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人NPCEDRG基因启动子的克隆及CCAAT/NFY结合位点初步分析 被引量:12
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作者 侯德富 关勇军 +3 位作者 关瑞 欧阳咏梅 余艳辉 陈主初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第8期713-723,共11页
NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的一个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.为揭示NPCEDRG基因在鼻咽癌细胞和组织中表达下调的分子... NPCEDRG基因是采用基因定位候选克隆策略获得的一个鼻咽癌候选抑瘤基因.NPCEDRG在鼻咽癌细胞和组织中表达下调,重新恢复NPCEDRG基因在CNE2细胞系的表达,可部分逆转CNE2的恶性表型.为揭示NPCEDRG基因在鼻咽癌细胞和组织中表达下调的分子机制,联合应用生物信息学和报告基因载体系统分析方法对NPCEDRG基因启动子区进行克隆及功能分析,系统发育进化足迹分析结果表明,NPCEDRG基因5′端调控区-180~+235 bp区间在脊椎动物中高度保守,该保守区域中存在包括CCAAT/NFY、STAT1和SP1等转录因子结合位点.构建Luc和/或EGFP报告基因表达载体并检测其启动子活性,-146~-8 bp区域有较强的启动子活性,电泳迁移阻滞分析实验(EMSA)提示,CCAAT/NFY转录因子结合位点是NPCEDRG基因的转录调控元件.因此,研究确定-146~-8 bp区域是NPCEDRG基因核心启动子区域且启动子核心元件CCAAT/NFY可能参与NPCEDRG基因的转录调控. 展开更多
关键词 NPCEDRG基因 核心启动子 转录调控 ccaat/nfy结合位点
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NFY结合位点缺失下调NPCEDRG基因启动子转录活性和效率
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作者 侯德富 关瑞 +1 位作者 万恂恂 陈主初 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1159-1165,共7页
NPCEDRG基因是一个鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)相关基因.NPCEDRG基因启动子为TATA-less启动子,其核心启动子区域位于-146~-8 bp区,该区域包含NFY、STAT1和cMYB等转录因子结合位点.前期研究结果提示,转录因子NFY可能参与NPCE... NPCEDRG基因是一个鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)相关基因.NPCEDRG基因启动子为TATA-less启动子,其核心启动子区域位于-146~-8 bp区,该区域包含NFY、STAT1和cMYB等转录因子结合位点.前期研究结果提示,转录因子NFY可能参与NPCEDRG基因的转录调控.为明确NFY转录因子在NPCEDRG基因转录中的作用,本研究应用报告基因载体系统分析方法对NPCEDRG基因核心启动子区进行NFY结合位点(或CCAAT-box)缺失突变及其功能分析,分别构建NPCEDRG基因核心启动子区NFY结合位点缺失突变的Luc和EGFP报告基因表达载体.比较核心启动子和NFY结合位点缺失突变体报告基因载体的转录活性和效率.结果表明,在MCF7和CNE2细胞中,NFY结合位点缺失突变体的转录活性分别约为其核心启动子转录活性66.94%和75.72%,即NFY结合位点缺失致使该启动子转录效率在MCF7和CNE2细胞中分别降低了33.06%和24.28%;EGFP报告基因表达载体系统研究结果与Luc报告基因载体系统结果基本吻合.本研究再次证实,转录因子NFY通过结合NPCEDRG基因启动子的核心元件NFY结合位点参与NPCEDRG基因的转录调控,并提高其基因转录活性和效率. 展开更多
关键词 NPCEDRG基因 核心启动子 转录活性 nfy结合位点
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