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假小链双歧杆菌比较基因组学分析
1
作者
路镜达
杨瑞
+5 位作者
钟罡
弓艳春
周钧鸿
张艺馨
徐维那
钟智
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第14期142-150,I0004,I0005,共11页
该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现...
该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现分离自相同国家的菌株更相似。功能基因注释结果进一步表明分离地会影响菌株的功能基因分布,碳水化合物活性酶注释结果显示15个碳水化合物活性酶存在地域性差异;经耐药基因和毒力因子数据库注释发现中国分离株携带的耐药基因和黏附型毒力因子的数量显著高于日本分离株;中国和日本分离株携带复制、重组和修复及噬菌体相关可移动遗传元件数量均与美国分离株存在差异。该研究发现分离地会影响假小链双歧杆菌的功能基因,不同分离地假小链双歧杆菌存在差异功能基因。研究结果可为解析假小链双歧杆菌的功能差异提供理论依据。
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关键词
假小链双歧杆菌
比较基因组学
碳水化合物活性酶
耐药基因
毒力因子
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职称材料
不同假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的比较研究
被引量：
3
2
作者
李刘若兰
张程程
+4 位作者
刘秉书
于雷雷
田丰伟
陈卫
翟齐啸
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第14期94-102,共9页
该研究通过生长曲线和体外发酵实验对12株假小链双歧杆菌利用17种碳水化合物的能力进行了比较探究。从整体上看,假小链双歧杆菌能在葡萄糖、乳糖、低聚半乳糖培养基中达到较高的生长量(OD_(600)≥0.99),在蔗糖、低聚半乳糖培养基中达到...
该研究通过生长曲线和体外发酵实验对12株假小链双歧杆菌利用17种碳水化合物的能力进行了比较探究。从整体上看,假小链双歧杆菌能在葡萄糖、乳糖、低聚半乳糖培养基中达到较高的生长量(OD_(600)≥0.99),在蔗糖、低聚半乳糖培养基中达到高的生长速率(代时≤150 min)。研究发现12株假小链双歧杆菌对于碳水化合物利用具有较大的差异性,其中FJSNT36M3仅能利用5种碳水化合物,而3株菌(FHNBA14M1、FGZ16I1M1、FXJWS49M21)能利用10种以上。3株菌(FGSYC12M4、FGZ16I1M1、FFJND17M1)在9种碳源培养基中的生长速率(代时)和生长量(OD_(600))较高。12株假小链双歧杆菌编码的大多为降解植源性碳水化合物的糖苷水解酶,在碳水化合物利用中展现出的差异可能是因为降解和转运碳水化合物的酶具有差异性。人粪便体外发酵实验证明,假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的不同与其占据肠道内丰度的潜力相关。
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关键词
假小链双歧杆菌
碳水化合物利用
代时
OD600
体外发酵
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职称材料
假小链双歧杆菌W112对免疫检查点阻断疗法的促进作用研究
3
作者
吕梦欣
吴江涛
+3 位作者
赵婧琦
贾龙刚
王艳萍
耿伟涛
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期10-17,共8页
该研究分析了一株假小链双歧杆菌W112对PD-1抗体免疫治疗的促进作用。首先通过在小鼠背部皮下注射B16-F10黑色素瘤细胞建立黑色素瘤小鼠模型,随后对肿瘤小鼠进行PD-1抗体治疗、灌胃假小链双歧杆菌W112及两者联合处理。结果表明,灌胃假...
该研究分析了一株假小链双歧杆菌W112对PD-1抗体免疫治疗的促进作用。首先通过在小鼠背部皮下注射B16-F10黑色素瘤细胞建立黑色素瘤小鼠模型,随后对肿瘤小鼠进行PD-1抗体治疗、灌胃假小链双歧杆菌W112及两者联合处理。结果表明,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了PD-1抗体对肿瘤的抑制率,增加了小鼠的存活率,增加了肿瘤组织的CD8+T细胞浸润,并增加了肿瘤组织白细胞介素-12(interleukin-12,IL-12)和γ-干扰素(interferon-γ,IFN-γ)的富集。收集小鼠粪便并进行宏基因组测序分析发现,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了小鼠肠道菌群的多样性,促进了有益菌的富集,降低了有害菌的富集。该研究表明,假小链双歧杆菌W112在促进免疫检查点疗法中具有一定的潜力。
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关键词
假小链双歧杆菌W112
肠道菌群
黑色素瘤
免疫治疗
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职称材料
题名
假小链双歧杆菌比较基因组学分析
1
作者
路镜达
杨瑞
钟罡
弓艳春
周钧鸿
张艺馨
徐维那
钟智
机构
内蒙古农业大学
内蒙古自治区农牧业技术推广中心
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第14期142-150,I0004,I0005,共11页
基金
内蒙古自治区科技计划项目(2021GG0080)。
文摘
该研究对分离自中国、日本和美国的104株假小链双歧杆菌进行比较基因组学分析。结果表明,在基因组特征上,日本分离株的编码序列数量显著高于中国和美国分离株(P<0.01)。基于核心基因构建的系统发育树和平均核苷酸一致性聚类热图发现分离自相同国家的菌株更相似。功能基因注释结果进一步表明分离地会影响菌株的功能基因分布,碳水化合物活性酶注释结果显示15个碳水化合物活性酶存在地域性差异;经耐药基因和毒力因子数据库注释发现中国分离株携带的耐药基因和黏附型毒力因子的数量显著高于日本分离株;中国和日本分离株携带复制、重组和修复及噬菌体相关可移动遗传元件数量均与美国分离株存在差异。该研究发现分离地会影响假小链双歧杆菌的功能基因,不同分离地假小链双歧杆菌存在差异功能基因。研究结果可为解析假小链双歧杆菌的功能差异提供理论依据。
关键词
假小链双歧杆菌
比较基因组学
碳水化合物活性酶
耐药基因
毒力因子
Keywords
bifidobacterium pseudocatenulatum
comparative genomics
carbohydrate active enzymes
antibiotics resistance genes
virulence factor
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
Q933 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
不同假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的比较研究
被引量：
3
2
作者
李刘若兰
张程程
刘秉书
于雷雷
田丰伟
陈卫
翟齐啸
机构
江南大学食品学院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第14期94-102,共9页
基金
江苏省自然科学基金优秀青年基金(BK20200084)。
文摘
该研究通过生长曲线和体外发酵实验对12株假小链双歧杆菌利用17种碳水化合物的能力进行了比较探究。从整体上看,假小链双歧杆菌能在葡萄糖、乳糖、低聚半乳糖培养基中达到较高的生长量(OD_(600)≥0.99),在蔗糖、低聚半乳糖培养基中达到高的生长速率(代时≤150 min)。研究发现12株假小链双歧杆菌对于碳水化合物利用具有较大的差异性,其中FJSNT36M3仅能利用5种碳水化合物,而3株菌(FHNBA14M1、FGZ16I1M1、FXJWS49M21)能利用10种以上。3株菌(FGSYC12M4、FGZ16I1M1、FFJND17M1)在9种碳源培养基中的生长速率(代时)和生长量(OD_(600))较高。12株假小链双歧杆菌编码的大多为降解植源性碳水化合物的糖苷水解酶,在碳水化合物利用中展现出的差异可能是因为降解和转运碳水化合物的酶具有差异性。人粪便体外发酵实验证明,假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的不同与其占据肠道内丰度的潜力相关。
关键词
假小链双歧杆菌
碳水化合物利用
代时
OD600
体外发酵
Keywords
bifidobacterium pseudocatenulatum
carbohydrates utilization
generation time
OD 600
in vitro fermentation
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
假小链双歧杆菌W112对免疫检查点阻断疗法的促进作用研究
3
作者
吕梦欣
吴江涛
赵婧琦
贾龙刚
王艳萍
耿伟涛
机构
天津科技大学食品科学与工程学院
出处
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期10-17,共8页
基金
国家自然科学基金(31801514)。
文摘
该研究分析了一株假小链双歧杆菌W112对PD-1抗体免疫治疗的促进作用。首先通过在小鼠背部皮下注射B16-F10黑色素瘤细胞建立黑色素瘤小鼠模型,随后对肿瘤小鼠进行PD-1抗体治疗、灌胃假小链双歧杆菌W112及两者联合处理。结果表明,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了PD-1抗体对肿瘤的抑制率,增加了小鼠的存活率,增加了肿瘤组织的CD8+T细胞浸润,并增加了肿瘤组织白细胞介素-12(interleukin-12,IL-12)和γ-干扰素(interferon-γ,IFN-γ)的富集。收集小鼠粪便并进行宏基因组测序分析发现,灌胃假小链双歧杆菌W112提高了小鼠肠道菌群的多样性,促进了有益菌的富集,降低了有害菌的富集。该研究表明,假小链双歧杆菌W112在促进免疫检查点疗法中具有一定的潜力。
关键词
假小链双歧杆菌W112
肠道菌群
黑色素瘤
免疫治疗
Keywords
bifidobacterium pseudocatenulatum
W112
intestinal flora
melanoma
immune checkpoint blockade
分类号
R739.5 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
假小链双歧杆菌比较基因组学分析
路镜达
杨瑞
钟罡
弓艳春
周钧鸿
张艺馨
徐维那
钟智
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
不同假小链双歧杆菌对碳水化合物利用能力的比较研究
李刘若兰
张程程
刘秉书
于雷雷
田丰伟
陈卫
翟齐啸
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
在线阅读
下载PDF
职称材料
3
假小链双歧杆菌W112对免疫检查点阻断疗法的促进作用研究
吕梦欣
吴江涛
赵婧琦
贾龙刚
王艳萍
耿伟涛
《食品与发酵工业》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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