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Effects of Mechanical Stress on the Gene Expression Profiles of Human Osteoblasts 被引量:2
1
作者 Yong - ruing Li Jun Qiu 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2008年第6期651-654,共4页
目的:研究周期性牵张力对人成骨细胞基因表达谱的影响。方法:通过体外细胞加载系统对培养的人成骨细胞施加8%形变率、6周/min的周期性牵张力24 h,应用基因表达谱芯片技术对人成骨细胞中mRNA表达水平进行对比杂交分析,检测周期性牵张力... 目的:研究周期性牵张力对人成骨细胞基因表达谱的影响。方法:通过体外细胞加载系统对培养的人成骨细胞施加8%形变率、6周/min的周期性牵张力24 h,应用基因表达谱芯片技术对人成骨细胞中mRNA表达水平进行对比杂交分析,检测周期性牵张力加载组成骨细胞基因表达谱的变化。结果:在所分析的21073条人类功能基因中,加载组与未加载组人成骨细胞之间差异表达显著的基因有2498条,其中表达上调的有899条(2.0倍以上),表达下降的有1599条(0.5倍以下)。这些基因表达产物涉及细胞信号转导、细胞周期调节等多个方面。结论:周期性牵张力对成骨细胞多种基因的表达产生了影响,成骨细胞的应力反应是一个复杂的,多基因参与调控的过程。这些变化的基因可能与成骨细胞的机械应力反应有关。 展开更多
关键词 周期性牵张应力 人成骨细胞 基因表达谱 基因芯片
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Analysis of Gene Expression Pattern of Lumbar Intervertebral Disc Degeneration in Human 被引量:4
2
作者 HU Ming MA Yuan-zheng FENG Hui-cheng CHEN Xing CHAI Xiao-jun PENG Wei LI Hong-wei 《中国康复理论与实践》 CSCD 2006年第5期420-422,共3页
ObjectiveTo investigate the gene expression changes in normal and degeneration lumbar intervertebral disc in humans, providing information for clinical. MethodsThe PCR products of 4096 human genes were spotted onto a ... ObjectiveTo investigate the gene expression changes in normal and degeneration lumbar intervertebral disc in humans, providing information for clinical. MethodsThe PCR products of 4096 human genes were spotted onto a kind of chemical-material-coated-glass slides. The total RNAs were isolated from the tissues. Both the mRNAs from the degeneration and normal lumbar intervertebral disc in humans were reversely transcribed to the cDNAs, which used as the hybridization probes with the incorporations of fluorescent dUTP. The mixed probes were then hybridized to the cDNA microarray. After high-stringent washing, the cDNA microarray was scanned for the fluorescent signals and analyzed with computer image analysis. ResultsAmong the 4096 targets, there were 706 genes whose expression levels differed between the degeneration and normal lumbar intervertebral disc in all cases, comprising 298 up-regulated and 358 down-regulated ones. ConclusionDNA microarray technology is an effective technique in screening for differently expressed genes between the degeneration and normal lumbar intervertebral disc. Cell apoptosis plays an important role in the process of lumbar intervertebral disc degeneration. 展开更多
关键词 intervertebral disc degeneration dna microarray gene expression pattern
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Alteration of Gene Expression Profile and Signal Pathway Induced by Methylseleninic Acid in Human Lung Cancer Cell Lines
3
作者 Ting WANG Zhihao WU Hongyu LIU Jun CHEN Liya SUN Qjnghua ZHOU 《中国肺癌杂志》 CAS 2009年第6期476-477,共2页
Objective and Methods Lung cancer has a fastest growing rate of morbidity and mortality among malignant tumors and poses a great threat to the human health. Chemotherapy, as one
关键词 肺癌 治疗 疗效 临床
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伤寒沙门菌基因组DNA芯片的制备与基因表达谱分析应用 被引量:14
4
作者 生秀梅 黄新祥 +5 位作者 茅凌翔 朱超望 徐顺高 张海方 许化溪 刘秀梅 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期206-212,共7页
伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取C... 伤寒沙门菌是一种具有鞭毛的革兰阴性人类肠道致病菌,也是一种重要的原核生物研究用模式菌.基因组芯片能够系统、全面且高效地观察生物的基因表达及进行基因组结构比较.利用伤寒沙门菌现有的全基因组序列,以Ty2菌株的基因组为基准,选取CT18菌株和z66阳性菌株的特异性蛋白编码基因,设计特异性引物,经PCR有效扩增出4201个基因,产物纯化后点样于多聚赖氨酸玻片制备伤寒沙门菌基因组DNA芯片,并验证了芯片样点位次与效果.通过对基因表达谱分析的各种条件进行优化,建立相应的表达谱分析方法,并用于比较伤寒沙门菌野生株在高渗、低渗条件下的基因表达差异,结果与以前的报道基本一致.结果表明,成功建立了伤寒沙门菌基因组DNA芯片及表达谱分析方法,可为有关伤寒沙门菌基因表达调控及致病性机理、进化和基因多样性等方面的深入研究提供有效的技术支持. 展开更多
关键词 伤寒沙门菌 基因组dna芯片 基因表达谱
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肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用 被引量:24
5
作者 孙青 丁彦青 +2 位作者 高雪芹 闫实 韩金祥 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第12期1070-1075,共6页
目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy... 目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果经ScanArrayTM 4000共聚焦荧光扫描仪检测,图像背景均匀,信号清晰,效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现:两种癌的基因表达大多数相同,仅少数有差别,有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因,包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别,表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。 展开更多
关键词 肿瘤转移 生物信息学 肿瘤基因 Cdna芯片 肠肿瘤 肺癌 基因表达谱
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EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析 被引量:7
6
作者 李沛 凌志强 +3 位作者 赵继敏 杨洪艳 黄幼田 董子明 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2006年第2期272-274,共3页
目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用... 目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片,筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R2、一致率(CR)及假阳性率(FPR)等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85%,R2=0.7329,CR=100%。该系统的FPR为0.45%,扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性。结论该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点,可用于基因差异表达谱的分析。 展开更多
关键词 食管癌细胞 基因芯片 差异表达 基因表达谱 可靠性
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应用cDNA微阵列芯片技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因的研究 被引量:7
7
作者 邹丰才 吴绍强 +5 位作者 廖申权 林瑞庆 李明伟 宋慧群 黄翠琴 朱兴全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期163-167,共5页
采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫... 采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫cDNA探针,与制备好的cDNA芯片杂交(平行进行反标杂交试验)。根据每个点杂交后的Ratio值,筛选出双点杂交和正反标中都同时具有表达差异的基因克隆共1 559个。将表达差异最明显的前831个克隆进行测序,获得720个有效序列,经生物信息学分析发现,雄虫特异表达的主要精子蛋白和雌虫特异表达的卵巢信息蛋白的基因序列多数与新杆属线虫存在同源性,有31个可能是新的ESTs。性别差异表达基因及其相关生物信息的获得为下一步研究基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪蛔虫cdna微阵列芯片 性别特异基因 表达谱分析
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中华蜜蜂DNA甲基化转移酶Dnmt3基因克隆及表达谱分析 被引量:5
8
作者 刘亭亭 刘俊峰 +4 位作者 王文祥 王欢 王子龙 曾志将 颜伟玉 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期284-290,共7页
为探究中华蜜蜂Apis cerana cerana的DNA甲基化模式,本研究采用RT-PCR技术克隆了中华蜜蜂DNA甲基化转移酶3(Dnmt3)基因(GenBank登录号为JQ740768);采用荧光定量PCR检测不同发育时期工蜂(4日龄蛹,1,7和30日龄成年蜂及产卵工蜂)和蜂王(4... 为探究中华蜜蜂Apis cerana cerana的DNA甲基化模式,本研究采用RT-PCR技术克隆了中华蜜蜂DNA甲基化转移酶3(Dnmt3)基因(GenBank登录号为JQ740768);采用荧光定量PCR检测不同发育时期工蜂(4日龄蛹,1,7和30日龄成年蜂及产卵工蜂)和蜂王(4日龄蛹,1日龄蜂王和产卵蜂王)头部的Dnmt3基因mRNA的表达量。结果表明:该基因cDNA序列全长2277bp,编码758个氨基酸残基,预测的蛋白分子量为88.24kD,等电点为7.85。将中华蜜蜂与其他物种的Dnmt3基因的结构域进行比对,同时将该基因推导的氨基酸序列与其他物种的Dnmt3氨基酸序列进行同源性比对和系统发育分析,发现与西方蜜蜂的Dnmt3序列一致性高达99%。该基因在工蜂和蜂王不同发育时期均有表达,1日龄工蜂与7日龄工蜂中没有显著差异(P>0.05),30日龄工蜂中的表达量显著高于前两者(P<0.05);蜂王蛹中的表达量显著高于工蜂蛹(P<0.05);1日龄的蜂王中的表达量显著高于1日龄的工蜂(P<0.05);产卵工蜂与产卵蜂王中的表达量没有差异(P>0.05)。这种表达情况提示其可能与工蜂劳动分工及蜜蜂卵巢发育有关。 展开更多
关键词 中华蜜蜂 dna甲基化 dna甲基化转移酶 基因克隆 序列分析 表达谱分析
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DNA芯片技术中利用内标对数据归一化后检测基因的表达变化 被引量:4
9
作者 张亮 张坚 +1 位作者 周玉祥 程京 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期115-119,共5页
在DNA芯片技术中 ,通过反转录反应 ,由mRNA合成带有荧光标记物的cDNA的过程中 ,往往要参入已知质量的poly(A) + RNA ,以对DNA芯片的检测灵敏度进行归一化处理 .通过体外转录的方法 ,以真核生物的cDNA克隆中的DNA片段为模板合成poly(A) +... 在DNA芯片技术中 ,通过反转录反应 ,由mRNA合成带有荧光标记物的cDNA的过程中 ,往往要参入已知质量的poly(A) + RNA ,以对DNA芯片的检测灵敏度进行归一化处理 .通过体外转录的方法 ,以真核生物的cDNA克隆中的DNA片段为模板合成poly(A) +RNA ,对之定量后 ,以不同的质量比参入到样品的反转录体系中 ,代表不同的RNA拷贝丰度 ,从而对DNA芯片检测的灵敏度进行了定量 ,并得到DNA芯片上杂交点的荧光信号强度与基因表达的RNA拷贝数成正相关的关系 .利用含有内标的DNA芯片检测了热击反应后酵母细胞的基因表达变化 。 展开更多
关键词 dna芯片 内标 poly(A)^+RNA 体外转录 基因表达 检测 归一化处理
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cDNA微阵列检测萌发期水稻重要代谢基因表达模式 被引量:3
10
作者 孙亮先 董海涛 李德葆 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期299-303,共5页
使用含 2 2 0 0条水稻表达序列标签的 c DNA微阵列检测了萌发期水稻胚芽、胚轴 (含糊粉层和盾片 )、胚根的基因表达模式 ,得到 10 32个有效的基因表达数据。其中 ,在胚芽、胚根、胚轴中特异表达的基因数分别为 5 5、10 6和 36个。以胚... 使用含 2 2 0 0条水稻表达序列标签的 c DNA微阵列检测了萌发期水稻胚芽、胚轴 (含糊粉层和盾片 )、胚根的基因表达模式 ,得到 10 32个有效的基因表达数据。其中 ,在胚芽、胚根、胚轴中特异表达的基因数分别为 5 5、10 6和 36个。以胚轴为参比 ,70个基因在胚芽、胚根中均表达上调 ,包括延伸因子 1和多个核糖体蛋白基因 ,这些基因与顶端生长点的细胞分化和生长有关。胚轴特异表达的基因有 36个 ,大部分参与胚乳贮藏物质的代谢 ,如聚泛蛋白基因。 展开更多
关键词 Cdna微阵列 萌发期 基因表达模式 水稻 物质代谢 胚芽 胚轴 胚根
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卵巢癌顺铂耐药细胞中DNA转录与修复相关基因的表达 被引量:5
11
作者 曹漫明 张积仁 +2 位作者 汪森明 胡喜钢 胡利娟 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2005年第12期1478-1481,共4页
目的研究DNA转录与修复相关基因的表达与卵巢癌顺铂耐药性之间的关系。方法以卵巢癌亲本细胞系COC1为对照,应用cDNA微阵列检测其顺铂耐药细胞系COC1/DDP中DNA转录与修复相关基因的表达。结果和结论与COC1细胞相比,COC1/DDP细胞有143个... 目的研究DNA转录与修复相关基因的表达与卵巢癌顺铂耐药性之间的关系。方法以卵巢癌亲本细胞系COC1为对照,应用cDNA微阵列检测其顺铂耐药细胞系COC1/DDP中DNA转录与修复相关基因的表达。结果和结论与COC1细胞相比,COC1/DDP细胞有143个基因的表达水平发生改变,其中共有20个DNA转录与修复相关基因的表达发生改变,表达上调的有13个基因,表达下调的有7个基因,包括CAD、DDB1、DDIT4等大量DNA修复基因以及一般转录因子RNA多聚酶Ⅰ、Ⅱ基因和DHX9、DDX3X基因的表达上调以及MLH1和BTF3基因的低表达,提示COC1/DDP细胞对顺铂的耐药性与DNA转录和损伤修复能力的异常有关。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 顺铂 耐药 dna转录和修复相关基因 Cdna微阵列 基因表达
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基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法 被引量:3
12
作者 聂桂军 王靖 +3 位作者 王加俊 叶锡君 陈强 杨静宇 《江南大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第1期16-21,共6页
针对cDNA基因芯片数据分析中划格对提取杂交荧光样点杂交强度信息的重要作用,提出了一种基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法,采用NCBI上GEO数据库中cDNA基因芯片图像进行划格实验,验证了该算法的有效性。
关键词 互补dna 基因芯片 划格 基因表达 图像分析
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应用cDNA芯片技术筛选胰腺癌相关基因 被引量:1
13
作者 蒋业贵 李兆申 +1 位作者 王宇明 刘同华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期235-238,共4页
目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转... 目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA一链做探针,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的量,获得的荧光信号图像用计算机分析。结果按差异显著性标准,从14 000条基因中筛选出在胰腺癌组织中共同差异表达基因189条,其中已知基因101条,新基因88条。在筛选出的已知基因中,有50条表达上调,51条表达下调,包括原癌及抑癌基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架和运动蛋白相关基因、细胞凋亡和应激反应相关基因、DNA合成和修复相关基因、转录因子类基因、细胞受体相关基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因等。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胰腺癌相关基因,并高效对基因功能进行研究。胰腺癌基因表达谱的分析有助于认识肿瘤发病机制。 展开更多
关键词 胰腺癌 Cdna芯片 基因表达谱
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实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片方法分析食管癌组织中基因的表达 被引量:1
14
作者 李沛 凌志强 +4 位作者 杨洪艳 黄幼田 赵继敏 郑智敏 董子明 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2006年第5期841-843,共3页
目的:采用实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片2种技术分析食管癌细胞基因表达的特征。方法:应用cDNA基因芯片筛选15例食管癌基因表达谱,用实时荧光定量RT-PCR验证其中16个基因的表达变化。结果:实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片技术对1... 目的:采用实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片2种技术分析食管癌细胞基因表达的特征。方法:应用cDNA基因芯片筛选15例食管癌基因表达谱,用实时荧光定量RT-PCR验证其中16个基因的表达变化。结果:实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片技术对16个基因的检测结果一致,不仅变化方向相同,而且表达值非常接近。结论:cDNA基因芯片和实时荧光定量RT-PCR分析基因表达变化都是可信的,基因芯片筛选基因表达谱具有高通量大规模的特点,而实时荧光定量RT-PCR则适合单个基因表达变化的研究,两者互为补充和印证。 展开更多
关键词 食管癌 基因芯片 基因表达谱 实时逆转录多聚酶链反应
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cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究 被引量:1
15
作者 欧阳取长 胡成平 +4 位作者 石林阶 梁清华 吴鄂生 杨红忠 潘频华 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第1期9-12,共4页
目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 ... 目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 4 0 96个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果 :肺鳞癌差异表达基因 5 91个 ,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 76个 ,上调的有 2 93个 ,下调的有 183个 ;肺腺癌差异表达基因 5 2 4个 ,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 6 0个 ,上调的有 2 14个 ,下调有 2 4 6个 ;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论 :肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱 ,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。 展开更多
关键词 Cdna微阵列 基因表达谱 肺肿瘤
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一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法 被引量:1
16
作者 武拴虎 严洪 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2005年第2期22-25,86,共5页
DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及... DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。该文主要研究分割和信息抽取问题。首先基于K-Means聚类技术提出了一种新的分割方法;其次基于统计分析文章建议了一种新的背景和前景分割校正方法用于更准确的信息抽取。新方法的优点是对于基因芯片中spot图像没有任何形状限制。实际图像分析结果与目前最流行的基因芯片图像分析软件GenePix对比研究表明该文算法是精确有效的。 展开更多
关键词 基因芯片 图像处理 聚类分析 基因表达信息
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人食管鳞状细胞癌基因表达变化的cDNA芯片研究
17
作者 李沛 凌志强 +4 位作者 杨洪艳 黄幼田 赵继敏 赵明耀 董子明 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期632-634,共3页
目的利用TaKaRa人癌基因芯片研究食管鳞状细胞癌(ESCC)和相应正常组织差异表达基因,分析基因差异表达谱,以期找到更快捷、高通量的方法来筛选与原发性食管癌发生、发展以及与食管癌临床进展相关的分子标记物。方法应用基因芯片技术及激... 目的利用TaKaRa人癌基因芯片研究食管鳞状细胞癌(ESCC)和相应正常组织差异表达基因,分析基因差异表达谱,以期找到更快捷、高通量的方法来筛选与原发性食管癌发生、发展以及与食管癌临床进展相关的分子标记物。方法应用基因芯片技术及激光捕获微切割术、T7RNA聚合酶扩增技术,对15例ESCC癌组织和正常组织的mRNA进行检测,并用生物信息学对检测结果进行分析。结果在886个目的基因中有110条(12.42%)至少2次出现差异表达,其中56条(6.32%)基因表达上调幅度>2.0倍,54条(6.09%)基因表达下调幅度<0.5。结论高通量的基因芯片技术可筛选出大量ESCC相关基因,对这些相关基因功能的验证将有助于找到ESCC发生、发展的关键基因或通路。 展开更多
关键词 食管癌 基因芯片 差异表达 基因表达谱
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卵巢癌基因表达谱的cDNA微矩阵研究
18
作者 张晓霞 何津 +1 位作者 孙晓琦 李荷莲 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期552-554,共3页
目的:探讨cDNA微矩阵(基因芯片)研究卵巢癌基因表达谱及分析部分差异表达基因功能的可行性。方法:采用4 097个靶基因点BiostarH-40s表达谱基因芯片,检测5例卵巢浆液性腺癌及5例正常卵巢组织(cy3-dUTP标记正常卵巢组织的RNA,用cy5-dUTP... 目的:探讨cDNA微矩阵(基因芯片)研究卵巢癌基因表达谱及分析部分差异表达基因功能的可行性。方法:采用4 097个靶基因点BiostarH-40s表达谱基因芯片,检测5例卵巢浆液性腺癌及5例正常卵巢组织(cy3-dUTP标记正常卵巢组织的RNA,用cy5-dUTP标记卵巢癌组织的RNA)的基因表达谱。结果:两组病例卵巢癌基因表达谱中,4例以上差异表达基因163个,其中基因表达增高(上调趋势)66个,基因表达降低(下调趋势)97个。明确基因功能分类的差异表达基因37个,其中原癌基因和抑癌基因类基因3个,细胞周期蛋白类基因1个,细胞骨架及运动蛋白类基因6个,DNA结合、转录和转录因子类基因1个,细胞受体类基因2个,免疫相关蛋白类基因5个,代谢类基因7个,蛋白翻译合成类基因2个,发育相关基因3个,其他类基因7个。结论:应用cDNA微矩阵研究卵巢癌基因表达谱,发现差异表达基因及其基因功能分类。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 基因表达谱 cdna微矩阵
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DNA微阵列与基因表达研究概况
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作者 刘丽玲 王秀荣 陈化兰 《动物医学进展》 CSCD 2003年第6期15-18,共4页
DNA微阵列技术是 90年代兴起的一种对成百上千甚至上万个基因同时进行检测的新技术 ,它具有高通量和并行化的特点 ,广泛应用于基因表达、预测基因功能、检测基因突变和多态性分析、发现新药物和药物靶器官以及疫苗设计等方面。文章对 DN... DNA微阵列技术是 90年代兴起的一种对成百上千甚至上万个基因同时进行检测的新技术 ,它具有高通量和并行化的特点 ,广泛应用于基因表达、预测基因功能、检测基因突变和多态性分析、发现新药物和药物靶器官以及疫苗设计等方面。文章对 DNA微阵列的基本原理、DNA微阵列制备技术、杂交信号检测以及数据分析。 c DNA微阵列与细胞周期相关基因表达、细菌基因表达、病毒基因表达、肿瘤基因表达进行了概述。 展开更多
关键词 dna微阵列 基因表达 技术原理 杂交信号检测 基因功能 基因突变 多态性分析
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应用DNA芯片技术筛选禽致病性大肠杆菌和尿道致病性大肠杆菌的差异表达基因
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作者 宦海霞 张科 +2 位作者 陈祥 高崧 刘秀梵 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期19-22,共4页
为研究禽致病性大肠杆菌强毒株E058的毒力相关基因在鸡体内、体外表达情况以及E058和尿道致病性大肠杆菌HEC4在LB和尿液中培养的表达情况,本研究分别提取E058株在SPF鸡体内及E058株和HEC4株在LB和尿液中静置培养的总RNA,与构建的DNA芯... 为研究禽致病性大肠杆菌强毒株E058的毒力相关基因在鸡体内、体外表达情况以及E058和尿道致病性大肠杆菌HEC4在LB和尿液中培养的表达情况,本研究分别提取E058株在SPF鸡体内及E058株和HEC4株在LB和尿液中静置培养的总RNA,与构建的DNA芯片杂交,检测和分析RNA的差异表达情况。芯片的检测结果表明:E058株在鸡体内和LB中培养差异表达基因共有9个,上调基因为5个,分别为neuC、iutA、cvaC、aes-15和iucCD;下调基因为4个,分别为aes-8、gyrB、aec-30和mdh。另外,芯片检测结果也显示E058株和HEC4株在LB和尿液中静置培养,具有相似的基因表达情况。 展开更多
关键词 禽致病性大肠杆菌 尿道致病性大肠杆菌 毒力基因 基因表达差异 dna芯片
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