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mtDNA的非同义突变与人类有氧耐力的获得及保护
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作者 漆正堂 高婧怡 刘微娜 《广州体育学院学报》 北大核心 2025年第4期82-90,共9页
线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能... 线粒体DNA(mtDNA)对能量需求相关的选择压力表现出极高的敏感性,并且具有较高的突变率。其中,非同义突变对能量代谢的影响尤为显著,因此在一定程度上可以反映人类有氧耐力的获得进程。在哺乳动物和鸟类的研究中发现,运动能力的退化与能量代谢约束放松后mtDNA非同义突变的积累有关。与其他灵长类动物相比,mtDNA非同义突变以及核DNA的协同进化使得人类选择性地获得了有氧耐力。由于现代社会能量的易获性以及耐力运动的非必要性,人类mtDNA的非同义突变积累逐渐增多,占据基因池甚至引发更多慢性代谢性疾病。从哺乳动物和鸟类的mtDNA非同义突变与运动能力退化的关系判断,人类主动设置能量代谢的约束条件,即主动进行有氧运动可保持mtDNA的纯洁性、防止mtDNA非同义突变,从个体和进化两个时间尺度上维系人类健康。 展开更多
关键词 mtdna 非同义突变 人类有氧耐力 有氧运动 慢性疾病
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西藏自治区10个黄牛群体的mtDNA遗传多样性与母系起源研究
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作者 姚婷婷 李昊 +9 位作者 阎卉萱 曹一凡 次仁罗布 索朗曲吉 尼玛仓决 赵丽 旦增洛桑 斯朗旺姆 巴桑珠扎 陈宁博 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第5期2194-2202,共9页
旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发... 旨在探究西藏自治区10个黄牛群体的线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。本研究通过线粒体基因组序列比对对西藏自治区10个黄牛群体的167个个体的线粒体基因组序列进行分析,重点探究其线粒体基因组遗传多样性及其母系起源。通过系统发育学和遗传多样性分析,检测到167个黄牛拥有120种单倍型,其中包括普通牛的T2、T3和T4单倍型,原牛的Q单倍型;瘤牛的I1和I2单倍型;以及牦牛的单倍型。T3单倍型还包括T3119和T3055两个东亚普通牛特异的亚单倍型。线粒体基因组遗传多样性分析结果显示,巴桑牛的单倍型多样度最高,为0.990±0.028,白朗牛的最低,为0.867±0.107;核苷酸多样度最高的为吉隆牛0.030±0.0005,最低的为日喀则牛0.001±0.0002。系统发育树和单倍型网络图表明,10个黄牛群体主要为普通牛母系起源,有少量牦牛及瘤牛母系起源。总体而言,10个黄牛群体均具有较高的遗传多样性,具有普通牛、瘤牛和牦牛的母系起源,表明这10个黄牛群体母系遗传多样性丰富,并且和牦牛之间存在基因交流。这些结果对于深入理解西藏自治区黄牛的遗传演化机制以及合理保护和利用这一珍贵遗传资源具有重要意义。 展开更多
关键词 西藏自治区 mtdna基因组 遗传多样性
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苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列的遗传多样性 被引量:3
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作者 张成东 任战军 杨雪娇 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2015年第3期32-42,共11页
【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA... 【目的】研究苏尼特家养双峰驼的遗传多样性,以全面揭示中国双峰驼的起源进化,为科学保护和利用我国的双峰驼遗传资源奠定基础。【方法】采集15峰苏尼特家养双峰驼(10峰雄驼和5峰雌驼)的血样,提取其DNA,采用PCR方法扩增线粒体DNA(mtDNA)细胞色素b(Cyt b)基因的全序列及D-loop的671bp序列,进行遗传多样性分析,并结合GenBank中已有的双峰驼的mtDNACyt b基因序列和D-loop序列进行系统发育分析。【结果】苏尼特家养双峰驼mtDNACyt b基因中存在10个变异位点,共形成了7种单倍型,单倍型多样度为0.857±0.065,核苷酸多样度为0.001 94±0.002 70,平均核苷酸差异数为2.210;在D-loop的671bp序列中,存在6个变异位点,共定义了6种单倍型,单倍型多样度为0.714±0.116,核苷酸多样度为0.002 53±0.002 75,平均核苷酸差异数为1.695。基于Cyt b基因和D-loop序列进行的系统发育分析均显示,苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先。【结论】苏尼特家养双峰驼mtDNA Cyt b基因和D-loop序列遗传多态性均比较丰富;苏尼特家养双峰驼与野生双峰驼归于2个不同的母系世系,野生双峰驼不是苏尼特家养双峰驼的直接祖先;家养双峰驼内部存在着一定的遗传分化。 展开更多
关键词 苏尼特家养双峰驼 mtdnaCyt B基因 mtdna D-loop序列
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利用mtDNA COⅠ基因序列鉴定我国烟粉虱的生物型 被引量:212
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作者 罗晨 姚远 +3 位作者 王戎疆 阎凤鸣 胡敦孝 张芝利 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期759-763,共5页
利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。... 利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。在 5个种群的基因片段上 ,截取与Texas B型相应的 72 0bp的序列分析 ,结果表明所测序列中只有 2个碱基与Texas B型不同 ,序列相似性为 99 7% ;在西安一品红种群和新疆吐鲁番棉花种群的原序列中截取与Arizona B型序列相应的4 2 3bp片段 ,分析表明这两个种群与AZB3型属于同一个单倍型。因此 ,我国烟粉虱 5个实验种群的生物型与Texas B型和Arizona B型种群为同一生物型“B”。 展开更多
关键词 mtdna COⅠ基因序列 鉴定 烟粉虱 生物型
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中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究 被引量:24
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作者 齐国强 昝林森 +3 位作者 张桂香 王志刚 王均辉 韩旭 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期7-11,共5页
对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 ... 对我国10个地方水牛品种110个个体的mtDNA D-loop区序列(930 bp左右)进行分析,共检测到50种单倍型,107个核苷酸多态位点,其单倍型多样度(Haplotype diversity,Hd)为0.895 2±0.024 0,核苷酸多样度(Nucleotide diversity,π)为0.020 0±0.005 6,平均核苷酸差异(Average number of nucleotide differences,k)为18.445 0,表明我国水牛的遗传多态性丰富。构建的NJ进化树显示这10个品种的水牛主要有两个母系起源。 展开更多
关键词 中国地方水牛 mtdna D-LOOP 遗传多样性 起源
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中国东南沿海青蟹属不同种类的mtDNA COI基因序列分析及其系统发育 被引量:26
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作者 林琪 李少菁 +1 位作者 黎中宝 王桂忠 《厦门大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期268-273,共6页
对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析... 对采自中国东南沿海青蟹属的4种青蟹锯缘青蟹Scylla serrata(Forskal,1775),紫螯青蟹S.tranquebarica(Fab-ricius,1798),榄绿青蟹S.olivacea(Herbst,1796),拟穴青蟹S.paramamosain(Estampador,1949)的线粒体COI基因片段进行了测定,分析研究了其种间遗传差异及系统发育关系.研究结果显示:4种青蟹在COI基因片段上存在差异,种间序列差异远大于种内差异.青蟹属在我国的优势种与GenBank上的S.paramamosain的遗传距离为0.001 3,与S.ser-rata的遗传距离为0.121 3.序列特征、遗传距离和系统进化等分析结果表明中国青蟹属的优势种为拟穴青蟹S.para-mamosain. 展开更多
关键词 青蟹属 mtdna COI 基因序列 系统发育
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家牦牛线粒体DNA(mtDNA)遗传多样性及其分类 被引量:36
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作者 郭松长 祁得林 +2 位作者 陈桂华 徐世晓 赵新全 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期4286-4294,共9页
通过分析包括我国10个家牦牛品种(类群)在内共296个样本的mtDNA控制(D-loop)区部分序列的遗传变异,对我国家牦牛的遗传多样性、遗传分化、聚类关系和分类进行了研究。所测序列经比对后,共检测到61个变异位点,定义了77种单倍型。分析显... 通过分析包括我国10个家牦牛品种(类群)在内共296个样本的mtDNA控制(D-loop)区部分序列的遗传变异,对我国家牦牛的遗传多样性、遗传分化、聚类关系和分类进行了研究。所测序列经比对后,共检测到61个变异位点,定义了77种单倍型。分析显示青海环湖牦牛的单倍型多样性最高,达0.9848±0.0403,而巴州牦牛单倍型多样性最低,为0.8000±0.0825;核苷酸多样性方面,斯布牦牛存在最为丰富的核苷酸序列变异,核苷酸多样性值为0.022582±0.011767,而巴州牦牛仅为0.006856±0.002476,表明我国家牦牛品种(类群)遗传多样性水平存在较大差异。总体上,我国家牦牛单倍型多样性、核苷酸多样性分别为0.9251±0.0095和0.015265±0.007757,呈现出丰富的遗传多样性。聚类分析显示我国家牦牛存在两个聚类簇——斯布牦牛独立为一类;其余9个品种(类群)聚为一类,表明家牦牛品种(类群)间遗传距离与地理分布无明显相关。分子变异分析(AMOVA)显示九龙、嘉黎、斯布牦牛构成的组与其余7个家牦牛品种(类群)构成的组之间存在极显著的遗传分化(ΦCT=0.05285,P<0.01),且其品种间/组内遗传分化不显著(ΦSC=0.00648,P>0.05),支持依据遗传分化程度将我国家牦牛划分为两大类型。AMOVA支持的分组在品种(类群)组成上与蔡立的研究结果相符,首次为我国家牦牛划分为横断高山型和青藏高原型两种类型提供了源自分子遗传学的证据。 展开更多
关键词 家牦牛 mtdna控制区 遗传多样性 聚类关系 遗传分化 分类
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成都地区四种食尸性蝇类mtDNA中COⅠ基因序列检测 被引量:14
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作者 蔡继峰 刘敏 +7 位作者 应斌武 董建国 邓振华 陶涛 潘洪富 张红霞 闫红涛 廖志钢 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期101-106,共6页
通过检测食尸性苍蝇线粒体DNA(mtDNA)上细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ )中 2 78bp基因序列 ,鉴定食尸性苍蝇的种类 ,解决依据形态学方法不能鉴定苍蝇卵的种类、很难鉴定幼虫种类的难题 ,作为法医鉴别食尸性苍蝇及其幼虫、卵种类依据。随... 通过检测食尸性苍蝇线粒体DNA(mtDNA)上细胞色素氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ )中 2 78bp基因序列 ,鉴定食尸性苍蝇的种类 ,解决依据形态学方法不能鉴定苍蝇卵的种类、很难鉴定幼虫种类的难题 ,作为法医鉴别食尸性苍蝇及其幼虫、卵种类依据。随机采集放置在成都地区室外草地兔尸体上的 4种 15个食尸性苍蝇。利用改进的小型昆虫DNA匀浆方法提取上述苍蝇mtDNA ;通过Perkin Elmer 96 0 0扩增仪进行PCR扩增 ;聚丙烯酰胺非变性凝胶连续缓冲体系垂直电泳和银染显色技术进行扩增结果检测 ;PCR胶回收试剂盒纯化 ;ABI 377测序仪测序 ;MEGA2 1软件包进行序列分析和构建系统发育树。在双翅目食尸性苍蝇的种内进化分歧均数小于 1% ,种间进化分歧均数大于 7%。mtDNA上COⅠ序列分析能有效地对主要的食尸性苍蝇进行种类鉴定。该检测方法快速、简便和精确 ,能作为法医鉴别食尸性苍蝇种类的可靠依据。 展开更多
关键词 成都市 食尸性蝇类 mtdna CoⅠ基因 序列分析 细胞色素氧化酶亚基I 法医鉴定学
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基于mtDNA COⅠ基因的十种长小蠹分子系统进化研究(鞘翅目:长小蠹科) 被引量:12
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作者 王银竹 余道坚 +3 位作者 张润杰 徐浪 陈志粦 焦懿 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期457-463,共7页
全世界记录的长小蠹(鞘翅目:长小蠹科)有1500余种,其分类地位一直存在争议。本研究通过分子基因信息探讨长小蠹科昆虫的分子系统进化关系,测定了中对长小蠹Euplatypus parallelus(Fabricius)、希氏长小蠹E.hintziSchaufuss、散对... 全世界记录的长小蠹(鞘翅目:长小蠹科)有1500余种,其分类地位一直存在争议。本研究通过分子基因信息探讨长小蠹科昆虫的分子系统进化关系,测定了中对长小蠹Euplatypus parallelus(Fabricius)、希氏长小蠹E.hintziSchaufuss、散对长小蠹E.solutusSchedl、杯长小蠹Dinoplatypus cupulatus Chapuis、小杯长小蠹D.cupulatulusSchedl、芦苇黄截尾长小蠹D.calamusBlandford、五棘长小蠹Diapus quinquespinatusChapuis、锥长小蠹Treptoplatypus solidusWalk、栎长小蠹Platypus quercivorusMurayama和东亚长小蠹P.lewisiBlandford等长小蠹科5属10种mtDNA COⅠ基因部分序列(549bp);采用MEGA3.1分析了序列组成及遗传距离,应用PAUP4.0分别构建了长小蠹NJ,MP和ML等3种分子系统树,同时结合长小蠹的形态分类,探讨10种长小蠹及其所在属的系统进化。结果表明:长小蠹科昆虫在碱基使用频率上有很大的偏向性;长小蠹科与外群小蠹科松瘤小蠹Orthotomicus erosusWollaston之间的遗传距离(0.288~0.338)远大于科内种间距离(0~0.226);Diapus属分化最早,Euplatypus属独成一支,Treptohlatypus,Dinoplatypus和Platypus3属分化为一支。长小蠹科分子系统进化研究结果与Wood(1993)新修订的分类系统基本一致,说明长小蠹科的分类系统更趋于合理。 展开更多
关键词 长小蠹科 mtdna COⅠ 系统进化 遗传距离 分化
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甘肃境内6个牦牛群体mtDNAD-环序列遗传多样性与聚类分析 被引量:18
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作者 成述儒 曾玉峰 +2 位作者 王欣荣 张利平 吴建平 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第3期16-21,共6页
利用线粒体DNA分子标记研究了甘肃境内6个牦牛群体的遗传多样性,并进行了聚类和网络关系分析。结果表明:甘肃境内6个牦牛群体240个个体的mtDNA D-loop全序列长度变异为891~895 bp,(G+C)含量为38.80%,(A+T)含量为61.20%,说明甘... 利用线粒体DNA分子标记研究了甘肃境内6个牦牛群体的遗传多样性,并进行了聚类和网络关系分析。结果表明:甘肃境内6个牦牛群体240个个体的mtDNA D-loop全序列长度变异为891~895 bp,(G+C)含量为38.80%,(A+T)含量为61.20%,说明甘肃境内6个牦牛群体mtDNA D-loop区富含A和T。6个牦牛群体240个体mtDNA D-loop序列共发现60个变异位点,变异主要集中在200~400 bp之间,说明该区域为牦牛mtDNA D-loop区的高变区。240个牦牛mtDNA D-loop序列共发现41种单倍型,在玛曲牦牛和碌曲牦牛群体发现的单倍型数最多,均为21个,其次为夏河牦牛群体(18个),在天祝白牦牛群体发现的单倍型数最少(11个)。单倍型多样度和平均核苷酸差异数(k)分析表明,来自于甘南州的3个牦牛群体的遗传多样性最丰富,而天祝白牦牛群体最低。41个单倍型序列构建的系统发生树和网络关系分析表明,甘肃境内6个牦牛群体可能具有2个母系起源。 展开更多
关键词 mtdna D-LOOP 遗传多样性 母系起源 牦牛
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云南3个地方鸡群体mtDNA D-loop遗传多样性分析 被引量:17
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作者 苗永旺 孙利民 +5 位作者 王素芳 欧阳依娜 张永云 袁峰 和四池 李庆量 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期395-401,共7页
他留乌骨鸡、兰坪绒毛鸡和武定鸡为分布于云南西北部和中部地区的优良地方鸡遗传资源。本研究采用mt DNA母系遗传标记,对这3个地方鸡的群体遗传变异进行了检测和遗传多样性分析。在他留乌骨鸡中检测到33个核苷酸变异位点,共定义16种单倍... 他留乌骨鸡、兰坪绒毛鸡和武定鸡为分布于云南西北部和中部地区的优良地方鸡遗传资源。本研究采用mt DNA母系遗传标记,对这3个地方鸡的群体遗传变异进行了检测和遗传多样性分析。在他留乌骨鸡中检测到33个核苷酸变异位点,共定义16种单倍型,单倍型多样度为0.855±0.036,核苷酸多样度为0.017 15±0.000 58,群体内遗传距离为0.018±0.004;在兰坪绒毛鸡中发现18个核苷酸变异位点,共定义7种单倍型,单倍型多样度为0.545±0.079,核苷酸多样度为0.004 65±0.001 29,群体内遗传距离为0.005±0.001;在武定鸡中观测到36个变异位点,共定义26种单倍型,单倍型多样度为0.922±0.018,核苷酸多样度为0.015 34±0.000 80,群体内遗传距离为0.016±0.003。单倍型中介网络分析显示:他留乌骨鸡和武定鸡均包含A,B,E,F,G和H等6个母系世系,但各世系的构成比存在较大差异:他留乌骨鸡中A,B,E,F,G和H世系的构成比为35.19%,5.55%,5.55%,16.67%,27.78%,9.26%,而在武定鸡中却为34.72%,22.22%,12.50%,12.50%,15.28%,2.78%;兰坪绒毛鸡仅含有A,F和G等3个世系,构成比为2.13%,89.36%,8.51%,云南土著鸡血统占97.87%,主要由F世系构成。上述结果揭示云南3个地方鸡群体存在较大遗传分化,他留乌骨鸡和武定鸡群体变异丰富,兰坪绒毛鸡群体变异较为贫乏,但其母系遗传组成独特。本研究结果支持家鸡多个母系起源的论点。 展开更多
关键词 他留乌骨鸡 兰坪绒毛鸡 武定鸡 mtdna D—loop 遗传多样性 遗传组成
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新疆三种雅罗鱼属鱼类mtDNA D-loop多态性及起源分化分析 被引量:11
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作者 胡文革 王金富 +2 位作者 盛金良 段子渊 马润林 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期414-418,共5页
用PCR-RFLP技术,对新疆分布的准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼的mtDNA D-loop高变区约827bp进行了扩增,用ScaI、HinfI、AluI、DdeI4种限制性内切核酸酶对56个样本的扩增产物酶切和RFLP分析,共检测到6种单倍型。准噶尔雅罗鱼存在... 用PCR-RFLP技术,对新疆分布的准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼的mtDNA D-loop高变区约827bp进行了扩增,用ScaI、HinfI、AluI、DdeI4种限制性内切核酸酶对56个样本的扩增产物酶切和RFLP分析,共检测到6种单倍型。准噶尔雅罗鱼存在2种单倍型:BDAA和BDBA;贝加尔雅罗鱼存在3种:AAAA、ABAA和ACAA;高体雅罗鱼只有1种。初步认为,准噶尔雅罗鱼、贝加尔雅罗鱼存在较丰富的群体内变异。用6种单倍型及净遗传距离绘制的UPGMA分子系统树,提示准噶尔雅罗鱼有可能是原始种,贝加尔雅罗鱼和高体雅罗鱼是由准噶尔雅罗鱼进化而来。 展开更多
关键词 新疆 雅罗鱼 mtdna D-100p PCR—RFLP 多态性 进化
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3个群体草鱼mtDNAD-Loop的PCR-RFLP分析 被引量:21
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作者 吴海防 董仕 +1 位作者 单淇 谷口顺彦 《水产科学》 CAS 北大核心 2006年第4期184-188,共5页
采用PCR技术对江西瑞昌、湖南长沙、天津宁河3个群体的144尾草鱼线粒体DNA(m tDNA)D-Loop区段的限制性片段长度多态性(RFLP)进行了分析。PCR扩增出的m tDNA D-Loop区段,用11种核酸内切限制酶酶切。结果显示:扩增出的142尾试验鱼的m tDNA... 采用PCR技术对江西瑞昌、湖南长沙、天津宁河3个群体的144尾草鱼线粒体DNA(m tDNA)D-Loop区段的限制性片段长度多态性(RFLP)进行了分析。PCR扩增出的m tDNA D-Loop区段,用11种核酸内切限制酶酶切。结果显示:扩增出的142尾试验鱼的m tDNA D-Loop区段为1.6 kbp,长沙群体中的两尾为1.8kbp,个体间存在长度变异现象;6种限制酶具有酶切位点,共检测到两种单倍型,其中长沙群体中有长度变异的两尾为一种单倍型,142尾为另一种单倍型;瑞昌和宁河两群体内的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均为0,长沙群体内的分别为0.0816、0.00315;长沙群体与瑞昌(或宁河)群体间的核苷酸歧化距离以及Rogers遗传距离分别为0.0000343和0.6783;χ2检验结果显示3个群体间的遗传差异不显著(P>0.05)。表明离草鱼m tDNA D-Loop区段的遗传多样性很低。 展开更多
关键词 草鱼 mtdna D—Loop PCR—RFLP 长度变异 遗传多样性
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长江水系不同水体鳜mtDNA控制区序列的遗传分析 被引量:12
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作者 赵金良 李思发 +5 位作者 蔡完其 王伟伟 杨晓发 程久发 钱叶洲 吴超 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第1期92-97,共6页
对长江水系洞庭湖、鄱阳湖、秋浦河和太湖4个鳜群体共42尾的mtDNA控制区核苷酸序列进行了测定,获得了长度785bp的同源序列.4个群体中共检测到变异位点36个,占全部序列4.6%.42个体中共检测到19种单倍型,根据碱基组成特征,19种单倍型... 对长江水系洞庭湖、鄱阳湖、秋浦河和太湖4个鳜群体共42尾的mtDNA控制区核苷酸序列进行了测定,获得了长度785bp的同源序列.4个群体中共检测到变异位点36个,占全部序列4.6%.42个体中共检测到19种单倍型,根据碱基组成特征,19种单倍型可分为两大类型:Ⅰ型和Ⅱ型.两大类型的主要区别在第6、8、17、25、35变异位点上,Ⅰ型的核苷酸分别为G、C、G、A、C,Ⅱ型为A、T、A、G、T.除太湖群体全部表现为Ⅱ型单倍型外,不同水体鳜两大单倍型的分布频率并无明显的地理变化规律.洞庭湖、鄱阳湖、秋浦河和太湖鳜群体内的核苷酸序列差异分别为0.5%、1.0%、0.6%、0.5%,群体间的遗传差异为0.6%-0.9%.利用控制区核苷酸序列构建的NJ分子树中,各群体内的个体均未单独成群,而是互有交叉.由于遗传分化低,初步认为洞庭湖、都阳湖、秋浦河和太湖鳜群体可能同属一个种群——长江种群. 展开更多
关键词 长江mtdna 控制区 序列分析
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中国17个黄牛品种mtDNA变异特征与多态性分析 被引量:12
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作者 蔡欣 陈宏 +2 位作者 雷初朝 王珊 胡沈荣 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期666-674,共9页
中国黄牛品种资源丰富,尚有28个地方固有品种.为了进一步深入了解这些宝贵遗传资源,本研究通过mtDNA变异特征与多态性分析揭示这些来自中国不同地域地方黄牛的母系起源与分子系统学特征.在17个品种84个体的mtDNAD-loop全序列中,一共检... 中国黄牛品种资源丰富,尚有28个地方固有品种.为了进一步深入了解这些宝贵遗传资源,本研究通过mtDNA变异特征与多态性分析揭示这些来自中国不同地域地方黄牛的母系起源与分子系统学特征.在17个品种84个体的mtDNAD-loop全序列中,一共检测到了102个核苷酸替代突变位.由此定义的53个单倍型被类聚为2个明显的单倍群:普通牛和瘤牛.mtDNAD-loop全序列变异的第一个特征是转换发生的频率远高于颠换;第二个特征是缺失与替代突变共存;第三个特征是缺失突变率比较高.所有D-loop全序列的核苷酸多样性和单倍型多样性分别为0.02678±0.00050和0.919±0.027.普通牛D-loop单倍型在北方牛种群中占有优势(80%~100%),而瘤牛单倍型在南方牛种群中占有优势(42.9%~100%),2种不同单倍型在中原牛种群中的分布也存在差异.2种不同单倍型在中国不同地域17个黄牛品种中的差异性分布揭示出了瘤牛mtDNA基因在中国黄牛中自南而北、由高到低的流动模式,这种基因流动模式的形成可能是由历史事件、地理隔离以及气候环境差异等造成的. 展开更多
关键词 中国黄牛 mtdna D-loop变异 多态性 基因流
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山羊mtDNA多态性及其起源分化研究 被引量:32
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作者 李祥龙 张亚平 +3 位作者 陈圣偶 曾凡同 邱祥聘 刘相模 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期313-319,共7页
本文用14种识别6碱基的限制性内切酶ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、KpnⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ研究了来自我国12个省和自治区共计1... 本文用14种识别6碱基的限制性内切酶ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、KpnⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ研究了来自我国12个省和自治区共计18个地方山羊品种218个个体mtDNA的RFLP,并运用Nei氏公式计算了各限制性类型间的遗传距离P和群体遗传多态度π值。结果表明,在研究的所有个体中共检测到41个酶切位点,18种限制性态型,其中BamHⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ和SalⅠ共5种酶表现出多态。18种限制性态型可归结为6种基因单倍型,单倍型Ⅰ(BamHⅠB、BglⅡA、DraⅠA、EcoRⅠA和SalⅠA)和单倍型Ⅱ(BamHⅠB、BglⅡA、DraⅠA、EcoRⅠA和SalⅠB)为两种基本单倍型,研究结果提示我国地方山羊品种起源于两种不同的母系祖先。各限制性类型间的平均遗传距离为000436,整个群体的平均遗传多态度π值为00487%,表明我国地方山羊品种mtDNA遗传多样性比较贫乏,分化程度较低。 展开更多
关键词 山羊 mtdna RFLP 起源分化 遗传多样性
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三大不同品种马mtDNA Cytb基因PCR-RFLP分析 被引量:16
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作者 李金莲 石有斐 +1 位作者 布仁其其格 芒来 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期933-938,共6页
用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变... 用BamHⅠ、TaqⅠ、HaeⅢ、RsaⅠ和HincⅡ5种限制性内切酶通过PCR-RFLP技术检测了包括引入品种、培育品种和地方品种的6个类型(纯血马、三河马、乌珠穆沁马、锡尼河马、乌审马和矮马)共256匹马的mtDNACytb基因部分序列多态性。用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳将酶切产物分离,并用银染法显色。结果BamHⅠ和TaqⅠ表现出多态,5种酶共检测到7种态型,归纳为3种单倍型,以单倍型Ⅰ和Ⅲ为主体单倍型,但通过一个特殊的酶型BamHⅠ-B分析推测所研究的马可能起源于一个母系祖先。 展开更多
关键词 限制性内切酶 PCR-RFLP mtdna CYTB基因 多态性
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山东猪种mtDNA D-loop区部分序列遗传多样性及系统进化研究 被引量:11
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作者 王继英 郭建凤 +3 位作者 孙守礼 王诚 张印 武英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期792-799,共8页
为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分... 为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分序列(1102 bp)进行PCR扩增和序列测定,并采用现代生物信息学软件进行了数据处理分析,结果表明:山东各猪种之间遗传距离较小(0.0005~0.0046),远小于国外猪种杜洛克、长白与山东各猪种间的遗传距离(〉0.14),但大约克与山东各猪种的平均遗传距离较小(0.005)。构建的NJ分子系统进化树将所测样本分为2个独立的支系,第一支由山东各猪种和部分大约克构成,另一支全部为引进猪种。莱芜黑猪和大蒲莲黑猪在NJ系统树上分布集中,各自聚为一小类,其它6个猪种都很分散,说明莱芜黑猪和大蒲莲黑猪母源血统单一,其它6个猪种母源血统遗传复杂,彼此之间基因交流多。 展开更多
关键词 山东省猪种 mtdna D-LOOP区 遗传多样性 系统进化
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不同地理种群的亚洲小车蝗mtDNA COⅠ基因序列及其相互关系 被引量:11
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作者 高书晶 李东伟 +2 位作者 刘爱萍 闫志坚 徐林波 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期846-851,共6页
亚洲小车蝗(Oedaleus asiaticus)是北方草原重要的经济害虫,应用PCR直接测序法对7个不同地理种群的亚洲小车蝗共32个个体的mtDNA COⅠ基因中一段473 bp的序列进行测序。通过比较其同源性,计算核苷酸组成,并用槌角蝗科的宽须蚁蝗(Myrmele... 亚洲小车蝗(Oedaleus asiaticus)是北方草原重要的经济害虫,应用PCR直接测序法对7个不同地理种群的亚洲小车蝗共32个个体的mtDNA COⅠ基因中一段473 bp的序列进行测序。通过比较其同源性,计算核苷酸组成,并用槌角蝗科的宽须蚁蝗(Myrmeleotettix palpalis)和斑腿蝗科的鼓翅皱膝蝗(Angaracris barabensis)作外群构建NJ分子系统树。结果表明:在获得的亚洲小车蝗473 bp的序列中,A+T约占71.7%,其中29个核苷酸位点存在变异(约占所测核苷酸的6.3%)。就每个氨基酸密码子来看,第3位点的A+T含量最高。由NJ树显示,亚洲小车蝗mtDNA COⅠ序列不同单倍型之间有一定的分歧,形成不同的簇类关系,其分枝与地理分布没有直接的对应关系,但总体上看,这种簇类关系基本上呈平行分布,没有明显的地域性差别。 展开更多
关键词 亚洲小车蝗 地理种群 mtdna COⅠ基因 遗传关系
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基于mtDNA CO Ⅰ和mtDNA CO Ⅱ分子标记的贵州省茶棍蓟马种群遗传多样性分析 被引量:8
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作者 罗林丽 孟泽洪 +4 位作者 李帅 赵兴丽 周罗娜 贺圣凌 周玉锋 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1684-1692,共9页
【目的】研究贵州省茶棍蓟马不同地理种群间的遗传多样性,为掌握贵州省茶棍蓟马的遗传动态和扩散规律及制定防控措施提供理论依据。【方法】以贵州省11个不同地理区域的茶棍蓟马种群mtDNA CO Ⅰ和mtDNA CO Ⅱ基因序列为靶标,利用MEGA 6.... 【目的】研究贵州省茶棍蓟马不同地理种群间的遗传多样性,为掌握贵州省茶棍蓟马的遗传动态和扩散规律及制定防控措施提供理论依据。【方法】以贵州省11个不同地理区域的茶棍蓟马种群mtDNA CO Ⅰ和mtDNA CO Ⅱ基因序列为靶标,利用MEGA 6.0、DnaSP 5.10、Arlequin 3.5.2.2和Network 2.0等软件对种群遗传分化、基因流水平、分子变异及种群遗传多样性等进行分析。【结果】基于mtDNA CO Ⅰ和mtDNA CO Ⅱ基因分析时,分别检测到11种和9种单倍型,各地理种群的单倍型多样度(Hd)较高,分别为0.609和0.633;总体遗传固定指数(FST)分别为0.11902和0.09052,基因流(Nm)分别为2.00和2.51,表明贵州省茶棍蓟马各地理种群间的基因交流水平较高,种群间遗传分化较小。mtDNA CO Ⅰ和mtDNA CO Ⅱ基因序列的单倍型网状树分析均无明显分支;种群间的分子变异(AMOVA)分析结果表明,茶棍蓟马的遗传变异主要来自种群内部。总群体的中性检验Fu’s Fs不显著(P>0.05),且错配分布曲线呈现多峰,说明贵州省茶棍蓟马种群在较近的历史时期内保持相对稳定,未经历明显的种群扩张,或处于临界状态。【结论】贵州省茶棍蓟马种群遗传多样性较丰富,虽然尚未形成明显的种群扩张,但可能已处于临界状态,应积极采取综合防控措施,力争将茶棍蓟马种群数量控制在危害水平以下,以保证贵州省茶产业生产健康可持续发展。 展开更多
关键词 茶棍蓟马 mtdna COⅠ基因 mtdna COⅡ基因 地理种群 遗传多样性
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