原子-键电负性均衡方法融合进分子力场(ABEEM/MM)应用于蛋白质分子(Crambin)模拟 被引量：9

1

作者 张强 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2345-2347,共3页

建立应用于多肽和蛋白质模拟的ABEEM/MM浮动电荷力场.利用该模型和参数,对实际蛋白质分子Cramb in(植物种子中的一种小的蛋白质)进行模拟,得到了满意的结果,为其更广泛的应用开辟了道路.

关键词 原子-键电负性均衡方法 分子力场 CRAMBIN

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用从头算和ABEEM/MM法研究水分子团簇增长方式 被引量：2

2

作者 金彦 杨忠志 《河南科技大学学报（自然科学版）》 CAS 2007年第2期96-101,共6页

应用从头计算方法和ABEEM／MM模型，模拟了以单环（H2O）n（n=3-6）为片段的水分子团簇初步增长的各种可能方式，得到该系列团簇的稳定结构。总结了结合能、氢键强度、电荷分布、氢键几何参数等性质在团簇增长过程中的变化趋势。ABEEM... 应用从头计算方法和ABEEM／MM模型，模拟了以单环（H2O）n（n=3-6）为片段的水分子团簇初步增长的各种可能方式，得到该系列团簇的稳定结构。总结了结合能、氢键强度、电荷分布、氢键几何参数等性质在团簇增长过程中的变化趋势。ABEEM／MM方法的几何构型优化结果、氢键几何参数与从头算方法在数值上符合较好；在氢键强度和氧原子所带电荷数的平均值方面，与从头算方法所得变化趋势完全一致。 展开更多

关键词 abeem/mm方法 水分子团簇 氢键

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Sr^(2+)和Ba^(2+)水分子体系结构和结合能的从头算和ABEEM/MM研究 被引量：11

3

作者 刘燕 王芳芳 +3 位作者 于春阳 刘翠 宫利东 杨忠志 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第2期379-387,共9页

应用从头算方法和ABEEM/MM浮动电荷分子力场,研究了水合碱土离子团簇Sr2+/Ba2+(H2O)n(n=1-6),构建了离子-水相互作用的ABEEM/MM势能函数,获得了水合离子团簇的稳定结构,计算了结合能.计算结果表明,ABEEM/MM方法的结果和从头算方法的结... 应用从头算方法和ABEEM/MM浮动电荷分子力场,研究了水合碱土离子团簇Sr2+/Ba2+(H2O)n(n=1-6),构建了离子-水相互作用的ABEEM/MM势能函数,获得了水合离子团簇的稳定结构,计算了结合能.计算结果表明,ABEEM/MM方法的结果和从头算方法的结果有很好的一致性.进一步应用ABEEM/MM对Sr2+和Ba2+水溶液进行了分子动力学模拟.对Sr2+水溶液,得到的Sr2+-水中氧原子的径向分布函数的第一和第二最高峰分别位于0.257和0.464nm处,第一和第二水合层的配位水分子数分别为9.2和11.4;对Ba2+水溶液,得到的Ba2+与水中氧原子的径向分布函数的第一和第二最高峰分别位于0.269和0.467nm处,第一和第二水合层的配位水分子数分别为9.9和12.4.这与实验值或其它理论模拟结果有较好的一致性.对比外层的水分子,金属离子的极化作用使得溶液中第一水合层中水分子的O―H键长增长,HOH键角减小. 展开更多

关键词 水合金属离子团簇 离子溶剂化 从头算方法 abeem/mm浮动电荷分子力场 相互作用能

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ABEEM／MM浮动电荷力场应用于血红素结构的研究 被引量：6

4

作者 崔宝秋 管清梅 +2 位作者 宫利东 赵东霞 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第3期585-590,共6页

运用拟合的参数,应用ABEEM/MM浮动电荷力场对血红素分子结构进行了模拟.结果表明,该力场与CHARMM力场相比,能更好地模拟晶体结构.计算的ruffing构象能与B3LYP/6-31G*计算结果的线性相关系数在0.98以上,同时表明血红素分子中twist-angle... 运用拟合的参数,应用ABEEM/MM浮动电荷力场对血红素分子结构进行了模拟.结果表明,该力场与CHARMM力场相比,能更好地模拟晶体结构.计算的ruffing构象能与B3LYP/6-31G*计算结果的线性相关系数在0.98以上,同时表明血红素分子中twist-angle对ruffing构象具有明显影响.ABEEM/MM力场计算的细胞色素c552中血红素分子的电荷分布与CHARMM固定电荷力场的比较,更准确地反映了血红素分子的电荷分布以及极化现象. 展开更多

关键词 abeem/mm力场 血红素 几何结构 构象能 电荷分布

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血红素近轴侧基氢键的ABEEM/MM分子动力学模拟 被引量：11

5

作者 杨忠志 崔宝秋 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第9期1332-1336,共5页

应用ABEEM/MM浮动电荷力场对鲸鱼肌红蛋白及突变体进行了分子动力学模拟.结果表明,血红素近轴侧基不存在稳定的双氢键,该氢键对轴配体咪唑的取向不起决定性作用,而咪唑的取向与键联的组氨酸有密切联系.同时表明,血红素轴配体的柔性与其... 应用ABEEM/MM浮动电荷力场对鲸鱼肌红蛋白及突变体进行了分子动力学模拟.结果表明,血红素近轴侧基不存在稳定的双氢键,该氢键对轴配体咪唑的取向不起决定性作用,而咪唑的取向与键联的组氨酸有密切联系.同时表明,血红素轴配体的柔性与其邻近的氨基酸和咪唑体积有关. 展开更多

关键词 abeem/mm力场 动力学模拟 血红素 咪唑基 氢键

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微过氧化物酶水溶液的ABEEM/MM动力学模拟 被引量：5

6

作者 崔宝秋 宫利东 赵东霞 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第6期1035-1040,共6页

应用原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对微过氧化物酶水溶液进行了分子动力学模拟.研究了水溶液对微过氧化物酶的结构,血红素的皱裂构象以及轴配体咪唑基的取向的影响.结果表明,在水溶液中微过氧化物酶的骨架氨基酸是稳定... 应用原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对微过氧化物酶水溶液进行了分子动力学模拟.研究了水溶液对微过氧化物酶的结构,血红素的皱裂构象以及轴配体咪唑基的取向的影响.结果表明,在水溶液中微过氧化物酶的骨架氨基酸是稳定的,而血红素的皱裂构象在水分子的作用下趋于平面.与血红素轴配体咪唑基键连的组氨酸决定着咪唑基的空间取向,而咪唑基与血红素侧链的丙酸基的静电作用对其取向仅起次要作用. 展开更多

关键词 abeem/mm浮动电荷分子力场 微过氧化物酶 血红素 构象 分子动力学模拟

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应用ABEEM/MM模型研究水分子团簇(H_2O)_n(n=11～16)的性质 被引量：9

7

作者 钱萍 杨忠志 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第5期561-568,共8页

应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡... 应用ABEEM/MM模型计算了较大的水分子团簇(H2O)n(n=11￣16)的各种性质,如:优化的几何构型,氢键个数,结合能,稳定性,ABEEM电荷分布,偶极矩,以及结构参数、平均氢键个数和强度,增加的团簇结合能等.结果表明,从立方体结构到笼状结构的过渡出现在n=12的水分子团簇中,随着类似于笼状结构特点的不断增强,五元环的富集程度有所增加. 展开更多

关键词 abeem/mm模型 原子-键电负性均衡方法 分子力场 水分子团簇

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精密从头算与ABEEM/MM模型对水团簇(H_2O)_(11)9种低能结构的计算 被引量：3

8

作者 杨忠志 刘永军 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第5期928-934,共7页

用精密从头算方法研究了(H2O)11的9种低能异构体的性质,包括优化的几何结构、结合能、偶极矩和氢键个数等,并且得出了515-a是(H2O)11的全局最低能结构.同时,也用ABEEM/MM(atom bond electronegativity equalization method/mole cular m... 用精密从头算方法研究了(H2O)11的9种低能异构体的性质,包括优化的几何结构、结合能、偶极矩和氢键个数等,并且得出了515-a是(H2O)11的全局最低能结构.同时,也用ABEEM/MM(atom bond electronegativity equalization method/mole cular mechanics)模型研究了这些性质,与从头算的结果进行了比较,得到了相符合的结果.这显示了ABEEM/MM模型在描述中等大小的水分子团簇结构上是成功的. 展开更多

关键词 从头算方法 abeem/mm 最低能结构 结合能 水分子团簇

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全国第十届数学方法论与数学教育学术研讨会暨MM课题实施20周年纪念活动的预备通知

9

作者 徐沥泉 《数学教育学报》 北大核心 2008年第5期102-102,共1页

全国第十届数学方法论与数学教育学术研讨会(简称PMX)暨MM课题实施20周年纪念活动,由中国自然辩证法研究会数学哲学委员会,全国数学科学方法论研究交流中心主办,无锡市教育研究中心和无锡市第一中学、无锡市第三高级中学、无锡市梅梁中... 全国第十届数学方法论与数学教育学术研讨会(简称PMX)暨MM课题实施20周年纪念活动,由中国自然辩证法研究会数学哲学委员会,全国数学科学方法论研究交流中心主办,无锡市教育研究中心和无锡市第一中学、无锡市第三高级中学、无锡市梅梁中学和无锡国大教育咨询有限公司联合承办,苏州市教育科学院和南京幼儿高等师范学校、南京市女子中专协办,拟定于2009年9月28—30日在中国江苏省无锡市举行.会议主题:数学科学方法论专题研讨,数学方法论在数学教育中的应用研究,MM数学教育方式与新课标的比较研究等.会议欢迎以下专题论文(已参加我中心论文评选的与会者不必再另交会议论文): 展开更多

关键词 数学方法论 数学教育 学术研讨会 课题实施 纪念活动 mm

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应用ABEEM/MM力场探究Na^+与氮-甲基乙酰胺及水的相互作用

10

作者 潘一鸣 张静 +4 位作者 田博 姚菁菁 宫利东 刘翠 杨忠志 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2018年第11期2468-2476,共9页

应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分... 应用量子化学方法 MP2/6-311++G(d,p)//B3LYP/6-31+G(d,p)和原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场(ABEEM/MM),对[Na(H_2O)n]+(n=3～8),[Na(NMA)n]+(n=3～8)和[Na(NMA)n(H_2O)m]+(n+m=4,6)(NMA=氮-甲基乙酰胺)体系的结构、结合能和电荷分布进行研究.在计算结果的基础上,构建上述体系的ABEEM/MM可极化势能函数,优选并确定相关参数.结果表明,ABEEM/MM的计算结果与量子化学的计算结果相符:Na+与配体间距离的平均绝对偏差(AAD)小于0. 007 nm,相对均方根偏差(RRMSD)小于3. 5%,夹角的AAD小于2. 4°,RRMSD小于2. 0%,结合能的AAD小于8. 9 k J/mol,RRMSD小于12. 4%;ABEEM/MM电荷分布与量子力学(QM)电荷分布的线性相关系数在0. 97以上. 展开更多

关键词 原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场 钠离子 氮-甲基乙酰胺 可极化力场

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数学概念引入与MM方法

11

作者 夏莉 《西部论坛》 1997年第1期62-65,共4页

本文应用MM方法，由实际原型，经过数学抽象，探讨数学概念引入的思维过程。

关键词 mm方法 数学概念 数学思维

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第12届数学方法论与数学教育学术研讨会暨MM实验30周年纪念活动

12

《数学教育学报》 CSSCI 北大核心 2019年第5期69-69,共1页

“全国第12届数学方法论与数学教育学术研讨会暨MM实验30周年纪念活动”将于2019年11月28—30日在江苏省无锡市举行.一、会议主题:推广应用MM教育方式,提高数学核心素养,实现数学的全面贯通.

关键词 数学方法论 数学核心素养 江苏省无锡市 mm教育方式 教育学术研讨会 会议主题

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IEC61850到MMS映射分析及实现 被引量：14

13

作者 林知明 扬丰萍 余瑛 《继电器》 CSCD 北大核心 2007年第2期64-67,共4页

在分析和理解IEC61850标准及MMS服务定义的基础上,归纳了MMS的应用途径及其优点。根据SCSM方法,给出了两者间主要模型及服务的映射原理和映射内容,重点介绍了其实现方法。针对典型IED,具体给出了服务器类、关联类、逻辑设备类等主要模... 在分析和理解IEC61850标准及MMS服务定义的基础上,归纳了MMS的应用途径及其优点。根据SCSM方法,给出了两者间主要模型及服务的映射原理和映射内容,重点介绍了其实现方法。针对典型IED,具体给出了服务器类、关联类、逻辑设备类等主要模型的映射实例,并对部分特殊处理的例子作了较详细的讨论和分析。 展开更多

关键词 IEC61 850 mmS SCSM方法 IED 映射

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MM5三维变分系统在北京地区冷暖季背景场误差的对比分析 被引量：24

14

作者 范水勇 张朝林 仲跻芹 《高原气象》 CSCD 北大核心 2006年第5期855-861,共7页

NMC方法是目前较广泛采用的一种对模式背景场误差协方差进行统计分析的一种方法。本文根据积累的2002年8月份和2003年2月份各一个月模式预报结果,采用NMC方法,计算了中尺度模式MM5V3在北京地区的冷暖季背景场误差,详细给出其气候统计特... NMC方法是目前较广泛采用的一种对模式背景场误差协方差进行统计分析的一种方法。本文根据积累的2002年8月份和2003年2月份各一个月模式预报结果,采用NMC方法,计算了中尺度模式MM5V3在北京地区的冷暖季背景场误差,详细给出其气候统计特征。通过对比分析发现,背景场误差特征对于不同的模式变量、水平分辨率、垂直层各不相同,冷暖季背景场误差也有不同的特征,其差别主要表现在风场。这些特征与模式模拟区域的平均天气状况相对应,同化应该在各模式区域分别进行。MM5三维变分系统在北京地区的实际应用中,应发展根据实际季节变换背景场误差协方差矩阵的方法。 展开更多

关键词 三维变分系统 NMC方法 冷暖季背景场误差 mm5模式

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3 mm波段烟幕插入损耗测量 被引量：2

15

作者 彭树生 赵刚锋 +2 位作者 郭建广 殷兴辉 徐之材 《南京理工大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2006年第5期626-629,652,共5页

为了满足3 mm波段烟幕辐射特性和插入损耗特性测量的需要,研制了3 mm波段烟幕特性自动测量系统-3 mm辐射源和3 mm辐射计／接收机一体机。一体机是对Dicke型辐射计的改进,在保持毫米波辐射计接收机高频前端不变的前提下,分别为辐射特性... 为了满足3 mm波段烟幕辐射特性和插入损耗特性测量的需要,研制了3 mm波段烟幕特性自动测量系统-3 mm辐射源和3 mm辐射计／接收机一体机。一体机是对Dicke型辐射计的改进,在保持毫米波辐射计接收机高频前端不变的前提下,分别为辐射特性测量和插入损耗特性测量设计了独立的被动通道和主动通道,并在窄带的插入损耗测量的主动通道增加了中频锁相环路。探讨了该系统的烟幕插入损耗特性测量方法,实验结果表明:该系统能满足3 mm波段烟幕特性自动化测量的要求。 展开更多

关键词 插入损耗 测量方法 3 mm波段 波辐射计 接收机 烟幕

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MM教育方式与当代数学教育 被引量：22

16

作者 运怀立 杨之 《数学教育学报》 北大核心 2005年第4期74-77,共4页

20世纪80年代至21世纪初,对数学教育改革和研究,这大浪淘沙式的严酷条件下,“MM教育方式”几乎是唯一存活下来,而且还在发展的一种教改方案.MM教育方式对当代数学教育的启示是:不能眼睛向外,看不到我们在数学教育方面的长处;要防止去“... 20世纪80年代至21世纪初,对数学教育改革和研究,这大浪淘沙式的严酷条件下,“MM教育方式”几乎是唯一存活下来,而且还在发展的一种教改方案.MM教育方式对当代数学教育的启示是:不能眼睛向外,看不到我们在数学教育方面的长处;要防止去“数学化”的倾向;要将数学教育理论研究与数学实践相结合. 展开更多

关键词 mm教育方式 mm实验 数学方法论 初等数学研究

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MM教育方式的生命力 被引量：8

17

作者 林夏水 《数学教育学报》 北大核心 2012年第6期1-5,共5页

20世纪80年代，中国数学教改方案如雨后春笋，但存活至今的却寥若晨星，而MM教育方式为什么却展现出强大的生命力呢？从数学观与数学方法论的一致性角度，考察MM教育方式蕴涵的数学观，说明MM教育方式的强大生命力在于，它具有深厚的哲... 20世纪80年代，中国数学教改方案如雨后春笋，但存活至今的却寥若晨星，而MM教育方式为什么却展现出强大的生命力呢？从数学观与数学方法论的一致性角度，考察MM教育方式蕴涵的数学观，说明MM教育方式的强大生命力在于，它具有深厚的哲学理论根据，体现一种新的数学教育观． 展开更多

关键词 数学方法论 数学观 mm实验 mm教育方式 数学教育观

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点群6mm一维六方准晶压电材料中含螺型位错的电弹性场分析 被引量：3

18

作者 周彦斌 刘官厅 《应用力学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期347-352,1,共6页

根据点群6mm一维六方准晶压电材料反平面问题的一般方程,得到其含螺型位错时应力场和电场的解析解。利用复变函数的方法,得出材料中裂纹与螺型位错在相互作用时的应力场解析表达式,所得到的解析解可以退化为已知材料的理论解。通过数值... 根据点群6mm一维六方准晶压电材料反平面问题的一般方程,得到其含螺型位错时应力场和电场的解析解。利用复变函数的方法,得出材料中裂纹与螺型位错在相互作用时的应力场解析表达式,所得到的解析解可以退化为已知材料的理论解。通过数值算例表明:离螺型位错越近,力场和电场值越小,反之越大。通过研究螺形位错与裂纹的相互作用为讨论一维六方准晶压电材料的裂纹顶端发射位错和裂纹钝化奠定了理论基础。 展开更多

关键词 点群6mm 一维六方准晶压电材料 螺型位错 复变函数方法 解析解 裂纹钝化

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MM教育方式实验研究综述与思考 被引量：4

19

作者 邝雪松 廖运章 《广西师范大学学报（自然科学版）》 CAS 1999年第S1期45-47,共3页

1MM教育方式实验状况 MM教育方式实验是“贯彻数学方法论的教育方式,全面提高学生素质”数学教育实验之简称,是在国内外数学教育研究的背景下,通过对众多教改实验研究的反思而于1989年5月由江苏无锡徐沥泉等首先设计并开展实验,1989年9... 1MM教育方式实验状况 MM教育方式实验是“贯彻数学方法论的教育方式,全面提高学生素质”数学教育实验之简称,是在国内外数学教育研究的背景下,通过对众多教改实验研究的反思而于1989年5月由江苏无锡徐沥泉等首先设计并开展实验,1989年9月MM教育方式通过可行性论证并由无锡市区三所普通中学和一所职业中学开始为期三年的第一轮实验,初战告捷;1994年5月历经五年三轮实验确立的MM教育方式通过了由中科院院士王梓坤教授为首的专家鉴定委员会的鉴定,之后MM实验开始分轮交叉进行,进入了边实验边推广阶段,实验点和实验研究协作单位亦由原无锡市区的4个扩大到70多个,其所在地已遍布我国二十多个省市自治区,并且在北京朝阳区、湖北武汉市形成了规模试验。 展开更多

关键词 mm教育方式 研究综述 数学方法论 高中数学教学 实验研究 数学教育实验 抽象度 学生素质 数学教学设计 高等数学

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数学教育的实践探索与数学方法论 被引量：2

20

作者 周春荔 《首都师范大学学报（社会科学版）》 2002年第S1期97-101,168,共6页

本文简要回顾了 2 0世纪 80年代以来 ,我国数学教育界部分学者、教师自觉学习与应用数学方法论指导数学教学方法改革的历史足迹 ,其中“贯彻数学方法的教育方式 ,全面提高学生素质”的数学教育实验 (简称MM教育方式实验 )已从无锡拓展... 本文简要回顾了 2 0世纪 80年代以来 ,我国数学教育界部分学者、教师自觉学习与应用数学方法论指导数学教学方法改革的历史足迹 ,其中“贯彻数学方法的教育方式 ,全面提高学生素质”的数学教育实验 (简称MM教育方式实验 )已从无锡拓展到湖北、天津、北京、新疆等十余个省市。这对进一步推进数学素质教育提供了重要启示。 展开更多

关键词 数学教育 数学方法论 mm教育方式 数学思维活动

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