随着人工智能大模型训练与推理业务的快速发展,智算中心面临算网协同调度的新挑战。为优化分布式智算Ring Allreduce业务的部署问题,首先,通过扩展传统波平面,开发了算力波平面技术,实现了算力与网络资源的一体化虚拟管理。然后,基于算...随着人工智能大模型训练与推理业务的快速发展,智算中心面临算网协同调度的新挑战。为优化分布式智算Ring Allreduce业务的部署问题,首先,通过扩展传统波平面,开发了算力波平面技术,实现了算力与网络资源的一体化虚拟管理。然后,基于算力波平面,提出了一种高效路由、波长、算力和时隙分配(routing,wavelength,computing power and time slot assignment,RWCTA)算法用于环规约(Ring Allreduce)业务部署。仿真结果表明,与传统基于波平面的部署算法相比,基于算力波平面的RWCTA算法能有效降低62.4%的总业务完成时间和54.5%的平均业务计算时间。展开更多
RING(Really Interesting New Gene)型泛素连接酶在水稻生长、发育、生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。根据水稻基因组信息,利用RT-PCR技术从粳稻日本晴中克隆了OsRING6基因的CDS序列。该基因的全长c DNA为1355 bp,包括长度为918 bp的...RING(Really Interesting New Gene)型泛素连接酶在水稻生长、发育、生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。根据水稻基因组信息,利用RT-PCR技术从粳稻日本晴中克隆了OsRING6基因的CDS序列。该基因的全长c DNA为1355 bp,包括长度为918 bp的CDS,编码一个含305个氨基酸的蛋白,预测该蛋白的分子量和等电点分别为32.96 k D和3.49,与籼稻(CT832014)和短花药野生稻(XM_006659599)中同源蛋白的序列相似性最高,分别为97%和83%。IPTG诱导表达的MBPOsRING6重组蛋白的表观分子量约为100 k D,比理论值76 k D大。启动子元件分析表明,其含有与干旱胁迫、光反应、ABA和GA信号传导相关的调控元件。Real-time PCR结果表明,该基因在水稻根、茎、叶、叶鞘、花和种子中都有表达,在萌发后4 d的种子中表达量最高,花中的表达量最低,且该基因的表达受到盐和ABA的诱导及PEG的抑制。OsRING6基因的克隆为水稻抗逆分子育种和功能分析提供了优质基因资源。展开更多
目的:观察RYBP(Ring1 and YY1-binding protein)在急性白血病中的表达情况,初步探索其在急性白血病中的临床意义。方法:应用蛋白质免疫印迹(western blot)技术分别检测急性单核细胞白血病细胞株SHI-1、急性早幼粒白血病细胞株HL-60、慢...目的:观察RYBP(Ring1 and YY1-binding protein)在急性白血病中的表达情况,初步探索其在急性白血病中的临床意义。方法:应用蛋白质免疫印迹(western blot)技术分别检测急性单核细胞白血病细胞株SHI-1、急性早幼粒白血病细胞株HL-60、慢性粒细胞白血病细胞株K562、51例初治急性白血病(AL)患者、23例急性白血病完全缓解(ALCR)患者和21例对照(非恶性血液病)患者骨髓单个核细胞中RYBP的表达情况。结果:SHI-1、HL-60及K562细胞株RYBP表达均为强阳性;21例阴性对照中RYBP表达均为阴性。AL组RYBP表达阳性率为73%,ALCR组阳性率为13%,AL组RYBP表达阳性率及表达量比ALCR组及对照组明显增高(P<0.05)。结论:RYBP在急性白血病细胞中表达水平异常增高,提示RYBP可能与急性白血病密切相关。展开更多
针对深度学习图像分类场景中多GPU并行后传输效率低的问题,提出一种低时间复杂度的Ring All Reduce改进算法。通过分节点间隔配对原则优化数据传输流程,缓解传统参数服务器并行结构的带宽损耗。基于数据并行难以支撑大规模网络参数及加...针对深度学习图像分类场景中多GPU并行后传输效率低的问题,提出一种低时间复杂度的Ring All Reduce改进算法。通过分节点间隔配对原则优化数据传输流程,缓解传统参数服务器并行结构的带宽损耗。基于数据并行难以支撑大规模网络参数及加速延缓的问题,根据深度学习主干网络所包含的权重参数低于全连接层权重参数、同步开销小、全连接层权重大与梯度传输开销过高等特点,提出GPU混合并行优化算法,将主干网络进行数据并行,全连接层进行模型并行,并通过改进的Ring All Reduce算法实现各节点之间的并行后数据通信,用于基于深度学习模型的图像分类。在Cifar10和mini ImageNet两个公共数据集上的实验结果表明,该算法在保持分类精度不变的情况下可以获得更好的加速效果,相比数据并行方法,可达到近45%的提升效果。展开更多
文摘随着人工智能大模型训练与推理业务的快速发展,智算中心面临算网协同调度的新挑战。为优化分布式智算Ring Allreduce业务的部署问题,首先,通过扩展传统波平面,开发了算力波平面技术,实现了算力与网络资源的一体化虚拟管理。然后,基于算力波平面,提出了一种高效路由、波长、算力和时隙分配(routing,wavelength,computing power and time slot assignment,RWCTA)算法用于环规约(Ring Allreduce)业务部署。仿真结果表明,与传统基于波平面的部署算法相比,基于算力波平面的RWCTA算法能有效降低62.4%的总业务完成时间和54.5%的平均业务计算时间。
文摘RING(Really Interesting New Gene)型泛素连接酶在水稻生长、发育、生物和非生物胁迫中发挥着重要作用。根据水稻基因组信息,利用RT-PCR技术从粳稻日本晴中克隆了OsRING6基因的CDS序列。该基因的全长c DNA为1355 bp,包括长度为918 bp的CDS,编码一个含305个氨基酸的蛋白,预测该蛋白的分子量和等电点分别为32.96 k D和3.49,与籼稻(CT832014)和短花药野生稻(XM_006659599)中同源蛋白的序列相似性最高,分别为97%和83%。IPTG诱导表达的MBPOsRING6重组蛋白的表观分子量约为100 k D,比理论值76 k D大。启动子元件分析表明,其含有与干旱胁迫、光反应、ABA和GA信号传导相关的调控元件。Real-time PCR结果表明,该基因在水稻根、茎、叶、叶鞘、花和种子中都有表达,在萌发后4 d的种子中表达量最高,花中的表达量最低,且该基因的表达受到盐和ABA的诱导及PEG的抑制。OsRING6基因的克隆为水稻抗逆分子育种和功能分析提供了优质基因资源。
文摘目的:观察RYBP(Ring1 and YY1-binding protein)在急性白血病中的表达情况,初步探索其在急性白血病中的临床意义。方法:应用蛋白质免疫印迹(western blot)技术分别检测急性单核细胞白血病细胞株SHI-1、急性早幼粒白血病细胞株HL-60、慢性粒细胞白血病细胞株K562、51例初治急性白血病(AL)患者、23例急性白血病完全缓解(ALCR)患者和21例对照(非恶性血液病)患者骨髓单个核细胞中RYBP的表达情况。结果:SHI-1、HL-60及K562细胞株RYBP表达均为强阳性;21例阴性对照中RYBP表达均为阴性。AL组RYBP表达阳性率为73%,ALCR组阳性率为13%,AL组RYBP表达阳性率及表达量比ALCR组及对照组明显增高(P<0.05)。结论:RYBP在急性白血病细胞中表达水平异常增高,提示RYBP可能与急性白血病密切相关。
文摘针对深度学习图像分类场景中多GPU并行后传输效率低的问题,提出一种低时间复杂度的Ring All Reduce改进算法。通过分节点间隔配对原则优化数据传输流程,缓解传统参数服务器并行结构的带宽损耗。基于数据并行难以支撑大规模网络参数及加速延缓的问题,根据深度学习主干网络所包含的权重参数低于全连接层权重参数、同步开销小、全连接层权重大与梯度传输开销过高等特点,提出GPU混合并行优化算法,将主干网络进行数据并行,全连接层进行模型并行,并通过改进的Ring All Reduce算法实现各节点之间的并行后数据通信,用于基于深度学习模型的图像分类。在Cifar10和mini ImageNet两个公共数据集上的实验结果表明,该算法在保持分类精度不变的情况下可以获得更好的加速效果,相比数据并行方法,可达到近45%的提升效果。