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SERS@Au微阵列芯片快速检测细菌性结膜炎病原体
1
作者 刘文博 李含 +5 位作者 徐瑗聪 刘梦东 王惠琴 林太凤 郑大威 张萍 《光谱学与光谱分析》 北大核心 2025年第2期476-482,共7页
急性细菌性结膜炎是一种常见的眼科疾病,医治不及时会严重损害视力。目前针对细菌性结膜炎常规的诊断方法仍为微生物培养法,该方法灵敏度高,但耗时耗力,难以满足快速检测的需求。该研究开发了一种SERS@Au微阵列芯片,将其作为增强基底收... 急性细菌性结膜炎是一种常见的眼科疾病,医治不及时会严重损害视力。目前针对细菌性结膜炎常规的诊断方法仍为微生物培养法,该方法灵敏度高,但耗时耗力,难以满足快速检测的需求。该研究开发了一种SERS@Au微阵列芯片,将其作为增强基底收集细菌性结膜炎相关金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌和表皮葡萄球菌的SERS图谱。结果表明,该芯片具有良好的增强效果、重现性和稳定性。选取400~1800 cm^(-1)波段,通过建立SVM模型和OPLS-DA模型对四种致病菌进行判别分析,区分准确率分别达到97%和90%。采用SERS@Au微阵列芯片对加标泪液进行检测,仅需短暂培养即可快速、准确、便捷、无损筛查致病菌,减少患者的痛苦。该研究开发的SERS@Au微阵列芯片与便携式拉曼光谱仪配套使用,具有准确、便携、快速、现场检测及微量样品检测的特点,适用于眼科细菌性感染疾病的快速筛查。该方法无需标记、无需鉴定培养基、对患者无损,实现了对复杂生物样本混合感染的快速检测,大大提高了检测效率,有望成为眼科疾病的新型辅助筛查手段。 展开更多
关键词 表面增强拉曼光谱 微阵列芯片 细菌性结膜炎 正交偏最小二乘判别分析 支持向量机 快速检测
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DNA微阵列(或芯片)技术原理及应用 被引量：20
2
作者 何志巍 姚开泰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第5期507-510,共4页
ＤＮＡ微阵列或芯片（ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｏｒｃｈｉｐ） 技术是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具． 它是利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术， 在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针，或将... ＤＮＡ微阵列或芯片（ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｏｒｃｈｉｐ） 技术是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具． 它是利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术， 在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针，或将液相合成的探针由微阵列器或机器人点样于尼龙膜或硅片上， 再与放射性同位素或荧光物标记的ＤＮＡ 或ｃＤＮＡ杂交， 用于分析ＤＮＡ突变及多态性、ＤＮＡ测序、监测同一组织细胞在不同状态下或同一状态下多种组织细胞基因表达水平的差异。 展开更多
关键词 dna微阵列(或芯片) 原理 应用
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应用cDNA微阵列芯片技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因的研究 被引量：7
3
作者 邹丰才 吴绍强 +5 位作者 廖申权 林瑞庆 李明伟 宋慧群 黄翠琴 朱兴全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期163-167,共5页
采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫... 采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫cDNA探针,与制备好的cDNA芯片杂交(平行进行反标杂交试验)。根据每个点杂交后的Ratio值,筛选出双点杂交和正反标中都同时具有表达差异的基因克隆共1 559个。将表达差异最明显的前831个克隆进行测序,获得720个有效序列,经生物信息学分析发现,雄虫特异表达的主要精子蛋白和雌虫特异表达的卵巢信息蛋白的基因序列多数与新杆属线虫存在同源性,有31个可能是新的ESTs。性别差异表达基因及其相关生物信息的获得为下一步研究基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪蛔虫cdna微阵列芯片 性别特异基因 表达谱分析
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DNA微阵列芯片技术检测培阳肺结核患者痰样本中结核分枝杆菌耐药性的价值 被引量：5
4
作者 王悦 孙颖 孙炳奇 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期109-114,共6页
目的评价DNA微阵列芯片法(以下称芯片法)检测培养阳性患者痰样本的利福平和异烟肼相关耐药基因的效能。方法收集并检测389例疑似肺结核患者痰样,以BACTEC MGIT 960液体药敏(以下称MGIT 960药敏)为参考标准,评价芯片法检测样本利福平(RIF... 目的评价DNA微阵列芯片法(以下称芯片法)检测培养阳性患者痰样本的利福平和异烟肼相关耐药基因的效能。方法收集并检测389例疑似肺结核患者痰样,以BACTEC MGIT 960液体药敏(以下称MGIT 960药敏)为参考标准,评价芯片法检测样本利福平(RIF)、异烟肼(INH)耐药性和MDR-TB的灵敏度、特异度及一致性。应用线性探针耐药技术(GenoType MTBDRplus VER 2,0)对不一致的结果进行分析。结果将334例(334/389)MGIT 960培阳结果对应的痰处理液进行芯片法耐药检测,其中2例为非结核分枝杆菌,9例为阴性。与参考标准对比,芯片法对利福平耐药检测的灵敏度为92.4%,特异度为97.7%,Kappa值为0.90;异烟肼为82.6%,特异度为99.2%,Kappa值为0.86。在MDR-TB的病人中,芯片法与MGIT 960药敏法有较好的一致性;且在初治患者中Kappa值为0.95,灵敏度为95.5%,明显优于复治患者。结论线性探针耐药技术对22份不一致结果进行分析,认为检测限及耐药机制的差异、异质性耐药和多重感染等原因是导致基因型和表型或是两种分子法结果不一致的主要原因。应用芯片法检测培阳患者痰样本的利福平和异烟肼的相关耐药基因,与MGIT 960药敏法相比较具有较好的灵敏度、特异度和一致性,可快速检测出患者耐药情况和MDR-TB患者,为临床患者尤其是初治患者提供了快速有效的化疗参考方案。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 dna微阵列芯片法 MDR-TB 耐药
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用氨基修饰的载玻片制作cDNA微阵列 被引量：15
5
作者 朱滨 景奉香 +4 位作者 赵建龙 孙悦 陈继锋 赵新泰 徐元森 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期121-124,共4页
cDNA微阵列已在基因差异表达、寻找新基因等研究方面获得广泛应用 ,但有关cDNA微阵列的制作 ,目前多采用多聚赖氨酸修饰的载玻片为探针固定载体 ,固定效果较差 .用氨基硅烷处理的载玻片为载体制作cDNA微阵列 ,然后考察其固定效率、检测... cDNA微阵列已在基因差异表达、寻找新基因等研究方面获得广泛应用 ,但有关cDNA微阵列的制作 ,目前多采用多聚赖氨酸修饰的载玻片为探针固定载体 ,固定效果较差 .用氨基硅烷处理的载玻片为载体制作cDNA微阵列 ,然后考察其固定效率、检测灵敏度、稳定性、实用性等指标 .结果表明 ,用氨基硅烷处理的载玻片具有比多聚赖氨酸更令人满意的核酸固定效率、检测灵敏度 ,且稳定实用 .因此 ,用氨基硅烷修饰的载玻片为探针固定载体制作cDNA微阵列较为理想 . 展开更多
关键词 微阵列 生物芯片 修饰 Cdna 氨基修饰 载玻片
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毒理基因组学与DNA微阵列技术的应用 被引量：8
6
作者 曹佳 周紫垣 +3 位作者 方福德 杨梦更生 胡绍火火火木 游力 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期336-340,共5页
近几年来 DNA微阵列和 DNA芯片技术得到了迅速发展 ,并开始应用于毒理学研究 ,本文介绍了微阵列技术如何与毒理学研究相结合并应用于危险度评估 。
关键词 毒理基因组学 dna微阵列 dna芯片
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DNA微阵列图象信息的自动提取 被引量：7
7
作者 朱疆 黄国亮 +2 位作者 高峻雄 张旭 于军 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2004年第7期84-87,共4页
微阵列图象分析是分子生物学中DNA微阵列杂交实验数据测定过程的一个重要部分。其目的是将微阵列图象中大量象素灰度信息简化为微阵列靶点的信号值。该文介绍了一种对DNA微阵列图象信息进行自动提取的方法,使用此方法完全不需要人为操作... 微阵列图象分析是分子生物学中DNA微阵列杂交实验数据测定过程的一个重要部分。其目的是将微阵列图象中大量象素灰度信息简化为微阵列靶点的信号值。该文介绍了一种对DNA微阵列图象信息进行自动提取的方法,使用此方法完全不需要人为操作,可避免操作者主观性对实验的影响,提高数据提取的效率和可重复性。其关键步骤包括:图象滤波,图象灰度信息提取,微阵列间距确定,靶点定位和靶点信号值计算。实验结果表明使用此算法提取DNA微阵列图象信息具有重复性好、效率高和分析准确的特点。 展开更多
关键词 dna微阵列 图象处理 自动提取
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利用微阵列基因芯片研究东海海参(Acaudina leucoprocta)的生理功能 被引量：6
8
作者 苏秀榕 金春华 +4 位作者 李妍妍 周君 董明敏 张春丹 王琦 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期75-80,共6页
取喂食东海海参60d的ICR小鼠肝脏,制备微阵列基因表达芯片,并与模式小鼠芯片进行杂交,筛选功能基因和差异表达蛋白。从食用海参的鼠肝中共筛选出了4180个基因,其中差异表达基因184个,上调基因107个,下调基因77个。利用MAS.2.0系统对其... 取喂食东海海参60d的ICR小鼠肝脏,制备微阵列基因表达芯片,并与模式小鼠芯片进行杂交,筛选功能基因和差异表达蛋白。从食用海参的鼠肝中共筛选出了4180个基因,其中差异表达基因184个,上调基因107个,下调基因77个。利用MAS.2.0系统对其功能进行分析,结果显示,分子功能上有催化活性的基因占39.86%,结合功能的基因占30.1%,信号转导、分子转导、电子传递、分子马达等功能基因占22.1%。从生化过程分析可见与新陈代谢有关的基因67.4%,调控基因16.2%,发育等相关基因9.1%。从细胞组成元件可见,各种细胞成分为51%,细胞器为21.6%,其差异表达蛋白均为参与细胞信号传导的因子、合成及分解代谢的酶和供能物质。 展开更多
关键词 东海海参 微阵列芯片 差异表达基因 聚类分析
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用寡核苷酸微阵列芯片方法检测常见的食源性致病微生物 被引量：5
9
作者 陈广全 张惠媛 +5 位作者 汪琦 曾静 张亮 臧庆伟 张昕 饶红 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2007年第12期122-126,共5页
研制了1种高通量检测食品中常见致病微生物的寡核苷酸微阵列芯片。该芯片在种的水平可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠埃希氏菌0157：H7、霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、大肠弯曲杆菌、单核细胞增生李斯特菌、乙型溶血型链球... 研制了1种高通量检测食品中常见致病微生物的寡核苷酸微阵列芯片。该芯片在种的水平可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠埃希氏菌0157：H7、霍乱弧菌、空肠弯曲杆菌、大肠弯曲杆菌、单核细胞增生李斯特菌、乙型溶血型链球菌和副溶血性弧菌；在属的水平可鉴别弯曲肠杆菌属、沙门氏菌属和李斯特氏菌属。研究中利用16S rDNA和沙门氏菌、O157：H7和副溶血性弧菌的特异基因序列设计引物和探针。用参比菌株和实验室自分离的菌株检测该芯片的特异性，结果表明该芯片的特异性良好，在所检测的菌株之间无交叉反应，与同属的其他菌株之间也不存在交叉反应。在鲜活海产品的24h增菌液中添加参比菌株，当样品增菌液中的目的菌的量达到10^6～10^7 CFU／mL时，芯片可以准确检测出目的菌。 展开更多
关键词 微阵列芯片 食源性致病菌 16S Rdna
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微流体数字化技术制备基因芯片微阵列 被引量：7
10
作者 耿鑫 侯丽雅 +2 位作者 杨眉 王洪成 章维一 《光学精密工程》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第6期1344-1352,共9页
采用以脉冲为微流动基本形态、脉冲当地惯性力为主动力的微流体数字化技术进行了基因芯片微阵列制备实验。在搭建的基于微流体数字化技术的基因芯片微阵列制备系统上,实验验证了脉冲点样系统参量(收敛角2θ、微喷嘴内径d、电压幅值U和... 采用以脉冲为微流动基本形态、脉冲当地惯性力为主动力的微流体数字化技术进行了基因芯片微阵列制备实验。在搭建的基于微流体数字化技术的基因芯片微阵列制备系统上,实验验证了脉冲点样系统参量(收敛角2θ、微喷嘴内径d、电压幅值U和驱动频率f)对样点直径和脉冲点样稳定性的影响规律。以实验规律为依据,提出了制备样点直径约为100μm的中等密度微阵列的实验路线,制备出了样点平均直径为102.2μm、微阵列密度约为4 000spot/cm2的基因芯片微阵列(点样溶液为3×SSC柠檬酸盐缓冲液)。得到的研究结果可为建立高密度基因芯片脉冲点样技术提供实验研究基础。 展开更多
关键词 微流体数字化 脉冲点样 基因芯片微阵列
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生物芯片微阵列制备方法研究 被引量：6
11
作者 王东 宋立斌 +1 位作者 李志明 陈恳 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第8期60-63,共4页
固定探针 ,即在基片上制备微阵列这一过程是微阵列芯片的关键技术。本文提出了用来评价微阵列制备方法的性能指标 ,如集成度、可靠性等 ;分析了应用最为广泛的预合成后钢针接触式制备微阵列方法的工作原理、关键技术和发展现状 ;
关键词 制备方法 生物芯片 微阵列 工作原理 性能指标
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DNA微阵列法检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药性 被引量：3
12
作者 赵静 王凤平 +2 位作者 孙清清 杨玉婷 陈蕾 《上海交通大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1651-1654,共4页
目的探讨DNA微阵列法在结核菌耐药基因快速检出中的应用价值。方法应用DNA微阵列法定性检测来源于临床疑似结核病患者痰液样本,检测利福平(RFP)和异烟肼(INH)的3个耐药相关基因rpo B、kat G及inh A基因启动子的野生型及不同突变型;采用B... 目的探讨DNA微阵列法在结核菌耐药基因快速检出中的应用价值。方法应用DNA微阵列法定性检测来源于临床疑似结核病患者痰液样本,检测利福平(RFP)和异烟肼(INH)的3个耐药相关基因rpo B、kat G及inh A基因启动子的野生型及不同突变型;采用BACTECTMMGIT 960培养仪进行结核分枝杆菌(M.tuberculosis)培养,阳性液体培养物用改良罗氏比例法进行药物敏感试验。结果 174份M.tuberculosis核酸阳性痰液标本中15份rpo B突变型,突变频率最高的位点是531,突变率66.7%;17份kat G/inh A突变型,其中12份是kat G位点的单一突变,突变率为70.6%。对照68例改良罗氏比例法药敏结果,DNA微阵列法检测RFP、INH耐药的符合率均达90%以上。结论 DNA微阵列法可快速准确地检测大部分疑似结核病临床样本的rpo B、kat G和inh A基因突变,可用于临床耐药性的检测,指导临床用药,并在临床诊断中推广应用。 展开更多
关键词 dna微阵列 结核分枝杆菌 耐药性
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微阵列基因芯片在新生儿遗传性耳聋筛查中的应用研究 被引量：4
13
作者 常亮 柯嘉 +3 位作者 张珂 赵楠 刘平 李蓉 《中国全科医学》 CAS 北大核心 2020年第17期2102-2104,共3页
背景新生儿听力筛查在世界范围内广泛开展,在早期发现、诊断和干预方面发挥了重要作用。2012年1月北京市启动了新生儿听力和基因筛查同步工作,同时进行新生儿听力和基因筛查,将发挥重要作用。目的应用微阵列基因芯片对新生儿进行遗传性... 背景新生儿听力筛查在世界范围内广泛开展,在早期发现、诊断和干预方面发挥了重要作用。2012年1月北京市启动了新生儿听力和基因筛查同步工作,同时进行新生儿听力和基因筛查,将发挥重要作用。目的应用微阵列基因芯片对新生儿进行遗传性耳聋筛查,评估新生儿中4个常见遗传性耳聋基因突变的频率、突变类型以及其与遗传性耳聋的相关性,为推广新生儿遗传性耳聋基因筛查提供临床研究证据。方法选取2017年度北京大学第三医院妇产科生殖医学中心检测的17824例新生儿,采集出生3 d后的足跟血,使用微阵列基因芯片进行4个常见遗传性耳聋基因9个突变位点的筛查,对阳性结果进行测序验证。结果新生儿遗传性耳聋基因筛查17824例,检出阳性890例,阳性率为4.99%。其中GJB2基因杂合突变型501例(2.81%),SLC26A4基因杂合突变型290例(1.63%),SLC26A4基因纯合突变型1例(0.01%),线粒体DNA 12S rRNA突变型41例(0.23%),GJB3基因杂合突变型41例(0.23%),双杂合突变型16例(0.09%)。结论新生儿常见遗传性耳聋基因突变以GJB2基因突变、SLC26A4基因突变为主,微阵列基因芯片可以及早有效地检出先天性耳聋、迟发性耳聋及药物性耳聋基因的携带情况。微阵列基因芯片筛查,快速、高效,对遗传性耳聋的早期诊断、早期干预及遗传咨询具有重要意义,提倡推广新生儿听力筛查联合基因筛查。 展开更多
关键词 听觉丧失 遗传性耳聋 新生儿筛查 基因 微阵列基因芯片
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基于数学形态学的微阵列芯片荧光图像处理与分析 被引量：6
14
作者 李红卫 苑伟政 叶芳 《传感技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期338-342,共5页
微阵列芯片技术由于其高通量分析的特点被广泛应用在生命科学领域,图像处理与分析是微阵列芯片技术中的一个重要环节.文中主要研究了基于数学形态学的微阵列芯片图像处理及数据提取方法,该方法采用形态学重构对图像投影产生的一维信号... 微阵列芯片技术由于其高通量分析的特点被广泛应用在生命科学领域,图像处理与分析是微阵列芯片技术中的一个重要环节.文中主要研究了基于数学形态学的微阵列芯片图像处理及数据提取方法,该方法采用形态学重构对图像投影产生的一维信号进行处理,进而完成对图像样点阵列的网格划分,运用自适应阈值分割算法对每个网格内的样点进行了图像分割,运用前景和背景校正的方法对样点的光密度值进行提取.结果显示,该算法具有简单、快速、易于实现,对样点形状没有限制而且精确度高等特点. 展开更多
关键词 微阵列芯片 图像处理 数学形态学 网格划分 图像分割
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cDNA微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌缺血-再灌诱导的基因表达谱改变 被引量：4
15
作者 袁灿 赵震宇 +3 位作者 刘瑛 吕青兰 王秋鹏 肖献忠 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期252-256,共5页
目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片... 目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片检测大鼠心肌缺血 再灌处理后不同时间点 (1,3,6 ,12 ,2 4h)的基因表达情况 ,并采用SOM算法将具有相似表达模式的基因进行聚类。结果 :短时间缺血后再灌 1,3,6 ,12 ,2 4h分别有 75 ,779,2 0 5 ,15 5 ,16 6个基因表达发生改变。具有相同表达模式的基因被聚为 12类。结论 :心肌缺血 再灌可以诱导心肌的基因表达谱发生改变 ,具有相似表达模式的基因可能具有相似的功能或相似的表达调控机制。 展开更多
关键词 Cdna微阵列 聚类分析 大鼠 心肌缺血 再灌诱导 基因表达谱 Cdna芯片
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基于AdaBoost集成学习的演化硬件DNA微阵列数据分类 被引量：2
16
作者 王进 黄超 +2 位作者 冉仟元 邓欣 陈乔松 《江苏大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期86-92,102,共8页
为了更好地解决DNA微阵列数据的分类问题并进一步提高系统的识别率,提出了一种用于DNA微阵列数据分类的演化硬件多分类器Ada Boost选择性集成学习方法.在系统集成阶段,介绍了2种改进的Ada Boost算法,分别探讨了以样本标记提升抽样有效... 为了更好地解决DNA微阵列数据的分类问题并进一步提高系统的识别率,提出了一种用于DNA微阵列数据分类的演化硬件多分类器Ada Boost选择性集成学习方法.在系统集成阶段,介绍了2种改进的Ada Boost算法,分别探讨了以样本标记提升抽样有效容量和直接面向组合分类器分类精度提升的选择性集成策略.对急性白血病、肺癌、结肠癌数据集进行了试验.结果表明,基于Ada Boost集成学习的演化硬件方法对白血病、肺癌、结肠癌的平均识别率为97.06%,99.32%,和94.44%.相对于传统演化硬件集成学习方法,文中方法保证更优识别率的同时有效降低了硬件实现代价. 展开更多
关键词 机器学习 演化硬件 dna微阵列 ADABOOST 选择性集成
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神经干细胞分化前后基因表达变化的DNA微阵列分析 被引量：2
17
作者 李巍 杨忠 +3 位作者 Lowrence 蔡文琴 李成仁 周德山 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期29-32,共4页
目的　了解神经干细胞分化前后的差异表达基因 ,为神经干细胞的分化调控提供基础研究资料。方法　利用细胞培养、DNA微阵列技术等 ,检测了神经干细胞分化前后的差异表达基因。结果　检测到了 10 0 0多个差异表达基因 ,其中明显上调的基... 目的　了解神经干细胞分化前后的差异表达基因 ,为神经干细胞的分化调控提供基础研究资料。方法　利用细胞培养、DNA微阵列技术等 ,检测了神经干细胞分化前后的差异表达基因。结果　检测到了 10 0 0多个差异表达基因 ,其中明显上调的基因 13 8个 ,明显下调的基因 179个 ,基因种类很多如细胞周期相关基因、发育与分化相关基因、受体与通道相关基因、细胞骨架相关基因、生长因子相关基因、原癌基因和抑癌基因、转录和翻译调节基因、ESTs、代谢调节、蛋白运输相关基因等。结论　大量基因参与了神经干细胞的分化调控 ,其确切调控机制 。 展开更多
关键词 细胞分化 基因表达 神经干细胞 分化调控 dna 微阵列
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应用DNA微阵列技术快速鉴定分枝杆菌菌种 被引量：5
18
作者 张俊仙 吴雪琼 +4 位作者 邢婉丽 张琼 梁建琴 张洪恩 陆阳 《中国防痨杂志》 CAS 2007年第1期1-7,共7页
目的利用DNA微阵列的高通量、高效性,建立一种快速、简便的分枝杆菌分子菌种鉴定方法,为临床医师正确诊断提供依据。方法以DNA直接测序法为对照,通过PCR-SSCP和DNA微阵列技术分析28种分枝杆菌标准菌株、9种非分枝杆菌和465株分枝杆菌临... 目的利用DNA微阵列的高通量、高效性,建立一种快速、简便的分枝杆菌分子菌种鉴定方法,为临床医师正确诊断提供依据。方法以DNA直接测序法为对照,通过PCR-SSCP和DNA微阵列技术分析28种分枝杆菌标准菌株、9种非分枝杆菌和465株分枝杆菌临床分离株的菌种。结果应用DNA微阵列技术分析28种分枝杆菌标准菌株和9种非分枝杆菌菌株,特异性100％。465株分枝杆菌临床分离株中,经16S rRNA PCR-SSCP初步菌种鉴定,256株为结核分枝杆菌复合群,应用DNA微阵列分析,显示与分枝杆菌属探针M和结核分枝杆菌复合群探针a杂交阳性,两种鉴定方法结果一致;209株PCR-SSCP初步鉴定为非结核分枝杆菌的分离株,经芯片分析,68株为龟分枝杆菌龟亚种和脓肿亚种,46株为胞内分枝杆菌,34株为堪萨斯、瘰疬、胃和猿猴分枝杆菌复合群,31株为偶然分枝杆菌,16株为戈登分枝杆菌,3株为鸟分枝杆菌,2株为海和溃疡分枝杆菌复合群,1株为土分枝杆菌, 1株为迪氏分枝杆菌,1株为草分枝杆菌;另6株只与探针M杂交,经测序显示5株为胞内分枝杆菌,但其基因序列与标准菌株不完全相同,1株为新金色分枝杆菌,芯片上无鉴定该菌种的探针。结论用DNA微阵列可简便、快速、灵敏、特异地将大多数分枝杆菌鉴定到种,提高分枝杆菌病的正确诊断率,指导临床合理治疗。 展开更多
关键词 分枝杆菌 聚合酶链反应 单链构象多态性 菌种鉴定 dna微阵列
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一种检测小鼠转录因子活性的微阵列芯片的构建及应用 被引量：2
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作者 孙义民 曾令琴 +4 位作者 张岩 魏丽 K R MITCHELSON 张亮 程京 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期244-253,共10页
转录因子是一类具有序列特异性的双链DNA结合蛋白.在哺乳动物细胞中,一个转录因子可以调控多个靶基因,一个基因也同时受到多个转录因子的调控,从而形成复杂的基因表达网络调控机制.在蛋白质水平检测特定状态下组织或细胞中的转录因子活... 转录因子是一类具有序列特异性的双链DNA结合蛋白.在哺乳动物细胞中,一个转录因子可以调控多个靶基因,一个基因也同时受到多个转录因子的调控,从而形成复杂的基因表达网络调控机制.在蛋白质水平检测特定状态下组织或细胞中的转录因子活性对深入研究基因表达调控的分子机制具有重要的意义.针对TRANSFAC数据库提供的226个小鼠转录因子的PSSM,设计了240个转录因子结合探针,构建了可以在蛋白质水平同时检测约200个小鼠转录因子的微阵列芯片,实验结果显示:a.针对含有不同DNA结合结构域的7个转录因子,进行依赖于抗体的转录因子活性检测,结果证明该芯片具有良好的特异性;b.针对NFκB转录因子纯品,芯片的检测灵敏度可以达到0.5nmol/L,线性范围为0.5～20nmol/L,表明芯片具有较高的灵敏度和良好的定量能力;c.针对经典的IKK,JNK信号通路和JAK/STAT信号通路,该芯片可以检测到其关键转录因子的活性变化,证明芯片的可靠性;d.针对小鼠前脂肪细胞系3T3-L1的分化,该转录因子活性芯片不但检测到了已经报道的活性发生变化的转录因子,如PPAR家族和C/EBP家族外,还发现了以前没有报道过的SRF等,充分显示了芯片技术的高通量优势和发现新数据的能力. 展开更多
关键词 基因表达调控 转录因子 微阵列芯片 TF—ELISA
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DNA微阵列技术在柑橘研究中的应用 被引量：2
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作者 张凌云 阳佳位 +1 位作者 王淼 钟广炎 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期110-114,共5页
DNA微阵列技术是一项能够分析基因组、基因表达特征性图谱的新技术,使研究人员能同时对成千上万的相互作用的基因展开研究。随着Affymetrix公司生产的世界上第一个商品化的柑橘基因组阵列(Citrus Genome Array)的诞生,该技术在柑橘基因... DNA微阵列技术是一项能够分析基因组、基因表达特征性图谱的新技术,使研究人员能同时对成千上万的相互作用的基因展开研究。随着Affymetrix公司生产的世界上第一个商品化的柑橘基因组阵列(Citrus Genome Array)的诞生,该技术在柑橘基因组学和相关科学研究中扮演着越来越重要的角色。综述了运用DNA微阵列技术在柑橘研究中的现状,重点说明了该技术在柑橘重要功能基因的检测及基因差异表达研究中的应用,介绍了柑桔研究中DNA微阵列的种类,及其在代谢途径分析、突变检测和突变机理分析等其他领域的研究现状,并对其在病原检测方面的可能应用也进行了探讨。 展开更多
关键词 柑橘 dna微阵列
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