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UHPLC-Qtrap-MS/MS法研究灯盏细辛成分在血管性痴呆模型大鼠的药代动力学及网络药理学
1
作者 高雪萌 程硕涵 +4 位作者 章宸 张晓东 李梦宇 周文斌 再帕尔·阿不力孜 《质谱学报》 北大核心 2025年第5期602-614,I0004,共14页
采用超高效液相色谱-串联四极杆-线性离子阱质谱(UHPLC-Qtrap-MS/MS)技术对芹菜素、野黄芩苷、丁香酸、水杨酸、芹菜素-7-O-葡萄糖醛酸苷、东莨菪亭等6种灯盏细辛入血成分在血管性痴呆(VaD)模型大鼠血浆中的含量变化进行定量分析,并进... 采用超高效液相色谱-串联四极杆-线性离子阱质谱(UHPLC-Qtrap-MS/MS)技术对芹菜素、野黄芩苷、丁香酸、水杨酸、芹菜素-7-O-葡萄糖醛酸苷、东莨菪亭等6种灯盏细辛入血成分在血管性痴呆(VaD)模型大鼠血浆中的含量变化进行定量分析,并进行药代动力学参数计算。以0.05%甲酸-水和乙腈为流动相,在ACQUITY UPLC HSS T3色谱柱(100 mm×2.1 mm,1.8μm)上梯度洗脱;采用多反应监测(MRM)模式,电喷雾离子源(ESI)进行质谱检测;随后使用DAS2.0软件进行药代动力学参数计算。结合入血成分分析结果,采用网络药理学方法构建入血成分-疾病靶点-代谢通路网络,推测潜在作用靶.点。结果表明,在VaD模型组中,丁香酸、野黄芩苷、东莨菪亭、水杨酸的体内暴露量均低于假手术组,可能存在代谢加快或排泄增加的现象;而野黄芩苷、水杨酸、芹菜素-7-O-葡萄糖醛酸苷在大鼠体内存在双峰吸收,可能存在肝肠循环现象;在所有入血成分中,野黄芩苷的体内暴露量最高。网络药理学研究发现,灯盏细辛主要入血成分共作用于12个疾病靶点,与5条信号通路有关;其中,药效成分野黄芩苷主要通过作用于丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路对VaD产生干预作用。本研究可为灯盏细辛的药代动力学研究提供支持,同时对深入理解其作用机制提供参考。 展开更多
关键词 超高效液相色谱-串联四极杆-线性离子阱质谱(UHPLC-Qtrap-MS/MS) 灯盏细辛 入血成分 药代动力学 网络药理学
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大型Petri网模型最小trap(siphon)集合的快速求解算法 被引量：1
2
作者 廖晶静 王明哲 +1 位作者 倪枫 郭法滨 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2010年第8期1766-1770,共5页
为了快速确定大型Petri网模型中的trap(siphon)逻辑结构,提出一种由Petri网关联矩阵寻找最小trap和siphon集合的有效算法。通过分析Petri网中trap和siphon集合对应的库所子集在关联矩阵中的特征,根据变迁的输入输出库所组合规则和目的,... 为了快速确定大型Petri网模型中的trap(siphon)逻辑结构,提出一种由Petri网关联矩阵寻找最小trap和siphon集合的有效算法。通过分析Petri网中trap和siphon集合对应的库所子集在关联矩阵中的特征,根据变迁的输入输出库所组合规则和目的,提出一种二元操作算子,由此构造计算最小trap和siphon集合的矩阵求解算法,以实例详细阐述了算法的具体步骤。通过与已有求解方法的比较,进一步验证了该算法在求解大型Petri网系统最小trap(siphon)集合上的计算速度优势。 展开更多
关键词 PETRI网 最小trap和siphon 关联矩阵 trap组合
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scFv-DEC205-Trap重组包涵体靶向抗原复性及过程的优化 被引量：1
3
作者 佟春玉 张喆林 +4 位作者 王森 郑小会 韩玉芳 崔玉东 宋博翠 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第15期1866-1871,共6页
目的:疫苗防治将成为金黄色葡萄球菌防控的主要方式,如何解决靶向亚单位疫苗生产中包涵体靶向抗原的复性问题,将是蛋白亚单位疫苗生产的核心问题。方法:构建靶向树突状细胞DEC205受体的金黄色葡萄球菌重组scFv-DEC205-Trap质粒进行PCR... 目的:疫苗防治将成为金黄色葡萄球菌防控的主要方式,如何解决靶向亚单位疫苗生产中包涵体靶向抗原的复性问题,将是蛋白亚单位疫苗生产的核心问题。方法:构建靶向树突状细胞DEC205受体的金黄色葡萄球菌重组scFv-DEC205-Trap质粒进行PCR、测序鉴定,IPTG诱导表达。对表达后形成的包涵体各项溶解条件:溶液、溶解温度、溶解时间以及是否振荡进行单因素优化;对复性缓冲液的不同添加剂和稀释浓度进行条件优化,最大限度提高包涵体蛋白复性率,Western blot检测复性蛋白抗原性。结果:离心力大于400 g,离心3 min以上,96%的包涵体蛋白沉降;含8 mol/L的尿素溶液在4~40℃溶解0.5 h以上可使包涵体蛋白充分溶解;3 mol/L精氨酸的100 mmol/L Tris-HCl缓冲液稀释5倍复性率最高,抗原性好。结论:实验证明通过适宜的溶解条件和复性条件可以从表达包涵体中获得良好抗原性的重组靶向抗原。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌trap scFv-DEC205-trap重组抗原 变性 复性
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新型分子标记——SRAP与TRAP及其应用 被引量：166
4
作者 柳李旺 龚义勤 +1 位作者 黄浩 朱献文 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期777-781,共5页
SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简单、高效、高共显性、重复性、易测序等优点,尤其是可检测基因的可译框(ORFs)区域。本文对分别在芸薹属作物与向日葵中开发的SRAP、TRAP标记系统的基本原理与分析程序进行介绍。引物设计... SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简单、高效、高共显性、重复性、易测序等优点,尤其是可检测基因的可译框(ORFs)区域。本文对分别在芸薹属作物与向日葵中开发的SRAP、TRAP标记系统的基本原理与分析程序进行介绍。引物设计是SRAP与TRAP分析的关键,目前已开发出多个SRAP正、反向引物;与SRAP标记技术无须任何序列信息不同,TRAP技术需要基于已知cDNA或EST序列信息设计固定引物才可进行PCR扩增;二者PCR条件采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30～35个循环为50℃;扩增产物可在聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶上电泳,同位素或银染、EB检测。目前这两种标记系统已开始在多种作物的种质资源鉴定评价、遗传图谱构建(包括转录图谱)、重要性状标记乃至基因分离克隆等方面成功应用。 展开更多
关键词 SRAP trap 分子标记
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SRAP与TRAP标记及其在园艺植物研究中的应用 被引量：35
5
作者 李莉 彭建营 +1 位作者 白瑞霞 韩斌 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期1749-1752,共4页
SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简便、高效、重复性好等优点,已在园艺植物遗传育种和种质资源研究的各个方面得到广泛应用.本文介绍了SRAP和TRAP标记的原理、特点,综述了这两种新型分子标记在园艺植物遗传图谱构建、遗传... SRAP与TRAP是最近发展的新型分子标记系统,具有简便、高效、重复性好等优点,已在园艺植物遗传育种和种质资源研究的各个方面得到广泛应用.本文介绍了SRAP和TRAP标记的原理、特点,综述了这两种新型分子标记在园艺植物遗传图谱构建、遗传多样性分析以及比较基因组学研究等方面的应用,并对其应用前景进行了展望. 展开更多
关键词 SRAP trap 园艺植物 应用
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棉花种质资源遗传多样性的TRAP分析 被引量：16
6
作者 苗培明 范玲 +3 位作者 师维军 乌买尔江 徐利民 马君 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2009年第5期420-426,共7页
应用TRAP分子标记方法对65份棉花种质资源进行遗传多样性分析。从100对引物中筛选出10对引物,用TRAP-PCR的方法共扩增出252条带,其中210条为多态带,比率为83.33%。利用NTSYSpc 2.1遗传学统计分析软件中的UPMGA法对所获得的数据进行聚类... 应用TRAP分子标记方法对65份棉花种质资源进行遗传多样性分析。从100对引物中筛选出10对引物,用TRAP-PCR的方法共扩增出252条带,其中210条为多态带,比率为83.33%。利用NTSYSpc 2.1遗传学统计分析软件中的UPMGA法对所获得的数据进行聚类分析,建立了65份棉花种质资源的亲缘关系树状图。当遗传相似性系数(GS)为0.84时,65份种质资源可以分为6大类群。所获得的聚类结果与种质资源的地域来源和形态特征有一定的相关性。说明TRAP型的分子标记方法在棉花种质资源鉴定、分类等方面的研究上具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 棉花 种质 遗传多样性 trap
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肿瘤治疗新靶点TRAP1研究进展 被引量：11
7
作者 沈培亮 刘兆国 +5 位作者 孙丽华 王旭 沈颖 吴红雁 王爱云 陆茵 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期459-463,共5页
肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated protein 1,TRAP1)是热休克蛋白90(Hsp90)家族的主要成员之一,其不仅能够抵御氧化应激所诱导的凋亡,同时在维持线粒体完整性及细胞内稳态方面也发挥着重要作用。... 肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated protein 1,TRAP1)是热休克蛋白90(Hsp90)家族的主要成员之一,其不仅能够抵御氧化应激所诱导的凋亡,同时在维持线粒体完整性及细胞内稳态方面也发挥着重要作用。研究发现,TRAP1的异常表达与多种肿瘤的发生、发展密切相关。进一步研究表明,TRAP1是肿瘤细胞内能量代谢重新编排的关键调控因素,干预其功能可导致肿瘤细胞的死亡,但却对正常细胞没有影响。这使得TRAP1作为治疗靶点,备受人们关注。该文对TRAP1蛋白的异常表达与肿瘤研究进展进行综述,探讨TRAP1蛋白调控肿瘤进程的相关分子机制,为临床的后续研究和治疗提供参考。 展开更多
关键词 trap1 AMPK 肿瘤 异常表达 分子机制 临床治疗
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Bassam和Sanguinetti银染方法在SRAP和TRAP标记中的比较研究 被引量：23
8
作者 任民 贾兴华 +2 位作者 蒋彩虹 杨爱国 王日新 《生物技术通报》 CAS CSCD 2008年第1期113-116,121,共5页
银染作为一种重要的DNA染色方法,对分子标记检测有重要影响。SRAP标记和TRAP标记是两种较为新型的分子标记,近年来得到了广泛应用,尤其在缺少遗传图谱的物种中应用价值更大。以普通烟草种(Nicotianatabacum L.)烤烟和香料烟品种作为供... 银染作为一种重要的DNA染色方法,对分子标记检测有重要影响。SRAP标记和TRAP标记是两种较为新型的分子标记,近年来得到了广泛应用,尤其在缺少遗传图谱的物种中应用价值更大。以普通烟草种(Nicotianatabacum L.)烤烟和香料烟品种作为供试材料,对Bassam和Sanguinetti两种银染方法,在标记检测效率、成本及染色效果等方面进行了研究,并对其在SRAP标记和TRAP标记中的应用进行了探讨。结果表明,Sanguinetti银染法比Bassam银染更为简便、经济,染色照片的色阶图说明Sanguinetti染色方法的背景与扩增带区分明显,能够清楚地读带;且该方法能够扩增出很好的SRAP和TRAP标记谱带。因此,推荐在SRAP和TRAP标记检测中采用Sanguinetti银染方法。 展开更多
关键词 银染 SRAP标记 trap标记
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9份烟草品种(系)及其航天诱变后代的TRAP分析 被引量：5
9
作者 冯俊彦 蒲志刚 +5 位作者 李明 张聪 阎文昭 王勇 邢小军 刘东阳 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期273-279,共7页
为了研究烟草航天诱变育种规律,充分利用该技术创制烟草育种材料、培育新品种,利用航天诱变技术处理9份我国主要烟草品种(系)种子,繁育多代待其性状稳定后,在每个品种(系)中随机选择20份诱变单株,利用42对目标序列多态性引物对其进行遗... 为了研究烟草航天诱变育种规律,充分利用该技术创制烟草育种材料、培育新品种,利用航天诱变技术处理9份我国主要烟草品种(系)种子,繁育多代待其性状稳定后,在每个品种(系)中随机选择20份诱变单株,利用42对目标序列多态性引物对其进行遗传多样性分析。共检测到200条变异条带,各品种(系)变异条带数为1~45条,其中LS-2产生的变异条带最少,仅有1条,云烟85产生的变异条带最多,为45条;通过对各品种(系)的遗传相似性分析和聚类分析表明,烟草品种(系)及其航天诱变后代的遗传相似系数变幅为0.32~1.00,其中烟草品种K346及其航天诱变后代的差异最大,遗传相似系数仅为0.32。在各品种航天诱变后代中均存在遗传相似系数为1.0的单株;K346、翠碧一号、云烟85及其诱变后代中都存在原始亲本与诱变单株遗传相似系数为1.0的现象,而云烟317、云烟87、红花大金元、K326、CF209及其诱变单株中没有出现。航天诱变育种技术可对参试烟草品种产生较好的诱变效果,烟草品种不同,其变异程度差异较大;在烟草基因组上航天诱变位点的发生具有一定随机性,但是推测在烟草基因组上可能存在容易发生诱变的区域。这些研究结果将为航天诱变育种技术在烟草育种中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 烟草 trap标记 航天诱变 多态性分析
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CC-TRAP在棉田烟粉虱移动态监测上的运用 被引量：7
10
作者 马宁远 张伟 +2 位作者 王惠卿 依萨克.司马义新疆农业大学农学院 马德英 《新疆农业科学》 CAS CSCD 2007年第3期368-371,共4页
通过诱集陷阱的诱集监测,肯定了CC-TRAP诱捕器对烟粉虱成虫的诱集效果,该诱捕器最大的优点是其仅对烟粉虱有诱集作用而不受其它害虫的干扰。田间观察与数据表明,温室是大田烟粉虱主要的冬季庇护所和春季的虫源中心。由于烟粉虱的主动迁... 通过诱集陷阱的诱集监测,肯定了CC-TRAP诱捕器对烟粉虱成虫的诱集效果,该诱捕器最大的优点是其仅对烟粉虱有诱集作用而不受其它害虫的干扰。田间观察与数据表明,温室是大田烟粉虱主要的冬季庇护所和春季的虫源中心。由于烟粉虱的主动迁移能力很弱,属于典型的借助风力被动扩散的昆虫,风向和风力是其田间传播扩散的关键影响因子,距离虫源中心越远,发生时间越晚,成虫数量越低。SPSS相关分析表明烟粉虱的成虫数量与风向、风力呈显著正相关。 展开更多
关键词 烟粉虱 CC—trap 棉田 监测
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基于TRAP的长穗偃麦草SCAR标记的开发及应用 被引量：5
11
作者 秦树文 戴毅 +6 位作者 陈士强 张璐璐 刘慧萍 曹文广 FEDAK George 高勇 陈建民 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期1595-1602,共8页
为了开发长穗偃麦草的特异标记,依据TRAP技术,利用56对固定引物与随机引物的组合对中国春-长穗偃麦草附加系等材料进行PCR扩增,共筛选出160条分布于长穗偃麦草1E-7E染色体的特异扩增片段。通过对104个片段的序列进行同源比对,选择与小... 为了开发长穗偃麦草的特异标记,依据TRAP技术,利用56对固定引物与随机引物的组合对中国春-长穗偃麦草附加系等材料进行PCR扩增,共筛选出160条分布于长穗偃麦草1E-7E染色体的特异扩增片段。通过对104个片段的序列进行同源比对,选择与小麦无同源序列的区段设计138对引物,分别对中国春、长穗偃麦草、中国春-长穗偃麦草附加系进行PCR扩增,最终获得30个长穗偃麦草特异SCAR标记,发展标记的效率为53.6%。利用这些特异SCAR标记对硬粒小麦(AABB)与异源六倍体小麦(AABBEE)杂交产生的F2中38个单株进行扩增鉴定,9个单株仅附加了1条相同的E染色体,其余为多条E染色体或者无E染色体附加。这些SCAR标记在不同材料和世代表现出优越的特异性和稳定性,可用于检测小麦背景中附加的相关长穗偃麦草染色体。 展开更多
关键词 长穗偃麦草 小麦 trap技术 基因组特异标记 染色体特异标记
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TRAP1通过TGF/Smad3通路对膀胱癌的迁移和侵袭能力的影响 被引量：6
12
作者 王哲 张敬 +5 位作者 陈怀安 张潮 张晓云 刘硕 苗文隆 李凤歧 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1306-1309,1314,共5页
目的:探讨TRAP1蛋白对膀胱癌细胞迁移和侵袭的影响及机制。方法:采用Western blot从膀胱癌细胞株中挑选出高表达TRAP1的细胞系BIU-87;使用TRAP1沉默慢病毒(LV3-TRAP1)沉默TRAP1,使用GFP荧光及PCR检测LV3-TRAP1沉默效率;Transwell和划痕... 目的:探讨TRAP1蛋白对膀胱癌细胞迁移和侵袭的影响及机制。方法:采用Western blot从膀胱癌细胞株中挑选出高表达TRAP1的细胞系BIU-87;使用TRAP1沉默慢病毒(LV3-TRAP1)沉默TRAP1,使用GFP荧光及PCR检测LV3-TRAP1沉默效率;Transwell和划痕实验分别检测沉默TRAP1蛋白表达后对膀胱癌细胞侵袭和迁移能力的影响;CMH2DCFDA荧光染色细胞检测膀胱癌细胞内活性氧水平;Western blot检测相关信号通路TGF/Smad3蛋白的表达情况。结果:LV3-TRAP1慢病毒可以有效地抑制TRAP1蛋白的表达;沉默TRAP1蛋白的表达可以有效抑制膀胱癌细胞的侵袭和迁移能力、降低膀胱癌细胞内活性氧水平;同时TGF/Smad3信号通路中的TGF、Smad2及Smad3蛋白表达也相应降低。结论:沉默TRAP1蛋白可以通过调控TGF/Smad3信号通路来抑制膀胱癌细胞的侵袭和迁移能力。 展开更多
关键词 trap1 膀胱癌 TGF SMAD3 ROS
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上、下坡跑台运动对去卵巢小鼠骨组织IL-6、TNF-α和TRAP基因表达的影响 被引量：4
13
作者 马涛 季浏 +1 位作者 李世昌 孙朋 《天津体育学院学报》 CAS CSSCI 北大核心 2011年第3期204-207,共4页
目的:以去卵巢手术小鼠模拟妇女绝经后骨质疏松症状,对比研究上、下坡跑台运动对去卵巢小鼠骨组织IL-6、TNF-α和TRAP等细胞因子的影响。方法:32只8周龄C57 BL/6雌性小鼠随机分为4组:假手术安静组(SHAM),去卵巢安静组(OVX),去卵巢上坡跑... 目的:以去卵巢手术小鼠模拟妇女绝经后骨质疏松症状,对比研究上、下坡跑台运动对去卵巢小鼠骨组织IL-6、TNF-α和TRAP等细胞因子的影响。方法:32只8周龄C57 BL/6雌性小鼠随机分为4组:假手术安静组(SHAM),去卵巢安静组(OVX),去卵巢上坡跑组(OVX+UP),去卵巢下坡跑组(OVX+DOWN)。SHAM组小实行去卵巢假手术,其余3组小鼠均摘除卵巢。训练方案为:OVX+UP组进行上坡跑训练,而OVX+DOWN组进行下坡跑训练,每次40 min,每周训练5次,共训练8周。8周后取右侧股骨提取mRNA,检测其骨组织IL-6、TNF-α和TRAP等细胞因子的基因表达。结果:与SHAM组相比,OVX组小鼠骨组织IL-6、TNF-α和TRAP的基因表达显著增加;两运动组小鼠骨组织IL-6、TNF-α和TRAP的基因表达比OVX组小鼠显著降低,且OVX+DOWN组比OVX+UP组的效果更明显。结论:跑台运动通过抑制去卵巢小鼠骨组织破骨细胞的分化和活化,从而有效预防骨质疏松症的发生,且下坡跑运动比上坡跑运动效果更明显;跑台运动对去卵巢小鼠破骨细胞分化和活化的抑制作用可能与骨组织IL-6和TNF-α等细胞因子基因表达的变化有关。 展开更多
关键词 跑台运动 去卵巢小鼠 IL-6 TNF-α trap
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罗非鱼TRAP分子标记反应体系优化设计方案的比较 被引量：3
14
作者 马庆男 董在杰 +4 位作者 朱文彬 苏胜彦 张宁 袁新华 杨弘 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期28-34,共7页
靶位区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)是一种新型功能性分子标记,比较了L16(45)正交试验和单因素方法优化罗非鱼(Oreochromis spp.)TRAP反应体系。2种分析方法结果中dNTPs浓度、随机引物浓度、DNA浓度相... 靶位区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)是一种新型功能性分子标记,比较了L16(45)正交试验和单因素方法优化罗非鱼(Oreochromis spp.)TRAP反应体系。2种分析方法结果中dNTPs浓度、随机引物浓度、DNA浓度相同而镁离子(Mg2+)浓度和TaqDNA聚合酶浓度不同,不同因素间存在一定的交互作用。正交设计方法比单因素法更简单、科学、合理。该试验获得罗非鱼15μL TRAP最优反应体系为DNA模板浓度为60 ng、Mg2+浓度为1.5 mmol.L-1、dNTPs浓度为0.3 mmol.L-1、TaqDNA聚合酶0.5 U、随机引物浓度为7 pmol.L-1和固定引物浓度为10 pmol.L-1。该反应体系在4个罗非鱼群体中验证,表现出良好的稳定性和重复性,该反应体系的建立为TRAP标记应用于罗非鱼遗传多样性评价、种质鉴定、分子标记辅助育种等研究提供了新的手段。 展开更多
关键词 罗非鱼 trap 正交设计 单因素试验 优化
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端粒酶调节相关基因TRAP与肿瘤生物学特性的关系 被引量：6
15
作者 唐志伟 张波 +2 位作者 徐文怀 赵瑗君 侯琳 《北京大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期402-407,共6页
目的 :研究TRAP基因在人肿瘤组织中的表达及其与人端粒酶逆转录酶 (hTERT)的作用相关性 ,探讨其在人肿瘤发生中的作用。方法 :通过原核表达TRAP蛋白免疫新西兰白兔 ,制备特异性多克隆抗体 ;免疫组化检测TRAP及hTERT在人肿瘤组织中的表... 目的 :研究TRAP基因在人肿瘤组织中的表达及其与人端粒酶逆转录酶 (hTERT)的作用相关性 ,探讨其在人肿瘤发生中的作用。方法 :通过原核表达TRAP蛋白免疫新西兰白兔 ,制备特异性多克隆抗体 ;免疫组化检测TRAP及hTERT在人肿瘤组织中的表达 ;通过构建TRAP真核表达载体、基因转染 ,观察TRAP对细胞hTERT转录、端粒酶活性和癌细胞生长及成瘤性的影响。结果 :通过大肠杆菌表达的TRAP蛋白免疫、制备多克隆抗体 ,经Westernblot鉴定与TRAP具有特异结合性 ;免疫组化显示 2 4 7例恶性肿瘤中有 2 13例TRAP阳性 ,表达率为 86 .2 % ,而在所有癌旁组织中TRAP为阴性。另外 ,交界性及癌前病变与良性病变组织中TRAP表达差异也有显著性。进一步检测卵巢生发上皮肿瘤、乳腺癌、肝癌及中枢神经系统肿瘤组织hTERT表达 ,显示hTERT与TRAP表达的结果相一致。TRAP正义转染使hTERT及端粒酶活性升高 ,细胞增殖加快 ;而反义转染时 ,两者均下降 ,细胞增殖受抑。裸鼠成瘤性实验表明 :正义TRAP使癌细胞成瘤性增强 ,而反义则抑制移植瘤的生长。结论 :TRAP表达存在于人癌组织及部分癌前病变 ,与癌细胞恶性表型相关 ,并与hTERT表达一致。TRAP基因参与对端粒酶的调节作用 ,可能与人肿瘤发生有关。 展开更多
关键词 端粒酶调节相关基因 trap 肿瘤 生物学特性 免疫组化
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基于SRAP和TRAP标记的河北野生狗牙根种质遗传多样性分析 被引量：3
16
作者 李会彬 赵玉靖 +3 位作者 梁中银 郭丽果 王丽宏 边秀举 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期1013-1019,共7页
以SRAP和TRAP 2种标记技术对36份狗牙根材料的遗传多样性及亲缘关系进行了分析,其中包含34份河北省野生狗牙根种质资源。分别由238对SRAP和85对TRAP引物组合中筛选获得具有多态性的SRAP和TRAP引物组合各10对,PCR扩增总条带分别为186和16... 以SRAP和TRAP 2种标记技术对36份狗牙根材料的遗传多样性及亲缘关系进行了分析,其中包含34份河北省野生狗牙根种质资源。分别由238对SRAP和85对TRAP引物组合中筛选获得具有多态性的SRAP和TRAP引物组合各10对,PCR扩增总条带分别为186和161条,多态性条带156和132条,平均每对引物扩增出多态性条带各15.6和13.2条,多态性位点比率分别为83.4%和81.0%。2种标记合并进行聚类分析,所有供试的36份狗牙根材料遗传相似系数GS=0.519~0.983,平均为0.7。当GS=0.68时,可将36份供试材料分为4个类群。本研究结果表明河北野生狗牙根种质资源存在较丰富的遗传多样性,可为种质资源保护和选育优良狗牙根新品种提供科学依据。 展开更多
关键词 狗牙根 种质资源 SRAP标记 trap标记 遗传多样性
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紫色叶用莴苣遗传多样性及亲缘关系的TRAP分析 被引量：9
17
作者 王亚楠 韩莹琰 +1 位作者 范双喜 卜斌 《中国蔬菜》 北大核心 2015年第3期25-32,共8页
利用TRAP标记对47份紫色叶用莴苣种质进行亲缘关系及遗传多样性分析。20对引物组合共扩增出多态性条带430条,多态性比率(PPB)为67.08%。47份紫色叶用莴苣材料的遗传相似系数在0.7063~0.9828之间,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon’s... 利用TRAP标记对47份紫色叶用莴苣种质进行亲缘关系及遗传多样性分析。20对引物组合共扩增出多态性条带430条,多态性比率(PPB)为67.08%。47份紫色叶用莴苣材料的遗传相似系数在0.7063~0.9828之间,Nei’s基因多样性指数(He)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.2553和0.3976,遗传多样性水平较低。聚类分析结果表明,47份紫色叶用莴苣材料分为2大类群,第Ⅱ类群又分为5个亚类,叶片形态相似的种质基本上聚在一起,亲缘关系较近。 展开更多
关键词 紫色叶用莴苣 trap标记 遗传多样性
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TRAP1在食管癌中的表达及对预后的影响 被引量：12
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作者 李纯 刘静 +1 位作者 关正元 冯倩倩 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期135-139,共5页
目的探讨TRAP1表达与食管癌临床病理特征及预后的关系。方法采用免疫组化法检测TRAP1在60例食管癌组织及对应癌旁组织中的表达,并分析其表达水平与临床病理特征的关系,用Kaplan-Meier和Cox回归对食管癌患者进行生存分析。结果 TRAP1在... 目的探讨TRAP1表达与食管癌临床病理特征及预后的关系。方法采用免疫组化法检测TRAP1在60例食管癌组织及对应癌旁组织中的表达,并分析其表达水平与临床病理特征的关系,用Kaplan-Meier和Cox回归对食管癌患者进行生存分析。结果 TRAP1在食管癌组织中的阳性率为55.0%,蛋白相对表达量为2.7±1.1;癌旁组织中的阳性率为11.7%,蛋白相对表达量为0.5±0.4,TRAP1在食管癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P<0.05)。TRAP1表达与患者性别、年龄、发病部位、分化程度、病理类型无明显相关性(P>0.05),与复发转移及TNM分期相关(P<0.05)。TRAP1阴性患者的平均生存时间为69.0个月(95%CI:60.2~77.9),TRAP1阳性患者的平均生存时间为34.2个月(95%CI:24.4~44.1),TRAP1高表达与食管癌术后生存期短相关(P<0.05)。结论 TRAP1在食管癌组织中过表达且与食管癌的进展及预后相关。 展开更多
关键词 食管肿瘤 trap1 预后 免疫组织化学
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云南超高产橡胶树的SSR、AFLP和TRAP分析 被引量：3
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作者 张燕燕 黄华孙 +2 位作者 胡彦师 程汉 安泽伟 《热带作物学报》 CSCD 2010年第6期881-886,共6页
利用SSR、AFLP和TRAP3种分子标记对云南勐腊农场发现的2株超高产橡胶树云PR107、云RRIM501与正常产量单株(PR107、RRIM501)进行遗传分析,共筛选到具有多态性的SSR引物7对、AFLP引物28对和TRAP引物12对,3种标记分别检测到多态性条带9、94... 利用SSR、AFLP和TRAP3种分子标记对云南勐腊农场发现的2株超高产橡胶树云PR107、云RRIM501与正常产量单株(PR107、RRIM501)进行遗传分析,共筛选到具有多态性的SSR引物7对、AFLP引物28对和TRAP引物12对,3种标记分别检测到多态性条带9、94和21条,平均每对引物可分别检测到1.16、3.36和1.4条多态性条带,结果表明,2株超高产橡胶树的遗传组成均发生了改变。 展开更多
关键词 橡胶树 SSR AFLP trap 高产
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我国羊巴贝斯虫trap基因结构及遗传进化分析 被引量：5
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作者 何欣 刘军龙 +6 位作者 刘爱红 王锦明 牛庆丽 李有全 殷宏 罗建勋 关贵全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期1332-1341,共10页
本研究拟解析我国羊巴贝斯虫trap基因的结构特征,并以其为分子标志开展遗传进化分析,为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据。用公布的巴贝斯虫trap基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库,以获得的保守序列片段为模板,设计PC... 本研究拟解析我国羊巴贝斯虫trap基因的结构特征,并以其为分子标志开展遗传进化分析,为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据。用公布的巴贝斯虫trap基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库,以获得的保守序列片段为模板,设计PCR引物;克隆我国分离的6株羊巴贝斯虫trap基因全长序列,分析其序列结构特征;比对序列相似性,构建系统发生树,分析其遗传进化关系。结果克隆获得6株羊巴贝斯虫trap基因,分析结果显示,其具有3、4、5个内含子的三种内含子数目,预测的开放阅读框(ORF)大小分别为1 944、2 100/2 142和2 286bp;氨基酸序列分析显示,其都具有TRAP蛋白家族特征性的vWFA、TSR、跨膜域和CTD结构域;进化关系分析显示,感染我国羊的巴贝斯虫被分成3组,组内序列相似性为99.8%~100%,而组间为43.6%~74.6%。系统发生树上6株羊巴贝斯虫被分到两大枝,羊巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫,而且莫氏巴贝斯虫又被分成两小枝。6株羊巴贝斯虫trap基因结构存在差异,但其蛋白特征性的结构域较为保守;我国分离的羊巴贝斯虫为两个种,但莫氏巴贝斯虫中可能存在两个亚种。 展开更多
关键词 羊巴贝斯虫 trap基因 基因结构 系统发生树
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