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水稻ACR家族基因的生物信息学分析
1
作者
李膳利
谢永
+4 位作者
王凌志
范刚强
杨昌元
潘宗东
张先文
《耕作与栽培》
2025年第6期1-7,共7页
ACT结构域是一个与小分子特异性结合调控蛋白质功能的保守结构域,参与代谢活动、溶质转运和信号转导等生命活动,水稻ACR家族蛋白具有ACT结构域。为进一步探究水稻ACR家族成员响应非生物胁迫分子机理,运用生物信息学方法,鉴定了19个OsAC...
ACT结构域是一个与小分子特异性结合调控蛋白质功能的保守结构域,参与代谢活动、溶质转运和信号转导等生命活动,水稻ACR家族蛋白具有ACT结构域。为进一步探究水稻ACR家族成员响应非生物胁迫分子机理,运用生物信息学方法,鉴定了19个OsACR基因,并进行系统聚类、基因结构和保守基序分析。同时结合芯片数据中OsACR基因响应干旱和盐胁迫的表达情况进行了筛选。结果表明,OsACR基因编码的蛋白质至少包含一个稳定ACT结构域,分别响应干旱和盐胁迫的ACR家族基因基本都具有相似的Motif结构,且表达特征与其启动子的元件分布有紧密相关性,并对可能参与干旱和盐胁迫响应的新的OsACR基因进行了预测。通过研究,为水稻ACR家族成员的功能鉴定和水稻抗逆性研究提供新的重要线索。
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关键词
act结构域
ACR家族基因
水稻
干旱
盐胁迫
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职称材料
大肠杆菌乙酰羟基酸合酶Ⅰ调控亚基IlvN的结晶及其与配体缬氨酸的共结晶(英文)
被引量：
1
2
作者
牛旭晖
刘祥
+2 位作者
周延菲
席真
苏晓东
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期45-50,共6页
乙酰羟基酸合酶(acetohydroxyacid synthase,AHAS)是生物体内支链氨基酸合成通路中的第一个通用酶,它是目前市售多种除草剂的靶标.AHAS通常由分子质量较大的催化亚基和分子质量较小的调控亚基组成.催化亚基结合催化必需的辅基(FAD、ThDP...
乙酰羟基酸合酶(acetohydroxyacid synthase,AHAS)是生物体内支链氨基酸合成通路中的第一个通用酶,它是目前市售多种除草剂的靶标.AHAS通常由分子质量较大的催化亚基和分子质量较小的调控亚基组成.催化亚基结合催化必需的辅基(FAD、ThDP和Mg2+);调控亚基可以结合终产物(缬氨酸、亮氨酸或异亮氨酸)作为负反馈信号调节全酶的活性.大肠杆菌中AHAS有3个同工酶,每种同工酶都由催化亚基和调控亚基组成.大肠杆菌ilvN基因编码了AHAS同工酶Ⅰ的调控亚基.ilvN基因克隆到pET28a表达载体中,在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中得到可溶性的大量表达.表达的蛋白质通过镍离子亲和层析和分子筛层析得到纯化.为了对调控亚基的调节机理有深入了解,对IlvN蛋白进行结晶并对蛋白质与其配体缬氨酸进行共结晶.IlvN蛋白晶体衍射能力为2.6魡,IlvN与缬氨酸共结晶的晶体衍射能力为3.0魡.
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关键词
乙酰羟基酸合酶
act结构域
结晶
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职称材料
题名
水稻ACR家族基因的生物信息学分析
1
作者
李膳利
谢永
王凌志
范刚强
杨昌元
潘宗东
张先文
机构
湖南农业大学生物科学技术学院
黔东南州农业科学院
出处
《耕作与栽培》
2025年第6期1-7,共7页
基金
贵州省科技计划项目“从江梯田湿地生态系统贵州省野外科学观测研究站”(黔科合平台YWZ[2024]004)
贵州省科技计划项目“黔东南州香禾糯种质资源科技创新基础平台建设”黔科合服企([2024]009-2)
+1 种基金
贵州省科技计划项目“黔东南州香禾糯种质资源鉴定评价及创新应用建设”(黔科合服企[2024]009-1)
贵州省水稻现代农业产业技术体系(GZSDCYJSTX2025-06)。
文摘
ACT结构域是一个与小分子特异性结合调控蛋白质功能的保守结构域,参与代谢活动、溶质转运和信号转导等生命活动,水稻ACR家族蛋白具有ACT结构域。为进一步探究水稻ACR家族成员响应非生物胁迫分子机理,运用生物信息学方法,鉴定了19个OsACR基因,并进行系统聚类、基因结构和保守基序分析。同时结合芯片数据中OsACR基因响应干旱和盐胁迫的表达情况进行了筛选。结果表明,OsACR基因编码的蛋白质至少包含一个稳定ACT结构域,分别响应干旱和盐胁迫的ACR家族基因基本都具有相似的Motif结构,且表达特征与其启动子的元件分布有紧密相关性,并对可能参与干旱和盐胁迫响应的新的OsACR基因进行了预测。通过研究,为水稻ACR家族成员的功能鉴定和水稻抗逆性研究提供新的重要线索。
关键词
act结构域
ACR家族基因
水稻
干旱
盐胁迫
Keywords
act
domain
ACR family gene
rice
drought
salt stress
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
大肠杆菌乙酰羟基酸合酶Ⅰ调控亚基IlvN的结晶及其与配体缬氨酸的共结晶(英文)
被引量：
1
2
作者
牛旭晖
刘祥
周延菲
席真
苏晓东
机构
北京大学
南开大学元素有机化学研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012年第1期45-50,共6页
基金
supported by grants from National Basic Research Program of China(2007CB914303,2011CB911103)
Peking University's 985 and 211 grants~~
文摘
乙酰羟基酸合酶(acetohydroxyacid synthase,AHAS)是生物体内支链氨基酸合成通路中的第一个通用酶,它是目前市售多种除草剂的靶标.AHAS通常由分子质量较大的催化亚基和分子质量较小的调控亚基组成.催化亚基结合催化必需的辅基(FAD、ThDP和Mg2+);调控亚基可以结合终产物(缬氨酸、亮氨酸或异亮氨酸)作为负反馈信号调节全酶的活性.大肠杆菌中AHAS有3个同工酶,每种同工酶都由催化亚基和调控亚基组成.大肠杆菌ilvN基因编码了AHAS同工酶Ⅰ的调控亚基.ilvN基因克隆到pET28a表达载体中,在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中得到可溶性的大量表达.表达的蛋白质通过镍离子亲和层析和分子筛层析得到纯化.为了对调控亚基的调节机理有深入了解,对IlvN蛋白进行结晶并对蛋白质与其配体缬氨酸进行共结晶.IlvN蛋白晶体衍射能力为2.6魡,IlvN与缬氨酸共结晶的晶体衍射能力为3.0魡.
关键词
乙酰羟基酸合酶
act结构域
结晶
Keywords
acetohydroxyacid synthase （AHAS）,
act
domain, crystallization
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻ACR家族基因的生物信息学分析
李膳利
谢永
王凌志
范刚强
杨昌元
潘宗东
张先文
《耕作与栽培》
2025
0
在线阅读
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职称材料
2
大肠杆菌乙酰羟基酸合酶Ⅰ调控亚基IlvN的结晶及其与配体缬氨酸的共结晶(英文)
牛旭晖
刘祥
周延菲
席真
苏晓东
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
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职称材料
已选择
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