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肺腺癌组织中RNA结合基序蛋白38和p53基因的表达及其临床意义 被引量:3
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作者 尚自强 童莹 +3 位作者 宋佳 薛亚斌 况志星 王洪江 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期900-903,共4页
目的:分析肺腺癌组织中RNA结合基序蛋白38基因(RNA-binding motif protein 38,RBM38)及抑癌基因p53 m RNA和蛋白的表达情况,探讨其在肺腺癌发生发展中的意义。方法:取2012年10月至2015年6月新疆医科大学附属肿瘤医院收治的50例肺腺癌患... 目的:分析肺腺癌组织中RNA结合基序蛋白38基因(RNA-binding motif protein 38,RBM38)及抑癌基因p53 m RNA和蛋白的表达情况,探讨其在肺腺癌发生发展中的意义。方法:取2012年10月至2015年6月新疆医科大学附属肿瘤医院收治的50例肺腺癌患者的肿瘤组织标本作为实验组,相对应的癌旁组织标本作为对照组。用RT-PCR法检测两组中RBM38及p53m RNA相对表达量,用Western blotting法检测两组中RBM38及p53蛋白的相对表达量。结果:实验组RBM38 m RNA及蛋白相对表达量(0.357±0.170、0.294±0.149)均高于对照组(0.271±0.128、0.206±0.099),实验组p53 m RNA及蛋白(0.457±0.208、0.671±0.200)相对表达量均高于对照组(0.308±0.167、0.332±0.071),差异均有统计学意义(均P<0.01)。RBM38表达与肺腺癌患者TNM分期、浸润深度有关(P<0.05),p53表达与患者TNM分期有关(P<0.05)。实验组RBM38与p53蛋白表达呈负相关(r=-0.626,P<0.01)。结论:肺腺癌组织RBM38、p53 m RNA及蛋白表达均高于癌旁组织,两者均与患者TNM分期等病理参数关系密切。随着RBM38蛋白表达的增加p53蛋白随之减少,RBM38可能通过抑制p53的翻译从而促进肺癌的发生发展,RBM38可能成为肺腺癌分子靶向治疗的靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 rna结合基序蛋白38基因 P53基因
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RNA结合基序蛋白3的生物学功能 被引量:2
2
作者 李云龙 李昌盛 +5 位作者 李静辉 孟宇 张雪 贺军 杨焕民 李士泽 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期429-433,共5页
RNA结合基序蛋白3(RNA binding motif protein 3,RBM3)是在哺乳动物细胞中发现的重要冷应激蛋白,伴随冷应激过程其表达量上调。研究发现RBM3与冷诱导RNA结合蛋白(cold inducible RNA binding protein,CIRP)在核酸结构和氨基酸结构上高... RNA结合基序蛋白3(RNA binding motif protein 3,RBM3)是在哺乳动物细胞中发现的重要冷应激蛋白,伴随冷应激过程其表达量上调。研究发现RBM3与冷诱导RNA结合蛋白(cold inducible RNA binding protein,CIRP)在核酸结构和氨基酸结构上高度保守,具有较高的同源性,且发挥作用的方式也有很多相似之处。RBM3不仅具有介导冷诱导下细胞抗凋亡的保护作用,还能参与人和动物的缺氧应激、缺血应激、紫外照射应激、细胞增殖、骨骼肌调节、生殖发育,疾病的治疗等多种生理过程,而且它还能够作为原癌基因以及参与小RNA(microRNA,简称miRNA)生物学过程的调控作用。因此,深入开展RBM3功能性研究和应用性研究具有重要的基础研究价值和临床研究意义。 展开更多
关键词 rna结合基序蛋白3 生物学功能 应激
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刚毛柽柳富含甘氨酸RNA结合蛋白ThGRP1基因克隆与表达分析 被引量:2
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作者 姜波 高彩球 +2 位作者 王玉成 于丽丽 杨传平 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2011年第2期256-262,共7页
在有机体的生长和发育过程中,基因表达在转录、转录后和翻译水平都受到严格地调控。转录调控是基因表达调控的第一步,曾被认为是基因表达的主要调控机制,但是随着对转录后调控机制越来越多的了解,发现转录后调控在基因表达调控中同样... 在有机体的生长和发育过程中,基因表达在转录、转录后和翻译水平都受到严格地调控。转录调控是基因表达调控的第一步,曾被认为是基因表达的主要调控机制,但是随着对转录后调控机制越来越多的了解,发现转录后调控在基因表达调控中同样起着重要作用。转录后的调控决定着基因表达最终产物的种类和表达量。转录后水平的基因表达调控主要是通过RNA结合蛋白(RBPs)直接完成,或通过RBPs控制其它转录因子间接完成的。 展开更多
关键词 刚毛柽柳 富含甘氨酸rna结合蛋白 基因克隆 实时定量RT-PCR
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玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 孙培元 王俊强 +4 位作者 韩业辉 于运凯 许健 周超 李昕 《黑龙江农业科学》 2016年第3期7-12,共6页
为了研究玉米RNA结合蛋白在玉米生长发育中的调节机制,以一个玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因为材料,采用生物信息学的方法,对其理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、功能域、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:基因包含一个1 ... 为了研究玉米RNA结合蛋白在玉米生长发育中的调节机制,以一个玉米RNA结合蛋白GRMZM2G052926基因为材料,采用生物信息学的方法,对其理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、功能域、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明:基因包含一个1 335bp开放阅读框,是一种具有亲水能力的不稳定酸性蛋白,相对分子质量38.301 1kDa,包含两个RRM超亲家族(RRM superfamily),无信号肽序列,无跨膜结构域,亚细胞定位在细胞质上,二级结构由无规则卷曲、α螺旋、延伸链和β折叠构成;系统进化树分析表明,GRMZM2G052926蛋白与水稻Os05g0437300蛋白亲缘关系最近,同源性达到87%。 展开更多
关键词 玉米 rna结合蛋白 GRMZM2G052926基因 生物信息学
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RNA结合蛋白基于RNA代谢调节在骨关节炎中发挥作用
5
作者 苏婧玥 陈思宇 +1 位作者 杨胜武 邓桢翰 《中南大学学报(医学版)》 CSCD 北大核心 2024年第12期1973-1982,共10页
骨关节炎(osteoarthritis,OA)是骨骼系统和肌肉系统常见的慢性退行性病变,目前致病机制仍不明确,因此尚缺乏有效治疗措施。核糖核酸结合蛋白(ribonucleic acid binding proteins,RBP)作为参与转录后调控的关键因子,可靶向结合核糖核酸(r... 骨关节炎(osteoarthritis,OA)是骨骼系统和肌肉系统常见的慢性退行性病变,目前致病机制仍不明确,因此尚缺乏有效治疗措施。核糖核酸结合蛋白(ribonucleic acid binding proteins,RBP)作为参与转录后调控的关键因子,可靶向结合核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)并调节其功能和命运。通过对包括转录、剪接、修饰、稳定和翻译在内的RNA代谢过程进行调控,RBP可影响OA的发生和发展。探讨RBP在生理病理状态下的调控机制,阐述RBP在OA发生和发展中的作用,分析目前RBP研究的困难及未来的研究方向,对靶向RBP的OA治疗具有重要意义。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 骨关节炎 rna代谢 基因表达调控
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RNA结合基序蛋白25作用的研究进展 被引量:1
6
作者 赵可心 丁虹 +1 位作者 刘述 张小卫 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1356-1360,共5页
RNA结合基序蛋白25(RNA-binding motif protein 25,RBM25)是RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)家族的一员。其富含丝氨酸/精氨酸蛋白,在mRNA剪接体的组装和选择性剪接的调控过程中起着重要作用,并参与多种疾病如(心血管疾病和肿瘤... RNA结合基序蛋白25(RNA-binding motif protein 25,RBM25)是RNA结合蛋白(RNA binding proteins,RBPs)家族的一员。其富含丝氨酸/精氨酸蛋白,在mRNA剪接体的组装和选择性剪接的调控过程中起着重要作用,并参与多种疾病如(心血管疾病和肿瘤)的发生、发展。RBM 25可以调控BCL-2、SCN5A、BIN1等基因的可变剪接,进而参与细胞凋亡、离子通道电流改变及细胞因子活性改变等重要病理生理过程,但人们对RBM25了解甚少。该文将从RBM 25的基本结构和功能、调控作用机制和研究进展进行系统综述。为心血管疾病和肿瘤的防治提供相应的理论参考。 展开更多
关键词 rna结合基序蛋白25 选择性剪接 BCL-2 SCN5A 心血管疾病 肿瘤
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RNA结合基序蛋白20在心肌病中作用的研究进展 被引量:4
7
作者 杨珍 刘宇宁 +1 位作者 余薇 郑萍 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1505-1508,共4页
心肌病是异质性的心肌病变,表现为心肌结构和功能的异常,心肌病最终会导致心力衰竭甚至死亡。RNA结合基序蛋白20(RBM 20)在心肌中高度表达,是富含丝氨酸/精氨酸蛋白家族的一种,对RNA剪接体的组装和选择性剪接的调控过程起着重要作用,参... 心肌病是异质性的心肌病变,表现为心肌结构和功能的异常,心肌病最终会导致心力衰竭甚至死亡。RNA结合基序蛋白20(RBM 20)在心肌中高度表达,是富含丝氨酸/精氨酸蛋白家族的一种,对RNA剪接体的组装和选择性剪接的调控过程起着重要作用,参与心肌病的发生、发展。RBM 20调控Titin、RyR 2、LDB 3、CaMKIIδ、CACNA1C等多种基因的选择性剪接,这些基因与心脏舒张功能、肌节组装、离子转运密切相关。该文将对RBM 20在心肌病中的作用和RBM 20调控机制进行综述,为心肌病的防治提供相应的理论参考。 展开更多
关键词 rna结合基序蛋白20 心肌病 心力衰竭 TITIN RyR2 CA 2+/CaM依赖激酶
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RRM RNA结合蛋白的结构与功能 被引量:8
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作者 杜光伟 周严 +1 位作者 袁建刚 强伯勤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第4期305-307,共3页
R R M R N A 结合蛋白是一类含一个或数个 R R M 结构域及附属结构域的 R N A 结合蛋白, 参与 R N A 前体的剪接、 R N A 的细胞定位、 R N A 的稳定性等多种转录后调控过程. 在 R R M 基序中含有许多保守... R R M R N A 结合蛋白是一类含一个或数个 R R M 结构域及附属结构域的 R N A 结合蛋白, 参与 R N A 前体的剪接、 R N A 的细胞定位、 R N A 的稳定性等多种转录后调控过程. 在 R R M 基序中含有许多保守的氨基酸以保证对 R N A 的结合活性, 但是这一家族的不同蛋白质却能特异地结合各种不同的 R N A 分子. R R M R N A 展开更多
关键词 转录后调控 rna结合蛋白 RRM基序
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家蚕AGO1蛋白结合RNA的分离与鉴定 被引量:1
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作者 杨帆 高珍 +4 位作者 马亚飞 蒋彩英 吕正兵 盛清 聂作明 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期346-352,共7页
RNA诱导的基因沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)核心蛋白为Argonaute(AGO)家族蛋白,作为miRNA及RNAi功能途径中的关键蛋白,能够结合miRNA和siRNA,降解靶标基因mRNA或抑制其翻译。因此,利用AGO蛋白抗体通过免疫沉淀分离... RNA诱导的基因沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)核心蛋白为Argonaute(AGO)家族蛋白,作为miRNA及RNAi功能途径中的关键蛋白,能够结合miRNA和siRNA,降解靶标基因mRNA或抑制其翻译。因此,利用AGO蛋白抗体通过免疫沉淀分离其结合RNA是目前规模化分离鉴定miRNA及相关小RNA靶基因的重要方法。首先对家蚕AGO1基因进行克隆表达和抗体制备,用自制的兔多克隆抗体免疫沉淀家蚕组织内源BmAGO1蛋白,成功分离BmAGO1蛋白结合的RNA;同时在BmN细胞中采用6×His标签融合表达BmAGO1蛋白,用His单抗免疫沉淀His-BmAGO1蛋白,同样成功分离获得其结合RNA。qRT-PCR检测发现,BmAGO1蛋白结合的RNA中含有家蚕miRNA靶基因BmEm4的mRNA。研究结果为批量鉴定家蚕miRNA靶基因奠定了基础,同时也为深入研究BmAGO1蛋白在家蚕中的功能提供了依据。 展开更多
关键词 家蚕 BmAGO1蛋白 免疫共沉淀 AGO结合rna mirna基因
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植物RNA结合蛋白的研究进展 被引量:7
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作者 唐蜻 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第1期38-41,共4页
从RNA结合蛋白的鉴定方法,RNA结合蛋白的基序,以及植物RNA结合蛋白在调控叶绿素mRNA的稳定和转录、植物抗逆反应、开花和激素信号传导等过程中的作用等方面介绍了植物RNA结合蛋白的研究进展。
关键词 rna结合蛋白 基因转录后调控 rna识别基序
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大鼠CREB结合蛋白RNA干扰重组慢病毒载体的构建与鉴定
11
作者 杨简 江洪 +3 位作者 陈思思 陈静 徐盛开 王继春 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2010年第4期348-350,共3页
目盼构建大鼠CREB结合蛋白(CREB binding protein,CBP)基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,并观察该载体对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)CBP表达的沉默效应。方法设计合成4条CBP基因的siRNA序列,将筛选... 目盼构建大鼠CREB结合蛋白(CREB binding protein,CBP)基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,并观察该载体对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)CBP表达的沉默效应。方法设计合成4条CBP基因的siRNA序列,将筛选确定的CBP RNAi有效靶序列与pFU—GW—iRNA载体连接产生CBPshRNA慢病毒表达载体,转化、PCR筛选阳性克隆及测序鉴定。脂质体2000将CBP shRNA慢病毒载体和慢病毒包装质粒共转染293T细胞,完成慢病毒颗粒包装及滴度测定。包装产生的重组慢病毒感染大鼠VSMCs,实时定量RT-PCR检测CBP mRNA的表达,并与未转染及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞进行比较。结果PCR扩增和测序结果证实,成功构建大鼠CBP shRNA慢病毒载体。经包装产生的慢病毒滴度为2×10^9TU/ml,与未转染慢病毒及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞比较,CBP shRNA慢病毒转染可使VsMcs的CBP mRNA分别下降88.5%和92.7%。结论成功构建CBP基因RNAi慢病毒表达载体.对VsMcs的CBP表达具有良好沉默作用,为后期基因治疗血管增殖性疾病奠定基础。 展开更多
关键词 CREB结合蛋白 rna干扰 转染 基因疗法
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沉默脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白基因对脂肪细胞合成甘油三酯及脂联素分泌的影响
12
作者 吴洁 钟敏 邹瑾 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2012年第5期464-467,共4页
目的应用RNA干扰(RNAi)技术,构建针对3T3-L1脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)的microRNA表达载体,研究沉默A-FABP基因的表达对脂肪细胞合成甘油三酯及脂联素分泌的影响。方法构建靶向A-FABP基因的microRNA表达载体转染3T3-L1脂肪细胞后... 目的应用RNA干扰(RNAi)技术,构建针对3T3-L1脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)的microRNA表达载体,研究沉默A-FABP基因的表达对脂肪细胞合成甘油三酯及脂联素分泌的影响。方法构建靶向A-FABP基因的microRNA表达载体转染3T3-L1脂肪细胞后,RT-PCR及Western blot法检测A FABP mRNA及蛋白表达。建立A-FABP基因沉默细胞模型,0.5 mmol/L游离脂肪酸和成熟脂肪细胞共孵育24 h,分为对照组、脂肪酸组、RNAi组、RNAi+脂肪酸组。ELISA法分别检测甘油三酯及脂联素水平,RT PCR法检测脂肪细胞A-FABP及脂联素mRNA的表达。结果 microRNA表达载体转染脂肪细胞后,能显著抑制A-FABP mRNA和蛋白表达。随着脂肪酸浓度的升高,脂肪细胞甘油三酯合成明显增加,脂联素分泌明显减少(P<0.05)。与对照组和脂肪酸组比较,RNAi组和RNAi+脂肪酸组甘油三酯水平明显降低,脂联素水平明显升高,脂联素mRNA表达明显上调(P<0.05)。结论阻断A-FABP基因有可能成为防治动脉粥样硬化及糖尿病的新靶点。 展开更多
关键词 rna干扰 脂细胞 脂肪酸结合蛋白质类 甘油三酯类 脂联素 基因表达 rnaS
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黑腹果蝇头部中RNA结合蛋白RBP9的互作蛋白筛选 被引量:1
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作者 时佳园 马达 +5 位作者 顾佳蕙 秦笙 汪生鹏 张国政 李木旺 孙霞 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期1615-1622,共8页
【目的】筛选RNA结合蛋白RBP9在黑腹果蝇Drosophila melanogaster头部中的互作蛋白。【方法】利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术,分别将3×Flag和V5标签编码序列插入到黑腹果蝇成虫头中RBP9和FNE基因起始密码子ATG的后面,构建黑腹果蝇... 【目的】筛选RNA结合蛋白RBP9在黑腹果蝇Drosophila melanogaster头部中的互作蛋白。【方法】利用CRISPR/Cas9基因组编辑技术,分别将3×Flag和V5标签编码序列插入到黑腹果蝇成虫头中RBP9和FNE基因起始密码子ATG的后面,构建黑腹果蝇转基因品系3×Flag-RBP 9/3×Flag-RBP9(3 FRBP9)和V5-FNE/V5-FNE(VFNE);利用免疫沉淀和质谱法鉴定黑腹果蝇3 FRBP9和野生型品系成虫头部中RBP9的互作蛋白并进行生物信息学分析。利用免疫共沉淀方法检测RBP9与FNE蛋白之间的相互作用。【结果】质谱法从黑腹果蝇成虫头部共鉴定了190个与RBP9相互作用的蛋白,其中包括ELAV和FNE。KEGG富集分析显示这些蛋白的基因主要参与核糖体、碳代谢、三羧酸循环、氨基酸生物合成等通路。免疫共沉淀实验结果验证了RBP9与FNE蛋白之间存在相互作用。【结论】RNA结合蛋白ELAV家族成员在黑腹果蝇成虫头部中具有相互作用。本研究为RBP9在果蝇神经系统发育中的功能研究提供了重要实验依据。 展开更多
关键词 黑腹果蝇 rna结合蛋白 基因表达 质谱分析 转录后调控
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SP-B基因内含子4区(CA)_n模体上SRp20蛋白结合位点的初步研究 被引量:1
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作者 倪岚 王桂荣 杨炯 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期623-628,共6页
目的探讨SP-B基因内含子4区第8号(CA)_n模体上可能存在的剪切蛋白结合位点,为进一步研究第8号(CA)_n模体影响SP-B mRNA剪切的机制提供实验基础。方法软件分析特定(CA)_n模体的潜在RNA结合蛋白,并合成含有特定蛋白潜在结合位点的模体RNA... 目的探讨SP-B基因内含子4区第8号(CA)_n模体上可能存在的剪切蛋白结合位点,为进一步研究第8号(CA)_n模体影响SP-B mRNA剪切的机制提供实验基础。方法软件分析特定(CA)_n模体的潜在RNA结合蛋白,并合成含有特定蛋白潜在结合位点的模体RNA序列的探针及突变序列探针,用凝胶阻滞迁移(EMSA)技术研究相关(CA)_n模体的RNA序列与其潜在结合蛋白的相互作用。结果软件分析预测第8号(CA)_n模体上可能存在特定剪切蛋白SRp20的结合位点;EMSA实验中当抗体或突变探针竞争时特异性结合带(迁移带)均消失,显示第8号(CA)_n模体RNA序列上的"CAUC"能够与SRp20特异性结合。结论SP-B内含子4区第8号(CA)_n模体的保守序列上存在SRp20的特异性结合位点,从而可能影响SP-B mRNA剪切。 展开更多
关键词 SP-B基因 rna结合蛋白 SRp20
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多房棘球蚴RNA结合蛋白EWS的原核表达及其细胞定位与功能的初步鉴定
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作者 严玉婷 郭小腊 +3 位作者 孙玥 何学东 丁军涛 郑亚东 《动物医学进展》 北大核心 2023年第12期29-35,共7页
通过对多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)RNA结合蛋白EWS(EmEWS)基因的原核表达、抗体制备、细胞定位等研究,初步探究EmEWS基因特征以及与RNA的结合能力。根据Wormbase数据库中EmEWS基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增EmEWS基因... 通过对多房棘球绦虫(Echinococcus multilocularis)RNA结合蛋白EWS(EmEWS)基因的原核表达、抗体制备、细胞定位等研究,初步探究EmEWS基因特征以及与RNA的结合能力。根据Wormbase数据库中EmEWS基因序列设计引物,利用RT-PCR扩增EmEWS基因并构建重组表达质粒,诱导表达、纯化重组蛋白,制备EmEWS多克隆抗体后进行Western blot、实时荧光定量PCR、免疫荧光定位、双荧光测定。结果表明,EmEWS基因长度为1485 bp,编码495个氨基酸,在多房棘球蚴原代细胞中表达量较高,在原头蚴中最低。生物信息学分析表明,细粒棘球蚴EWS与EmEWS相似性高达98.3%,且EmEWS的RBD结构域在绦虫中高度保守。EmEWS重组蛋白大小约为54 ku,制备的多克隆抗体可识别多房棘球绦虫中天然EmEWS蛋白。细胞定位显示EmEWS主要分布在细胞膜上。双荧光试验证明EmEWS可以与结合富含UG的RNA序列结合。综合上述结果,推测EmEWS可能作为转录调控因子参与小RNA的形成,同时有助于核蛋白的运输。 展开更多
关键词 多房棘球蚴 rna结合蛋白EWS基因 原核表达 多克隆抗体 免疫荧光
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张进研究员团队揭示核仁定位的RNA结合蛋白LIN28调控小鼠胚胎干细胞多能性状态与二细胞样状态转变机制
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《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期419-419,共1页
2021年7月31日,《蛋白和细胞》(Protein&Cell)在线发表了张进研究员团队有关RNA结合蛋白LIN28调控小鼠胚胎干(ES)细胞多能性状态与二细胞(2C)样状态转变的最新研究成果“LIN28 coordinately promotes nucleolar/ribosomal functions... 2021年7月31日,《蛋白和细胞》(Protein&Cell)在线发表了张进研究员团队有关RNA结合蛋白LIN28调控小鼠胚胎干(ES)细胞多能性状态与二细胞(2C)样状态转变的最新研究成果“LIN28 coordinately promotes nucleolar/ribosomal functions and represses the 2C-like transcriptional program in pluripotent stem cells”(https://link.springer.com/article/10.1007/s13238-021-00864-5)。研究结果揭示了定位于核仁中RNA结合蛋白LIN28在小鼠早期胚胎发育过程中的新功能,以及LIN28介导的核仁完整性在ES-2C状态转变和基因表达调控中的作用,为早期胚胎发育过程中2C程序的调控提供一个新的机制。 展开更多
关键词 rna结合蛋白 多能性 小鼠胚胎干细胞 早期胚胎发育 基因表达调控 核仁
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RNA干扰FABP5基因对人肝癌HepG2细胞裸鼠移植瘤生长的影响 被引量:6
17
作者 周玲丽 曹骥 +6 位作者 李薇 罗旺 杨香娣 杨春 骆成飘 唐艳萍 李瑗 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期603-608,共6页
目的:研究脂肪酸结合蛋白5(FABP5)基因沉默的慢病毒载体对人肝癌Hep G2细胞成瘤效应的影响。方法:采用RNA干扰技术构建重组逆转录慢病毒载体。Hep G2细胞分为3组:实验组以FABP5基因沉默慢病毒颗粒(LV-shRNA-FABP5)感染Hep G2细胞;阴性... 目的:研究脂肪酸结合蛋白5(FABP5)基因沉默的慢病毒载体对人肝癌Hep G2细胞成瘤效应的影响。方法:采用RNA干扰技术构建重组逆转录慢病毒载体。Hep G2细胞分为3组:实验组以FABP5基因沉默慢病毒颗粒(LV-shRNA-FABP5)感染Hep G2细胞;阴性对照组以空载体慢病毒颗粒(LV-shRNA-NC)感染Hep G2细胞;空白对照组不做任何处理。将裸鼠随机分为3组,接种肿瘤细胞后观察裸鼠成瘤情况。4周后测量肿瘤的体积和重量,绘制移植瘤生长曲线。Real-time PCR、Western blot及免疫组织化学法检测裸鼠移植瘤中FABP5的表达。结果:LV-shRNA-FABP5可以降低Hep G2细胞FABP5的表达。3组裸鼠接种癌细胞后均有肿瘤形成。与空白对照组和阴性对照组相比,实验组肿瘤生长速度明显减慢,且体积及重量明显减小(P<0.05);实验组裸鼠肝癌移植瘤组织的FABP5 mRNA和蛋白表达水平相比空白对照组和阴性对照组表达明显下降(P<0.05)。结论:沉默FABP5基因表达能有效抑制人肝癌裸鼠移植瘤的生长。FABP5可能成为肝癌基因治疗的一个有效靶点。 展开更多
关键词 rna干扰 脂肪酸结合蛋白5 肝癌 裸鼠 移植瘤 基因治疗
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桑树钙调素蛋白基因MCaM-3的克隆及序列分析与诱导表达 被引量:3
18
作者 方荣俊 扈冬青 +6 位作者 杜伟 赵卫国 潘刚 张林 刘利 杨永华 程嘉翎 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期711-717,共7页
钙调素蛋白(calmodulin CaM)作为真核生物细胞内的多功能Ca2+结合蛋白,在调节植物的生长发育、环境适应性和抗逆性方面具有重要作用。利用桑树表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)克隆了一个编码桑树CaM基因的全长cDNA序列,命名... 钙调素蛋白(calmodulin CaM)作为真核生物细胞内的多功能Ca2+结合蛋白,在调节植物的生长发育、环境适应性和抗逆性方面具有重要作用。利用桑树表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)克隆了一个编码桑树CaM基因的全长cDNA序列,命名为MCaM-3(GenBank登录号:GQ303247)。序列分析表明,MCaM-3全长951bp,存在143 bp的5′端非翻译序列(5′-UTR)和358 bp的3′端非翻译序列(3′-UTR),其开放读码框(ORF)长450bp,编码149个氨基酸,预测蛋白质分子质量为16.85 kD,等电点为3.95。用在线软件SMART分析显示,MCaM-3蛋白含有4个Ca2+结合基序(EFh)结构域,可以结合Ca2+。同源分析表明,CaM基因在桑树与拟南芥、杨树、大豆、小麦、水稻、玉米各物种间具有很高的保守性。基于桑树和其它19个物种CaM基因的系统进化分析表明,桑树与蓖麻、烟草、大黄、樱桃的亲缘关系较近。半定量RT-PCR检测表明,与正常生长环境相比,MCaM-3基因mRNA的转录水平在低温、干旱、盐胁迫条件下均显著提高,初步推测MCaM-3基因与桑树的抗逆性有一定关联。 展开更多
关键词 桑树 钙调素蛋白基因 基因克隆 序列分析 Ca2+结合基序 逆境胁迫 诱导表达
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野桑蚕肌球蛋白轻链2基因(MLC2)的克隆和序列分析 被引量:3
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作者 许西奎 徐升胜 +2 位作者 李兵 许雅香 沈卫德 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期71-77,共7页
利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了野桑蚕间接飞行肌(in-direct flight muscle,IFM)的肌球蛋白轻链2(myosin light chain2,MLC2)基因(GenBank登录号:EU332913),其cDNA序列全长979 bp,包括63 bp的5′... 利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了野桑蚕间接飞行肌(in-direct flight muscle,IFM)的肌球蛋白轻链2(myosin light chain2,MLC2)基因(GenBank登录号:EU332913),其cDNA序列全长979 bp,包括63 bp的5′端非翻译区序列(5′-UTR)、603 bp的开放读码框(ORF)、终止密码子TAA和310bp的3′端非翻译区序列(3′-UTR)。克隆该基因的内含子序列并分析基因结构表明,该基因包括3个外显子和2个内含子,编码201个氨基酸,预测蛋白质分子质量约22.0 kD,等电点4.67。用在线软件SMART分析显示,野桑蚕MLC2蛋白有2个Ca2+结合基序(EFh)结构域,可以结合Ca2+,属于肌钙蛋白C超家族成员,并且含有保守的可以磷酸化的氨基酸残基,有可能具有磷酸化过程,参与肌动球蛋白ATPase活性的调节。 展开更多
关键词 野桑蚕 肌球蛋白轻链2基因 序列分析 Ca2+结合基序 磷酸化
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锌指蛋白A20 RNAi腺病毒的制备及其对人脑胶质瘤细胞系U87细胞功能的影响 被引量:1
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作者 郭庆东 张伟 +4 位作者 王春梅 李兵 曹卫东 李侠 章翔 《实用医学杂志》 CAS 2007年第9期1278-1281,共4页
目的:进一步探讨A20与促进脑胶质瘤恶性增殖和抗细胞凋亡之间的关系,尝试今后在动物体内进行脑胶质瘤基因治疗的研究,通过构建针对A20基因的重组腺病毒干涉载体感染U87细胞系,观察其对细胞生存状态的影响。方法:在前期预实验的基础上构... 目的:进一步探讨A20与促进脑胶质瘤恶性增殖和抗细胞凋亡之间的关系,尝试今后在动物体内进行脑胶质瘤基因治疗的研究,通过构建针对A20基因的重组腺病毒干涉载体感染U87细胞系,观察其对细胞生存状态的影响。方法:在前期预实验的基础上构建对A20干涉效果最好的腺病毒干涉表达载体pSilencerTM adeno 1.0-CMV-A20R1,通过HEK-293细胞的包装后收获腺病毒并进行纯化,最后用此腺病毒再次感染人脑胶质母细胞瘤细胞U87,经RT-PCR、Western blot确认干涉效果;通过流式细胞术(FCM)观察A20表达抑制对U87细胞周期和细胞凋亡的影响。结果:完成了重组腺病毒干涉表达载体pSilencerTM adeno 1.0-CMV-A20R1在HEK-293细胞内的包装;对病毒进行纯化后获得了高滴度(1.1×1011pfu/mL)的感染病毒,将其感染U87细胞系后,RT-PCR和Westernblot结果证实U87细胞中A20mRNA和蛋白的表达均受到明显抑制;FCM结果也证实U87-A20R1细胞内凋亡细胞明显增多。结论:重组A20腺病毒干涉载体可很好地抑制U87细胞内A20的表达且能导致细胞凋亡,该研究结果为临床上用新思路治疗脑胶质瘤提供了实验依据。 展开更多
关键词 神经胶质瘤 rna结合蛋白质类 锌指 基因
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