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基于转录组学分析氟维司群治疗对单核-巨噬细胞趋化因子表达及极化的影响
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作者 刘宇婷 叶敬文 +7 位作者 刘泊含 刘鷖雯 何怡青 杜艳 张国良 郭倩 高锋 杨翠霞 《海南医科大学学报》 北大核心 2025年第14期1041-1049,1056,共10页
目的:肿瘤细胞获得对内分泌治疗药物的耐受性是ER+乳腺癌治疗失败的关键因素。肿瘤相关巨噬细胞是乳腺癌微环境中的重要成分,然而内分泌治疗药物对巨噬细胞的调控作用尚不清楚,本研究旨在探讨内分泌治疗药物氟维司群对单核-巨噬细胞极... 目的:肿瘤细胞获得对内分泌治疗药物的耐受性是ER+乳腺癌治疗失败的关键因素。肿瘤相关巨噬细胞是乳腺癌微环境中的重要成分,然而内分泌治疗药物对巨噬细胞的调控作用尚不清楚,本研究旨在探讨内分泌治疗药物氟维司群对单核-巨噬细胞极化的影响。方法:借助PMA诱导获得THP-1细胞来源的巨噬细胞,通过RT-qPCR、Western blot、流式细胞术验证氟维司群刺激后的巨噬细胞表面marker变化;通过RNA-Seq技术对氟维司群刺激后的巨噬细胞的转录组改变进行分析,筛选组间差异表达基因;结合GO功能与KEGG通路富集分析差异基因的功能;构建差异基因的蛋白相互作用网络并筛选Hub基因;最后通过RT-qPCR和趋化因子阵列实验验证氟维司群对巨噬细胞Hub基因中5种趋化因子表达的影响。结果:RT-qPCR、Western blot、流式细胞术分析结果表明氟维司群刺激后的巨噬细胞M2相关标志分子表达升高而M1相关标志分子表达降低;RNA-Seq结果显示,氟维司群刺激后的巨噬细胞出现118个差异表达基因;GO与KEGG富集分析结果显示差异基因富集于趋化因子相关功能和信号通路;蛋白互作网络和Hub基因筛选确定了CXCL8、CCL20、CCL22、CXCL10、CCL7 5个关键的趋化因子;对5个关键趋化因子进行RT-qPCR验证表明其表达趋势与RNA-Seq结果一致;趋化因子阵列实验证实氟维司群刺激后的巨噬细胞分泌的CXCL8、CCL20、CCL22增多,而CXCL10、CCL7减少。结论:内分泌治疗药物氟维司群使巨噬细胞M2相关分子CD206表达升高而M1相关分子CD86表达降低,同时使巨噬细胞M2相关趋化因子分泌增多而M1相关趋化因子分泌减少,提示氟维司群促进巨噬细胞向M2极化,抑制其向M1极化,可能与临床内分泌治疗耐药形成有关。 展开更多
关键词 乳腺癌 内分泌治疗耐药 巨噬细胞 趋化因子
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碳青霉烯类抗生素耐药肠杆菌科细菌中KPC酶的研究 被引量:11
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作者 汤瑾 蒋燕群 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2009年第6期446-450,共5页
目的了解上海部分医院肠杆菌科细菌中KPC酶的产生及耐药情况。研究KPC酶的分子生物学特性和blaKPC的转移和传播。方法在上海4所医院收集亚胺培南或美罗培南(纸片扩散法)中介或耐药的肠杆菌科菌株,PCR检测blaKPC、DNA测序、接合转移试验... 目的了解上海部分医院肠杆菌科细菌中KPC酶的产生及耐药情况。研究KPC酶的分子生物学特性和blaKPC的转移和传播。方法在上海4所医院收集亚胺培南或美罗培南(纸片扩散法)中介或耐药的肠杆菌科菌株,PCR检测blaKPC、DNA测序、接合转移试验、质粒电泳、Southern blot。结果在上海4所医院共收集到7株对亚胺培南药敏结果(纸片扩散法)中介或耐药的肠杆菌科细菌;PCR检测显示有2株菌株携带blaKPC-2;接合转移试验、质粒电泳、Southern blot试验显示blaKPC-2是由一个50kb大小的质粒携带。结论上海4所医院2006年的KPC酶的检出率还比较低;2株肠杆菌科菌株的blaKPC-2都是由1个50kb的质粒所携带。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药 KPC酶 肠杆菌科
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双套血培养对提高血流感染检出率和鉴别污染的评价 被引量:24
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作者 王坚镪 汤瑾 +2 位作者 庄亦晖 陈瑜 高锋 《中国感染与化疗杂志》 CAS 北大核心 2012年第6期440-442,共3页
目的评价双套血培养在提高血流感染检出率及鉴别污染的临床价值。方法统计2010—2011年上海交通大学附属第六人民医院双套血培养的双次阳性率和单次阳性率,评价双次阳性和单次阳性在鉴别血培养污染中的差异。结果我院2010—2011年共送... 目的评价双套血培养在提高血流感染检出率及鉴别污染的临床价值。方法统计2010—2011年上海交通大学附属第六人民医院双套血培养的双次阳性率和单次阳性率,评价双次阳性和单次阳性在鉴别血培养污染中的差异。结果我院2010—2011年共送检双套血培养3 151例,占全年送检病例数的71.2%。共检出483例阳性,阳性率15.33%。其中双次阳性192例,阳性率6.09%;单次阳性291例,阳性率9.23%。结论双套血培养能够提高血流感染检出率并能鉴别分离菌的定植或污染,建议临床在诊断血流感染时送检双套血培养。 展开更多
关键词 双套血培养 血流感染 检出率
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婴幼儿轮状病毒感染的综合表现与治疗 被引量:21
4
作者 杨忆辛 蒋燕群 +3 位作者 王健雄 刘引 孙德斌 汤瑾 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期652-653,666,共3页
关键词 婴幼儿 轮状病毒 病毒感染 临床表现 思密达 妈咪爱
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HBsAg和HBsAb双阳性慢性乙肝患者血清中HBV基因型与S区突变的关系 被引量:7
5
作者 王蕾 刘华 +2 位作者 宁小晓 庄瑜 高锋 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1226-1230,共5页
目的探讨HBsAg和HBsAb同时阳性(HBsAg+/HBsAb+)慢性乙肝患者血清中HBV基因型与S区氨基酸序列突变的关系。方法将43例HBsAg+/HBsAb+慢性乙肝患者作为实验组,并选取35例HBsAg+/HBsAb-慢性乙肝患者作为对照组,对血清中HBV DNA S区基因序列... 目的探讨HBsAg和HBsAb同时阳性(HBsAg+/HBsAb+)慢性乙肝患者血清中HBV基因型与S区氨基酸序列突变的关系。方法将43例HBsAg+/HBsAb+慢性乙肝患者作为实验组,并选取35例HBsAg+/HBsAb-慢性乙肝患者作为对照组,对血清中HBV DNA S区基因序列进行PCR扩增和测序,根据测序结果对患者的基因型进行分型并对S区氨基酸序列突变进行比对分析。结果实验组中B基因型8例、C基因型35例,对照组中B基因型9例、C基因型26例。实验组C基因型患者的年龄[(50.2±16.3)岁]明显大于B基因型[(34.4±13.4)岁](P=0.015);实验组B基因型和C基因型的S区氨基酸突变率分别为0.77%和1.64%(P=0.005);而对照组的B、C两种基因型的突变率分别为0.59%和0.49%(P=0.597)。同样为C基因型的两组患者,实验组S区氨基酸突变明显多于对照组(P=0.000),而且实验组S区氨基酸突变大多分布在主要亲水结构区域(MHR)α决定簇的第一个环状结构区内;而B基因型只有少数患者有α决定簇内的突变。结论 HBsAg+/HbsAb+的乙肝患者C基因型较B基因型更易发生突变;且C基因型患者的氨基酸突变大多发生于S区的α决定簇内,可能正是由于此种突变使HbsAg的抗原性发生改变,最终导致了HbsAg和HbsAb同时阳性。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 乙肝表面抗原 乙肝表面抗体 基因型 基因突变
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葡萄球菌对克林霉素诱导耐药的检测和分析 被引量:5
6
作者 汤瑾 王坚镪 蒋燕群 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2008年第1期50-52,共3页
目的调查临床分离的葡萄球菌对克林霉素诱导耐药状况和基因型特征。方法收集我院2004年分离到的70株红霉素耐药、克林霉素敏感和中介葡萄球菌临床分离株,双纸片法做克林霉素诱导耐药(D试验),PCR检测细菌的ermA、ermB、ermC和msrA基因。... 目的调查临床分离的葡萄球菌对克林霉素诱导耐药状况和基因型特征。方法收集我院2004年分离到的70株红霉素耐药、克林霉素敏感和中介葡萄球菌临床分离株,双纸片法做克林霉素诱导耐药(D试验),PCR检测细菌的ermA、ermB、ermC和msrA基因。结果70株葡萄球菌中克林霉素诱导耐药32株(45.7%)。基因型分别是ermA1株,ermC33株,msrA18株,ermC+msrA5株,全部阴性的13株。结论我院葡萄球菌克林霉素诱导耐药率较高,且存在多种基因型,应提高对诱导耐药葡萄球菌的监测和控制。 展开更多
关键词 克林霉素 葡萄球菌 D试验 erm基因 msrA基因
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大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌外膜蛋白与耐药机制的研究进展 被引量:9
7
作者 李俐 蒋燕群 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1433-1436,共4页
细菌的膜孔蛋白及其形成的孔道是细菌与外界交流的主要途径,也是抗生素透过细菌细胞膜的重要通道。细菌膜孔蛋白合成降低或膜孔蛋白缺失可阻碍抗生素进入细菌,从而引起细菌对抗生素耐药。在细菌的耐药机制研究方面,膜孔蛋白的作用日益... 细菌的膜孔蛋白及其形成的孔道是细菌与外界交流的主要途径,也是抗生素透过细菌细胞膜的重要通道。细菌膜孔蛋白合成降低或膜孔蛋白缺失可阻碍抗生素进入细菌,从而引起细菌对抗生素耐药。在细菌的耐药机制研究方面,膜孔蛋白的作用日益受到关注,文章从大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌入手,对其膜孔蛋白的特点、构成、合成调控机制及其与细菌耐药的关系进行综述。 展开更多
关键词 膜孔蛋白 耐药 大肠埃希菌 肺炎克雷伯菌
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71株葡萄球菌克林霉素诱导耐药分析 被引量:4
8
作者 汤瑾 王坚镪 蒋燕群 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2006年第2期110-112,共3页
目的了解我院2004年葡萄球菌临床分离株的克林霉素诱导耐药分布情况以及纸片距离对试验结果的影响。方法收集我院2004年分离到的红霉素耐药、克林霉素敏感和中介的葡萄球菌临床株71株,其中金葡菌16株,凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)55株... 目的了解我院2004年葡萄球菌临床分离株的克林霉素诱导耐药分布情况以及纸片距离对试验结果的影响。方法收集我院2004年分离到的红霉素耐药、克林霉素敏感和中介的葡萄球菌临床株71株,其中金葡菌16株,凝固酶阴性葡萄球菌(CNS)55株。双纸片法检测克林霉素诱导耐药(D试验),对D试验阳性菌株再次用纸片边缘距离分别为10~15mm,16~20mm,21~25mm,26-28mm4组测定D试验结果,了解纸片距离对D试验结果的影响。结果克林霉素的诱导耐药比例为45.1%,其中金葡菌组68.8%,CNS组38.2%,P〈0。05,差异具有非常显著性,纸片距离大于26mm会对D试验结果造成影响。结论实验室必须加强对葡萄球菌诱导耐药检测。 展开更多
关键词 克林霉素 葡萄球菌 诱导耐药 D试验
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青霉素结合蛋白与革兰阴性细菌耐药性的研究进展 被引量:8
9
作者 王欣慧 蒋燕群 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期820-822,F0003,共4页
青霉素结合蛋白(PBPs)的改变与β-内酰胺类抗生素的亲和力降低是革兰阳性球菌获得抗生素耐药性的重要机制之一,而在革兰阴性细菌中因PBPs的改变导致耐药的出现却十分少见,这一观点忽视了革兰阴性细菌中PBPs在β-内酰胺类抗生素耐药机制... 青霉素结合蛋白(PBPs)的改变与β-内酰胺类抗生素的亲和力降低是革兰阳性球菌获得抗生素耐药性的重要机制之一,而在革兰阴性细菌中因PBPs的改变导致耐药的出现却十分少见,这一观点忽视了革兰阴性细菌中PBPs在β-内酰胺类抗生素耐药机制中的作用。文章对PBPs的结构、功能、检测方法及与革兰阴性细菌耐药性的关系等方面的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 青霉素结合蛋白 革兰阴性细菌 耐药性
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用cDNA-AFLP技术筛选新生牛软骨无血管区的高表达基因 被引量:3
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作者 杜玉珍 高锋 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期55-59,共5页
软骨一直被认为是内源性血管生成抑制物的重要来源.为更好理解软骨血管生成抑制的遗传学基础,对软骨中与血管生成抑制有关的基因进行了初步的探索.本研究应用cDNA-AFLP技术对新生牛关节骨骺软骨无血管区和有血管区的差异表达基因进行分... 软骨一直被认为是内源性血管生成抑制物的重要来源.为更好理解软骨血管生成抑制的遗传学基础,对软骨中与血管生成抑制有关的基因进行了初步的探索.本研究应用cDNA-AFLP技术对新生牛关节骨骺软骨无血管区和有血管区的差异表达基因进行分析,筛选无血管区特异表达或高表达的基因,共得到43个无血管区高表达的片段.通过对片段进行亚克隆、测序及同源性分析,结果发现,16个片段与已知基因同源,25个片段只在牛的基因组数据库中找到同源序列,另有2个片段未找到同源序列.在同源基因中,肌钙蛋白Ⅰ亚型其血管生成抑制作用已有较详细报道;S100A7与血管生成和肿瘤发生的关系也已有阐述.另外14个同源基因按生物过程分析,发现参与了细胞周期调节、信号传递、细胞间相互作用及新陈代谢等多个生物过程.研究结果提示,牛软骨组织无血管区的无血管状态可能由多基因介导,其中一些可能是已知或未知的新基因. 展开更多
关键词 血管生成抑制物 牛软骨 cDNA-扩增片段长度多态性分析(cDNA-AFLP)
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斯钙素1的表达对肺癌细胞A549细胞周期及凋亡的影响 被引量:1
11
作者 李妮娅 左雪梅 +2 位作者 李莉 刘华 杜玉珍 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期641-647,共7页
背景与目的:斯钙素1(stanniocalcin l,STC1)在多种癌组织中表达上调,且与癌组织的恶性程度相关,但STC1在肺癌细胞中的分子作用机制尚不明确。本研究旨在探讨STC1的表达对肺癌细胞A549细胞周期及凋亡的影响。方法:构建STC1基因RNA干扰的... 背景与目的:斯钙素1(stanniocalcin l,STC1)在多种癌组织中表达上调,且与癌组织的恶性程度相关,但STC1在肺癌细胞中的分子作用机制尚不明确。本研究旨在探讨STC1的表达对肺癌细胞A549细胞周期及凋亡的影响。方法:构建STC1基因RNA干扰的肺癌细胞株A549-STC1-si RNA和对照细胞株A549-Vector,用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白[质]印迹法(Western blot)检测A549-Vector及A549-STC1-si RNA细胞株的细胞周期蛋白基因Cyclin A、Cyclin B1、Cyclin D1、Cyclin E、CDK2、CDK4,凋亡抑制基因Bcl-2、Bcl-xl及凋亡诱导基因Caspase-3、Bax、Bak、Bid的表达水平,用流式细胞术检测STC1基因对A549细胞周期的影响,用原位末端标记(terminal deoxynucleotidyl transferase-mediated nick-end labeling,TUNEL)检测STC1基因对A549细胞凋亡的影响。结果:与A549-Vector细胞相比,A549-STC1-si RNA的细胞周期蛋白基因Cyclin A、Cyclin B1、Cyclin D1、Cyclin E、CDK2和CDK4在转录和蛋白表达水平上均显著减少(P<0.05),G_0/G_1期细胞比例明显增加,S期及G_2/M期细胞比例降低(P<0.05),细胞周期受阻;A549-STC1-si RNA的凋亡抑制基因Bcl-2和Bcl-xl表达下调(P<0.05),而凋亡诱导基因Caspase-3、Bax、Bak及Bid显著上调(P<0.05);TUNEL实验表明,A549-STC1-si RNA细胞的凋亡率明显增加。结论:STC1基因的低表达可阻滞肺癌细胞A549的细胞周期,抑制细胞增殖,同时促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 斯钙素1 RNA干扰 细胞周期 细胞凋亡
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大肠埃希菌临床菌株中MicF的转录情况检测及分析 被引量:2
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作者 李俐 蒋燕群 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2011年第3期191-194,共4页
目的调查大肠埃希菌临床菌株中MicF的转录情况并分析其作用。方法选取上海交通大学附属第六人民医院2003—2009年间产AmpC酶的部分大肠埃希菌40株,对上述菌株进行药敏试验;实时定量反转录(RT)-PCR技术检测大肠埃希菌膜孔蛋白OmpF的表达... 目的调查大肠埃希菌临床菌株中MicF的转录情况并分析其作用。方法选取上海交通大学附属第六人民医院2003—2009年间产AmpC酶的部分大肠埃希菌40株,对上述菌株进行药敏试验;实时定量反转录(RT)-PCR技术检测大肠埃希菌膜孔蛋白OmpF的表达情况,并分为OmpF转录水平下调组和上调组,RT-PCR方法检测MicF的转录水平;用PCR扩增膜孔蛋白(ompF)基因。结果 ompF转录水平下调组耐药率明显高于上调组;ompF转录水平下调组MicF转录水平高于上调组。结论 MicF是大肠埃希菌膜孔蛋白重要的调控机制,可引起细菌耐药性增高。 展开更多
关键词 膜孔蛋白调控 非编码RNA 耐药机制
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多重PCR检测MRSA的SCCmec基因分型 被引量:6
13
作者 韩玉涛 蒋燕群 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2008年第3期206-210,共5页
目的了解我院MRSA的流行状况。方法收集2005年1—6月65株社区感染MRSA及60株医院感染MRSA,应用多重PCR对MRSA染色体mec基因盒(Staphylococcal cassette chromosome SCCmec)分型及杀白细胞毒素(PVL)基因检测,应用K-B纸片法进行药敏分析... 目的了解我院MRSA的流行状况。方法收集2005年1—6月65株社区感染MRSA及60株医院感染MRSA,应用多重PCR对MRSA染色体mec基因盒(Staphylococcal cassette chromosome SCCmec)分型及杀白细胞毒素(PVL)基因检测,应用K-B纸片法进行药敏分析。结果125株MRSA的mecA基因阳性,其中SCCmecⅡ型1株,SCCmecⅢ型120株,SCCmecⅣ型3株,未分型1株;未发现携带PVL基因的MRSA。携带SCCmecⅡ型、SCCmecⅢ型的菌株均为多重耐药株,而携带SCCmecⅣ型的菌株除对β内酰胺类药物耐药外,对其他类别的抗菌药敏感。结论本院分离的MRSA以SCCmecⅢ型为主,发现SCCmecⅣ型CA-MRSA,但不携带PVL基因;携带SCCmecⅡ、SCCmecⅢ的临床分离株耐药严重。 展开更多
关键词 社区获得耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 杀白细胞毒素 葡萄球菌染色体mec基因盒
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整合素β3在肺腺癌骨转移中的作用及应用价值 被引量:4
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作者 穆佳倩 滕小艳 +3 位作者 魏丽荣 仇荣 桂鹏程 杜玉珍 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期351-356,共6页
肺癌患者的5年生存率为14%~17%[1],转移是肺癌患者死亡的主要原因[2]。肺腺癌是肺癌最常见的病理学类型,骨骼是肺腺癌常见的转移部位[3],且以溶骨性骨转移多见[4]。肺癌发生骨转移后,易伴有骨痛、神经压迫和高钙血症等骨相关事件,严重... 肺癌患者的5年生存率为14%~17%[1],转移是肺癌患者死亡的主要原因[2]。肺腺癌是肺癌最常见的病理学类型,骨骼是肺腺癌常见的转移部位[3],且以溶骨性骨转移多见[4]。肺癌发生骨转移后,易伴有骨痛、神经压迫和高钙血症等骨相关事件,严重影响患者生存质量[5]。 展开更多
关键词 整合素Β3 肺腺癌 骨转移 外泌体
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