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基于MCID法的萝卜品种快速鉴定 被引量:11
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作者 许园园 刘哲 +1 位作者 娄丽娜 苏小俊 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第6期1384-1389,共6页
应用基于DNA分子标记的人工绘制植物品种树形鉴别图法(Manual cultivar identification diagram,MCID)对来源于中国各地的20个萝卜品种进行了鉴定。结果表明,通过设计筛选出的4个RAPD随机引物和4次PCR扩增、统计凝胶电泳谱带,并人工绘... 应用基于DNA分子标记的人工绘制植物品种树形鉴别图法(Manual cultivar identification diagram,MCID)对来源于中国各地的20个萝卜品种进行了鉴定。结果表明,通过设计筛选出的4个RAPD随机引物和4次PCR扩增、统计凝胶电泳谱带,并人工绘制品种树形鉴别图,即可将20个萝卜品种在分子水平上进行快速区分。 展开更多
关键词 萝卜 RAPD 人工绘制植物品种鉴别图法(mcid) 品种鉴定
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二元表法和MCID法快速鉴定烟草品种 被引量:1
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作者 王君婷 杨金初 +4 位作者 孙九喆 王二彬 苏东赢 李萌 马林 《河南农业科学》 北大核心 2019年第2期63-67,82,共6页
为建立快速鉴定烟草品种的方法,利用RAPD分子标记方法对13个烟草品种进行鉴定,分别应用二元表法和人工绘制品种树图(Manual cultivar identification diagram,MCID)法2种分析方法对烟草品种DNA指纹图进行分析。结果表明:从150条特异性... 为建立快速鉴定烟草品种的方法,利用RAPD分子标记方法对13个烟草品种进行鉴定,分别应用二元表法和人工绘制品种树图(Manual cultivar identification diagram,MCID)法2种分析方法对烟草品种DNA指纹图进行分析。结果表明:从150条特异性引物中共筛选出4条稳定性好、特异性高的随机引物,得到4张DNA指纹图,利用2种分析方法对指纹图分析后成功得到13个品种的分子ID,并构建出13个烟草品种的MCID。研究发现,2种分析方法均可有效鉴定烟草品种,其中,MCID法的直观性和可加性优于二元表法,操作性更强,当供试品种较多时MCID法更简单实用,可用于大量烟草品种的快速鉴定。 展开更多
关键词 烟草 品种鉴定 RAPD分子标记 二元表法 人工绘制品种树图(mcid)法
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基于SSR荧光标记的MCID快速鉴定13个湖北茶树品种 被引量:14
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作者 黄丹娟 马建强 +4 位作者 马春雷 王松琳 陈亮 毛迎新 陈勋 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期1045-1052,共8页
【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀... 【目的】通过人工绘制品种鉴别图(Manual cultivar identification diagram,MCID)快速区分鉴别湖北茶树品种,为湖北茶树种质资源评价、品种保护及苗木纯度早期鉴定提供技术支持。【方法】以湖北省13个优良茶树品种为材料,利用30对均匀分布于遗传连锁图谱上的SSR荧光引物进行PCR扩增,并用荧光标记毛细管电泳检测扩增产物以筛选出核心引物,利用MCID法构建CID图谱。【结果】30对SSR引物共扩增出145个等位基因,各引物等位基因数为3~9个,平均每对引物为4.83个;共检测到194个基因型,各引物检测出的基因型为3~12个,平均每对引物6.47个;多态性信息量(PIC)为0.29~0.85,平均为0.58。13个茶树品种的Nei’s遗传距离为0.19~0.44。基于Nei’s遗传距离,采用Neighbor-Joining(NJ)法可将13个品种分为三大类(Nei’s遗传距离为0.16),结果表明地理来源相同的品种可能因为具有相似的遗传背景而聚在一起,也可能因为亲本来源不同而存在明显的遗传差异。利用筛选出的3对核心引物(TM547、TM552和TM107)可快速鉴别所有参试品种,通过MCID法构建的CID图谱可直观看出各参试茶树品种鉴定所需要的引物及其对应的基因型。【结论】基于SSR荧光标记的茶树品种MCID鉴定方法具有快速、准确、高效的特点,可用于湖北茶树良种知识产权保护、苗期鉴定及品种区分。 展开更多
关键词 茶树 品种鉴定 SSR荧光标记 人工绘制品种鉴别图(mcid) 湖北
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利用基于SSR标记的MCID法鉴定72个柿地方品种 被引量:14
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作者 戚建锋 李晓鹏 +1 位作者 王文然 贾海锋 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期895-903,共9页
应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID,manual cultivar identification diagram)对来源于中国各地的72个柿地方品种进行了鉴定。结果表明,利用筛选出的6对引物进行PCR扩增、再统计凝胶电泳特征性谱带,最后人工绘制出品... 应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID,manual cultivar identification diagram)对来源于中国各地的72个柿地方品种进行了鉴定。结果表明,利用筛选出的6对引物进行PCR扩增、再统计凝胶电泳特征性谱带,最后人工绘制出品种树形鉴别图,可将72个柿地方品种在分子水平上进行快速区分。同时利用NTSYS-2.10e软件进行聚类分析,通过聚类分析树状图直观了解各品种间的遗传关系,在遗传相似系数为0.62左右时,可以分为3个类群。所得的MCID图比聚类树更具直观性与实用性,通过查阅MCID图可以快速获得鉴别这些地方品种所需要的引物以及依据的多态性谱带。这对柿种质资源的鉴定及促进柿产业的持续发展具有积极的意义。 展开更多
关键词 地方品种 SSR 人工绘制植物品种鉴别图法(mcid) 品种鉴定
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基于EST-SSR标记的MCID法鉴定冬瓜种质资源 被引量:10
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作者 叶新如 刘建汀 +2 位作者 李永平 朱海生 温庆放 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期780-788,共9页
种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进... 种质资源鉴定是研究与利用冬瓜种质资源的基础。为了明确冬瓜种质资源遗传多样性,本研究基于表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR)分子标记的人工绘制品种鉴别示意图(MCID)法鉴定40份冬瓜种质资源。利用筛选出的7对引物对冬瓜种质资源进行PCR扩增,应用MCID法构建冬瓜品种鉴定图。结果表明,利用7对引物扩增的特征性谱带能够将冬瓜品种在分子水平上区分开,同时能够构建40份冬瓜种质资源的品种鉴定图。利用Ntsys2.10e软件进行聚类分析,在遗传相似系数0.77处,将冬瓜资源分为3个类群。品种鉴定图能够快速地找到区分品种的引物,比聚类图更加直观。基于EST-SSR标记的MCID法是一种有效的冬瓜资源鉴定方法。本研究对冬瓜资源鉴定具有重要意义。 展开更多
关键词 冬瓜 表达序列标签-简单重复序列(EST-SSR) 人工绘制品种鉴别示意图(mcid)法 多态性
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基于SSR标记的MCID法鉴定中国自主选育的葡萄品种 被引量:2
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作者 魏新科 樊秀彩 +1 位作者 王晨 刘崇怀 《中外葡萄与葡萄酒》 2019年第5期12-20,共9页
葡萄品种鉴定是葡萄种质资源研究、保存和新品种保护的基础,是确保引种安全性和可靠性的重要保障。传统的鉴定方式难以有效地从繁多的葡萄品种中快速鉴别,且易受环境和主观因素的影响。本研究利用9对SSR引物,应用基于SSR分子标记的人工... 葡萄品种鉴定是葡萄种质资源研究、保存和新品种保护的基础,是确保引种安全性和可靠性的重要保障。传统的鉴定方式难以有效地从繁多的葡萄品种中快速鉴别,且易受环境和主观因素的影响。本研究利用9对SSR引物,应用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID,Manual cultivar identification diagram)对中国自主选育的308个葡萄品种进行鉴定。结果表明,用8对引物就可以在分子水平上对308个中国自育葡萄品种进行区分,根据鉴定图可快速地找到鉴别某两个品种所需的引物和多态性条带长度。同时对这些品种进行了遗传多样性分析,了解各品种间的遗传关系,研究表明308个品种可分为9个类群。这为今后我国葡萄品种鉴定、品种保护提供参考依据,对我国葡萄产业的发展具有积极影响。 展开更多
关键词 葡萄 自主选育品种 SSR分子标记 人工绘制植物品种鉴别图法(mcid) 品种鉴定
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基于SSR标记的MCID法鉴定72个酿酒葡萄品种 被引量:2
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作者 傅伟红 魏新科 +2 位作者 葛孟清 刘崇怀 房经贵 《中外葡萄与葡萄酒》 2019年第5期1-7,共7页
葡萄品种繁多,表型现象不明显,同名异物或同物异名现象时有发生,品种的精准鉴定异常重要。本文利用8对引物的SSR指纹图谱通过NTSYS-2.10e软件对来源于不同国家及地区的72个酿酒葡萄品种进行了聚类分析,所得的聚类树状图直观反映了各品... 葡萄品种繁多,表型现象不明显,同名异物或同物异名现象时有发生,品种的精准鉴定异常重要。本文利用8对引物的SSR指纹图谱通过NTSYS-2.10e软件对来源于不同国家及地区的72个酿酒葡萄品种进行了聚类分析,所得的聚类树状图直观反映了各品种间的遗传关系。在遗传相似系数为0.52左右时,可以分为4个类群。同时也发现聚类结果无法显示特定的引物和多态性标记等可用于品种鉴定参考的信息,限制了分子标记在品种鉴定中的实际应用。本文同时利用基于SSR分子标记的人工绘制植物品种鉴别图法(MCID),通过筛选出的6对引物的多态性指纹图谱,绘制了这些品种的鉴定图(CID),成功将72个酿酒品种进行区分。从CID图上可以找到任意2个或多个品种间进行区分与鉴定的引物以及依据的多态性条带。这对酿酒葡萄品种鉴定、新品种保护及促进酿酒葡萄产业的持续发展具有重要作用。 展开更多
关键词 酿酒葡萄 SSR 人工绘制植物品种鉴别图法(mcid) 品种鉴定
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