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环状RNA在肺动脉高压中的作用和机制 被引量:1
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作者 宋新月 朱大岭 《生理科学进展》 北大核心 2025年第1期22-29,共8页
环状RNA(circular RNA, circRNA)作为内源性的非编码RNA在真核生物转录组中普遍存在,调控生物体生命活动的各个方面,如转录调控、表观遗传修饰、信号传导、染色质修饰等,与多种疾病密切相关,发挥着不可或缺的作用。近年来,随着对circRN... 环状RNA(circular RNA, circRNA)作为内源性的非编码RNA在真核生物转录组中普遍存在,调控生物体生命活动的各个方面,如转录调控、表观遗传修饰、信号传导、染色质修饰等,与多种疾病密切相关,发挥着不可或缺的作用。近年来,随着对circRNA研究的不断深入,与肺动脉高压相关的circRNA逐渐被挖掘,使其成为当前肺动脉高压发病机制研究中的新热点。本文重点介绍了circRNA在肺动脉高压领域的研究现状,并探究了其在肺动脉高压中的作用和机制。 展开更多
关键词 肺动脉高压 环状RNA 肺血管重构 基因调控 RNA剪切 超级增强子 分子机制
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lncSIL通过EZH2/P21/CDK6信号通路负向调控TGF-β1诱导的肺泡上皮细胞间质转化 被引量:2
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作者 张万方 王琳 +10 位作者 潘鹏涛 李文昕 康瑞丽 朱子任 陈浩勤 方新宇 张星灿 张雨昕 姜依雯 李欣妍 袁本琪 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2024年第4期600-604,共5页
目的研究在转化生长因子β1(TGF-β1)诱导肺泡上皮细胞间质转化(EMT)进程中lncSIL的作用及其相关信号通路。方法采用Western blot法研究沉默lncSIL后对TGF-β1诱导EMT进程中细胞标志蛋白E-钙黏蛋白(E-cad)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)... 目的研究在转化生长因子β1(TGF-β1)诱导肺泡上皮细胞间质转化(EMT)进程中lncSIL的作用及其相关信号通路。方法采用Western blot法研究沉默lncSIL后对TGF-β1诱导EMT进程中细胞标志蛋白E-钙黏蛋白(E-cad)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)和Ⅰ型胶原蛋白(ColⅠ)表达的影响;通过RNA pulldown分析lncSIL相互作用蛋白,并检测过表达或沉默lncSIL后对其靶基因组蛋白赖氨酸N-甲基转移酶(EZH2)以及下游因子P21蛋白(P21)和细胞周期蛋白依赖性激酶6(CDK6)表达的影响,并结合流式细胞术分析lncSIL对细胞周期进程的作用。结果沉默lncSIL后,间质细胞标志蛋白α-SMA和Col I表达升高,肺泡上皮细胞标志蛋白E-cad表达下降;RNA pulldown实验结果显示EZH2是与lncSIL相互作用的靶蛋白,并且沉默lncSIL后EZH2表达升高,其下游基因P21表达下调,CDK6表达上调,同时S期细胞的数量显著升高;过表达lncSIL时,EZH2与CDK6表达下调,P21表达上调,同时S期细胞的数量明显降低。结论lncSIL通过负向调控EZH2/P21/CDK6信号通路抑制细胞周期进程进而抑制TGF-β1诱导的肺泡上皮细胞向间质转化。 展开更多
关键词 lncSIL 长链非编码RNA 特发性肺纤维化 上皮细胞间质转化 转化生长因子β1 Zeste同源物增强子2 细胞标志蛋白
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dsRNA阻断大鼠骨髓源性神经干细胞Hes5表达的实验研究 被引量:3
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作者 王海燕 徐如祥 +1 位作者 姜晓丹 罗深秋 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2004年第1期35-38,41,共5页
目的 观察外源性短双链RNA(dsRNA)在转录后水平即mRNA水平降低基因表达的效率,并对其影响因素进行初步探讨。方法 将体外分离培养的大鼠骨髓基质细胞,通过由本实验室配制的特殊培养基诱导成神经干细胞,应用人工合成的dsRNA于不同浓... 目的 观察外源性短双链RNA(dsRNA)在转录后水平即mRNA水平降低基因表达的效率,并对其影响因素进行初步探讨。方法 将体外分离培养的大鼠骨髓基质细胞,通过由本实验室配制的特殊培养基诱导成神经干细胞,应用人工合成的dsRNA于不同浓度转染神经干细胞,Western bloting检测dsRNA是否能阻断转录因子Hes5的表达,0.5%锥虫蓝法测定各浓度组中培养细胞活力。结果 200、300nmol/L浓度的dsRNA能特异有效地阻断Hes5的表达,而50~200nmol/L浓度的dsRNA有利于干细胞存活。结论 dsRNA能在神经干细胞内启动RNA干扰作用,适宜浓度的dsRNA能在特异有效地阻断内源性基因的表达的同时,最大限度地保持细胞活力。 展开更多
关键词 DSRNA 大鼠 骨髓源性神经干细胞 Hes5 实验 外源性短双链RNA 基因表达
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MEF2A RNA干扰对小鼠主动脉内皮细胞MEF2A表达及细胞间黏附分子-1、血管细胞黏附分子-1表达的影响 被引量:3
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作者 周文平 张辉 张金盈 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2016年第4期502-505,共4页
目的:观察肌细胞增强因子2A(MEF2A)RNA干扰对小鼠主动脉内皮细胞MEF2A及细胞间黏附分子-1(ICAM-1)、血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)表达的影响。方法:培养小鼠主动脉内皮细胞,构建MEF2A RNA干扰慢病毒或者阴性对照慢病毒(NC)并转染小鼠主... 目的:观察肌细胞增强因子2A(MEF2A)RNA干扰对小鼠主动脉内皮细胞MEF2A及细胞间黏附分子-1(ICAM-1)、血管细胞黏附分子-1(VCAM-1)表达的影响。方法:培养小鼠主动脉内皮细胞,构建MEF2A RNA干扰慢病毒或者阴性对照慢病毒(NC)并转染小鼠主动脉内皮细胞。实验设对照组(不加慢病毒)、NC组和MEF2A RNA干扰组3组,应用ELISA和RT-PCR法分别检测MEF2A及ICAM-1、VCAM-1蛋白及mRNA的表达水平。结果:ICAM-1在对照组、NC组和MEF2A RNA干扰组上清液中的表达量分别为(1.133±0.182)、(1.267±0.115)、(2.249±0.185)μg/L;VCAM-1在对照组、NC组和MEF2A RNA干扰组上清液中的表达量分别为(2.382±0.204)、(2.253±0.281)、(5.077±0.198)μg/L。ICAM-1、VCAM-1在上清液中的水平及mRNA表达水平,NC组与对照组相比,差异无统计学意义(P>0.05);MEF2A RNA干扰组与对照组和NC组相比均升高(P<0.05)。结论:慢病毒介导的MEF2A RNA干扰可抑制小鼠主动脉内皮细胞MEF2A活性及mRNA的表达,并可促进血管内ICAM-1、VCAM-1蛋白及mRNA的表达。 展开更多
关键词 小鼠 肌细胞增强因子2A RNA干扰 ICAM-1 VCAM-1
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小干扰RNA表达载体介导的EOLA1基因表达抑制研究 被引量:1
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作者 苏踊跃 梁光萍 +4 位作者 罗向东 刘月明 陈渝 陈建 杨宗城 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期200-202,共3页
目的 设计和构建EOLA1基因特异性的小干扰RNA质粒 ,并初步验证其对靶基因的抑制作用。方法 将靶点特异性的寡核苷酸连接到经ApaⅠ EcoRⅠ酶切线性化的pBS/U6质粒 ,测序验证 ,阳性重组质粒转染ECV3 0 4细胞 ,半定量RT PCR方法检测靶... 目的 设计和构建EOLA1基因特异性的小干扰RNA质粒 ,并初步验证其对靶基因的抑制作用。方法 将靶点特异性的寡核苷酸连接到经ApaⅠ EcoRⅠ酶切线性化的pBS/U6质粒 ,测序验证 ,阳性重组质粒转染ECV3 0 4细胞 ,半定量RT PCR方法检测靶基因的表达 ,阳性重组质粒与pEGFP EOLA1共转染 ,观察外源报告基因绿色荧光蛋白的表达。结果 构建的阳性重组质粒转染能够抑制靶基因EOLA1mRNA的表达 ,并能够显著抑制EOLA1 EGFP融合蛋白的表达。结论 成功构建了针对EOLA1基因的siRNA质粒 ,为进一步研究该基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 RNA干扰 ECV304 EOLA1 增强绿色荧光蛋白
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EZH2 shRNA真核表达载体的构建及其在卵巢癌A2780细胞系的稳定表达 被引量:1
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作者 胡沙 于利利 +4 位作者 李智敏 韩方 吴莉英 黄在菊 王泽华 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期632-634,666,共4页
目的采用基因工程技术,构建EZH2 shRNA的真核表达载体,获得稳定表达干扰质粒的卵巢癌A2780细胞系。方法合成特异性干扰EZH2的shRNA片段并定向克隆插入Supersilencing shRNA质粒表达载体pGPU6/GFP/Neo,获得表达载体pGPU6/GFP/Neo-shEZH2... 目的采用基因工程技术,构建EZH2 shRNA的真核表达载体,获得稳定表达干扰质粒的卵巢癌A2780细胞系。方法合成特异性干扰EZH2的shRNA片段并定向克隆插入Supersilencing shRNA质粒表达载体pGPU6/GFP/Neo,获得表达载体pGPU6/GFP/Neo-shEZH2。脂质体介导重组质粒转染A2780细胞,经G418加压筛选获得稳定转染细胞株,Real time RT-PCR和Western blot检测转染后细胞系EZH2的表达。结果测序结果证实重组载体构建成功,稳定转染shEZH2的A2780细胞EZH2的mRNA和蛋白水平下降(90.20±1.66)%和(73.80±5.49)%,P<0.01,差异有统计学意义。结论成功构建EZH2 shRNA表达载体,获得EZH2基因稳定沉默的A2780细胞系,为进一步研究以EZH2为靶点的卵巢癌治疗奠定实验基础。 展开更多
关键词 EZH2 卵巢癌 RNA干扰 载体构建
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MEF2A RNA干扰对apoE^(-/-)小鼠动脉粥样硬化斑块及血清Lp-PLA2、MCP-1表达的影响 被引量:4
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作者 周文平 周应乾 +1 位作者 张辉 张金盈 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2018年第4期440-443,共4页
目的:观察肌细胞增强因子2A(MEF2A)表达下降对载脂蛋白E基因敲除(apoE^(-/-))小鼠动脉粥样硬化(AS)斑块形成及脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)表达的影响。方法:高脂喂养apoE^(-/-)小鼠以构建AS模型。45只模型... 目的:观察肌细胞增强因子2A(MEF2A)表达下降对载脂蛋白E基因敲除(apoE^(-/-))小鼠动脉粥样硬化(AS)斑块形成及脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)、单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)表达的影响。方法:高脂喂养apoE^(-/-)小鼠以构建AS模型。45只模型小鼠被分为MEF2A RNAi组、阴性对照组(NC组)和对照组,每组15只。MEF2A RNAi组动脉局部斑块滴注慢病毒悬液,NC组动脉局部斑块滴注NC慢病毒悬液,对照组滴加生理盐水,术后继续高脂喂养,5周后进行组织学检查。采用ELISA和real-time PCR法检测血清和斑块局部MEF2A及Lp-PLA2、MCP-1表达的变化。结果:MEF2A RNAi组与对照组、NC组相比,血清MEF2A水平降低,Lp-PLA2、MCP-1水平升高(P<0.05);AS斑块增厚,面积增大,斑块局部MEF2A mRNA表达水平降低,Lp-PLA2、MCP-1 mRNA表达水平增高(P<0.05)。结论:在体内apo E缺失时,抑制MEF2A活性可增强Lp-PLA2、MCP-1表达,促进AS及斑块形成。 展开更多
关键词 小鼠 肌细胞增强因子2A RNA干扰 脂蛋白相关磷脂酶A2 单核细胞趋化蛋白-1
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马铃薯S病毒内蒙分离株3'端序列的分析 被引量:1
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作者 刘俊莹 迟胜起 +2 位作者 张剑峰 张华鹏 王聪聪 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第B12期20-24,共5页
为明确马铃薯S病毒内蒙古分离株(Potato Virus S-Inner Mongolia,PVS-IM)3'端序列结构的特点,通过在马铃薯S病毒亚基因组增强子保守区域设计引物,运用3'RACE技术获得了马铃薯S病毒内蒙古分离株3'端序列。比对显示PVS-IM分... 为明确马铃薯S病毒内蒙古分离株(Potato Virus S-Inner Mongolia,PVS-IM)3'端序列结构的特点,通过在马铃薯S病毒亚基因组增强子保守区域设计引物,运用3'RACE技术获得了马铃薯S病毒内蒙古分离株3'端序列。比对显示PVS-IM分离株属于PVSO(Ordinary)株系,为有针对性的防治病害以及预测产量损失提供依据;分析还发现PVSO和PVSA(Andean)两株系在外壳蛋白氨基酸N端和亚基因组增强子区域也存在可以区分两株系的差异,为区分两株系提供参考,也为PVS基因组功能以及作用机制的研究奠定基础。 展开更多
关键词 亚基因组增强子 PVSO(Ordinary) PVSA(Andean)
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缺氧/放射活化Epo/e9增强子调控Layilin siRNA表达以抑制人肺腺癌A549细胞侵袭的研究 被引量:1
9
作者 卓文磊 陶光利 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期846-851,共6页
背景与目的:Layilin是一种新发现与肺腺癌侵袭转移有密切联系的特异性透明质酸受体。本研究旨在观察缺氧/放射条件下活化缺氧/放射双敏感性增强子(Epo/e9),调控针对layilin的小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)表达,探讨其对人肺腺... 背景与目的:Layilin是一种新发现与肺腺癌侵袭转移有密切联系的特异性透明质酸受体。本研究旨在观察缺氧/放射条件下活化缺氧/放射双敏感性增强子(Epo/e9),调控针对layilin的小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)表达,探讨其对人肺腺癌A549细胞受透明质酸诱导侵袭的影响。方法:构建携带Epo/e9增强子和U6启动子且表达针对layilin的siRNA的RNA干扰载体(Epoo/e9-siLay plasmid)和阴性对照RNA干扰载体(Epo/e9-siCtrl plasmid),分别转染A549细胞,新霉素抗性筛选得到layilin表达受抑制的A549_(Epo/e9-siLay)细胞和layilin表达未受影响的A549_(Epo/e9-siCtrl)细胞。针对非转染A549(A549_(untransfected))、A549_(Epo/e9siLay)、A549_(Epo/e9-siCtrl)三组细胞,在缺氧/放射处理下,分别采用RT-PCR和和Western blot检测layilin mRNA和和蛋白表达,用Transwell模型检测细胞侵袭能力。结果:与A549_(untransfected)组相比,A549_(Epo/e9-siLay)组layilin表达显著减弱(P<0.01),Transwell穿膜细胞数显著减少(P<0.01);A549_(Epo/e9-siCtrl)组layilin表达、Transwell穿膜细胞数皆和A549_(untransfected)组无显著差异(P>0.05)。缺氧/放射处理能进一步增加和RNA干扰的上述效应(P<0.01)。结论:在缺氧/放射条件下,Epo/e9增强子调控layilin siRNA表达能明显抑制A549细胞侵袭行为。 展开更多
关键词 Epo/e9增强子 layilin RNA干扰 侵袭 A549细胞
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EZH2基因与卵巢癌细胞系A2780化疗敏感性的关系
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作者 黄在菊 胡沙 +3 位作者 蔡晶 于利利 李智敏 王泽华 《实用妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期365-368,共4页
目的:探讨RNA干扰沉默果蝇zeste基因增强子同源物2(enhancer of zeste homolog2,EZH2)基因与卵巢癌细胞A2780顺铂敏感性的关系。方法:获得稳定表达EZH2短发夹状RNA(short hairpin RNA,shRNA)的人卵巢癌细胞A2780-shEZH2,实时定量PCR(Rea... 目的:探讨RNA干扰沉默果蝇zeste基因增强子同源物2(enhancer of zeste homolog2,EZH2)基因与卵巢癌细胞A2780顺铂敏感性的关系。方法:获得稳定表达EZH2短发夹状RNA(short hairpin RNA,shRNA)的人卵巢癌细胞A2780-shEZH2,实时定量PCR(Real time RT-PCR)法和免疫印记法检测转染株的EZH2基因表达,MTT法检测细胞对顺铂的耐药性,流式细胞学检测细胞凋亡。结果:以未转染组A2780细胞EZH2的表达水平为100%,EZH2-shRNA转染组A2780-shEZH2细胞EZH2的mRNA及蛋白水平分别下降90.20±1.66%和76.54±8.92%,与未转染组比较差异均有高度统计学意义(P<0.01)。EZH2-shRNA转染组A2780-shEZH2细胞对顺铂的IC50与未转染组A2780细胞IC50值和空质粒转染组A2780-shVector细胞IC50值比较,差异无统计学意义(P>0.05)。EZH2-shEZH2转染组的细胞凋亡率与空质粒转染组凋亡率及未转染细胞凋亡率相比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:EZH2基因与卵巢癌原发性顺铂耐药无关。 展开更多
关键词 果蝇zeste基因增强子同源物2基因 顺铂敏感性 RNA干扰
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Fas靶向RNA干扰逆转录病毒载体的构建及生物活性鉴定
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作者 刘苏虎 张王刚 +2 位作者 张镁 朱青 田玮 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2005年第5期827-831,共5页
本研究构建Fas靶向RNA干扰逆转录病毒载体,为探讨抑制Fas表达在再生障碍性贫血等疾病治疗中的意义、以及为促进RNA干扰技术的广泛开展奠定基础。用PCR方法获得小鼠U6+27启动子盒及产生siRNA的相应DNA模板,然后连同增强绿色荧光蛋白(EGFP... 本研究构建Fas靶向RNA干扰逆转录病毒载体,为探讨抑制Fas表达在再生障碍性贫血等疾病治疗中的意义、以及为促进RNA干扰技术的广泛开展奠定基础。用PCR方法获得小鼠U6+27启动子盒及产生siRNA的相应DNA模板,然后连同增强绿色荧光蛋白(EGFP)基因克隆入商业化逆转录病毒载体pLXSN,以获得逆转录病毒载体穿梭质粒pLXSN/EGFPsiFas。包装、滴定重组逆转录病毒载体,并感染P815细胞,检测绿色荧光蛋白表达情况及对细胞Fas表达的抑制情况。结果表明:构建的逆转录病毒载体pLXSN/EGFPsiFas能够有效被包装并感染靶细胞,在靶细胞内可同时表达siRNA、绿色荧光蛋白以及新霉素抗性。结论:成功构建了抑制小鼠Fas表达的RNA干扰逆转录病毒载体。 展开更多
关键词 RNA干扰 FAS 再生障碍性贫血 逆转录病毒载体 绿色荧光蛋白
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构建RNA干扰载体特异性抑制绿色荧光蛋白表达的研究
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作者 张镁 刘苏虎 张王刚 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期389-391,F003,共4页
目的:利用PCR构建RNA干扰质粒载体的方法,促进RNA干扰技术的广泛开展。方法:PCR方法获得小鼠U6+27启动子序列,以及干扰绿色荧光蛋白(EGFP)表达的siRNA的相应DNA模板序列。将其序列克隆入pUC19,获得RNA干扰载体pU6-siEGFP。将pU6-siEGFP... 目的:利用PCR构建RNA干扰质粒载体的方法,促进RNA干扰技术的广泛开展。方法:PCR方法获得小鼠U6+27启动子序列,以及干扰绿色荧光蛋白(EGFP)表达的siRNA的相应DNA模板序列。将其序列克隆入pUC19,获得RNA干扰载体pU6-siEGFP。将pU6-siEGFP及pcDNA3.1/EGFP共转导COS-7细胞,观察EGFP表达情况。结果:所构建的pU6-siEGFP能够成功干扰COS-7细胞中EGFP的表达。结论:PCR方法成功构建了RNA干扰载体,为RNA干扰技术在更多实验室的广泛开展奠定基础。 展开更多
关键词 RNA干扰 绿色荧光蛋白 多聚酶链反应
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增强子RNA研究现状 被引量:3
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作者 程霄 杨琼 +5 位作者 谭镇东 谭娅 蒲红州 赵雪 张顺华 朱砺 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期784-797,共14页
增强子是真核生物基因表达调控的主要顺式作用元件,能有效促进基因表达。活化的增强子可以转录生成增强子RNA(enhancerRNAs,eRNAs),其合成受到信号系统和信号转录因子的约束。eRNAs与其他转录本(如lncRNAs和mRNAs)相比,其长度更短、稳... 增强子是真核生物基因表达调控的主要顺式作用元件,能有效促进基因表达。活化的增强子可以转录生成增强子RNA(enhancerRNAs,eRNAs),其合成受到信号系统和信号转录因子的约束。eRNAs与其他转录本(如lncRNAs和mRNAs)相比,其长度更短、稳定性更差、组织特异性更强。此外,eRNAs对增强子与启动子之间的染色质环(looping)的形成和稳定有一定的作用,并能促进靶基因的表达。目前,越来越多的研究发现eRNAs在发育和疾病发生等生物学过程中扮演着重要角色,但是其功能研究一直进展缓慢,调控机制尚不清楚。本文概述了eRNAs的特征、研究方法和功能特性,探讨了eRNAs作为潜在治疗靶标的可能性,以期为eRNAs的后续研究提供参考。 展开更多
关键词 增强子RNA 转录本 染色质环 功能特性
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DNA/RNA提取及处理方法对评价沉积物中纤毛虫分子多样性的影响 被引量:1
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作者 李龙召 黄平平 +1 位作者 徐奎栋 赵峰 《海洋科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期52-60,共9页
环境DNA(eDNA)技术结合高通量测序已广泛应用于评价微型生物多样性与群落构成。相较于eDNA,RNA在环境中易降解,环境RNA(eRNA)可更准确地反映群落近期生命活性状态。理论上,基于eRNA检获的生物多样性要低于eDNA检获的总体多样性。但前期... 环境DNA(eDNA)技术结合高通量测序已广泛应用于评价微型生物多样性与群落构成。相较于eDNA,RNA在环境中易降解,环境RNA(eRNA)可更准确地反映群落近期生命活性状态。理论上,基于eRNA检获的生物多样性要低于eDNA检获的总体多样性。但前期已发表研究显示同一站点eDNA获得的多样性低于eRNA检获量,推测可能原因包括:1)样本量不同;2)RNA中存在DNA污染。为验证假设,本研究以陆架区2个站位沉积物中的纤毛虫为实验对象,系统性比较4种DNA/RNA提取方法:DNA直接提取(0.9 g沉积物),大样本量DNA直接提取(2 g),DNA洗脱法(2 g),RNA直接提取法(2 g);以及3种RNA提取后的处理方法:无DNA酶反转录,含DNA酶反转录,先纯化RNA再反转录。研究结果表明,大样本量(2 g)DNA直接提取法所检获的可操作分类单元(OTUs)约为小样本量(0.9 g)的2倍。相同样本量下,DNA洗脱法检获的OTUs最多,而DNA直接提取检获的OTUs低于有/无DNA酶反转检获的数量,先纯化再反转录所获得OTUs最少。就群落构成而言,DNA洗脱法和RNA纯化可有效降低浮游类群比例,可更真实展现底栖群落的构成。综上,建议使用DNA洗脱法评价沉积物中微型生物的总体多样性;采用eRNA研究具有生命活性的生物群落时,反转录之前可纯化RNA,以获得更加准确的具有生命活性的群落信息。 展开更多
关键词 EDNA eRNA DNA/RNA提取 纤毛虫 分子多样性
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载siRNA微泡实现肿瘤治疗与疗效评估一体化的可行性分析 被引量:4
15
作者 李硕阳 尹庭辉 +3 位作者 李景果 郑博文 邱晨 王平 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期874-878,共5页
目的探讨利用载小干扰RNA(small interfering RNA,si RNA)的脂质微泡超声造影剂实现恶性肿瘤基因治疗与疗效评估一体化的可行性。方法以异质性组装法制备载si RNA的脂质微泡,并用动态光散射法检测其直径大小和表面电位。通过激光共聚焦... 目的探讨利用载小干扰RNA(small interfering RNA,si RNA)的脂质微泡超声造影剂实现恶性肿瘤基因治疗与疗效评估一体化的可行性。方法以异质性组装法制备载si RNA的脂质微泡,并用动态光散射法检测其直径大小和表面电位。通过激光共聚焦显微镜观察红色荧光标记的si RNA在瘤内的分布。针对抗凋亡基因sirtuin 2(SIRT2)设计si RNA,通过在体实验研究载si RNA微泡在超声辐照下的肿瘤基因沉默效果。在用载si RNA微泡治疗肿瘤的同时,以超声造影技术观察肿瘤治疗效果。结果 si RNA微泡的直径为400.7±30.5 nm,表面带弱正电(+8.8±0.8 m V)。si RNA微泡协同超声辐照能高效地将si RNA递送到肿瘤细胞胞浆内,有效沉默肿瘤组织中的SIRT2基因,诱导肿瘤凋亡,明显减缓肿瘤的生长速度。超声造影检查结果提示,载si RNA微泡具有良好的超声显像效果,能在治疗过程中实时评估肿瘤的血供情况。结论新型载si RNA的脂质微泡超声造影剂在活体上能对肿瘤进行基因沉默治疗,同时观察肿瘤治疗效果,实现恶性肿瘤基因治疗与疗效评估的一体化。 展开更多
关键词 小干扰RNA 脂质微泡 超声造影 肿瘤治疗 基因治疗 疗效评估
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RNA结合蛋白与RNA相互作用鉴定技术 被引量:6
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作者 陈伟 许馨 孙绍光 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期103-107,共5页
RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这... RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)通过与RNA相互作用,广泛参与到RNA的剪切、转运、编辑、胞内定位及翻译调控等过程中。RNA领域尤其是非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)研究的快速发展,催生了多种RBPs-RNAs相互作用鉴定技术。这些技术反之又推动了RNA领域的研究进程。本文对紫外交联免疫沉淀(ultraviolet crosslinking and immunoprecipitation,CLIP),CLIP cDNA文库高通量测序(high-throughput sequencing of CLIP cDNA library,HITS-CLIP),光活化核苷增强的CLIP(photoactivatable-ribonucleoside-enhanced crosslinking and immunoprecipitation,PAR-CLIP),单核苷酸分离CLIP(individual nucleotide resolution CLIP,i CLIP),TRIBE(targets of RNA-binding protein identified by editing),RNA标记,相互作用组捕获(interactome capture,IC)和Ser IC(serial RNA interactome capture)等RBPs-RNAs相互作用鉴定技术的基本原理和优缺点以及应用进行综述。 展开更多
关键词 RNA结合蛋白 紫外交联免疫沉淀 CLIP cDNA文库高通量测序 光活化核苷增强的CLIP RNA结合蛋白免疫沉淀微阵列 TRIBE RNA标记 相互作用组捕获
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流感病毒两种反向遗传学操作系统的初步构建 被引量:2
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作者 连孟洋 王昕 +6 位作者 彭博 武伟华 刘慧 董方圆 丁小满 房师松 郑青 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期432-436,共5页
目的构建依赖辅助病毒和宿主细胞内合成病毒核糖核蛋白复合体(vRNPs)的反向遗传学系统,利用上述两系统表达绿色荧光蛋白(EGFP)。方法将EGFP cDNA精确插入人RNA聚合酶I启动子和小鼠终止子序列之间,构建RNA POLI系统,此系统被克隆入pBlues... 目的构建依赖辅助病毒和宿主细胞内合成病毒核糖核蛋白复合体(vRNPs)的反向遗传学系统,利用上述两系统表达绿色荧光蛋白(EGFP)。方法将EGFP cDNA精确插入人RNA聚合酶I启动子和小鼠终止子序列之间,构建RNA POLI系统,此系统被克隆入pBluescript II sk(+),获得重组质粒pBluescript II sk(+)-tI-EGFP-PIh;基于辅助病毒H1N1,pBluescript II sk(+)-tI-EGFP-PIh转染MDCK细胞,观察荧光。来源于甲型流感病毒H1N1分离株A/Puerto Rico/8/34的PB2、PB1、PA、NP 4个基因片段cDNA克隆入载体pcDNA3.1(+),获得pcDNA3.1-PB2、pcDNA3.1-PB1、pcDNA3.1-PA、pcDNA3.1-NP,将pBluescript II sk(+)-tI-EGFP-PIh与4个表达质粒共转染293T细胞,观察荧光。结果所构建的载体均经菌液PCR及测序验证正确;两种转染体系均可观察到绿色荧光。结论所构建的依赖辅助病毒和宿主细胞内合成vRNPs的反向遗传学系统均可使绿色荧光蛋白表达。 展开更多
关键词 RNA聚合酶I 反向遗传学 绿色荧光蛋白 转染
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肝细胞癌患者预后相关增强子RNA和对应靶基因的筛选及其预后预测意义 被引量:3
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作者 白易 吴昊 张雅敏 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期914-919,共6页
目的:筛选与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后相关的增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)及其对应的靶基因,并探究其调控作用及功能。方法:通过UCSC数据库下载HCC的转录本数据和临床病例数据,提取eRNA及其预测的相应靶基因表达矩阵... 目的:筛选与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后相关的增强子RNA(enhancer RNA,eRNA)及其对应的靶基因,并探究其调控作用及功能。方法:通过UCSC数据库下载HCC的转录本数据和临床病例数据,提取eRNA及其预测的相应靶基因表达矩阵,用Kaplan-Meier和Spearman相关性分析方法筛选HCC预后相关的eRNA和靶基因,并采用最小化绝对收缩和选择算子回归分析及多因素Cox多元回归分析构建HCC预后风险评分模型。设计合成针对筛选所获关键eRNA AP003469.2的小干扰RNA并转染肝癌SMMC-7721细胞,采用RT-PCR方法验证敲减效率,qPCR法检测AP003469.2靶基因YWHAZ的表达水平,CCK-8法检测转染后SMMC-7721细胞的增殖情况。结果:筛选获得4个与预后相关基因,包括两个eRNA(AP003469.2和SPRY4-AS1)和两个靶基因(PPARGC1A和SLC2A1)(P<0.05),其中PPARGC1A高表达提示预后较好,AP003469.2、SPRY4-AS1和SLC2A1基因高表达则提示预后较差。基于4个基因构建的预后风险评分模型,第1、3和5年的AUC分别为0.730、0.699和0.679,提示模型具备良好的预测效能。在敲减AP003469.2后,SMMC-7721细胞中YWHAZ的表达无明显改变,且对细胞的增殖无影响。结论:基于生物信息学分析共筛选出4个关键基因,其中eRNA AP003469.2是HCC预后预测效能较高的标志物,其无促癌功能且对YWHAZ基因无调控作用。 展开更多
关键词 肝细胞癌 SMMC-7721细胞 生物信息学 预后 增强子RNA 靶基因
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EZH2的小干扰RNA真核表达载体的构建及其在膀胱癌T24细胞系稳定表达的研究 被引量:1
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作者 王海峰 杨宏 +5 位作者 胡礼炳 雷永虹 秦扬 李俊 毕城伟 霍倩 《中国全科医学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第33期3927-3929,共3页
目的构建EZH2的小干扰RNA(siRNA2)真核表达载体质粒,获得稳定表达干扰质粒的膀胱癌细胞系,并探讨EZH2在膀胱癌中的作用。方法通过合成特异性沉默EZH2的siRNA2片段,获得pEGFP-C1-siEZH2表达载体;脂质体介导重组质粒转染T24细胞,经G418加... 目的构建EZH2的小干扰RNA(siRNA2)真核表达载体质粒,获得稳定表达干扰质粒的膀胱癌细胞系,并探讨EZH2在膀胱癌中的作用。方法通过合成特异性沉默EZH2的siRNA2片段,获得pEGFP-C1-siEZH2表达载体;脂质体介导重组质粒转染T24细胞,经G418加压筛选获得稳定转染细胞株,采用实时荧光定量PCR和免疫印迹法检测转染后细胞系T24 EZH2的表达。结果经测序证明重组载体构建成功,稳定转染siRNA2的T24细胞EZH2的mRNA和蛋白水平均较空白对照组下降(P<0.01)。结论成功构建EZH2的siRNA2真核表达载体,获得EZH2稳定沉默的T24细胞系,为进一步研究以EZH2为靶点的膀胱癌基因治疗奠定实验基础。 展开更多
关键词 EZH2 膀胱肿瘤 RNA干扰 真核载体构建
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棉铃虫激活增强子结合蛋白AP-4基因的原核表达、多克隆抗体制备、表达谱分析及功能鉴定 被引量:1
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作者 王婷婷 索倩 +4 位作者 孙晓燕 马跃敏 刘凯于 彭建新 彭蓉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1028-1037,共10页
【目的】激活增强子结合蛋白4(activating enhancer binding protein 4, AP-4)是近年来备受关注的一类功能广泛的转录因子,参与Wnt/β-catenin信号通路的调控。本研究旨在研究棉铃虫Helicoverpa armigera HaAP-4基因的原核表达并制备多... 【目的】激活增强子结合蛋白4(activating enhancer binding protein 4, AP-4)是近年来备受关注的一类功能广泛的转录因子,参与Wnt/β-catenin信号通路的调控。本研究旨在研究棉铃虫Helicoverpa armigera HaAP-4基因的原核表达并制备多克隆抗体,明确HaAP-4基因的时空表达谱,初步探究HaAP-4对棉铃虫胆固醇载体蛋白2(sterol carrier protein-2, SCP-2)基因(HaSCP-2)表达的调控作用。【方法】通过PCR扩增棉铃虫HaAP-4基因片段,将其克隆至pET-28a原核表达载体,转化至大肠杆菌Escherichia coli BL21,经IPTG诱导表达,采用镍柱纯化重组蛋白,免疫新西兰兔制备多克隆抗体。运用RT-qPCR检测HaAP-4基因在棉铃虫不同发育阶段(卵、幼虫、预蛹、蛹和成虫)以及5龄幼虫和预蛹不同组织(中肠、脂肪体、头和表皮)中的表达水平。设计并合成HaAP-4 siRNA,转染棉铃虫Ha细胞,通过RT-qPCR检测和分析使用HaAP-4 siRNA进行RNA干扰后Ha细胞中HaAP-4和HaSCP-2基因mRNA的表达情况。【结果】成功构建pET-28a-HaAP-4重组表达质粒,在大肠杆菌细胞中获得高效表达的可溶性蛋白,目的蛋白大小约为55 kD,经纯化获得了纯度较高的重组蛋白,免疫新西兰兔成功制备了多克隆抗体,通过Western blotting检测显示抗体具有较好的特异性,ELISA分析表明抗体效价较高。发育阶段特异性表达结果显示,HaAP-4基因在棉铃虫不同发育阶段均有表达,其中在卵期、5龄幼虫期和预蛹期的表达量较高。组织表达结果表明,HaAP-4基因在5龄幼虫和预蛹不同组织中均有表达,且在中肠和头部具有高表达,而在表皮和脂肪体中表达量较低。RNA干扰实验发现,HaAP-4基因的敲降对HaSCP-2基因转录有显著影响,HaSCP-2基因mRNA表达水平下降了约55%。【结论】利用pET-28a原核表达系统能有效地在体外表达可溶性的HaAP-4,并制备了较好的多克隆抗体。RNAi实验结果提示,在中肠内高表达的HaAP-4基因能促进HaSCP-2基因的转录表达,在棉铃虫脂质生理代谢过程中发挥作用。本研究为进一步深入阐明棉铃虫HaAP-4的潜在功能打下了基础。 展开更多
关键词 棉铃虫 激活增强子结合蛋白 原核表达 多克隆抗体 表达谱 RNA干扰
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