实时荧光定量PCR筛选稻曲病菌内参基因 被引量：17

1

作者 顾志敏 丁正中 +4 位作者 陈析丰 郭龙彪 曾大力 钱前 马伯军 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期615-618,共4页

通过实时定量PCR分析了稻曲病菌中5个传统内参基因18SrRNA、GAPDH、ubiquitin、β-actin、α-tubulin的mRNA差异表达情况,并利用geNorm软件分析了它们在4个发育时期和NaCl胁迫处理中的表达稳定性。结果表明,在菌龄为7d、8d、9d、10d的... 通过实时定量PCR分析了稻曲病菌中5个传统内参基因18SrRNA、GAPDH、ubiquitin、β-actin、α-tubulin的mRNA差异表达情况,并利用geNorm软件分析了它们在4个发育时期和NaCl胁迫处理中的表达稳定性。结果表明,在菌龄为7d、8d、9d、10d的稻曲病菌中,α-tubulin-2和β-actin表达稳定;在0.4mol/L NaCl溶液处理0h、4h、8h、12h、16h后,β-actin和α-tubulin-2表达稳定。因此,当利用荧光定量PCR分析比较稻曲病菌基因表达差异时,可选择α-tubulin和β-actin作为内参基因。 展开更多

关键词 稻曲病菌 实时定量pcr 内参基因 geNorm软件

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测定猪不同组织基因表达时RT-PCR内参基因的选择 被引量：8

2

作者 齐波 朱荣生 +5 位作者 王怀中 孙守礼 王建才 刘俊珍 黄保华 呼红梅 《家畜生态学报》 北大核心 2017年第6期8-12,共5页

以95kg体重育肥猪的不同组织为研究对象,应用实时荧光定量PCR技术,对SDHA、HMBS、TOP2B、ACTB、B2M、PPIA、GAPDH、HPRT1、RPL4、TBP和YWHAZ共11个候选内参基因表达量进行检测,应用geNorm程序对内参基因的稳定性进行分析。结果表明,肌... 以95kg体重育肥猪的不同组织为研究对象,应用实时荧光定量PCR技术,对SDHA、HMBS、TOP2B、ACTB、B2M、PPIA、GAPDH、HPRT1、RPL4、TBP和YWHAZ共11个候选内参基因表达量进行检测,应用geNorm程序对内参基因的稳定性进行分析。结果表明,肌肉组织中稳定表达的内参基因是TBP、RPL4,心脏组织中稳定表达的内参基因是GAPDH、RPL4,肝脏组织中稳定表达的内参基因是TBP、HPRT1,脾脏组织中稳定表达的内参基因是SDHA、ACTB,肺脏组织中稳定表达的内参基因是B2M、HPRT1,肾脏组织中稳定表达的内参基因是B2M、TBP。由此可见,不同组织中最稳定表达的内参基因不同,不同组织中标准化目的基因的内参基因也不一样。 展开更多

关键词 猪 实时荧光定量pcr 内参基因选择 geNorm程序 基因表达

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人不同孕期胎盘组织中实时荧光定量PCR内参基因的选择 被引量：3

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作者 赵晶 赵俊杰 +3 位作者 康丽丽 李亚清 王斌 雷艳霞 《西安交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期218-221,共4页

目的比较人不同孕期胎盘组织中最常用的内参基因及其他几种管家基因mRNA表达水平的差异及稳定性,选出用于该研究的最佳内参基因。方法应用荧光实时定量RT-PCR技术检测6种管家基因[3磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、β肌动蛋白(β-actin)、β2... 目的比较人不同孕期胎盘组织中最常用的内参基因及其他几种管家基因mRNA表达水平的差异及稳定性,选出用于该研究的最佳内参基因。方法应用荧光实时定量RT-PCR技术检测6种管家基因[3磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、β肌动蛋白(β-actin)、β2微球蛋白(β2-M)、18S核糖体RNA(18srRNA)、RNA聚合酶Ⅱ(RPⅡ)、泛素(UBC)]在早、中、晚不同孕期孕妇绒毛和胎盘组织中mRNA的表达情况,并应用geNorm程序对内参基因表达稳定性进行分析。结果在早、中、晚不同孕期的孕妇早孕绒毛或胎盘组织中内参基因GAPDH mRNA的表达水平变化最大,其中在早孕绒毛组织中表达水平最高,随着孕期的延长其表达水平逐渐降低;内参基因β-actin mRNA转录水平则呈相反的趋势变化,标本间mRNA表达水平变化亦较大;内参基因β2-M、18S和UBC mRNA表达水平在不同孕期标本间变化相对较小,其中内参基因RPⅡmRNA表达水平在不同孕期标本间变化最小。所选内参基因的表达稳定度由高到低依次为RPⅡ>UBC>18srRNA>β2-M>β-actin>GAPDH。结论在应用荧光实时定量RT-PCR技术研究基因转录表达时,应根据研究所用的材料选择合适的内参基因;本研究中RPⅡ是可用的稳定内参基因。 展开更多

关键词 实时定量pcr 内参基因 GeNorm程序分析 不同孕期 胎盘组织

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免疫刺激后小鼠肝脏内参基因稳定性研究 被引量：7

4

作者 董晓丽 王加启 +7 位作者 卜登攀 刘光磊 李旦 张春刚 程金波 魏宏阳 周凌云 赵国琦 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期80-85,共6页

实时定量PCR技术现已广泛应用于细胞或组织mRNA转录水平的检测和半定量。选择合适的内参基因可以消除不同标本在RNA的产量、质量以及逆转录效率上可能存在的差别,从而获得目标基因特异性表达的真正差异。本试验应用实时定量PCR技术,研... 实时定量PCR技术现已广泛应用于细胞或组织mRNA转录水平的检测和半定量。选择合适的内参基因可以消除不同标本在RNA的产量、质量以及逆转录效率上可能存在的差别,从而获得目标基因特异性表达的真正差异。本试验应用实时定量PCR技术,研究小鼠在经过免疫刺激后,B2M、ACTB、GAPDH、SDHA、HPRT1和ARBP共6个内参基因在肝脏中的表达情况。结果表明,这6个内参基因表达存在差异。经过geNorm程序统计学分析,确定了ACTB、GAPDH两个看家基因适用于校正目标基因的表达量,为研究小鼠免疫刺激后肝脏目标基因的表达奠定基础。 展开更多

关键词 内参基因 geNorm程序 基因表达 实时定量pcr 免疫刺激

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MPEG-2传输流中的时间信息与音视频同步 被引量：5

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作者 王保雄 余松煜 庄建敏 《红外与激光工程》 EI CSCD 2000年第5期76-79,共4页

文中讨论了MPEG 2传输码流中的时间信息 (传输层中的节目参考时钟 ,PES层中的显示时间标签和节码时间标签 )在音视频同步中的作用。对理想解码器中的音频、视频同步原理作出了分析。指出了实际解码器实现视音频同步的困难之处并提出了... 文中讨论了MPEG 2传输码流中的时间信息 (传输层中的节目参考时钟 ,PES层中的显示时间标签和节码时间标签 )在音视频同步中的作用。对理想解码器中的音频、视频同步原理作出了分析。指出了实际解码器实现视音频同步的困难之处并提出了解决办法。对实际解码中出现的视音频失同步的情况 ,通过对解码器的控制达到重复帧和丢帧的效果 ,从而重新实现了音、视频的同步。 展开更多

关键词 时间信息 音视频同步 MPEG-2 传输流

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数字电视传输流循环播放码流预处理的研究与实现 被引量：1

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作者 张宝菊 贾萍 +1 位作者 吕达夫 李桂苓 《天津大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第1期124-128,共5页

数字电视传输流在循环播放时需要实时更新节目时钟基准、音视频解码时间标签和显示时间标签,接收机(机顶盒)才能正确解码．为此,提出并实现了通过对数据流进行预处理生成报告文件,循环播放时再按报告文件实时更新定时参数的算法．解决... 数字电视传输流在循环播放时需要实时更新节目时钟基准、音视频解码时间标签和显示时间标签,接收机(机顶盒)才能正确解码．为此,提出并实现了通过对数据流进行预处理生成报告文件,循环播放时再按报告文件实时更新定时参数的算法．解决了多个传输流文件之间以及单个传输流文件循环播放时头尾的无缝粘接．使机顶盒接收、解码、系统时基、声音、图像以及声音与图像之间均能良好同步． 展开更多

关键词 数字电视传输流 预处理 节目时钟基准 循环播放

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一种新型的VBR视频传输方法 被引量：1

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作者 张源海 钟琳华 +2 位作者 皇甫伟 许长桥 李凯慧 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第5期895-899,共5页

保证变比特率(VBR)视频流在IP网络上的平滑传输一直是多媒体通信领域研究的热点.传统的PCR协助的恒定速率传输方法利用了嵌入到视频码流中的程序参考时钟(PCR)来定期校正发送速率,是以较高的传输速率为代价减少了播放低码率视频流时的... 保证变比特率(VBR)视频流在IP网络上的平滑传输一直是多媒体通信领域研究的热点.传统的PCR协助的恒定速率传输方法利用了嵌入到视频码流中的程序参考时钟(PCR)来定期校正发送速率,是以较高的传输速率为代价减少了播放低码率视频流时的缓存需求.为了同时适应高码率视频流的鲁棒传输,本文提出了一种改进的方法,通过对发送速率进行更细粒度的调整和服务器端的自适应缓冲机制,进一步平滑了传输速率,而且没有增加终端缓存的需求.仿真实验的测试结果表明,改进的方法能更好地服务于各种码率的流媒体传输与回放,适用范围更加广泛. 展开更多

关键词 MPEG-2 传输流 变比特率 程序参考时钟

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数字电视传输流的实时码率变换系统 被引量：1

8

作者 梁龙飞 余松煜 叶玮 《红外与激光工程》 EI CSCD 北大核心 2002年第1期68-71,共4页

数字视频压缩后通常是打包成传输流的形式进行传送 ,每个传输流都有其固定的发送码率。在某些应用场合 ,比如信道调制前端 ,需要对输入传输流码率进行改变以适应该信道要求。描述了一种全硬件实现、双路输出、实时。

关键词 数字电视 实时码率变换系统 传输流

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MPEG-2数字视频广播传输流中节目参考时钟的处理 被引量：2

9

作者 金盛 张文军 余松煜 《红外与激光工程》 EI CSCD 2000年第5期73-75,共3页

MPEG 2标准系统层中定义的传输流已经在事实上成为数字电视领域中系统层传输的普遍标准。数字视频广播系统中传输流的处理由复用器完成。由于节目参考时钟是编解码器中共同系统时钟的标签 ,精确度要求非常严格 ,因此复用器研制的一个难... MPEG 2标准系统层中定义的传输流已经在事实上成为数字电视领域中系统层传输的普遍标准。数字视频广播系统中传输流的处理由复用器完成。由于节目参考时钟是编解码器中共同系统时钟的标签 ,精确度要求非常严格 ,因此复用器研制的一个难点就是节目参考时钟的处理。文中利用复用器的传输流输出端对节目参考时钟进行精确插入 ,充分利用了数字信号处理器和 9位先入先出缓存的特性 ,精确而简易地满足了数字视频广播系统的时序要求。 展开更多

关键词 MPEG-2 节目参考时钟 数字电视 数字视频广播

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小鼠基因转录表达分析中内参基因的优选 被引量：6

10

作者 陈烨 李凯 +1 位作者 周宇荀 肖君华 《中国实验动物学报》 CAS CSCD 2011年第3期197-202,共6页

目的建立小鼠基因转录表达分析中内参基因的选择方法。方法以C57BL/6J和C3H/HeJ两个品系3个不同组织及2个不同发育阶段为研究对象,应用反转录实时定量PCR技术,评价GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)、HPRT1(hypoxanthine... 目的建立小鼠基因转录表达分析中内参基因的选择方法。方法以C57BL/6J和C3H/HeJ两个品系3个不同组织及2个不同发育阶段为研究对象,应用反转录实时定量PCR技术,评价GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)、HPRT1(hypoxanthine phosphoribosyl transferase)、B2M(β2-microglobulin)、PPIA(peptidylprolyl isomerase A)、ACTB(Actin-beta)和18S rRNA(18S ribosomal RNA)等6个看家基因在下丘脑、垂体与卵巢中mRNA水平的表达稳定性。结果 GeNorm统计分析表明,GAPDH和HPRT1表达最为稳定,PPIA等次之,B2M在不同组织和发育阶段中都几乎无表达。结论成功筛选到GAPDH和HPRT1两个稳定表达的看家基因,证实了小鼠基因表达转录分析中内参基因选择的必要性和可行性。 展开更多

关键词 内参基因 基因表达 反转录实时定量pcr geNorm程序

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基于FPGA的虚拟FIFO改进设计 被引量：5

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作者 张玉平 叶圣江 《沈阳工业大学学报》 EI CAS 北大核心 2016年第3期298-303,共6页

为了降低网络接口缓存设计的开发难度和复杂度,对现有基于FPGA的DDR2虚拟FIFO设计进行了改进.提出了以FPGA(EP4CGX150F672)为核心、DDR2(MT47H128M16RT-25E)为数据缓存、采用Qsys系统互联及IPCORE辅助搭建设计的改进方案,实现了DVB-IP分... 为了降低网络接口缓存设计的开发难度和复杂度,对现有基于FPGA的DDR2虚拟FIFO设计进行了改进.提出了以FPGA(EP4CGX150F672)为核心、DDR2(MT47H128M16RT-25E)为数据缓存、采用Qsys系统互联及IPCORE辅助搭建设计的改进方案,实现了DVB-IP分组TS流的快速缓存,平滑IP网络抖动,避免了数据码流丢失和延迟过大的问题.该设计方案在降低传统设计难度和复杂度的背景下,具有良好的存储器兼容性,同时具有系统资源丰富、容量大、成本低和开发周期短等优点,在众多DVB行业的设备中使用后效果良好. 展开更多

关键词 现场可编程门阵列 双倍速率 先入先出队列 系统互联 知识产权核 网络抖动 码流 节目参考时钟

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一种基于非实时操作系统的数字视频传输方法

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作者 杨晓君 苗彦超 +1 位作者 郭黎利 孙凝晖 《哈尔滨工程大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第6期777-780,共4页

视频服务器是非实时音视频节目的存储和播控设备,在非实时操作系统中,视频服务器改变了PCR在原始传送流中的时域位置,造成PCR抖动.对视频服务器来说,输出传送流的PCR校正是必须的.文章在分析影响MPEG-2系统同步因素的基础上,提出了解决... 视频服务器是非实时音视频节目的存储和播控设备,在非实时操作系统中,视频服务器改变了PCR在原始传送流中的时域位置,造成PCR抖动.对视频服务器来说,输出传送流的PCR校正是必须的.文章在分析影响MPEG-2系统同步因素的基础上,提出了解决非实时操作系统处理实时传输应用的积分流控模型和包近似等间距传输算法,并进行了视频服务器实时传输性能分析,实验结果证明该模型与算法是实用有效的,是高性能计算机处理实时音视频传输的理想解决方案. 展开更多

关键词 视频服务器 传送流 节目时钟基准

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Joint Rate Allocation and Buffer Management for Robust Transmission of VBR Video

13

作者 ZHANG Yuan-Hai LI Kai-Hui +1 位作者 XU Chang-Qiao SUN Li-Min 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第3期337-343,共7页

在这份报纸我们在场在接收装置与播放调整机制在来源集成率分配和缓冲区控制的一个适应录像传播框架。传播率被使用在录像流嵌入以一个精制方法调整传播率的程序钟引用(PCR ) 的一个率分配算法决定。服务者方面也维持多重缓冲区让一些... 在这份报纸我们在场在接收装置与播放调整机制在来源集成率分配和缓冲区控制的一个适应录像传播框架。传播率被使用在录像流嵌入以一个精制方法调整传播率的程序钟引用(PCR ) 的一个率分配算法决定。服务者方面也维持多重缓冲区让一些不同重要性层次根据来源缓冲区尺寸，视觉影响，和播放截止时间为控制损失做贸易离开随机的损失。在边界上播放调整机制基于 proportional-integra (PI ) ，控制器在接收装置被采用根据全面损失和接收装置缓冲区占有最大化显示的录像的视觉质量。我们的建议框架的表演在模拟以山峰 signal-to-noise 比率(PSNR ) 被评估，并且模拟结果象译码的框架的更好的质量一样表明平均 PSNR 价值的改进。 展开更多

关键词 可变比特率 视频传输 节目时间参考 缓冲管理 比例完整控制器 比率分配

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