稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS标记的开发与验证(英文) 被引量：30

1

作者 王惠梅 陈洁 +3 位作者 施勇烽 潘刚 沈海超 吴建利 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1960-1968,共9页

为在水稻育种中快速与高效利用稻瘟病抗性基因Pi25,本文利用该基因不同等位基因编码区序列差异开发了4套CAPS标记(CAP1/HincII、CAP3/BglII、CAP3/NdeI和CAP3/Hpy99I),并利用169份稻种资源、98个重组自交系(RIL)以及217个水稻转基因后代... 为在水稻育种中快速与高效利用稻瘟病抗性基因Pi25,本文利用该基因不同等位基因编码区序列差异开发了4套CAPS标记(CAP1/HincII、CAP3/BglII、CAP3/NdeI和CAP3/Hpy99I),并利用169份稻种资源、98个重组自交系(RIL)以及217个水稻转基因后代,对4套标记的准确性和选择效果进行了验证。结果表明,4套标记均能准确地检测Pi25/pi25座位。其中,标记CAP1/HincII和CAP3/Hpy99I特异性识别并酶切显性等位基因,而标记CAP3/BglII和CAP3/NdeI特异性识别并酶切隐性等位基因。利用稻瘟病菌株JS001-20接种RIL与转基因材料,抗性表现与标记检测的结果完全一致,表明该CAPS标记准确可靠。分析稻种资源后发现,Pi25基因频率较低(1.2%),说明该基因在我国水稻稻瘟病抗性育种中还没有被充分利用。本文的研究结果特别是开发的2对识别并酶切显性等位基因的CAPS标记可用于分子标记辅助选择,改良我国早籼稻的稻瘟病抗性。 展开更多

关键词 水稻 稻瘟病抗性 酶切扩增多态性序列 标记辅助选择 单核苷酸多态性

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利用原位杂交及CAPS标记分析芸薹属A、B和C基因组间的关系 被引量：11

2

作者 孔芳 蒋金金 +1 位作者 吴磊 王幼平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1188-1192,共5页

以来源于Brassica rapa基因组(AA)的重复序列(151bp)为探针,分别同二倍体白菜型油菜(AA,2n=20)、甘蓝(CC,2n=18)和异源四倍体芥菜型油菜(AABB,2n=36)的中期染色体杂交,白菜型油菜和甘蓝的所有染色体上都有杂交信号,芥菜型油菜的染色体... 以来源于Brassica rapa基因组(AA)的重复序列(151bp)为探针,分别同二倍体白菜型油菜(AA,2n=20)、甘蓝(CC,2n=18)和异源四倍体芥菜型油菜(AABB,2n=36)的中期染色体杂交,白菜型油菜和甘蓝的所有染色体上都有杂交信号,芥菜型油菜的染色体上显示出20个明显的信号,其余染色体上信号很弱或无,可以区分出A和B基因组。对来源于油菜3个基本种与3个复合种FAE1基因进行CAPS分析表明,3个基本种表现出不同的酶切式样,用MboI和MspI酶切表现出多态性,基因组A和C非常相似,而基因组B与A、C关系较远,同时3个复合种也并不是2个基本种的简单相加,表明异源四倍体在长期进化过程中可能发生了重排和重组。 展开更多

关键词 芸薹属 荧光原位杂交 重复序列 caps标记 亲缘关系

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烟粉虱Q与B隐种mtCOI基因的遗传变异及其对利用CAPS标记进行隐种鉴别的影响 被引量：5

3

作者 刘国霞 高长生 +1 位作者 付海滨 褚栋 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1238-1244,共7页

【目的】为了评估Vsp I,Sty I和Stu I为基础的线粒体细胞色素氧化酶I基因(mt COI)酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)标记方法鉴别烟粉虱Q与B隐种的有效性。【方法】本研究对国内外烟粉虱种群的mt COI基... 【目的】为了评估Vsp I,Sty I和Stu I为基础的线粒体细胞色素氧化酶I基因(mt COI)酶切扩增多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)标记方法鉴别烟粉虱Q与B隐种的有效性。【方法】本研究对国内外烟粉虱种群的mt COI基因进行了测序并鉴定了其隐种;在对464个Q隐种、98个B隐种mt COI序列分析的基础上,利用Vsp I,Sty I和Stu I对Q与B隐种分别进行了CAPS标记验证。检索并比对了Gen Bank中烟粉虱Q与B隐种mt COI序列中Vsp I,Sty I和Stu I酶切位点分布情况。【结果】对国内外烟粉虱种群研究发现,以Vsp I为基础的CAPS标记方法能够有效鉴别实验中的Q与B隐种;利用Stu I或Sty I的CAPS标记方法无法有效鉴别Q与B隐种。对Gen Bank中烟粉虱Q与B隐种mt COI序列比对发现,利用Vsp I,Sty I和Stu I为基础的CAPS标记方法不能有效鉴别Q与B隐种。【结论】以Vsp I,Sty I和Stu I为基础的CAPS标记方法鉴别Q与B隐种方面均有一定的局限性。 展开更多

关键词 烟粉虱 隐种 mtCOI基因 酶切扩增多态性序列(caps) 隐种鉴定

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分群分析法获得与多花黑麦草抗叶班病基因连锁的EST-CAPS标记 被引量：6

4

作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾共如 三浦优一 《草地学报》 CAS CSCD 2006年第1期9-13,23,共6页

利用多花黑麦草叶斑病抗性和敏感个体杂交构建F 1分离群体,采用分群分析法(bu lked segregan t ana lys is,BSA),通过多花黑麦草表达序列标签(expressed sequence tag,EST)的PCR扩增和扩增产物的限制性内切酶酶切多态性(cleaved am p li... 利用多花黑麦草叶斑病抗性和敏感个体杂交构建F 1分离群体,采用分群分析法(bu lked segregan t ana lys is,BSA),通过多花黑麦草表达序列标签(expressed sequence tag,EST)的PCR扩增和扩增产物的限制性内切酶酶切多态性(cleaved am p lified po lym orph ic sequence,CAPS)筛选,获得一个同多花黑麦草草抗叶斑病紧密连锁的EST-CAPS标记p56。对照多花黑麦草细胞质雄性不育(CM S)群体构建的遗传连锁图,该EST-CAPS标记位于多花黑麦草的第5遗传连锁群(LG 5)。对cDNA文库中对应于标记位点p56的EST序列片段分析和基因库搜索结果表明,该EST所编码的氨基酸序列同大麦天冬酰胺合成酶基因H vAS 1和H vAS 2的部分氨基酸序列片段同源性很高,推测位点p56所处的基因为编码多花黑麦草天冬酰胺合成酶基因。该分子标记可用于多花黑麦草分子标记辅助育种。 展开更多

关键词 多花黑麦草 叶班病 分子标记 表达序列标签(EST) 酶切扩增片段多态性序列(caps)

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多花黑麦草抗病基因类似物的克隆及CAPS标记 被引量：4

5

作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾洪如 三浦優一 《草业学报》 CSCD 2006年第3期107-114,共8页

多花黑麦草具有适应性强、生物产量高和品质好等优点,为我国南方及其他温带地区重要的牧草。本研究利用目前已克隆出的抗病基因(R基因)所编码的蛋白质结构上所具有的共同氨基酸基序NBS-LRR设计寡核苷酸简并引物,对多花黑麦草基因组进行... 多花黑麦草具有适应性强、生物产量高和品质好等优点,为我国南方及其他温带地区重要的牧草。本研究利用目前已克隆出的抗病基因(R基因)所编码的蛋白质结构上所具有的共同氨基酸基序NBS-LRR设计寡核苷酸简并引物,对多花黑麦草基因组进行抗病基因类似物(RGA)克隆。从克隆中筛选出具代表性的RGA克隆115个,设计RGA-STS引物113对。利用细胞质雄性不育(CMS)F1群体对RGA-STS引物进行筛选,并采用限制性内切酶酶切扩增多态序列(CAPS)法进行抗病类似物的分子标记,共检测到22对RGA-STS引物的扩增产物具多态性,22个RGA-CAPS标记均被标记于多花黑麦草遗传连锁图中。结果还表明RGA在多花黑麦草遗传连锁图中分布范围较广,并具有簇状分布特性。 展开更多

关键词 多花黑麦草 抗病基因类似物 酶切扩增多态序列(caps) 遗传连锁图

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M342抗除草剂基因CAPS标记的开发与应用 被引量：6

6

作者 程丽 胡茂龙 +7 位作者 浦惠明 龙卫华 高建芹 陈锋 周晓婴 张维 陈松 张洁夫 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期241-247,共7页

M342是利用EMS诱变定向选育获得的甘蓝型油菜抗磺酰脲类除草剂新种质。通过M342抗性基因与敏感型油菜的ALS基因序列分析结果表明,M342的BnALS3基因存在1处SNP突变,导致编码的蛋白质第556位色氨酸突变为亮氨酸,该突变导致基因序列对BsrD ... M342是利用EMS诱变定向选育获得的甘蓝型油菜抗磺酰脲类除草剂新种质。通过M342抗性基因与敏感型油菜的ALS基因序列分析结果表明,M342的BnALS3基因存在1处SNP突变,导致编码的蛋白质第556位色氨酸突变为亮氨酸,该突变导致基因序列对BsrD I内切酶消化的差异。为此设计了8条引物,从中筛选到引物对SU54F/SU58R在不同油菜品种中可以特异性扩增出目的片段,该片段经BsrD I酶切分型正确,从而开发了检测M342中抗性基因BnALS3R的CAPS标记。运用该标记对除草剂敏感型油菜、纯合抗性油菜及杂合抗性油菜BnALS3的基因型进行验证,并应用该标记对F_2、BC_1分离群体进行检测。结果表明,该标记验证的基因型结果与测序结果一致。F_2分离群体有Als3Als3、Als3als3、als3als3 3种基因型,BC_1分离群体有Als3als3、als3als3 2种基因型,与表型鉴定结果一致,遵循单基因遗传分离规律,表明该标记可以应用于抗性基因的检测。CAPS标记的获得为抗除草剂油菜的分子标记辅助选择育种奠定了基础。 展开更多

关键词 油菜 磺酰脲类除草剂 乙酰乳酸合酶 酶切扩增多态性序列(caps)标记

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与抗TYLCV基因连锁的AFLP标记筛选及CAPS标记的转化 被引量：3

7

作者 侯富恩 杨玛丽 +3 位作者 赵统敏 余文贵 沈新莲 赵丽萍 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第5期1047-1052,共6页

为加快番茄黄化曲叶病抗病品种培育进程,阻止该病蔓延,以抗病亲本CLN2777A和感病亲本TMXA48-4-0及其F2分离群体为材料,应用分子标记辅助选择技术进行抗TYLCV(番茄黄化曲叶病毒)基因连锁标记的筛选。通过对亲本及F2分离群体进行TYLCV接种... 为加快番茄黄化曲叶病抗病品种培育进程,阻止该病蔓延,以抗病亲本CLN2777A和感病亲本TMXA48-4-0及其F2分离群体为材料,应用分子标记辅助选择技术进行抗TYLCV(番茄黄化曲叶病毒)基因连锁标记的筛选。通过对亲本及F2分离群体进行TYLCV接种,发现F2代抗感病分离比率接近3∶1,抗性受单个显性基因控制。用512对MseⅠ/PstⅠ引物组合对亲本及F2代抗感基因池进行AFLP分析,最终引物组合P15M28在亲本及抗感组间表现多态性,回收并克隆测序,片段大小为106 bp,重新设计引物,将其成功转化为CAPS(酶切扩增多态性序列)标记,命名为P15M28,遗传距离为6.7 cM。P15M28标记可以应用于标记辅助选择育种。 展开更多

关键词 番茄黄化曲叶病毒 AFLP caps 分子标记

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通过分子标记辅助选择培育优良食味水稻新品种 被引量：45

8

作者 王才林 陈涛 +3 位作者 张亚东 朱镇 赵凌 林静 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期25-30,共6页

为了培育食味品质优良、综合丰产性好的粳稻新品种,以高产粳稻品种武香粳14作母本,具有暗胚乳突变基因的优质粳稻品种关东194作父本配制杂交组合。利用与暗胚乳突变基因Wx-mq直接相关的单核苷酸差异,设计合成了CAPS标记,该标记能区分含... 为了培育食味品质优良、综合丰产性好的粳稻新品种,以高产粳稻品种武香粳14作母本,具有暗胚乳突变基因的优质粳稻品种关东194作父本配制杂交组合。利用与暗胚乳突变基因Wx-mq直接相关的单核苷酸差异,设计合成了CAPS标记,该标记能区分含或不含Wx-mq基因的纯合基因型和杂合基因型。利用该标记对武香粳14/关东194衍生的F5、F6株系进行辅助选择,筛选到含Wx-mq基因的纯合基因型,成熟后对胚乳淀粉性质的调查结果与分子检测结果完全一致,分子标记辅助选择效果达100%。最终将关东194的暗胚乳突变基因Wx-mq与高产基因聚合于一体,育成含有暗胚乳突变基因Wx-mq的优良食味粳稻新品种南粳46。 展开更多

关键词 分子标记辅助选择 食味品质 水稻 酶切扩增多态性序列 育种

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水稻Wx基因的遗传多态性及其与主要米质指标的相关性分析 被引量：23

9

作者 万映秀 邓其明 +3 位作者 王世全 刘明伟 周华强 李平 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期603-609,共7页

利用RM190和484/W2R-ACCⅠ标记分析了50个水稻非糯品种的Wx基因的等位性变异。其中,RM190揭示出7种(CT)n纯合变异类型和1种杂合类型,分别为(CT)20、(CT)19、(CT)18、(CT)17、(CT)14、(CT)11、(CT)10和(CT)11/(CT)18,并以(CT)11和(CT)18... 利用RM190和484/W2R-ACCⅠ标记分析了50个水稻非糯品种的Wx基因的等位性变异。其中,RM190揭示出7种(CT)n纯合变异类型和1种杂合类型,分别为(CT)20、(CT)19、(CT)18、(CT)17、(CT)14、(CT)11、(CT)10和(CT)11/(CT)18,并以(CT)11和(CT)18两种类型为主;484/W2R-ACCⅠ共揭示出2种纯合类型和1种杂合类型,分别为G/G型、T/T型及G/T型;(CT)11大多为G/G型,(CT)18大多为T/T型,这两个标记可将供试材料划分为10种等位基因变异类型。进一步分析表明,RM190揭示的Wx基因多态性可以解释直链淀粉含量变异的59.3%;484/W2R-ACCⅠ揭示的Wx基因多态性可以分别解释直链淀粉含量及胶稠度变异的56.1%和24.6%;而两标记共同可解释直链淀粉含量变异的72.4%。还对这两个标记在育种实践中的应用前景进行了探讨。 展开更多

关键词 蜡质基因 微卫星标记 酶切扩增多态性序列标记 糊化温度 胶稠度 直链淀粉含量 水稻 多态性

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不同性别类型黄瓜ACC合酶基因的单核苷酸多态性标记和酶切扩增长度多态性标记 被引量：14

10

作者 向太和 王利琳 +3 位作者 庞基良 胡江琴 申屠连峰 吴锴 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第4期362-367,共6页

黄瓜的性别分化与乙烯密切相关,1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶是乙烯生物合成过程中的关键酶.根据ACC合酶基因家族的保守序列设计PCR引物,从8个不同性别类型(雌雄同株、强雌性和全雌性)黄瓜品种中克隆了长度为1188bp的ACC合酶基因(CS-AC... 黄瓜的性别分化与乙烯密切相关,1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶是乙烯生物合成过程中的关键酶.根据ACC合酶基因家族的保守序列设计PCR引物,从8个不同性别类型(雌雄同株、强雌性和全雌性)黄瓜品种中克隆了长度为1188bp的ACC合酶基因(CS-ACS2)片段(GenBank登记号为:DQ115884～DQ115886和DQ115875～DQ115879).经测序分析,3个雌雄同株性别类型品种的序列完全相同.与之相比,5个强雌性和全雌性品种中存在8个单核苷酸多态性(SNPs)标记,SNPs标记为4个A←→G和4个T←→C之间的转换.在8个SNPs中,有1个SNP位于内含子区域,其余7个SNPs都位于外显子区域.在7个位于外显子区域的SNPs中,有3个为非编码区的SNPs,4个为cSNPs.而在4个cSNPs中,有3个导致了编码的氨基酸序列改变.研究结果表明,与雌雄同株性别类型相比,雌性系中均存在单核苷酸的变异,这提示ACC合酶基因CS-ACS2的单核苷酸变异可能与黄瓜雌性系的发生形成有关.另一方面,根据SNP多态性还发展了一个酶切扩增长度多态性(CAPS)标记C-MT700.利用CAPS标记C-MT700能将强雌性优良品种MT-705与其他黄瓜品种相区别,该标记在黄瓜育种生产上具有一定的应用价值.此外,研究获得的SNPs标记和CAPS标记丰富了黄瓜的分子标记种类. 展开更多

关键词 黄瓜 性别类型 1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)合酶基因 单核苷酸多态性(SNP) 酶切扩增长度多态性(caps)

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番茄品种Mi基因对根结线虫抗性的检测 被引量：10

11

作者 韩娜 卓侃 +2 位作者 王彬 林柏荣 廖金铃 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期19-23,共5页

采用酶切扩增多态性序列（Cleaved amplified polymorphic sequences,CAPS）方法对国内市场上的26个番茄So-lanum lycopersicum品种进行Mi基因检测.结果表明,特璐丝、红丽、TRS-401、仙客1号和仙客5号5个品种含有纯合体Mi基因,其余品种... 采用酶切扩增多态性序列（Cleaved amplified polymorphic sequences,CAPS）方法对国内市场上的26个番茄So-lanum lycopersicum品种进行Mi基因检测.结果表明,特璐丝、红丽、TRS-401、仙客1号和仙客5号5个品种含有纯合体Mi基因,其余品种均不含Mi基因.进一步用南方根结线虫Meloidogyne incognita和象耳豆根结线虫M.enter-olobii对这26个品种进行接种试验,计算根结率和根结指数.结果发现,南方根结线虫和象耳豆根结线虫侵染不含Mi基因的21个番茄品种的根结率为100%,根结指数为100;而含Mi基因的5个番茄品种对南方根结线虫的根结率为1%~5%,根结指数为0~4,而对象耳豆根结线虫的根结率为26.7%~45.6%,根结指数为56~64.表明含Mi基因的番茄高抗南方根结线虫,但对象耳豆根结线虫感病或比较感病. 展开更多

关键词 番茄 Mi基因 酶切扩增多态性序列 根结线虫

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中国舞毒蛾六个地理种群的RAPD分析及SCAR标记构建 被引量：11

12

作者 张浩 陈乃中 李正西 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期714-721,共8页

舞毒蛾Lymantria disparL.是世界性农林害虫,包含不同的亚种,其中亚洲舞毒蛾的雌蛾具有较强的飞行能力,已成为国际性的重要检疫性有害生物。然而,不同舞毒蛾亚种及种群间形态难辨,因此采用传统的手段鉴别舞毒蛾亚种种群是很困难的。本... 舞毒蛾Lymantria disparL.是世界性农林害虫,包含不同的亚种,其中亚洲舞毒蛾的雌蛾具有较强的飞行能力,已成为国际性的重要检疫性有害生物。然而,不同舞毒蛾亚种及种群间形态难辨,因此采用传统的手段鉴别舞毒蛾亚种种群是很困难的。本研究首先采用RAPD标记分析了中国舞毒蛾6个地理种群的遗传多态性。结果表明,所检测的舞毒蛾种群的遗传分化系数Gst为0.7571,由此推算出的平均有效迁移数(基因流参数)Nem为0.1604,说明不同舞毒蛾种群间的遗传分化程度较高,缺乏广泛的基因流动。本研究在RAPD遗传分析基础之上,筛选出了4个舞毒蛾种群的特异性遗传位点,然后对这些特异性位点进行了克隆测序、序列分析和位点特异性引物设计。结果表明,其中2个舞毒蛾种群的位点特异性引物可产生序列特征性扩增区域(SCAR)标记。经验证,这些标记可被用来鉴别特定的舞毒蛾地理种群,因此有助于对这些舞毒蛾地理种群的分布与扩散进行监测。 展开更多

关键词 舞毒蛾 地理种群 RAPD标记 SCAR标记

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胚挽救和分子标记辅助筛选获得番茄抗根结线虫杂种 被引量：8

13

作者 周国治 叶青静 +2 位作者 王荣青 阮美颖 杨悦俭 《浙江大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期255-261,共7页

为获得番茄抗根结线虫杂种,以含有温度敏感型抗根结线虫Mi-1基因的高代优良自交系栽培番茄(Lycopersicon esculentum)5678161"为母本,与含有非温度敏感型抗根结线虫Mi-3基因的秘鲁番茄(Lycopersicon peruvianum)LA2823"为父... 为获得番茄抗根结线虫杂种,以含有温度敏感型抗根结线虫Mi-1基因的高代优良自交系栽培番茄(Lycopersicon esculentum)5678161"为母本,与含有非温度敏感型抗根结线虫Mi-3基因的秘鲁番茄(Lycopersicon peruvianum)LA2823"为父本进行杂交,通过胚挽救技术获得10个胚挽救苗株系;应用序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术对胚挽救苗进行亲子鉴定,证实杂种的真实性;利用Mi-1和Mi-3基因的特异引物对杂种植株进行分子检测,从杂种中检测出拥有Mi-1基因标记的后代10株,同时拥有Mi-1和Mi-3基因标记的后代1株. 展开更多

关键词 番茄 抗根结线虫 胚挽救 序列相关扩增多态性(SRAP) 分子标记辅助选择

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大豆耐盐相关基因GmNcl1功能标记的开发及验证 被引量：5

14

作者 宁丽华 何晓兰 张大勇 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期1227-1234,共8页

土壤盐渍化严重影响大豆生产,因而鉴定大豆耐盐种质的分子标记对大豆耐盐新品种的培育具有重要意义。本研究分析了大豆耐盐相关基因Gm Ncl1等位变异位点的限制性酶切位点,通过酶切PCR产物,琼脂糖凝胶电泳和酶切片段分析,开发建立了分子... 土壤盐渍化严重影响大豆生产,因而鉴定大豆耐盐种质的分子标记对大豆耐盐新品种的培育具有重要意义。本研究分析了大豆耐盐相关基因Gm Ncl1等位变异位点的限制性酶切位点,通过酶切PCR产物,琼脂糖凝胶电泳和酶切片段分析,开发建立了分子标记CAPS/Xba I。利用该标记对10份不同耐盐大豆种质进行酶切分型鉴定,然后通过测序试验进行验证。结果表明,用所开发的共显性标记CAPS/Xba I对10份大豆种质进行耐盐性鉴定,鉴定结果与依据表型进行鉴定的结果一致。由此可见,CAPS/Xba I可用于大豆品种的耐盐性鉴定。 展开更多

关键词 大豆 耐盐性 GmNcl1 酶切扩增多态性序列(caps)标记

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同源四倍体和二倍体水稻Wx基因与淀粉品质的遗传关系 被引量：3

15

作者 刘玉花 栾丽 +4 位作者 龙文波 王兴 孔繁伦 何涛 涂升斌 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期143-149,共7页

用Wx基因的(CT)n微卫星标记和切割的扩增产物多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)分子标记PCR-AccⅠ对40份同源四倍体和14份二倍体水稻Wx基因型进行研究。利用484/485引物检测,Wx基因呈Wx1、Wx2和Wx33种多态性;而... 用Wx基因的(CT)n微卫星标记和切割的扩增产物多态性序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS)分子标记PCR-AccⅠ对40份同源四倍体和14份二倍体水稻Wx基因型进行研究。利用484/485引物检测,Wx基因呈Wx1、Wx2和Wx33种多态性;而用PCR-AccⅠ检测,Wx基因表现为G-型和T-型。同时,在测定稻米直链淀粉含量(AC)、胶稠度(GC)和糊化温度(GT)的基础上探讨它们与Wx基因的关系,结果表明AC、GC与Wx基因密切相关,GT与Wx基因相关不显著。综合分析表明,同源四倍体水稻中,92.0%的Wx1基因型材料为G-型,而Wx2基因型村料和80.0%的Wx3基因型材料为T-型。统计分析表明,Wx基因(CT)n微卫星标记检测与PCR-AccⅠ分子标记检测的相关系数为0.842,呈极显著正相关。 展开更多

关键词 同源四倍体 水稻 蜡质基因 直链淀粉含量 胶稠度 糊化温度 遗传关系 微卫星标记 切割的扩增产物多态性序列

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甘薯蔓割病抗性相关SRAP标记的获得 被引量：4

16

作者 刘中华 林志坚 +5 位作者 李华伟 邱永祥 邱思鑫 张鸿 余华 蓝春准 《福建农业学报》 CAS 北大核心 2017年第6期639-644,共6页

以高抗甘薯蔓割病品种金山57和高感蔓割病甘薯品种新种花为亲本进行杂交,获得F1分离群体,对F1群体进行蔓割病抗性鉴定,从中选出7个高抗和7个高感蔓割病株系构建抗、感池。以抗、感池基因组DNA为模板,用276对SRAP引物组合对其扩增,从中... 以高抗甘薯蔓割病品种金山57和高感蔓割病甘薯品种新种花为亲本进行杂交,获得F1分离群体,对F1群体进行蔓割病抗性鉴定,从中选出7个高抗和7个高感蔓割病株系构建抗、感池。以抗、感池基因组DNA为模板,用276对SRAP引物组合对其扩增,从中筛选出98对具有多态性的引物组合,再以抗感亲本加抗感池基因组DNA为模板筛选,从98份SRAP引物组合中筛选出33对多态性较好的引物组合。后通过用一组小群体(6个高抗株系和6个高感株系)进一步筛选,最终获得一对与甘薯抗蔓割病连锁的SRAP引物组合a12b8,经过抗感亲本及F1代的进一步验证,认为该标记与甘薯抗蔓割病基因相关。 展开更多

关键词 甘薯 蔓割病 SRAP标记 分子标记

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多花黑麦草遗传连锁图的构建 被引量：6

17

作者 丁成龙 沈益新 +1 位作者 顾洪如 三浦优一 《草地学报》 CAS CSCD 2006年第3期223-230,共8页

利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并... 利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135 cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14 cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0 cM,相邻标记之间的平均距离为1.89 cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。 展开更多

关键词 多花黑麦草(Lolium multiflorum) 遗传连锁图 SSR(简单重复序列) AFLP(扩增片段长度多态性)

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丹参SRAP反应体系的建立与优化 被引量：12

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作者 李廷春 高正良 汤志顺 《生物学杂志》 CAS CSCD 2008年第1期40-44,共5页

相关序列扩增多态性(SRAP)是一种新发展起来的分子标记技术。实验以丹参总DNA为模板,对SRAP-PCR反应体系的重要参数设置梯度实验,筛选最佳的SRAP-PCR反应条件。经过大量重复性实验,建立了一套适用于丹参稳定可靠、重复性好、带型清晰的S... 相关序列扩增多态性(SRAP)是一种新发展起来的分子标记技术。实验以丹参总DNA为模板,对SRAP-PCR反应体系的重要参数设置梯度实验,筛选最佳的SRAP-PCR反应条件。经过大量重复性实验,建立了一套适用于丹参稳定可靠、重复性好、带型清晰的SRAP-PCR反应体系:25μL的反应体系中,模板DNA量40ng、2.5mmol/L Mg2+浓度、0.8μmol/L的上下游引物、200μmol/L的dNTPs以及Taq酶1U。研究结果表明,该体系可应用于丹参植物种质的分类鉴别,并为其地道性及功能基因的研究奠定基础。 展开更多

关键词 丹参 相关序列扩增多态性 分子标记

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新型分子标记SRAP的原理及其研究进展 被引量：20

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作者 杨迎花 李先信 +1 位作者 曾柏全 邓子牛 《湖南农业科学》 2009年第5期15-17,20,共4页

阐述了SRAP的原理和流程,详细论述了SRAP标记在动植物种质资源鉴定评价、遗传图谱构建、重要性状标记以及比较基因组学方面的研究进展及应用前景。认为在遗传多样性的研究中,SRAP比AFLP更能反映表型的多样性及进化历史,SRAP标记将会在... 阐述了SRAP的原理和流程,详细论述了SRAP标记在动植物种质资源鉴定评价、遗传图谱构建、重要性状标记以及比较基因组学方面的研究进展及应用前景。认为在遗传多样性的研究中,SRAP比AFLP更能反映表型的多样性及进化历史,SRAP标记将会在生命科学领域中发挥更大的作用。 展开更多

关键词 SRAP 分子标记 研究进展

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cDNA-SRAP技术在植物基因表达差异分析中的应用 被引量：2

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作者 刘洋 高宝嘉 +1 位作者 张斌 陈明叶 《河北林果研究》 2016年第2期146-150,共5页

相关序列扩增多态性(SRAP)是基于PCR的新型分子标记系统。文章综述了现今植物基因表达差异分析中的常用方法,并简单介绍了cDNA-SRAP技术的原理、方法、步骤、优点,及其研究现状和前景。该方法具有简单便捷、结果稳定、重复性好、试验成... 相关序列扩增多态性(SRAP)是基于PCR的新型分子标记系统。文章综述了现今植物基因表达差异分析中的常用方法,并简单介绍了cDNA-SRAP技术的原理、方法、步骤、优点,及其研究现状和前景。该方法具有简单便捷、结果稳定、重复性好、试验成本低的优点,将会成为基因表达研究的有力工具。随着分子标记技术的发展和新技术的出现,不同分子标记和技术的相互结合使用将会在发现新基因、比较植物不同生长发育时期的基因表达、构建植物转录图谱和植物抗逆分子机制研究等方面发挥重要作用。 展开更多

关键词 相关序列扩增多态性 分子标记 cDNA-SRAP 植物 基因表达差异

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