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CDH1受幽门螺杆菌感染调控及其在胃癌组织中表达分析 被引量:7
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作者 陈定宇 何小凤 +6 位作者 程薇 全欣莹 张瑜 赵艳 王琴容 周建奖 谢渊 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2022年第3期412-417,共6页
目的探究幽门螺杆菌(Hp)对E-钙黏蛋白(CDH1)表达的影响及CDH1在胃癌(GC)组织中的表达情况,为进一步探索CDH1在Hp引起胃癌中的作用提供理论基础。方法用Hp灌胃蒙古沙鼠,3、12、24个月后分别取其胃组织,进行免疫组化染色检测CDH1的表达;H... 目的探究幽门螺杆菌(Hp)对E-钙黏蛋白(CDH1)表达的影响及CDH1在胃癌(GC)组织中的表达情况,为进一步探索CDH1在Hp引起胃癌中的作用提供理论基础。方法用Hp灌胃蒙古沙鼠,3、12、24个月后分别取其胃组织,进行免疫组化染色检测CDH1的表达;Hp感染胃上皮细胞AGS,24 h后收集样本,Western blot检测各组CDH1的表达。通过TCGA和Kaplan-Meier Plotter数据库比较胃癌组织和癌旁组织中CDH1的表达差异及CDH1与胃癌的预后分析;通过R语言对CDH1基因进行KEGG富集分析;另收集胃癌组织和癌旁组织标本各10例,免疫组化染色检测CDH1的表达。结果Hp灌胃蒙古沙鼠胃组织免疫组化染色结果显示,Hp感染3、12、24个月胃组织CDH1阳性率分别为13.70%、13.20%、22.90%,对照组阳性率分别为0.04%、4.50%、4.77%,差异有统计学意义(P<0.05);与对照组比较,Hp感染AGS细胞组CDH1蛋白表达增高,差异有统计学意义(P<0.05);TCGA胃癌数据库中共收集449例具有临床病理参数的病例及其对应的CDH1 mRNA表达量,癌旁组织中CDH1 mRNA表达水平(76.36±0.48)显著低于胃癌组织中CDH1 mRNA的表达水平(147.59±0.11),差异有统计学意义(P<0.05);Kaplan-Meier Plotter数据库分析表明胃癌CDH1高表达时,生存率降低(P<0.05);KEGG富集显示CDH1表达与胃癌、甲状腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌、黑色素瘤等肿瘤相关,功能显著富集到细菌侵袭上皮细胞和黏附连接,通路显著富集到Apelin信号通路、Hippo信号通路和Rap1信号通路等;CDH1阳性率在人胃癌组织为76.27%,高于癌旁组织45.68%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论Hp感染引起CDH1表达水平升高,可能是Hp引起胃癌的原因之一。 展开更多
关键词 E-钙黏蛋白 幽门螺杆菌 TCGA kaplan-meier plotter KEGG 胃癌
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卵巢上皮性癌组织中长链非编码RNA PURPL的表达及其意义 被引量:2
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作者 何婷婷 张瑞涛 +4 位作者 史惠蓉 曹媛 冯巍 王文文 张微微 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2021年第19期979-982,共4页
目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier... 目的:检测长链非编码RNA PURPL(p53 upregulated regulator of p53 levels)在卵巢上皮性癌(epithelial ovarian cancer,EOC)组织中的表达情况,探讨其在卵巢癌发生发展中的作用。方法:选用开放医学数据库lncRNASNP2、GEPIA和Kaplan-Meier Plotter检索PURPL在EOC组织中的表达及其与预后的关系。收集2012年10月至2015年10月郑州大学第一附属医院105例患者的临床病理资料,其中包括正常卵巢组织20例、良性卵巢上皮性肿瘤组织20例、EOC组织65例,采用实时荧光定量PCR检测上述不同卵巢组织中的PURPL表达情况,分析EOC组织中PURPL表达与EOC临床病理指标的关系,Kaplan-Meier法分析PURPL表达对EOC患者生存的影响。结果:数据库检索显示,EOC组织中PURPL的表达显著高于正常卵巢组织,PURPL表达升高与EOC患者的总生存(overall survival,OS)率和无复发生存期(recurrence-free survival,RFS)缩短相关。实时荧光定量PCR检测显示,晚期EOC组织中的PURPL表达为0.530±0.004,显著高于正常卵巢组织的0.029±0.001、良性卵巢上皮性肿瘤组织的0.135±0.001和早期EOC组织的0.488±0.006的表达(P<0.0001)。临床分期越晚(χ2=10.785,P=0.001)、有淋巴结转移(χ2=4.481,P=0.034)的EOC组织中的PURPL高表达。PURPL表达水平相对较高的EOC患者的OS和RFS,明显短于PURPL表达水平相对较低的患者(P<0.05)。结论:PURPL高表达提示EOC患者预后不良,可作为EOC预后监测的潜在标记物。 展开更多
关键词 卵巢上皮性癌 医学数据库lncRNASNP2 GEPIA数据 kaplan-meier plotter数据库 PURPL预后
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LRP8在胃癌中的表达及其在胃癌发生过程中的作用 被引量:4
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作者 刘斌 郑鹏远 +4 位作者 米阳 任飞飞 高爽 刘传 李发展 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期285-293,共9页
背景与目的:低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在肝癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤发生中起重要作用,分析LRP8在胃癌中的表达及其意义,探讨LRP8作为胃癌生物治疗新靶点的可... 背景与目的:低密度脂蛋白受体相关蛋白8(low-density lipoprotein receptor-related protein 8,LRP8)在肝癌、肺癌、乳腺癌、结直肠癌等多种肿瘤发生中起重要作用,分析LRP8在胃癌中的表达及其意义,探讨LRP8作为胃癌生物治疗新靶点的可能性。方法:利用人类癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和基因表达汇编(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库分析LRP8在胃癌组织中的表达;对胃癌中与LRP8共表达的基因进行基因本体(GeneOntology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;利用RNA干扰技术及细胞功能实验,测定LRP8表达对胃癌细胞系AGS增殖和迁移能力的影响,并检测LRP8敲低对Wnt信号通路活性的影响。利用Kaplan-Meier plotter数据库分析LRP8高低表达与胃癌患者预后的相关性;分析TCGA数据库中240例和郑州大学第五附属医院2018年8月—2019年7月行全胃切除术或部分切除术的25例胃癌患者LRP8表达及其与临床病理学特征之间的关系。结果:TCGA数据库中胃癌组织中LRP8表达高于正常胃黏膜,差异有统计学意义(P<0.000 1),GEO数据库中3项研究结果一致(P<0.05)。细胞功能实验表明,AGS细胞系中沉默LRP8表达后,相比对照组,si-LRP8组AGS细胞在体外增殖率和迁移率下降(P<0.05),且Wnt通路下游关键靶点β-catenin、LRP5、POU5F1、CCND1、AXIN2表达下调(P<0.05);KaplanMeier plotter数据库中两项芯片的生存分析显示,LRP8高表达患者预后不良(均P<0.05);TCGA数据库中分析显示,LRP8高表达与胃癌患者年龄呈正相关(P<0.001);回顾性分析显示LRP8高表达与胃癌分期正相关(P=0.034)。结论:LRP8在胃癌中高表达,并通过影响Wnt/β-catenin信号转导通路促进胃癌细胞恶性行为。LRP8的高表达与胃癌患者的远期生存率下降相关,有望成为胃癌患者治疗或预后的生物学标志物。 展开更多
关键词 胃癌 低密度脂蛋白受体相关蛋白8 人类癌症基因组图谱 基因表达汇编 kaplan-meier plotter 细胞功能实验 WNT信号通路
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基于Oncomine数据库分析ENO1在卵巢癌中的表达及其预后价值
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作者 张涛红 熊莉莉 +3 位作者 王小伟 王伟红 刘英 安瑞芳 《海南医学院学报》 CAS 2019年第18期1405-1409,共5页
目的:拟探讨α-烯醇化酶(α-enolase,ENO1)在卵巢癌中的表达及其预后意义。方法:收集Oncomine数据库中关于ENO1的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,对其在卵巢癌中的作用进行荟萃分析,同时利用Kaplan-Meier Plotter进行卵巢癌患... 目的:拟探讨α-烯醇化酶(α-enolase,ENO1)在卵巢癌中的表达及其预后意义。方法:收集Oncomine数据库中关于ENO1的信息,并对目前数据库中资料进行二次分析,对其在卵巢癌中的作用进行荟萃分析,同时利用Kaplan-Meier Plotter进行卵巢癌患者生存分析。结果:Oncomine数据库中共有14项研究涉及ENO1在卵巢癌组织和正常组织中的表达,共包括1 001个样本。与对照组相比,ENO1在卵巢癌组织中高表达(P<0.05)。高表达ENO1的卵巢癌患者总体生存率较高,而低表达ENO1的卵巢癌患者预后较差(P<0.05)。进一步亚组分析发现,ENO1表达水平对浆液性卵巢癌患者预后有显著影响,而在子宫内膜样卵巢癌患者中,其表达水平对预后无显著影响(P<0.05)。结论:通过对Oncomine基因芯片数据库中肿瘤相关基因信息的深入挖掘,发现ENO1在卵巢癌中高表达,且与卵巢癌的预后有关,可作为肿瘤预后标志物及替代药物治疗的新靶点。 展开更多
关键词 卵巢癌 Oncomine数据库 α-烯醇化酶(ENO1) 总体生存率 kaplan-meier plotter数据库
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胃癌中RNA解旋酶DDX19A的表达及临床意义
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作者 张美智子 郭佳雯 +1 位作者 周丽丽 程玉 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期899-904,共6页
背景与目的:RNA解旋酶DDX19A(DEAD-box helicases 19A)是DDX蛋白超家族的成员之一,主要参与RNA的转运过程。该家族的许多成员参与肿瘤的发生及发展过程,然而关于DDX19A在胃癌中的作用,目前尚未见报道。结合生物信息学分析,探讨胃癌组织... 背景与目的:RNA解旋酶DDX19A(DEAD-box helicases 19A)是DDX蛋白超家族的成员之一,主要参与RNA的转运过程。该家族的许多成员参与肿瘤的发生及发展过程,然而关于DDX19A在胃癌中的作用,目前尚未见报道。结合生物信息学分析,探讨胃癌组织中DDX19A的表达情况及临床意义。方法:采用UALCAN数据库,转录水平分析胃癌及癌旁胃组织中DDX19A的表达差异,进一步分析其在胃癌中的表达及与临床分期的关系;采用Kaplan-Meier Plotter数据库分析DDX19A表达水平与胃癌患者总生存期(overall survival,OS)及无病生存期(disease-free survival,DFS)的相关性。采用蛋白质印迹法(Western blot)检测16对冻存的新鲜胃癌组织及配对癌旁胃黏膜中DDX19A蛋白的表达。收集2011—2015年承德医学院附属医院病理科存档的胃癌石蜡包埋标本109例、癌旁胃黏膜标本30例,所有患者临床病理学资料完整。免疫组织化学S-P四步法检测109例胃癌及30例癌旁胃黏膜中DDX19A蛋白的表达,分析其高表达与胃癌临床病理学特征及预后的关系。结果:UALCAN及Kaplan-Meier Plotter数据库检索结果显示,DDX19A mRNA在胃癌组织中的表达明显高于癌旁胃组织(P<0.01),其高表达与胃癌临床分期及患者不良预后正相关(P<0.05)。Western blot结果显示,胃癌组织中DDX19A蛋白显著高表达(P<0.01)。免疫组织化学结果显示,胃癌组织中的DDX19A阳性表达率为68.8%(75/109),显著高于其在癌旁胃黏膜中的表达(33.3%,10/30),差异有统计学意义(P<0.01)。DDX19A高表达与胃癌分化程度、浸润深度、TNM分期密切相关(P<0.05),而与患者性别、年龄、肿瘤大小、淋巴结转移无关(P>0.05)。69例随访资料完整的病例中,DDX19A高表达患者的OS明显短于低表达患者(P<0.05)。结论:DDX19A在胃癌组织中明显高表达,并且其高表达与胃癌临床分期、侵袭性及患者不良预后相关。DDX19A有望成为与胃癌预后相关的潜在生物标志物及治疗的新靶点。 展开更多
关键词 胃肿瘤 DDX19A 预后 UALCAN kaplan-meier plotter
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