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Analysis of Gene Expression Pattern of Lumbar Intervertebral Disc Degeneration in Human 被引量:4
1
作者 HU Ming MA Yuan-zheng FENG Hui-cheng CHEN Xing CHAI Xiao-jun PENG Wei LI Hong-wei 《中国康复理论与实践》 CSCD 2006年第5期420-422,共3页
ObjectiveTo investigate the gene expression changes in normal and degeneration lumbar intervertebral disc in humans, providing information for clinical. MethodsThe PCR products of 4096 human genes were spotted onto a ... ObjectiveTo investigate the gene expression changes in normal and degeneration lumbar intervertebral disc in humans, providing information for clinical. MethodsThe PCR products of 4096 human genes were spotted onto a kind of chemical-material-coated-glass slides. The total RNAs were isolated from the tissues. Both the mRNAs from the degeneration and normal lumbar intervertebral disc in humans were reversely transcribed to the cDNAs, which used as the hybridization probes with the incorporations of fluorescent dUTP. The mixed probes were then hybridized to the cDNA microarray. After high-stringent washing, the cDNA microarray was scanned for the fluorescent signals and analyzed with computer image analysis. ResultsAmong the 4096 targets, there were 706 genes whose expression levels differed between the degeneration and normal lumbar intervertebral disc in all cases, comprising 298 up-regulated and 358 down-regulated ones. ConclusionDNA microarray technology is an effective technique in screening for differently expressed genes between the degeneration and normal lumbar intervertebral disc. Cell apoptosis plays an important role in the process of lumbar intervertebral disc degeneration. 展开更多
关键词 intervertebral disc degeneration DNA microarray gene expression pattern
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应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究 被引量:23
2
作者 田振军 张志琪 +2 位作者 唐量 郭进 刘健 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期122-126,共5页
目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按... 目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按微矩阵 (12× 12点× 16亚矩阵 ,点间距离 375 μm)点制于硅烷化玻片上 ,制备成cDNA芯片。将等量抽提纯化的运动组和对照组小鼠心肌组织mRNA ,分别与掺入的荧光分子Cy3和Cy5经逆转录合成cDNA荧光探针 ,混合后再与cD NA芯片杂交 ,通过芯片扫描仪对荧光信号图像进行扫描 ,经计算机分析比较运动组和安静对照组心肌组织中基因表达谱的变化。结果 :在 2 2 0 1条待研究基因中 ,两组小鼠心肌组织间存在差异表达的基因。具有显著表达差异的基因有 71条 ,其中上调基因有 37条 ,下调基因有 34条。结果显示 :cDNA芯片技术筛选运动性心肌肥大相关基因具有高通量、高敏度、高效率、大规模和并行性等优点。 展开更多
关键词 cdna芯片 cdna微矩阵基因芯片 基因 差异表达 运动性心肌肥大
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肿瘤转移相关基因cDNA芯片的制备与应用 被引量:24
3
作者 孙青 丁彦青 +2 位作者 高雪芹 闫实 韩金祥 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第12期1070-1075,共6页
目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy... 目的建立制备肿瘤转移相关基因cDNA基因芯片的方法,并探讨其在肿瘤转移表达谱应用方面的意义。方法选择了399个已知转移相关基因克隆,经PCR扩增纯化后,以Cartesian Pixsys 5500芯片点样仪点布于多聚赖氨酸包被的玻片上;采用Cy3-dUTP和Cy5-dUTP双重荧光标记人大肠癌和肺癌细胞、正常组织、大肠癌和肺癌组织总RNA并与阵列进行杂交。结果经ScanArrayTM 4000共聚焦荧光扫描仪检测,图像背景均匀,信号清晰,效果满意。对大肠癌细胞系和组织标本及肺癌标本表达基因扫描结果行联合聚类分析发现:两种癌的基因表达大多数相同,仅少数有差别,有30种在两种转移癌中呈持续上调或下调的基因,包括运动因子基因、粘附分子、蛋白水解酶、癌基因、抑癌基因、抑制或促进凋亡基因以及诱导血管增生和信号转导的基因等。结论优化的cDNA基因芯片制备技术用于基因表达分析有较高的效率和可靠的实用性能。检测的肿瘤转移相关基因的表达在两种癌无明显差别,表明不同癌其浸润和转移的分子机制大致相同。 展开更多
关键词 肿瘤转移 生物信息学 肿瘤基因 cdna芯片 肠肿瘤 肺癌 基因表达谱
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cDNA微阵列技术分析NAG7基因对鼻咽癌细胞基因表达谱的影响 被引量:6
4
作者 谭琛 李江 +4 位作者 彭聪 张秋红 唐珂 李小玲 李桂源 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第1期99-106,共8页
运用cDNA微阵列技术分析NAG7基因重表达对HNE1细胞基因表达谱的影响 .抽提HNE1细胞和pcDNA3 1(+) /NAG7/HNE1细胞总RNA ,分离 polyAmRNA ,将mRNA逆转录为cDNA ,并在逆转录过程中用33P dATP进行标记 ,与含有 16 15 0个基因和表达序列标签... 运用cDNA微阵列技术分析NAG7基因重表达对HNE1细胞基因表达谱的影响 .抽提HNE1细胞和pcDNA3 1(+) /NAG7/HNE1细胞总RNA ,分离 polyAmRNA ,将mRNA逆转录为cDNA ,并在逆转录过程中用33P dATP进行标记 ,与含有 16 15 0个基因和表达序列标签 (EST)的cDNA表达阵列膜杂交 ,获得基因表达图谱 .ArrayGauge软件分析NAG7基因的重表达所导致的鼻咽癌细胞HNE1基因表达谱改变 ,并用RNA印迹对微阵列杂交结果进行验证 .结果分析表明 ,2倍以上的差异表达基因或EST 179个 ,其中表达上调的 91个 ,表达下调的 88个 ;已明确基因表达产物的上调基因 2 9个 ,下调基因 37个 .在差异表达基因中 ,涉及基因转录调控、信号转导、细胞生长、细胞代谢和细胞凋亡等基因 .RNA印迹证实生长阻滞特异蛋白 1(gas 1)基因表达上调 .特别值得关注的是 ,先前的蛋白质组研究结果亦发现NAG7基因可导致生长阻滞特异蛋白 1表达上调 ,说明gas 1基因在NAG7重表达的HNE1细胞中具有重要作用 ,这为深入研究NAG7基因的作用环节和机理提供了重要的线索 . 展开更多
关键词 cdna微阵列 NAG7基因 gasl基因 鼻咽癌细胞 基因表达谱
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EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片的建立及其方法学分析 被引量:7
5
作者 李沛 凌志强 +3 位作者 赵继敏 杨洪艳 黄幼田 董子明 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2006年第2期272-274,共3页
目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用... 目的建立食管癌EC109细胞cDNA微矩阵基因芯片,并对其可靠性进行验证。方法提取正常食管上皮细胞和EC109细胞的mRNA,逆转录得cDNA,再逆转录得cRNA,用Cy3-dUTP标记EC109细胞cRNA,用Cy5-dUTP标记正常食管上皮细胞cRNA,制备表达谱探针,利用该探针对EC109细胞与正常食管上皮细胞进行杂交。荧光扫描基因芯片,筛选表达谱。利用自身比较实验、重复实验和R2、一致率(CR)及假阳性率(FPR)等指标对该基因芯片系统进行方法学分析。结果该基因芯片系统2次实验结果的符合率达85%,R2=0.7329,CR=100%。该系统的FPR为0.45%,扩增样品与无扩增样品的基因表达谱表现出较好的吻合性。结论该芯片系统具有良好的稳定性、可靠性及低误差率等特点,可用于基因差异表达谱的分析。 展开更多
关键词 食管癌细胞 基因芯片 差异表达 基因表达谱 可靠性
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利用斑茅cDNA芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达 被引量:5
6
作者 阙友雄 许莉萍 +4 位作者 林剑伟 徐景升 张积森 张木清 陈如凯 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期940-945,共6页
为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制,利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达。经杂交,在cDNA芯片的3860个模板中,有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个,其中上调55个,下调46个。部分基因的定量PCR验... 为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制,利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达。经杂交,在cDNA芯片的3860个模板中,有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个,其中上调55个,下调46个。部分基因的定量PCR验证表明,芯片杂交结果可靠。上调表达基因经测序、冗余序列剔除,一共获得36个uniqueESTs。已知功能的22个上调表达基因,涉及多条生理代谢途径,如光合作用、离子转运和核酸代谢途径;以及多种分子水平的进程,如基因转录、蛋白质合成与修饰以及细胞信号转导等。另外,还检测到14个未知功能基因。结果表明,甘蔗对黑穗病的抗性具有复杂的机制。本研究为解释甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达及其网络构建奠定了基础,还为今后系统研究甘蔗对生物与非生物胁迫的响应机制提供技术支持。 展开更多
关键词 甘蔗 黑穗病菌 斑茅 cdna芯片 差异表达基因
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cDNA微阵列结合聚类分析探讨大鼠心肌缺血-再灌诱导的基因表达谱改变 被引量:4
7
作者 袁灿 赵震宇 +3 位作者 刘瑛 吕青兰 王秋鹏 肖献忠 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期252-256,共5页
目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片... 目的 :探讨大鼠心肌缺血 再灌诱导的基因表达谱改变 ,为揭示心肌内源性保护的分子机制提供新的线索和思路。方法 :采用反复短时间结扎及松解左冠状动脉主支构建大鼠心肌缺血 再灌反应动物模型 ,运用含 4 0 97个大鼠基因点的cDNA芯片检测大鼠心肌缺血 再灌处理后不同时间点 (1,3,6 ,12 ,2 4h)的基因表达情况 ,并采用SOM算法将具有相似表达模式的基因进行聚类。结果 :短时间缺血后再灌 1,3,6 ,12 ,2 4h分别有 75 ,779,2 0 5 ,15 5 ,16 6个基因表达发生改变。具有相同表达模式的基因被聚为 12类。结论 :心肌缺血 再灌可以诱导心肌的基因表达谱发生改变 ,具有相似表达模式的基因可能具有相似的功能或相似的表达调控机制。 展开更多
关键词 cdna微阵列 聚类分析 大鼠 心肌缺血 再灌诱导 基因表达谱 cdna芯片
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应用cDNA微阵列芯片技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因的研究 被引量:7
8
作者 邹丰才 吴绍强 +5 位作者 廖申权 林瑞庆 李明伟 宋慧群 黄翠琴 朱兴全 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期163-167,共5页
采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫... 采用cDNA微阵列芯片技术,从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1 044和1 119个克隆,PCR扩增其插入片段,经纯化后点样于预先处理好的基片上(双点杂交),制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫cDNA探针,与制备好的cDNA芯片杂交(平行进行反标杂交试验)。根据每个点杂交后的Ratio值,筛选出双点杂交和正反标中都同时具有表达差异的基因克隆共1 559个。将表达差异最明显的前831个克隆进行测序,获得720个有效序列,经生物信息学分析发现,雄虫特异表达的主要精子蛋白和雌虫特异表达的卵巢信息蛋白的基因序列多数与新杆属线虫存在同源性,有31个可能是新的ESTs。性别差异表达基因及其相关生物信息的获得为下一步研究基因功能奠定了基础。 展开更多
关键词 猪蛔虫cdna微阵列芯片 性别特异基因 表达谱分析
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利用cDNA微阵列分离津田芜菁花青素生物合成相关基因 被引量:17
9
作者 许志茹 李玉花 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1101-1106,共6页
花色素苷是植物的重要次生代谢产物,在植物体内行使多种生理功能。利用UV-A处理48h后津田芜菁块根变红,以黑暗处理条件下的白色块根为对照,与削减文库特异基因片段制备的cDNA微阵列进行杂交。UV-A处理条件下津田芜菁中表达上调的基因为8... 花色素苷是植物的重要次生代谢产物,在植物体内行使多种生理功能。利用UV-A处理48h后津田芜菁块根变红,以黑暗处理条件下的白色块根为对照,与削减文库特异基因片段制备的cDNA微阵列进行杂交。UV-A处理条件下津田芜菁中表达上调的基因为81个,表达下调的基因为47个,表达上调的基因中包括与花青素生物合成直接相关的基因片段cytochromeP450,PAL,F3H,ANS,CHS,DFR和GST等。Northern杂交结果显示,UV-A处理48h的津田芜菁试材中,PAL、CHS、F3H、DFR和ANS基因的表达量明显高于黑暗条件下白色块根中这些基因的表达量,进一步验证了芯片杂交结果的可靠性。 展开更多
关键词 花色素苷 津田芜菁 块根 UV-A cdna微阵列 基因表达
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应用cDNA表达芯片研究复方黄连对CNE1鼻咽癌移植瘤基因表达的影响 被引量:12
10
作者 王光平 唐发清 周金平 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第4期347-352,共6页
目的 :研究复方黄连对鼻咽癌裸鼠移植瘤基因表达的影响。方法 :培养的鼻咽癌细胞系CNE1细胞接种Balb/C裸鼠 ,待移植瘤形成后灌喂复方黄连 ,然后从移植瘤组织提取RNA ,经逆转录标记后的cDNA作为探针 ,与高通量cDNA表达芯片杂交并用激光... 目的 :研究复方黄连对鼻咽癌裸鼠移植瘤基因表达的影响。方法 :培养的鼻咽癌细胞系CNE1细胞接种Balb/C裸鼠 ,待移植瘤形成后灌喂复方黄连 ,然后从移植瘤组织提取RNA ,经逆转录标记后的cDNA作为探针 ,与高通量cDNA表达芯片杂交并用激光共聚焦扫描仪分析基因表达。通过逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)半定量技术进一步分析差异表达基因的表达。结果 :复方黄连处理移植瘤裸鼠 30d后 ,移植瘤明显减小 ,其抑瘤率为 2 9.5 %。同时 ,移植瘤组织基因表达发生显著变化。用该复方处理的CNE1鼻咽癌移植瘤组织有 147条基因表达发生改变 ,包括 10 2条下调表达的基因和 45条上调表达的基因。RT PCR半定量技术分析证实有 3条基因为真正差异表达 ,它们分别是MAD3,H731和CHK1基因。其中 ,MAD3和H731基因表达上调 ,CHK1基因表达下调。结论 :复方黄连可抑制CNE1鼻咽癌裸鼠移植瘤的生长并可影响其基因的表达 ,它对CNE1鼻咽癌移植瘤的抑制作用与其调节移植瘤基因表达密切相关。 展开更多
关键词 应用 cdna表达芯片 复方黄连 CNE1 鼻咽癌 移植瘤 基因表达 影响
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基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法 被引量:3
11
作者 聂桂军 王靖 +3 位作者 王加俊 叶锡君 陈强 杨静宇 《江南大学学报(自然科学版)》 CAS 2010年第1期16-21,共6页
针对cDNA基因芯片数据分析中划格对提取杂交荧光样点杂交强度信息的重要作用,提出了一种基于微分的cDNA基因芯片图像自动划格算法,采用NCBI上GEO数据库中cDNA基因芯片图像进行划格实验,验证了该算法的有效性。
关键词 互补DNA 基因芯片 划格 基因表达 图像分析
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cDNA基因芯片对人胶质瘤组织原发性耐药相关基因的筛查 被引量:2
12
作者 强兆艳 汤华 +1 位作者 李欣 刘民 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 2008年第4期369-373,共5页
目的:利用cDNA基因芯片筛查与人脑胶质瘤原发性耐药相关的基因,为获取不同个体胶质瘤化疗药物药敏预报基因提供实验依据。方法:收集符合要求的临床手术切除的人脑胶质瘤组织标本共6例,原代培养肿瘤细胞;由MTT法检测替尼泊苷(teniposide,... 目的:利用cDNA基因芯片筛查与人脑胶质瘤原发性耐药相关的基因,为获取不同个体胶质瘤化疗药物药敏预报基因提供实验依据。方法:收集符合要求的临床手术切除的人脑胶质瘤组织标本共6例,原代培养肿瘤细胞;由MTT法检测替尼泊苷(teniposide,VM-26)对胶质瘤细胞生长的抑制率,按VM-2645μg/ml(人血药峰浓度)时抑制率>30%为敏感、≤30%为耐药作为标准,将6例组织细胞分为耐药和敏感2组。cDNA芯片检测结合聚类分析方法筛查瘤细胞中与耐药相关的差异表达基因;以半定量RT-PCR法检测瘤细胞中HDAC1基因表达加以验证。结果:根据VM-26对细胞抑制率将6例胶质瘤细胞分为3例VM-26敏感和3例耐药。cDNA芯片结合聚类分析共筛选出有表达差异的基因21个,其中表达上调的基因6个、表达下调的基因15个。将表达差异明显的HDAC1经半定量RT-PCR验证,该基因在6例组织中都有表达,趋势与芯片结果一致。结论:胶质瘤原发性耐药可能与cDNA芯片筛查到的21个基因相关,其确切的耐药机制需要进一步深入研究。 展开更多
关键词 胶质瘤 替尼泊苷 cdna基因芯片 耐药相关基因 差异表达基因
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cDNA微阵列鉴定差异表达基因的可靠性分析 被引量:2
13
作者 王冰林 柳俊 +1 位作者 李媛媛 谢从华 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2008年第3期5-8,共4页
应用马铃薯晚疫病水平抗性相关的1 009条表达序列标签(ESTs)所制备的cDNA微阵列和荧光信号Cy3,Cy5杂交系统,通过同一样品RNA的自身比较试验及与不同样品RNA的差异分析试验,对该技术的重复性和可靠性进行了验证分析。结果表明,在自身比... 应用马铃薯晚疫病水平抗性相关的1 009条表达序列标签(ESTs)所制备的cDNA微阵列和荧光信号Cy3,Cy5杂交系统,通过同一样品RNA的自身比较试验及与不同样品RNA的差异分析试验,对该技术的重复性和可靠性进行了验证分析。结果表明,在自身比较试验中,芯片杂交的假阳性率仅为0.79%,相关系数高达0.981 1;在差异分析试验中,同向标记、正反向标记、同一芯片内2个重复杂交结果的相关系数分别为0.966 0,0.889 5,0.980 2。研究结果证实,cDNA芯片技术具有高度的可靠性,可以鉴定出显著差异表达基因,并构建高质量的基因表达数据库,通过3次生物学重复和2次技术重复试验(采用正、反向标记)即可克服绝大部分试验误差。 展开更多
关键词 cdna微阵列 差异表达基因 可靠性
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SSH与cDNA芯片技术的联合及其在植物基因差异表达研究中的应用 被引量:4
14
作者 康俊梅 孙彦 杨青川 《中国草地学报》 CSCD 2007年第5期89-94,共6页
抑制消减杂交技术(SSH)与cDNA芯片技术是新近发展起来的研究差异表达基因的两种非常有效的方法。近年来,将SSH和cDNA芯片技术结合使用,为分析组织细胞的已知基因表达差异提供了新的手段,也为克隆和鉴定新基因开辟了新的道路,是目前寻找... 抑制消减杂交技术(SSH)与cDNA芯片技术是新近发展起来的研究差异表达基因的两种非常有效的方法。近年来,将SSH和cDNA芯片技术结合使用,为分析组织细胞的已知基因表达差异提供了新的手段,也为克隆和鉴定新基因开辟了新的道路,是目前寻找差异表达基因的适用方法。鉴于此,对SSH和cDNA芯片技术的基本原理、两种方法结合使用的操作流程、克隆差异表达新基因的特点,以及在植物基因差异表达方面的应用进行了概述。 展开更多
关键词 抑制性消减杂交(SSH) cdna芯片 差异表达基因
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应用cDNA芯片技术筛选胰腺癌相关基因 被引量:1
15
作者 蒋业贵 李兆申 +1 位作者 王宇明 刘同华 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期235-238,共4页
目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转... 目的应用基因芯片技术筛选胰腺癌相关基因。方法将14 000种人类基因PCR产物用CartesianP ix-sys7500点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上,制成基因芯片。按一步法抽提4例胰腺癌和癌旁正常胰腺组织的总RNA,将等量的RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA一链做探针,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像,每点上两种荧光信号的强度分别代表Cy5-dCTP和Cy3-dCTP的量,获得的荧光信号图像用计算机分析。结果按差异显著性标准,从14 000条基因中筛选出在胰腺癌组织中共同差异表达基因189条,其中已知基因101条,新基因88条。在筛选出的已知基因中,有50条表达上调,51条表达下调,包括原癌及抑癌基因、细胞周期蛋白相关基因、细胞骨架和运动蛋白相关基因、细胞凋亡和应激反应相关基因、DNA合成和修复相关基因、转录因子类基因、细胞受体相关基因、免疫相关基因、细胞信号和传递蛋白相关基因、蛋白翻译和合成相关基因、代谢相关基因等。结论基因芯片技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选胰腺癌相关基因,并高效对基因功能进行研究。胰腺癌基因表达谱的分析有助于认识肿瘤发病机制。 展开更多
关键词 胰腺癌 cdna芯片 基因表达谱
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实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片方法分析食管癌组织中基因的表达 被引量:1
16
作者 李沛 凌志强 +4 位作者 杨洪艳 黄幼田 赵继敏 郑智敏 董子明 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2006年第5期841-843,共3页
目的:采用实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片2种技术分析食管癌细胞基因表达的特征。方法:应用cDNA基因芯片筛选15例食管癌基因表达谱,用实时荧光定量RT-PCR验证其中16个基因的表达变化。结果:实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片技术对1... 目的:采用实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片2种技术分析食管癌细胞基因表达的特征。方法:应用cDNA基因芯片筛选15例食管癌基因表达谱,用实时荧光定量RT-PCR验证其中16个基因的表达变化。结果:实时荧光定量RT-PCR和cDNA基因芯片技术对16个基因的检测结果一致,不仅变化方向相同,而且表达值非常接近。结论:cDNA基因芯片和实时荧光定量RT-PCR分析基因表达变化都是可信的,基因芯片筛选基因表达谱具有高通量大规模的特点,而实时荧光定量RT-PCR则适合单个基因表达变化的研究,两者互为补充和印证。 展开更多
关键词 食管癌 基因芯片 基因表达谱 实时逆转录多聚酶链反应
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cDNA微阵列技术对肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱的研究 被引量:1
17
作者 欧阳取长 胡成平 +4 位作者 石林阶 梁清华 吴鄂生 杨红忠 潘频华 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第1期9-12,共4页
目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 ... 目的 :利用cDNA微阵列技术研究肺鳞癌、肺腺癌基因表达谱 ,并与肺炎性假瘤基因表达谱进行比较 ,筛选肺鳞癌、肺腺癌的差异表达基因 ,及肺鳞癌、肺腺癌的共同表达基因 ,为研究肺癌的分子机制及肺癌的早期诊断和治疗提供线索。方法 :用含 4 0 96个基因的人基因表达谱芯片研究肺鳞癌、肺腺癌及肺炎性假瘤的基因表达谱。结果 :肺鳞癌差异表达基因 5 91个 ,其中筛选出在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 76个 ,上调的有 2 93个 ,下调的有 183个 ;肺腺癌差异表达基因 5 2 4个 ,其中在肺炎性假瘤中没有差异表达的基因 4 6 0个 ,上调的有 2 14个 ,下调有 2 4 6个 ;有113个基因在肺鳞癌与肺腺癌中均出现差异表达。结论 :肺鳞癌、肺腺癌存在不同的基因表达谱 ,筛选出的特异表达基因和共同表达基因为进一步研究肺癌的发生、发展和肺鳞癌与肺腺癌的分子特征提供了重要线索。 展开更多
关键词 cdna微阵列 基因表达谱 肺肿瘤
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应用cDNA微阵列技术研究MMP1,TIMP1基因在肺癌中的表达 被引量:1
18
作者 欧阳取长 胡成平 +4 位作者 梁清华 石林阶 吴鄂生 杨红忠 潘频华 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期227-228,共2页
研究基质金属蛋白酶 1 (MMP1 )和基质金属蛋白酶组织抑制物 1 (TIMP1 )基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法 :利用含 4 0 96个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因 ,重点分析MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌与肺... 研究基质金属蛋白酶 1 (MMP1 )和基质金属蛋白酶组织抑制物 1 (TIMP1 )基因在肺鳞癌、肺腺癌中的表达。方法 :利用含 4 0 96个基因的cDNA微阵列检测肺鳞癌、肺腺癌组织与正常肺组织的差异表达基因 ,重点分析MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌与肺腺癌中的表达。结果 :MMP1 ,TIMP1基因在肺鳞癌与肺腺癌中均表达上调。结论 :MMP1 ,TIMP1在肺鳞癌、肺腺癌中均出现表达上调 ,可作为肺鳞癌。 展开更多
关键词 应用 cdna微阵列技术 研究 MMP1 TIMP1基因 肺癌 表达
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人食管鳞状细胞癌基因表达变化的cDNA芯片研究
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作者 李沛 凌志强 +4 位作者 杨洪艳 黄幼田 赵继敏 赵明耀 董子明 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期632-634,共3页
目的利用TaKaRa人癌基因芯片研究食管鳞状细胞癌(ESCC)和相应正常组织差异表达基因,分析基因差异表达谱,以期找到更快捷、高通量的方法来筛选与原发性食管癌发生、发展以及与食管癌临床进展相关的分子标记物。方法应用基因芯片技术及激... 目的利用TaKaRa人癌基因芯片研究食管鳞状细胞癌(ESCC)和相应正常组织差异表达基因,分析基因差异表达谱,以期找到更快捷、高通量的方法来筛选与原发性食管癌发生、发展以及与食管癌临床进展相关的分子标记物。方法应用基因芯片技术及激光捕获微切割术、T7RNA聚合酶扩增技术,对15例ESCC癌组织和正常组织的mRNA进行检测,并用生物信息学对检测结果进行分析。结果在886个目的基因中有110条(12.42%)至少2次出现差异表达,其中56条(6.32%)基因表达上调幅度>2.0倍,54条(6.09%)基因表达下调幅度<0.5。结论高通量的基因芯片技术可筛选出大量ESCC相关基因,对这些相关基因功能的验证将有助于找到ESCC发生、发展的关键基因或通路。 展开更多
关键词 食管癌 基因芯片 差异表达 基因表达谱
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卵巢癌基因表达谱的cDNA微矩阵研究
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作者 张晓霞 何津 +1 位作者 孙晓琦 李荷莲 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期552-554,共3页
目的:探讨cDNA微矩阵(基因芯片)研究卵巢癌基因表达谱及分析部分差异表达基因功能的可行性。方法:采用4 097个靶基因点BiostarH-40s表达谱基因芯片,检测5例卵巢浆液性腺癌及5例正常卵巢组织(cy3-dUTP标记正常卵巢组织的RNA,用cy5-dUTP... 目的:探讨cDNA微矩阵(基因芯片)研究卵巢癌基因表达谱及分析部分差异表达基因功能的可行性。方法:采用4 097个靶基因点BiostarH-40s表达谱基因芯片,检测5例卵巢浆液性腺癌及5例正常卵巢组织(cy3-dUTP标记正常卵巢组织的RNA,用cy5-dUTP标记卵巢癌组织的RNA)的基因表达谱。结果:两组病例卵巢癌基因表达谱中,4例以上差异表达基因163个,其中基因表达增高(上调趋势)66个,基因表达降低(下调趋势)97个。明确基因功能分类的差异表达基因37个,其中原癌基因和抑癌基因类基因3个,细胞周期蛋白类基因1个,细胞骨架及运动蛋白类基因6个,DNA结合、转录和转录因子类基因1个,细胞受体类基因2个,免疫相关蛋白类基因5个,代谢类基因7个,蛋白翻译合成类基因2个,发育相关基因3个,其他类基因7个。结论:应用cDNA微矩阵研究卵巢癌基因表达谱,发现差异表达基因及其基因功能分类。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 基因表达谱 cdna微矩阵
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