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Insync Surveys图书馆用户满意度调查分析 被引量:8
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作者 张为杰 杨广锋 周婕 《图书情报知识》 CSSCI 北大核心 2009年第6期34-38,86,共6页
Insync Surveys,原名Ambit Insights/Rodski Survey Research,是澳大利亚一家调查服务公司。其用户满意度调查自1998年在墨尔本大学图书馆实施以来,影响不断扩大,并与CAUL建立了稳定的合作关系。Insync Surveys以关注度-满意度为方法基... Insync Surveys,原名Ambit Insights/Rodski Survey Research,是澳大利亚一家调查服务公司。其用户满意度调查自1998年在墨尔本大学图书馆实施以来,影响不断扩大,并与CAUL建立了稳定的合作关系。Insync Surveys以关注度-满意度为方法基础,指标体系灵活调整,并提供基本调查和全面调查两种服务模式,取得了良好的实践效果。 展开更多
关键词 Insync surveys Rodski 满意度调查 服务质量评估
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基于基因组Survey的翅果菊基因组大小评估及特征分析
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作者 赵椿柳 张彬 +7 位作者 宗梅 赵泓 薛迎飞 王晨晨 刘洋洋 高普 孙成 李大勇 《草地学报》 北大核心 2025年第11期3540-3549,共10页
翅果菊(Lactuca indica)是一种兼具药用、食用及饲用价值的植物资源,其生物量大、适应性强,可作为优质饲草。目前,翅果菊的基因组信息仍比较匮乏,这限制了它的分子育种研究及资源利用。本研究利用流式细胞术和基因组Survey等实验手段,... 翅果菊(Lactuca indica)是一种兼具药用、食用及饲用价值的植物资源,其生物量大、适应性强,可作为优质饲草。目前,翅果菊的基因组信息仍比较匮乏,这限制了它的分子育种研究及资源利用。本研究利用流式细胞术和基因组Survey等实验手段,对翅果菊的基因组大小及特征进行综合评估。染色体计数分析结果显示,翅果菊体细胞染色体数目为2n=18;流式细胞术分析估测翅果菊基因组大小介于4.26~4.50 Gb区间;基于二代DNA测序的K-mer分析结果表明,翅果菊基因组大小约4.76 Gb,重复序列比例约73.76%,杂合率约0.24%;基因组初步组装后,获得了总长度为4.02 Gb,重叠群N_(50)达5070 bp的初代翅果菊基因组。本研究提供了对翅果菊基因组的初步解析,为其未来分子育种及饲用价值挖掘提供了数据支持。 展开更多
关键词 翅果菊 基因组大小 基因组survey 饲用植物 K-mer分析
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光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)基因组Survey及线粒体基因组研究
3
作者 赖洁 叶树政 +6 位作者 黄文炜 李斯迅 邓彬华 韩崇 龚剑 桂林 李强 《海洋与湖沼》 北大核心 2025年第2期423-432,共10页
光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)是我国南部重要经济鱼类,为了解其基因组特征及线粒体基因组结构,首次采用二代高通量测序技术对珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组进行Survey分析,并在此基础上提取出两者的线粒体基因组。结果显示珠江和赣... 光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi)是我国南部重要经济鱼类,为了解其基因组特征及线粒体基因组结构,首次采用二代高通量测序技术对珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组进行Survey分析,并在此基础上提取出两者的线粒体基因组。结果显示珠江和赣江水系光倒刺鲃基因组大小分别为1769.91 Mb和1846.46 Mb,均为简单杂合型基因组。珠江和赣江水系光倒刺鲃线粒体基因组长度分别为16543 bp和16546 bp,除16S rRNA、tRNA-Leu(UUA)和D-loop区外,两水系其他线粒体基因长度一致。光倒刺鲃线粒体蛋白编码基因中出现不完整的密码子T/TA。tRNA中除tRNA-Ser(GCT)外,其他均能折叠形成正常二级结构。利用线粒体基因组序列计算各水系个体间的遗传距离,使用邻接法和贝叶斯法构建系统进化树,结果表明赣江和桐江水系光倒刺鲃亲缘关系最近,台湾水系光倒刺鲃与大陆水系的亲缘关系较远,台湾种群光倒刺鲃可能是有效种。该研究旨在为研究光倒刺鲃群体遗传学和分子系统学提供基础信息,为今后其种质鉴定、保护和开发利用提供科学依据。 展开更多
关键词 光倒刺鲃 基因组Survey 线粒体基因组 系统发育
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热带胎生睡莲保罗蓝基因组大小及Survey测序分析
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作者 苏群 赵家惠 +7 位作者 王虹妍 喇燕菲 方明雅 盛威 石林 唐毓玮 田敏 王凌云 《南方农业学报》 北大核心 2025年第2期407-415,共9页
【目的】研究热带胎生睡莲保罗蓝基因组大小等特征,为开展睡莲全基因组图谱绘制、重要性状功能基因挖掘及加快热带胎生睡莲分子育种进程提供参考依据。【方法】以保罗蓝睡莲2~3 cm长的幼嫩根尖和3~5 cm长幼嫩未展开的叶片为试验材料,以... 【目的】研究热带胎生睡莲保罗蓝基因组大小等特征,为开展睡莲全基因组图谱绘制、重要性状功能基因挖掘及加快热带胎生睡莲分子育种进程提供参考依据。【方法】以保罗蓝睡莲2~3 cm长的幼嫩根尖和3~5 cm长幼嫩未展开的叶片为试验材料,以已知基因组大小的玉米为内参植物,采用流式细胞术检测并估算保罗蓝睡莲的基因组大小,并与已公开发表的二倍体睡莲蓝星进行比较,初步判断保罗蓝睡莲的染色体倍型。采用荧光原位杂交法分析保罗蓝睡莲染色体数目、长度等,并结合基于K-mer分析的全基因组Survey测序和生物信息学方法,进一步明确保罗蓝睡莲基因组大小、倍性、杂合率、重复率等信息。【结果】流式细胞术估算保罗蓝睡莲基因组大小为0.82 Gb,对比二倍体蓝星睡莲基因组,可初步判断出其为四倍体。利用基因组DAPI荧光染色及荧光原位杂交进一步证明保罗蓝睡莲基因组为四倍体,具有56条染色体,长度为0.45~1.50μm,核型公式为2n=4x=56。利用BGI测序平台对保罗蓝睡莲进行Survey测序分析,获得原始序列615552560条,有效碱基共92.33 Gb,其中GC含量为39.45%,Q20为97.08%,Q30为91.97%;有效序列(Clean reads)615552500条,有效碱基共89.17 Gb,其中Clean reads中GC含量为39.00%,Q20为97.11%,Q30为92.05%。Survey总测序深度为106.9X,通过K-mer(K=19)分析修正后的保罗蓝睡莲基因组大小为834.12 Mb,杂合率为1.95%,重复率为68.48%。Smudgeplot分析结果也表明保罗蓝睡莲为四倍体,其中以四倍体AAAB出现的频率最高,为0.43。【结论】保罗蓝睡莲基因组属于高杂合高重复的复杂四倍体基因组,推测其基因组结构为AAAB,具有3套同源单倍型基因组,组装难度较高。 展开更多
关键词 保罗蓝睡莲 流式细胞术 荧光原位杂交 Survey测序 K-mer分析
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基于流式细胞术和基因组Survey测定川滇无患子基因组大小
5
作者 尹月 周美君 张永洪 《贵州农业科学》 2025年第4期125-132,共8页
【目的】测定川滇无患子基因组大小,为川滇无患子全基因组测序和无患子属中其他物种的基因组大小评估提供重要依据。【方法】在进行全面深度测序前,采用流式细胞术和K-mer分析法评估川滇无患子基因组的特征信息。【结果】基于流式细胞... 【目的】测定川滇无患子基因组大小,为川滇无患子全基因组测序和无患子属中其他物种的基因组大小评估提供重要依据。【方法】在进行全面深度测序前,采用流式细胞术和K-mer分析法评估川滇无患子基因组的特征信息。【结果】基于流式细胞术估算的川滇无患子基因组大小为450Mb;K-mer分析法估算的川滇无患子基因组大小为331.04Mb,杂合度为1.67%,重复序列占比约为40.0%,基因组GC含量约为36.57%,其基因组为低重复高杂合的二倍体基因组。【结论】川滇无患子基因组为低重复高杂合的二倍体基因组。 展开更多
关键词 川滇无患子 基因组 流式细胞术 基因组Survey 杂合度 序列
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云南澄广花基因组大小的测定和分析
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作者 原晓龙 杨跃仙 +2 位作者 卯梅华 张传光 王毅 《西南林业大学学报(自然科学)》 北大核心 2025年第3期202-207,共6页
以玉米和番茄作为内参植物,采用联合流式细胞术和基因组survey分析结合的方法评估云南澄广花的基因组大小,并分析其基因组特征。结果表明:流式细胞术估算云南澄广花基因组大小约为866.53 Mb或781.82 Mb;高通量测序获得原始数据125.97 Gb... 以玉米和番茄作为内参植物,采用联合流式细胞术和基因组survey分析结合的方法评估云南澄广花的基因组大小,并分析其基因组特征。结果表明:流式细胞术估算云南澄广花基因组大小约为866.53 Mb或781.82 Mb;高通量测序获得原始数据125.97 Gb,处理后得到约123.33 Gb的有效测序数据,说明测序数据质量良好;K-mer分析预估云南澄广花基因组大小约为782.90 Mb(K=19),杂合度为0.86%左右;当K=21时,评估基因组大小约为781.20 Mb,杂合度为0.90%,说明云南澄广花基因组为高杂合基因组;NT数据库比对发现相似度较高的前3位为蕉木、海南藤春和茎花玉盘(与云南澄广花属同一科)。 展开更多
关键词 云南澄广花 流式细胞术 survey分析 基因组
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基于流式细胞术和全基因组Survey的盐爪爪基因组大小测定
7
作者 刘鹏辉 袁庆 +3 位作者 宋晓硕 任飞 秦乐乐 刘海瑞 《种子》 北大核心 2025年第8期94-100,135,共8页
为制定盐爪爪全基因组测序以及染色体水平基因组组装策略方案,以二倍体盐生植物盐爪爪为研究对象,采用流式细胞术和基因组Survey对盐爪爪基因组大小以及杂合率等相关特征进行评估。流式细胞术结果表明,盐爪爪的基因组大小在0.93~1.01 G... 为制定盐爪爪全基因组测序以及染色体水平基因组组装策略方案,以二倍体盐生植物盐爪爪为研究对象,采用流式细胞术和基因组Survey对盐爪爪基因组大小以及杂合率等相关特征进行评估。流式细胞术结果表明,盐爪爪的基因组大小在0.93~1.01 Gb之间,通过基因组Survey测定盐爪爪基因组大小为987.17 Mb,杂合率为1.01%,重复序列比例为63.72%,表明盐爪爪基因组属于一般复杂基因组。采用K-mer=41进行初步组装,得到Contig N50为765 bp,总长为814715464 bp,Scaffold N50为1170 bp,总长为848776486 bp。 展开更多
关键词 盐爪爪 基因组Survey 流式细胞术
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上海世博会出行方式选择意愿建模与场景分析 被引量:11
8
作者 杜豫川 蒋盛川 +1 位作者 朱迪 孙立军 《同济大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第4期515-520,共6页
针对2010年上海世博会客流来源广泛、背景差异大的特点,设计了两阶段递进式的SP(stated preference survey)调查方法,进行了大规模的世博客流出行方式选择意愿调查,多层次地分析了各种影响因素的效用;以此为基础,建立了描述本地、外地... 针对2010年上海世博会客流来源广泛、背景差异大的特点,设计了两阶段递进式的SP(stated preference survey)调查方法,进行了大规模的世博客流出行方式选择意愿调查,多层次地分析了各种影响因素的效用;以此为基础,建立了描述本地、外地住宿、外地一日游等不同类型游客出行方式选择行为的多项Logit模型;利用这些出行方式离散选择模型,分析对比了多种交通管理措施和政策的组合场景实施效果,针对性地给出了世博交通管理的建议措施. 展开更多
关键词 世博交通管理 出行方式选择 递进式SP(stated PREFERENCE survey)调查 离散选择模型 场景分析
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罗源湾海水中重金属的调查研究 被引量:6
9
作者 邹栋梁 高淑英 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1989年第S1期144-147,共4页
为了开发利用罗源湾,我们于1986年11月至1987年9月调查了海水中重金属,报道了罗源湾海水中Cu,Pb,Zn,Cd,Hg②的含量及其分布特征,并着重研究了表层海水中Cu,Pb,Zn,Cd含量与盐度的关系。
关键词 HEAVY metal. Survey. Extraction. GFAAS SALINITY
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黑壳楠染色体核型分析及基因组Survey预测 被引量:2
10
作者 逯久幸 刘燕 +3 位作者 许朵朵 陈鹏 李永华 刘红利 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2023年第6期967-974,共8页
【目的】明确黑壳楠(Lindera megaphylla)染色体形态结构特征和基因组基本信息。【方法】以野生黑壳楠为材料,采用荧光原位杂交法,对染色体进行核型分析,并通过基因组survey预测了黑壳楠基因组的基本信息。【结果】黑壳楠染色体数目为2n... 【目的】明确黑壳楠(Lindera megaphylla)染色体形态结构特征和基因组基本信息。【方法】以野生黑壳楠为材料,采用荧光原位杂交法,对染色体进行核型分析,并通过基因组survey预测了黑壳楠基因组的基本信息。【结果】黑壳楠染色体数目为2n=24,核型公式为2n=2X=24=18m(2SAT)+6sm,9号染色体存在1对随体,属于2B型染色体。染色体组绝对长度变异范围为2.92~5.83,相对长度的变化范围为5.33%~11.11%,核型不对称系数为59.49%。研究还发现,存在1对5S rDNA杂交位点和1对18S rDNA杂交位点,分别位于5号和9号染色体。18S rDNA杂交位点2个杂交信号位置相同、强度近似。基因组survey结果显示,黑壳楠基因大小为1.38 Gb,杂合率为0.8%,重复序列比例为70%。【结论】黑壳楠为2倍体,染色体数目为24条,核型相对对称。黑壳楠在樟科的进化中属于较为原始的物种,且染色体未发生重组、变异或者种内杂交等现象。黑壳楠为大基因组,杂合率较高,重复序列多的物种。 展开更多
关键词 黑壳楠 核型分析 荧光原位杂交 基因组survey
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轿车尾流移测试验研究 被引量:1
11
作者 张群锋 王望予 +1 位作者 傅立敏 蔡国华 《兵工学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2000年第1期57-60,共4页
轿车的尾流结构与其空气阻力、升力与安全性有密切联系 ,为进一步研究轿车尾流结构及验证尾流场数值模拟结果的精确性提供依据 ,需通过试验得到较为全面地反映尾流结构的定量信息。为此 ,进行了红旗CA774轿车 1 10模型的七孔探针尾流移... 轿车的尾流结构与其空气阻力、升力与安全性有密切联系 ,为进一步研究轿车尾流结构及验证尾流场数值模拟结果的精确性提供依据 ,需通过试验得到较为全面地反映尾流结构的定量信息。为此 ,进行了红旗CA774轿车 1 10模型的七孔探针尾流移测试验 。 展开更多
关键词 尾流结构 尾流移测 七孔探针 A WAKE TRAVERSE SURVEY ON PASSENGER CARS Zhang Qunfeng Wang Wangyu FU Limin
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China’s Future Missions for Deep Space Exploration and Exoplanet Space Survey by 2030 被引量:4
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作者 JI Jianghui WANG Su 《空间科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期729-731,共3页
Four future missions for deep space exploration and future space-based exoplanet surveys on habitable planets by 2030 are scheduled to be launched.Two Mars exploration missions are designed to investigate geological s... Four future missions for deep space exploration and future space-based exoplanet surveys on habitable planets by 2030 are scheduled to be launched.Two Mars exploration missions are designed to investigate geological structure,the material on Martian surface,and retrieve returned samples.The asteroids and main belt comet exploration is expected to explore two objects within 10 years.The small-body mission will aim to land on the asteroid and get samples return to Earth.The basic physical characteristics of the two objects will be obtained through the mission.The exploration of Jupiter system will characterize the environment of Jupiter and the four largest Moons and understand the atmosphere of Jupiter.In addition,we further introduce two space-based exoplanet survey by 2030,Miyin Program and Closeby Habitable Exoplanet Survey(CHES Mission).Miyin program aims to detect habitable exoplanets using interferometry,while CHES mission expects to discover habitable exoplanets orbiting FGK stars within 10 pc through astrometry.The above-mentioned missions are positively to achieve breakthroughs in the field of planetary science. 展开更多
关键词 Deep space exploration Exoplanet surveys MARS JUPITER Habitable planets
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OneGeology:Making Geological Map Data for the Earth Accessible 被引量:2
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作者 Chloe Wrighton Catherine Pennington 《地学前缘》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期278-278,共1页
OneGeology is an international initiative of the geological surveys of the world and a flagship project of the"International Year of Planet Earth".Its aim is to create a digital geological map of the world a... OneGeology is an international initiative of the geological surveys of the world and a flagship project of the"International Year of Planet Earth".Its aim is to create a digital geological map of the world and to make it available via the web to all.The target scale is l:l million but the project is pragmatic and accepts a range of scales and the best available data.To date, 102 countries are participating in the project and。 展开更多
关键词 GLOBAL GEOLOGY MAP GEOLOGICAL surveys OneGeology
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Windshield Survey在社区评估中的应用 被引量:2
14
作者 陈杰 余立平 《护理学杂志》 2010年第11期80-81,共2页
目的对武汉市部分社区进行环境、卫生保健及社会服务等评估,为实施有效的社区健康护理提供实证参考。方法采用Windshield Survey和访谈相结合的方式对9个社区进行环境、卫生保健与社会服务、经济、交通与安全、政治与政府、信息传递、... 目的对武汉市部分社区进行环境、卫生保健及社会服务等评估,为实施有效的社区健康护理提供实证参考。方法采用Windshield Survey和访谈相结合的方式对9个社区进行环境、卫生保健与社会服务、经济、交通与安全、政治与政府、信息传递、教育和社区娱乐8个子系统评估。结果 9个社区的共同优势为生活气息浓厚,比较适宜居住,出行方便,医疗卫生服务具有较强的可及性,娱乐丰富和上学方便,有浓厚的文化气息;问题为卫生状况较差,空巢老人较多和部分孤寡老人的基本生理及健康需求得不到满足。结论社区的优势和不足均非常明显,需针对性加强卫生宣传,改善环境;加强志愿者队伍建设,完善高龄孤寡老人照护机制;加强社区健康教育,以全面提升社区人群的生活质量。 展开更多
关键词 社区评估 WINDSHIELD SURVEY 健康问题 社区护理
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山桐子基因组调研及SSR特征
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作者 周文才 何小三 +3 位作者 李进 幸伟年 龚春 左继林 《南方林业科学》 2024年第6期1-5,共5页
为了研究山桐子的遗传背景,进一步为山桐子基因组简单重复序列(SSR)标记开发、种质资源遗传评价等研究提供基础,采用高通量测序技术开展山桐子基因组调研,并基于山桐子基因组测序数据,利用MISA软件检索基因组SSR并分析其组成特征。结果... 为了研究山桐子的遗传背景,进一步为山桐子基因组简单重复序列(SSR)标记开发、种质资源遗传评价等研究提供基础,采用高通量测序技术开展山桐子基因组调研,并基于山桐子基因组测序数据,利用MISA软件检索基因组SSR并分析其组成特征。结果表明:(1)山桐子的基因组大小约为1.23 Gb,基因组重复序列含量约为57.00%,杂合度约为1.05%。(2)共检索到重复单元长度为2~7个核苷酸的SSR位点392 580个,SSR平均分布距离为1.73 kb,平均出现频率为578.65个·Mb~(-1)。二核苷酸重复类型SSR数量最多,占比80.41%,三、四、五、六、七核苷酸重复类型数量依次减少;SSR中优势重复基元富含A/T核苷酸。(3)重复次数为5~10次的SSR数量占总数的79.79%,其中重复次数为5次的SSR数量最多,占总数的36.25%;重复次数为11~15次的SSR数量占总数的11.85%;重复次数为16次以上的SSR数量占总数的8.36%。(4)SSR基序长度为12~57 bp,10~20 bp的SSR数量占总数的73.34%,其中10 bp的SSR数量最多,占总数的27.75%;20~30 bp的SSR数量占总数的15.67%;大于30 bp的SSR数量占总数的10.99%。研究结果表明,山桐子基因组为高杂合的复杂基因组,且基因组中SSR标记非常丰富。 展开更多
关键词 山桐子 基因组 SURVEY SSR 多样性
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Evaluation of the Validity of Interpretation System for the Visitors to Yuntaishan Global Geopark in China
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作者 Dongying Wei,Min Wang College of Geography,Beijing Normal University,Beijing 100875,China. 《地学前缘》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期303-303,共1页
This study was conducted over a twelve-month period of study at Yuntaishan Global Geopark centered to assess the validity of interpretation system for the visitors there.And the author designed four sets of questionna... This study was conducted over a twelve-month period of study at Yuntaishan Global Geopark centered to assess the validity of interpretation system for the visitors there.And the author designed four sets of questionnaires for it,one for Chinese visitors, one for English-speaking visitors,one for the interpreters and one for management staffs of Yuntaishan Global Geopark.1149 Chinese visitors,15 English-speaking visitors,63 interpreters and 展开更多
关键词 EVALUATION VISITOR surveys Yuntaishan GLOBAL GEOPARK INTERPRETATION system
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Green Fingers for Sustainable Groundwater Resource Development in an Urban Node at Tellapur,Greater Hyderabad,India
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作者 L.Surinaidu G.Thamma Rao +2 位作者 J.Mahesh G.Ramesh V.V.S.Gurunadha Rao 《地学前缘》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期8-8,共1页
Integrated geological,geochemical and geophysical investigations have been carried out for the groundwater management in Tellapur Urban node, Greater Hyderbad,India.The watershed covering an area of 10 km^2,a part of ... Integrated geological,geochemical and geophysical investigations have been carried out for the groundwater management in Tellapur Urban node, Greater Hyderbad,India.The watershed covering an area of 10 km^2,a part of Nakkavagu catchment in the Manjira River sub-basin,which is a tributary of Godavari River.Electrical Resistivity Tomography and conventional Resistivity investigations have been carried out at different locations for assessment of sub-surface geometry as well as groundwater condi- 展开更多
关键词 GROUNDWATER management ERT surveys URBAN NODE
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金钱鱼基因组微卫星分布特征分析及多态性标记开发 被引量:15
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作者 王耀嵘 杨尉 +5 位作者 任席林 江东能 邓思平 陈华谱 朱春华 李广丽 《广东海洋大学学报》 CAS 2020年第4期7-14,共8页
【目的】研究金钱鱼(Scatophagus argus)全基因组微卫星分布特征,筛选高多态性微卫星(SSR)标记。【方法】利用MISA软件对金钱鱼基因组中微卫星进行筛选并分析分布特征,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点。【结果与结... 【目的】研究金钱鱼(Scatophagus argus)全基因组微卫星分布特征,筛选高多态性微卫星(SSR)标记。【方法】利用MISA软件对金钱鱼基因组中微卫星进行筛选并分析分布特征,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点。【结果与结论】金钱鱼基因组总共挖掘390967个SSR位点,相对丰度为653个/Mb。二碱基重复类型最多(52.64%),微卫星标记整体偏向A+T碱基组合。筛选出23对多态性标记位点,其中7对的等位基因数为4~11,期望杂合度为0.431~0.859,观测杂合度0.417~0.861,多态性含量为0.389~0.830。经Bonferroni校正后,5个位点符合哈德温伯格平衡,且位点间不存在连锁不平衡现象。 展开更多
关键词 金钱鱼 基因组survey测序 微卫星 标记开发
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基于流式细胞法和K-mer分析法检测沙鞭基因组大小 被引量:6
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作者 刘涛 刘玉萍 +7 位作者 富贵 吕婷 刘峰 张雨 苏丹丹 王亚男 郑长远 苏旭 《草业学报》 CSCD 北大核心 2022年第12期133-145,共13页
禾本科沙鞭属仅包含沙鞭一个种。沙鞭具有根茎繁殖、克隆整合等典型沙生植物特征,是我国内蒙古高原非固定沙地的建群种。本研究采用流式细胞术和K-mer分析方法测定沙鞭基因组大小,建立和优化以芨芨草为内参物种、青海固沙草和方穗山羊... 禾本科沙鞭属仅包含沙鞭一个种。沙鞭具有根茎繁殖、克隆整合等典型沙生植物特征,是我国内蒙古高原非固定沙地的建群种。本研究采用流式细胞术和K-mer分析方法测定沙鞭基因组大小,建立和优化以芨芨草为内参物种、青海固沙草和方穗山羊草为外参物种的二倍体植物DNA含量(DNA C值)测定体系。研究结果表明:1)沙鞭流式细胞峰值荧光是青海固沙草的2。54倍,是芨芨草的1。35倍,峰值信号远小于方穗山羊草,推测沙鞭基因组大小约为1580。10±5。02 Mb;2)K-mer分析结果表明,沙鞭基因组大小为1563。54 Mb,杂合率1。15%,重复序列比例为66。27%,基因组GC含量为43。4%,属于高杂合、高重复的复杂基因组;3)沙鞭基因组可使用PacBio平台CLR或HiFi模式进行三代测序,测序深度应不低于20×。沙鞭基因组大小的准确测定不仅补充了禾本科针茅族植物的DNA含量数据,同时也为沙鞭基因组测序、进化基因组研究、种质资源开发和利用以及遗传资源保护提供了数据参考,可为针茅族近缘物种基因组大小测定提供借鉴。 展开更多
关键词 基因组大小 DNA C值 流式细胞术 基因组survey测序 K-mer分析
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Survey Propagation:一种求解SAT的高效算法 被引量:6
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作者 李韶华 张健 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2005年第1期132-137,共6页
Survey ProPagation是一种新生的SAT(CSP)算法。它基于统计物理的sPin glass 模型,针对具体问题进行纵览(survey),从而极大地降低求解的复杂度。但sp算法在某些时候不收敛,或引导向错误的解。对此,G.Parisi提出一种复杂回溯(backtrack)... Survey ProPagation是一种新生的SAT(CSP)算法。它基于统计物理的sPin glass 模型,针对具体问题进行纵览(survey),从而极大地降低求解的复杂度。但sp算法在某些时候不收敛,或引导向错误的解。对此,G.Parisi提出一种复杂回溯(backtrack)算法,而作者在sp中加入简单回溯,也使一部分此类问题得到解决。 展开更多
关键词 “Survey Propagation” SAT算法 可满足性问题 求解算法 不完备搜索方法 人工智能 命题逻辑公式
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