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StFBL25基因的克隆及转基因马铃薯获得
1
作者
特日格乐
白凯黎
+3 位作者
赵利强
郭江波
辛翠花
简磊
《中国马铃薯》
2024年第5期385-393,共9页
马铃薯(Solanum tuberosum L.)F-Box蛋白功能研究尚不完善,尤其是低温响应机制缺乏系统性分析。目前研究主要聚焦于F-Box蛋白的互作网络,其具体功能尚缺乏系统研究,尤其在马铃薯中研究较少。实验室前期通过甲基化扩增敏感多态性技术获...
马铃薯(Solanum tuberosum L.)F-Box蛋白功能研究尚不完善,尤其是低温响应机制缺乏系统性分析。目前研究主要聚焦于F-Box蛋白的互作网络,其具体功能尚缺乏系统研究,尤其在马铃薯中研究较少。实验室前期通过甲基化扩增敏感多态性技术获得了马铃薯低温响应基因StFBL25,鉴定为一类F-Box蛋白编码基因。通过生物信息学分析StFBL25蛋白结构与功能,构建StFBL25基因亚细胞定位载体,观察StFBL25蛋白的亚细胞定位情况。构建StFBL25基因的过表达和干扰表达载体,用于马铃薯的遗传转化。StFBL25基因全长1455 bp,编码484个氨基酸,预测含61个潜在磷酸化位点,蛋白结构预测显示,其主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成。亚细胞定位显示StFBL25定位于细胞核。成功获得StFBL25基因过表达与干扰表达的转基因马铃薯植株,qRT-PCR结果显示,过表达株系3-10中StFBL25表达量较野生型上调213倍,干扰表达株系5-6中StFBL25基因的表达量为野生型的0.097倍。研究结果可为马铃薯抗低温基因的筛选和功能研究提供理论基础。
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关键词
StFBL25蛋白
生物信息学预测
亚细胞定位
马铃薯
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职称材料
蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究
被引量：
40
2
作者
张松
黄波
+1 位作者
夏学峰
孙之荣
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期573-579,共7页
细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据...
细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据库的构建和亚细胞定位分析及预测加速了蛋白质结构和功能的研究.
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关键词
亚细胞定位
生物信息学
数据库
预测
蛋白质
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职称材料
葡萄基因组无内含子基因生物信息学及其表达分析
被引量：
3
3
作者
李傲
崔梦杰
+4 位作者
刘众杰
陈立德
贾海峰
上官凌飞
房经贵
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期655-661,共7页
[目的]本文旨在研究葡萄(Vitis vinifera)无内含子基因的结构特征、功能以及表达特点。[方法]对葡萄19条染色体上4 906个(占整个基因组的13.8%)无内含子基因情况进行分析,并研究了无内含子基因的亚细胞结构、GO功能类型以及基因在不同...
[目的]本文旨在研究葡萄(Vitis vinifera)无内含子基因的结构特征、功能以及表达特点。[方法]对葡萄19条染色体上4 906个(占整个基因组的13.8%)无内含子基因情况进行分析,并研究了无内含子基因的亚细胞结构、GO功能类型以及基因在不同组织的表达情况。[结果]葡萄无内含子基因数与每条染色体长度和染色体的基因总数存在正相关关系,每条染色体上无内含子基因占染色体上基因总数的1.2%~1.5%,同时无内含子基因在同一条染色体上的分布是不均匀的,更偏向富集于染色体的两端。葡萄无内含子基因的平均长度为997 bp,比总基因的平均长度短,是总基因长度的1/5。葡萄无内含子基因的亚细胞定位表明,基因产物分布在叶绿体上的数最多,线粒体上几乎没有。基因功能预测结果表明,葡萄无内含子基因主要为生长因子、转录调控、电压门控离子通道以及结构蛋白4种,其中更多参与生长调节。葡萄无内含子基因在不同组织中的表达水平低于有内含子的基因。[结论]葡萄无内含子基因与有内含子基因相比长度较短,表达水平较低。
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关键词
葡萄
无内含子基因
生物信息学
亚细胞定位预测
功能预测
基因表达
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职称材料
题名
StFBL25基因的克隆及转基因马铃薯获得
1
作者
特日格乐
白凯黎
赵利强
郭江波
辛翠花
简磊
机构
内蒙古科技大学生命科学与技术学院
出处
《中国马铃薯》
2024年第5期385-393,共9页
基金
国家自然科学基金项目(32060498)。
文摘
马铃薯(Solanum tuberosum L.)F-Box蛋白功能研究尚不完善,尤其是低温响应机制缺乏系统性分析。目前研究主要聚焦于F-Box蛋白的互作网络,其具体功能尚缺乏系统研究,尤其在马铃薯中研究较少。实验室前期通过甲基化扩增敏感多态性技术获得了马铃薯低温响应基因StFBL25,鉴定为一类F-Box蛋白编码基因。通过生物信息学分析StFBL25蛋白结构与功能,构建StFBL25基因亚细胞定位载体,观察StFBL25蛋白的亚细胞定位情况。构建StFBL25基因的过表达和干扰表达载体,用于马铃薯的遗传转化。StFBL25基因全长1455 bp,编码484个氨基酸,预测含61个潜在磷酸化位点,蛋白结构预测显示,其主要由α-螺旋、无规则卷曲和延伸链组成。亚细胞定位显示StFBL25定位于细胞核。成功获得StFBL25基因过表达与干扰表达的转基因马铃薯植株,qRT-PCR结果显示,过表达株系3-10中StFBL25表达量较野生型上调213倍,干扰表达株系5-6中StFBL25基因的表达量为野生型的0.097倍。研究结果可为马铃薯抗低温基因的筛选和功能研究提供理论基础。
关键词
StFBL25蛋白
生物信息学预测
亚细胞定位
马铃薯
Keywords
StFBL25 protein
bioinformatics
prediction
subcellular localization
potato
分类号
S532 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究
被引量：
40
2
作者
张松
黄波
夏学峰
孙之荣
机构
清华大学生物信息与系统生物学研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007年第6期573-579,共7页
基金
国家自然科学基金(90408019)
国家重点基础研究发展计划(973)(2003CB715900)资助项目.~~
文摘
细胞中蛋白质合成后被转运到特定的细胞器中,只有转运到正确的部位才能参与细胞的各种生命活动,如果定位发生偏差,将会对细胞功能甚至生命产生重大影响.蛋白质的亚细胞定位是蛋白质功能研究的重要方面,也是生物信息学中的热点问题,数据库的构建和亚细胞定位分析及预测加速了蛋白质结构和功能的研究.
关键词
亚细胞定位
生物信息学
数据库
预测
蛋白质
Keywords
subcellular localization
,
bioinformatics
,
database
,
prediction
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
葡萄基因组无内含子基因生物信息学及其表达分析
被引量：
3
3
作者
李傲
崔梦杰
刘众杰
陈立德
贾海峰
上官凌飞
房经贵
机构
南京农业大学园艺学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期655-661,共7页
基金
江苏省科技支撑计划项目(BE2013431)
南京农业大学青年基金项目(KJ2013013)
文摘
[目的]本文旨在研究葡萄(Vitis vinifera)无内含子基因的结构特征、功能以及表达特点。[方法]对葡萄19条染色体上4 906个(占整个基因组的13.8%)无内含子基因情况进行分析,并研究了无内含子基因的亚细胞结构、GO功能类型以及基因在不同组织的表达情况。[结果]葡萄无内含子基因数与每条染色体长度和染色体的基因总数存在正相关关系,每条染色体上无内含子基因占染色体上基因总数的1.2%~1.5%,同时无内含子基因在同一条染色体上的分布是不均匀的,更偏向富集于染色体的两端。葡萄无内含子基因的平均长度为997 bp,比总基因的平均长度短,是总基因长度的1/5。葡萄无内含子基因的亚细胞定位表明,基因产物分布在叶绿体上的数最多,线粒体上几乎没有。基因功能预测结果表明,葡萄无内含子基因主要为生长因子、转录调控、电压门控离子通道以及结构蛋白4种,其中更多参与生长调节。葡萄无内含子基因在不同组织中的表达水平低于有内含子的基因。[结论]葡萄无内含子基因与有内含子基因相比长度较短,表达水平较低。
关键词
葡萄
无内含子基因
生物信息学
亚细胞定位预测
功能预测
基因表达
Keywords
grape
intronless genes
bioinformatics
subcellular localization
prediction
functional
prediction
gene expression
分类号
S663.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
StFBL25基因的克隆及转基因马铃薯获得
特日格乐
白凯黎
赵利强
郭江波
辛翠花
简磊
《中国马铃薯》
2024
0
在线阅读
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职称材料
2
蛋白质亚细胞定位的生物信息学研究
张松
黄波
夏学峰
孙之荣
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2007
40
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
葡萄基因组无内含子基因生物信息学及其表达分析
李傲
崔梦杰
刘众杰
陈立德
贾海峰
上官凌飞
房经贵
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
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职称材料
已选择
0
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