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福建及贵州等地烟草青枯菌系统发育分析 被引量：21
1
作者 潘哲超 徐进 +4 位作者 顾钢 吴畏 许景升 陈顺辉 冯洁 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期18-23,43,共7页
[目的]探寻烟草上青枯菌的系统发育。[方法]采用演化型分类框架对福建及贵州等地的62个烟草青枯病菌株进行鉴定分析。[结果]基于内切葡聚糖酶基因系统发育学的分析结果表明:所有参试菌株均归属于青枯菌亚洲分支的4个序列变种,分别为序... [目的]探寻烟草上青枯菌的系统发育。[方法]采用演化型分类框架对福建及贵州等地的62个烟草青枯病菌株进行鉴定分析。[结果]基于内切葡聚糖酶基因系统发育学的分析结果表明:所有参试菌株均归属于青枯菌亚洲分支的4个序列变种,分别为序列变种15、17、34和44;尚未发现归属于美洲或非洲分支的烟草青枯病菌株。其中序列变种15和17为优势菌系,序列变种34的菌株都来自福建省,只发现3个菌株属于序列变种44。基于avrA基因的氨基酸序列比对结果表明4个序列变种的avrA基因都属于RS1000类型。[结论]本研究表明福建及贵州等地烟草上的青枯菌存在一定的遗传分化。 展开更多
关键词 烟草 青枯菌 演化型 序列变种 内切葡聚糖酶基因
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湖北地区烟草青枯菌系统发育分析 被引量：11
2
作者 刘海龙 黎妍妍 +2 位作者 郑露 李锡宏 黄俊斌 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2015年第2期81-86,共6页
本研究采用青枯菌演化型分类框架,对来源于湖北烟区的48个烟草青枯菌进行系统发育学分析并进行序列变种鉴定,以明确该地区烟草青枯菌的菌系分化。基于青枯菌内切葡聚糖酶基因(egl)和DNA蛋白修复基因(mut S)的系统发育学分析结果表明,48... 本研究采用青枯菌演化型分类框架,对来源于湖北烟区的48个烟草青枯菌进行系统发育学分析并进行序列变种鉴定,以明确该地区烟草青枯菌的菌系分化。基于青枯菌内切葡聚糖酶基因(egl)和DNA蛋白修复基因(mut S)的系统发育学分析结果表明,48个供试菌株属于青枯菌亚洲分支(演化型Ⅰ)的3个序列变种,分别为序列变种15、17和44,未发现我国已报道的烟草青枯菌序列变种34。其中序列变种17和44为优势菌系,且均来源于恩施地区;序列变种15只包含来源于十堰地区的3个菌株。本研究表明湖北地区烟草上的青枯菌存在一定程度的遗传分化。 展开更多
关键词 烟草 青枯菌 序列变种 内切葡聚糖酶基因 DNA修复蛋白基因
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番茄青枯病菌的分子鉴定及其生物学特性研究 被引量：5
3
作者 刘海龙 黎妍妍 +2 位作者 郑露 刘浩 黄俊斌 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期415-420,共6页
【目的】分离鉴定番茄青枯病的病原菌,并分析其生物学特性,以期为番茄青枯病防治和番茄抗青枯病育种提供理论基础。【方法】采用平板稀释法从番茄青枯病株中分离得到病原菌,并对分离菌株的16S r DNA序列、碳水化合物利用、致病性、演化... 【目的】分离鉴定番茄青枯病的病原菌,并分析其生物学特性,以期为番茄青枯病防治和番茄抗青枯病育种提供理论基础。【方法】采用平板稀释法从番茄青枯病株中分离得到病原菌,并对分离菌株的16S r DNA序列、碳水化合物利用、致病性、演化型及序列变种等进行分析。【结果】从感染了青枯病的番茄植株中分离到9个菌株Tom 1-Tom 9,根据分离菌株在TTC培养基上的菌落形态、致病性测定和分子鉴定,将9个菌株鉴定为茄科雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）;9个分离菌株可以利用3种双糖和3种己醇,并可侵染烟草、马铃薯、番茄、辣椒和茄子;9个分离菌株均可同时扩增得到144 bp的演化型Ⅰ的特异条带和280 bp的青枯菌特异条带。【结论】从感病番茄植株中分离得到的9个菌株为茄科雷尔氏菌（Ralstonia solanacearum）,属于生化型Ⅲ、生理小种1、演化型Ⅰ和序列变种17。 展开更多
关键词 番茄 青枯菌 生理小种 演化型 序列变种
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我国植物青枯菌遗传多样性研究进展 被引量：16
4
作者 黎妍妍 刘海龙 +2 位作者 郑露 黄俊斌 李锡宏 《安徽农业科学》 CAS 2015年第14期107-110,112,共5页
综述了我国植物青枯病的发生情况、新出现的青枯菌寄主、青枯菌的分类体系、植物青枯菌遗传多样性以及植物青枯病防治等方面的研究进展。
关键词 青枯菌 多样性 生化型 演化型 序列变种
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福建青枯雷尔氏菌的遗传多样性及其生防放线菌的筛选 被引量：3
5
作者 郑雪芳 陈燕萍 +5 位作者 肖荣凤 陈梅春 陈峥 刘欣 王阶平 刘波 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2022年第5期1269-1279,共11页
为了明确福建青枯雷尔氏菌(简称青枯菌)的遗传多样性,综合菌株的演化型、生化型及基于内源葡聚糖酶基因egl的序列变种鉴定,对福建省8个地区的番茄、辣椒和茄子寄主分离的56株青枯菌进行分析。结果表明:供试的56株青枯菌均属于演化型Ⅰ;5... 为了明确福建青枯雷尔氏菌(简称青枯菌)的遗传多样性,综合菌株的演化型、生化型及基于内源葡聚糖酶基因egl的序列变种鉴定,对福建省8个地区的番茄、辣椒和茄子寄主分离的56株青枯菌进行分析。结果表明:供试的56株青枯菌均属于演化型Ⅰ;53株为生化型Ⅲ(占94.64%),1株为生化型Ⅱ,2株为非标准生化型;从序列变种来看,4株来自茄子的青枯菌均属序列变种15,24株来自辣椒的青枯菌中,23株属于序列变种14,1株为序列变种16,28株番茄青枯菌鉴定出7个序列变种。进一步,选择上述鉴定的生化型Ⅲ和生化型Ⅱ的代表菌株为靶标菌进行生防菌筛选。结果表明,供试14株放线菌中,筛选到1株对生化Ⅲ青枯菌有拮抗作用的放线菌FJAT-31535。基于菌落形态特征和16S rRNA基因序列相似性分析,菌株FJAT-31535属于链霉菌属(Streptomyces sp.)。 展开更多
关键词 青枯雷尔氏菌 生化型 演化型 序列变种 链霉菌
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假茄科雷尔氏菌引起向日葵青枯病在中国的首次报道 被引量：2
6
作者 佘小漫 李萍 +4 位作者 蓝国兵 于琳 李正刚 汤亚飞 何自福 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期243-249,共7页
茄科雷尔氏菌复合种侵染引起的青枯病是众多作物上的毁灭性病害。2020年笔者首次在广东省东莞市发现向日葵青枯病,并对其病原菌进行了鉴定。室内人工接种试验、16S rDNA序列比对和演化型鉴定结果表明,引起向日葵青枯病的病原菌为假茄科... 茄科雷尔氏菌复合种侵染引起的青枯病是众多作物上的毁灭性病害。2020年笔者首次在广东省东莞市发现向日葵青枯病,并对其病原菌进行了鉴定。室内人工接种试验、16S rDNA序列比对和演化型鉴定结果表明,引起向日葵青枯病的病原菌为假茄科雷尔氏菌Ralstonia pseudosolanacearum。生理生化特性和致病性鉴定结果表明,分离自向日葵的15株假茄科雷尔氏菌为1号生理小种和生化变种3。egl基因部分序列系统进化分析表明,15株假茄科雷尔氏菌分属4个序列变种,其中8株菌株为序列变种17,5株菌株为序列变种13,其余2株菌株分别为序列变种14和序列变种54。本文是我国首次报道假茄科雷尔氏菌侵染引起向日葵青枯病。 展开更多
关键词 向日葵 假茄科雷尔氏菌 致病性 分子鉴定 序列变种
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我国烟草青枯菌的种下多样性及统一用名问题商榷 被引量：4
7
作者 刘颖 谭万忠 丁伟 《植物医生》 2019年第6期12-17,共6页
烟草青枯病在我国许多烟区普遍发生,17个主要烟草种植区中有14个发生了青枯病,近年来,该病的危害范围有逐渐向北和冷凉地区扩展蔓延之势,造成了严重的经济损失.在传统分类中烟草青枯菌属于生理小种1号;在生化变种及演化型分类中,我国大... 烟草青枯病在我国许多烟区普遍发生,17个主要烟草种植区中有14个发生了青枯病,近年来,该病的危害范围有逐渐向北和冷凉地区扩展蔓延之势,造成了严重的经济损失.在传统分类中烟草青枯菌属于生理小种1号;在生化变种及演化型分类中,我国大多数烟草菌株为生化变种3(但也有部分为生化变种4),演化型Ⅰ,而美洲的烟草青枯菌则属于生化变种1,演化型Ⅱ;烟草青枯菌具有序列变种多样性,美洲菌株可聚类为序列变种7和25等,中国烟草青枯菌则属于序列变种13,14,15,17,34,44,54和55.学者们基于DNA-DNA杂交、基因组、蛋白质组及代谢组等证据提议将青枯菌这一复合种重新划分为3个新的种,即Ralstonia solanacearumsp.nov.(原本的演化型Ⅱ菌株),R.syzygii sp.nov.(原本的演化型IV菌株,包括苏门答腊病的病原及香蕉血液病细菌),R.pseudosolanacearumsp.nov.(原本的演化型Ⅰ和演化型Ⅲ菌株).基于此,美洲烟草青枯菌菌株为R.solanacearum,而我国的烟草青枯菌菌株为R.pseudosolanacearum,建议将我国烟草青枯病菌的中文名称为:假茄科雷尔氏菌. 展开更多
关键词 烟草青枯菌 分类地位 种下多样性 新分类及命名
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我国主要烟草青枯病病圃青枯菌系统发育分析 被引量：13
8
作者 谭茜 李杰 +3 位作者 汪代斌 徐小洪 刘颖 丁伟 《中国烟草科学》 CSCD 北大核心 2022年第2期52-57,共6页
为探究我国主要植烟区烟草青枯病鉴定病圃中青枯菌的系统发育,采用演化型分类框架下的序列变种分类方法,对从各烟株和土壤样品中分离得到的100株青枯菌进行系统发育分析。结果表明,所有菌株可归为4个分支,分别为序列变种15、17、34、54... 为探究我国主要植烟区烟草青枯病鉴定病圃中青枯菌的系统发育,采用演化型分类框架下的序列变种分类方法,对从各烟株和土壤样品中分离得到的100株青枯菌进行系统发育分析。结果表明,所有菌株可归为4个分支,分别为序列变种15、17、34、54。其中,云南文山州广南县病圃中的菌株为序列变种17和54,福建泰宁县的菌株为序列变种34,福建三明市三元区的菌株为序列变种15和34,广东白云区的菌株为序列变种15和17,广东南雄市的菌株为序列变种15、17和34,安徽宣城市宣州区的菌株为序列变种34和54,贵州福泉的菌株为序列变种17,重庆彭水的菌株为序列变种17。本研究发现同一病圃中存在多个序列变种,某些病圃同一地块中烟株与土壤分离所得菌株序列变种不一致。 展开更多
关键词 烟草青枯菌 田间抗性鉴定病圃 菌株分离 序列变种 内切葡聚糖酶基因
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赣南地区番茄青枯菌菌系多样性分析 被引量：11
9
作者 任敏华 张静燕 +2 位作者 崔晓东 陈荣华 刘琼光 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期67-76,共10页
【目的】分离鉴定赣南地区番茄青枯病菌,明确菌系分化,为当地番茄抗青枯病育种和病害防治奠定基础。【方法】从江西省赣南地区采集番茄青枯病病株,经选择性平板分离、纯化和分子鉴定,获得不同地理来源的青枯菌Ralstonia solanacearum菌... 【目的】分离鉴定赣南地区番茄青枯病菌,明确菌系分化,为当地番茄抗青枯病育种和病害防治奠定基础。【方法】从江西省赣南地区采集番茄青枯病病株,经选择性平板分离、纯化和分子鉴定,获得不同地理来源的青枯菌Ralstonia solanacearum菌株。通过生理生化测定和接种番茄试验,鉴定青枯菌的生化变种和致病类型。PCR扩增内切葡聚糖酶基因egl序列,明确青枯菌的演化型和序列变种。双层平板培养法测定其对8个不同噬菌体的敏感性。【结果】获得了来自赣南地区9个市(县)的番茄青枯菌菌株44个,其中,41个菌株为生化变种Ⅲ,3个菌株为生化变种Ⅳ;致病力测定结果聚为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ类,其致病力分别为强、中和弱,其中,强致病力菌株占65.9%。所有菌株属于亚洲分支演化型(Ⅰ),并进一步划分为Sequevar13、14、15、17、18、34、44和48等8个序列变种。大部分菌株对供试的8个噬菌体敏感。【结论】赣南地区番茄青枯菌以生化变种Ⅲ和强致病力菌株为主,对噬菌体较敏感,存在8个序列变种,具有明显的菌系分化现象和遗传多样性。 展开更多
关键词 茄科雷尔氏菌 番茄青枯病 生化变种 致病力 演化型 序列变种 噬菌体
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2个烟草青枯病菌菌株的致病力差异与基因组比较分析
10
作者 管成伟 胡利伟 +4 位作者 冯小虎 张超群 秦言敏 张志高 王利兵 《广东农业科学》 CAS 2023年第8期85-93,共9页
【目的】探索比较2个不同青枯病菌菌株之间致病力差异和基因组差异,分析影响菌株致病力差异的关键基因,为烟草青枯病的防治提供理论参考。【方法】从烟草青枯病发病烟株上分离获得不同的青枯病菌菌株并进行鉴定,通过侵染试验比较2个菌... 【目的】探索比较2个不同青枯病菌菌株之间致病力差异和基因组差异,分析影响菌株致病力差异的关键基因,为烟草青枯病的防治提供理论参考。【方法】从烟草青枯病发病烟株上分离获得不同的青枯病菌菌株并进行鉴定,通过侵染试验比较2个菌株之间的致病力差异,并对2个菌株的基因组进行测序,比较二者之间基因组序列差异,分析影响菌株致病力差异的基因。【结果】从江西省抚州市广昌县和南丰县分离到2株青枯病菌菌株RsTP2和RsTY2,egl测序表明菌株RsTP2和RsTY2均属于亚洲分支演化型Ⅰ中的序列变种13,其中菌株RsTP2对云烟87致病力较强,而菌株RsTY2致病力较弱。通过对2个菌株进行基因组测序,获得二者的基因组框架图,其基因组大小分别为5.43MB和5.23MB。将获得的基因和蛋白序列与相关数据库进行比对,获得基因的功能及物种注释信息。通过分析发现,菌株RsTY2有52个蛋白和菌株RsTP2的44个蛋白比对后序列存在差异,其相似度在50.00%~99.88%,其中存在较大差异的编码蛋白主要是凝集素类蛋白,其次是细胞溶素分泌激活蛋白和穿孔素家族蛋白。【结论】通过比较不同致病力青枯病菌株RsTP2和RsTY2的基因组序列差异,发现二者基因组中编码凝集素类蛋白、细胞溶素分泌激活蛋白和穿孔素家族蛋白等蛋白序列差异较大,这类编码蛋白主要参与细菌的黏附、膜溶解、穿透等功能,与细菌侵入宿主细胞的能力关系密切。这几类编码蛋白的差异推测是导致菌株RsTP2和RsTY2致病力差异的重要因素之一。 展开更多
关键词 烟草青枯病菌 序列变种 致病力 基因组测序 凝集素蛋白
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