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运动转化医学:从分子生物力学管窥主动健康 被引量:3
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作者 樊春海 程蜀琳 《体育科学》 CSSCI 北大核心 2024年第1期3-11,20,共10页
运动在促进健康和预防疾病中一直发挥着积极的作用,大量研究已从多个维度提供了运动有益健康的科学证据,然而人们对其分子和细胞机制却知之甚少。不断深化运动的分子和细胞机制研究,破译特定类型的运动与人体特定组织之间的联系,并将相... 运动在促进健康和预防疾病中一直发挥着积极的作用,大量研究已从多个维度提供了运动有益健康的科学证据,然而人们对其分子和细胞机制却知之甚少。不断深化运动的分子和细胞机制研究,破译特定类型的运动与人体特定组织之间的联系,并将相关知识转化到医学和健康实践中来,仍是目前生命科学面临的巨大挑战。在这方面,新兴的系统生物学从信号网络系统层面提供了新的视角,为建立个性化的生活方式和干预方案奠定了基础。而一些全新的分子生物学概念及生物技术(如力敏感蛋白PIEZOs、自噬和微生物组学等)正在全面改变人类对运动(力信号刺激)影响人体系统的认知。研究分析了当前运动研究领域所面临的机遇与挑战,建议从生物力学以及运动科学跨维度交互作用的视角重新认知运动,研究健康敏感指标与运动即刻响应和适应性的相互关系与可信度,促进运动转化医学的发展。 展开更多
关键词 运动转化医学 主动健康 生物力学 机械刺激 自噬 多组学 中西医结合
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癌-睾丸抗原SPANXB在肝癌中的表达及其影响肝癌进展的机制研究
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作者 薛煜 张海龙 雷鸣 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期801-813,共13页
目的·分析癌-睾丸抗原(cancer-testis antigen,CTA)家族成员SPANXB(sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B)在肝癌中的表达及其与肝癌患者预后之间的相关性,并探究SPANXB对肝癌细胞增殖的影响及其潜在... 目的·分析癌-睾丸抗原(cancer-testis antigen,CTA)家族成员SPANXB(sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B)在肝癌中的表达及其与肝癌患者预后之间的相关性,并探究SPANXB对肝癌细胞增殖的影响及其潜在机制。方法·利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的肝癌样本数据,分析SPANXB在肝癌组织中的表达及其与患者生存期的相关性。构建稳定敲低SPANXB与稳定过表达SPANXB的肝癌细胞系,利用活细胞成像实验、EdU细胞增殖实验和平板克隆形成实验评估SPANXB对肝癌细胞增殖的影响。通过RNA测序(RNA-sequence,RNA-seq)探究SPANXB调控肝癌细胞增殖的相关通路,并利用细胞周期实验验证SPANXB对肝癌细胞周期的影响。采用免疫沉淀-质谱联用技术(immunoprecipitation-mass spectrometry,IP-MS)探索与SPANXB相互作用的蛋白,并使用免疫共沉淀(co-immunoprecipitation,Co-IP)进行验证。结果·SPANXB mRNA在肝癌组织中的表达高于正常组织(P=0.003),且与肝癌患者的生存期呈负相关。稳定敲低SPANXB可降低肝癌细胞的增殖能力、克隆形成能力,而稳定过表达SPANXB则可促进这些过程。RNA-seq的结果显示,SPANXB的敲低可下调DNA复制与G1/S细胞周期转换相关通路,细胞周期实验的结果显示SPANXB的敲低可导致肝癌细胞周期发生改变。IP-MS和Co-IP结果显示,SPAXNB与有丝分裂停滞缺陷2样蛋白1(mitotic arrest deficient 2-like protein 1,MAD2L1)、WD重复域蛋白5(WD repeat domain 5,WDR5)等细胞周期相关蛋白存在相互作用。结论·SPANXB的高表达与肝癌的预后呈负相关,其可能通过与MAD2L1、WDR5相互作用调控细胞周期并增强肝癌细胞的增殖活性。 展开更多
关键词 癌-睾丸抗原 SPANXB 肝癌 细胞周期
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基于质谱的单细胞分辨的空间蛋白质组学新技术研究
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作者 沈枫林 冯兆莹 +3 位作者 方静 张磊 刘晓慧 周新文 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2024年第11期48-60,共13页
细胞的异质性普遍存在,单细胞及单细胞分辨的空间蛋白质组学的研究能够帮助人类更加深入地了解疾病机理.然而,受限于单细胞中蛋白含量低以及检测技术灵敏度等问题,单细胞分辨的蛋白质组学的发展面临着一系列重大技术挑战.近年来,随着质... 细胞的异质性普遍存在,单细胞及单细胞分辨的空间蛋白质组学的研究能够帮助人类更加深入地了解疾病机理.然而,受限于单细胞中蛋白含量低以及检测技术灵敏度等问题,单细胞分辨的蛋白质组学的发展面临着一系列重大技术挑战.近年来,随着质谱仪器的灵敏度、分辨率和扫描速度等方面的提升,许多新的基于质谱的单细胞分辨率的空间蛋白组学新技术被开发出来,并用于定量单个细胞中数千种的蛋白,给疾病、环境和医药等研究领域提供了高分辨的数据,具有广阔的应用前景.本文综合评述了这些基于质谱的单细胞分辨率的空间蛋白质组学的新技术,并对其未来的发展趋势进行了展望. 展开更多
关键词 单细胞蛋白质组学 空间蛋白质组学 质谱技术
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基于3D打印矫形器三点力学数据与机器学习的特发性脊柱侧弯Cobb角预测及临床评价
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作者 马寻君 李娅 +3 位作者 蔚俊 刘海涛 吴云成 王金武 《医用生物力学》 北大核心 2025年第2期364-370,共7页
目的构建基于3D打印矫形器三点力学数据与多种机器学习算法的青少年特发性脊柱侧弯(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)Cobb角预测模型,以提供一种创新、无辐射的AIS早期临床筛查和监测方法。方法采集AIS患者的临床数据及3D打印矫形... 目的构建基于3D打印矫形器三点力学数据与多种机器学习算法的青少年特发性脊柱侧弯(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)Cobb角预测模型,以提供一种创新、无辐射的AIS早期临床筛查和监测方法。方法采集AIS患者的临床数据及3D打印矫形器的力学数据,构建包含性别、年龄、疾病类型、体重和Risser评分等特征的综合数据集。使用随机森林、支持向量回归、梯度提升回归机、极限梯度提升、轻量级梯度提升机和类别提升6种算法构建并评估Cobb角预测模型性能。结果梯度提升回归机模型在多项评估指标上表现最佳,精确率达到0.937、召回率为0.818、F1分数为0.949、曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.843,在验证集中该模型的预测值准确率达到0.942,与实际Cobb值拟合较好。结论基于力学数据和机器学习的Cobb角预测模型有效避免了早期临床筛查中传统全脊柱X线片检查的辐射风险,实现了AIS患者的非侵入性评估,提高了筛查和监测的安全性和效率,为临床医生提供了有力的辅助决策工具,具有重要的临床意义。 展开更多
关键词 特发性脊柱侧弯 3D打印矫形器 Cobb角预测 机器学习 非辐射评估
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高校工程技术实践平台构建与创新能力培养
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作者 冯兆莹 万克明 蔚俊 《实验室研究与探索》 北大核心 2025年第3期189-194,共6页
为提升研究生的工程创新能力,培育壮大新兴产业工程人才队伍,建设了面向工程创新能力培养的高校工程技术实践平台。在高质量发展背景下,围绕工程能力培养,从实践环境、课程体系、教学方法等方面出发,分析了我国工程技术实践平台存在的... 为提升研究生的工程创新能力,培育壮大新兴产业工程人才队伍,建设了面向工程创新能力培养的高校工程技术实践平台。在高质量发展背景下,围绕工程能力培养,从实践环境、课程体系、教学方法等方面出发,分析了我国工程技术实践平台存在的主要问题。以转化医学国家科学中心(上海)为例,开展以工程创新能力培养为核心的多学科交叉工程技术创新实践平台建设,探索构建了创新培养系统、复合式工程实践课程体系、多元化教学方法和多维度评估体系,促进了新质生产力和高校内涵式高质量发展,为高校工程技术实践平台建设提供理论指导和经验参考。 展开更多
关键词 工程创新能力 工程技术实践平台 多学科交叉
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多中心结直肠癌临床研究生物样本库信息系统的建设与管理 被引量:1
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作者 孔伟名 吕文文 +2 位作者 姜嘉媛 冯铁男 俞章盛 《协和医学杂志》 CSCD 2022年第4期664-669,共6页
近年来,我国结直肠癌的发病率显著升高。随着对结直肠癌复发、转移机制的深入探索,可提供全面生物医学信息的生物样本库信息系统显得尤为重要。本文阐述了采用微服务架构构建包含临床电子数据采集系统、生物样本管理系统和生物信息数据... 近年来,我国结直肠癌的发病率显著升高。随着对结直肠癌复发、转移机制的深入探索,可提供全面生物医学信息的生物样本库信息系统显得尤为重要。本文阐述了采用微服务架构构建包含临床电子数据采集系统、生物样本管理系统和生物信息数据平台三个子系统的多中心结直肠癌临床研究生物样本库信息系统,同时介绍各子系统在多中心临床研究中的管理模式和特色功能;并通过统一化编码规则、结构化临床信息、标准化样本流转信息和规范化数据存储等数据标准化管理方案,保障数据质量和互联互通,从而为推进转化医学研究和精准医疗发展提供全方位生物医学信息。 展开更多
关键词 多中心 临床研究 生物样本库 信息系统
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3D打印矫形鞋垫在扁平足中应用的系统综述 被引量:8
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作者 黄承兰 侯俞彤 +8 位作者 杨云霄 曾红 张子砚 赵文宽 王赞博 单春雷 戴尅戎 蔡斌 王金武 《中国康复理论与实践》 CSCD 北大核心 2023年第4期416-422,共7页
目的了解矫形鞋垫的分类,3D打印矫形鞋垫常用技术、常用材料及其在扁平足中的应用。方法检索PubMed、Web of Science、中国知网和万方数据库2012年至2022年发表的相关文献,总结相关内容。结果最终纳入文献10篇,来自5个国家,涉及290例参... 目的了解矫形鞋垫的分类,3D打印矫形鞋垫常用技术、常用材料及其在扁平足中的应用。方法检索PubMed、Web of Science、中国知网和万方数据库2012年至2022年发表的相关文献,总结相关内容。结果最终纳入文献10篇,来自5个国家,涉及290例参与者,发表时间主要集中于2019年至2022年。矫形鞋垫可分为预制型、半定制型和定制型,其中定制型可分为传统定制型和3D打印定制型。3D打印制作矫形鞋垫时常选择的打印技术为选择性激光烧结、熔融沉积成型(FDM)和PolyJet打印,材料包括乙烯醋酸乙烯酯(EVA)、聚乳酸、热塑性聚氨酯、聚酰胺、聚丙烯。3D打印矫形鞋垫应用于扁平足,改善足底压力,缓解足部疼痛,联合使用鞋垫张贴能有效控制后足外翻。结论3D打印定制鞋垫的制作效率和精确度优于传统定制鞋垫;常选择的打印技术和材料主要为FDM和EVA。3D打印矫形鞋垫可对扁平足足底压力、舒适度和足部运动功能产生积极影响。 展开更多
关键词 足弓 扁平足 3D打印 个性化 矫形鞋垫 系统综述
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基于R-shiny的临床数据分析应用 被引量:2
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作者 崔怡丹 魏婷 +1 位作者 孔伟名 俞章盛 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2022年第1期149-152,共4页
目的针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用。方法基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上。以UK Biobank乳腺癌数据为... 目的针对临床数据变量类型多、数据结构复杂的特征,基于R-shiny开发交互式分析临床数据并展示结果的应用。方法基于R-shiny与R语言,搭建应用的UI(用户界面)和Server(后台功能),将相应代码封装并部署在网页上。以UK Biobank乳腺癌数据为例,对其临床及基因数据进行分析,查看R-shiny应用的分析效果。结果构建出能够交互式分析临床数据的R-shiny应用,可供用户上传临床数据、生存型数据及基因数据进行分析。将UK Biobank数据作为示例进行分析,得到了具有临床与生物学意义的结果。结论将R-shiny与临床数据分析结合,为使用者提供了分析临床数据的简便方式,并为UK Biobank数据提供新的交互式展示分析平台。 展开更多
关键词 R-shiny 临床数据 生存分析 变量选择 GWAS
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针对泛素化与去泛素化酶的化学探针
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作者 梁家伟 武世典 +1 位作者 王天 郑清芸 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第4期824-840,共17页
蛋白质泛素化对真核细胞内几乎所有生理过程都具备调控作用。新的泛素化与去泛素化酶的发现、功能机制研究及相关化学分子干预是该领域的重要科学命题。针对泛素化与去泛素化酶的化学探针开发促进了人们对于蛋白质泛素化的形成、募集、... 蛋白质泛素化对真核细胞内几乎所有生理过程都具备调控作用。新的泛素化与去泛素化酶的发现、功能机制研究及相关化学分子干预是该领域的重要科学命题。针对泛素化与去泛素化酶的化学探针开发促进了人们对于蛋白质泛素化的形成、募集、信号传导及脱除过程中所涉及生化事件的理解。本文总结了近年来针对泛素化与去泛素化酶化学探针的发展,归纳了不同类型探针的化学结构及合成方法,并讨论了它们的各类应用,包括筛查泛素依赖的信号传导系统、监控泛素相关酶活性、辅助泛素相关的识别和催化过程的分子机制解析等。 展开更多
关键词 翻译后修饰 泛素 泛素化学探针
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