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基于51K液相探针构建国外松良种的DNA指纹图谱
1
作者 吴亚荻 刁姝 +2 位作者 丁显印 黄琴韵 栾启福 《林业科学》 北大核心 2025年第6期109-119,共11页
【目的】由于国外松在苗期的形态特征十分相似,区分这些良种具有一定的挑战性。本研究旨在构建一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,为国外松种质资源管理、良种知识产权保护等提供技术支持。【方法】本研究以38份国外松本种及其杂种松良... 【目的】由于国外松在苗期的形态特征十分相似,区分这些良种具有一定的挑战性。本研究旨在构建一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,为国外松种质资源管理、良种知识产权保护等提供技术支持。【方法】本研究以38份国外松本种及其杂种松良种为材料,利用湿地松和火炬松的51K液相探针芯片进行SNPs捕获,获得38个国外松改良品种的基因型数据。通过次要等位基因频率、缺失率、杂合率和多态性信息含量等遗传参数筛选能够高效识别国外松种质资源的核心SNPs;根据PIC值进一步简化SNP标记的数量,达到较少数量的SNPs能高效识样本的目的。【结果】通过SNP位点捕获和基因分型,共得到560,567个SNPs位点,筛选得到344个核心SNPs,并利用PIC值进一步精简为20个SNPs,能够高效区分湿地松、火炬松、加勒比松及其杂交松,成功建立了38个松树良种的DNA指纹图谱。【结论】开发了一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,建立了指纹图谱鉴定国外松及其良种的方法,可为良种知识产权保护、种质管理和系谱分析提供技术支持。 展开更多
关键词 dna指纹图谱 品种鉴别 湿地松 火炬松
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大杯蕈遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建
2
作者 吴碧君 邱春锦 +3 位作者 卢翠香 郑永德 曾丽兰 刘小英 《热带农业科学》 2025年第6期56-64,共9页
为了解大杯蕈种质资源的遗传多样性,加快大杯蕈良种选育进程,以10株大杯蕈菌株为试验材料,调查其农艺性状,采用拮抗试验和ISSR、RAPD、SRAP分子标记,分析10株大杯蕈菌株间的遗传多样性,基于3种分子标记扩增结果进行指纹图谱构建。农艺... 为了解大杯蕈种质资源的遗传多样性,加快大杯蕈良种选育进程,以10株大杯蕈菌株为试验材料,调查其农艺性状,采用拮抗试验和ISSR、RAPD、SRAP分子标记,分析10株大杯蕈菌株间的遗传多样性,基于3种分子标记扩增结果进行指纹图谱构建。农艺性状聚类分析显示,在欧氏距离2.5时,10份大杯蕈菌株被分为4类。筛选出的8个ISSR引物、10个RAPD引物、12对SRAP引物分别扩增出清晰条带111、121、166条,多态性比率ISSR(81.98%)>SRAP(77.71%)>RAPD(66.12%)。基于3种分子标记的综合聚类结果,当遗传相似系数为0.76时,10份大杯蕈种质菌株被分为4类,具有相似遗传背景的菌株聚为一类。10份供试菌株具有较丰富的遗传多样性,农艺性状聚类结果、拮抗试验与3种分子标记的综合聚类结果基本一致。ISSR分子标记的聚类结果与菌株间遗传背景更吻合,且ISSR引物组合可用于构建DNA指纹图谱。研究结果可为大杯蕈菌株鉴定和亲缘关系分析提供依据。 展开更多
关键词 大杯蕈 分子标记 遗传多样性 dna指纹图谱
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基于KASP-SNP的辣椒品种辣美11号DNA指纹图谱构建和种子纯度检测
3
作者 胡宗伟 宗琛 +3 位作者 戴蕾 魏周颖 戴祖云 杨中周 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第4期45-52,共8页
为向辣椒杂交种子品种识别、纯度鉴定等工作提供更为高效、可靠的方法,基于辣椒全基因组开发的65对核心SNP标记,通过KASP-SNP技术对辣椒品种辣美11号及其双亲进行基因分型。利用条码在线生成软件将遗传信息转化为二维码,完成了辣美11号... 为向辣椒杂交种子品种识别、纯度鉴定等工作提供更为高效、可靠的方法,基于辣椒全基因组开发的65对核心SNP标记,通过KASP-SNP技术对辣椒品种辣美11号及其双亲进行基因分型。利用条码在线生成软件将遗传信息转化为二维码,完成了辣美11号及其双亲的种质身份证的构建。利用CaSNP10和CaSNP11两个分子标记检测辣美11号的纯度为98.4%,同时通过对比SSR分子标记以及田间纯度鉴定结果,验证了结果的可靠性。本研究实现了辣椒品种辣美11号的高通量检测,为实现辣椒品种权保护及高通量背景下辣椒的品种纯度鉴定提供了可靠依据。 展开更多
关键词 辣椒 dna指纹图谱 品种纯度 KASP SNP SSR
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50份无花果种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 被引量：6
4
作者 卢立媛 阮树安 +4 位作者 杨伟聪 刘晗琪 刘振盼 张永华 孙阳 《中国果树》 2024年第1期45-51,共7页
为探究国内外无花果遗传多样性并对种质资源进行鉴定,利用15对SSR分子标记引物对50份无花果种质资源从DNA水平上进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。结果表明,15对SSR引物在50份无花果种质资源中共扩增出67个等位基因,等位基因数范... 为探究国内外无花果遗传多样性并对种质资源进行鉴定,利用15对SSR分子标记引物对50份无花果种质资源从DNA水平上进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。结果表明,15对SSR引物在50份无花果种质资源中共扩增出67个等位基因,等位基因数范围为2~8个,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均值分别为0.5947和0.5703,Shannon’s多态性信息指数(I)平均值为1.0452,多态性信息含量指数(PIC)变化范围为0.2411~0.7353,平均为0.5101,表明无花果种质资源具有丰富的遗传多样性。50份无花果种质资源之间的遗传距离为0~0.68,平均为0.39,与其他种质资源遗传距离最大的为哈代。基于SSR分子标记结果,利用UPGMA方法对50份无花果种质资源进行聚类分析,根据遗传距离可将50份无花果种质资源分为四大类,第Ⅰ类为哈代,第Ⅱ类为斯特拉,第Ⅲ类为梦幻甜蜜,其余无花果种质资源划归为第Ⅳ类。构建了26份无花果种质资源的SSR指纹图谱,可用于品种鉴定,以期为无花果分子辅助育种提供科学依据。 展开更多
关键词 无花果 SSR 遗传多样性 聚类分析 dna指纹图谱
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基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 被引量：1
5
作者 王宏利 赵久成 +5 位作者 赖淼 卢家仕 凌启昌 肖锦华 张华 付鑫锋 《中国瓜菜》 CAS 北大核心 2024年第4期36-45,共10页
为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8... 为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT12和SCoT83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。 展开更多
关键词 黄瓜 SCoT分子标记 亲缘关系 遗传多样性 dna指纹图谱
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基于SCoT分子标记分析白术种质资源遗传多样性及DNA指纹图谱构建 被引量：1
6
作者 李晴 石雨荷 +3 位作者 朱珏 李晓玲 侯超文 童巧珍 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期142-151,共10页
【目的】采用SCoT分子标记技术对17份白术种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,为白术种质的鉴定、保存和新品种选育提供一定的理论依据。【方法】从92条SCoT引物中筛选得到13条核心引物用于白术分子标记,利用Popgene1.32软件... 【目的】采用SCoT分子标记技术对17份白术种质资源进行遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建,为白术种质的鉴定、保存和新品种选育提供一定的理论依据。【方法】从92条SCoT引物中筛选得到13条核心引物用于白术分子标记,利用Popgene1.32软件和NTSYS-pc 2.10e软件进行白术种质资源多样性分析和聚类分析,以核心引物SCoT-9、SCoT-12和SCoT-41组合构建白术DNA分子指纹图谱。【结果】13条SCoT核心引物扩增17份白术样品共得到192条条带,其中,多态性条带165条,平均百分率85.94%;遗传相似系数(GS)和遗传距离(GD)分别介于0.5781-0.8750和0.1335-0.5480,白术种质的观测等位基因数(Na)为1.8594,有效等位基因数(Ne)为1.4180,Nei's遗传多样性指数(He)为0.2563,Shannon信息指数(I)为0.3968,聚类分析得到白术栽培品一类,而大围山野生品被单独聚为一类;所构建的17份白术种质资源DNA指纹图谱,可以将样品区分并准确鉴定。【结论】白术种质资源具有较为丰富的遗传多样性,但不同产地白术栽培品之间遗传差异低,表明地理位置并不是判断白术亲缘关系远近的决定性因素。 展开更多
关键词 白术 SCoT分子标记 遗传多样性分析 dna指纹图谱
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基于ISSR标记的南瓜遗传多样性与DNA指纹图谱研究 被引量：2
7
作者 王加龙 马坤 +3 位作者 周静 朱金芳 高鹏 黄凤娇 《河南农业科学》 北大核心 2024年第12期119-130,共12页
以31份南瓜种质资源为试材,利用筛选得到的7条多态性丰富的内部简单重复序列(ISSR)引物,分析31份南瓜材料的遗传多样性并建立DNA指纹图谱,为南瓜品种鉴定、种质资源保护及创新提供理论依据。结果表明,7条ISSR引物共扩增出73个条带,其中... 以31份南瓜种质资源为试材,利用筛选得到的7条多态性丰富的内部简单重复序列(ISSR)引物,分析31份南瓜材料的遗传多样性并建立DNA指纹图谱,为南瓜品种鉴定、种质资源保护及创新提供理论依据。结果表明,7条ISSR引物共扩增出73个条带,其中多态性条带72个,多态性条带占比为98.63%;平均观测等位基因数、平均有效等位基因数、平均Nei’s基因多样性指数、平均Shannon’s多样性信息指数分别为1.9863、1.5704、0.3299、0.4944;种间遗传相似系数为0.12~0.89,平均值为0.46。非加权组平均法聚类分析显示,31份南瓜材料在遗传相似系数为0.46处被分为中国南瓜、美洲南瓜和印度南瓜3类。利用引物UBC811和引物UBC843扩增的14个多态性位点构建31份南瓜材料的DNA指纹图谱,图谱中31份南瓜材料均具有唯一性,可用于南瓜的分子鉴定。综上,31份南瓜材料的遗传多样性丰富,中国南瓜与美洲南瓜亲缘关系较近,二者与印度南瓜亲缘关系较远,可为南瓜种质资源保护和品种创新提供科学依据;基于ISSR分子标记技术构建的南瓜DNA指纹图谱,可为南瓜品种鉴定提供新的途径。 展开更多
关键词 南瓜 ISSR 遗传多样性 dna指纹图谱 品种鉴定
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基于核心KASP标记的江苏粳稻品种DNA指纹图谱构建
8
作者 朱小品 徐婷婷 +7 位作者 孟珊 杨雪 杨欣 朱银 狄佳春 郭春滨 王宁 颜伟 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期1569-1585,共17页
为了建立江苏粳稻品种DNA指纹图谱数据库,本研究利用水稻10K液相芯片对314份来源广泛的水稻种质资源进行SNP基因分型,筛选出一系列高多态性的SNP位点并开发出122个KASP标记。利用122个KASP标记对38份江苏粳稻品种进行检测,以多态性信息... 为了建立江苏粳稻品种DNA指纹图谱数据库,本研究利用水稻10K液相芯片对314份来源广泛的水稻种质资源进行SNP基因分型,筛选出一系列高多态性的SNP位点并开发出122个KASP标记。利用122个KASP标记对38份江苏粳稻品种进行检测,以多态性信息量(PIC)>0.3,最小等位基因频率(MAF)>0.2,检出率>0.9为筛选标准,筛选出56个具有高效鉴别效率的核心KASP标记。遗传距离相关性分析结果表明,基于56个核心KASP标记的江苏粳稻品种的遗传距离与基于122个高多态性KASP标记的的江苏粳稻品种的遗传距离相关系数为89.1%,呈极显著正相关(P<0.01),表明56个核心标记可以有效代替122个高多态性标记进行品种鉴定。进一步利用56个核心KASP标记对102份江苏粳稻品种的遗传多样性进行分析,并构建了102份品种的DNA指纹图谱和分子身份证二维码,本研究结果为江苏地区粳稻品种鉴定、选育和种质资源高效利用提供了参考。 展开更多
关键词 水稻 KASP标记 dna指纹图谱 品种鉴定 遗传多样性分析
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52份枇杷种质资源遗传多样性分析与DNA指纹图谱构建
9
作者 赵科 孙淑霞 +7 位作者 李靖 涂美艳 王玲利 何成勇 徐子鸿 江国良 宋海岩 陈栋 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期242-249,共8页
【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法,为枇杷种质资源发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST⁃SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记,对52份国内外枇杷种质资源和国家西南特色园艺作物种质资源圃(成都)枇杷育种与栽培创新团队创制的... 【目的】丰富枇杷种质资源鉴定方法,为枇杷种质资源发掘和利用提供理论依据。【方法】利用277对EST⁃SSR标记和1对果肉颜色相关InDel标记,对52份国内外枇杷种质资源和国家西南特色园艺作物种质资源圃(成都)枇杷育种与栽培创新团队创制的杂交后代进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。【结果】筛选出扩增带型清晰、稳定性和重复性好的9对引物,每对引物扩增条带为2~5条,平均85条;多态性条带比率为40.00%~100.00%,平均71.55%;多态性信息含量(PIC)为0.250~0.999,平均0.685。遗传多样性分析显示,52份枇杷种质资源和创制的杂交后代的平均相似系数为0.791;果肉颜色一致或地理分布相近的枇杷种质资源被聚类到相近的分类单元,并且可以准确地将西班牙、日本枇杷种质资源与其他种质资源进行区分。此外,本研究还构建了52份枇杷种质资源的DNA指纹图谱和色块矩阵。【结论】丰富了枇杷种质资源鉴定的分子标记,为今后发掘分子标记紧密连锁的功能基因或片段提供了理论依据。 展开更多
关键词 枇杷 分子标记 dna指纹图谱 遗传多样性
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50种石斛种质资源的遗传多样性及DNA指纹图谱构建
10
作者 江荣慧 田凡 +2 位作者 王莲辉 罗在柒 颜凤霞 《贵州农业科学》 CAS 2024年第7期63-70,共8页
【目的】分析国内外引种石斛种质资源遗传多样性,揭示不同种质间的亲缘关系,为促进石斛种质的有效利用及保护提供参考。【方法】利用ISSR分子标记技术对杯鞘石斛、金钗石斛、檀香石斛等50种石斛进行遗传多样性和亲缘关系研究分析,并构建... 【目的】分析国内外引种石斛种质资源遗传多样性,揭示不同种质间的亲缘关系,为促进石斛种质的有效利用及保护提供参考。【方法】利用ISSR分子标记技术对杯鞘石斛、金钗石斛、檀香石斛等50种石斛进行遗传多样性和亲缘关系研究分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】9条多态性高、重复性好的引物共扩增出112个等位基因,其中,多态性位点102个,多态性比率为93.09%。检测的位点数为9~14,平均为12.44;50种石斛属植物的遗传相似系数为0.15~0.95。聚类分析显示,在遗传相关系数0.70处,可将石斛材料分为12个大组。PCR扩增显示,引物UBC808可将50种石斛完全区分开,基于其扩增的14个清晰的多态性条带构建50种石斛的DNA指纹图谱。【结论】50种石斛种间具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 石斛 ISSR 遗传多样性 多态性 dna指纹图谱
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利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱 被引量：42
11
作者 齐兰 王文泉 +2 位作者 张振文 叶剑秋 李开绵 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1642-1648,共7页
利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行... 利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,以遗传相似系数0.734为阈值,可将18份供试材料分为4组;选用2对多态性引物Me1-Em5和Me24-Em10,初步构建了18份木薯品种的指纹图谱,根据条带的有无转换为0、1二进制编码形成数字指纹,每个品种拥有唯一的数字指纹区别于其他品种,置信概率达到99.999%。结果表明,采用SRAP标记建立的指纹图谱适用于木薯品种的分类和鉴定。 展开更多
关键词 木薯 SRAP dna指纹图谱
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贵州地方火龙果芽变种质DNA指纹图谱及遗传多样性的ISSR分析 被引量：30
12
作者 张冰雪 范付华 +3 位作者 乔光 宋莎 文晓鹏 刘涛 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期573-577,共5页
【目的】为了构建火龙果芽变种质的DNA指纹图谱,并揭示种质间的遗传关系,【方法】以贵州近几年选育的一些优良火龙果种质为试材,采用ISSR标记技术和NTSYS 2.01软件对这些新种质及其原始品种进行分析。【结果】利用筛选出的52条引物进行... 【目的】为了构建火龙果芽变种质的DNA指纹图谱,并揭示种质间的遗传关系,【方法】以贵州近几年选育的一些优良火龙果种质为试材,采用ISSR标记技术和NTSYS 2.01软件对这些新种质及其原始品种进行分析。【结果】利用筛选出的52条引物进行PCR扩增,共扩增出364个清晰、重复性好的标记,其中215个（60%）为多态性标记。M08、845和881等3个引物扩增出的标记能将22份种质区分开来。采用NTSYS 2.01软件计算,供试种质间的相似性系数为0.70~0.96,平均0.81,其中红肉种质间平均值为0.82,白肉为0.89。UPGMA聚类分析显示,在相似系数0.9处可将供试材料分为11类,其中7份分别各自聚类（红肉占86%）。【结论】火龙果体细胞变异率较高,且红肉品种高于白肉品种,通过芽变选种能有效地实现遗传改良。 展开更多
关键词 火龙果 贵州 ISSR 遗传多样性 dna指纹图谱
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新陆早棉花品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 被引量：29
13
作者 聂新辉 尤春源 +6 位作者 李晓方 秦江鸿 黄聪 郭欢乐 王夏青 赵文霞 林忠旭 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2104-2117,共14页
以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料,从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上（每条染色体上选择2-3对）的75对核心引物,检测到多态性位点226个,每个标记检测到的基因型位点数在2-12之间... 以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料,从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上（每条染色体上选择2-3对）的75对核心引物,检测到多态性位点226个,每个标记检测到的基因型位点数在2-12之间,平均为3.01个;引物多态信息量（PIC）值介于0.0799-0.8752之间,平均值为0.6624。结果显示,在51份新陆早棉花常规品种中,可利用特征引物将21份品种一次性区分开。利用40对引物可以完全区分开新陆早51份常规品种,并构建供试品种的指纹图谱。同时利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明,51个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为0.4269-0.9873,平均值为0.7071,说明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄;遗传相似系数矩阵和聚类分析将51个新陆早品种分为4大类型,与原品种选育系谱高度吻合。 展开更多
关键词 新陆早常规品种 SSR dna指纹图谱 遗传多样性
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中国鸭茅主栽品种DNA指纹图谱构建 被引量：29
14
作者 蒋林峰 张新全 +4 位作者 黄琳凯 马啸 罗登 张宗瑜 蒙芬 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期604-614,共11页
利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特... 利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特异条带6个,平均多态性比率94.03%,多态性信息量均值0.845,Shannon指数变幅0.4479～0.6549,基因多样性指数变幅0.2946～0.4633,可鉴别的品种数2～21个；利用24个SCoT引物在供试材料中共检测到321个条带,其中多态性条带为249个,品种特异条带6个,平均多态性比率76.33%,多态性信息量均值0.907,Shannon指数变幅0.2588～0.6329,基因多样性指数变幅0.1695～0.4451,可鉴别的品种数1～21个；5对SSR引物和5个SCoT引物在10个品种上具有唯一特征谱带,最终综合各项指标筛选出5个引物（A01E14、A01K14、B03E14、D02K13和SCoT23）上的37个条带用于鸭茅品种DNA指纹图谱构建,数据库中每个品种均具有唯一DNA指纹编码,构建的DNA指纹数据可用于鸭茅品种真伪鉴定,为品种权保护提供了科学依据。 展开更多
关键词 鸭茅 主栽品种 SSR SCoT dna指纹图谱 遗传多样性
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采用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群结构特征 被引量：21
15
作者 乔德才 陈敬 +2 位作者 魏桂芳 王凌华 赵立平 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期517-521,共5页
目的 :用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群区系结构的特征。方法 :对 7名中长跑运动员进行连续 6天的跟踪观察 ,直接从其粪便样品中提取出总DNA为模板 ,进行ERIC-PCR扩增 ,得到反映肠道微生物菌群结构特征的DNA指纹图。结果 :... 目的 :用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群区系结构的特征。方法 :对 7名中长跑运动员进行连续 6天的跟踪观察 ,直接从其粪便样品中提取出总DNA为模板 ,进行ERIC-PCR扩增 ,得到反映肠道微生物菌群结构特征的DNA指纹图。结果 :根据图谱多样性指数变化和相似性系数值的分布特征 ,受试运动员表现出两种类型 :一类菌群区系结构稳定 ,受运动负荷变化影响较小 ;另一类菌群区系结构随运动负荷的增减出现较大波动。结果表明 :运动员DNA指纹图谱特征存在明显个体差异 ;运动负荷的变化可能改变运动员肠道菌群区系结构。提示稳定的菌群结构可能是运动员在剧烈运动条件下保持良好机能状态的重要因素之一。 展开更多
关键词 肠道菌群 dna指纹图谱 取出 改变 剧烈运动 观察 中长跑运动员 运动负荷 特征 技术分析
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东北地区水稻区试新品种的DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量：26
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作者 陈英华 侯昱铭 +3 位作者 李宏宇 李茂柏 袁媛 徐正进 《种子》 CSCD 北大核心 2009年第3期28-35,共8页
构建DNA指纹图谱对新品种登记注册、种子质量鉴定、品种权益保护、遗传资源评价等具有重要的意义。本研究从500对SSR引物中筛选出10对核心引物,用于构建东北地区近两年区域试验品种的DNA指纹图谱。遗传多样性分析结果显示,在100对多态... 构建DNA指纹图谱对新品种登记注册、种子质量鉴定、品种权益保护、遗传资源评价等具有重要的意义。本研究从500对SSR引物中筛选出10对核心引物,用于构建东北地区近两年区域试验品种的DNA指纹图谱。遗传多样性分析结果显示,在100对多态性位点上只检测到300个等位基因,平均每个位点的等位基因数是仅为3个,平均PIC值为0.375 3,平均Shannon-Weiner多样性指数为0.644 5,明显低于国内其它稻区水平。因此,认为东北地区当前的种质资源遗传多样性相对狭窄。 展开更多
关键词 dna指纹图谱 SSR分子标记 水稻 遗传多样性 东北地区
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兼容型maizeSNP384标记筛选与玉米杂交种DNA指纹图谱构建 被引量：12
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作者 田红丽 杨扬 +7 位作者 王璐 王蕊 易红梅 许理文 张云龙 葛建镕 王凤格 赵久然 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1006-1015,共10页
为加强玉米品种管理和知识产权保护,评估确定了一套兼容多技术平台,适于玉米分子鉴定的SNP位点组合,该组合包含384个位点;构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,并针对位点和样品从各个角度进行分析。384个位点全部分布在基因内区域,显示... 为加强玉米品种管理和知识产权保护,评估确定了一套兼容多技术平台,适于玉米分子鉴定的SNP位点组合,该组合包含384个位点;构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,并针对位点和样品从各个角度进行分析。384个位点全部分布在基因内区域,显示了较好的多态性;MAF、PIC、DP平均值分别为0.39、0.36、0.60,384个位点中88%的位点MAF值高于0.30,98%的位点PIC值高于0.30,98%的位点DP值高于0.50。对335个玉米杂交种进行遗传相似系数两两比较,GD(1−Nei遗传距离)的变异范围为0.60~0.99,GD≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.10%、0.38%、1.40%;GS(相同等位基因比)的变异范围为0.50~0.99,GS≥0.98、0.95、0.90者分别占比0.03%、0.11%、0.35%。从384个位点中抽取最优位点组合,12个位点组合时品种识别率为0.99,20个位点组合能够识别335个品种。综上所述,本研究报道的384个核心SNP位点具有兼容多平台、高稳定性、高重复性、高品种区分能力,利用核心位点构建了335个玉米杂交种SNP-DNA指纹,为玉米品种分子鉴定、指纹数据构建以及分子育种提供了关键数据支撑。 展开更多
关键词 玉米 SNP 位点组合 品种分子鉴定 dna指纹图谱 芯片
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新疆枸杞种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建 被引量：20
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作者 查美琴 赵玉玲 +3 位作者 李疆 朱瑜 罗淑萍 胡月 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期1065-1071,共7页
利用SCoT分子标记对新疆枸杞种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,为杂交育种和种质鉴定提供理论依据。结果显示：9条SCoT引物扩增出条带256条,其中219条为多态性条带,多态性比率达85.62%,多态性信息含量（PIC）值变化范围在0.... 利用SCoT分子标记对新疆枸杞种质资源进行遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,为杂交育种和种质鉴定提供理论依据。结果显示：9条SCoT引物扩增出条带256条,其中219条为多态性条带,多态性比率达85.62%,多态性信息含量（PIC）值变化范围在0.77-0.91之间,平均值为0.85,观测等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Nei＇s基因多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）的平均值分别为1.8562、1.4350、0.2611、0.3989,聚类分析表明,遗传相似系数变化范围在0.5938-0.8398之间,在遗传相似系数为0.66和0.71处,可将30份材料分别分为2大类和4个亚类,主坐标分析结果和聚类结果基本一致,同时利用5条多态性SCoT引物构建了30份材料的DNA指纹图谱。新疆枸杞种质资源遗传多样性水平较高,且SCoT分子标记适于新疆枸杞种质资源遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建,该研究结果为新疆枸杞种质资源评价、鉴定和新品种选育奠定了基础。 展开更多
关键词 枸杞 SCoT 种质资源 遗传多样性 dna指纹图谱
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基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建 被引量：17
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作者 罗忠霞 房伯平 +7 位作者 李茹 王章英 黄立飞 陈景益 张雄坚 李育军 陈新亮 黄实辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期810-814,共5页
采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5～19个不... 采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5～19个不等,平均为9.94个,多态性信息含量变化范围为0.6235～0.9593,平均为0.7991。选择带型清晰、重复性好、易于统计且能将52份资源完全区分开的2对引物组合构建供试资源的DNA指纹图谱。NTSYS软件聚类分析表明,EST-SSR标记能正确反映出不同资源间的亲缘关系,为构建甘薯大型DNA指纹图谱数据库奠定了基础。 展开更多
关键词 甘薯 种质资源 EST-SSR dna指纹图谱
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基于SRAP标记的薏苡种质资源遗传多样性及DNA指纹图谱构建 被引量：18
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作者 夏法刚 黄金星 +5 位作者 季彪俊 詹福杨 谢萍萍 邓邦柱 林宏 郑金贵 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期413-420,共8页
利用SRAP分子标记对从各主要产地收集到的90份薏苡种质进行遗传多样性分析,其中68份收集于福建省,6份来自中国台湾,16份来自浙江、辽宁、山东、河南、云南、江苏、湖南、广东、上海等省(市)。结果表明,从88对SRAP引物组合中筛选出26对... 利用SRAP分子标记对从各主要产地收集到的90份薏苡种质进行遗传多样性分析,其中68份收集于福建省,6份来自中国台湾,16份来自浙江、辽宁、山东、河南、云南、江苏、湖南、广东、上海等省(市)。结果表明,从88对SRAP引物组合中筛选出26对引物进行SRAP扩增,共扩增出185条带,其中具有多态性的有157,占总数的84.86%,表明90份薏苡种质表现出丰富的遗传多样性。基于SRAP标记利用系统聚类法将90份薏苡种质资源分为4大类,与形态性状分类结果有一定的相似性;利用16对SRAP引物构建了73份薏苡种质资源的DNA指纹图谱,为薏苡遗传研究、品种选育与资源保护提供了依据。 展开更多
关键词 薏苡 种质资源 SRAP标记 dna指纹图谱
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