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利用扩增片段长度多态性(AFLP)研究坛紫菜的遗传变异 被引量:42
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作者 杨锐 刘必谦 +3 位作者 骆其君 王亚军 周湘池 戴继勋 《高技术通讯》 EI CAS CSCD 2002年第1期83-86,共4页
应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ... 应用AFLP技术对浙江普陀列岛、渔山列岛和南麂列岛野生坛紫菜、福建野生厚型及薄型以及栽培坛紫菜的两个表型分化类型进行了研究。结果表明 :坛紫菜的遗传变异较为丰富 ,共记录了 5 2 8个位点 ,其中 16个为单态位点 ,其余的为多态位点 ,多态位点比例达到 96 97%。其遗传距离与地域分布正相关 ,说明不同的环境因素可能是造成坛紫菜遗传变异的主要因素。对遗传距离进行UPGMA和Neighbor joining聚类分析表明具有薄型叶片性状的浙江野生坛紫菜和福建野生薄型坛紫菜聚合 ,而福建野生厚型与栽培具厚型叶片 ,当地俗称为木耳菜的样本聚合。该结果基本清楚地反映了坛紫菜表型特征的分化。栽培薄型叶片俗称鸡毛菜样本在不同聚类方法中分别于外侧并入不同的分支。在福建野生坛紫菜与养殖坛紫菜的AFLP图谱中仅发现了三条与叶片性状相关的谱带 :具有厚型叶片性状的坛紫菜共有的ACC CAA(10 0 )和ACT CAG(2 32 ) ,具有薄型叶性状的坛紫菜共有的ACC CAA(490 )。 展开更多
关键词 坛紫菜 aflp 片段多态性 遗传变异 遗传距离 聚类分析 表型分化类型
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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究 Ⅱ.5个萱草材料的AFLP分析 被引量:11
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作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期76-77,共2页
为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ... 为了快速准确地进行萱草种质鉴定 ,从 6 4对AFLP引物中随机选出了 3对引物组合 (即EcoRⅠAAC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAT ,EcoRⅠACC MseⅠCAG) ,构建了 5个萱草种质的指纹图谱 .3对引物在 5个萱草材料中 2 0 5个位点上扩增出了条带 ,其中多态性条带 12 8个 ,占扩增条带总数的 6 2 .9% ,5个萱草材料具有较高的遗传多样性 ,并初步认为其中野生重瓣萱草可能来自于萱草H . 展开更多
关键词 萱草 种质资源 片段长度 多态性鉴别 鉴别分类
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香蕉种质资源的扩增片段长度多态性鉴定与分类 被引量:17
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作者 于晓英 张秋明 +3 位作者 易干军 霍合强 谭卫萍 李典范 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期206-210,共5页
为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物E... 为了建立一个准确、完善、统一的香蕉鉴别分类标准 ,促进香蕉种质资源的合理利用及新品种的选育与推广 ,于 2 0 0 0年 2至 12月在广东省农科院果树研究所对广州国家种质香蕉圃的 35份香蕉种质材料进行了AFLP分子标记 .结果表明 :1)引物EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG对 35个香蕉材料进行选择性扩增后 ,共得到扩增位点 10 7个 ,其中多态性位点 84个 ,多态性位点比例达到 78.5 % ,对 35个材料的区分率达到10 0 % .2 )在引物对EcoRⅠACC +MseⅠCAT和EcoRⅠACC +MseⅠCAG构建的香蕉AFLP指纹图谱中 ,供试的35个香蕉材料都有差异带或特异带 ,滑蕉 ,龙选 ,东S 1,海红 ,泰国蕉等品种的特征带尤为明显 .3)根据基因组指纹图谱聚类分析 ,当相似系数达到 0 .88的水平 ,可将供试的 35个香蕉材料分为 7类 .4)几内亚、苹果以及阳江矮 3份种质材料实际上为同一个品种 . 展开更多
关键词 香蕉 种质资源 鉴别 片段长度多态性
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萱草种质资源扩增片段长度多态性鉴别与分类的研究Ⅰ.萱草DNA模板的制备 被引量:19
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作者 于晓英 吴铁明 +3 位作者 彭尽晖 吕长平 张宏志 丁江南 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期41-43,共3页
为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获... 为了获得萱草清晰的 AFL P指纹图谱并进一步进行萱草种质资源的鉴别与分类研究 ,以大花萱草为试材 ,用改进后的 SDS法和 CTAB法 ,从萱草的幼叶、成熟叶、新根等部位提取 DNA.结果表明 ,用这两种方法均可从萱草的幼叶、成熟叶、新根中获得高分子量基因组 DNA和 AFL P指纹图谱 ,其中以幼叶的 DNA产量和品质最好 ,CTAB法提取的 展开更多
关键词 萱草 片段长度多态性 脱氧核糖核酸 种质资源 DNA模板
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序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原
5
作者 吴红瑛 《中国小儿血液》 1996年第6期272-274,共3页
序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原吴红瑛综述兰炯采黄志光审校广州市第一军医大学南方医院儿科HLA基因位于人体第6对染色体短臂,是由一组密切连锁的复等位基因位点组成,是人类最高度多态性的遗... 序列特异性引物扩增和限制性片段长度多态性分析检定HLA Ⅱ类抗原吴红瑛综述兰炯采黄志光审校广州市第一军医大学南方医院儿科HLA基因位于人体第6对染色体短臂,是由一组密切连锁的复等位基因位点组成,是人类最高度多态性的遗传系统,其基因产物能在各种细胞表面... 展开更多
关键词 HLA 抗原 引物 限制片段长度 多态性
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中国部分地区绵羊肺炎支原体的基因多态性分析 被引量:11
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作者 许健 储岳峰 +4 位作者 赵萍 高鹏程 贺英 剡根强 逯忠新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第9期1295-1301,共7页
为了解绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,Mo)在我国部分地区的流行病学特征,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)及限制性片段长度多态性(RFLP)方法对26株Mo基因多态性进行了研究,并利用NTsys-2.10e软件对获得的多态性图谱进行了聚类... 为了解绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae,Mo)在我国部分地区的流行病学特征,采用随机扩增多态性DNA(RAPD)及限制性片段长度多态性(RFLP)方法对26株Mo基因多态性进行了研究,并利用NTsys-2.10e软件对获得的多态性图谱进行了聚类分析。结果在相似系数为0.70时,26株Mo可分成6个RAPD群或6个RFLP群;相似系数为0.90时,分成18个RAPD群或18个RFLP群;相似系数为1.00时,分成25个RAPD群或26个RFLP群。结果表明,我国Mo存在高度的基因多态性,这种多态性与地域差异相关,与宿主来源也具有一定的相关性。研究结果为了解我国Mo的分子流行病学特征打下了基础,也为建立有效的Mo诊断方法和疫苗研制提供了参考依据。 展开更多
关键词 绵羊肺炎支原体 随机多态性DNA 限制性片段长度多态性 基因多态性 流行病学
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药物代谢酶CYP3A在中国肾移植人群的遗传多态性 被引量:8
7
作者 储小曼 闵佩清 +2 位作者 张静 孔诚 蔡卫民 《医学研究生学报》 CAS 2005年第2期107-111,共5页
目的:建立药物代谢酶CYP3A4、CYP3A5的多个等位基因分型方法,为进一步从基因水平研究CYP3A与机 体对药物反应的个体差异本质及其与药物代谢的相关性提供分子生物学实验方法;探讨药物代谢酶CYP3A在中 国肾移植人群的遗传多态性。 方... 目的:建立药物代谢酶CYP3A4、CYP3A5的多个等位基因分型方法,为进一步从基因水平研究CYP3A与机 体对药物反应的个体差异本质及其与药物代谢的相关性提供分子生物学实验方法;探讨药物代谢酶CYP3A在中 国肾移植人群的遗传多态性。 方法:用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)法及特异性等位基因 扩增(PCR ASA)法分别建立了CYP3A的CYP3A4亚型三个新突变点(CYP3A4 4、 5、 6)及CYP3A5亚型的 CYP3A5 3基因分型方法,并对中国肾移植人群进行基因分型。 结果:CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3在中 国肾移植人群的基因频率分别为0.75%、0.76%、0.75%和27.83%;个体突变率分别为2/133、3/197、3/200和 55/115。 结论:研究结果提示,中国肾移植人群中CYP3A4 4、 5、 6、CYP3A5 3的存在可能使其表达的药 物代谢酶活性改变,从而影响药物在体内的代谢过程。 展开更多
关键词 CYP3A 基因多态性 药物代谢 特异性等位基因 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性
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细胞色素P450酶1A2和2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联分析 被引量:11
8
作者 陈静 陆峥 +3 位作者 江三多 蔡军 钱伊萍 李霞 《上海精神医学》 2005年第2期95-98,共4页
目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681... 目的探讨细胞色素P450酶(cytochromeP450enzymes,CYP)1A2、2C19基因多态性与难治性抑郁症的关联。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增技术及限制性片段长度多态性(RFLP)测定79例难治性抑郁症患者及107名正常对照者CYP1A2C163A、CYP2C19G681A基因多态性。结果两组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=3.605,P>0.05;χ2=3.154,P>0.05)。难治性抑郁症患者对照组间基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.853,P>0.05;χ2=0.568,P>0.05)。79名患者中46名接受氟西汀合并小剂量利培酮(0.5~2.0mg/d)治疗,将其分为治疗有效组和无效组,两组间CYP1A2C163A(χ2=0.785,P>0.05;χ2=7.142,P>0.05)CYP2C19G681A(χ2=3.008,P>0.05;χ2=2.722,P>0.05)基因型及等位基因分布差异均无显著性。根据CYP2C19G681A基因多态性将患者分为无突变组(G/G型)和突变组(G/A型和A/A型),两组患者CYP1A2C163A基因型及等位基因分布差异无显著性(χ2=0.252,P>0.05;χ2=0.682,P>0.05)。结论CYP1A2C163A和CYP2C19G681A基因多态性与难治性抑郁症无显著关联,不是影响利培酮对氟西汀增效作用的主要因素。 展开更多
关键词 细胞色素P450酶 难治性抑郁症 基因多态性 关联分析 聚合酶链反应(PCR) CYP2C19 限制性片段长度多态性 P〉0.05 CYP1A2 抑郁症患者 分布差异 等位基因 显著性 基因型 正常对照 技术 方法应用 效作用 利培酮 氟西汀
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CD40基因多态性与自身免疫性甲状腺病的相关性 被引量:1
9
作者 张怡 朱本章 孙燕 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期294-296,304,共4页
目的了解CD40基因多态性在西北地区汉族人群中的分布及其与自身免疫性甲状腺病(AITD)的相关性。方法随机选取本院内分泌科门诊的165例Graves病(GD)患者、113例桥本甲状腺炎(HT)患者为研究对象,以94例健康体查者为对照。①应用聚合酶链反... 目的了解CD40基因多态性在西北地区汉族人群中的分布及其与自身免疫性甲状腺病(AITD)的相关性。方法随机选取本院内分泌科门诊的165例Graves病(GD)患者、113例桥本甲状腺炎(HT)患者为研究对象,以94例健康体查者为对照。①应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性技术检测CD40基因5′非翻译区-1位点C/T多态性(5′UTR C(-1)T)、第三外显子58038位点-/T多态性;②应用扩增受阻突变系统-聚合酶链反应检测第九外显子64610位点C/G多态性。结果①5′UTR C(-1)T位点中CC基因型、C等位基因在GD组和对照组间有显著差异(P<0.05);②58038位点在372例样本中均为TT型;③64610位点未发现GG基因型。结论①西北地区汉族人CD40基因5′UTR C(-1)T位点上C等位基因型与GD发病有相关性,CC基因型者患GD的危险性较TT高;②58038位点-/T在西北地区汉族人中无多态性;③64610位点C/G在西北地区汉族人中未发现GG基因型。 展开更多
关键词 自身免疫性甲状腺病 CD40基因 单核苷酸多态性 聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性 受阻突变系统-聚合酶链反应
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乌龙茶种质资源种群遗传多样性AFLP评价 被引量:33
10
作者 黄福平 梁月荣 +3 位作者 陆建良 陈荣冰 Mamati G.E. 孙庆磊 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期183-189,共7页
以银染法 AFLP 分子标记技术用 5 对引物组合对来自福建武夷山市、安溪县、台湾省和广东潮安县 45份乌龙茶品种资源进行遗传多样性分析。结果表明,5 对引物扩增出 208 条多态性条带,多态性为 92.03%;最大遗传距离为 0.481,最小遗传距离... 以银染法 AFLP 分子标记技术用 5 对引物组合对来自福建武夷山市、安溪县、台湾省和广东潮安县 45份乌龙茶品种资源进行遗传多样性分析。结果表明,5 对引物扩增出 208 条多态性条带,多态性为 92.03%;最大遗传距离为 0.481,最小遗传距离为 0.124,种质资源间遗传多样性估值较高,达 0.311。按照地理分布分组分析表明,种群内遗传多样性以武夷山最高,其次为安溪乌龙茶种质资源,以台湾的乌龙茶种质资源遗传多样性最小;种群间遗传相似性,以武夷山与安溪种群间最高,达 0.9505,以台湾和潮安县类型间的相似性最低,相似性系数为 0.77。构建的种间和种群间进化树表明,可将 45 份乌龙茶品种划分为二大类型,福建类型和广东潮安类型。结合种群间相似系数,提出乌龙茶种质资源与其加工工艺的演化路径是一致的,也是由武夷山向安溪再向台湾传播。 展开更多
关键词 乌龙茶 种质资源 种群 遗传多样性 分子标记 片段长度多态性
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山核桃AFLP实验技术体系的建立 被引量:10
11
作者 郭金剑 池伟 +3 位作者 赵鑫珠 王丽 曾燕如 张秋月 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期532-537,共6页
以充分展开的山核桃Carya cathayensis嫩叶为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法与CTAB裂解-硅珠吸附法提取山核桃总DNA,对适合于山核桃叶片的AFLP(扩增片段长度多态性)分析体系进行了摸索。结果表明:"!改良CTAB法适用于... 以充分展开的山核桃Carya cathayensis嫩叶为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法与CTAB裂解-硅珠吸附法提取山核桃总DNA,对适合于山核桃叶片的AFLP(扩增片段长度多态性)分析体系进行了摸索。结果表明:"!改良CTAB法适用于从山核桃叶中提取高质量的DNA,提取的DNA可用于AFLP的分析;#"采用EcoR I/MseⅠ酶切组合,酶切连接一步法与两步法的效果没有明显的差异,但一步法操作更为简便;&%适合于山核桃叶AFLP分析的引物组合为E-ACT+M-CAT,E-ACT+M-CTG,E-ACG+M-CAT,E-ACG+M-CTG。扩增产物经60 g.L-1变性聚丙烯酰胺凝胶电泳后进行银染,条带信号强度一致性好,条带分布均匀、清晰,分辨率较高。 展开更多
关键词 植物学 山核桃 DNA提取 片段长度多态性(aflp)
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68份国外甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析 被引量:11
12
作者 刘家勇 赵培方 +6 位作者 刘新龙 赵俊 杨昆 吴才文 应雄美 昝逢刚 陈学宽 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第5期466-470,共5页
采用10对扩增片段长度多态性标记(AFLP)引物,对近年来从澳大利亚、法国、美国和菲律宾引进,并保存于国家甘蔗种质资源圃的68份甘蔗种质资源进行遗传多样性研究。结果表明:68份种质间的遗传相似性系数较高,为0.497 5~0.887 9,平均为0.76... 采用10对扩增片段长度多态性标记(AFLP)引物,对近年来从澳大利亚、法国、美国和菲律宾引进,并保存于国家甘蔗种质资源圃的68份甘蔗种质资源进行遗传多样性研究。结果表明:68份种质间的遗传相似性系数较高,为0.497 5~0.887 9,平均为0.761 2,表明大部分种质之间亲缘关系相近,遗传基础相似,遗传多样性并不丰富;各类种质间的平均遗传相似性系数以VMC型(菲律宾)最大,为0.825,Q型(澳大利亚)和CP型(美国)次之,分别为0.802和0.752,FR型(法国)最小,为0.685;在相似性系数0.676处可将68份种质分为5组,A组含CP67–412,B组含FR94–515,C组含FR96–626,D组含FR94–126,其余64份种质构成E组,占全部种质数的94.1%,A、B、C、D组4份种质与E组种质相比,亲缘关系较远,显示了独特的遗传组成;来自法国的种质资源具有较高的分散度,包含了较多的遗传信息。 展开更多
关键词 甘蔗 国外种质 片段长度多态性 遗传多样性
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梅根系丛枝菌根真菌AFLP分析 被引量:6
13
作者 蔡邦平 陈俊愉 +3 位作者 张启翔 郭良栋 黄耀坚 王增福 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第S1期82-87,共6页
为了解决梅根系共生的丛枝菌根(AM)真菌难以应用形态学鉴定的问题,以巢式PCR的AFLP方法研究梅根系AM真菌DNA多态性。试验采集梅花期的根系样品,应用改良CTAB法提取总DNA,经纯化处理后,应用巢式PCR扩增根系AM真菌基因片段,进行AFLP分析... 为了解决梅根系共生的丛枝菌根(AM)真菌难以应用形态学鉴定的问题,以巢式PCR的AFLP方法研究梅根系AM真菌DNA多态性。试验采集梅花期的根系样品,应用改良CTAB法提取总DNA,经纯化处理后,应用巢式PCR扩增根系AM真菌基因片段,进行AFLP分析。结果表明,18个梅品种的30个根系样品中,仅有8个样品经巢式PCR后获得纯化的DNA片段,占试验样品数的26.7%;8个样品共得到指纹图谱带24条,各样品平均多态性位点数为3.0个,Nei’s基因多样性为0.4097±0.0848,Shannon信息指数为0.5968±0.0955;利用Nei’s遗传相似性系数聚类,梅品种根系内AMF基因组DNA的聚类类别与梅"品种群"这一分类级别无相关性。该试验为植物根系共生AM真菌DNA多态性研究提供了一种简便的技术。 展开更多
关键词 丛枝菌根真菌 巢式PCR 片段长度多态性
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泥东风螺4个群体遗传多样性的AFLP分析 被引量:6
14
作者 秦溱 王晓清 +4 位作者 曾志南 朱丹丽 熊钢 巫旗生 宁岳 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期299-304,共6页
利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有... 利用AFLP分子标记方法对4个群体(福建连江野生、连江养殖、长乐养殖、广西野生)的泥东风螺进行遗传多样性分析。结果:用11对引物共扩增出908条有效片段,其中684条(75.33%)为多态性片段,224条片段(24.67%)为4个群体所共有;遗传多样性指数分析显示,4个群体的有效等位基因数、平均等位基因数、Shannon’s多样性指数和平均杂合度依次为1.5006、1.9740、0.4647、0.3034,Nei’s遗传距离为0.1284~0.1806,遗传相似系数为0.8348~0.8795,表明4个泥东风螺群体具有较为丰富的遗传多样性,且群体间具有较高的遗传相似性;分子方差分析(AMOVA)结果显示,4个群体中83.49%的变异来源于群体内,14.65%的变异来源于地区间,而群体间的遗传变异仅为1.86%,且4个群体间的遗传分化(GST)为0.1954,基因流(NM)为2.0586,说明群体间的基因交流水平较低;UPGMA聚类分析和主坐标(PCA)分析结果表明,长乐养殖群体和广西野生群体遗传距离最近,而连江野生群体与其他3个群体的遗传距离最远。 展开更多
关键词 泥东风螺 遗传多样性 遗传距离 片段长度多态性(aflp)
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混合花粉授粉茶树杂交F_1代AFLP分析 被引量:6
15
作者 曾贞 罗军武 +3 位作者 杨阳 晏嫦妤 王旭 赵洋 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期719-723,共5页
应用AFLP技术,使用E0/M0预扩引物及5对选扩引物(E41/M42,E41/M55,E42/M34,E43/M42,E44/M33),对以槠叶齐、福鼎大白茶、白毫早、龙井43为父本,湘波绿为母本的混合花粉授粉茶树杂交F1代79个单株进行分析.聚类结果将混合花粉授粉杂交的4个... 应用AFLP技术,使用E0/M0预扩引物及5对选扩引物(E41/M42,E41/M55,E42/M34,E43/M42,E44/M33),对以槠叶齐、福鼎大白茶、白毫早、龙井43为父本,湘波绿为母本的混合花粉授粉茶树杂交F1代79个单株进行分析.聚类结果将混合花粉授粉杂交的4个父本完全分开,其F1代79个单株分别归于4个父本所在的类群里;遗传距离为0.085~0.83,表明茶树是高度杂合的,混合花粉授粉杂交后代各单株间的遗传变异大;混合花粉授粉可以提高茶树杂交的可孕性,改变亲本间的亲和力;茶树混合花粉授粉杂交比单一父本杂交F1代的分离度更大. 展开更多
关键词 茶树 混合花粉授粉法 片段长度多态性
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茶树AFLP—银染技术体系与品种指纹图谱的建立 被引量:4
16
作者 黄建安 黄意欢 +3 位作者 罗军武 龚志华 刘仲华 欧秋良 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期427-430,共4页
通过对影响茶树AFLP—银染技术体系的关键因素作对比研究,建立了一套优化的茶树AFLP分子标记体系.应用该体系研究不同茶树品种的AFLP指纹,结果同一引物对不同品种扩增及不同引物对同一品种扩增都呈现出十分丰富的多态性,图谱清晰,分辨率高.
关键词 茶树 片段长度多态性 体系优化 指纹图谱
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卡瓦胡椒及胡椒的AFLP分子标记探讨 被引量:9
17
作者 施江 辛莉 +1 位作者 杨彦 郑学勤 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第24期7415-7417,7419,共4页
为了探讨卡瓦胡椒与胡椒及胡椒属其他野生种的亲缘关系。以6份卡瓦胡椒2、1份栽培胡椒和野生胡椒、1份不同属的草胡椒28份种质为试材,提取叶片DNA,从64对引物中筛选出带型好、多态性和分辨率高的引物进行AFLP扩增,并运用MVSP3.13f软件... 为了探讨卡瓦胡椒与胡椒及胡椒属其他野生种的亲缘关系。以6份卡瓦胡椒2、1份栽培胡椒和野生胡椒、1份不同属的草胡椒28份种质为试材,提取叶片DNA,从64对引物中筛选出带型好、多态性和分辨率高的引物进行AFLP扩增,并运用MVSP3.13f软件进行聚类分析。筛选出的4对引物共扩增出191个条带,其中189个具有多态性,占98.6%。AFLP分子标记结果表明,在相似系数0.52处将28份种质分为6个类型,6份卡瓦胡椒聚成一类,说明卡瓦胡椒为胡椒科胡椒属,但与胡椒及其近缘野生种间亲缘关系有一定的距离。该研究为选择卡瓦胡椒嫁接用砧木、卡瓦胡椒的分子鉴定和构建卡瓦胡椒指纹图谱提供了依据。 展开更多
关键词 卡瓦胡椒 胡椒 片段长度多态性
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红花檵木的AFLP分析及分类 被引量:4
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作者 李达 于晓英 +5 位作者 熊兴耀 彭尽晖 李炎林 吕长平 张宏志 陈海霞 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期169-175,共7页
采用荧光AFLP技术,对所收集的22个红花檵木材料和变异类型进行分类与亲缘关系研究.从64对引物组合中筛选出8对引物组合进行扩增,共扩增出1226条带,多态条带1085条,多态性比率为88.5%.冬艳紫红、大圆叶双面红的多态性比率最高,... 采用荧光AFLP技术,对所收集的22个红花檵木材料和变异类型进行分类与亲缘关系研究.从64对引物组合中筛选出8对引物组合进行扩增,共扩增出1226条带,多态条带1085条,多态性比率为88.5%.冬艳紫红、大圆叶双面红的多态性比率最高,达100%,其同源性最低.基于AFLP分析的UPGMA聚类分析得到,供试材料的遗传相似系数为0.7442~0.9207.以0.8171的相似系数为阈值,所有供试材料被分为6大组群,第一组群内以0.8484为阈值,又可分为4组.通过AFLP标记发现冬艳红5个类型中冬艳玫红、冬艳亮红、冬艳卷瓣玫聚类在一起,冬艳紫红、冬艳卷瓣红与其他类型存在的遗传差异通过分子标记可以鉴定出来.通过标记发现大圆叶双面红并没有与大叶玫红、大叶红、大叶卷瓣红、大红伏划分在双面红类型中,其外部形态相似,但遗传距离有较大差异.与形态标记相比,基于AFLP标记的红花檵木分类体系更能反映红花橙木品种间的亲缘关系. 展开更多
关键词 红花檵木 片断长度多态性 遗传多样性 亲缘关系 分类
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厚朴AFLP分子标记体系的建立 被引量:3
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作者 蒋燕锋 斯金平 +1 位作者 黄华宏 程龙军 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期304-309,共6页
以厚朴Magnolia officinalis为材料,通过对扩增片段长度多态性(AFLP)反应体系中的酶切模板用量、扩增条件等几个方面进行优化,建立了较为理想的厚朴AFLP反应体系。结果表明:①采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)硅珠法提取的DNA质量较好,... 以厚朴Magnolia officinalis为材料,通过对扩增片段长度多态性(AFLP)反应体系中的酶切模板用量、扩增条件等几个方面进行优化,建立了较为理想的厚朴AFLP反应体系。结果表明:①采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)硅珠法提取的DNA质量较好,适用于AFLP分析。②酶切的基因组DNA以400ng为宜;预扩增产物的稀释倍数以30倍为宜;20.00μL选扩反应体系中Mg2+最佳浓度为2.00mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTPs)最佳浓度为0.225mmol·L-1,Taq DNA聚合酶最佳用量为16.67nkat时,扩增带清晰且稳定,扩增效果较好。旨在为研究厚朴天然种群的遗传多样性及遗传结构分析、新品种选育及鉴定和遗传图谱构建等奠定理论基础。 展开更多
关键词 中草药 厚朴 片段长度多态性 中药材
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药食昆虫九香虫AFLP遗传多样性研究 被引量:3
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作者 范钦 朱刚利 +3 位作者 孙学刚 蔡红兵 廉振民 王启瑞 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2011年第8期4732-4733,4767,共3页
[目的]对广州鼎湖山和罗浮山药食昆虫九香虫(Aspongopus chinensis Dallas)种群进行遗传多样性分析。[方法]利用扩增片段长度多态性(AFLP)标记,建立九香虫AFLP指纹图谱,分析其种群遗传多样性参数。[结果]4个引物组合共揭示了362个位点,... [目的]对广州鼎湖山和罗浮山药食昆虫九香虫(Aspongopus chinensis Dallas)种群进行遗传多样性分析。[方法]利用扩增片段长度多态性(AFLP)标记,建立九香虫AFLP指纹图谱,分析其种群遗传多样性参数。[结果]4个引物组合共揭示了362个位点,其中293个位点具有多态性,多态性位点所占比例为80.94%。种群Nei's基因多样性指数平均为0.2467,Shannon多态性信息指数为0.3687,种群间基因分化系数GST为0.1701,种群每代迁移数Nm为3.157。[结论]AFLP标记具有很高的多态性检测效率,适合用于分析九香虫种群遗传多样性;九香虫种群内的遗传变异程度较高,种群具有丰富的DNA遗传多样性水平。 展开更多
关键词 半翅目 九香虫 片段长度多态性 遗传多样性
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