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单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157:H7、沙门氏菌三重荧光PCR检测方法的建立
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作者 劳嘉倩 蒋佳希 +4 位作者 黄志深 尹玮璐 梁美丹 林秀敏 陈楷 《现代食品》 2025年第5期216-222,共7页
为提高常见食源性致病菌单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157:H7、沙门氏菌的检测效率,本研究与前期研制的LES共增菌培养基联用,参考《出口食品中食源性致病菌检测方法实时荧光PCR法》(SN/T 1870—2016)方法,通过优化反应体系及... 为提高常见食源性致病菌单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157:H7、沙门氏菌的检测效率,本研究与前期研制的LES共增菌培养基联用,参考《出口食品中食源性致病菌检测方法实时荧光PCR法》(SN/T 1870—2016)方法,通过优化反应体系及反应条件,建立一种多重荧光PCR检测3种目标菌的方法。通过验证不同混合比例共增菌培养物检测效果及体系的特异性、敏感性,成功构建3种目标菌“同平台共增菌-多重荧光PCR检测”方法,体系的特异性好,灵敏度高,能够为食源性致病菌的快速检测提供技术支持。 展开更多
关键词 食源性致病菌 共增菌培养 多重荧光pcr检测
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靶序列富集多重PCR技术的发展及其应用 被引量:7
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作者 邬旭龙 肖璐 +5 位作者 姜睿姣 王印 杨泽晓 姚学萍 张鹏飞 张博 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期172-176,共5页
靶序列富集多重PCR(target enriched multiplex PCR,Tem–PCR)作为一种新型的分子生物学高通量检测技术,通过靶序列富集、靶序列加标签以及超级引物扩增3个阶段实现对靶标序列的大量扩增。靶序列富集多重PCR具有独特的反应过程,克服了... 靶序列富集多重PCR(target enriched multiplex PCR,Tem–PCR)作为一种新型的分子生物学高通量检测技术,通过靶序列富集、靶序列加标签以及超级引物扩增3个阶段实现对靶标序列的大量扩增。靶序列富集多重PCR具有独特的反应过程,克服了常规多重PCR扩增条件不兼容、扩增具有偏爱性等缺点,实现了对同一反应体系多种病原的同步检测,为临床病原鉴别诊断、基因分型、耐药基因等领域的研究提供了新思路,具有较大的发展前景。笔者对Tem–PCR的研究背景、反应原理、技术应用及试剂盒开发等进行综述,旨在为Tem–PCR的研究和发展提供参考依据,为中国应对公共卫生危机提供新思路。 展开更多
关键词 靶序列富集多重pcr 高通量 生物技术 公共卫生
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靶序列富集多重PCR-液相芯片联合检测4种常见呼吸道病毒的初步应用 被引量:7
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作者 王洁 王卫萍 +4 位作者 胡毓安 孙宁 杨波 夏正坤 李晓军 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2016年第9期958-963,共6页
目的呼吸道病毒是引起婴幼儿呼吸道感染的最主要病原体,为快速准确诊断其感染,文中建立一种基于液相芯片系统的4种常见呼吸道病毒快速分子检测方法,为有效防控其发生和流行提供有力手段。方法采集南京总医院儿科就诊的有急性呼吸道感染... 目的呼吸道病毒是引起婴幼儿呼吸道感染的最主要病原体,为快速准确诊断其感染,文中建立一种基于液相芯片系统的4种常见呼吸道病毒快速分子检测方法,为有效防控其发生和流行提供有力手段。方法采集南京总医院儿科就诊的有急性呼吸道感染症状的患儿咽拭子标本120例及30例正常对照标本,分别纳入患儿组和对照组。针对A型流感病毒(Flu A)、B型流感病毒(Flu B)、呼吸道合胞病毒A型(RSVA)和B型(RSVB)的保守区序列分别设计并合成了特异性引物、探针和通用引物,构建4种病原体阳性参比品,通过对扩增和杂交条件的优化,建立了靶序列富集多重PCR(Tem-PCR)和Luminex液相芯片(x MAP)技术相结合的检测系统,并对该检测系统进行了特异性、灵敏度评价。收集以急性上呼吸道感染为主要表现的患儿咽拭子标本,用上述建立的方法进行检测分析,分别与单病毒基因荧光定量PCR检测方法及x TAG液相芯片法进行比对检测。结果建立了Flu A、Flu B、RSVA和RSVB4种呼吸道病毒的特异性快速分子检测方法且灵敏度可达10拷贝/μL。用快速分子检测方法和单病毒基因荧光定量PCR法对120例疑似患儿咽拭子标本进行检测,快速法阳性检出率为31.7%(38/120),荧光定量法阳性检出率为29.2%(35/120)。经一致性检验分析提示2种方法一致性较强(k>0.7)。部分标本同时采用x TAG液相芯片试剂盒进行检测,经一致性检验分析提示2种方法一致性较好(k>0.6)。结论临床的初步应用证实了4种常见呼吸道病毒快速分子检测方法具备灵敏、特异、快速等优点,为临床早期、准确判断呼吸道感染的病原体提供实验依据。 展开更多
关键词 呼吸道病毒 靶序列富集多重-聚合酶链反应 液相芯片技术[
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应用多重PCR技术快速筛查食品中的转基因成分 被引量:4
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作者 董立明 邢珍娟 +3 位作者 李葱葱 夏蔚 闫伟 李飞武 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期56-61,共6页
以转基因植物中常见的3种筛选调控元件、2种标记基因和1种目的基因为检测靶标,建立了能在一次PCR扩增中同时检测6种转基因成分的多重PCR检测方法。结果表明,当多重PCR体系中Ca MV35S启动子、Fa MV35S启动子、NOS终止子、bar基因、NPTII... 以转基因植物中常见的3种筛选调控元件、2种标记基因和1种目的基因为检测靶标,建立了能在一次PCR扩增中同时检测6种转基因成分的多重PCR检测方法。结果表明,当多重PCR体系中Ca MV35S启动子、Fa MV35S启动子、NOS终止子、bar基因、NPTII基因、CP4-EPSPS基因的检测引物浓度分别为0.2、0.2、0.3、0.3、0.2、0.2μmol/L,退火温度为60℃时扩增效果最佳,利用优化后的六重PCR方法可从转基因玉米、大豆、棉花、油菜等各类样品中精准检测出相应的转基因成分,方法的检测灵敏度可达到0.1%。该方法为食品中常见转基因成分的筛查提供了一种高效的手段,在转基因产品的检测工作中具有较高的应用价值。 展开更多
关键词 转基因生物 调控元件 标记基因 目的基因 多重pcr 筛查
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靶序列富集多重PCR结合DHPLC同时检测5种食源性致病菌 被引量:6
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作者 刘忠梅 曾繁华 +5 位作者 罗佳 徐义刚 曲敏 莫春生 刘新亮 李苏龙 《食品安全质量检测学报》 CAS 2015年第6期2275-2282,共8页
目的建立同时检测沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157、金黄色葡萄球菌和志贺氏菌5种食源性致病菌的简便、灵敏的高通量方法。方法根据GenBank公布的5种致病菌的特异性靶基因序列,设计5对特异性引物,与通用引物连接构... 目的建立同时检测沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157、金黄色葡萄球菌和志贺氏菌5种食源性致病菌的简便、灵敏的高通量方法。方法根据GenBank公布的5种致病菌的特异性靶基因序列,设计5对特异性引物,与通用引物连接构成复合引物。经过反应条件的优化,建立了5种致病菌的靶序列富集多重PCR(target enriched multiplex PCR,Tem-PCR)扩增方法,扩增产物采用变性高效液相色谱(denaturing high-performance liquid chromatography,DHPLC)技术进行检测。结果采用Tem-PCR-DHPLC方法,检测48株试验菌株,未发现非特异性结果。对5种致病菌检测灵敏度,除金黄色葡萄球菌为620 cfu/mL外,其余都小于100 cfu/mL。对4种样品的检测结果与国家标准方法相符合。结论 Tem-PCR-DHPLC检测方法,相比传统多重PCR方法,能有效地解决引物扩增效率不均衡的问题,不需优化引物浓度,方法特异性强,灵敏度高,具有较好的实用性。 展开更多
关键词 靶序列富集多重pcr 变性高效液相色谱 沙门氏菌 单核细胞增生李斯特氏菌 大肠埃希氏菌O157 金黄色葡萄球菌 志贺氏菌
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利用二代测序技术进行近交系小鼠品系验证
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作者 王勃 王忠 +4 位作者 连军 周蓓 吕晓敏 从美丽 赵效国 《动物医学进展》 北大核心 2021年第5期62-66,共5页
为了对生产群中的无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级近交系小鼠进行遗传质量检测,以确认其品系正确,未发生突变。选取2个品系(Balb/cByJ和C57BL/6J)雌雄各半,共16只小鼠,通过多重靶向多聚酶链反应(PCR),扩增包含112个单核苷... 为了对生产群中的无特定病原体(specific pathogen free,SPF)级近交系小鼠进行遗传质量检测,以确认其品系正确,未发生突变。选取2个品系(Balb/cByJ和C57BL/6J)雌雄各半,共16只小鼠,通过多重靶向多聚酶链反应(PCR),扩增包含112个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点的DNA片段,对其进行二代测序(next-generation sequencing,NGS),获得它们在这些SNP位点的基因型。经二代测序后,得到有效读取数为6118873,每个位点的平均读取数为3631,97个SNP位点在所有的小鼠中都被分型,另外15个SNP位点,至少在1个样本中没有被检出。其中,6个SNP只在一个品系的小鼠中有结果,还有2个SNP只在一种性别的小鼠中有结果。在所有样本中得到的全部SNP分型结果都符合其品系的基因型,且均为纯合子。送检的小鼠遗传特征稳定,利用二代测序技术进行SNP分型,能对近交系小鼠的遗传特性进行快速准确的评估。 展开更多
关键词 近交系小鼠 单核苷酸多态性 多重靶向聚合酶链式反应 二代测序
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牛miR-144靶基因预测与组织表达分析
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作者 丁燕玲 王鹏飞 +5 位作者 杨朝云 周小南 赵志艳 张岩峰 史远刚 康晓龙 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期471-479,共9页
为研究miR-144的靶基因与miR-144在牛不同组织中的表达规律,预测其对肌肉生长发育的调节机制,对miR-144在各物种间的保守性、潜在靶基因及其富集通路进行分析,通过qRT-PCR方法检测牛不同组织中miR-144的表达。结果表明,miR-144成熟序列... 为研究miR-144的靶基因与miR-144在牛不同组织中的表达规律,预测其对肌肉生长发育的调节机制,对miR-144在各物种间的保守性、潜在靶基因及其富集通路进行分析,通过qRT-PCR方法检测牛不同组织中miR-144的表达。结果表明,miR-144成熟序列在各物种间保守性较高;富集分析发现,靶基因显著富集于血管平滑肌收缩、cGMP-PKG、cAMP等与肌肉发育相关通路中。qRT-PCR结果显示,miR-144在肝中的表达量最高,在皮下脂肪中的表达量最低;miR-144在腿肌和心中的表达差异不显著(P>0.05),但在肝中的表达显著(P<0.05)高于腿肌和心;miR-144在背最长肌中的表达显著(P<0.05)高于瘤胃和皮下脂肪,而瘤胃和皮下脂肪组织间表达差异不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 miR-144 组织表达 靶基因预测 实时荧光定量pcr 富集通路
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