目的基于生物信息学与实验研究探讨卷曲相关蛋白(Frizzled-related protein 1 FRZB)参与调控Wnt信号通路对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)预后的影响。方法(1)通过(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取HCC的RNA-Seq数据...目的基于生物信息学与实验研究探讨卷曲相关蛋白(Frizzled-related protein 1 FRZB)参与调控Wnt信号通路对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)预后的影响。方法(1)通过(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取HCC的RNA-Seq数据和临床资料,运用R软件分析FRZB mRNA在泛癌和肝癌中的表达差异。(2)选取石河子大学第一附属医院肝癌和正常肝脏石蜡包埋组织样本,通过免疫组化分析FRZB蛋白在两组间的表达差异。(3)分析FRZB与HCC临床特征的相关性,通过Kaplan-Meier生存分析评估FRZB的表达量与肝癌患者的预后关系。(4)基于TCGA数据库和(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库获取Wnt通路相关基因,使用LASSO-Cox回归法构建肝癌预后模型并验证模型的预测效能,同时利用HCCDB数据库进行外部独立验证。(5)探讨FRZB与预后模型中基因的相关性。结果TCGA数据库分析发现,FRZB mRNA在HCC组织中显著高表达,差异具有统计学意义(P<0.001);免疫组化显示其蛋白表达在HCC组织中同样显著上调;临床特征分析表明,FRZB与HCC患者的TN M分期、病理分级以及Child-pugh分级显著相关,FRZB高表达的HCC患者总生存期更长;通过LASSO-Cox回归得到并构建7个预后相关基因(CACYBP、FRAT2、PLCB3、RAC1、RAC3、RUVBL1、BL1XR1L)的风险预测模型,K-M生存分析表明高风险组患者的总生存期明显低于低风险组(P<0.05),ROC曲线显示该模型具有良好的预测能力;通过Spearman分析揭示FRZB与RAC3、CACYBP、RUVBL1负相关(P<0.05),与PLCB3正相关(P<0.05)。结论FRZB可能通过调控Wnt信号通路相关基因对HCC预后产生影响,可能可以作为检测HCC患者预后的潜在生物标志物,为改善HCC的预后提供新的理论依据。展开更多
目的:探讨Wnt/PCP信号通路与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)共同调控钙调蛋白2(calponin 2,CNN2)在促进肝癌细胞群体性迁移中的作用及其分子机制。方法:结合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)与人类蛋白图谱(Human P...目的:探讨Wnt/PCP信号通路与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)共同调控钙调蛋白2(calponin 2,CNN2)在促进肝癌细胞群体性迁移中的作用及其分子机制。方法:结合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)与人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)分析CNN2在不同组织中的表达特征,并通过组织芯片评估其在肝癌中的表达水平及预后相关性;采用迁移与划痕实验探讨CNN2对肝癌细胞迁移能力的影响,进一步通过shRNA慢病毒降低Wnt11及CNN2表达,研究Wnt/PCP信号通路对CNN2的调控作用及其分子机制;最后以硬质培养基模拟ECM环境,探讨其与CNN2表达及细胞迁移能力之间的关联。结果:CNN2在肝癌组织中高表达,富集于肿瘤边缘区域,提示其可能在肿瘤细胞迁移早期阶段发挥关键作用。功能实验进一步证实,CNN2显著促进肝癌细胞的群体性迁移,其高表达水平与患者不良预后显著相关。在机制层面,CNN2受Wnt/PCP信号通路调控,且在模拟ECM力学环境下表达显著上调,提示其在肿瘤细胞感知和响应力学信号过程中具有重要功能。结论:Wnt/PCP信号通路调控CNN2的表达与功能,同时CNN2作为力学信号介导因子受ECM力学信号调控,二者协同驱动肝癌细胞的群体性迁移。展开更多
文摘目的基于生物信息学与实验研究探讨卷曲相关蛋白(Frizzled-related protein 1 FRZB)参与调控Wnt信号通路对肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)预后的影响。方法(1)通过(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获取HCC的RNA-Seq数据和临床资料,运用R软件分析FRZB mRNA在泛癌和肝癌中的表达差异。(2)选取石河子大学第一附属医院肝癌和正常肝脏石蜡包埋组织样本,通过免疫组化分析FRZB蛋白在两组间的表达差异。(3)分析FRZB与HCC临床特征的相关性,通过Kaplan-Meier生存分析评估FRZB的表达量与肝癌患者的预后关系。(4)基于TCGA数据库和(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库获取Wnt通路相关基因,使用LASSO-Cox回归法构建肝癌预后模型并验证模型的预测效能,同时利用HCCDB数据库进行外部独立验证。(5)探讨FRZB与预后模型中基因的相关性。结果TCGA数据库分析发现,FRZB mRNA在HCC组织中显著高表达,差异具有统计学意义(P<0.001);免疫组化显示其蛋白表达在HCC组织中同样显著上调;临床特征分析表明,FRZB与HCC患者的TN M分期、病理分级以及Child-pugh分级显著相关,FRZB高表达的HCC患者总生存期更长;通过LASSO-Cox回归得到并构建7个预后相关基因(CACYBP、FRAT2、PLCB3、RAC1、RAC3、RUVBL1、BL1XR1L)的风险预测模型,K-M生存分析表明高风险组患者的总生存期明显低于低风险组(P<0.05),ROC曲线显示该模型具有良好的预测能力;通过Spearman分析揭示FRZB与RAC3、CACYBP、RUVBL1负相关(P<0.05),与PLCB3正相关(P<0.05)。结论FRZB可能通过调控Wnt信号通路相关基因对HCC预后产生影响,可能可以作为检测HCC患者预后的潜在生物标志物,为改善HCC的预后提供新的理论依据。
文摘目的:探讨Wnt/PCP信号通路与细胞外基质(extracellular matrix,ECM)共同调控钙调蛋白2(calponin 2,CNN2)在促进肝癌细胞群体性迁移中的作用及其分子机制。方法:结合癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)与人类蛋白图谱(Human Protein Atlas,HPA)分析CNN2在不同组织中的表达特征,并通过组织芯片评估其在肝癌中的表达水平及预后相关性;采用迁移与划痕实验探讨CNN2对肝癌细胞迁移能力的影响,进一步通过shRNA慢病毒降低Wnt11及CNN2表达,研究Wnt/PCP信号通路对CNN2的调控作用及其分子机制;最后以硬质培养基模拟ECM环境,探讨其与CNN2表达及细胞迁移能力之间的关联。结果:CNN2在肝癌组织中高表达,富集于肿瘤边缘区域,提示其可能在肿瘤细胞迁移早期阶段发挥关键作用。功能实验进一步证实,CNN2显著促进肝癌细胞的群体性迁移,其高表达水平与患者不良预后显著相关。在机制层面,CNN2受Wnt/PCP信号通路调控,且在模拟ECM力学环境下表达显著上调,提示其在肿瘤细胞感知和响应力学信号过程中具有重要功能。结论:Wnt/PCP信号通路调控CNN2的表达与功能,同时CNN2作为力学信号介导因子受ECM力学信号调控,二者协同驱动肝癌细胞的群体性迁移。
