期刊文献+
共找到3,599篇文章
< 1 2 180 >
每页显示 20 50 100
基于高通量测序技术对口腔扁平苔藓患者相关癌变差异LncRNAs的筛选与分析 被引量:1
1
作者 董文亮 黄一丹 +2 位作者 郭文卓 杨慧霞 张敬 《实用口腔医学杂志》 北大核心 2025年第1期80-87,共8页
目的:筛选并分析口腔扁平苔藓(OLP)黏膜组织的长链非编码RNAs(LncRNAs)的癌变相关差异性表达谱,并对其功能进行初步分析,探索其在OLP发生发展过程中可能的作用。方法:收集OLP(糜烂型)病损黏膜组织和正常黏膜组织各5例,应用高通量测序技... 目的:筛选并分析口腔扁平苔藓(OLP)黏膜组织的长链非编码RNAs(LncRNAs)的癌变相关差异性表达谱,并对其功能进行初步分析,探索其在OLP发生发展过程中可能的作用。方法:收集OLP(糜烂型)病损黏膜组织和正常黏膜组织各5例,应用高通量测序技术构建OLP中基因差异表达谱,生物信息学分析得到与口腔扁平苔藓癌变关系密切的LncRNAs。结果:筛选获得400个与OLP相关的LncRNAs,其中250个表达上调,150个表达下调,得到5个与口腔扁平苔藓癌变相关的差异表达LncRNAs:54055、100128560、399717、378825、100130231。结论:筛选得到的OLP病损黏膜中差异表达LncRNAs400个,发现其中5个LncRNAs可能与OLP发病、癌变倾向相关。 展开更多
关键词 长链非编码RNAs 口腔扁平苔藓 高通量 生物信息学分析 癌变
在线阅读 下载PDF
基于16S rRNA高通量测序的驻岛人员肠道菌群分析
2
作者 吴浩 谢沛 +4 位作者 张菂 黄文 李兆申 薛芊 鞠金涛 《海军军医大学学报》 北大核心 2025年第3期400-405,共6页
目的分析驻岛人员肠道菌群特征,为维护驻岛人员的肠道微生态平衡及提供精准的医疗保障奠定基础。方法采用随机抽样的方法纳入驻岛人员若干,同时纳入沿海地区人员若干作为对照,对人员粪便标本进行16S rRNA高通量测序。比较两组人员肠道... 目的分析驻岛人员肠道菌群特征,为维护驻岛人员的肠道微生态平衡及提供精准的医疗保障奠定基础。方法采用随机抽样的方法纳入驻岛人员若干,同时纳入沿海地区人员若干作为对照,对人员粪便标本进行16S rRNA高通量测序。比较两组人员肠道菌群多样性及菌群组成差异。结果肠道菌群alpha多样性分析显示驻岛人员肠道菌群丰度较沿海地区人员升高,beta多样性分析提示驻岛人员肠道微生物群落构成与沿海地区人员相比差异有统计学意义(P=0.001)。驻岛人员肠道内拟杆菌门丰度低于沿海地区人员(30.8%vs 48.3%,P<0.001),而肠道内变形菌门丰度高于沿海地区人员(28.3%vs 10.2%,P<0.001)。经多重假设检验校正后发现,驻岛人员肠道内拟杆菌属、罗斯氏菌属、另枝菌属、副拟杆菌属丰度显著下降,普雷沃氏菌属、大肠埃希菌-志贺菌属、柠檬酸杆菌属、产粪甾醇真杆菌属丰度显著提升。结论海岛特殊环境影响驻岛人员肠道菌群特征,肠道微生态健康亟需精准保障。 展开更多
关键词 驻岛人员 海岛 肠道菌群 16S rRNA 高通量
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序的青花菜KASP标记开发与应用
3
作者 张振超 陶美奇 +4 位作者 潘永飞 孙国胜 王传友 安林海 戴忠良 《核农学报》 北大核心 2025年第3期513-521,I0003-I0005,共12页
为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表... 为提高青花菜分子标记辅助育种水平,本研究基于高通量测序数据开发了70组KASP标记,并采用KASP检测平台对43份青花菜试验材料进行分型,根据分型结果筛选出分型效果好、多态性高的标记,用于指纹图谱构建、遗传关系确定和纯度鉴定。结果表明,70组KASP标记中,未分型成功有3个,未分型材料>5份有13个,多态性差的有6个,分型成功48个(成功率68.6%)。48个标记中,多态性信息含量(PIC)值≥0.30的标记有37个(占比77.08%),其中PIC值为0.37的标记数量最多,为11个,0.38的标记有3个。将48个标记的分型结果转化为二元编码数据,获得了43份青花菜育种材料的SNP-DNA指纹图谱。聚类分析结果发现,Br05与其他材料的遗传关系较远;Br12和Br19、Br33和Br34之间遗传系数均为100,Br14和Br32的遗传系数为99,表明两两间为同一株系的可能性大,这与在田间的表型观察结果基本一致。10组标记对30株Br19的一致性进行鉴定,发现纯度值区间为83.3%~96.7%,说明Br19株系间存在差异;采用10组标记对亲本Br19、Br35和杂交种F1(Br19×Br35)进行基因分型,结果有5个标记(SNP07、SNP09、SNP10、SNP11和SNP19)在三者间的分型结果不同,可用于杂交制种田F1(Br19×Br35)种子纯度鉴定。本研究结果对青花菜种质资源鉴定、分子标记辅助育种与新品种保护具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 高通量 竞争性等位基因特异性PCR 指纹图谱 纯度鉴定 分子标记
在线阅读 下载PDF
宏基因组高通量测序辅助诊断日本斑点热一例
4
作者 阮永春 周宜庆 +4 位作者 张海旺 周洁 段金楠 张晓静 李明晖 《中国医学科学院学报》 北大核心 2025年第1期146-149,共4页
日本斑点热是由日本立克次体感染引起的一种自然疫源性疾病,临床症状缺乏特异性,易误诊。本文报道1例日本斑点热病例,采用宏基因组高通量测序技术在血细胞中检出日本立克次体,经多西环素治疗好转,为该病的临床诊治提供参考。
关键词 日本立克次体 日本斑点热 诊断 宏基因组高通量
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序的草莓白粉病和向日葵白粉病群落组成分析
5
作者 张振荣 朱维贤 +4 位作者 董琼娥 钱玲 任建青 李亚平 王薇 《贵州农业科学》 2025年第3期93-100,共8页
【目的】探明相邻地点同时爆发草莓白粉病(CM)、向日葵白粉病(XRK)的微生物多样性与群落种类差异性,为研究白粉病的侵染特点和防治提供理论依据。【方法】2023年5—7月,分别取位于昆明市农业科学院嵩明基地的温室大棚草莓白粉病样品,与... 【目的】探明相邻地点同时爆发草莓白粉病(CM)、向日葵白粉病(XRK)的微生物多样性与群落种类差异性,为研究白粉病的侵染特点和防治提供理论依据。【方法】2023年5—7月,分别取位于昆明市农业科学院嵩明基地的温室大棚草莓白粉病样品,与之相隔300 m的露天爆发严重的向日葵白粉病样品,进行Illumina MiSeq高通量测序,对这2种植物感染白粉病部位表面的白粉层真菌群落组成与结构进行比较分析。【结果】在97%相似水平下物种分析和聚类显示,草莓白粉病样本群落涵盖1域1界5门17纲26目35科39属50种62个OTU的真菌;向日葵白粉病样本群落涵盖1域1界2门5纲7目10科13属13种15个OTU的真菌;草莓白粉病样本的物种丰富度高于向日葵白粉病样本;2个样本的真菌群落组成与物种在门、科和属水平上均呈显著差异。子囊菌门(Ascomycota)在2个样本的相对丰度均大于93%。草莓白粉病优势群落以枝孢科(Cladosporiaceae)枝孢属(Cladosporium)真菌为主,同时含有青霉科(Aspergillacea)青霉属(Penicillium)、白粉菌科(Erysiphaceae)叉丝单囊壳属(Podosphaera)等多种真菌微生物;向日葵白粉病优势群落由白粉菌科(Erysiphaceae)unclassified_f_Erysiphaceae真菌组成,群落组成相对单一。【结论】昆明市相邻地点同时爆发的向日葵白粉病和草莓白粉病的微生物多样性与群落种类差异极显著;草莓白粉病病原菌主要为枝孢属(Cladosporium)真菌,同时含有其他多种真菌微生物,向日葵白粉病由白粉菌科(Erysiphaceae)unclassified_f_Erysiphaceae真菌组成,群落组成相对单一,且云南省昆明市向日葵白粉病病原菌种类为白粉菌科(Erysiphaceae)真菌为首次报道。 展开更多
关键词 向日葵白粉病 草莓白粉病 真菌多样性 白粉菌科 Illumina高通量
在线阅读 下载PDF
基于形态学和高通量测序的春季南澳海域浮游植物群落特征及其与环境因子关系 被引量:2
6
作者 周志希 唐汇娟 +2 位作者 柯志新 刘甲星 周伟华 《热带海洋学报》 北大核心 2025年第1期53-65,共13页
利用形态学鉴定和高通量测序技术,对2022年5月南澳海域浮游植物群落结构进行了研究,探讨其空间分布与环境因子的关系,并对两种不同方法得出的结果进行了比较和讨论。根据环境因子聚类分析,调查海域可分为近岸区域和远岸区域。通过形态... 利用形态学鉴定和高通量测序技术,对2022年5月南澳海域浮游植物群落结构进行了研究,探讨其空间分布与环境因子的关系,并对两种不同方法得出的结果进行了比较和讨论。根据环境因子聚类分析,调查海域可分为近岸区域和远岸区域。通过形态学方法鉴定浮游植物5门8纲27目39科52属10^(5)种,高通量测序鉴定出6门32纲97目155科272属543种,其中硅藻门(Bacillariophyta)和甲藻门(Dinophyta)为优势类群,分别平均占形态学鉴定结果的74.54%和24.78%以及高通量测序结果的17.52%和67.84%。形态学鉴定结果显示浮游植物丰度变化范围为0.11×10^(5)~6.85×10^(5)cells·L^(-1),与叶绿素a浓度分布显著相关,浮游植物多样性指数低于高通量测序方法。两种方法得到优势种均为7种,其中形态学鉴定结果中绝对优势种为扁面角毛藻(Chaetoceros compressus),高通量测序鉴定结果中绝对优势种为球形异帽藻(Heterocapsa rotundata)。相关性分析结果表明,春季影响南澳浮游植物群落结构的主要环境因子是pH、盐度和溶解态无机磷。利用形态学鉴定与高通量测序技术相结合的方法,可以更全面、更准确地描述浮游植物群落结构及多样性。 展开更多
关键词 南澳 浮游植物 群落结构 高通量 环境因子
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序技术的寒地苹果根际土壤微生物群落组成及功能预测
7
作者 杨悦 顾广军 +7 位作者 于文全 卜海东 胡颖慧 刘畅 程显敏 高洪娜 董航 汤佳翰 《经济林研究》 北大核心 2025年第2期31-42,共12页
【目的】改善寒地苹果园土壤环境,为提高果树产量和果品质量提供参考。【方法】以寒地小苹果‘龙丰’为试验材料,利用高通量测序技术测定其根际土壤微生物群落组成与功能,分析不同种植年限(3、5、8、12 a)苹果根际土壤微生物群落结构及... 【目的】改善寒地苹果园土壤环境,为提高果树产量和果品质量提供参考。【方法】以寒地小苹果‘龙丰’为试验材料,利用高通量测序技术测定其根际土壤微生物群落组成与功能,分析不同种植年限(3、5、8、12 a)苹果根际土壤微生物群落结构及其与酶活性之间的关系,预测土壤细菌与真菌功能特征。【结果】土壤酶活性均高于空地土壤。种植园中,随种植年限增加,土壤脲酶活性呈降低趋势;蔗糖酶和碱性磷酸酶总体呈先升高后降低的趋势,均为5 a最高;蔗糖酶3、8、12 a之间差异不显著,碱性磷酸酶12 a最低;过氧化氢酶也呈先升高后降低的趋势,8 a最高,3 a最低。土壤样品中细菌和真菌的OTU数目均表现为空地土壤最高,8 a最低。门水平上,放线菌门、绿弯菌门、变形菌门和酸杆菌门为‘龙丰’苹果的优势细菌门;与空地土壤相比,绿弯菌门和酸杆菌门有所减少;随着苹果种植年限的延长,放线菌门、绿弯菌门和酸杆菌门呈降低趋势,变形菌门先降低再升高(8 a最低),疣微菌门呈增加趋势。真菌土壤中,子囊菌门是占绝对优势的真菌门,其次是担子菌门;子囊菌门相对丰度均小于空地,且随种植年限延长先降低再升高;担子菌门高于空地,且随种植年限延长先升高再降低。相关性分析表明,土壤细菌群落受碱性磷酸酶、脲酶、过氧化氢酶影响较大,土壤真菌群落受碱性磷酸酶、蔗糖酶、过氧化氢酶影响较大。功能预测分析显示,土壤细菌以代谢为主,涉及全局概览通路、碳水化合物代谢和氨基酸代谢等46个二级功能;真菌群落以腐生及病理-腐生-共生营养型为主,包括未定义腐生菌等细分功能22类。【结论】12 a的土壤酶活性均较8 a有所降低。土壤细菌群落受碱性磷酸酶、脲酶、过氧化氢酶影响较大,土壤真菌群落受碱性磷酸酶、蔗糖酶、过氧化氢酶影响较大。苹果园根际土壤细菌和真菌群落结构和功能均随种植年限的延长产生差异。8 a的细菌和真菌类群OTU数目均为最低,是土壤发生变化的转折点。种植苹果树显著降低了腐生营养型真菌的占比;12 a的苹果树根际土壤细菌代谢功能减弱。综上,苹果园根际土壤微生物群落受土壤酶活性的影响,不同种植年限对土壤微生物群落结构和功能均有影响。 展开更多
关键词 寒地苹果 土壤微生物 群落组成 群落功能 高通量技术
在线阅读 下载PDF
高通量测序分析向日葵—工业大麻轮作土壤微生物群落结构变化
8
作者 张元野 张明 +4 位作者 房郁妍 郑楠 闫博巍 隋月 张利国 《沈阳农业大学学报》 北大核心 2025年第3期61-75,共15页
[目的]连作障碍是限制农业生产的重要因素之一,土壤退化、作物减产等问题频发。合理轮作能够缓解连作障碍。工业大麻是一种理想的轮作作物,与其他作物合理轮作能够维持微生物多样性、提升生物产量。[方法]采用高通量测序技术侦测不同时... [目的]连作障碍是限制农业生产的重要因素之一,土壤退化、作物减产等问题频发。合理轮作能够缓解连作障碍。工业大麻是一种理想的轮作作物,与其他作物合理轮作能够维持微生物多样性、提升生物产量。[方法]采用高通量测序技术侦测不同时间节点向日葵、工业大麻土壤微生物多样性和群落结构的动态变化。[结果]细菌高通量测序共检测到45门143纲330目552科1 160属1 795种,丰度最高的门和属分别为变形菌门和鞘氨醇单胞菌属,LEFSe分析揭示3个时期的Biomarker分别为节杆菌属、小梨形属和罗河杆菌属。真菌高通量测序共检测到12门38纲79目142科242属373种,丰度最高的门和属分别为子囊菌门和Guehomyces,LEFSe分析揭示3个时期的Biomarker分别为交链孢属、未鉴定真菌、木霉属。向日葵-工业大麻轮作根际土壤微生物多样性差异丰富,工业大麻根际土壤中抑菌真菌显著增加,使得致病菌生长受抑制。[结论]研究结果可为探究工业大麻缓解连作障碍机制及微生物与作物平衡关系做数据铺垫。 展开更多
关键词 工业大麻 轮作 土壤微生物 高通量
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序分析甲状腺癌基因变异和临床病理特征相关性的单中心回顾性队列研究
9
作者 陈灵锋 林洁 +1 位作者 俞训彬 吴义娟 《临床与实验病理学杂志》 北大核心 2025年第1期74-80,共7页
目的 分析甲状腺癌患者基因变异与临床病理特征的相关性。方法 结合高通量测序检测甲状腺肿瘤基因变异的结果与临床病理特征进行相关性分析。结果 238例甲状腺癌中93.7%存在Ⅰ类或Ⅱ类变异。与癌症基因组图谱(TCGA)相比,本中心队列甲状... 目的 分析甲状腺癌患者基因变异与临床病理特征的相关性。方法 结合高通量测序检测甲状腺肿瘤基因变异的结果与临床病理特征进行相关性分析。结果 238例甲状腺癌中93.7%存在Ⅰ类或Ⅱ类变异。与癌症基因组图谱(TCGA)相比,本中心队列甲状腺乳头状癌(papillary thyroid cancer, PTC)患者的平均年龄较小(44.4±12.4岁vs 46.8±15.5岁,P=0.043),淋巴结转移率较高(57.5%vs 49.2%;P=0.046),BRAF突变的发生率较高(82.4%vs 59.7%,P<0.001),而RAS突变(2.3%vs 12.9%,P<0.001)和TERT启动子突变(1.8%vs 9.4%,P<0.001)的发生率较低,RET融合(5.4%vs 6.8%,P=0.484)和NTRK融合(4.1%vs 2.1%,P=0.127)则无差别。在221例PTC队列中95.0%患者存在基因变异,分别为BRAF(182/221,82.4%)、RET融合(12/221,5.4%)、NTRK融合(9/221,4.1%)、FGFR扩增(6/221,2.7%)、CCND1扩增(6/221,2.7%)、FGF19扩增(6/221,2.7%)、RAS(5/221,2.3%)、PIK3CA(5/221,2.3%)和TERT启动子(4/221,1.8%)等。NTRK融合与年龄较小(P=0.049)和T分期更高(P=0.005)相关,而TERT启动子突变与年龄较大(P=0.003)和T分期更高(P=0.001)相关。8.6%(19/221)的PTC患者具有至少2个驱动基因变异,且倾向于发生在年龄较大(P=0.001)和T分期更高(P=0.001)的患者中,更容易出现淋巴结转移。BRAF较高的突变丰度与T分期(P<0.001)和N分期(P=0.017)相关。结论 中国PTC患者具有独特的基因变异特征;NTRK融合、TERT启动子突变、多个驱动基因变异或BRAF较高的突变丰度患者表现出特殊的临床病理特征。 展开更多
关键词 甲状腺肿瘤 甲状腺乳头状癌 基因变异 高通量 临床病理特征
在线阅读 下载PDF
基于广泛靶向代谢组学与高通量测序技术研究广陈皮原位仓储的陈化机制
10
作者 何天行 苟海英 +3 位作者 王彬 王福 陈鸿平 刘友平 《食品科学》 北大核心 2025年第16期33-43,共11页
本研究探究原位仓储与非原位仓储广陈皮品质差异的形成机制。采用广泛靶向代谢组学及高通量测序技术解析原位仓储(广东)及非原位仓储(北京、四川、云南)陈化的广陈皮代谢物与微生物变化规律。超高效液相色谱-电喷雾离子化串联质谱共鉴... 本研究探究原位仓储与非原位仓储广陈皮品质差异的形成机制。采用广泛靶向代谢组学及高通量测序技术解析原位仓储(广东)及非原位仓储(北京、四川、云南)陈化的广陈皮代谢物与微生物变化规律。超高效液相色谱-电喷雾离子化串联质谱共鉴定和表征了1440种代谢物,其中472种化合物被筛选为差异代谢物;与其他陈化地点相比,于广东陈化的样品中黄酮类差异代谢物普遍上调,黄酮合成相关通路显著富集,并且总黄酮含量显著高于其他样品;14种于广东陈化的样品中上调的黄酮类代谢物被确定为广陈皮陈化过程中的关键代谢物。微生物中Aspergillus、Sphingobium等物种在广东陈化样品中显著富集。相关性分析表明,气候因子中平均温度与关键差异代谢物呈显著正相关(P<0.05),微生物Aspergillus、Cutibacterium、Staphylococcus、Xeromyces、Entyloma与6-甲氧基山柰酚-3-O-葡萄糖苷、2’,3’,4’,5,7-五羟基黄酮、黄芩黄酮II、槲皮素、金圣草黄素-7-O-龙胆二糖苷等关键代谢物呈显著正相关(P<0.05),并筛选出Aspergillus、Xeromyces为陈化过程中的核心微生物。综上,平均温度作为广陈皮品质形成的重要影响因素,其诱导Aspergillus、Xeromyces等核心微生物富集,加速原位仓储的广陈皮中黄酮类化合物的积累。本研究可为阐明广陈皮原位仓储的意义以及深入理解广陈皮的陈化机制提供科学基础。 展开更多
关键词 广陈皮 原位仓储 代谢组学 高通量 气候因子
在线阅读 下载PDF
高通量测序在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中的应用
11
作者 李向 杨进 +2 位作者 黄爱军 周俊 易龙 《果树学报》 北大核心 2025年第3期651-661,共11页
中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高... 中国柑橘产业在全球占据至关重要的地位,然而,柑橘病毒病却给该产业带来了严重的经济损失。随着病毒种类的不断增多,快速、准确地对病毒进行鉴定及遗传多样性分析变得愈发关键。高通量测序(High-Throughput Sequencing,HTS)技术,具有高通量、高效快速以及效益高的优势,逐渐成为了鉴定柑橘病毒的核心技术手段。HTS技术的应用不仅成功揭示了多种新病毒的存在,还深入挖掘了已知病毒的全基因组信息,提供了大量的基因序列数据,极大地推动了柑橘病毒在遗传变异、进化关系以及生态系统作用等方面的研究。展望未来,随着技术的发展和优化,HTS将在柑橘病毒鉴定与种群多样性分析中发挥更为重要的作用,为柑橘产业的可持续发展提供坚实的支撑。综述了HTS技术在柑橘病毒检测与鉴定,以及种群多样性分析方面的最新进展,并深入探讨了当前面临的挑战、未来的发展前景及其意义。 展开更多
关键词 柑橘 高通量技术 柑橘病毒 种群多样性分析
在线阅读 下载PDF
基于MiSeq高通量测序技术机制与脚踩高温大曲真菌菌群的对比分析
12
作者 葛东颖 蔡文超 +4 位作者 余培荣 陈炜 单春会 王玉荣 郭壮 《食品与发酵工业》 北大核心 2025年第14期313-319,共7页
该研究以机制和脚踩高温大曲为研究对象,采用高通量测序技术对其蕴含的真菌菌群进行了对比分析。通过α多样性分析可知,与脚踩曲相比,机制曲所蕴含真菌菌群的丰富度和多样性均非常显著偏低(P<0.01);通过置换多因素方差分析可知,两类... 该研究以机制和脚踩高温大曲为研究对象,采用高通量测序技术对其蕴含的真菌菌群进行了对比分析。通过α多样性分析可知,与脚踩曲相比,机制曲所蕴含真菌菌群的丰富度和多样性均非常显著偏低(P<0.01);通过置换多因素方差分析可知,两类高温大曲样品真菌菌群的构成均存在非常显著差异(P<0.01);通过对真菌菌群进行解析可知,机制曲中酵母共生菌属(Symbiotaphrina)、干霉菌属(Xeromyces)和丝衣霉属(Byssochlamys)的含量显著偏高(P<0.05),它们在机制曲中相对含量分别为9.51%、3.52%和0.90%,在脚踩曲中相对含量分别为0.02%、0.02%和0.00%;而脚踩曲中罗森氏菌属(Rasamsonia)和嗜热子囊菌属(Thermoascus)的含量显著偏高(P<0.05),它们在机制曲中相对含量分别为0.01%和5.67%,在脚踩曲中相对含量分别为1.47%和27.82%;通过操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)分析可知,有1569和3727个OTU分别只在机制曲或脚踩曲真菌菌群中存在,分别仅占总序列数的0.86%和1.58%,而有8305个OTU同时存在于两类高温大曲的若干个样品中,占总序列数的97.56%。通过共现网络分析可知,机制曲和脚踩曲共现网络的平均度分别为4.034和2.718。由此可见,机制曲和脚踩曲中真菌的菌群结构和菌属间的作用关系均存在差异,但菌群的差异主要体现在含量较低的物种上,同时较之脚踩曲,机制曲中真菌属间的稳定性更高。 展开更多
关键词 机制曲 脚踩曲 真菌菌群 Illumina MiSeq高通量
在线阅读 下载PDF
中重度宫腔粘连患者生殖道微生态高通量测序分析
13
作者 陈明倩 刘宝 +1 位作者 池余刚 杨晓煜 《实用妇产科杂志》 北大核心 2025年第1期77-82,共6页
目的:探讨中重度宫腔粘连(IUA)患者与正常宫腔的不孕患者生殖道微生态差异及其临床意义。方法:收集2022年6月1日至2022年9月12日15例经宫腔镜证实为中重度IUA患者(A组),15例因原发不孕行门诊宫腔镜检查排除宫内疾病患者(B组)进行研究。... 目的:探讨中重度宫腔粘连(IUA)患者与正常宫腔的不孕患者生殖道微生态差异及其临床意义。方法:收集2022年6月1日至2022年9月12日15例经宫腔镜证实为中重度IUA患者(A组),15例因原发不孕行门诊宫腔镜检查排除宫内疾病患者(B组)进行研究。分别采取阴道、子宫颈、宫腔的分泌物进行高通量测序。结果:两组患者宫腔内微生物α多样性差异无统计学意义(P>0.05),但A组宫腔微生物α多样性明显高于子宫颈微生物(P=0.036)。在菌属水平,两组相对丰度前10位相同。在菌种水平,A组相对B组惰性乳杆菌丰度明显降低(P=0.001)。A组阴道、子宫颈、宫腔微生物门、属及种水平的丰度差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:IUA患者与不孕女性的子宫内膜微生物类别大致相同,但构成存在差异。IUA患者生殖道微生物群多样性存在差异,宫腔内微生物多样性更高,提示IUA发病可能与子宫内膜菌群改变有关,微生物多样性增加,微生物种类复杂,尤其是乳杆菌种的微生态失调,不利于子宫内膜损伤后修复。 展开更多
关键词 宫腔粘连 生殖道微生态 子宫内膜菌群 高通量
在线阅读 下载PDF
基于Illumina Miseq高通量测序分析贵州韭菜红酸汤微生物菌群多样性
14
作者 周罗娜 刘辉 +4 位作者 王梅 陆邦富 李俊 刘军林 陈中爱 《中国酿造》 北大核心 2025年第3期87-92,共6页
该研究采用Illumina miseq高通量测序技术对红酸汤和韭菜红酸汤微生物菌群多样性及群落结构进行分析。结果表明,韭菜红酸汤样品的细菌菌群相对丰度高于红酸汤样品,多样性低于红酸汤样品;真菌菌群则相反。两种红酸汤样品的微生物群落存... 该研究采用Illumina miseq高通量测序技术对红酸汤和韭菜红酸汤微生物菌群多样性及群落结构进行分析。结果表明,韭菜红酸汤样品的细菌菌群相对丰度高于红酸汤样品,多样性低于红酸汤样品;真菌菌群则相反。两种红酸汤样品的微生物群落存在一定的差异,差异主要体现在相对丰度上。从红酸汤样品中共注释到8个细菌门、4个真菌门,从韭菜红酸汤样品中共注释到18个细菌门、3个真菌门,优势细菌门(相对丰度>1%)均为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、蓝菌门(Cyanobacteria),优势真菌门均为子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)。从红酸汤样品中共注释到43个细菌属、25个真菌属,从韭菜红酸汤样品中共注释到103个细菌属、18个真菌属,优势细菌属(相对丰度>1%)均为乳酸杆菌属(Lactobacillus)、迟缓乳杆菌属(Lentilactobacillus)、片球菌属(Pediococcus)、小坂菌属(Kosakonia)、乳酪杆菌属(Lacticaseibacillus)、Lactiplantibacillus;优势真菌属均为酵母属(Saccharomyces)、糙缘腺革菌属(Amphinema)、毕赤酵母属(Pichia)、Ascomycota_gen_Incertae_sedis、Tetracladium、哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)。 展开更多
关键词 高通量 红酸汤 韭菜红酸汤 微生物多样性
在线阅读 下载PDF
高通量测序技术在骨关节结核诊疗中的研究进展
15
作者 徐子安 浦飞飞 +1 位作者 冯晶 夏平 《中国防痨杂志》 北大核心 2025年第2期224-230,共7页
骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通... 骨关节结核约占肺外结核的10%,传统的诊断方法如分枝杆菌培养和免疫学检测存在敏感度低、误诊率和漏诊率高等问题。GeneXpert MTB/RIF在骨关节结核的诊断中具有重要作用,但存在无法检测其他病原菌、肺外结核检测敏感度有限等不足。高通量测序技术不仅提供了快速和精确的病原体检测方法,还在骨关节结核治疗指导和耐药性检测方面显示出巨大的潜力。作者就高通量测序技术在骨关节结核中的应用进行综述,以期为该疾病的诊断和治疗提供参考。 展开更多
关键词 结核 骨关节 高通量技术 药物耐受性
在线阅读 下载PDF
基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析高温大曲发酵过程中真菌群落结构演替规律
16
作者 李娜 崔梦君 +4 位作者 倪慧 田龙新 叶明波 郭壮 侯强川 《中国酿造》 北大核心 2025年第5期169-174,共6页
该研究利用Illumina Mi Seq测序技术研究高温大曲发酵过程中真菌群落的演替规律。α多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落的丰富度和多样性均呈先上升后下降的趋势,在第二次翻曲时,发现物种数(369.16)和辛普森指数(0.75)均达... 该研究利用Illumina Mi Seq测序技术研究高温大曲发酵过程中真菌群落的演替规律。α多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落的丰富度和多样性均呈先上升后下降的趋势,在第二次翻曲时,发现物种数(369.16)和辛普森指数(0.75)均达到最大,且极显著高于拆曲出库时(P<0.01);优势真菌属包括嗜热子囊菌属(Thermoascus)、嗜热真菌属(Thermomyces)、曲霉属(Aspergillus)、罗萨氏菌属(Rasamsonia)和丝衣霉菌属(Byssochlamys)。β多样性分析结果表明,高温大曲发酵过程中真菌群落结构发生了较大变化。线性判别分析效应值大小(LEfSe)分析结果表明,不同发酵阶段呈现出特征性优势菌,Phialosimplex、Thermoascus和Thermomyces可分别为第一次翻曲、第二次翻曲和拆曲出库阶段的生物标志物。相关性分析结果表明,真菌群落结构的变化可能与菌群间的互作关系密切相关。该研究结果为后续优化大曲发酵过程和提高产品品质奠定了基础。 展开更多
关键词 高温大曲 发酵过程 高通量技术 真菌群落结构 群落演替
在线阅读 下载PDF
肺泡灌洗液高通量测序病原检测在儿童血液肿瘤中的应用价值
17
作者 吴彬 汪洁 +2 位作者 张兰男 唐威 陈开澜 《中国实验血液学杂志》 北大核心 2025年第2期569-574,共6页
目的:探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组高通量测序(mNGS)病原学检测在儿童血液肿瘤肺炎患者中的临床应用价值。方法:回顾性分析本院因肺炎行BALF mNGS病原检测的血液肿瘤患儿的临床资料。所有患儿均接受了肺泡灌洗液mNGS检测以及传... 目的:探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)宏基因组高通量测序(mNGS)病原学检测在儿童血液肿瘤肺炎患者中的临床应用价值。方法:回顾性分析本院因肺炎行BALF mNGS病原检测的血液肿瘤患儿的临床资料。所有患儿均接受了肺泡灌洗液mNGS检测以及传统方法检测(包括痰培养、肺泡灌洗液培养、血培养、病原血清学检测等)。通过对mNGS及传统方法检测结果的分析,比较不同检测方法的阳性率、病原学分布等指标。结果:26例血液肿瘤患儿纳入研究,其中男12例,女14例,中位年龄4.9(1.8-14.9)岁,共进行35例次支气管肺泡灌洗术(BAL)。BALF mNGS共检出病原微生物17种,最常检出的细菌、病毒和真菌分别为肺炎链球菌、巨细胞病毒和耶氏肺孢子菌。BALF mNGS检出细菌9例次、病毒10例次、真菌3例次、支原体2例次、混合感染8例次,其检测的阳性率为91.43%,显著高于传统方法检测(20%,P<0.001)。共有25例次根据BALF mNGS结果进行抗感染方案调整。结论:BALF mNGS技术的应用能够提高血液肿瘤患儿肺部感染病原的检出率,初步揭示了该群体肺部感染病原谱,能够有效指导临床用药,提高治疗效果。 展开更多
关键词 儿童 血液肿瘤 肺泡灌洗液 宏基因组高通量
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序的枇杷花药微生物多样性研究
18
作者 高枫 邓国翠 +2 位作者 张伍 张野驰 龚燕兵 《植物科学学报》 北大核心 2025年第1期32-40,共9页
果树具有较高的经济价值,并大多依赖传粉者实现繁殖成功以保证产量。花药微生物能影响植物的花粉活力,其组成也可能受到传粉者访问的影响;理解花药微生物的多样性和群落构建模式对于提高果树的繁殖适合度具有潜在意义,但目前相关研究仍... 果树具有较高的经济价值,并大多依赖传粉者实现繁殖成功以保证产量。花药微生物能影响植物的花粉活力,其组成也可能受到传粉者访问的影响;理解花药微生物的多样性和群落构建模式对于提高果树的繁殖适合度具有潜在意义,但目前相关研究仍相对缺乏。本研究基于高通量测序技术分析了传粉者访问前(套袋组)与访问后(访问组)枇杷(Eriobotrya japonica(Thunb.)Lindl.)花药中真菌与细菌的组成及差异。结果显示,传粉者访问未显著改变花药微生物的多样性及组成,套袋组中优势真菌科为枝孢菌科与球腔菌科,访问组优势真菌科则为枝孢菌科与梅奇酵母科。此外,两组中优势细菌科均为产碱杆菌科与欧文菌科。研究结果表明,枇杷花药微生物具有相对稳定的群落结构,传粉者不是驱动花药微生物群落构建的主要因素。 展开更多
关键词 传粉者访问 花药微生物 高通量技术 微生物组成
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序的城市绿地土壤微生物多样性评价
19
作者 石兴宇 杨新建 +2 位作者 田璐 王伟青 张阳 《现代园艺》 2025年第10期172-174,共3页
基于城市绿地中土壤微生物多样性的重要性及其面临的挑战,探讨了高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用,分析了其在揭示土壤微生物群落结构与功能中的潜力。以期为城市绿地土壤管理提供参考。
关键词 高通量 城市绿地 土壤微生物多样性 生态功能
在线阅读 下载PDF
基于高通量测序技术分析藏药浴发酵酒曲微生物群落结构及多样性
20
作者 栗果 禄玉冰 +4 位作者 樊伊琳 赵有玺 段辉琴 张元 薛蓓 《高原农业》 2025年第2期211-222,共12页
本研究利用高通量测序技术对藏药浴发酵酒曲微生物群落结构组成及优势菌群的相对丰度进行研究和分析。结果表明,在属分类水平上,9组藏药浴发酵酒曲样品的细菌属富含丰富的微生物类群,而真菌属微生物群落丰富度较小。所有样品组共有的优... 本研究利用高通量测序技术对藏药浴发酵酒曲微生物群落结构组成及优势菌群的相对丰度进行研究和分析。结果表明,在属分类水平上,9组藏药浴发酵酒曲样品的细菌属富含丰富的微生物类群,而真菌属微生物群落丰富度较小。所有样品组共有的优势细菌门为变形菌门和厚壁菌门,优势菌属为醋杆菌属、明串珠菌属等;优势真菌门为子囊菌门,优势菌属为覆膜孢酵母属。结论:西藏同一地区藏药浴发酵酒曲中的微生物群落构成存在差异,且相同菌门的相对丰度也有显著差异。本研究全面分析了藏药浴发酵酒曲中各类优势菌群和微生物群落结构比例,对推动西藏地区民族特色藏药浴酒曲品质和产业化发展提供了理论参考。 展开更多
关键词 藏药浴发酵酒曲 高通量 群落结构 微生物多样性
在线阅读 下载PDF
上一页 1 2 180 下一页 到第
使用帮助 返回顶部