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虾肝肠胞虫Septin的生物信息学分析及其在增殖中的潜在作用
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作者 张晟 乔毅 +4 位作者 曹晓慧 张雷霆 成婕 吴海龙 沈辉 《南京师大学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期66-74,共9页
虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)是对虾养殖业的重要病原体之一,其裂殖增殖的分子机制尚不明确.本研究通过克隆和分析EHP裂殖期Septin蛋白EhpSeptin的基因序列、表达及定位,初步阐释了该基因在EHP裂殖中的潜在作用.结果表... 虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)是对虾养殖业的重要病原体之一,其裂殖增殖的分子机制尚不明确.本研究通过克隆和分析EHP裂殖期Septin蛋白EhpSeptin的基因序列、表达及定位,初步阐释了该基因在EHP裂殖中的潜在作用.结果表明,EhpSeptin基因序列编码265个氨基酸的蛋白质,分子量约30.4 kDa,等电点4.75.构建EhpSeptin原核表达载体,获得高纯度表达蛋白.Western blotting验证了表达蛋白与天然蛋白一致.此外,本研究建立了EhpSeptin基因显色原位杂交技术(chromogenic in situ hybridization,CISH),分析感染对虾样本中EhpSeptin的表达模式.结果显示,EhpSeptin的表达水平随EHP感染强度增加而升高,表明其参与了EHP的裂殖过程.本研究首次报道了EHP裂殖相关蛋白EhpSeptin的克隆、表达、定位及其在EHP感染过程中的变化规律,为探究EHP裂殖分子机制和防治该病原体的感染提供了理论基础和技术手段. 展开更多
关键词 虾肝肠胞虫 SEPTin 原核表达 显色原位杂交
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六氰合铁酸铜钴薄膜修饰电极的in-situ FTIR研究 被引量:1
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作者 崔兴品 汪夏燕 林祥钦 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第3期603-604,共2页
本文用循环伏安法在铂电极的表面电沉积了六氰合铁酸铜钴薄膜 ,结合电化学方法 ,研究了修饰膜氧化过程中的现场红外光谱。
关键词 六氰合铁酸铜钴薄膜 修饰电极 in-situFTIR 电化学 红外光谱 铂电极 导电聚合物
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线纹尖塘鳢性别相关的2个dmrt基因结构特征及表达规律 被引量:1
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作者 樊佳佳 马冬梅 +3 位作者 朱华平 林明辉 钟再选 田园园 《渔业科学进展》 北大核心 2025年第1期93-104,共12页
线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolata)具有典型性别生长二态性,雄鱼生长优势显著,doublesex and mab-3 related transcription factor(DMRT)家族是一个与性别决定相关的转录因子家族。基于线纹尖塘鳢性腺转录组数据,共获得2个dmrt基因的c... 线纹尖塘鳢(Oxyeleotris lineolata)具有典型性别生长二态性,雄鱼生长优势显著,doublesex and mab-3 related transcription factor(DMRT)家族是一个与性别决定相关的转录因子家族。基于线纹尖塘鳢性腺转录组数据,共获得2个dmrt基因的cDNA序列,分别命名为Oxldmrt1和Oxldmrt3,并采用PCR技术扩增验证2个基因的cDNA序列。运用生物信息学方法分析2个基因序列结构特征,结果显示,Oxldmrt1和Oxldmrt3开放阅读框分别为903 bp和1363 bp,分别编码300个氨基酸和453个氨基酸;OxlDMRT1属于碱性蛋白,而OxlDMRT3属于酸性蛋白;2个基因均含有高度保守的DM结构域,OxlDMRT3还存在DMA结构域。氨基酸聚类分析显示,脊椎动物不同DMRT家族都是独立聚类,OxlDMRT1属于DMRT1家族,OxlDMRT3属于DMRT3家族,DMRT1家族最先聚类,再和DMRT3家族聚类。利用实时荧光定量PCR技术(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)分析2个dmrt基因在雌鱼和雄鱼8个组织的表达水平,结果显示,2个基因在精巢中的表达量均显著高于其他组织(P<0.01),Oxldmrt3在脑中也有少量表达;利用RT-qPCR分析2个dmrt基因在早期不同发育时期的表达谱,显示2个基因在受精卵中的表达量均最高,Oxldmrt1在眼囊期的表达量最低,而Oxldmrt3在出膜7 d时的表达量最低。利用荧光原位杂交(fluorescencein situhybridization,FISH)对2个基因在精巢中的表达进行定位,显示2个基因在精巢中表达部位一致,均在精原细胞中有较强的表达信号。综上所述,Oxldmrt1和Oxldmrt3均在线纹尖塘鳢性腺胚胎发育阶段和精巢发育过程中起调节作用,而Oxldmrt1还可能参与胚胎后期性别决定和性别分化调控过程,Oxldmrt3还可能参与神经系统发育。本研究为线纹尖塘鳢性别决定与性别分化相关的分子机制研究提供了参考。 展开更多
关键词 线纹尖塘鳢 Oxldmrt1 Oxldmrt3 基因结构 基因表达 荧光原位杂交
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EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤5例临床病理特征
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作者 黄永塔 郭文文 +3 位作者 刘霞 李玲 叶秋容 莫祥兰 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第2期186-190,共5页
目的探讨EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤的临床病理学特征。方法收集5例EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤的临床病理资料。采用免疫组化EnVision法检测CD3、CD56、TIA-1、Granzyme B等的表达,原位杂交法检测EBER的表达,应用PCR及聚丙烯酰胺凝... 目的探讨EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤的临床病理学特征。方法收集5例EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤的临床病理资料。采用免疫组化EnVision法检测CD3、CD56、TIA-1、Granzyme B等的表达,原位杂交法检测EBER的表达,应用PCR及聚丙烯酰胺凝胶电泳法行基因重排克隆性分析,并复习相关文献。结果5例肿瘤原发病变部位均位于淋巴结,伴有多发淋巴结肿大,出现B症状、乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)及C-反应蛋白(C-reactive protein,CRP)升高,处于临床Ⅲ/Ⅳ期。形态学改变表现为淋巴结结构破坏,肿瘤细胞单形性,体积大至中等大小,呈弥漫性分布,散在中心母样细胞。细胞凋亡、坏死和血管侵袭均不明显。免疫表型:5例均表达CD3和细胞毒性标志物,均不表达CD56。原位杂交检测显示大部分肿瘤细胞EBER阳性。仅4例TCR基因克隆性重排阳性。3例行化疗,2例放弃治疗,中位总生存期为3个月。结论EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤好发于老年男性,是一组原发于淋巴结内细胞毒T细胞或NK细胞且EBV阳性的侵袭性淋巴瘤。患者临床症状和体征明显,病情进展快,预后不良。熟悉EBV阳性淋巴结T/NK细胞淋巴瘤的临床病理特征,有助于与其他EBV阳性T/NK细胞淋巴组织增殖性疾病或淋巴瘤鉴别。 展开更多
关键词 淋巴瘤 T/NK细胞 EBV EBER 原位杂交
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小麦-单芒山羊草染色体易位系创制
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作者 宫文萍 汪晓潞 +5 位作者 韩冉 刘爱峰 李豪圣 刘建军 徐文竞 刘成 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第8期1003-1010,共8页
单芒山羊草1N染色体上含有小麦育种所需的优异基因,为快速准确鉴定小麦背景中的单芒山羊草1N染色质,本研究利用合成的212对引物对单芒山羊草、一套小麦-单芒山羊草附加系和小麦对照进行分析。结果表明,引物TNAC1006、TNAC1017、TNAC1029... 单芒山羊草1N染色体上含有小麦育种所需的优异基因,为快速准确鉴定小麦背景中的单芒山羊草1N染色质,本研究利用合成的212对引物对单芒山羊草、一套小麦-单芒山羊草附加系和小麦对照进行分析。结果表明,引物TNAC1006、TNAC1017、TNAC1029和TANC1031的扩增产物经TaqⅠ酶切后,在单芒山羊草和小麦-单芒山羊草1N附加系中分别获得长度为900、1 200、1 800和400 bp的多态性片段,而在其他供试材料中未获得这些多态性片段,因此它们可作为特异分子标记用于小麦背景中的1N染色质检测。利用建立分子标记筛选小麦-单芒山羊草1N附加系和中国春杂交F2群体,同时用以Oligo-pSc119.2-1和Oligo-pTa535-1为探针的双色FISH鉴定相应单株,结果发现,单株N91和N350含有杂合1NS·1NS等臂染色体,N46含有杂合1N+1NL·1NL染色体,N319含有杂合1BS·1NS易位染色体。进一步对上述4个单株的207个自交后代单株进行分子标记和FISH鉴定,结果仅获得1份小麦-单芒山羊草1NS·1NS纯合易位系。为研究清楚获得纯合易位系比例极低的原因,以1BS·1NS+1B杂合系与济麦38为材料进行测交,结果证实1BS·1NS仅通过雌配子传递。 展开更多
关键词 单芒山羊草 易位系 分子标记 荧光原位杂交 雌配子传递
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大颖草和短芒披碱草的染色体FISH分析
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作者 刘瑞娟 陈文杰 蒋礼玲 《草业科学》 北大核心 2025年第2期371-377,共7页
大颖草(Kengyilia grandiglumis)和短芒披碱草(Elymus breviaristatus)是分布在青藏高原沙生环境中的两种多年生禾草。本研究采用顺序荧光原位杂交(FISH)和基因组原位杂交(GISH)技术,应用转座子探针S5和串联重复序列探针AAG对两禾草根... 大颖草(Kengyilia grandiglumis)和短芒披碱草(Elymus breviaristatus)是分布在青藏高原沙生环境中的两种多年生禾草。本研究采用顺序荧光原位杂交(FISH)和基因组原位杂交(GISH)技术,应用转座子探针S5和串联重复序列探针AAG对两禾草根尖有丝分裂中期的染色体进行了分析。结果显示,GISH信号可成功区分P、H、St和Y 4个亚基因组,在此基础上获得了S5和AAG探针在两种植物21对染色体上的分布信息。大颖草中S5信号多分布在端粒及近端粒区,P亚基因组中分布位点最多;AAG信号多分布在近着丝粒区和近端粒区,Y亚基因组中分布的位点最多。短芒披碱草中S5信号分布在端粒、近端粒区、近着丝粒区和臂中部区,H亚基因组上信号比St和Y亚基因组丰富;AAG信号分布在近着丝粒区、臂中部区和近端粒区,信号分布位点在St亚基因组中最少。本研究获得了两种异源六倍体禾草亚基因组水平的染色体信号特征,为大颖草和短芒披碱草种质资源的评价及利用奠定了基础。 展开更多
关键词 禾草 转座子探针 串联重复探针 异源六倍体 基因组原位杂交 亚基因组 沙生植物
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拟松材线虫类毒液过敏原蛋白基因Bm-vap-1的克隆与分析
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作者 李莉 余婧 +7 位作者 王仁刚 杨春元 林世锋 朱秀 叶子 李国红 陈越男 吴沙沙 《福建农林大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第5期599-608,共10页
【目的】克隆拟松材线虫类毒液过敏原蛋白(VAP)基因Bm-vap-1,并进行表达特性分析,为深入研究Bm-vap-1基因在拟松材线虫与寄主互作过程中的作用提供参考。【方法】以拟松材线虫体前端特异cDNA文库构建和测序获得的VAP基因片段为基础,通过... 【目的】克隆拟松材线虫类毒液过敏原蛋白(VAP)基因Bm-vap-1,并进行表达特性分析,为深入研究Bm-vap-1基因在拟松材线虫与寄主互作过程中的作用提供参考。【方法】以拟松材线虫体前端特异cDNA文库构建和测序获得的VAP基因片段为基础,通过cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆得到该基因的全长cDNA序列,将其命名为Bm-vap-1。利用生物信息学软件预测Bm-VAP-1蛋白的理化性质、信号肽和跨膜区,并通过生物数据库对其同源性和保守结构域进行分析。然后利用实时荧光定量PCR检测该基因在拟松材线虫不同虫态中的表达水平,并利用原位杂交技术进行转录组表达定位。【结果】Bm-vap-1基因开放阅读框序列长度为621 bp,编码206个氨基酸,GenBank登录号为GU451046。编码蛋白质的分子质量为22.49 ku,理论等电点为4.61,与松材线虫、豆伞滑刃线虫和冲绳伞滑刃线虫VAP同源蛋白的序列一致性较高,含有1个典型且保守的CAP结构域,存在信号肽,无跨膜结构域,属于分泌型蛋白。实时荧光定量PCR结果显示,Bm-vap-1基因在拟松材线虫各个虫态中均有表达,但在成虫中的表达量较高。原位杂交结果表明,Bm-vap-1基因在拟松材线虫的食道腺特异表达。【结论】成功克隆了拟松材线虫Bm-vap-1基因,初步推测其编码蛋白在线虫食道腺合成,且在线虫寄生过程中分泌到体外发挥作用。 展开更多
关键词 拟松材线虫 类毒液过敏原蛋白 生物信息学 表达水平 原位杂交
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基于荧光原位杂交(FISH)技术的假俭草染色体鉴定和核型分析
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作者 李建建 王浩然 +4 位作者 张源 徐夕雯 李晓慧 张苓 郭海林 《植物资源与环境学报》 北大核心 2025年第1期33-41,共9页
以假俭草(Eremochloa ophiuroides(Munro)Hack.)品种‘赣北’(‘Ganbei’)基因组序列数据为基础,通过生物信息学手段挖掘和设计了假俭草染色体特异的单拷贝寡核苷酸(oligo)探针库,同时结合端粒重复序列和rDNA重复序列探针,在假俭草根尖... 以假俭草(Eremochloa ophiuroides(Munro)Hack.)品种‘赣北’(‘Ganbei’)基因组序列数据为基础,通过生物信息学手段挖掘和设计了假俭草染色体特异的单拷贝寡核苷酸(oligo)探针库,同时结合端粒重复序列和rDNA重复序列探针,在假俭草根尖细胞有丝分裂中期染色体上进行了系列荧光原位杂交(FISH)试验。结果显示:假俭草染色体核型公式为2n=2x=18(2SAT),利用5S rDNA和18S rDNA重复序列探针可识别出第5和第4号染色体,且第4号染色体18S rDNA富集区段易出现或存在断裂现象;设计的假俭草染色体特异单拷贝oligo探针可识别出第2、第6和第9号染色体,进一步结合rDNA重复序列探针结果还发现第4号染色体与第8号染色体间发生了染色体易位。综合分析认为,假俭草染色体核型存在不稳定性,且其基因组在进化过程中发生了染色体结构重排。本研究建立的基于重复序列和单拷贝oligo探针的FISH技术体系,可为假俭草染色体的准确识别和变异鉴定提供新方法,观察到的假俭草染色体核型特征可为假俭草高质量基因组图谱的构建提供细胞学证据。 展开更多
关键词 假俭草 染色体 重复序列 寡核苷酸(oligo) 荧光原位杂交(FISH) 核型分析
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38家实验室EBER原位杂交室间质控结果分析
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作者 蔡晴 郭文阳 +3 位作者 薛晓伟 王德田 王先博 周炜洵 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第7期918-923,共6页
目的 通过中国医学装备协会病理装备分会组织的原位杂交室间测评活动,分析EBER原位杂交染色中的常见问题及影响染色质量的关键因素,为原位杂交技术的标准化和规范化提供技术支撑。方法 选定已确诊EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡切片作为... 目的 通过中国医学装备协会病理装备分会组织的原位杂交室间测评活动,分析EBER原位杂交染色中的常见问题及影响染色质量的关键因素,为原位杂交技术的标准化和规范化提供技术支撑。方法 选定已确诊EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤石蜡切片作为本次测评切片,同时玻片滴加EBER原位杂交液态细胞质控品作为测评对照。问卷收集各实验室染色信息及方法。最后收集染色后切片,由协会病理专家按照评分标准进行统一评价。结果 共有来自7个省/直辖市的38家单位参评,包括32家医院病理科和6家第三方检测机构病理实验室。染色方法有:手工染色(21家),仪器进行的自动化染色(17家)。本次室间质评EBER原位杂交染色的总合格率为94.74%(36/38),优良率为26.32%(10/38),其中自动化染色优良率(41.12%,7/17)显著高于手工染色优良率(14.29%,3/21),差异有统计学意义(χ^(2)=4.852,P=0.028)。液态细胞质控品与组织对照具有良好一致性(Kappa=0.909,r=0.944)。结论 本次室间质评数据证实病理实验室EBER原位杂交技术合格,不同检测方法之间的优良率结果存在差异,推荐自动化染色作为首选染色方法;液态细胞质控品与阳性对照组织在本次质控表现中无差异;个别实验室染色技术有待改进。 展开更多
关键词 室间质控 原位杂交染色 EBER 组织阳性对照 液态细胞质控品
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芦笋DUF247基因家族成员鉴定及表达分析 被引量:1
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作者 李云宾 黎玉萍 +3 位作者 成钦 林春 毛自朝 刘正杰 《生物技术通报》 北大核心 2025年第1期198-209,共12页
【目的】对芦笋全基因组DUF247家族进行鉴定与分析,为该基因家族特别是AoSOFF的性别决定的分子功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对芦笋中的DUF247基因家族成员进行鉴定,开展其各成员编码蛋白理化性质、聚类、蛋白保守结构... 【目的】对芦笋全基因组DUF247家族进行鉴定与分析,为该基因家族特别是AoSOFF的性别决定的分子功能研究奠定基础。【方法】利用生物信息学方法对芦笋中的DUF247基因家族成员进行鉴定,开展其各成员编码蛋白理化性质、聚类、蛋白保守结构域、启动子中顺式作用元件及表达模式分析;利用实时定量PCR(RT-qPCR)和组织原位杂交技术验证芦笋性别决定基因AoSOFF的表达模式。【结果】芦笋中鉴定出24个DUF247基因家族成员,它们不均匀地分布在7条染色体上,且在不同器官中呈现差异表达。该家族成员编码蛋白的理化性质如氨基酸组成、分子量、理论等电点、不稳定系数和脂肪族系数等都存在差异。RT-qPCR和组织原位杂交结果表明,DUF247基因家族成员之一AoSOFF在芦笋雄花无性别分化早期的雌蕊、雄蕊以及花冠中均有较高表达,但在性别分化早期开始降低表达;在两性花中的表达量较低;而在雌性芦笋各组织中表达极低或检测不到,说明AoSOFF在雄性芦笋中特异性表达,与芦笋性别决定中的雌性抑制功能密切相关。【结论】芦笋DUF247家族成员具有明显的保守性,在芦笋不同性别的不同组织中的表达模式存在显著差异,特别是AoSOFF是一个雄性专一性基因,其同源基因参与植物的自交亲和调控,预示其以自交不亲和类似的反应导致雌性发育的抑制。 展开更多
关键词 芦笋 DUF247 AoSOFF 性别分化 雄性专一性 雌性抑制 原位杂交
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三类次生共生菌在豆大蓟马体内分布以及不同因子对其含量的影响 被引量:1
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作者 刘晓旭 钟泽鑫 +4 位作者 李建兴 邱佳仁 吴建辉 张永军 潘慧鹏 《昆虫学报》 北大核心 2025年第6期754-764,共11页
【目的】本研究旨在研究豆大蓟马Megalurothrips usitatus体内次生共生菌Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus的分布模式以及虫生真菌侵染、温度、寄主植物、啶虫脒抗性对Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus含量的影响,为深入了解这些... 【目的】本研究旨在研究豆大蓟马Megalurothrips usitatus体内次生共生菌Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus的分布模式以及虫生真菌侵染、温度、寄主植物、啶虫脒抗性对Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus含量的影响,为深入了解这些次生共生菌在豆大蓟马中的潜在功能奠定基础,为开发新型生物防治策略提供理论支持。【方法】采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术检测Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus在豆大蓟马雌雄成虫和2龄若虫体内的分布;通过RT-qPCR检测取食球孢白僵菌Beauveria bassiana孢悬液(1×10^(8)孢子/mL)浸泡的豇豆Vigna unguiculata、不同温度(5,10,15,25,30,35和45℃)处理、取食寄主植物豇豆和刀豆Canavalia gladiata的豆大蓟马及啶虫脒敏感品系与抗性品系豆大蓟马成虫中Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus的含量。【结果】Rickettsia和Wolbachia广泛分布于豆大蓟马的成虫和2龄若虫中,主要位于胸部和腹部,少量分布于口器和尾部;Arsenophonus仅在豆大蓟马雌成虫腹部发现。与对照相比,球孢白僵菌感染4 d时豆大蓟马雌成虫中Rickettsia的含量开始显著增加,Wolbachia的含量先增加后减少,Arsenophonus的含量直到6 d时显著增加。豆大蓟马成虫中Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus含量在25℃下最高,在其他温度下则有不同程度的下降;与取食豇豆的豆大蓟马相比,取食刀豆后豆大蓟马成虫中Rickettsia含量显著降低;与啶虫脒敏感品系相比,豆大蓟马啶虫脒抗性品系成虫中Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus含量显著增加。【结论】Rickettsia和Wolbachia广泛分布于豆大蓟马成虫和2龄若虫中,而Arsenophonus仅存在于豆大蓟马雌成虫体内;真菌侵染、温度、寄主植物和杀虫剂等因子动态调控Rickettsia,Wolbachia和Arsenophonus的含量。上述研究结果突显了次生共生菌的生态可塑性,为其在害虫靶向性防控策略中的应用提供了理论依据。 展开更多
关键词 豆大蓟马 次生共生菌 RICKETTSIA WOLBACHIA ARSENOPHONUS 荧光原位杂交 环境因子
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survivin基因表达与非小细胞肺癌发生发展的关系 被引量:12
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作者 陶琳 姚峰 +3 位作者 李华 余峰 王敏 刘铭球 《中国肺癌杂志》 CAS 2003年第4期275-277,共3页
目的 研究非小细胞肺癌 (NSCLC)组织中survivinmRNA的表达 ,探讨其在NSCLC发生发展、浸润转移中的作用。方法 原位杂交法检测 12例正常支气管粘膜上皮、9例不典型增生、3 4例NSCLC、12例淋巴结转移癌组织中survivinmRNA的表达。结果... 目的 研究非小细胞肺癌 (NSCLC)组织中survivinmRNA的表达 ,探讨其在NSCLC发生发展、浸润转移中的作用。方法 原位杂交法检测 12例正常支气管粘膜上皮、9例不典型增生、3 4例NSCLC、12例淋巴结转移癌组织中survivinmRNA的表达。结果 在正常支气管粘膜上皮、不典型增生、肺癌及淋巴结转移癌组织中survivinmRNA阳性表达率呈递增趋势 ,分别为 16.67% ( 2 /12 )、3 3 .3 3 % ( 3 /9)、61.76% ( 2 1/3 4)、91.67% ( 11/12 ) ,其中肺癌、淋巴结转移癌组织阳性表达率与正常支气管粘膜上皮比较 ,差异均有显著性 (P<0 .0 1,P <0 .0 1)。低分化肺癌survivinmRNA阳性表达率 88.89% ( 8/9)和中分化肺癌 75 .0 0 % ( 12 /16)均显著高于高分化肺癌 11.11% ( 1/9) (P =0 .0 0 3 ,P =0 .0 0 4)。survivin基因表达与NSCLC组织学类型及有无淋巴结转移无明显关系 (P >0 .0 5 ,P >0 .0 5 )。结论 survivin基因可能在肺癌的发生发展中起着重要作用 ;封闭或下调survivin基因的表达水平 ,恢复正常凋亡调控机制 。 展开更多
关键词 SURVIVin 基因表达 非小细胞肺癌 抑癌基因 原位杂交法 检测
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豆伞滑刃线虫类转甲状腺素基因(Bd-TTL-1)的克隆与表达定位分析 被引量:1
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作者 林世锋 王仁刚 +4 位作者 杨志晓 王自力 李莉 朱秀 陈越男 《南方农业学报》 北大核心 2025年第3期816-826,共11页
[目的]克隆豆伞滑刃线虫(Bursaphelenchus doui)类转甲状腺素(Transthyretin-like,TTL)基因Bd-TTL-1并进行表达特性分析,为进一步研究该基因的生物学功能打下基础。[方法]以植物寄生线虫豆伞滑刃线虫为试验材料,以其体前端cDNA为试验方... [目的]克隆豆伞滑刃线虫(Bursaphelenchus doui)类转甲状腺素(Transthyretin-like,TTL)基因Bd-TTL-1并进行表达特性分析,为进一步研究该基因的生物学功能打下基础。[方法]以植物寄生线虫豆伞滑刃线虫为试验材料,以其体前端cDNA为试验方,体后端cDNA为驱动方,利用固相消减杂交方法构建豆伞滑刃线虫体前端特异cDNA文库。利用反向Northern杂交和测序筛选文库,结合RACE技术获得Bd-TTL-1基因全长序列,并利用生物信息学软件及数据库对Bd-TTL-1蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、同源性和保守结构域进行预测分析。利用实时荧光定量PCR和原位杂交分别进行基因发育模式和表达定位分析。[结果]成功构建1个豆伞滑刃线虫体前端特异cDNA文库。通过反向Northern杂交、测序与RACE技术相结合的方法克隆获得豆伞滑刃线虫TTL全长基因Bd-TTL-1,GenBank登录号PQ276066。Bd-TTL-1基因DNA编码区全长497 bp,包括2个外显子和1个内含子;cDNA编码区全长435 bp,编码144个氨基酸。预测Bd-TTL-1蛋白的相对分子量为15.86 kD,理论等电点为9.37;Bd-TTL-1蛋白含有1个典型且保守的TTL蛋白结构域,存在信号肽但无跨膜结构域,属于分泌性蛋白。实时荧光定量PCR结果显示,Bd-TTL-1基因在豆伞滑刃线虫各发育阶段均有表达,但在虫卵期表达微弱,显著低于其他发育阶段(P<0.05)。原位杂交结果显示,Bd-TTL-1基因在豆伞滑刃线虫的食道腺特异表达。[结论]豆伞滑刃线虫Bd-TTL-1蛋白的氨基酸序列含有1个TTL蛋白保守结构域,是一种具有信号肽但无跨膜结构域的分泌性蛋白;Bd-TTL-1基因在豆伞滑刃线虫食道腺中特异表达,初步推测编码蛋白在寄生过程中通过口针释放到体外发挥作用。 展开更多
关键词 豆伞滑刃线虫 类转甲状腺素 生物信息学 表达分析 原位杂交
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Stathmin基因在食管鳞癌中的表达及生物学意义 被引量:16
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作者 王峰 王留兴 +3 位作者 何伟 朱利楠 赵培荣 樊青霞 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期1552-1557,共6页
目的探讨Stathmin基因在食管鳞癌(ESCC)中的表达及其与ESCC发生、发展的关系。方法应用原位杂交和免疫组织化学法检测3株食管鳞癌细胞EC9706、Eca109和EC-1及75例食管鳞癌组织、25例癌旁不典型增生组织和正常食管黏膜组织中StathminmRN... 目的探讨Stathmin基因在食管鳞癌(ESCC)中的表达及其与ESCC发生、发展的关系。方法应用原位杂交和免疫组织化学法检测3株食管鳞癌细胞EC9706、Eca109和EC-1及75例食管鳞癌组织、25例癌旁不典型增生组织和正常食管黏膜组织中StathminmRNA和蛋白的表达,并分析Stathmin基因表达与临床病理特征的关系。结果 StathminmRNA和蛋白在3株食管鳞癌细胞EC9706、Eca109和EC-1中均呈高表达,阳性表达率>80%。在75例食管鳞癌组织标本中,StathminmRNA和蛋白的阳性表达率分别为82.7%和81.3%,与癌旁不典型增生组织及正常食管黏膜组织比较有显著性差异(χ2=19.204、25.03,均P<0.01)。StathminmRNA和蛋白在食管鳞癌组织中的表达呈正相关(r=0.413,P=0.000)。不同分化程度、有无淋巴结转移、肿瘤浸润深度和TNM分级的食管鳞癌组织之间StathminmRNA和蛋白表达差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论食管鳞癌细胞株及组织中StathminmRNA及蛋白高表达,与食管鳞癌的分化程度、淋巴结转移、肿瘤浸润深度及TNM分期显著相关,Stathmin可能与食管鳞癌发生发展有关。Stathmin对ESCC的早期诊断及预后判断均有重要意义。Stathmin有望成为理想的生物治疗靶点。 展开更多
关键词 食管鳞癌 STATHMin 原位杂交 免疫组化
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松材线虫mix-1基因的表达特性与生物学功能 被引量:1
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作者 钟伟良 庞凯飞 +4 位作者 鲁建斌 范忠轰 孙士淼 邵蝴蝶 胡加付 《林业科学》 北大核心 2025年第1期150-158,共9页
【目的】研究松材线虫中与性别决定相关基因Bxy-mix-1的表达特性和生物学重要功能,明确该基因在松材线虫性别分化和繁殖交配中的作用,为从雌雄比例调节角度探索以该基因为靶标设计分子药物提供理论依据。【方法】根据松材线虫基因组设... 【目的】研究松材线虫中与性别决定相关基因Bxy-mix-1的表达特性和生物学重要功能,明确该基因在松材线虫性别分化和繁殖交配中的作用,为从雌雄比例调节角度探索以该基因为靶标设计分子药物提供理论依据。【方法】根据松材线虫基因组设计引物、克隆Bxy-mix-1基因。对Bxy-mix-1进行生物信息学分析。利用RT-qPCR技术和原位杂交技术探究Bxy-mix-1基因在松材线虫各龄期的表达水平和表达部位,以明确其时空动态表达特性,采用RNA干扰技术探究该基因在松材线虫生长发育中的作用。【结果】生物信息学结果显示,松材线虫Bxy-mix-1基因的全长CDS为2163 bp,共编码1171个氨基酸,属于SMC蛋白家族。Bxy-mix-1基因在松材线虫各发育阶段均有表达,胚胎期表达量最低,2龄、3龄、4龄表达量逐渐升高,成虫期表达水平最高,且基因表达水平具有雌、雄虫差异性,即雌虫的基因表达水平显著高于雄虫。原位杂交结果表明Bxy-mix-1基因在松材线虫胚胎期呈现全胚胎表达,2龄期、3龄期表达集中在体中后段,4龄和成虫期出现雌、雄差异性表达,即在雌、雄虫的性腺以及雄虫的交合刺表达。Bxy-mix-1基因沉默后,雌雄比例统计结果显示,松材线虫的雌雄比率显著下降。交配结果显示,松材线虫雄虫错误定位率显著升高,雌虫被干扰后的平均产卵量显著下降。【结论】松材线虫Bxy-mix-1基因属SMC蛋白家族,基因表达水平及表达部位皆具有雌、雄虫显著差异性。研究表明Bxy-mix-1基因对松材线虫的性别决定和生殖交配行为具有重要的调控功能。 展开更多
关键词 松材线虫 Bxy-mix-1 性别决定 RNAI 原位杂交
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凋亡抑制基因Survivin在非小细胞肺癌中的表达及其与Caspase-3、Bcl-2蛋白表达的关系 被引量:13
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作者 姚峰 陶琳 +2 位作者 陈倩 黎辉 刘铭球 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2004年第2期109-112,共4页
目的:探讨Survivin基因的表达在肺癌发生、发展中的作用及其与Caspase-3、Bcl-2蛋白表达的相互关系。方法:对13例正常支气管粘膜上皮、11列不典型增生、54例肺癌及12例淋巴结转移癌石蜡切片组织,应用原位分子杂交法检测Survivin mRNA的... 目的:探讨Survivin基因的表达在肺癌发生、发展中的作用及其与Caspase-3、Bcl-2蛋白表达的相互关系。方法:对13例正常支气管粘膜上皮、11列不典型增生、54例肺癌及12例淋巴结转移癌石蜡切片组织,应用原位分子杂交法检测Survivin mRNA的表达;用免疫组化S-P法检测Caspase-3、Bcl-2蛋白的表达。结果:肺癌、淋巴结转移癌中Survivin mRNA阳性率分别为74.07%及91.67%,显著高于正常支气管粘膜上皮及不典型增生中的阳性率7.69%及27.27%(P均<0.01);低分化、中分化肺癌中阳性率96%、75%较高分化30.76%显著升高(P<0.01,P<0.05)。TNM分期Ⅲ期病例中,Survivin mRNA表达阳性率92.31%高于Ⅰ+Ⅱ期病例的57.14%(P<0.01)。Survivin mRNA表达与Caspase-3蛋白表达呈负相关(P<0.01),与Bcl-2蛋白表达呈正相关(P<0.01)。结论:Survivin基因在非小细胞肺癌中表达上调,提示其通过抑制细胞凋亡,在肺癌癌变发生、发展中起重要作用,可能成为肺癌基因治疗的新靶点;Survivin基因通过与激活的Caspase-3结合,抑制其活性,从而阻止细胞凋亡,其阳性表达亦预示肿瘤有较高的侵袭性和不良预后;Survivin基因与凋亡抑制基因bcl-2的共同表达可能在肺癌中起协同作用。 展开更多
关键词 肺肿瘤 原位分子杂交 免疫组织化学 SURVIVin基因 细胞凋亡
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α-synuclein-pEGFP真核表达载体的构建及其在SH-SY5Y细胞中的表达 被引量:4
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作者 张宇新 赵焕英 +4 位作者 苏月 苏玉金 赵春礼 徐群渊 杨慧 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期124-128,共5页
为了构建 α-synuclein-p EGFP真核表达载体 ,检测其在 SH-SY5 Y细胞内的表达 ,本研究应用下述方法 :PCR扩增 α-synuclein基因并消除终止密码子 ;PCR产物连入 p GEM T-easy载体 ,经测序确认无误后 ,亚克隆入 p EGFP-N1,构建α-synucle-... 为了构建 α-synuclein-p EGFP真核表达载体 ,检测其在 SH-SY5 Y细胞内的表达 ,本研究应用下述方法 :PCR扩增 α-synuclein基因并消除终止密码子 ;PCR产物连入 p GEM T-easy载体 ,经测序确认无误后 ,亚克隆入 p EGFP-N1,构建α-synucle-in-p EGF P真核表达载体 ;Lipofect AMINE法转染 SH-SY5 Y细胞 ;荧光显微镜检测报告基因表达产物 EGFP,原位杂交和免疫荧光细胞化学法检测α-synuclein m RNA及其蛋白表达。结果显示 ,该载体转染 SH-SY5 Y细胞后 ,可在细胞内观察到报告基因和目的基因的表达产物。结论 :α-synuclein-p EGFP真核表达载体构建成功 ,并可在细胞内表达。本工作为今后动态观察研究α-synu-clein致 展开更多
关键词 Α-SYNUCLEin PEGFP 原位杂交 真核表达载体 绿色荧光蛋白 荧光免疫细胞化学 SH—SY5Y细胞
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CyclinD1、CyclinE、CDK6在原发性肝细胞癌中的表达 被引量:7
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作者 郑美蓉 阮庆大 +3 位作者 程玲 胡志红 梁淑凡 吴萍 《临床肝胆病杂志》 CAS 2006年第1期49-51,共3页
探讨细胞周期调控因子CyclinD1、CyclinE、CDK6在原发性肝细胞癌中的表达及意义。应用免疫组织化学、原位分子杂交和细胞图象分析技术检测原发性肝细胞癌组织及其对应的癌旁肝组织(各20例)、正常肝组织(5例)中CyclinD1、CyclinE和CDK6m... 探讨细胞周期调控因子CyclinD1、CyclinE、CDK6在原发性肝细胞癌中的表达及意义。应用免疫组织化学、原位分子杂交和细胞图象分析技术检测原发性肝细胞癌组织及其对应的癌旁肝组织(各20例)、正常肝组织(5例)中CyclinD1、CyclinE和CDK6mRNA表达情况。结果显示:CyclinD1、CyclinE和CDK6mRNA在肝细胞癌组织中呈阳性表达,阳性率分别为70%、75%和25%,正常肝组织呈阴性表达;肝细胞癌组织中CyclinD1和CyclinE的阳性表达与癌旁肝组织、正常肝组织相比,差异均有显著性意义(P<0.05);CyclinD1和CyclinE的过表达在肝细胞癌的发生和发展中起着重要作用。 展开更多
关键词 原发性肝细胞癌 细胞周期素 免疫组织化学 原位分子杂交
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血清与组织glactin-3联合检测在甲状腺癌早期诊断中的价值 被引量:19
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作者 薛刚 刘军超 +4 位作者 黄静 张静 张文静 吴靖芳 尚小领 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第7期1027-1030,共4页
目的探讨甲状腺癌患者血清与组织中半乳凝素-3(galectin-3,gal-3)的表达水平及意义。方法收集河北北方学院附属第一医院就诊甲状腺肿瘤患者159例,正常对照组16例。采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清gal-3浓度,免疫组织化学SP和原位杂... 目的探讨甲状腺癌患者血清与组织中半乳凝素-3(galectin-3,gal-3)的表达水平及意义。方法收集河北北方学院附属第一医院就诊甲状腺肿瘤患者159例,正常对照组16例。采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清gal-3浓度,免疫组织化学SP和原位杂交技术法检测甲状腺手术标本中gal-3蛋白和mRNA的表达。结果 Gal-3蛋白和mRNA均表达于胞浆,呈棕黄色颗粒。66例乳头状癌gal-3表达阳性率96.97%;6例滤泡癌阳性率83.33%;36例乳头状增生阳性率16.67%;51例腺瘤gal-3阳性率11.74%;Gal-3mRNA阳性率略低于其蛋白,且与蛋白表达呈正相关。甲状腺癌组血清gal-3浓度明显高于良性乳头状增生组、腺瘤组和正常对照组(均为P<0.001)。血清gal-3浓度在甲状腺癌组织阳性组明显高于阴性组P<0.05。结论检测血清gal-3浓度及组织表达可以提高甲状腺癌的诊断率。 展开更多
关键词 半乳糖血凝素-3 酶联免疫吸附试验 免疫组化 原位杂交 甲状腺癌
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EBER原位杂交检测技术专家共识
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作者 中国医师协会医学技师委员会病理技术专家组 中国医学装备协会病理装备分会标准化部 +6 位作者 中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会病理技术学组 中国研究型医院学会病理学专业委员会病理技术学组 周立新 张炜明 薛晓伟 徐黎明 丁伟 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第2期157-161,共5页
EBER原位杂交检测技术是一种用于检测RNA分子在组织细胞中表达定位的方法,规范检测是其结果准确性的根本保证。针对EBER原位杂交检测技术在临床应用中的关键问题,中国医师协会医学技师委员会病理技术专家组、中国医学装备协会病理装备... EBER原位杂交检测技术是一种用于检测RNA分子在组织细胞中表达定位的方法,规范检测是其结果准确性的根本保证。针对EBER原位杂交检测技术在临床应用中的关键问题,中国医师协会医学技师委员会病理技术专家组、中国医学装备协会病理装备分会标准化部、中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会病理技术学组及中国研究型医院学会病理学专业委员会病理技术学组组织相关领域专家进行深入探讨,最终形成此共识。该共识涵盖了EBER原位杂交检测技术的原理、样本处理规范、标准操作流程以及质量控制措施等方面内容,旨在为临床实验室开展EBER原位杂交检测提供指导,以提高检测结果的准确性和可靠性。 展开更多
关键词 原位杂交 EBER 质量控制
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