目的:探究食管鳞癌特异的超保守癌/睾丸(cancer/testis,CT)-LINC01424在食管鳞癌进展中的作用。方法:利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)及GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库系统筛选食管鳞癌特异的超保守CT特性的长链非编码RNA(l...目的:探究食管鳞癌特异的超保守癌/睾丸(cancer/testis,CT)-LINC01424在食管鳞癌进展中的作用。方法:利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)及GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库系统筛选食管鳞癌特异的超保守CT特性的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),运用核质分离实验和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA end,RACE)进行LINC01424细胞定位及序列鉴定;利用118例食管鳞癌样本数据进行预后分析;下调ECA109细胞系中LINC01424,以及上调KYSE410细胞系中LINC01424后,通过CCK-8实验、平板克隆法、Transwell实验和裸鼠成瘤动物实验研究CT-LINC01424在食管鳞癌细胞中的作用;进一步应用MEM(Multi Experiment Matrix)数据库进行下游基因的探索。结果:首次鉴定出食管鳞癌特异的超保守CT-LINC01424;临床资料分析显示,CT-LINC01424与食管鳞癌较差的临床分期及预后显著相关;降低LINC01424的表达可以抑制食管鳞癌细胞的增殖、侵袭能力,过表达LINC01424则会导致相反结果;此外,LINC01424与着丝粒相关1(kinetochore associated 1,KNTC1)基因存在显著共表达关系。结论:LINC01424在食管鳞癌组织中高表达,促进食管鳞癌细胞增殖和侵袭,并可能通过影响KNTC1的表达发挥其促癌作用。展开更多
文摘目的:探究食管鳞癌特异的超保守癌/睾丸(cancer/testis,CT)-LINC01424在食管鳞癌进展中的作用。方法:利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)及GTEx(Genotype-Tissue Expression)数据库系统筛选食管鳞癌特异的超保守CT特性的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA),运用核质分离实验和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of c DNA end,RACE)进行LINC01424细胞定位及序列鉴定;利用118例食管鳞癌样本数据进行预后分析;下调ECA109细胞系中LINC01424,以及上调KYSE410细胞系中LINC01424后,通过CCK-8实验、平板克隆法、Transwell实验和裸鼠成瘤动物实验研究CT-LINC01424在食管鳞癌细胞中的作用;进一步应用MEM(Multi Experiment Matrix)数据库进行下游基因的探索。结果:首次鉴定出食管鳞癌特异的超保守CT-LINC01424;临床资料分析显示,CT-LINC01424与食管鳞癌较差的临床分期及预后显著相关;降低LINC01424的表达可以抑制食管鳞癌细胞的增殖、侵袭能力,过表达LINC01424则会导致相反结果;此外,LINC01424与着丝粒相关1(kinetochore associated 1,KNTC1)基因存在显著共表达关系。结论:LINC01424在食管鳞癌组织中高表达,促进食管鳞癌细胞增殖和侵袭,并可能通过影响KNTC1的表达发挥其促癌作用。
