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基于人类全基因表达谱技术对“肾精亏虚证”原发性骨质疏松患者差异基因表达分析 被引量:9
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作者 辛华 谢晚晴 +2 位作者 蒋宁 孙丽 郑洪新 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1180-1185,共6页
目的基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,检测肾精亏虚证骨质疏松患者和同龄健康状态老年人血液中的差异基因表达,探讨肾精亏虚证骨质疏松症的发病机制,为中医药防治该病证提供可能的作用靶点。方法从辽宁中医药大学附属医院和上... 目的基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,检测肾精亏虚证骨质疏松患者和同龄健康状态老年人血液中的差异基因表达,探讨肾精亏虚证骨质疏松症的发病机制,为中医药防治该病证提供可能的作用靶点。方法从辽宁中医药大学附属医院和上海中医药大学附属龙华医院门诊肾精亏虚证原发性骨质疏松症患者群中随机选择16例患者,男女各半,年龄60岁以上,作为OP组(OP group);同龄健康状态老年人24例,男女各半,年龄60岁以上,作为对照组。采用人类全基因表达谱芯片检测两组人群的差异基因表达,并对差异显著的基因表达进行荧光定量PCR验证。结果在肾精亏虚证OP患者中共有602个基因呈现差异性表达,其中上调基因579个,下调基因23个(FC≥1.5或FC≤0.667,q-value≤5%)。表达上调超过3倍的基因有7个,分别为S100P、SNX3、DEFA1、MMP9、ANXA3、IL1R2、PLSCR1;表达下调超过2倍的基因有3个,分别为CX3CR1、SPON2、GNLY。对以上10个差异显著的基因进行RT-PCR验证,结果与基因芯片检测结果一致。结论肾精亏虚证OP患者与同龄健康老年人比较,差异基因表达上调或下调显著,这些基因通过调控免疫应答、防御应答、趋化因子信号转导通路等方面在肾精亏虚证OP的发病过程中可能发挥着重要的作用。 展开更多
关键词 肾精亏虚 骨质疏松 高通量 差异基因
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基于干扰管理的高吞吐无线多跳网络基站选址算法 被引量:7
2
作者 石雷 刘正丽 +2 位作者 韩江洪 石怡 魏振春 《电子测量与仪器学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期389-399,共11页
为减少无线节点数据并发传输干扰,提高网络数据传输效率,在多跳无线网络中,设计了基于干扰管理的高吞吐基站选址算法。首先根据网络中节点位置的稀疏程度确定基站坐标的可行区域.然后通过对串行干扰消除技术特点的研究,发现基站位置应... 为减少无线节点数据并发传输干扰,提高网络数据传输效率,在多跳无线网络中,设计了基于干扰管理的高吞吐基站选址算法。首先根据网络中节点位置的稀疏程度确定基站坐标的可行区域.然后通过对串行干扰消除技术特点的研究,发现基站位置应尽可能远离两两节点之间的中垂线。基于此,设计相关算法实现将可行区域划分成若干小区域,并提出通过一种"收缩"的方式在每一小区域内确定一点,作为基站选址的备选位置。最后,从备选位置中选出对网络吞吐量改善效果最好的一点作为基站的最终位置。仿真显示该算法能使网络整体性能提升10%~70%。 展开更多
关键词 干扰管理 串行干扰消除 基站选址 网络吞吐量
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胡麻连作对土壤细菌群落的影响 被引量:5
3
作者 王立光 叶春雷 +2 位作者 陈军 李进京 罗俊杰 《干旱地区农业研究》 CSCD 北大核心 2022年第1期70-75,共6页
采集种植1、2 a和3 a的胡麻土壤,利用高通量测序技术对不同胡麻连作年限土壤细菌群落进行测定,旨在揭示不同连作年限对胡麻土壤细菌群落结构和多样性的影响。结果表明:连作3 a土壤样本细菌OTU数目最多,为1773条,细菌群落丰度指数(Chao指... 采集种植1、2 a和3 a的胡麻土壤,利用高通量测序技术对不同胡麻连作年限土壤细菌群落进行测定,旨在揭示不同连作年限对胡麻土壤细菌群落结构和多样性的影响。结果表明:连作3 a土壤样本细菌OTU数目最多,为1773条,细菌群落丰度指数(Chao指数1759.07和Ace指数1741.89)最高,而细菌群落多样性(Shannon指数T1(6.45)>T2(6.41)>T3(6.33),Simpson指数T1(0.0034)<T2(0.0037)<T3(0.0074))随着连作年限增长而降低;不同连作年限胡麻土壤内共获得36门的细菌,且优势菌门(丰度占比>0.01)都为变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和绿湾菌门(Chloroflexi)等12个菌门,但各优势菌门在各样本中所占的丰度不同;随着连作年限增加,变形菌门丰度(T1(31.74%)>T2(27.69%)>T3(25.21%))逐渐降低,酸杆菌门丰度(T119.39%,T221.99%,T314.28%)和拟杆菌门丰度(Bacteroidetes,T17.29%,T28.72%,T32.59%)先增加后降低,放线菌门丰度(T1(12.16%)<T2(15.38%)<T3(24.12%))和绿湾菌门丰度(T1(9.58%)<T2(10.99%)<T3(11.82%))逐渐增加。土壤细菌群落β多样性分析显示,连作显著改变土壤细菌的群落结构,其影响随连作年限增长而增强。研究表明胡麻连作降低土壤细菌多样性,影响细菌群落结构组成。 展开更多
关键词 胡麻 连作 高通量测序 土壤细菌群落
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组合化学法在筛选真空紫外荧光材料中的应用 被引量:5
4
作者 陈雷 陈士夫 程继贵 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第5期921-926,共6页
综述了近年来组合化学法在筛选新型真空紫外荧光材料研究方面取得的进展,包括组合材料库的并行合成和高通量表征技术,并重点介绍了组合材料库的设计艺术,最后列举了组合化学法筛选真空紫外荧光材料体系研究的实例及结果.
关键词 组合化学法 真空紫外 荧光材料 并行合成 高通量表征
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基因组DNA高通量提取技术及其在骨髓库捐献者样本HLA基因分型中的应用 被引量:3
5
作者 王大明 唐斯 +3 位作者 李桢 程曦 高素青 邓志辉 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2009年第5期1265-1268,共4页
本研究旨在建立从全血EDTA抗凝样本中高通量提取基因组DNA的有效方法,以常规应用于Luminexr SSO HLA流式磁珠基因分型。使用2ml深孔板和TECAN DNA全自动工作站,从288份骨髓捐献者样本中提取基因组DNA;提取的DNA样本用紫外分光光度仪测... 本研究旨在建立从全血EDTA抗凝样本中高通量提取基因组DNA的有效方法,以常规应用于Luminexr SSO HLA流式磁珠基因分型。使用2ml深孔板和TECAN DNA全自动工作站,从288份骨髓捐献者样本中提取基因组DNA;提取的DNA样本用紫外分光光度仪测定其浓度和纯度,并采用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性;DNA样本用Onelambdar SSOHLA-A、B和DRB1基因分型试剂盒进行PCR扩增、分子杂交和Luminex流式磁珠分析仪检测,统计分析每一DNA样本HLA-A、B和DRB1基因扩增产物经DNA探针分子杂交后的阳性磁珠和阴性磁珠的荧光信号强度。结果表明:从400μl全血中提取了基因组DNA,288份样本的DNA产量平均为3.217±0.715μg,A260/A280值平均为1.710±0.103,A260-A320/A280-A320值平均为1.761±0.151;用琼脂糖凝胶电泳法测得DNA的分子量均大于15kb;每一样本HLA-A、-B和-DRB1杂交后的阳性磁珠的荧光信号强度均>600RFU,而阴性磁珠的荧光信号强度<50RFU。结论:本方法适用于从大量全血样本中快速提取基因组DNA,所得的基因组DNA适用于高通量中华骨髓捐献者样本的HLA流式磁珠基因分型等下游的移植免疫学与分子生物学实验。 展开更多
关键词 基因组DNA 基因组DNA高通量提取 中华骨髓库 HLA基因分型
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广东汉族妊娠期糖尿病妇女胎盘组织microRNA差异表达谱分析 被引量:8
6
作者 李伟 胡宝春 龚照 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2017年第3期298-302,共5页
目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就... 目的 :探索妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)与正常妊娠胎盘组织微小RNA(microRNA,miRNA)的差异表达,为深入研究GDM发病机制提供基础。方法:选取于2013年1月—2014年1月在武警广东省总队医院、南方医科大学珠江医院就诊并分娩的GDM孕妇20例作为观察组(GDM组),均为粤籍汉族并且相互之间无亲缘关系,随机选取同期无妊娠合并症的正常广东汉族孕妇20例作为对照组。胎儿分娩后收集胎盘组织,用TRIzol法进行总RNA提取,经过质量和纯度分析鉴定合格后分别选取5个样本混合成GDM和对照组,采用逆转录法构建小RNA文库,使用第二代高通量测序采用边合成边测序的方法对miRNA进行测序并分析结果。结果:从胎盘组织提取到的总RNA纯度较高,D(260 nm)/D(280 nm)>1.90,并成功构建小RNA的c DNA文库。采用高通量测序得到长度为10~35 nt的小RNA片段,其中文库数量最多的小RNA长度21~24 nt,miRNA量占所有小RNA总量的30%以上,最终获得洁净的片段超过10 000 000。将得到的片段与Genebank及Rfram数据库比对,去除其他小RNA筛选出miRNA达7 000多种。通过样本两两比较分析,与对照组相比,发现GDM组有138种已知的miRNA表达明显上调,包括hsa-miR-548au-5p、hsa-miR-95a-5p、hsa-miR-373-5p、hsa-miR-216-5p等(log2-ratio>1,P<0.01);16种已知miRNAs明显表达下调,如hsa-miR-5699-5p、hsa-miR-4286等(log2-ratio<-1,P<0.01)。Mireap软件预测出27种新miRNA,其中有9种在GDM表达升高,6种表达降低。结论:GDM的胎盘组织miRNAs与对照组存在表达差异,胎盘组织miRNA可能在GDM发病过程中起一定的调节作用。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 miRNA 差异表达谱 高通量测序
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产脂肪酶菌株的常压室温等离子体诱变及高通量筛选方法的建立 被引量:7
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作者 曹茜 冯凤琴 《中国粮油学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第2期52-57,共6页
脂肪酶由于可催化的反应种类和底物类别多,且具有位置选择性和异构体选择性等特点而常用于结构酯的合成和油脂改性等领域。丝孢酵母(Trichosporon sp.)是一种产脂肪酶菌种,但生产能力偏低是限制该菌实现工业化生产的重要因素。本研究利... 脂肪酶由于可催化的反应种类和底物类别多,且具有位置选择性和异构体选择性等特点而常用于结构酯的合成和油脂改性等领域。丝孢酵母(Trichosporon sp.)是一种产脂肪酶菌种,但生产能力偏低是限制该菌实现工业化生产的重要因素。本研究利用常压室温等离子体(ARTP)对丝孢酵母野生菌进行诱变处理,并建立了96孔板培养结合对硝基苯酚棕榈酸酯(P-NPP)法测定酶活力的高通量筛选方法,实现了60个突变菌株的初筛。以酶活力为筛选指标时,突变率和正突变率分别为51.7%和28.3%。8株初筛菌株的摇瓶发酵结果显示,A13和A5的产酶提高最显著,培养96 h后分别比野生菌增加2.64倍和1.54倍,且2个突变菌株的遗传稳定性良好。对比研究发现,突变菌株A13相较野生菌的最大优势在于提前24 h便能达到最高产酶量。 展开更多
关键词 丝孢酵母 脂肪酶 常压室温等离子体 诱变 高通量筛选
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高通量分子捕捉系统研究中药的思路与方法 被引量:3
8
作者 韩宇萍 王宁生 宓穗卿 《世界科学技术-中医药现代化》 2004年第1期30-36,共7页
目的:本文提出以高通量分子捕捉系统研究中药的思路和方法。方法:以简单的分子系统和复杂的生物系统对信号分子捕捉和响应的特点为基础,分析了简单的单一蛋白质分子系统对中药混合物中的活性分子具有的特异性捕捉作用,蛋白质分子捕获活... 目的:本文提出以高通量分子捕捉系统研究中药的思路和方法。方法:以简单的分子系统和复杂的生物系统对信号分子捕捉和响应的特点为基础,分析了简单的单一蛋白质分子系统对中药混合物中的活性分子具有的特异性捕捉作用,蛋白质分子捕获活性分子后产生的信号变化可被检测系统检知,且反应易于分析,因此,以蛋白质分子为基本构件构建分子捕捉系统,可将目前所有药物作用机制涉及的约500种蛋白靶标分子构建成适于分析、研究的高通量分子捕捉阵列,从而对中药进行全方位研究。结果:将含药材料的获得和处理技术、高通量分子捕捉阵列、高通量检测技术和自动化数据处理系统整合、集成为高通量分子捕捉系统,可以突破现有研究方法的限制,对中药进行多方位的研究。结论 采用高通量分子捕捉系统研究中药可突破目前中药研究的方法学限制。但将此设想用于研究实践尚需大量工作。 展开更多
关键词 高通量分子捕捉系统 中药 蛋白质分子 分子检测 给药 生物活性成分
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亚麻籽饼粕对奶牛和肉牛肠道微生物的影响 被引量:1
9
作者 方媛 景亚萍 +6 位作者 扎拉加 白妍睿 李玉玺 魏俊淑 李晨辉 陈新君 张春江 《兰州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期781-788,共8页
分别采用基础饲料和在基础饲料中添加30%的亚麻籽饼粕饲喂10头成年奶牛和10头肉牛5个月后,收集粪便,通过试剂盒提取粪便DNA采用16S rDNA测序和ITS1测序,探讨了添加亚麻籽饼粕对奶牛和肉牛肠道微生物群落结构和多样性的影响.结果发现,亚... 分别采用基础饲料和在基础饲料中添加30%的亚麻籽饼粕饲喂10头成年奶牛和10头肉牛5个月后,收集粪便,通过试剂盒提取粪便DNA采用16S rDNA测序和ITS1测序,探讨了添加亚麻籽饼粕对奶牛和肉牛肠道微生物群落结构和多样性的影响.结果发现,亚麻籽饼粕饮食干预改变了成年奶牛和肉牛肠道微生物群的多样性.在亚麻籽饼粕组中,细菌门中Proteobacteria的相对丰度显著低于正常对照组;在真菌门的水平上,Unidentified门的相对丰度与正常对照组相比明显受到抑制(P<0.001).亚麻籽饼粕组中Ascomycota和Basidiomycota的相对丰度显著高于正常对照组.给奶牛喂亚麻籽饼粕后,Kernia,Malassezia和Pseudozyma的相对丰度增加,而Scedosporium,Unidentified,Archaeorhizomyces和Pseudallescheria的生长受到抑制,但这些物种在肉牛肠道中的变化模式与奶牛相反.表明肠道微生物群的药理或营养调节是预防性保健的有效方法. 展开更多
关键词 亚麻籽饼粕 肠道微生物群 高通量测序 奶牛和肉牛
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焦化炉处理量上限理论分析 被引量:1
10
作者 王兰娟 杨哲 +1 位作者 吕亮功 肖家治 《石油大学学报(自然科学版)》 EI CSCD 北大核心 2003年第1期80-83,共4页
焦化炉是延迟焦化装置的核心单元设备 ,也是整个装置提高处理量的制约因素。对 5座焦化炉进行了现场标定和管内外过程模拟 ,在控制炉管结焦速率的情况下 ,对单面辐射焦化炉的处理量上限进行了分析。结果表明 ,以现场操作工况下平均热强... 焦化炉是延迟焦化装置的核心单元设备 ,也是整个装置提高处理量的制约因素。对 5座焦化炉进行了现场标定和管内外过程模拟 ,在控制炉管结焦速率的情况下 ,对单面辐射焦化炉的处理量上限进行了分析。结果表明 ,以现场操作工况下平均热强度和 1984年设计规范中冷油流速上限为基准时 ,4座单面辐射焦化炉的单炉处理量可分别提高到 6 0 0~ 6 5 0kt/a和 70 0~ 85 0kt/a,而炉出口热转化率仍低于炉管内重油的最大可裂化度。如将炉出口热转化率限制在 2 0 %,分别以操作工况下炉管平均热强度和 1984年设计规范中平均热强度上限为限制条件时 ,4座单面辐射焦化炉的单炉处理量可分别提高到 6 80 .8~ 796 .8kt/a和 76 4~ 110 0kt/a。 展开更多
关键词 焦化炉 最大处理量 最大可裂化度 炉出口 热转化率
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天然提取物数据库的计算机管理方法探讨 被引量:2
11
作者 刘艾林 黄家学 杜冠华 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 2000年第6期70-73,共4页
为适应高通量药物筛选 ,建立天然提取物数据库 ,对于活性化合物的发现及其进一步研究具有重要意义。我们根据提取物数据库的要求以及现有数据库软件的特点 ,探索出合理使用这些软件的方法 ,使软件可以优势互补 ,以更好地进行提取物数据... 为适应高通量药物筛选 ,建立天然提取物数据库 ,对于活性化合物的发现及其进一步研究具有重要意义。我们根据提取物数据库的要求以及现有数据库软件的特点 ,探索出合理使用这些软件的方法 ,使软件可以优势互补 ,以更好地进行提取物数据库的管理。 展开更多
关键词 高通量筛选 提取物 数据库软件
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Throughput-based mode switching for MIMO ARQ systems in presence of transmit correlation 被引量:1
12
作者 Zhengyu Zhang Ling Qiu 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2013年第1期1-10,共10页
The mode switching between spatial multiplexing (SM) and space-time block code (STBC) diversity is investigated for the multiple-input multiple-output (MIMO) automatic repeat request (ARQ) system. Five importa... The mode switching between spatial multiplexing (SM) and space-time block code (STBC) diversity is investigated for the multiple-input multiple-output (MIMO) automatic repeat request (ARQ) system. Five important practical factors are considered in the proposed switching scheme: transmit correlation, ARQ technique, packet loss probability (PLP) constraint, discrete rate transmission (DRT) and channel coding. Under the spatially correlated channel, the distributions of the post signal-to-interference-plus- noise ratio (SiNR) for the SM mode and the STBC mode are obtained by using Gamma approximations. Then this paper derives the closed-form expressions of the PLP and the throughput for different modes when the ARQ technique is employed, based on which the mode switching algorithm is proposed to improve the spectral efficency. In the simulation, the correction of the expressions is first verified. Then, the significant gain observed by the proposed algorithm is presented. Since the switching point is the key parameter to implement the mode switching, this paper also shows how the switching point is affected by the practical factors considered. 展开更多
关键词 multiple-input multiple-output (MIMO) mode switch-ing transmit correlation automatic repeat request (ARQ) through-put.
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大接经全息疗法治疗中风后遗症42例 被引量:6
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作者 万文蓉 《辽宁中医杂志》 CAS 2001年第9期553-554,共2页
通过以大接经全息疗法针刺治疗中风后遗症 42例 ,结果显效 16例 ,有效 15例 ,好转 8例 ,无效 3例 ,总有效率为 92 8% ,提示本法对治疗中风后遗症有较好的疗效 。
关键词 中风后遗症 大接经全息疗法 针刺治疗
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大学的城市 城市的大学——“三区”联动之同济模式研究 被引量:9
14
作者 谭震威 张希胜 《高教发展与评估》 2007年第2期6-12,共7页
科教兴市战略的提出,需要大力发挥高校在城市发展与建设中的作用。“三区”联动即以大学校区为依托,以科技园区为平台,以资源在公共社区的集聚、共享、融合为抓手,是落实科教兴市战略的具体策略。以同济大学为例,分析大学在“三区”联... 科教兴市战略的提出,需要大力发挥高校在城市发展与建设中的作用。“三区”联动即以大学校区为依托,以科技园区为平台,以资源在公共社区的集聚、共享、融合为抓手,是落实科教兴市战略的具体策略。以同济大学为例,分析大学在“三区”联动过程中存在的问题和障碍,进而提出针对性的解决措施。 展开更多
关键词 科教兴市 “三区”融合 同济模式
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基于数据校验时空图的卫星网络连接计划设计
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作者 戴翠琴 贺黎明 罗屹 《应用科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期738-752,共15页
针对低轨卫星网络中网络时空连通性和流量阻塞的问题,综合考虑了星间链路状态、卫星能效和负载状态,提出了一种基于数据校验时空图的连接计划设计(data check time-space graph-contact plan design, DCTSG-CPD)方案。首先,构建基于电... 针对低轨卫星网络中网络时空连通性和流量阻塞的问题,综合考虑了星间链路状态、卫星能效和负载状态,提出了一种基于数据校验时空图的连接计划设计(data check time-space graph-contact plan design, DCTSG-CPD)方案。首先,构建基于电池模型的数据校验时空图(data check time-space graph, DCTSG),并以星间链路和卫星能源为约束,将连接计划设计建模为最大化吞吐量问题;其次,在DCTSG的基础上,通过对校验数据和转发数据的对比判断网络拥塞状态,根据卫星节点负载和星间链路流量阻塞状态,生成可用连接计划(contact plan, CP);最后,设计适应度函数以评价可用CP的优劣,提出基于数据校验的遗传算法更新CP以生成吞吐量最大化的最佳CP。仿真结果表明,所提DCTSG-CPD方案不仅能够提升吞吐量,而且可以有效降低数据交付时延。 展开更多
关键词 卫星网络 连接计划设计 时空图 数据校验 吞吐量
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高分辨质谱在食品农药残留检测中的研究进展 被引量:31
16
作者 张申平 周静 +3 位作者 杜茹芸 郑翌 刘洋 徐红斌 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期502-509,共8页
利用准确、可靠的色谱-质谱联用分析技术开展我国食用农产品中农兽药残留、有机污染物等有害物质的筛查和检测具有重要意义。高分辨质谱具备更高的分辨率和质量精度,在复杂食品基质中痕量化合物的定性确证和定量检测方面拥有很大应用潜... 利用准确、可靠的色谱-质谱联用分析技术开展我国食用农产品中农兽药残留、有机污染物等有害物质的筛查和检测具有重要意义。高分辨质谱具备更高的分辨率和质量精度,在复杂食品基质中痕量化合物的定性确证和定量检测方面拥有很大应用潜力。该文综述了四极杆/飞行时间质谱(Q/TOF MS)、四极杆/静电场轨道阱质谱(Q/Orbitrap MS)技术的特点,重点分析了2017年至2022年国内外植物源和动物源食品中农药残留检测的高分辨质谱应用情况。从高分辨质谱技术本身的发展、食品安全监管部门和第三方检测机构的技术需求3个方面讨论了高分辨质谱技术的发展前景,展望了其未来研究的主要方向。 展开更多
关键词 高分辨质谱(HRMS) 食品 农药残留 高通量检测
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绵甜型白酒酒醅原核微生物群落结构分析 被引量:8
17
作者 王鹏 蒋超 +5 位作者 常强 崔磊 闫寅卓 李红 刘海坡 韩兴林 《食品科学技术学报》 CAS 北大核心 2018年第5期19-25,共7页
利用高通量测序技术对绵甜型白酒酿造过程酒醅中原核微生物的群落结构进行分析。选取2个窖池,跟踪采集窖内不同空间位置及不同发酵阶段的酒醅,将混匀后的酒醅样品分装于无菌真空塑料袋,进行DNA提取和后续的高通量测序分析。结果表明:从... 利用高通量测序技术对绵甜型白酒酿造过程酒醅中原核微生物的群落结构进行分析。选取2个窖池,跟踪采集窖内不同空间位置及不同发酵阶段的酒醅,将混匀后的酒醅样品分装于无菌真空塑料袋,进行DNA提取和后续的高通量测序分析。结果表明:从OTU分析中可以看出,1号窖池酒醅和2号窖池酒醅的原核微生物种类相似度较高;同一个窖池中原核微生物种类相似度很高,同时,随着发酵的进行两个窖池酒醅中的细菌种类在不断减少;从样品种类来看,1号窖池酒醅中的原核微生物多样性要高于2号窖池; 1号窖池和2号窖池酒醅中的原核微生物菌群种类相似,同时菌群种类变化趋势相同。1号窖池和2号窖池酒醅中的优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)。优势菌门的数量由多到少排列顺序为:Firmicutes、Proteobacteria、Actinobacteria、Cyanobacteria、Gemmatimonadetes。 展开更多
关键词 绵甜型白酒 酒醅 原核微生物 群落结构 高通量测序技术
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基于单纯型设计和部件搜索方法的CHO细胞无血清培养基的高通量优化 被引量:5
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作者 李晓璐 范里 +2 位作者 赵亮 陈飞 谭文松 《高校化学工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第4期777-783,共7页
氨基酸的浓度与配比对细胞生长和产物表达有重要作用。在自主研发无血清培养基的基础上,通过单纯型格子实验设计优化氨基酸浓度及配比后发现,优化的无血清培养基明显促进了细胞生长。生物反应器批式培养中,最高活细胞密度达52.6×10... 氨基酸的浓度与配比对细胞生长和产物表达有重要作用。在自主研发无血清培养基的基础上,通过单纯型格子实验设计优化氨基酸浓度及配比后发现,优化的无血清培养基明显促进了细胞生长。生物反应器批式培养中,最高活细胞密度达52.6×105 cells·mL-1,抗体融合蛋白产量52.2 mg·L-1,相对于商业培养基Ex-cell 302,分别提高了26.7%和11.5%。在此基础上,通过部件搜索的方法确认具有显著正影响的氨基酸为谷氨酰胺、脯氨酸和甲硫氨酸。基于上述研究工作,在2 L反应器采用自主研发的优化无血清培养基,以葡萄糖为关键控制参数,进行两阶段动态流加培养过程,CHO细胞最大活细胞密度达94.6×105 cells·mL-1,抗体融合蛋白终产量600 mg·L-1,相对于商业培养基Ex-cell 302批式培养,分别提高了2.75倍和11.8倍。本研究工作为抗体融合蛋白的高效工业化生产奠定了基础。 展开更多
关键词 CHO细胞 无血清培养基 高通量筛选技术 氨基酸优化
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稻虾共作对稻田土壤nirK反硝化微生物群落结构和多样性的影响 被引量:40
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作者 朱杰 刘海 +3 位作者 吴邦魁 袁峰 刘章勇 金涛 《中国生态农业学报》 CSCD 北大核心 2018年第9期1324-1332,共9页
稻虾共作是水稻种植与克氏螯虾共作形成的互利共生的稻田种养复合生态模式。目前对稻虾共作模式稻田反硝化微生物多样性和群落结构的影响尚不清楚。本研究以江汉平原常规中稻模式(MR)为对照,设置连续3年(2014—2016年)稻虾共作模式(CR)... 稻虾共作是水稻种植与克氏螯虾共作形成的互利共生的稻田种养复合生态模式。目前对稻虾共作模式稻田反硝化微生物多样性和群落结构的影响尚不清楚。本研究以江汉平原常规中稻模式(MR)为对照,设置连续3年(2014—2016年)稻虾共作模式(CR)为处理,通过特异引物提取中稻抽穗期稻田土壤nirK基因,采用Illumina Miseq高通量测序技术,探讨稻虾共作模式对稻田土壤nirK反硝化微生物多样性和群落结构的影响。结果表明:稻虾共作模式显著提升水稻抽穗期稻田土壤中硝态氮、全氮及全碳的含量,对土壤碳氮比、碱解氮和铵态氮含量没有显著影响。稻虾共作模式显著增加稻田土壤nirK基因微生物的丰富度指数,但对nirK基因微生物的多样性指数影响不显著。稻虾共作模式改变了nirK基因微生物在目、科、属、种水平的群落组成,较常规中稻模式,稻虾共作模式在各分类水平组成类群均减少;稻虾共作模式较常规中稻模式改变了目的种类,对共有目相对丰度没有显著性改变。RDA分析表明稻虾共作模式对土壤nirK基因菌群的群落结构有一定的改变,但稻虾共作模式与常规中稻模式在群落结构上仍保留着一定的相似性。硝态氮含量是影响nirK反硝化细菌群落结构的主效因子。可见,稻虾共作模式对微生物多样性指数没有显著影响,但显著增加了微生物丰富度指数,改变了稻田土壤nirK反硝化微生物在目、科、属、种的群落结构。 展开更多
关键词 江汉平原 稻虾共作 克氏螯虾 nirK基因 反硝化微生物 群落结构 硝态氮 高通量测序技术
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基于高通量测序分析的荣成扇贝养殖区微型浮游生物群落结构研究 被引量:4
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作者 乔玲 于杰 +4 位作者 李迎 甄毓 米铁柱 张玲玲 包振民 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期64-72,共9页
运用Illumina高通量测序技术对2011年7月荣成八河扇贝养殖区和楮岛扇贝养殖区中微型浮游生物群落组成特征进行研究,结果表明,在浮游植物种类组成上,2个样品中共检测到22个纲,其中海金藻、硅藻、绿藻、甲藻和隐藻是主要类群,多形微眼藻... 运用Illumina高通量测序技术对2011年7月荣成八河扇贝养殖区和楮岛扇贝养殖区中微型浮游生物群落组成特征进行研究,结果表明,在浮游植物种类组成上,2个样品中共检测到22个纲,其中海金藻、硅藻、绿藻、甲藻和隐藻是主要类群,多形微眼藻和抑食金球藻的18SrDNA相对丰度较高;在浮游动物种类组成上,2个样品中共检测到16个门,在八河扇贝养殖区18SrDNA相对丰度较高的浮游动物是软体动物、有孔虫和纤毛虫,而在楮岛扇贝养殖区则是环节动物的18SrDNA相对丰度较高。结果表明,荣成扇贝养殖区有暴发褐潮的可能,需采取有效措施进行应对。 展开更多
关键词 抑食金球藻 多形微眼藻 18SrDNA基因 高通量测序
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