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东安舜皇山国家级自然保护区资源冷杉遗传多样性分析及DNA指纹构建 被引量：1
1
作者 唐隆平 张占平 +3 位作者 吕明洲 肖倩茹 苏艳 唐绍清 《湖南林业科技》 2025年第3期36-41,共6页
东安舜皇山国家级自然保护区是资源冷杉的重要分布地之一。本研究应用7对SSR分子标记引物对该保护区资源冷杉的全部14个个体进行了遗传多样性分析。结果表明:7个SSR位点的等位基因数量(N_(a))为4~9个,平均为6.7个;有效等位基因数量(N_(... 东安舜皇山国家级自然保护区是资源冷杉的重要分布地之一。本研究应用7对SSR分子标记引物对该保护区资源冷杉的全部14个个体进行了遗传多样性分析。结果表明:7个SSR位点的等位基因数量(N_(a))为4~9个,平均为6.7个;有效等位基因数量(N_(a))为3.698~5.939个,平均为4.610个;观测杂合度(H_(o))为0.286~1.000,平均为0.742;期望杂合度(H_(e))为0.730~0.832,平均为0.774,显示该种群维持了一定水平的遗传多样性。进一步地,使用AFSI16/As20引物组合构建了DNA指纹图谱。本研究为该保护区资源冷杉个体的快速鉴定和科学保护提供了可靠的分子依据。 展开更多
关键词 资源冷杉 遗传多样性 dna指纹图谱 SSR 标记
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基于果实性状和ISSR分子标记的荔枝种质遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建
2
作者 刘小英 吴碧君 +3 位作者 曾丽兰 张游南 林革 刘国强 《南方农业学报》 北大核心 2025年第7期2216-2229,共14页
【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物... 【目的】基于果实性状和ISSR分子标记对34份荔枝种质开展遗传多样性及聚类分析,并构建DNA指纹图谱,以期为荔枝种质资源分类鉴定、评价和创新利用提供理论参考。【方法】以我国34份荔枝种质资源为研究对象,对其平均单果重、可溶性固形物含量、果形、龟裂片形状、缝合线是否明显等果实性状进行观测,并进行变异分析、多样性分析及相关分析,分别基于果实形状和ISSR分子标记进行聚类分析。最后基于ISSR分子标记检测结果构建DNA指纹图谱。【结果】34份荔枝种质的单果重17.0~57.5 g,可溶性固形物含量13.0%~20.7%,果形有心形、近圆球形、卵圆形、椭圆形、歪心形,龟裂片形状有隆起、锥尖状突起、平滑,缝合线明显或不明显。果实性状的Shannon-Weaver多样性指数为0.67~1.97,其中缝合线是否明显最低,可溶性固形物含量最高。单果重与可溶性固形物含量呈极显著负相关(P<0.01),果形与龟裂片形状呈显著正相关(P<0.05)。基于果实性状的聚类结果显示,在欧氏距离为8时,供试材料被分为四大类,果实性状聚类结果与荔枝种质的果实缝合线是否明显相关性较强,其次是按果形和龟裂片形状进行聚类,且各类群包含不同地区的种质,说明聚类结果与地理分布无明显相关性。17条ISSR引物共扩增出191条条带,其中多态性条带165条,平均多态性比率86.39%,引物UBC835、UBC846和UBC879多态性比率高达100.00%;等位基因数(Na)为1.6875~2.0000,平均为1.8422,有效等位基因数(Ne)为1.2498~1.7177,平均为1.4470,Nei’s基因多样性指数(H')为0.16~0.40,平均为0.26,Shannon’s信息指数(I)为0.2616~0.5746,平均为0.4015。基于ISSR分子标记的聚类结果显示,34份荔枝种质的遗传相似系数为0.5916~0.8691,平均为0.7359,在遗传相似系数0.7100时,供试材料被分成四大类,各类群均包含多个地区的荔枝种质,聚类结果与地理分布无明显相关性,而与果实成熟期存在一定的相关性。ISSR引物UBC857可用于构建34份荔枝种质资源的DNA指纹图谱。【结论】34份荔枝种质果实性状遗传多样性较丰富,但遗传相似系数较高,遗传基础较狭窄。基于果实性状的聚类结果与ISSR分子标记的聚类结果仅部分相同,均与地理分布无明显相关性,分别与荔枝种质的果实缝合线是否明显和果实成熟期存在相关性。引物UBC857可鉴别34份荔枝种质资源。 展开更多
关键词 荔枝 果实性状 ISSR分子标记 遗传多样性 dna指纹图谱
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甘肃省玉米品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析
3
作者 马艳红 王芳 +7 位作者 白丽霞 汤芳 岳庆春 王子榕 刘悦善 易红梅 刘国华 第红君 《种子》 北大核心 2025年第1期107-111,117,共6页
以甘肃省2021年审定的94个玉米品种为材料,构建DNA指纹图谱并分析其遗传多样性。结果表明,40对SSR标记检测到等位基因数473个,平均值为11.8250个;期望杂合度平均值为0.7243;Nei's基因多样性指数和Shannon-Wiener指数的平均值分别为0... 以甘肃省2021年审定的94个玉米品种为材料,构建DNA指纹图谱并分析其遗传多样性。结果表明,40对SSR标记检测到等位基因数473个,平均值为11.8250个;期望杂合度平均值为0.7243;Nei's基因多样性指数和Shannon-Wiener指数的平均值分别为0.7205和1.6728,94个玉米品种遗传多样性整体较之前有所提高。品种间的差异位点数均大于等于2个。早熟组和中晚熟组遗传距离最近,鲜食玉米在遗传上与其他玉米品种有明显的差异。研究表明,甘肃省2021年审定的玉米品种在其类型和杂优模式上都比较广泛,鲜食组表现出种质特异性。 展开更多
关键词 玉米品种 dna指纹构建 遗传多样性分析
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平顶山地区小麦种质资源DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析
4
作者 王二伟 马爱锄 +5 位作者 王健胜 杨好好 王军峰 黄雅敏 耿若飞 蒋钦群 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第10期1342-1350,共9页
小麦种质资源是小麦新品种培育的重要基础。以平顶山地区40份小麦种质为材料,利用SSR分子标记对其遗传多样性进行了分析。结果表明,引物多态性条带百分比介于35%~100%之间,平均为74.5%,29对SSR引物共扩增出164个多态性条带,单对SSR引物... 小麦种质资源是小麦新品种培育的重要基础。以平顶山地区40份小麦种质为材料,利用SSR分子标记对其遗传多样性进行了分析。结果表明,引物多态性条带百分比介于35%~100%之间,平均为74.5%,29对SSR引物共扩增出164个多态性条带,单对SSR引物平均扩增5.60个,SSR引物有效等位基因数、Nei's基因多样性指数和Shannon's信息指数变化范围分别为1.17~1.66、0.11~0.38和0.17~0.55,平均值分别为1.43、0.26和0.39。不同小麦种质间的遗传相似系数变化范围为0.55~0.98,平均为0.77。基于遗传相似系数将40份小麦资源聚类为5个类群,第I类群包含3个小麦种质,第Ⅱ类包含11个小麦种质,第Ⅲ类群有5个小麦种质,第Ⅳ类群有3个小麦种质,第Ⅴ类群包含的小麦种质数最多,共有18个,占参试种质数量的45.0%。主成分分析结果与聚类分析结果基本一致。同时,利用SSR标记构建了40个小麦种质的DNA指纹图谱。 展开更多
关键词 小麦 SSR分子标记 dna指纹图谱 遗传多样性
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基于51K液相探针构建国外松良种的DNA指纹图谱
5
作者 吴亚荻 刁姝 +2 位作者 丁显印 黄琴韵 栾启福 《林业科学》 北大核心 2025年第6期109-119,共11页
【目的】由于国外松在苗期的形态特征十分相似,区分这些良种具有一定的挑战性。本研究旨在构建一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,为国外松种质资源管理、良种知识产权保护等提供技术支持。【方法】本研究以38份国外松本种及其杂种松良... 【目的】由于国外松在苗期的形态特征十分相似,区分这些良种具有一定的挑战性。本研究旨在构建一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,为国外松种质资源管理、良种知识产权保护等提供技术支持。【方法】本研究以38份国外松本种及其杂种松良种为材料,利用湿地松和火炬松的51K液相探针芯片进行SNPs捕获,获得38个国外松改良品种的基因型数据。通过次要等位基因频率、缺失率、杂合率和多态性信息含量等遗传参数筛选能够高效识别国外松种质资源的核心SNPs;根据PIC值进一步简化SNP标记的数量,达到较少数量的SNPs能高效识样本的目的。【结果】通过SNP位点捕获和基因分型,共得到560,567个SNPs位点,筛选得到344个核心SNPs,并利用PIC值进一步精简为20个SNPs,能够高效区分湿地松、火炬松、加勒比松及其杂交松,成功建立了38个松树良种的DNA指纹图谱。【结论】开发了一套针对国外松良种的DNA指纹图谱,建立了指纹图谱鉴定国外松及其良种的方法,可为良种知识产权保护、种质管理和系谱分析提供技术支持。 展开更多
关键词 dna指纹图谱 品种鉴别 湿地松 火炬松
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大杯蕈遗传多样性分析和DNA指纹图谱构建
6
作者 吴碧君 邱春锦 +3 位作者 卢翠香 郑永德 曾丽兰 刘小英 《热带农业科学》 2025年第6期56-64,共9页
为了解大杯蕈种质资源的遗传多样性,加快大杯蕈良种选育进程,以10株大杯蕈菌株为试验材料,调查其农艺性状,采用拮抗试验和ISSR、RAPD、SRAP分子标记,分析10株大杯蕈菌株间的遗传多样性,基于3种分子标记扩增结果进行指纹图谱构建。农艺... 为了解大杯蕈种质资源的遗传多样性,加快大杯蕈良种选育进程,以10株大杯蕈菌株为试验材料,调查其农艺性状,采用拮抗试验和ISSR、RAPD、SRAP分子标记,分析10株大杯蕈菌株间的遗传多样性,基于3种分子标记扩增结果进行指纹图谱构建。农艺性状聚类分析显示,在欧氏距离2.5时,10份大杯蕈菌株被分为4类。筛选出的8个ISSR引物、10个RAPD引物、12对SRAP引物分别扩增出清晰条带111、121、166条,多态性比率ISSR(81.98%)>SRAP(77.71%)>RAPD(66.12%)。基于3种分子标记的综合聚类结果,当遗传相似系数为0.76时,10份大杯蕈种质菌株被分为4类,具有相似遗传背景的菌株聚为一类。10份供试菌株具有较丰富的遗传多样性,农艺性状聚类结果、拮抗试验与3种分子标记的综合聚类结果基本一致。ISSR分子标记的聚类结果与菌株间遗传背景更吻合,且ISSR引物组合可用于构建DNA指纹图谱。研究结果可为大杯蕈菌株鉴定和亲缘关系分析提供依据。 展开更多
关键词 大杯蕈 分子标记 遗传多样性 dna指纹图谱
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基于KASP-SNP的辣椒品种辣美11号DNA指纹图谱构建和种子纯度检测
7
作者 胡宗伟 宗琛 +3 位作者 戴蕾 魏周颖 戴祖云 杨中周 《中国瓜菜》 北大核心 2025年第4期45-52,共8页
为向辣椒杂交种子品种识别、纯度鉴定等工作提供更为高效、可靠的方法,基于辣椒全基因组开发的65对核心SNP标记,通过KASP-SNP技术对辣椒品种辣美11号及其双亲进行基因分型。利用条码在线生成软件将遗传信息转化为二维码,完成了辣美11号... 为向辣椒杂交种子品种识别、纯度鉴定等工作提供更为高效、可靠的方法,基于辣椒全基因组开发的65对核心SNP标记,通过KASP-SNP技术对辣椒品种辣美11号及其双亲进行基因分型。利用条码在线生成软件将遗传信息转化为二维码,完成了辣美11号及其双亲的种质身份证的构建。利用CaSNP10和CaSNP11两个分子标记检测辣美11号的纯度为98.4%,同时通过对比SSR分子标记以及田间纯度鉴定结果,验证了结果的可靠性。本研究实现了辣椒品种辣美11号的高通量检测,为实现辣椒品种权保护及高通量背景下辣椒的品种纯度鉴定提供了可靠依据。 展开更多
关键词 辣椒 dna指纹图谱 品种纯度 KASP SNP SSR
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云南甘蔗自育品种DNA指纹身份证构建 被引量：59
8
作者 刘新龙 马丽 +4 位作者 陈学宽 应雄美 蔡青 刘家勇 吴才文 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期202-210,共9页
以云南27份甘蔗自育品种为材料，从国际微卫星协会提供的120对SSR引物中筛选出8对多态性丰富、品种聚类区分率高、易统计的引物组成核心引物。8对SSR引物共产生129条带，123个为多态带，多态条带比例为95．35％，多态信息量平均为0．944... 以云南27份甘蔗自育品种为材料，从国际微卫星协会提供的120对SSR引物中筛选出8对多态性丰富、品种聚类区分率高、易统计的引物组成核心引物。8对SSR引物共产生129条带，123个为多态带，多态条带比例为95．35％，多态信息量平均为0．9445，品种相似性系数在0．269～0．767之间，其中引物SMC1047HA，MSSCIR21不仅多态性丰富，而且单个引物就可区分所有品种，是最有效的核心引物。8对核心引物两两组合的效率分析表明，MSSCIR36／MSSCIR2、MSSCIR16／MSSCIR36和MSSCIR36／SMC336BS是高效引物组合，可以完全有效区分所有品种，且品种相似性系数较低；同时使用蔗区种植面积较大的10个主栽品种验证3个高效引物组合，结果表明，MSSCIR16／MSSCIR36是最佳引物组合，不仅能有效区分所有云南甘蔗自育品种，而且能将云南甘蔗自育品种与10个主栽品种最有效地区分开。使用品种的国圃号、国家地区代码、育种单位英文缩写、核心引物名称和分子数据组成云南甘蔗自育品种的DNA指纹身份证，不仅包含了品种的重要信息，而且其中的分子数据可用于品种的真伪鉴定和遗传关系分析，为品种的知识产权保护提供有效的科学依据。 展开更多
关键词 云南甘蔗品种 SSR dna 指纹 身份证
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玉米杂交种DNA指纹图谱及其在亲子鉴定中的应用 被引量：62
9
作者 李晓辉 李新海 +4 位作者 高文伟 田清震 李明顺 马凤鸣 张世煌 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期386-391,共6页
采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术... 采用79对SSR引物分析了86个玉米杂交种的72份亲本自交系的遗传多态性,从中筛选出扩增带型清晰、稳定的50对引物用于构建86个杂交种的DNA指纹图谱数据库,进而确定10对核心引物和判别标准用于亲子鉴定研究。结合玉米SSR分子标记检测技术和单籽粒DNA快速提取方法,DNA指纹数据库和判别标准可有效地用于玉米杂交种的亲子鉴定。 展开更多
关键词 玉米 SSR标记 dna指纹 亲子鉴定
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建立小麦品种DNA指纹的方法研究 被引量：67
10
作者 王立新 李云伏 +6 位作者 常利芳 黄岚 李宏博 葛玲玲 刘丽华 姚骥 赵昌平 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期1738-1740,共3页
建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多... 建立小麦DNA指纹对遗传资源评价、品种权益保护、种子质量鉴定具有重要的意义。本研究采用15个SSR标记和20个AFLP-SCAR标记,分析了来自我国不同麦区的455个小麦品种,证明用两种分子标记建立小麦DNA指纹可以更加全面地反应品种的遗传多样性。从而,在提出采用SSR标记与AFLP-SCAR标记构建小麦品种DNA指纹的技术路线的基础上,建立了构建DNA指纹的方法模式。按此方法获得的品种指纹代码可以经条形码软件转换为条形码,使为每个品种建立身份证的设想成为可能。 展开更多
关键词 小麦 dna指纹 SSR标记 AFLP-SCAR标记
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镉胁迫对大麦幼苗基因组DNA多态性影响 被引量：33
11
作者 刘宛 郑乐 +3 位作者 李培军 齐雪梅 周启星 孙铁珩 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期19-24,共6页
采用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术,在实验室条件下研究了镉胁迫对大麦幼苗根尖基因组DNA的多态性影响,比较了RAPD图谱与幼苗根系生长、可溶性蛋白含量变化的关系。结果表明,20￣80mg·L-1Cd溶液处理8d后,大麦幼苗根的生长及根系中... 采用随机扩增DNA多态性(RAPD)技术,在实验室条件下研究了镉胁迫对大麦幼苗根尖基因组DNA的多态性影响,比较了RAPD图谱与幼苗根系生长、可溶性蛋白含量变化的关系。结果表明,20￣80mg·L-1Cd溶液处理8d后,大麦幼苗根的生长及根系中可溶性蛋白质含量均受到不同程度的抑制,在所用的12条寡核苷酸序列10碱基(bp)引物中,仅有5条引物可以扩增出特异、稳定的PCR产物。对照大麦根尖基因组DNA的RAPD图谱中可分辨出51条谱带,其分子量在240～2344bp之间。Cd胁迫影响使大麦基因组的RAPD图谱产生明显的改变,包括RAPD谱带的增加、缺失及其荧光强度的改变,而且这些变化与Cd剂量有关。这些结果表明Cd明显影响基因组模板的稳定性(RAPD图谱变化的定性描述指标),利用RAPD分析获得的DNA多态性变化可作为检测Cd污染对植物遗传毒性效应的生物标记物。 展开更多
关键词 RAPD CD胁迫 大麦幼苗 遗传毒性 dna印迹
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利用SRAP标记构建18个木薯品种的DNA指纹图谱 被引量：42
12
作者 齐兰 王文泉 +2 位作者 张振文 叶剑秋 李开绵 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第10期1642-1648,共7页
利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行... 利用SRAP标记,选用36对多态性较好的引物组合,对18个木薯品种进行分析鉴定,扩增出320个位点,其中多态性位点235个,多态性比率达73.4%,平均每对引物组合可产生8.9个位点和6.5个多态性位点;235个多态性位点采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,以遗传相似系数0.734为阈值,可将18份供试材料分为4组;选用2对多态性引物Me1-Em5和Me24-Em10,初步构建了18份木薯品种的指纹图谱,根据条带的有无转换为0、1二进制编码形成数字指纹,每个品种拥有唯一的数字指纹区别于其他品种,置信概率达到99.999%。结果表明,采用SRAP标记建立的指纹图谱适用于木薯品种的分类和鉴定。 展开更多
关键词 木薯 SRAP dna指纹图谱
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贵州地方火龙果芽变种质DNA指纹图谱及遗传多样性的ISSR分析 被引量：31
13
作者 张冰雪 范付华 +3 位作者 乔光 宋莎 文晓鹏 刘涛 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期573-577,共5页
【目的】为了构建火龙果芽变种质的DNA指纹图谱,并揭示种质间的遗传关系,【方法】以贵州近几年选育的一些优良火龙果种质为试材,采用ISSR标记技术和NTSYS 2.01软件对这些新种质及其原始品种进行分析。【结果】利用筛选出的52条引物进行... 【目的】为了构建火龙果芽变种质的DNA指纹图谱,并揭示种质间的遗传关系,【方法】以贵州近几年选育的一些优良火龙果种质为试材,采用ISSR标记技术和NTSYS 2.01软件对这些新种质及其原始品种进行分析。【结果】利用筛选出的52条引物进行PCR扩增,共扩增出364个清晰、重复性好的标记,其中215个（60%）为多态性标记。M08、845和881等3个引物扩增出的标记能将22份种质区分开来。采用NTSYS 2.01软件计算,供试种质间的相似性系数为0.70~0.96,平均0.81,其中红肉种质间平均值为0.82,白肉为0.89。UPGMA聚类分析显示,在相似系数0.9处可将供试材料分为11类,其中7份分别各自聚类（红肉占86%）。【结论】火龙果体细胞变异率较高,且红肉品种高于白肉品种,通过芽变选种能有效地实现遗传改良。 展开更多
关键词 火龙果 贵州 ISSR 遗传多样性 dna指纹图谱
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杨山牡丹和牡丹种间杂交后代的DNA分子证据 被引量：32
14
作者 索志立 周世良 +1 位作者 张会金 张治明 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2004年第6期700-705,共6页
以杨山牡丹作母本,分别以牡丹品种'赵粉'(PaeoniasuffruticosaAndr.cv.'ZhaoFen')和'紫二乔'(P suffruticosacv.'ZiErQiao')作父本,进行人工杂交,获得了杂交后代。利用DNAISSR标记技术构建的亲子代DNA... 以杨山牡丹作母本,分别以牡丹品种'赵粉'(PaeoniasuffruticosaAndr.cv.'ZhaoFen')和'紫二乔'(P suffruticosacv.'ZiErQiao')作父本,进行人工杂交,获得了杂交后代。利用DNAISSR标记技术构建的亲子代DNA指纹图谱显示,在杂交后代中检测到了分别来自双亲的特征带。建立起来的专用于牡丹研究的ISSR标记技术方法可以用于牡丹杂交种的苗期快速鉴定。 展开更多
关键词 杨山牡丹 牡丹 种间杂交 杂交后代 dna指纹图谱 品种鉴定 ISSR标记
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SSR荧光标记毛细管电泳检测法在水稻DNA指纹鉴定中的应用 被引量：65
15
作者 程本义 夏俊辉 +1 位作者 龚俊义 杨仕华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期672-676,共5页
以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳... 以16个杂交水稻不育系、恢复系及组合为材料,初步建立了水稻品种SSR荧光标记毛细管电泳检测方法。与常规凝胶电泳检测方法相比,荧光标记毛细管电泳检测方法可以读出目标DNA片段的准确大小,检测数据更为精确,检测效率更高。常规凝胶电泳检测方法验证表明,利用SSR荧光标记毛细管电泳检测方法进行水稻品种DNA指纹鉴定,方法可行、结果可靠。 展开更多
关键词 水稻 SSR荧光标记 毛细管电泳 dna指纹鉴定
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采用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群结构特征 被引量：23
16
作者 乔德才 陈敬 +2 位作者 魏桂芳 王凌华 赵立平 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期517-521,共5页
目的 :用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群区系结构的特征。方法 :对 7名中长跑运动员进行连续 6天的跟踪观察 ,直接从其粪便样品中提取出总DNA为模板 ,进行ERIC-PCR扩增 ,得到反映肠道微生物菌群结构特征的DNA指纹图。结果 :... 目的 :用DNA指纹图谱技术分析中长跑运动员肠道菌群区系结构的特征。方法 :对 7名中长跑运动员进行连续 6天的跟踪观察 ,直接从其粪便样品中提取出总DNA为模板 ,进行ERIC-PCR扩增 ,得到反映肠道微生物菌群结构特征的DNA指纹图。结果 :根据图谱多样性指数变化和相似性系数值的分布特征 ,受试运动员表现出两种类型 :一类菌群区系结构稳定 ,受运动负荷变化影响较小 ;另一类菌群区系结构随运动负荷的增减出现较大波动。结果表明 :运动员DNA指纹图谱特征存在明显个体差异 ;运动负荷的变化可能改变运动员肠道菌群区系结构。提示稳定的菌群结构可能是运动员在剧烈运动条件下保持良好机能状态的重要因素之一。 展开更多
关键词 肠道菌群 dna指纹图谱 取出 改变 剧烈运动 观察 中长跑运动员 运动负荷 特征 技术分析
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32个棉花主栽品种DNA指纹图谱构建及遗传多样性分析 被引量：26
17
作者 张玉翠 杨伟华 +5 位作者 匡猛 许红霞 王延琴 周大云 冯新爱 苏畅 《棉花学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期120-126,共7页
以我国2010年32个主栽品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从95对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的40对引物,共扩增出161种多态性基因型,平均每对引物扩增出4.025种。引... 以我国2010年32个主栽品种为材料,利用SSR标记进行DNA指纹图谱的构建和遗传多样性分析。从95对SSR引物中,挑选出多态性高、稳定性好、均匀分布在棉花26条染色体上的40对引物,共扩增出161种多态性基因型,平均每对引物扩增出4.025种。引物多态信息量(PIC)0.2989～0.7585,平均为0.5407。11对引物在13个品种上有特征带型,最少利用5对引物就可以将32份材料完全区分开。利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明:长江流域棉区品种间遗传差异最大,黄河流域棉区次之,新疆棉区最小;常规种遗传基础较杂交种窄。 展开更多
关键词 棉花 SSR dna 指纹图谱 遗传多样性
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新陆早棉花品种DNA指纹图谱的构建及遗传多样性分析 被引量：29
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作者 聂新辉 尤春源 +6 位作者 李晓方 秦江鸿 黄聪 郭欢乐 王夏青 赵文霞 林忠旭 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2104-2117,共14页
以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料,从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上（每条染色体上选择2-3对）的75对核心引物,检测到多态性位点226个,每个标记检测到的基因型位点数在2-12之间... 以新疆2013年前审定的51个新陆早常规棉花品种为材料,从5000对SSR引物中筛选出多态性高、稳定性好、且定位在棉花26条染色体上（每条染色体上选择2-3对）的75对核心引物,检测到多态性位点226个,每个标记检测到的基因型位点数在2-12之间,平均为3.01个;引物多态信息量（PIC）值介于0.0799-0.8752之间,平均值为0.6624。结果显示,在51份新陆早棉花常规品种中,可利用特征引物将21份品种一次性区分开。利用40对引物可以完全区分开新陆早51份常规品种,并构建供试品种的指纹图谱。同时利用NTSYS-pc V2.10软件聚类分析表明,51个新陆早棉花品种遗传相似系数变化范围为0.4269-0.9873,平均值为0.7071,说明新陆早棉花品种之间遗传多样性较狭窄;遗传相似系数矩阵和聚类分析将51个新陆早品种分为4大类型,与原品种选育系谱高度吻合。 展开更多
关键词 新陆早常规品种 SSR dna指纹图谱 遗传多样性
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中国松毛虫属八个种和亚种亲缘关系的DNA指纹证据 被引量：30
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作者 张爱兵 孔祥波 +1 位作者 李典谟 刘友樵 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期236-242,共7页
利用DNA指纹谱方法探讨了中国松毛虫属 8个种和亚种〔马尾松毛虫Dendrolimuspunctatuspunctatus (Walker) ,德昌松毛虫D .punctatustehchangensisTsaietLiu ,文山松毛虫D .punctatuswenshanensisTsaietLiu ,思茅松毛虫D .kikuchiiMatsum... 利用DNA指纹谱方法探讨了中国松毛虫属 8个种和亚种〔马尾松毛虫Dendrolimuspunctatuspunctatus (Walker) ,德昌松毛虫D .punctatustehchangensisTsaietLiu ,文山松毛虫D .punctatuswenshanensisTsaietLiu ,思茅松毛虫D .kikuchiiMatsumura,赤松毛虫D .spectabilisButler,油松毛虫D .tabulaeformisTsaietLiu ,落叶松毛虫D .superans (Butler) ,云南松毛虫D .houiLajonquiere]之间的亲缘关系。 13个随机引物在 8种松毛虫中共检测到 16 8个多态分子标记。分析表明 ,这 8个种间的遗传距离的变化范围为 0 3780～ 0 736 0 ;马尾松毛虫与其亚种德昌松毛虫的遗传距离最近 ,为 0 3780 ,与其另一亚种文山松毛虫以及油松毛虫的遗传距离次之 ,皆为 0 5 2 33;赤松毛虫、落叶松毛虫、云南松毛虫与马尾松毛虫的遗传距离则再次之 ,分别为0 6 36 2 ,0 6 770和 0 6 94 4 ;与马尾松毛虫遗传距离最远的是思茅松毛虫 ,为 0 736 0。 8种松毛虫间具体的亲缘关系为 :(D .superans (D .tabulaeformis (D .p .wenshanensis (D .p .tehchangensis,D .p.punctatus) ) ) ) (D .kikuchii (D .spectabilis,D .houi) )。 展开更多
关键词 松毛虫 松毛虫属 亲缘关系 dna指纹
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中国鸭茅主栽品种DNA指纹图谱构建 被引量：29
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作者 蒋林峰 张新全 +4 位作者 黄琳凯 马啸 罗登 张宗瑜 蒙芬 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期604-614,共11页
利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特... 利用SSR标记和SCoT标记构建了我国主栽的21个鸭茅品种的DNA指纹图谱。从180对SSR引物和80个SCoT引物中,筛选出多态性高、谱带清晰的SSR引物和SCoT引物各24个。24对SSR引物在供试材料中共检测到186个条带,其中多态性条带为175个,品种特异条带6个,平均多态性比率94.03%,多态性信息量均值0.845,Shannon指数变幅0.4479～0.6549,基因多样性指数变幅0.2946～0.4633,可鉴别的品种数2～21个；利用24个SCoT引物在供试材料中共检测到321个条带,其中多态性条带为249个,品种特异条带6个,平均多态性比率76.33%,多态性信息量均值0.907,Shannon指数变幅0.2588～0.6329,基因多样性指数变幅0.1695～0.4451,可鉴别的品种数1～21个；5对SSR引物和5个SCoT引物在10个品种上具有唯一特征谱带,最终综合各项指标筛选出5个引物（A01E14、A01K14、B03E14、D02K13和SCoT23）上的37个条带用于鸭茅品种DNA指纹图谱构建,数据库中每个品种均具有唯一DNA指纹编码,构建的DNA指纹数据可用于鸭茅品种真伪鉴定,为品种权保护提供了科学依据。 展开更多
关键词 鸭茅 主栽品种 SSR SCoT dna指纹图谱 遗传多样性
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