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DNA微阵列数据特征提取的分类方法研究被引量：1: 1; 作者彭红毅叶燕锐 +2 位作者张俊辉罗泽举奉国和《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第28期40-42,共3页; 常用的排列方法从DNA微数据中选择的基因集合往往会包含相关性较高的基因,而且使用单个基因评价方法也不能真正反映由此得到的特征集合分类能力的优劣。另外,基因数量远多于样本数量是进行疾病诊断面临的又一挑战。为此,提出一种DNA微... 展开更多; 关键词 dna微阵列特征提取独立成分分析(ICA) 聚类分析支持向量机(SVMs); 在线阅读下载PDF 职称材料

一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法被引量：1: 2; 作者武拴虎严洪《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2005年第2期22-25,86,共5页; DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及... 展开更多; 关键词基因芯片图像处理聚类分析基因表达信息; 在线阅读下载PDF 职称材料

重度颅内感染集束化疗效分析: 3; 作者荣轩苏高健 +2 位作者吴佳宁赵世光黄贤键《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期471-477,共7页; 目的探讨集束化治疗方案对于重度颅内感染的疗效。方法共纳入2020年7月至2023年6月深圳大学总医院和广东省深圳市第二人民医院收治的43例重度颅内感染患者,采取集束化治疗方案,先予以广谱抗生素;多途径引流并获取脑脊液行常规和生化检... 展开更多; 关键词中枢神经系统感染集束化治疗(非MeSH词) 脑脊髓液序列分析 dna 抗菌药; 在线阅读下载PDF 职称材料

用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱被引量：4: 4; 作者张亮张岩 +5 位作者周一鸣安爽果德安周玉祥曾令文程京《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期538-542,共5页; 微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况 ,它为研究药物的作用机制提供了一个新的高效技术平台 .用 9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞 ,并得到酵母细胞的全基因表达谱 ,然后对其进行聚类分析 .结果表... 展开更多; 关键词聚类法抗真菌物质处理酵母细胞全基因表达谱微阵列dna芯片聚类分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因表达数据的聚类分析研究进展被引量：25: 5; 作者岳峰孙亮 +2 位作者王宽全王永吉左旺孟《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第2期113-120,共8页; 基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具.目前聚类分析己成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具.为了更好地挖掘基因表达数据,近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法.本文首先简单介绍了基因表达... 展开更多; 关键词 dna微阵列基因表达数据聚类分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

基因芯片在抗微生物药学研究中的应用被引量：2: 6; 作者陶文琴陈杖榴曾振灵《动物医学进展》 CSCD 2003年第2期18-21,共4页; 基因芯片技术是一种高通量、快速、平行、自动化的DNA测序及基因表达研究工具。病原微生物全基因组测序的完成为抗微生物药物提供了大量潜在靶位。因而利用基因芯片技术进行抗微生物药学研究已逐渐成为热点之一。本文从药物作用机制、... 展开更多; 关键词基因芯片抗微生物药物基因表达分析作用机制药物靶位应用; 在线阅读下载PDF 职称材料

最小支撑树算法在基因表达数据聚类分析中的应用被引量：1: 7; 作者张焕萍王惠南宋晓峰《南京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期171-175,共5页; 聚类分析已成为对基因表达数据进行挖掘以提取生物医学信息的主要方法。本文提出了基于图论的最小支撑树(Minimum spanning tree,MST)聚类算法,用MST表示多维基因表达数据,可将数据的聚类转换为对最小支撑树的分割,相对于传统聚类方法,... 展开更多; 关键词最小支撑树基因表达数据聚类分析 dna微阵列; 在线阅读下载PDF 职称材料

模糊C-均值聚类分析在基因表达数据分析中的应用被引量：3: 8; 作者陈佳妮段文英丁徽《森林工程》 2010年第2期54-57,76,共5页; 为更好地挖掘基因表达数据、获取更多的生物学信息,近年来许多改进的传统聚类算法和新聚类算法不断涌现。模糊聚类在聚类分析中又具有广泛的意义和重要的应用价值。叙述基因表达数据的获取和表达,介绍应用在基因表达数据中的模糊C均值... 展开更多; 关键词 dna微阵列基因表达数据聚类分析; 在线阅读下载PDF 职称材料

相似性度量在基因表达聚类分析中的应用研究: 9; 作者孙杰吴陈《现代电子技术》 2012年第6期78-82,共5页; 聚类分析是基因表达数据分析研究的主要技术之一,其算法的基本出发点在于根据对象间相似度将对象划分为不同的类,选择适当的相似性度量准则是获得有效聚类结果的关键。采用预处理过的基因数据集在不同相似性度量准则下进行的不同聚类算... 展开更多; 关键词 dna微阵列聚类分析相似性度量基因表达; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名DNA微阵列数据特征提取的分类方法研究被引量：1: 1; 作者彭红毅叶燕锐张俊辉罗泽举奉国和; 机构华南农业大学理学院统计系华南理工大学生物科学与工程学院重庆工商大学计算机科学与信息工程学院华南师范大学经济管理学院; 出处《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第28期40-42,共3页; 基金国家社会科学基金No.08CTQ003 广东省自然科学基金No.2008276 +1 种基金重庆市科委重点攻关项目No.2008AC0043~~; 文摘常用的排列方法从DNA微数据中选择的基因集合往往会包含相关性较高的基因,而且使用单个基因评价方法也不能真正反映由此得到的特征集合分类能力的优劣。另外,基因数量远多于样本数量是进行疾病诊断面临的又一挑战。为此,提出一种DNA微阵列数据特征提取方法用于组织分类。该方法运用K-means方法对基因进行聚类分析,获取各子类DNA微阵列数据中心,用排列法去除对分类无关的子类,然后利用ICA方法提取剩余子类集合的特征,用SVMs方法构造分类器对组织进行分类。真实的生物学数据实验表明,该方法通过提取一种复合基因,能综合评价基因分类能力,减少特征数,提高分类器的分类准确性。; 关键词 dna微阵列特征提取独立成分分析(ICA) 聚类分析支持向量机(SVMs); Keywords dna microarray extracting feature Independent Components analysis （ICA） clustering analysis Support Vector Machines （SVMs）; 分类号 TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法被引量：1: 2; 作者武拴虎严洪; 机构烟台大学计算机学院香港城市大学电脑工程和资讯科技系; 出处《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2005年第2期22-25,86,共5页; 基金香港城市大学交叉学科基金(编号:9010003); 文摘 DNA基因芯片可以同时监控成千上万个基因的表达信息。图像分析是基因芯片试验中一个重要的环节,直接影响到其后续的处理、分析和研究,比如鉴别预测具有不同表达信息的基因功能。基因芯片图像分析包括三个步骤:图像网格化,图像分割以及信息抽取。该文主要研究分割和信息抽取问题。首先基于K-Means聚类技术提出了一种新的分割方法;其次基于统计分析文章建议了一种新的背景和前景分割校正方法用于更准确的信息抽取。新方法的优点是对于基因芯片中spot图像没有任何形状限制。实际图像分析结果与目前最流行的基因芯片图像分析软件GenePix对比研究表明该文算法是精确有效的。; 关键词基因芯片图像处理聚类分析基因表达信息; Keywords dna microarray,image processing,clustering analysis,Gene expressions; 分类号 TP301.6 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名重度颅内感染集束化疗效分析: 3; 作者荣轩苏高健吴佳宁赵世光黄贤键; 机构汕头大学医学院广东省深圳市第二人民医院神经外科深圳大学总医院神经外科; 出处《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心 2024年第6期471-477,共7页; 基金广东省基础与应用基础研究基金项目(项目编号:2023A1515010320) 广东省普通高校重点领域专项(项目编号:2021ZDZX2020) 广东省深圳市科技计划项目(项目编号:JCYJ20210324100001004)。; 文摘目的探讨集束化治疗方案对于重度颅内感染的疗效。方法共纳入2020年7月至2023年6月深圳大学总医院和广东省深圳市第二人民医院收治的43例重度颅内感染患者,采取集束化治疗方案,先予以广谱抗生素;多途径引流并获取脑脊液行常规和生化检测、微生物培养及第二代测序(NGS);完善头部和胸部CT和(或)MRI平扫和增强扫描;待脑脊液NGS测序结果回报后精准调整抗生素治疗方案;序贯引流脑脊液;严重脑室内感染患者予脑室镜(软式内镜)冲洗和脑室造瘘;定期复查行脑脊液和血液感染指标测定和微生物培养,待各项指标正常1周后调整抗生素或停药;根据临床表现、实验室和影像学检查结果综合判断疗效。结果16例予广谱抗生素美罗培南+万古霉素抗感染治疗;脑脊液检查,微生物(细菌、真菌、病毒)培养阳性12例(27.91%),NGS测序阳性35例(81.40%),经NGS测序明确病原体后,15例调整为敏感抗生素,12例症状明显改善、3例无明显改善;27例(62.79%)行外科治疗,包括脓肿穿刺引流术7例(16.28%)、Ommaya囊植入术6例(13.95%)、脑室外引流术11例(25.58%,其中8例行脑室镜冲洗和脑室造瘘)、腰大池引流术3例(6.98%);住院时间为30(19,57)d,37例(86.05%)治愈出院、6例(13.95%)死亡。结论重度颅内感染患者经集束化治疗后治愈率显著提高,早期启动集束化治疗方案可明显改善患者预后,值得临床推广应用。; 关键词中枢神经系统感染集束化治疗(非MeSH词) 脑脊髓液序列分析 dna 抗菌药; Keywords Central nervous system infections cluster therapy(not in MeSH) Cerebrospinal fluid Sequence analysis,dna Anti⁃bacterial agents; 分类号 R742.9 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱被引量：4: 4; 作者张亮张岩周一鸣安爽果德安周玉祥曾令文程京; 机构清华大学生物科学与技术系生物芯片北京国家工程研究中心北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室; 出处《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第4期538-542,共5页; 基金国家自然科学基金 (3 98890 0 1 3 982 5 10 8 +1 种基金 3 0 0 70 917) 国家重点基础研究 (G19990 116)资助项目~~; 文摘微阵列DNA芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况 ,它为研究药物的作用机制提供了一个新的高效技术平台 .用 9种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞 ,并得到酵母细胞的全基因表达谱 ,然后对其进行聚类分析 .结果表明作用机制类似的化合物具有相近的聚类关系 .两性霉素B和制霉菌素、酮康唑和克霉唑都是已知的作用机制类似的抗真菌药物 .通过对基因表达谱进行聚类分析 ,发现前一组和后一组分别被聚类在一起 .另外已知澳洲茄胺抑制的是细胞膜上麦角固醇的合成 ,聚类分析表明它与酮康唑 ,克霉唑的聚类很靠近 .对微阵列DNA芯片产生的基因表达谱进行聚类分析 ,由于作用机制相似的药物会被聚类在一起 ,因此根据未知药物和已知药物的聚类关系 ,可以了解未知药物的作用机制。; 关键词聚类法抗真菌物质处理酵母细胞全基因表达谱微阵列dna芯片聚类分析; Keywords dna microarray, cluster analysis, antifungal agents; 分类号 Q78 [生物学—分子生物学] Q949.326.1 [生物学—植物学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因表达数据的聚类分析研究进展被引量：25: 5; 作者岳峰孙亮王宽全王永吉左旺孟; 机构哈尔滨工业大学计算机学院生物信息技术研究中心中国科学院软件研究所互联网软件技术实验室; 出处《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第2期113-120,共8页; 基金国家高技术研究发展计划(863计划)(2006AA012308) 国家自然科学基金(60373053，60571025)资助~~; 文摘基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具.目前聚类分析己成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具.为了更好地挖掘基因表达数据,近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法.本文首先简单介绍了基因表达数据的获取和表示,之后系统地介绍了近年来应用在基因表达数据分析中的聚类算法.根据聚类目标的不同将算法分为基于基因的聚类、基于样本的聚类和两路聚类,并对每类算法介绍了其生物学的含义及其难点,详细讨论了各种算法的基本原理及优缺点.最后总结了当前的基因表达数据的聚类分析方法,并对发展趋势作了进一步的展望.; 关键词 dna微阵列基因表达数据聚类分析; Keywords dna microarray, gene expression data, cluster analysis; 分类号 TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名基因芯片在抗微生物药学研究中的应用被引量：2: 6; 作者陶文琴陈杖榴曾振灵; 机构华南农业大学广东省兽药研制与安全性评价重点实验室; 出处《动物医学进展》 CSCD 2003年第2期18-21,共4页; 文摘基因芯片技术是一种高通量、快速、平行、自动化的DNA测序及基因表达研究工具。病原微生物全基因组测序的完成为抗微生物药物提供了大量潜在靶位。因而利用基因芯片技术进行抗微生物药学研究已逐渐成为热点之一。本文从药物作用机制、药物靶位研究、病原菌与寄主的相互作用、病原菌的鉴定及其耐药性的监测以及新药筛选、用药个体化等方面对其进行了综述。; 关键词基因芯片抗微生物药物基因表达分析作用机制药物靶位应用; Keywords dna microarray antimicrobial agents gene expression analysis; 分类号 TQ464 [化学工程—制药化工] TQ460.38 [化学工程—制药化工]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名最小支撑树算法在基因表达数据聚类分析中的应用被引量：1: 7; 作者张焕萍王惠南宋晓峰; 机构南京航空航天大学自动化学院; 出处《南京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第2期171-175,共5页; 文摘聚类分析已成为对基因表达数据进行挖掘以提取生物医学信息的主要方法。本文提出了基于图论的最小支撑树(Minimum spanning tree,MST)聚类算法,用MST表示多维基因表达数据,可将数据的聚类转换为对最小支撑树的分割,相对于传统聚类方法,最小支撑树算法具有形象直观、对一些准则函数能产生全局最优解等优点;将MST算法分别与Memetic algorithm及人工免疫算法(Artificial immune network,aiNet)相结合,则产生更优化的聚类结果。对酵母基因表达数据的实验结果表明,最小支撑树聚类算法是一种有效的基因表达数据的聚类方法。; 关键词最小支撑树基因表达数据聚类分析 dna微阵列; Keywords minimum spanning tree （MST） gene expression data clustering analysis dna microarray; 分类号 Q811.4 [生物学—生物工程]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名模糊C-均值聚类分析在基因表达数据分析中的应用被引量：3: 8; 作者陈佳妮段文英丁徽; 机构东北林业大学; 出处《森林工程》 2010年第2期54-57,76,共5页; 文摘为更好地挖掘基因表达数据、获取更多的生物学信息,近年来许多改进的传统聚类算法和新聚类算法不断涌现。模糊聚类在聚类分析中又具有广泛的意义和重要的应用价值。叙述基因表达数据的获取和表达,介绍应用在基因表达数据中的模糊C均值聚类算法以及不同的实现途径和相应的优缺点,简述聚类结果的评价问题,并对发展趋势做进一步的展望。; 关键词 dna微阵列基因表达数据聚类分析; Keywords dna microarray gene expression data clustering analysis; 分类号 O212.4 [理学—概率论与数理统计]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名相似性度量在基因表达聚类分析中的应用研究: 9; 作者孙杰吴陈; 机构江苏科技大学计算机科学与工程学院; 出处《现代电子技术》 2012年第6期78-82,共5页; 文摘聚类分析是基因表达数据分析研究的主要技术之一,其算法的基本出发点在于根据对象间相似度将对象划分为不同的类,选择适当的相似性度量准则是获得有效聚类结果的关键。采用预处理过的基因数据集在不同相似性度量准则下进行的不同聚类算法的聚类分析,并得到聚类结果评价。其中算法本身的缺陷及距离相似性度量的局限性都是影响结果评价的因素,为了获得更有效的聚类结果,改进相关聚类算法并提出了一种比例相似性度量准则。; 关键词 dna微阵列聚类分析相似性度量基因表达; Keywords dna microarray clustering analysis similarity measurement gene expression; 分类号 TN911-34 [电子电信—通信与信息系统] TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	DNA微阵列数据特征提取的分类方法研究	彭红毅叶燕锐张俊辉罗泽举奉国和	《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心	2010	1	在线阅读下载PDF 职称材料
2	一种基于聚类和统计分析DNA基因芯片图像处理算法	武拴虎严洪	《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心	2005	1	在线阅读下载PDF 职称材料
3	重度颅内感染集束化疗效分析	荣轩苏高健吴佳宁赵世光黄贤键	《中国现代神经疾病杂志》 CAS 北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
4	用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱	张亮张岩周一鸣安爽果德安周玉祥曾令文程京	《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心	2002	4	在线阅读下载PDF 职称材料
5	基因表达数据的聚类分析研究进展	岳峰孙亮王宽全王永吉左旺孟	《自动化学报》 EI CSCD 北大核心	2008	25	在线阅读下载PDF 职称材料
6	基因芯片在抗微生物药学研究中的应用	陶文琴陈杖榴曾振灵	《动物医学进展》 CSCD	2003	2	在线阅读下载PDF 职称材料
7	最小支撑树算法在基因表达数据聚类分析中的应用	张焕萍王惠南宋晓峰	《南京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心	2007	1	在线阅读下载PDF 职称材料
8	模糊C-均值聚类分析在基因表达数据分析中的应用	陈佳妮段文英丁徽	《森林工程》	2010	3	在线阅读下载PDF 职称材料
9	相似性度量在基因表达聚类分析中的应用研究	孙杰吴陈	《现代电子技术》	2012	0	在线阅读下载PDF 职称材料