库中检索针刺治疗DN涉及机制相关生物标志物的人体或动物随机对照试验及疗效相关meta分析。对纳入文献的腧穴选择、腧穴归经、针刺治疗DN机制研究中高频腧穴涉及生物标志物的分布进行总结与分析。通过SYRCLE或Cochrane偏倚风险评估工具对文献质量进行评价。结果:初筛764篇文献中,共纳入针刺治疗DN疗效相关meta分析3篇,针刺治疗DN机制研究35篇。纳入文献的总体质量中等。疗效分析表明在西医基础治疗上联合针刺治疗能够更好的减轻DN患者的24 h尿蛋白定量、降低血肌酐水平和降低尿白蛋白排泄率。文献中涉及腧穴共计49个,其中使用频次>10的高频腧穴共15个,排名前3位的分别为足三里31篇(88.6%)、肾俞28篇(80.0%)和三阴交21篇(60.0%)。观察指标方面,研究频次以糖代谢途径为主[涉及6项观察指标,研究频次最高的依次为空腹血糖(FBG)22篇、餐后2 h血糖(2 h PG)14篇];其次是免疫炎症途径[共10项指标,其中转化生长因子β1(TGF-β1)5篇,肿瘤坏死因子α(TNF-α)、CD_(3)^(+)、CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)T淋巴细胞各3篇];再次是氧化应激途径[共6项,其中羰基(PCO)5篇,丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)、8-羟基脱氧鸟苷(8-OHdG)各4篇]。排名前三位高频腧穴的研究指标多涉及糖代谢途径的FBG、2 h PG,氧化应激途径的PCO,以及免疫炎症途径的TGF-β1等。结论:针刺可有效改善DN患者肾功能水平,其可能机制以糖代谢和免疫炎症途径为主,部分涉及氧化应激及血流动力学途径,但在因果推断方面,仍需开展规范、高质量的研究加以验证。展开更多
目的基于网络药理学分析石菖蒲主要成分治疗神经退行性疾病(neurodegenerative diseases,ND)的作用靶点和机制。方法利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform)数据库检索和既往文...目的基于网络药理学分析石菖蒲主要成分治疗神经退行性疾病(neurodegenerative diseases,ND)的作用靶点和机制。方法利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform)数据库检索和既往文献证明得到石菖蒲的主要有效成分。在GeneCards,OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man),TTD(Therapeutic Target Database)数据库检索ND的相关靶点,并用Uniprot数据库进行标准化。构建ND和石菖蒲有效成分的共有靶点韦恩图和PPI网络图,进行GO(Gene ontology)注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,展示石菖蒲有效成分在治疗ND过程中疾病-靶点的关系。结果石菖蒲和ND的共有靶点总计为41个,关键靶点主要有FOS、ACHE、SLC6A4、ADRA1B、ADRA2A、MAOB、PTGS2、ADRA1A等。这些靶点涉及G蛋白偶联的胺受体活性、肾上腺素受体活性、儿茶酚胺结合、类固醇激素受体活性、神经递质受体活性、突触后神经递质受体活性等与突触间神经递质及其受体密切相关的生物过程、钙信号通路、cGMP-PKG信号通路和唾液分泌通路等信号通路。结论石菖蒲的主要有效成分可能通过对FOS、ACHE、SLC6A4、ADRA1B、MAOB等蛋白及相关通路的影响进而对神经神经递质受体或突触的损伤修复发挥治疗ND的作用,这为石菖蒲有效成分治疗ND的作用机制提供了新方向。展开更多
文摘目的基于网络药理学和分子对接的方法预测固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的靶点及相关信号通路,探讨其治疗慢性荨麻疹的作用机制。方法通过中医药生物信息分析网站(TCMSP,BATMAN-TCM,贝尔斯坦数据库,CNPD)并查阅文献,筛查和预测固本抗敏方有效成分,与Drugbank收集的慢性荨麻疹小分子药物计算化学描述符进行比较,通过“rule of five”筛选类药性成分,并进一步与慢性荨麻疹小分子药物的功效进行主成分分析,得到潜在活性成分及其靶点;检索GeneCards和OMIM疾病数据库获取慢性荨麻疹疾病靶点,与潜在活性成分靶点通过映射取交集,作为固本抗敏方治疗慢性荨麻疹的作用靶标,并进行GO和KEGG通路富集分析;同时将作用靶标导入STRING数据库,对靶标间的相互作用进行分析,分析结果导入Cytoscape软件进行MCODE聚类和网络括扑性质分析,得到核心靶标,将核心靶标导入BioGPS数据库,分析核心靶标在皮肤和淋巴结以及CD4+T细胞和CD8+T细胞中的表达丰度,同时对核心靶标进行KEGG通路富集分析。结果检索得到固本抗敏方成分1124个和有关慢性荨麻疹西药小分子药物25种;类药性和主成分分析筛选出潜在活性成分349个,预测得到90个作用靶点;MCODE聚类和网络括扑性质分析得到HIF1A、IL6、MAPK3等10个等核心靶标,这些核心靶标在皮肤、淋巴结、CD4+T细胞、CD8+T细胞均有表达,且与炎症反应等多个生物过程、分子组成和细胞功能有关,其中包含HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等多条信号通路。分子对接结果表明去氧紫草素、yinyanghuoA和9alpha-hydroxyfraxinellone-9-o-beta-d-glucosid等活性成分通过INS、MAPK3、JAK2等靶标调控GBKMF治疗银屑病的治疗机制。结论固本抗敏方治疗慢性荨麻疹具有多成分-多靶点-多通路特点,其作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、PI3K-Akt等信号通路有关。
文摘目的:系统性分析与评价目前针刺治疗糖尿病肾病(DN)疗效及机制研究的现有证据。方法:在国内外数据库中检索针刺治疗DN涉及机制相关生物标志物的人体或动物随机对照试验及疗效相关meta分析。对纳入文献的腧穴选择、腧穴归经、针刺治疗DN机制研究中高频腧穴涉及生物标志物的分布进行总结与分析。通过SYRCLE或Cochrane偏倚风险评估工具对文献质量进行评价。结果:初筛764篇文献中,共纳入针刺治疗DN疗效相关meta分析3篇,针刺治疗DN机制研究35篇。纳入文献的总体质量中等。疗效分析表明在西医基础治疗上联合针刺治疗能够更好的减轻DN患者的24 h尿蛋白定量、降低血肌酐水平和降低尿白蛋白排泄率。文献中涉及腧穴共计49个,其中使用频次>10的高频腧穴共15个,排名前3位的分别为足三里31篇(88.6%)、肾俞28篇(80.0%)和三阴交21篇(60.0%)。观察指标方面,研究频次以糖代谢途径为主[涉及6项观察指标,研究频次最高的依次为空腹血糖(FBG)22篇、餐后2 h血糖(2 h PG)14篇];其次是免疫炎症途径[共10项指标,其中转化生长因子β1(TGF-β1)5篇,肿瘤坏死因子α(TNF-α)、CD_(3)^(+)、CD_(4)^(+)、CD_(8)^(+)T淋巴细胞各3篇];再次是氧化应激途径[共6项,其中羰基(PCO)5篇,丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)、8-羟基脱氧鸟苷(8-OHdG)各4篇]。排名前三位高频腧穴的研究指标多涉及糖代谢途径的FBG、2 h PG,氧化应激途径的PCO,以及免疫炎症途径的TGF-β1等。结论:针刺可有效改善DN患者肾功能水平,其可能机制以糖代谢和免疫炎症途径为主,部分涉及氧化应激及血流动力学途径,但在因果推断方面,仍需开展规范、高质量的研究加以验证。
文摘目的基于网络药理学分析石菖蒲主要成分治疗神经退行性疾病(neurodegenerative diseases,ND)的作用靶点和机制。方法利用TCMSP(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform)数据库检索和既往文献证明得到石菖蒲的主要有效成分。在GeneCards,OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man),TTD(Therapeutic Target Database)数据库检索ND的相关靶点,并用Uniprot数据库进行标准化。构建ND和石菖蒲有效成分的共有靶点韦恩图和PPI网络图,进行GO(Gene ontology)注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,展示石菖蒲有效成分在治疗ND过程中疾病-靶点的关系。结果石菖蒲和ND的共有靶点总计为41个,关键靶点主要有FOS、ACHE、SLC6A4、ADRA1B、ADRA2A、MAOB、PTGS2、ADRA1A等。这些靶点涉及G蛋白偶联的胺受体活性、肾上腺素受体活性、儿茶酚胺结合、类固醇激素受体活性、神经递质受体活性、突触后神经递质受体活性等与突触间神经递质及其受体密切相关的生物过程、钙信号通路、cGMP-PKG信号通路和唾液分泌通路等信号通路。结论石菖蒲的主要有效成分可能通过对FOS、ACHE、SLC6A4、ADRA1B、MAOB等蛋白及相关通路的影响进而对神经神经递质受体或突触的损伤修复发挥治疗ND的作用,这为石菖蒲有效成分治疗ND的作用机制提供了新方向。
