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Catalpol Promotes Differentiation of Neural Stem Cells into Oligodendrocyte via Caveolin-1-dependent Pathway in The 3D Microfluidic Chip
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作者 WANG Ya-Chen WANG Liang +1 位作者 SHEN Li-Ming LIU Jing 《生物化学与生物物理进展》 北大核心 2025年第11期2842-2853,共12页
Objective Cerebral palsy(CP)is a prevalent neurodevelopmental disorder acquired during the perinatal period,with periventricular white matter injury(PWMI)serving as its primary pathological hallmark.PWMI is characteri... Objective Cerebral palsy(CP)is a prevalent neurodevelopmental disorder acquired during the perinatal period,with periventricular white matter injury(PWMI)serving as its primary pathological hallmark.PWMI is characterized by the loss of oligodendrocytes(OLs)and the disintegration of myelin sheaths,leading to impaired neural connectivity and motor dysfunction.Neural stem cells(NSCs)represent a promising regenerative source for replenishing lost OLs;however,conventional twodimensional(2D)in vitro culture systems lack the three-dimensional(3D)physiological microenvironment.Microfluidic chip technology has emerged as a powerful tool to overcome this limitation by enabling precise spatial and temporal control over 3D microenvironmental conditions,including the establishment of stable concentration gradients of bioactive molecules.Catalpol,an iridoid glycoside derived from traditional medicinal plants,exhibits dual antioxidant and anti-apoptotic properties.Despite its therapeutic potential,the capacity of catalpol to drive NSC differentiation toward OLs under biomimetic 3D conditions,as well as the underlying molecular mechanisms,remains poorly understood.This study aims to develop a microfluidic-based 3D biomimetic platform to systematically investigate the concentration-dependent effects of catalpol on promoting NSCs-to-OLs differentiation and to elucidate the role of the caveolin-1(Cav-1)signaling pathway in this process.Methods We developed a novel multiplexed microfluidic device featuring parallel microchannels with integrated gradient generators capable of establishing and maintaining precise linear concentration gradients(0-3 g/L catalpol)across 3D NSCs cultures.This platform facilitated the continuous perfusion culture of NSC-derived 3D spheroids,mimicking the dynamic in vivo microenvironment.Real-time cell viability was assessed using Calcein-AM/propidium iodide(PI)dual staining,with fluorescence imaging quantifying live/dead cell ratios.Oligodendrocyte differentiation was evaluated through quantitative reverse transcription polymerase chain reaction(qRT-PCR)for MBP and SOX10 gene expression,complemented by immunofluorescence staining to visualize corresponding protein changes.To dissect the molecular mechanism,the Cav-1-specific pharmacological inhibitor methyl‑β‑cyclodextrin(MCD)was employed to perturb the pathway,and its effects on differentiation markers were analyzed.Results Catalpol demonstrated excellent biocompatibility,with cell viability exceeding 96%across the entire tested concentration range(0-3 g/L),confirming its non-cytotoxic nature.At the optimal concentration of 0-3 g/L,catalpol significantly upregulated both MBP and SOX10 expression(P<0.05,P<0.01),indicating robust promotion of oligodendroglial differentiation.Intriguingly,Cav-1 mRNA expression was progressively downregulated during NSC differentiation into OLs.Further inhibition of Cav-1 with MCD further enhanced this effect,leading to a statistically significant increase in OL-specific gene expression(P<0.05,P<0.01),suggesting Cav-1 acts as a negative regulator of OLs differentiation.Conclusion This study established an integrated microfluidic gradient chip-3D NSC spheroid culture system,which combines the advantages of precise chemical gradient control with physiologically relevant 3D cell culture.The findings demonstrate that 3 g/L catalpol effectively suppresses Cav-1 signaling to drive NSC differentiation into functional OLs.This work not only provides novel insights into the Cav-1-dependent mechanisms of myelination but also delivers a scalable technological platform for future research on remyelination therapies,with potential applications in cerebral palsy and other white matter disorders.The platform’s modular design permits adaptation for screening other neurogenic compounds or investigating additional signaling pathways involved in OLs maturation. 展开更多
关键词 CATALPOL neural stem cells OLIGODENDROCYTES DIFFERENTIATION CAVEOLIN-1 microfluidic chip
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征稿通知丨第十一届中国健康信息处理大会(CHIP 2025)
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作者 《中文信息学报》 北大核心 2025年第9期22-22,共1页
大会介绍中国健康信息处理大会(China Health Information Processing Conference,CHIP)是中国中文信息学会(CIPS)医疗健康与生物信息处理专业委员会开展的“以信息处理技术助力探索生命之奥秘、提高健康之质量、提升医疗之水平”为主... 大会介绍中国健康信息处理大会(China Health Information Processing Conference,CHIP)是中国中文信息学会(CIPS)医疗健康与生物信息处理专业委员会开展的“以信息处理技术助力探索生命之奥秘、提高健康之质量、提升医疗之水平”为主旨的年度会议。CHIP是中国健康信息处理领域的重要会议,是世界各地学术界、企业界和政府部门的研究人员和从业人士分享创意,进一步推广领域研究成果和经验的重要平台。本次第十一届中国健康信息处理大会(CHIP 2025)将于2025年11月14-16日在广东东莞举行。我们诚挚地邀请大家莅临CHIP 2025,共襄盛举。 展开更多
关键词 chip 医疗健康 中国中文信息学会
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Evolution mechanism of interconnect interface and shear properties of 64.8Sn35.2Pb microbump during flip chip bonding
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作者 SHEN Yu-lu LUO Jiao +2 位作者 XU Keng-feng WU Dao-wei ZHANG Ning 《Journal of Central South University》 2025年第4期1284-1298,共15页
Effect of flip chip bonding parameters on microstructure at the interconnect interface and shear properties of 64.8Sn35.2Pb microbumps were investigated in this work.Results show that the main intermetallic compound(I... Effect of flip chip bonding parameters on microstructure at the interconnect interface and shear properties of 64.8Sn35.2Pb microbumps were investigated in this work.Results show that the main intermetallic compound(IMC)at the interconnect interface is(Ni,Cu)_(3)Sn_(4)phase,and meanwhile a small amount of(Cu,Ni)_(6)Sn_(5)phase with a size of 50−100 nm is formed around(Ni,Cu)_(3)Sn_(4)phase.The orientation relationship of[-1-56](Ni,Cu)_(3)Sn_(4)//[152](Cu,Ni)_(6)Sn_(5)and(601)(Ni,Cu)_(3)Sn_(4)//(-201)(Cu,Ni)_(6)Sn_(5)is found between these two phases,and the atomic matching at the interface of the two phases is low.The highest shear force of 77.3 gf is achieved in the 64.8Sn35.2Pb microbump at the peak temperature of 250℃and parameter V1 because dense IMCs and no cracks form at the interconnect interface.Two typical fracture modes of microbumps are determined as solder fracture and mixed fracture.The high thermal stress presenting in the thick IMCs layer induces crack initiation,and cracks propagate along theα/βphase boundaries in the Sn-Pb solder under shear force,leading to a mixed fracture mode in the microbumps. 展开更多
关键词 flip chip bonding microbump SN-PB intermetallic compound orientation relationship shear properties
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ChIP技术及其在基因组水平上分析DNA与蛋白质相互作用 被引量:21
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作者 李敏俐 王薇 陆祖宏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期219-228,共10页
染色质免疫沉淀(Chromatin immunoprecipitaion,ChIP)技术是分析细胞内生理状态下DNA结合蛋白与基因组DNA相互作用的技术。ChIP与高密度芯片(ChIP-chip)或高通量测序(ChIP-Seq)相结合能产生大量的研究数据,在细胞的基因表达调控网络研... 染色质免疫沉淀(Chromatin immunoprecipitaion,ChIP)技术是分析细胞内生理状态下DNA结合蛋白与基因组DNA相互作用的技术。ChIP与高密度芯片(ChIP-chip)或高通量测序(ChIP-Seq)相结合能产生大量的研究数据,在细胞的基因表达调控网络研究中发挥重要作用。文章主要介绍ChIP、ChIP-chip和ChIP-Seq的技术特点以及发展趋势,重点讨论了ChIP-Seq数据分析方法及相关的应用实例。 展开更多
关键词 基因组 chip—Seq chipchip
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Hsp/Hsc70相互作用蛋白CHIP在大鼠肾纤维化组织中的高表达 被引量:2
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作者 徐夏莲 辛宏 +3 位作者 李林钰 张慧 黄海长 常智杰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期347-351,共5页
利用DNA重组技术 ,将编码人Hsp Hsc70相互作用蛋白CHIP(carboxylterminusofHsc 70 interactingprotein ,CHIP)全长、N端TPR及C端U box结构域的DNA片段分别构建于融合表达质粒pGEX 5X 1中 ,转化大肠杆菌 .纯化GST CHIP融合蛋白 ,制备了... 利用DNA重组技术 ,将编码人Hsp Hsc70相互作用蛋白CHIP(carboxylterminusofHsc 70 interactingprotein ,CHIP)全长、N端TPR及C端U box结构域的DNA片段分别构建于融合表达质粒pGEX 5X 1中 ,转化大肠杆菌 .纯化GST CHIP融合蛋白 ,制备了特异性识别人、小鼠及大鼠组织细胞内CHIP蛋白的多克隆抗体 .利用该抗体 ,对多种组织、细胞的内源性CHIP蛋白进行了检测 .发现在肾组织中 ,CHIP主要表达于皮质、髓质小管上皮细胞的胞浆中 ,且在单侧结扎输尿管所至的大鼠肾纤维化模型 (UUO)组织中 。 展开更多
关键词 chip 表达 肾纤维化
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教育、社会资本对中国农村家庭代际流动的影响——基于CHIP数据的实证分析 被引量:22
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作者 朱月季 张颖 陈新锋 《华中农业大学学报(社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2020年第1期75-83,165,166,共11页
良好的代际流动可以缩小中国城乡收入差距,家庭成员的教育和社会资本是中国农村家庭代际流动的重要通道。文章基于2013年中国家庭收入调查(CHIP)数据,从教育和社会资本的角度出发,探讨两者对中国农村家庭代际流动的影响机理及区域差异... 良好的代际流动可以缩小中国城乡收入差距,家庭成员的教育和社会资本是中国农村家庭代际流动的重要通道。文章基于2013年中国家庭收入调查(CHIP)数据,从教育和社会资本的角度出发,探讨两者对中国农村家庭代际流动的影响机理及区域差异。研究发现:男性子代的受教育水平对农村家庭代际流动具有显著的正向影响,而女性子代的受教育水平并未显著影响代际流动;尽管父代受教育水平并不直接影响家庭代际流动,但它在男性子代的代际流动中发挥了完全中介作用;社会资本在农村家庭代际流动中的作用也存在性别差异,男性子代通过社会资本路径求职能够促进其向上的代际流动,而社会资本在女性子代的代际流动中并未发挥显著作用;进一步的区域比较研究发现,农村地区整体上的代际流动不明显,且一级地区、二级地区均呈现微弱向下的流动趋势,三级地区呈现微弱向上的流动趋势。由此提出提升农村教育质量;维护农村家庭的社会网络和加强农村乡风文明建设;拓宽农民增收渠道,为农民提供更多非农就业信息等建议。 展开更多
关键词 代际流动 社会资本 教育 中国农村 中国家庭收入调查(chip)
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利用四环素调控系统研究CHIP对TGF-β信号通路的抑制性调节 被引量:2
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作者 徐夏莲 辛宏 +3 位作者 张新军 任芳丽 王银银 常智杰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第6期557-561,共5页
为了研究伴侣分子相互作用蛋白CHIP对TGF-β信号通路的调控,利用四环素基因表达调控系统,建立四环素调控表达CHIP的稳定细胞系(Mv1Lu-Tetoff-CHIP).利用此细胞模型,发现CHIP的过量表达可显著降低细胞内Smad2/3蛋白水平;荧光素酶报告分... 为了研究伴侣分子相互作用蛋白CHIP对TGF-β信号通路的调控,利用四环素基因表达调控系统,建立四环素调控表达CHIP的稳定细胞系(Mv1Lu-Tetoff-CHIP).利用此细胞模型,发现CHIP的过量表达可显著降低细胞内Smad2/3蛋白水平;荧光素酶报告分析也表明开启CHIP蛋白表达可明显降低Smads介导的基因转录活性;进一步的免疫印迹结果显示CHIP蛋白可明显下调TGF-β所诱导的下游基因JunB的表达.上述结果提示CHIP可以作为一种新的蛋白质分子抑制性调节TGF-β信号通路. 展开更多
关键词 四环素调控 chip TGF-Β SMAD2/3 JUNB 抑制
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序列特异的双链RNA可解除CHIP对TGF-β信号通路的抑制作用 被引量:2
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作者 徐夏莲 辛宏 +2 位作者 王春华 王银银 常智杰 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期445-450,共6页
根据热休克蛋白Hsc70C端结合蛋白CHIP(carboxylterminusofHsc70 interactingprotein ,CHIP)cDNA上特异序列合成寡核苷酸片段 ,以pBS U6为载体 ,构建产生CHIPdsRNA (doublestrandedRNA ,dsRNA)的表达质粒pBS U6 CHIPi .免疫印迹和免疫... 根据热休克蛋白Hsc70C端结合蛋白CHIP(carboxylterminusofHsc70 interactingprotein ,CHIP)cDNA上特异序列合成寡核苷酸片段 ,以pBS U6为载体 ,构建产生CHIPdsRNA (doublestrandedRNA ,dsRNA)的表达质粒pBS U6 CHIPi .免疫印迹和免疫染色结果显示 ,pBS U6 CHIPi可以高效、特异地抑制哺乳动物细胞内CHIP基因的表达 .为进一步研究CHIP在TGF β信号通路中的调控作用 ,利用pBS U6 CHIPi从细胞水平上封闭CHIP基因表达 ,观察TGF β介导的基因转录活性的变化 .荧光素酶报告分析 (luciferaseassay)结果显示 ,CHIP明显抑制TGF β介导的下游基因的转录活性 ,而转染pBS U6 CHIPi能有效解除CHIP的抑制作用 ,从而提高TGF β信号通路转录水平 ,从逆向角度进一步验证了CHIP在TGF 展开更多
关键词 chip DSRNA 免疫印迹 免疫染色 荧光素酶报告分析(1uciferase assay)
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CHIP调节UUO再通大鼠肾组织TGF-β1/Smads信号通路的研究 被引量:4
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作者 董飞侠 张新志 +2 位作者 吴锋 黄迪 何立群 《中华中医药学刊》 CAS 2012年第2期245-248,I0003,共5页
目的:利用基因芯片研究Carboxyl terminus of Hsc70-interacting protein(CHIP)对肾间质纤维化TGF-β1/Smads信号通路的抑制性调节。方法:将18只SPF级SD大鼠中6只行unilateral ureteral occlusion(UUO)模型,6只植入弹性管脂肪垫加压梗... 目的:利用基因芯片研究Carboxyl terminus of Hsc70-interacting protein(CHIP)对肾间质纤维化TGF-β1/Smads信号通路的抑制性调节。方法:将18只SPF级SD大鼠中6只行unilateral ureteral occlusion(UUO)模型,6只植入弹性管脂肪垫加压梗阻,7天后再通定为reverse of unilateral ureteral occlusion(RUUO)组,6只UUO在7天处死留取左肾组织,另外6只为假手术组。6只RUUO大鼠在再通7天后处死,留取左侧肾组织,运用West-ern blotting检测肾组织CHIP的表达,免疫组化检测肾组织中α-SMA、CD68的阳性表达面积,定制芯片研究TGF-β1/Smads信号通路的基因变化。结果:UUO组TGF-β1、smad2、smad3、COL1a2、JunB基因显著上调,和假手术组比较上调超过1.5倍,肾组织中的α-SMA、CD68表达面积和假手术组比较有显著统计学意义P<0.01。而RUUO组CHIP表达量较UUO组更是显著增强P<0.01,TGF-β1、smad2、smad3、COL1a2、JunB基因显著下调,和UUO组比较下调超过1.5倍,肾组织中的α-SMA、CD68表达面积减小和UUO组比较有显著统计学意义P<0.01。结论:发现CHIP的过量表达能显著降低细胞内,TGF-β1、Smad2/3、COL1a2、JunB基因水平,Western blot结果也表明CHIP蛋白表达能明显降低Smads介导的基因转录活性,进一步的基因芯片结果显示CHIP蛋白能明显下调TGF-β1所诱导的下游基因JunB的表达。结果提示CHIP蛋白能抑制性调节TGF-β1/Smads信号通路,抑制肾纤维化。 展开更多
关键词 UUO动物模型 RUUO动物模型 chip CD68 TGF-β1/Smads 肾间质纤维化
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社会资本与中国农村养老保险——基于CHIPS数据的实证研究 被引量:5
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作者 张文闻 陈广汉 《社会保障研究》 CSSCI 2016年第5期11-17,共7页
党的十八大以来,习近平总书记多次发表重要论述,阐明自己的"民生观",指出中国养老问题的重要性。改革开放以来,中国经济、社会、政治都发生了巨大变化。福利一词也越来越多为人所谈论。本文以农村养老保险为切入口,研究社会... 党的十八大以来,习近平总书记多次发表重要论述,阐明自己的"民生观",指出中国养老问题的重要性。改革开放以来,中国经济、社会、政治都发生了巨大变化。福利一词也越来越多为人所谈论。本文以农村养老保险为切入口,研究社会资本、党员身份与农村养老保险的参与程度、知情程度、未来参与意愿之间的关系,从一个侧面反映中国农村的福利情况。通过文献综述,提出了六个假设。根据中国家庭收入调查(CHIPS)数据,建立Logistic回归模型,发现社会资本对是否参加农村养老保险、是否知道个人账户有多少钱、将来是否加入农村养老保险都有积极作用;党员身份与是否参加农村养老保险、是否知道自己的个人账户有多少钱、将来是否可能参加无关。结果表明,提高村民的社会资本,加强他们的社会交往有助于他们获取信息,改善福利,所以可以提高村民小组活动和村民大会的频率以增加农民的社会资本。 展开更多
关键词 社会资本 农村养老保险 chipS
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热休克蛋白70羧基末端相互作用蛋白(CHIP)对HER2的降解作用 被引量:2
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作者 郭芸菲 王涛 +5 位作者 徐小洁 宋金洁 王宣 王子政 叶棋浓 江泽飞 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期611-613,共3页
热休克蛋白70羧基末端相互作用蛋白(carboxyl-terminus of the Hsp70 interacting protein,CHIP)是Ballinger等发现的同时具有辅助伴侣分子和E3泛素连接酶活性的特殊蛋白分子。作为辅助伴侣分子,它与Hsp90和Hsc/Hsp70相互作用,调... 热休克蛋白70羧基末端相互作用蛋白(carboxyl-terminus of the Hsp70 interacting protein,CHIP)是Ballinger等发现的同时具有辅助伴侣分子和E3泛素连接酶活性的特殊蛋白分子。作为辅助伴侣分子,它与Hsp90和Hsc/Hsp70相互作用,调节Hsp介导的蛋白质的异常折叠;而作为E3泛素连接酶,通过泛素化-蛋白酶体途径参与许多疾病相关蛋白的降解过程。 展开更多
关键词 chip基因 真核表达 HER-2
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小鼠NPC细胞RFX1ChIP-Seq数据分析
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作者 刘晓杰 赵志虎 +2 位作者 赵小英 张文斗 刘选明 《湖南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第2期59-65,共7页
利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均... 利用NCBI数据库中小鼠Embryonic Stem Cells(ESC)与Neural ProgenitorCells(NPC)的基因芯片结果及NPC时期的RFX1ChIP-Seq数据,进行有关RFX1的分析,结果表明:RFX1结合位点富集在1,2,4,5,7,9,11染色体上,Y染色体上最少,其他染色体上比较均衡;在基因组中结合位点分布区域主要在基因的promoter区域,约有53.2%,其次是intergentic,占22.5%,body区域,占13.1%,enhancer区域,占11.2%.说明RFX1是以结合在基因的promoter区为主要形式对目的基因进行调控.同时在DAVID数据库中用生物信息学方法探索了RFX1靶基因的生物学功能分类. 展开更多
关键词 神经先祖细胞 RFX1 chip—Seq
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下一代测序中ChIP-seq数据的处理与分析 被引量:5
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作者 高山 张宁 +3 位作者 李勃 徐硕 叶彦波 阮吉寿 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期773-783,共11页
将染色质免疫共沉淀技术(ChIP)与下一代高通量测序技术相结合的染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq),已成为功能基因组学、特别是基因表达调控领域研究的关键技术。ChIP-seq实验带来的海量数据向生物信息学研究人员提出了新的挑战。由于此... 将染色质免疫共沉淀技术(ChIP)与下一代高通量测序技术相结合的染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq),已成为功能基因组学、特别是基因表达调控领域研究的关键技术。ChIP-seq实验带来的海量数据向生物信息学研究人员提出了新的挑战。由于此领域数据处理技术的发展大大滞后于实验技术进步,有必要系统地介绍和回顾ChIP-seq数据处理的各个方面,以便更多研究人员进入此领域设计或改进相应的算法。文章结合实例详细介绍了ChIP-seq数据整个流程,并重点讨论了其中的主要问题和关键环节,为这一研究领域的科研人员提供一个快速而深入的认识。 展开更多
关键词 下一代测序 chip-SEQ 数据处理 转录调控 表观遗传学
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具有不同chip波形的DS/SS系统抗单频干扰的精确性能分析
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作者 臧国珍 凌聪 李广侠 《通信学报》 EI CSCD 北大核心 2003年第5期57-63,共7页
用频域分析的方法,分析了具有不同chip波形的DS/SS系统单频干扰时的误码性能,讨论了chip波形对系统抗单频干扰能力的影响,将Torrieri的改进高斯近似方法推广应用到一般的chip波形。
关键词 chip波形 DS/SS系统 单频干扰 高斯分布 频域分析
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CHIP相关基因与MPN患者心脑血管事件的风险分析
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作者 韩雪 白贝贝 +2 位作者 冯翠翠 赵森 陈烨 《中国实验血液学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期190-196,共7页
目的:分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者不确定潜能的克隆性造血(CHIP)相关基因突变谱和临床特征,探讨CHIP相关基因与其心脑血管事件(CCE)的相关性及可能作用机制。方法:回顾性分析2019年8月-2022年7月首都医科大学附属北京安贞医院血液科收... 目的:分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者不确定潜能的克隆性造血(CHIP)相关基因突变谱和临床特征,探讨CHIP相关基因与其心脑血管事件(CCE)的相关性及可能作用机制。方法:回顾性分析2019年8月-2022年7月首都医科大学附属北京安贞医院血液科收治的73例MPN患者的临床资料和二代测序结果,采用Logistic回归分析CHIP相关基因、炎症细胞因子对MPN患者CCE的影响。结果:55例(75.3%)MPN患者检出CHIP相关基因,原发性血小板增多症(ET)和真性红细胞增多症(PV)患者CHIP相关基因各突变频率差异无统计学意义。CHIP相关基因突变以单基因形式为主,检出率从高至低依次为JAK2V617F(63.0%,46/73)、ASXL1(16.4%,12/73)、TET2(11.0%,8/73)、DNMT3A(9.6%,7/73)、SRSF2(6.9%,5/73)、SF3B1(4.1%,3/73)、TP53(1.4%,1/73)和PPMID(1.4%,1/73)。年龄>60岁患者CHIP相关基因检出率明显高于≤60岁者[91.7%(33/36)vs 59.5%(22/37)]。27例(37.0%)MPN患者伴CCE(MPN/CCE),2次CCE者5例,均为动脉事件。CCE组患者年龄(62.8±12.8 vs 53.9±15.8岁,P=0.015)、IL-1β水平(17.7±26.0vs 4.3±8.6,P=0.012)、IL-8水平(360.7±598.6 vs 108.3±317.0,P=0.045)、血栓形成史(29.6%vs 2.2%,P=0.020)和CHIP相关基因检出率(88.9%vs 67.4%,P=0.040)高于无CCE组。多因素Logistic回归分析结果显示,年龄(OR=0.917,95%CI:0.843-0.999,P=0.047)、血栓形成史(OR=34.148,95%CI:2.392-487.535,P=0.009)、任何1个CHIP相关基因突变(OR=16.065,95%CI:1.217-212.024,P=0.035)和IL-1β水平升高(OR=0.929,95%CI:0.870-0.992,P=0.027)均是MPN/CCE的独立危险因素;CHIP相关单基因突变与MPN/CCE无关,但DNMT3A(OR=88.717,95%CI:2.690-292.482,P=0.012)、ASXL1(OR=7.941,95%CI:1.045-60.353,P=0.045)突变是PV/CCE的独立危险因素。结论:MPN患者CHIP相关基因突变率高,尤其是60岁以上患者;高龄、血栓形成史、CHIP相关基因突变和IL-1β水平升高是MPN发生CCE的独立危险因素。DNMT3A、ASXL1单基因突变是PV患者CCE的独立危险因素。CHIP相关基因突变及炎症细胞因子IL-1β升高是MPN新的CCE危险因素。 展开更多
关键词 骨髓增殖性肿瘤 chip相关基因 心脑血管事件 炎症细胞因子
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肉质相关基因TCAP启动子与转录因子MyoD结合的ChIP分析 被引量:4
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作者 吴俊静 梅书棋 +3 位作者 彭先文 乔木 武华玉 刘贵生 《湖北农业科学》 北大核心 2013年第22期5612-5614,5617,共4页
为了检测肉质相关基因TCAP(Titin-cap,Telethonin)启动子与转录因子MyoD(Myogenic differentiation antigen)的体内结合情况,采用染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)结合PCR技术分析TCAP启动子与转录因子MyoD的结合... 为了检测肉质相关基因TCAP(Titin-cap,Telethonin)启动子与转录因子MyoD(Myogenic differentiation antigen)的体内结合情况,采用染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)结合PCR技术分析TCAP启动子与转录因子MyoD的结合。结果表明,以MyoD抗体免疫沉淀的DNA片段为模板,PCR扩增获得了TCAP基因启动区121 bp的片段,实现了转录因子MyoD与TCAP启动子DNA序列结合。试验证实TCAP基因是MyoD调控的下游基因,在肌肉发育过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 染色质免疫共沉淀 TCAP基因 MyoD转录因子
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基于概率排序的Chip类元件焊点检测方法 被引量:4
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作者 吴福培 李昇平 张宪民 《焊接学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第6期39-43,115,共6页
为了提高自动光学检测系统在焊点分类、检测准确性和检测速度等方面的性能,针对Chip类元件焊点提出了基于概率排序的检测方法.通过分析彩色焊点图像、建立各焊点类型的模型、定义检测区域、提取区域的面积、重心和色彩梯度特征,并以出... 为了提高自动光学检测系统在焊点分类、检测准确性和检测速度等方面的性能,针对Chip类元件焊点提出了基于概率排序的检测方法.通过分析彩色焊点图像、建立各焊点类型的模型、定义检测区域、提取区域的面积、重心和色彩梯度特征,并以出现概率的高低规划各焊点类型的检测顺序,进而设计出Chip类元件的焊点检测算法.结果表明,所提方法能有效地检测Chip类元件8种常见的焊点类型,且检测速度获得了明显提高.详细的分类和准确的检测有利于SMT生产线的质量控制,而快速可靠的焊点检测利于提高生产线的效率. 展开更多
关键词 自动光学检测 焊点检测 晶片 色彩梯度
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Slater条件、BCQ条件、强CHIP性质和限制域最佳逼近的特征
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作者 方东辉 王仙云 《江南大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第5期619-622,共4页
针对广义限制域的最佳逼近问题,在允许有有限个节点的情况下,运用优化理论中的Slate条件、BCQ条件、强CHIP性质的定义,刻划了Slate条件、BCQ条件、强CHIP性质和最佳逼近的特征之间的关系.
关键词 最佳逼近 Slate条件 BCQ条件 chip 特征
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利用ChIP-seq技术研究转录因子EDAG在全基因组的结合谱 被引量:3
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作者 董小明 郑巍薇 +3 位作者 尹荣华 詹轶群 杨晓明 李长燕 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期578-584,共7页
为揭示红系分化相关基因(erythroid differentiation-associated gene,EDAG)在造血中的作用机制,利用ChIP-seq分析EDAG的全基因组结合谱.首先从产妇脐带血分离CD34+细胞,EPO诱导CD34+细胞培养5 d.利用EDAG抗体进行染色体免疫共沉淀(chro... 为揭示红系分化相关基因(erythroid differentiation-associated gene,EDAG)在造血中的作用机制,利用ChIP-seq分析EDAG的全基因组结合谱.首先从产妇脐带血分离CD34+细胞,EPO诱导CD34+细胞培养5 d.利用EDAG抗体进行染色体免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)实验、Western印迹法检测EDAG抗体的富集情况.将富集到的DNA样品进行高通量测序,最后利用生物信息学分析测序结果.成功富集染色体DNA,经高通量测序和生物信息学分析,共得到1 292个EDAG结合位点的Peaks数目,代表了975个结合的基因且错误发现率(false discovery rate,FDR)小于0.0001.EDAG Peaks主要分布在基因间区和内含子区.进一步利用Q-PCR对ChIP-Seq数据进行了验证,证实EDAG可结合在检测的靶基因调控区上.将EDAG结合的基因进行基因功能(gene ontology,GO)注释,表明EDAG参与了细胞周期、细胞生长、细胞分化、细胞凋亡及信号通路等多种生物学过程.综上,利用ChIP-seq技术在促红细胞生成素(EPO)诱导分化的CD34+细胞中鉴定了1 292个EDAG结合的peaks对应975个基因,并对该结果进行了随机验证,提示EDAG广泛参与了多种生物学过程.该研究为揭示EDAG的功能及作用机制提供了线索. 展开更多
关键词 红系分化相关基因(EDAG) 染色体免疫共沉淀-高通量测序(chip-seq) CD34+细胞 生物信息学分析
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基于Chip延迟与矩分析的扩频序列估计方法
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作者 董占奇 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期47-49,共3页
提出通过Chip延迟相乘与相关矩分析的方法实现对直扩信号扩频序列的估计,理论分析与计算机仿真显示该方法不但能实现对直扩信号扩频序列的估计,而且能提供序列的同步信息,并能适应对直扩信号检测的低信噪比要求.
关键词 直扩信号 chip延迟相乘 相关矩分析 扩频序列 盲估计
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