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刺参循环水养殖系统水体及沉积物微生物群落结构特征
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作者 刘丹 潘浩然 +6 位作者 倪红东 赵新延 许天浩 汪南壹 丁君 常亚青 田燚 《大连海洋大学学报》 北大核心 2025年第1期135-145,共11页
为研究刺参(Apostichopus japonicus)循环水养殖系统(recirculating aquaculture systems,简称RAS)的微生物组成,通过16S rRNA高通量测序方法分析了刺参循环水养殖系统不同月份水体和沉积物微生物菌群特征。结果表明:Alpha多样性分析结... 为研究刺参(Apostichopus japonicus)循环水养殖系统(recirculating aquaculture systems,简称RAS)的微生物组成,通过16S rRNA高通量测序方法分析了刺参循环水养殖系统不同月份水体和沉积物微生物菌群特征。结果表明:Alpha多样性分析结果显示,刺参循环水养殖池塘中水体多样性和丰富度均大于沉积物,且两者间存在显著性差异(P<0.05);比较水体和沉积物微生物群落组成差异发现,沉积物中拟杆菌门相对丰度极显著高于水体(P<0.001),水体中放线菌门相对丰度显著高于沉积物(P<0.05);沉积物中Lutibacter和假鲁杰氏菌属相对丰度显著高于水体样本(P<0.05);不同月份水体中微生物在门水平上存在差异,其中蓝细菌门在5月(W517)中所占比例明显高于其他月份,unidentified_Bacteria和绿弯菌门在7月(W075)中所占比例明显高于其他月份;在属水平上存在差异,十八杆菌属和unidentified_Cyanobacteria在5月(W517)中所占比例明显高于其他月份,弓形杆菌属在7月(W075)中所占比例明显高于其他月份,海生杆菌属和冰居菌属在9月(W913)中所占比例明显高于其他月份;不同月份沉积物微生物在门水平上也存在差异,其中蓝细菌门在9月(P91322)中所占比例明显高于其他月份;在属水平上差异,冰居菌属、unidentified_Flavobacteriaceae和十八杆菌属在5月(P51722)中所占比例明显高于其他月份,弓形杆菌属和噬琼胶菌属在7月(P07522)中所占比例明显高于其他月份,unidentified_Cyanobacteria在9月(P91322)中所占比例明显高于其他月份。研究表明,不同月份间水体及沉积物中优势属均有不同,本试验结果可为刺参循环水养殖生产中微生物制剂合理利用及刺参健康养殖模式提供有益参考。 展开更多
关键词 刺参 微生物群落 循环水养殖系统 高通量测序 养殖水体 沉积物
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不同林分类型下花榈木根系细菌群落多样性分析及其功能预测
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作者 周洁尘 肖亚琴 +6 位作者 段翔 朱天才 吴小丽 彭皎 王昌 刘康 钟红艳 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2025年第2期112-121,共10页
【目的】探究花榈木不同根系分区细菌群落结构和多样性的差异以及与林分类型的相关性,挖掘影响花榈木相关的功能基因。【方法】以樟树林和国外松林下套种的花榈木非根系土壤、根系土壤和根为研究对象,进行高通量测序和生物信息学分析。... 【目的】探究花榈木不同根系分区细菌群落结构和多样性的差异以及与林分类型的相关性,挖掘影响花榈木相关的功能基因。【方法】以樟树林和国外松林下套种的花榈木非根系土壤、根系土壤和根为研究对象,进行高通量测序和生物信息学分析。【结果】花榈木根系细菌隶属于29个门、72个纲、171个目、303个科、625个属、1118个种和2570个OTU。2个林分中花榈木根系细菌群落多样性和均匀度差异较小,丰富度具有显著差异。3个根系分区中,花榈木根内分区的细菌群落多样性、丰富度最低,与其他2个根系分区具有极显著差异。在门分类水平上,根系细菌群落主要由变形菌门Proteobacteria、绿弯菌门Chloroflex和放线菌门Actinobacteria组成。在属分类水平上,各样品的根系细菌群落的优势菌群的组成及相对丰度具有较大差异,主要以变形菌门和放线菌门为主。花榈木不同根系分区的细菌群落结构上具有极显著差异,根内与其他2个分区的根系细菌群落之间存在明显分离,在群落结构具有极显著影响。Tax4Fun功能预测显示花榈木根系细菌包含大量关于膜运输、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、翻译、复制和修复、能量代谢、辅因子和维生素的代谢等基因信息,其中功能基因丰度较大的为碳水化合物代谢、膜运输和氨基酸代谢。【结论】花榈木不同根系分区的细菌群落组成、结构和多样性均具有显著差异,并且林分影响根系细菌群落的组成,本研究可为后期深入研究花榈木功能基因挖掘、病害防治以及提高花榈木品质提供理论基础。 展开更多
关键词 花榈木 根系 微生物多样性 高通量测序 功能基因
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无线通信技术在高速列车网络控制系统中的应用 被引量:2
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作者 王华伟 高阳 +3 位作者 李海龙 张子奇 刘聪 董维金 《城市轨道交通研究》 北大核心 2025年第2期140-143,147,共5页
[目的]无线通信技术具有灵活性高、适应性强的特点,能够有效解决有线网络在高速列车运行环境中的诸多问题。但由于高速列车运行环境比较复杂,无线通信技术在该领域的应用仍面临很多挑战,需要对此进行深入研究。[方法]介绍了本次测试的... [目的]无线通信技术具有灵活性高、适应性强的特点,能够有效解决有线网络在高速列车运行环境中的诸多问题。但由于高速列车运行环境比较复杂,无线通信技术在该领域的应用仍面临很多挑战,需要对此进行深入研究。[方法]介绍了本次测试的硬件系统,阐述了NDT(网络传输时延测试仪)的构成及待测网桥设备的具体规格。设置了工况1(楼道环境)、工况2(贴近地面)和工况3(有铁门阻挡)3个模拟环境工况,采用测试软件得到了3个工况下信号吞吐量、无线通信单程传输时延的测试数据。对测试数据进行了分析,找出无线信号在3个工况下的传播特性和潜在干扰因素。[结果及结论]3种工况对无线信号传输的信号吞吐量和传输时延均有一定程度的影响,车厢间的金属物质会对无线电波产生显著的屏蔽效应。工况1下无线信号的表现最优,工况2次之,工况3最差。 展开更多
关键词 高速列车 列车网络控制系统 无线通信 信号吞吐量 传输时延
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非完美SIC D2D-NOMA系统吞吐量最大化功率分配
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作者 张东方 叶成荫 《电子测量技术》 北大核心 2025年第8期80-87,共8页
针对D2D-NOMA系统在非完美串行干扰消除条件下的吞吐量最大化问题,提出了一种基于非完美SIC的D2D-NOMA系统吞吐量最大化算法。首先在蜂窝用户和D2D用户的服务质量、最大发射功率下,考虑非完美SIC条件,建立一个以D2D-NOMA系统的吞吐量最... 针对D2D-NOMA系统在非完美串行干扰消除条件下的吞吐量最大化问题,提出了一种基于非完美SIC的D2D-NOMA系统吞吐量最大化算法。首先在蜂窝用户和D2D用户的服务质量、最大发射功率下,考虑非完美SIC条件,建立一个以D2D-NOMA系统的吞吐量最大化为目标的优化模型。然后将模型转换为以吞吐量为奖励的马尔可夫决策过程。利用TD3算法设计了一个功率分配算法,实现了系统吞吐量最大化。经仿真验证,所提出的算法与DDPG算法、遗传算法和随机功率分配算法相比,非完美SIC下D2D-NOMA系统的吞吐量分别提高了约14%、25%和40%,也展现出更优的收敛性和公平性。 展开更多
关键词 非完美SIC D2D-NOMA系统 吞吐量最大化 TD3算法
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油麦兼用气送式排种系统高通量混种装置设计与试验 被引量:2
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作者 廖宜涛 王传奇 +3 位作者 施彬彬 王磊 廖庆喜 何凯威 《农业机械学报》 CSCD 北大核心 2024年第12期134-146,共13页
针对气送式排种系统在排种量增大时混种装置内易出现种子回流、堵塞等现象,导致排种系统高速播种作业适应性较差的问题,设计了一种突扩文丘里结构的高通量混种装置,通过理论分析确定了输种管直径、混种区长度、进种入口截面长度等关键... 针对气送式排种系统在排种量增大时混种装置内易出现种子回流、堵塞等现象,导致排种系统高速播种作业适应性较差的问题,设计了一种突扩文丘里结构的高通量混种装置,通过理论分析确定了输种管直径、混种区长度、进种入口截面长度等关键结构参数;Fluent气流场仿真结果表明,当风速为12、15、18 m/s时,文丘里结构的混种装置喉管处负压最小值分别为-236、-372、-538 Pa,突扩文丘里结构的混种装置预混区负压最小值分别为-396、-621、-1007 Pa,突扩文丘里结构产生的“文丘里效应”优于普通文丘里结构;DEM-CFD耦合仿真结果表明,在混种过程中突扩文丘里结构的混种装置存在约12%油菜种子与突扩文丘里结构延伸部分碰撞后弹跳,碰撞后种子保持向混种区方向运移,油菜和小麦均未出现回流、堵塞等现象。台架试验结果表明,传统文丘里结构的混种装置在油菜混种通量大于等于2.4 g/s出现种子回流,小麦混种通量大于等于60 g/s时出现种子回流且各行排量一致性变异系数显著增大、混种通量大于等于100 g/s时发生堵塞;突扩文丘里结构的混种装置在油菜混种通量小于等于4.8 g/s、小麦混种通量小于等于120 g/s时未出现种子回流、堵塞等现象,油菜、小麦各行排量一致性变异系数低于5.17%、3.29%,总排量稳定性变异系数低于1.19%、0.80%,可满足油菜、小麦播种机速度为4~12 km/h的农艺播量要求,研究结果为气送式排种系统结构优化提供参考。 展开更多
关键词 气送式排种系统 油麦兼用 高通量 混种装置
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Zero-forcing beamforming with receiver antenna selection in downlink multi-antenna multi-user system
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作者 Huang Senhua Qiu Ling Shi Lin 《Journal of Systems Engineering and Electronics》 SCIE EI CSCD 2008年第6期1258-1263,共6页
A study on the zero-forcing beamforming (ZFBF) scheme with antenna selection at user terminals in downlink multi-antenna multi-user systems is presented. Simulation results show that the proposed ZFBF scheme with re... A study on the zero-forcing beamforming (ZFBF) scheme with antenna selection at user terminals in downlink multi-antenna multi-user systems is presented. Simulation results show that the proposed ZFBF scheme with receiver antenna selection (ZFBF-AS) achieves considerable throughput improvement over the ZFBF scheme with single receiver antenna. The results also show that, with multi-user diversity, the ZFBF-AS scheme approaches the throughput performance of the ZFBF scheme using all receiver antennas (ZFBF-WO-AS) when the base station adopts semi-orthogonal user selection (SUS) algorithm, and achieves larger throughput when the base station adopts the Round-robin scheduling algorithm. Compared with ZFBF-WO-AS, the proposed ZFBF-AS scheme can reduce the cost of user equipments and the channel state information requirement at the transmitter (CSIT) as well as the multiuser scheduling complexity at the transmitter. 展开更多
关键词 downlink multi-antenna multi-user system zero-forcing beamforming antenna selection throughput performance
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面向中压直流配电网的模块化多电平电池储能系统电荷吞吐量抑制策略 被引量:2
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作者 肖迁 于浩霖 +4 位作者 金昱 穆云飞 陆文标 李文华 贾宏杰 《中国电机工程学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第16期6482-6493,I0016,共13页
模块化多电平电池储能系统(modular multilevel converter-battery energy storage system,MMC-BESS)中各子模块功率周期性波动,与其相连的电池组充放电状态频繁切换,产生额外的电荷吞吐量,危害电池储能系统寿命。当MMC-BESS用于中压直... 模块化多电平电池储能系统(modular multilevel converter-battery energy storage system,MMC-BESS)中各子模块功率周期性波动,与其相连的电池组充放电状态频繁切换,产生额外的电荷吞吐量,危害电池储能系统寿命。当MMC-BESS用于中压直流配电网时,其交直流侧功率传输情况复杂多变,增大电荷吞吐量的抑制难度。因此,文中针对中压直流配电网中的MMC-BESS,提出一种基于二倍频环流注入的电荷吞吐量抑制策略。首先,构建中压直流配电网中MMC-BESS的数学模型;其次,剖析MMC-BESS电荷吞吐量的产生机理,分析不同运行方式下电荷吞吐量的影响因素;再次,提出基于二倍频环流注入的电荷吞吐量抑制策略,以系统总电荷吞吐量最小为目标,选取不同工况下需注入的最优二倍频环流分量;最后,多种工况下的仿真及实验结果表明,所提方法可有效抑制中压直流配电网中MMC-BESS的电荷吞吐量。 展开更多
关键词 中压直流配电网 电池储能系统 模块化多电平变换器 电荷吞吐量 环流注入
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融合多头自注意力的AeroMACS自适应调制编码算法
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作者 程龙 孟繁栋 +2 位作者 毛建华 袁树德 姜博文 《电光与控制》 CSCD 北大核心 2024年第6期36-41,共6页
航空移动机场通信系统(AeroMACS)因传输速率高、安全性好等优点成为机场、空地通信网络的重要组成部分。针对飞机起飞、着陆高速移动阶段的信道快速时变导致信道状态信息(CSI)过时和多普勒频移大等引起通信质量恶化的问题,利用多头自注... 航空移动机场通信系统(AeroMACS)因传输速率高、安全性好等优点成为机场、空地通信网络的重要组成部分。针对飞机起飞、着陆高速移动阶段的信道快速时变导致信道状态信息(CSI)过时和多普勒频移大等引起通信质量恶化的问题,利用多头自注意力机制,提出了基于Transformer神经网络的信道预测方法。根据实时预测的信噪比(SNR)来调整AeroMACS的WiMAX和5G双模的调制编码方案(MCS)。仿真结果表明,与其他3种人工智能方法相比,所提出的基于Transformer网络的信道预测方法能够达到较高的准确率,并提升了系统的总吞吐量,对缓解信道参数过时现状和提高系统通信性能具有良好的促进作用。 展开更多
关键词 航空移动机场通信系统 信道预测 多头自注意力 调制编码方案 系统吞吐量
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高通量卫星资源管控系统现状与趋势研究 被引量:2
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作者 秦鹏飞 衣龙腾 +4 位作者 周业军 张程 董赞扬 戚凯强 曾令超 《航天器工程》 CSCD 北大核心 2024年第1期99-106,共8页
随着灵活载荷技术的发展,高通量卫星从大容量向兼顾灵活性发展,资源管控系统作为高通量卫星在轨应用的关键部分,对提升系统资源利用率和降低单位带宽使用成本至关重要。文章总结了国外高通量卫星资源管控系统及资源管控算法的最新研究进... 随着灵活载荷技术的发展,高通量卫星从大容量向兼顾灵活性发展,资源管控系统作为高通量卫星在轨应用的关键部分,对提升系统资源利用率和降低单位带宽使用成本至关重要。文章总结了国外高通量卫星资源管控系统及资源管控算法的最新研究进展,包括泰雷兹公司、GMV公司、欧洲卫星(SES)公司、卫讯(Viasat)公司等提出的高通量卫星资源管控系统。结合高通量卫星资源在轨灵活管控需求,提出后续高通量卫星资源管控系统的发展趋势,例如,基于人工智能的资源管控系统成为后续发展的重要方向,同时,随着星上处理能力与存储能力的提升,星载资源管控系统架构也成为有潜力的发展方向而受到运营商的关注。 展开更多
关键词 高通量卫星 资源管控系统 灵活载荷
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高通量蛋白质结构生物信息学进展 被引量:2
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作者 祝云篪 陆祖宏 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1989-1999,共11页
本文总结了高通量蛋白质结构生物信息学的最新进展,包括结构数据管理、工具软件开发和结构数据挖掘三个主要方面。结构数据管理方面,得益于类AlphaFold系统的发展,蛋白质结构数据量实现爆发式增长,直接促进了压缩技术的升级,也吸引了研... 本文总结了高通量蛋白质结构生物信息学的最新进展,包括结构数据管理、工具软件开发和结构数据挖掘三个主要方面。结构数据管理方面,得益于类AlphaFold系统的发展,蛋白质结构数据量实现爆发式增长,直接促进了压缩技术的升级,也吸引了研究者对结构数据管理的关注。工具软件开发方面,以Foldseek为代表的新算法实现了高速的结构比对,突破了结构分析的通量瓶颈,此外深度学习模型的大量应用从多个方面改进了基于结构的蛋白质功能注释。结构数据挖掘方面,研究者以组学思维处理结构大数据,在持续的探索中提炼分析要素、优化方法,并在新工具的帮助下推动着结构数据挖掘的进阶。随着高通量方法的发展,结构生物信息学有望在生命科学中发挥更重要的作用。 展开更多
关键词 蛋白质结构生物信息学 高通量 类AlphaFold系统 结构蛋白质组学
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罗非鱼混养对广西三江传统稻渔综合种养系统环境及其菌群多样性的影响 被引量:1
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作者 王淼 莫洁琳 +6 位作者 韦领英 莫航 杨世宇 衣萌萌 范梓健 张紫玥 卢迈新 《水生态学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第2期141-147,共7页
研究罗非鱼混养对广西三江传统稻渔综合种养系统环境的影响,可为科学推广稻田金边鲤-罗非鱼混养模式提供基础。2021年5-10月设置3个试验组和1个对照组研究不同密度混养对种养系统环境及菌群多样性的影响,其中试验组内进行罗非鱼和金边... 研究罗非鱼混养对广西三江传统稻渔综合种养系统环境的影响,可为科学推广稻田金边鲤-罗非鱼混养模式提供基础。2021年5-10月设置3个试验组和1个对照组研究不同密度混养对种养系统环境及菌群多样性的影响,其中试验组内进行罗非鱼和金边鲤的混养,对照组为鲤单养组。结果表明,金边鲤的生长未受到罗非鱼混养的影响;高通量测序结果显示水体中的主要菌群为变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),其次为拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)和蓝菌门(Cyanobacteria),主要功能为化能异养和有氧化能异养;底泥中的主要菌群为变形菌门和绿弯菌门(Chloroflexi),其次为酸杆菌门(Acidobacteria)、广古菌门(Euryarchaeota)和蓝菌门,主要功能类群为甲烷生成和化能异养。罗非鱼高密度混养组稻田底泥中的总氮和硝酸盐氮含量有所下降,水体中Polynucleobacter等水质良好的指示物种相对丰度增加,罗非鱼混养对稻渔综合种养系统环境及其菌群产生了有益的影响。 展开更多
关键词 稻渔综合种养系统 罗非鱼 水体 底泥 菌群 高通量测序
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氨基酸脱氢酶突变体的高通量筛选方法 被引量:1
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作者 任红 谢莹莹 +4 位作者 黄锦婷 金钰莹 范文静 黄桂东 钟先锋 《化学与生物工程》 CAS 北大核心 2024年第6期21-28,共8页
基于显色体系和破壁条件的优化,构建了酶解破壁与显色反应相结合的氨基酸脱氢酶突变体高通量筛选方法。以颜色和吸光度表征内消旋-2,6-二氨基庚二酸脱氢酶(StDAPDH)酶活,以碘硝基四唑紫(INT)-吩嗪硫酸甲酯(PMS)为显色剂,通过其与StDAPD... 基于显色体系和破壁条件的优化,构建了酶解破壁与显色反应相结合的氨基酸脱氢酶突变体高通量筛选方法。以颜色和吸光度表征内消旋-2,6-二氨基庚二酸脱氢酶(StDAPDH)酶活,以碘硝基四唑紫(INT)-吩嗪硫酸甲酯(PMS)为显色剂,通过其与StDAPDH的偶联反应优化了显色体系;以StDAPDH酶活为评价指标,在单因素实验的基础上,采用响应面法探究了菌体量、破壁时间、溶菌酶加量对菌体破壁效果的影响。确定最优显色体系为:INT浓度0.1 mg·mL^(-1)、PMS浓度0.5μg·mL^(-1)、检测波长510 nm;确定最优菌体破壁条件为:30 mL OD 600值为1.5的菌悬液,离心后用10 mL PBS缓冲液重悬菌体沉淀,加入0.2 mg·mL^(-1)的溶菌酶,在37℃下破壁50 min。该方法简单高效,为氨基酸脱氢酶突变体的高通量筛选提供了一定参考。 展开更多
关键词 显色体系 破壁 高通量筛选 氨基酸脱氢酶
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IRS-NOMA系统最大化系统吞吐量优化
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作者 王璐 周婷 +1 位作者 徐天衡 胡宏林 《计算机工程与设计》 北大核心 2024年第5期1281-1288,共8页
在智能反射面辅助的上行非正交多址通信网络中,考虑到用户的位移会对智能反射面的服务效果带来影响,设计集中式和分布式两种智能反射面部署方案,并提出一种离散反射相位优化算法,运用半正定松弛法和高斯随机法,应用于这两种部署方案,以... 在智能反射面辅助的上行非正交多址通信网络中,考虑到用户的位移会对智能反射面的服务效果带来影响,设计集中式和分布式两种智能反射面部署方案,并提出一种离散反射相位优化算法,运用半正定松弛法和高斯随机法,应用于这两种部署方案,以达到最大化系统吞吐量的目的。仿真结果表明,所设计的优化算法能有效提升系统的吞吐量性能,同时表明了分布式部署方案比集中式对用户的位移具有更高的包容度。 展开更多
关键词 智能反射面 非正交多址接入 吞吐量最大化 相位优化 离散反射相位 位移用户 部署
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南瓜类胡萝卜素高通量提取检测体系建立及应用 被引量:1
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作者 宋慧 安学君 +1 位作者 黄芸萍 张香琴 《农学学报》 2024年第3期21-27,共7页
为了建立南瓜类胡萝卜素高通量提取检测体系,以南瓜果肉为试材,通过单因素试验和L27(313)正交试验,确定和优化南瓜类胡萝卜素提取的最佳提取液、提取温度和料液比。结果表明,乙醇是提取南瓜类胡萝卜素的最佳提取液,在55℃条件下,以料液... 为了建立南瓜类胡萝卜素高通量提取检测体系,以南瓜果肉为试材,通过单因素试验和L27(313)正交试验,确定和优化南瓜类胡萝卜素提取的最佳提取液、提取温度和料液比。结果表明,乙醇是提取南瓜类胡萝卜素的最佳提取液,在55℃条件下,以料液比1:28,浸提90 min,类胡萝卜素的得率显著高[(7.56±0.14) mg/100 g]。在南瓜类胡萝卜素的提取条件中,提取温度对提取效果影响最大,料液比×提取时间和提取时间×温度的互作次之。利用高通量提取检测体系比较分析23份不同类型南瓜材料类胡萝卜素含量,发现印度南瓜‘贝栗4号’和中国南瓜×印度南瓜远缘杂种自交系20F8的类胡萝卜素含量分别为(31.40±0.35) mg/100g和(24.72±0.72) mg/100 g,显著高于其他供试南瓜材料,具有显著的营养利用价值。试验获得的南瓜类葫芦卜素高效检测体系,省事省力,结果准确,可提高南瓜营养品质育种效率。 展开更多
关键词 南瓜 类胡萝卜素 高通量测定 远缘杂交 营养品质育种
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基于CRISPR-Cas系统的微生物基因编辑与调控技术 被引量:2
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作者 刘嵘明 谭慧萍 +3 位作者 王晴晴 张皓喃 孜力汗 梁丽亚 《微生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1-14,共14页
CRISPR-Cas系统的基因编辑与调控技术为原核和真核微生物的遗传改造提供了高效且精确的工具,显著提升了工业底盘细胞的生产能力和多样性。在原核微生物中,大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒杆菌等工业重要菌株通过CRISPR-Cas系统实现了... CRISPR-Cas系统的基因编辑与调控技术为原核和真核微生物的遗传改造提供了高效且精确的工具,显著提升了工业底盘细胞的生产能力和多样性。在原核微生物中,大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒杆菌等工业重要菌株通过CRISPR-Cas系统实现了代谢网络的重构和多基因位点的精确编辑,显著优化了细胞工厂的生产性能。在真核微生物中,酿酒酵母、毕赤酵母、解脂耶氏酵母等模式生物也得益于CRISPR-Cas系统的发展,尤其是CRISPR-Cas9、CRISPR-Cas12a和碱基编辑工具等在基因组精确编辑和调控中的应用,实现了代谢途径的高效优化。高通量基因组编辑技术,如CHASE、CREATE、iCREATE等,结合了CRISPR-Cas系统的强大工具,能够同时对多个基因进行编辑和调控,加速了对复杂表型的优化和代谢网络的解析。本文总结了CRISPR-Cas系统在原核、真核微生物中的应用及其高通量基因组编辑技术的发展,展望了这些技术在工业微生物细胞工厂构建中的潜在应用。 展开更多
关键词 CRISPR-Cas系统 微生物 基因编辑 碱基编辑 代谢网络 高通量基因组编辑 细胞工厂
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基于SoC的非对称数字系统算法设计与实现
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作者 姜智 肖昊 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第5期655-659,677,共6页
文章提出一种在片上系统(System on Chip,SoC)实现高吞吐率的有限状态熵编码(finite state entropy,FSE)算法。通过压缩率、速度、资源消耗、功耗4个方面对所提出的编码器和解码器与典型的硬件哈夫曼编码(Huffman coding,HC)进行性能比... 文章提出一种在片上系统(System on Chip,SoC)实现高吞吐率的有限状态熵编码(finite state entropy,FSE)算法。通过压缩率、速度、资源消耗、功耗4个方面对所提出的编码器和解码器与典型的硬件哈夫曼编码(Huffman coding,HC)进行性能比较,结果表明,所提出的硬件FSE编码器和解码器具有显著优势。硬件FSE(hFSE)架构实现在SoC的处理系统和可编程逻辑块(programmable logic,PL)上,通过高级可扩展接口(Advanced eXtensible Interface 4,AXI4)总线连接SoC的处理系统和可编程逻辑块。算法测试显示,FSE算法在非均匀数据分布和大数据量情况下,具有更好的压缩率。该文设计的编码器和解码器已在可编程逻辑块上实现,其中包括1个可配置的缓冲模块,将比特流作为单字节或双字节配置输出到8 bit位宽4096深度或16 bit位宽2048深度的块随机访问存储器(block random access memory,BRAM)中。所提出的FSE硬件架构为实时压缩应用提供了高吞吐率、低功耗和低资源消耗的硬件实现。 展开更多
关键词 有限状态熵编码(FSE) 哈夫曼编码(HC) 片上系统(SoC) 高吞吐率 块随机访问存储器(BRAM)
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基于PiggyBac转座子优化稳定表达细胞系的新型瞬时受体电位M2通道抑制剂筛选
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作者 应凯悦 华宁 +3 位作者 骆燕萍 刘星宇 刘敏 杨巍 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期604-614,共11页
目的:使用PiggyBac(PB)转座系统建立稳定表达瞬时受体电位M2(TRPM2)通道的人胚胎肾细胞HEK293T,并进行TRPM2通道抑制剂筛选,为治疗脑缺血等疾病寻找潜在的药物。方法:根据PB转座原理,构建pPB-hTRPM2真核表达载体。将重组质粒和辅助质粒... 目的:使用PiggyBac(PB)转座系统建立稳定表达瞬时受体电位M2(TRPM2)通道的人胚胎肾细胞HEK293T,并进行TRPM2通道抑制剂筛选,为治疗脑缺血等疾病寻找潜在的药物。方法:根据PB转座原理,构建pPB-hTRPM2真核表达载体。将重组质粒和辅助质粒共同转染至HEK293T细胞中,利用系统携带的荧光与膜片钳鉴定TRPM2基因表达,通过Z'因子评估细胞模型是否适用于钙成像法的高通量筛选。利用钙成像法和膜片钳对11个先导化合物分子进行初步活性评价,测定化合物分子对TRPM2通道的抑制活性。利用氧糖剥夺/再灌注(OGD/R)损伤模型和细胞计数试剂盒8(CCK-8)方法验证筛选得到的化合物分子对损伤细胞的保护作用。利用流式细胞术检测细胞活性氧水平。利用小鼠短暂性大脑中动脉栓塞(tMCAO)模型评价化合物的神经保护作用。结果:成功构建pPB-hTRPM2真核表达载体,构建出可高效表达TRPM2基因的HEK293T细胞系,并同时表达增强型绿色荧光蛋白(EGFP)。在筛选获得的嘌呤霉素抗性细胞中,所有细胞荧光明亮可见,诱导后细胞表现出经典的TRPM2通道电流特征,TRPM2通道电流值与瞬时转染对照组差异无统计学意义(P>0.05)。该筛选系统进行钙成像实验的Z'因子为0.5416,表明其适用于高通量筛选。通过钙成像法结合膜片钳筛选出化合物6,其具有显著的TRPM2通道抑制作用,且1.0μmol/L的化合物6能够显著提高OGD/R后SH-SY5Y细胞的存活率(P<0.05),降低活性氧水平(P<0.05),0.3、1.0 mg/kg的化合物6能降低tMCAO小鼠脑梗死体积百分比(均P<0.05)。结论:利用PiggyBac基因编辑技术成功构建了TRPM2基因稳定表达细胞系,利用钙成像法和膜片钳在候选化合物中成功筛选出一个高亲和力的新的TRPM2通道抑制剂。该抑制剂可以通过降低细胞活性氧水平缓解OGD/R后细胞损伤,并对小鼠脑缺血再灌注损伤具有保护作用。 展开更多
关键词 PiggyBac转座系统 瞬时受体电位M2型 高通量筛选 膜片钳 氧糖剥夺/再灌注损伤 短暂性大脑中动脉栓塞 小鼠
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中国内地集装箱港口体系吞吐量增长的俱乐部收敛研究
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作者 李婉莹 尤再进 隋意 《运筹与管理》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第5期154-160,共7页
本文旨在探究中国内地集装箱港口体系发展是否存在俱乐部收敛。基于2001—2020年52个集装箱港口的吞吐量数据,采用非线性时变因子模型对港口体系进行收敛识别和俱乐部聚类,在此基础上采用定序逻辑模型探索俱乐部收敛的驱动机制。主要研... 本文旨在探究中国内地集装箱港口体系发展是否存在俱乐部收敛。基于2001—2020年52个集装箱港口的吞吐量数据,采用非线性时变因子模型对港口体系进行收敛识别和俱乐部聚类,在此基础上采用定序逻辑模型探索俱乐部收敛的驱动机制。主要研究结果表明:(1)中国内地集装箱港口吞吐量增长不存在整体收敛,可划分为4个不同层次的俱乐部;(2)中国集装箱港口体系规模分布相对集中,部分中小港口发展相对缓慢甚至停滞;(3)港口的初始条件、港口所在城市的规模、外贸、产业结构和交通发展速度能够影响集装箱吞吐量的收敛水平,但经贸推动是港口发展的源动力。 展开更多
关键词 中国内地集装箱港口体系 俱乐部收敛 定序逻辑模型 驱动机制 集装箱吞吐量
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港口体系转型的空间格局及影响因素——基于长江三角洲实证分析 被引量:10
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作者 蒋自然 朱华友 +1 位作者 王成金 叶士琳 《地理科学》 CSSCI CSCD 北大核心 2021年第7期1187-1198,共12页
采用"理论演绎-案例实证-机理阐释"的研究逻辑,从空间视角提出理论假设,分析港口体系在运量、航线与后勤3个维度的集散及转型规律,并以长三角集装箱港口体系为例进行假设验证。结果表明,运量和航线总体上表现为空间分散化态势... 采用"理论演绎-案例实证-机理阐释"的研究逻辑,从空间视角提出理论假设,分析港口体系在运量、航线与后勤3个维度的集散及转型规律,并以长三角集装箱港口体系为例进行假设验证。结果表明,运量和航线总体上表现为空间分散化态势,低端后勤要素亦由中心枢纽港城市向外围边缘港城市扩散,但高端后勤要素在空间上呈现出进一步向中心枢纽港城市集聚的趋势。通过数理模型研究发现,全球化、市场化、信息化等外部因素以及城市工业发展水平促使运量和航线趋于集聚分布,腹地经济实力、传统交通因素以及金融发展水平、服务化水平等推动运量和航线趋于离散分布;同时,腹地经济和交通等传统因素对港口后勤要素区位选择的影响程度有所下降,而全球化、市场化、服务化等外部因素以及信息化、金融发展水平等新兴因素的影响程度明显上升,尤其对高端后勤要素的区位决策影响更显著。 展开更多
关键词 港口体系 运量 航线 后勤要素 长三角
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分布式文件系统存储介质评测与分析 被引量:9
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作者 许春聪 黄小猛 +2 位作者 吴诺 孙宁伟 杨广文 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2010年第10期1873-1880,共8页
文中分析了磁盘、SSD和DRAM的价格和能耗,测试了分布式文件系统HDFS、MooseFS和CarrierFS部署在不同存储介质上的数据吞吐率,接着提出了一种存储介质的性价比理论模型,并分析了当前、2015年和2020年不同存储介质的性价比和变化趋势.通... 文中分析了磁盘、SSD和DRAM的价格和能耗,测试了分布式文件系统HDFS、MooseFS和CarrierFS部署在不同存储介质上的数据吞吐率,接着提出了一种存储介质的性价比理论模型,并分析了当前、2015年和2020年不同存储介质的性价比和变化趋势.通过性价比分析可得,DRAM具有较大的性价比优势,适合于高并发随机访问应用.随着DRAM容量的快速提升,未来DRAM有可能成为可选的数据存储介质.当前,SSD虽然具有较好的访问性能,但其价格高、容量小、性价比低于磁盘.2015年SSD的性价比将超过磁盘,有可能替代磁盘成为大规模存储系统的基本存储设备. 展开更多
关键词 分布式文件系统 吞吐率 存储介质
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