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密度泛函方法对外电场作用下NaH分子结构和激发特性的研究 被引量:5
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作者 吴位巍 岳莉 +1 位作者 梁冬梅 徐梅 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期77-81,共5页
采用密度泛函(DFT)方法,运用LSDA对不同外电场(-10.284 5×109~10.284 5×109 V/m)中基态NaH分子进行理论计算,得到了它的几何参数、电荷分布、电偶极矩、最高占据轨道能级、最低空轨道能级.采用杂化CIS-DFT方法(CIS-LSDA),在... 采用密度泛函(DFT)方法,运用LSDA对不同外电场(-10.284 5×109~10.284 5×109 V/m)中基态NaH分子进行理论计算,得到了它的几何参数、电荷分布、电偶极矩、最高占据轨道能级、最低空轨道能级.采用杂化CIS-DFT方法(CIS-LSDA),在同样的外电场作用下,计算了NaH分子的激发能、波长和振子强度.结果表明,NaH分子结构强烈地依赖着外电场,且变化规律对电场方向呈现非对称性,外电场改变了NaH分子激发态出现的顺序和电子跃迁光谱强度. 展开更多
关键词 NaH分子 外电场 基态结构参数 激发态
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未折叠蛋白质的普遍初始热力学亚稳态
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作者 杨霖 郭帅 +4 位作者 马晓亮 侯成宇 史丽萍 李佳成 赫晓东 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2019年第10期993-1001,共9页
探索和理解蛋白质折叠问题一直是分子生物学、结构生物学和生物物理学的终极挑战.未折叠的蛋白质应该存在一种普遍初始热力学亚稳态,否则无法解释蛋白质是如何在剧烈的热振动干扰下完成快速精确折叠的.本文通过分析水溶液环境和蛋白质... 探索和理解蛋白质折叠问题一直是分子生物学、结构生物学和生物物理学的终极挑战.未折叠的蛋白质应该存在一种普遍初始热力学亚稳态,否则无法解释蛋白质是如何在剧烈的热振动干扰下完成快速精确折叠的.本文通过分析水溶液环境和蛋白质折叠的相关性,揭示了一种由水分子屏蔽效应引起的未折叠蛋白质的普遍初始热力学亚稳态,该亚稳态的存在是水溶液环境中水分子的物理性质决定,并赋予未折叠蛋白质抵抗热扰动和避免错误折叠的能力.我们通过研究已发表的实验数据和建立分子模型,找到了该初始热力学亚稳态存在的相关证据,并推测了该亚稳态导致蛋白质精确折叠的相关物理学机制. 展开更多
关键词 未折叠蛋白质 蛋白质二级结构 水分子屏蔽效应 热力学亚稳态
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SAC/SAC-CI方法计算Li_2分子X^1Σ_g^+,A^1Σ_u^+,B^1Π_u,a^3Σ_u^+以及b^3Π_u态结构与势能函数(英文)
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作者 赵倩 黄杰 蒋刚 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期36-40,共5页
利用SAC(symmetry-adapted cluster)/SAC-CI(configuration interaction)方法以及优选出的6-311+g*基组对Li2分子基态X1Σg+,以及A1Σu+,B1Πu,a3Σu+和b3Πu激发态进行结构计算,用正规方程组对它们拟合Murrell-Sorbie函数或Huxley函数... 利用SAC(symmetry-adapted cluster)/SAC-CI(configuration interaction)方法以及优选出的6-311+g*基组对Li2分子基态X1Σg+,以及A1Σu+,B1Πu,a3Σu+和b3Πu激发态进行结构计算,用正规方程组对它们拟合Murrell-Sorbie函数或Huxley函数,做出的势能曲线与单点扫描结果符合较好,并计算出一些分子态的光谱常数,与已有的光谱实验结果进行了对比.结果显示,理论计算值与实验值相符合. 展开更多
关键词 结构与性质 LI2 SAC/SAC-CI 激发态
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紫外光区S_2分子激光诱导荧光光谱
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作者 王书龙 向前兰 +2 位作者 赵冬梅 马新文 杨杰 《光谱学与光谱分析》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2017年第9期2792-2798,共7页
利用真空脉冲放电超声射流气体束(H_2S/Ar^3%混合气体)的方法产生了气相S_2分子,并研究了30 400~34 400cm^(-1)范围内S_2分子的时间分辨和基态振动频率分辨的激光诱导荧光光谱,获得了184支谱带的高分辨率(0.1cm^(-1))和低分辨率(0.3cm^(... 利用真空脉冲放电超声射流气体束(H_2S/Ar^3%混合气体)的方法产生了气相S_2分子,并研究了30 400~34 400cm^(-1)范围内S_2分子的时间分辨和基态振动频率分辨的激光诱导荧光光谱,获得了184支谱带的高分辨率(0.1cm^(-1))和低分辨率(0.3cm^(-1))转动光谱。实验观测并归属了S_2分子B_u^(Σ-)-X^3Σ_g^-和B″~3Π_u-X^3Σ_g^-共84支振动跃迁,分析得到了激发态B^3Σ_u^-态ν=0~9和B″~3Π_u态ν=2~12的分子常数以及B^3Σ_u^-态的基态平衡分子构型。由于S_2分子B^3Σ_u^-与B″~3Π_u态之间存在微扰,这两个电子激发态的振动能级间隔、自旋分裂常数和自旋-轨道分裂常数变化不规律,转动跃迁强度和跃迁选择定则存在异常,利用~3Σ-~3Π的齐次微扰哈密顿量定性地对这些异常光谱进行了解释,进一步丰富了S_2分子紫外区低能电子激发态的信息。 展开更多
关键词 S2分子 激光诱导荧光光谱 低能量激发态 电子态结构 微扰
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外电场下GeO分子结构特性及激发性质的研究 被引量:4
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作者 刘高福 吴旭普 +1 位作者 刘家兴 吴永刚 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第3期101-107,共7页
用密度泛函理论,采用Hseh1pb/3-21g方法,优化在不同电场强度下获得GeO分子的稳定构型及结构参数,并对外电场作用下GeO分子的键长、总能量、电偶极矩、分子轨道、能隙和红外振动频率等进行分析.结果表明:在轴向(z方向)随外电场的增加,分... 用密度泛函理论,采用Hseh1pb/3-21g方法,优化在不同电场强度下获得GeO分子的稳定构型及结构参数,并对外电场作用下GeO分子的键长、总能量、电偶极矩、分子轨道、能隙和红外振动频率等进行分析.结果表明:在轴向(z方向)随外电场的增加,分子的键长增大,而分子总能量减小,偶极矩呈线性增加,LUMO轨道能量和HOMO轨道能量随着电场的增加而缓慢减少,能隙缓慢增加,其振幅变小,同时振动频率出现红移现象.另外,基于相同的基组采用TDDFT的方法研究了外电场对GeO分子的紫外可见吸收光谱、激发能和振子强度等的影响.结果表明:随着外电场的增加跃迁能量降低,产生的激发态波长增大,吸收峰出现红移,同时摩尔吸收系数减小. 展开更多
关键词 GeO分子 外电场 分子结构 红外振动 激发态 激发性质
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核磁共振波谱法在蛋白质三维结构解析中的应用 被引量:1
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作者 尹林 申峻丞 杨立群 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1273-1290,共18页
蛋白质特定的三维结构与其生物功能密切相关,因此,研究蛋白质的三维结构有助于揭示其生物功能机制。将核磁共振(NMR)波谱法应用于研究溶液状态下蛋白质的三维结构,能够更加准确地揭示蛋白质结构与生物功能之间的关系。本文综述了NMR解... 蛋白质特定的三维结构与其生物功能密切相关,因此,研究蛋白质的三维结构有助于揭示其生物功能机制。将核磁共振(NMR)波谱法应用于研究溶液状态下蛋白质的三维结构,能够更加准确地揭示蛋白质结构与生物功能之间的关系。本文综述了NMR解析蛋白质三维结构的理论和技术方法,以及NMR结合其他生物物理手段,并辅以分子建模计算法研究蛋白质三维结构的研究进展和最新方法,为精准解析蛋白质的三维结构提供思路及策略。 展开更多
关键词 核磁共振波谱法 蛋白质三维结构 同位素标记蛋白质 结构约束 蛋白质分子激发态结构 超大蛋白质复合体的三维结构
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