试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass t...试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass tags, TMT)技术对2组个体睾丸蛋白质进行差异表达、功能富集和基因互作分析,初步筛选候选蛋白质,分析这些蛋白质在6个个体的表达量与6个睾丸性状指标(左侧睾丸重、右侧睾丸重、总睾丸重、左侧睾丸指数、右侧睾丸指数、总睾丸指数)之间的相关性,分析候选蛋白质的功能。结果表明,宁都黄鸡睾丸中共鉴定到4 683个蛋白质,筛选到144个差异表达蛋白质。GO分析结果表明,差异蛋白质主要参与精子结构组成,具有尿蛋白-谷氨酸连接酶活性、胸腺嘧啶结合、脱氢抗坏血酸跨膜转运体活性等功能。差异蛋白质显著富集的KEGG通路为精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A的生物合成、β-丙氨酸代谢等。蛋白质互作网络中有34个差异蛋白质,初步筛选出30个候选蛋白质。结合相关性分析和文献查阅,筛选出16个关键候选蛋白质,即SPAG6、TPPP2、ENKUR、ODF2、SAXO1、TCP11、DNALI1、CCDC63、TSSK3、TEKT2、TEKT3、ALDH2、DNAH5、CCDC40、CCDC39、DNAH10。结合关键候选蛋白质的功能,初步确定精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A生物合成、β-丙氨酸代谢、紧密连接、间隙连接是睾丸性状调控关键KEGG通路。研究结果为地方鸡种睾丸质量性状选育提供了基础依据。展开更多
目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8...目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8/Svneo感染组和非感染组蛋白质组进行定量分析,运用GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达蛋白进行分子功能、生物过程及代谢途径富集分析。结果共鉴定肽段76285个,可定量蛋白6979个。HTR-8/Svneo感染过程中356个蛋白发生了显著性差异表达。153个表达量上调,203个表达量下调。差异表达量倍数最高的蛋白为微管马达蛋白(B4DYE2),最低为翻译起始因子1(Q6IAV3)。GO功能富集和KEGG代谢途径富集结果表明,上调蛋白参与的生物过程和代谢途径集中在微管、微丝运动,细胞自噬等方面,下调蛋白集中在碳代谢、氮代谢、氨基酸生物合成、核酸代谢等初级代谢途径和泛素介导的蛋白质水解等方面。结论单增李斯特菌侵袭HTR-8/Svneo过程中,宿主细胞的基础代谢可能发生了显著降低,并处于较高的自噬水平。细胞迁移诱导透明质酸酶CEMIP(Q8WUJ3)的显著上调说明该蛋白可能在调节滋养层细胞迁移、侵袭能力进而造成不良妊娠方面具有重要作用,为单增李斯特菌感染胎盘分子机制研究提供新的思路。展开更多
文摘试验旨在探讨成年宁都黄鸡睾丸的蛋白质表达谱,筛选大小睾丸个体差异表达蛋白和功能通路,为繁殖性能选育提供基础数据。以6只22周龄宁都黄鸡的睾丸组织为研究对象,分为大睾丸组(H-TES)和小睾丸组(L-TES),采用串联质量标签(tandem mass tags, TMT)技术对2组个体睾丸蛋白质进行差异表达、功能富集和基因互作分析,初步筛选候选蛋白质,分析这些蛋白质在6个个体的表达量与6个睾丸性状指标(左侧睾丸重、右侧睾丸重、总睾丸重、左侧睾丸指数、右侧睾丸指数、总睾丸指数)之间的相关性,分析候选蛋白质的功能。结果表明,宁都黄鸡睾丸中共鉴定到4 683个蛋白质,筛选到144个差异表达蛋白质。GO分析结果表明,差异蛋白质主要参与精子结构组成,具有尿蛋白-谷氨酸连接酶活性、胸腺嘧啶结合、脱氢抗坏血酸跨膜转运体活性等功能。差异蛋白质显著富集的KEGG通路为精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A的生物合成、β-丙氨酸代谢等。蛋白质互作网络中有34个差异蛋白质,初步筛选出30个候选蛋白质。结合相关性分析和文献查阅,筛选出16个关键候选蛋白质,即SPAG6、TPPP2、ENKUR、ODF2、SAXO1、TCP11、DNALI1、CCDC63、TSSK3、TEKT2、TEKT3、ALDH2、DNAH5、CCDC40、CCDC39、DNAH10。结合关键候选蛋白质的功能,初步确定精氨酸和脯氨酸代谢、泛酸和辅酶A生物合成、β-丙氨酸代谢、紧密连接、间隙连接是睾丸性状调控关键KEGG通路。研究结果为地方鸡种睾丸质量性状选育提供了基础依据。
文摘目的分析单核细胞增生李斯特氏菌(简称单增李斯特菌)感染人绒毛膜滋养层细胞HTR-8/Svneo过程中引起的细胞蛋白质组变化。从宿主细胞分子水平对单增李斯特菌感染胎盘的机制进行研究。方法运用TMT(Tandem Mass Tags)蛋白质组学技术对HTR-8/Svneo感染组和非感染组蛋白质组进行定量分析,运用GO(Gene Ontology)、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库对差异表达蛋白进行分子功能、生物过程及代谢途径富集分析。结果共鉴定肽段76285个,可定量蛋白6979个。HTR-8/Svneo感染过程中356个蛋白发生了显著性差异表达。153个表达量上调,203个表达量下调。差异表达量倍数最高的蛋白为微管马达蛋白(B4DYE2),最低为翻译起始因子1(Q6IAV3)。GO功能富集和KEGG代谢途径富集结果表明,上调蛋白参与的生物过程和代谢途径集中在微管、微丝运动,细胞自噬等方面,下调蛋白集中在碳代谢、氮代谢、氨基酸生物合成、核酸代谢等初级代谢途径和泛素介导的蛋白质水解等方面。结论单增李斯特菌侵袭HTR-8/Svneo过程中,宿主细胞的基础代谢可能发生了显著降低,并处于较高的自噬水平。细胞迁移诱导透明质酸酶CEMIP(Q8WUJ3)的显著上调说明该蛋白可能在调节滋养层细胞迁移、侵袭能力进而造成不良妊娠方面具有重要作用,为单增李斯特菌感染胎盘分子机制研究提供新的思路。
文摘蛋白质组学的兴起带动了质谱技术的快速发展,而质谱技术的进步则拓宽了蛋白质组学研究问题的广度.最近10年内,肽段或完整蛋白质在质谱仪中的裂解技术——电子捕获裂解(electron capture dissociation,ECD)与电子转运裂解(electron transfer dissociation,ETD)逐渐发展起来.ECD和ETD在蛋白质组学中的应用,特别是在蛋白质的翻译后修饰鉴定和"自顶而下(Top-down)"的完整蛋白质裂解研究中已经展示出了诱人的前景.对ECD和ETD的基本原理、质谱特点、仪器实现、数据解析算法与软件开发,以及在蛋白质组学中的应用进展等方面进行了比较系统全面的阐述,并对当前的研究问题、面临的技术挑战与未来的发展趋势等方面作了深入剖析.
