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颈动脉支架植入术后血清长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因水平及临床意义 被引量:3
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作者 李爽 王建民 胡沛霖 《介入放射学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第7期707-710,共4页
目的探讨颈动脉支架植入术后血清长链非编码RNA(LncRNA)结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)水平及临床意义。方法选取2018年1月至2019年6月在邢台市人民医院接受颈动脉支架植入术治疗的173例颈动脉狭窄性急性缺血性脑卒中(AIS)患者作为研究... 目的探讨颈动脉支架植入术后血清长链非编码RNA(LncRNA)结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)水平及临床意义。方法选取2018年1月至2019年6月在邢台市人民医院接受颈动脉支架植入术治疗的173例颈动脉狭窄性急性缺血性脑卒中(AIS)患者作为研究对象。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)法检测患者血清LncRNA CRNDE相对表达量,并分析其与预后的关系。结果173例颈动脉狭窄性AIS患者支架植入术后预后不良发生率为39.88%(69/173)。预后不良组患者血清LncRNA CRNDE相对表达量为(1.35±0.34)%,显著高于预后良好组[(0.93±0.19)%](P<0.001)。Logistic回归分析显示,出血转化、脑卒中病灶数、LncRNA CRNDE与颈动脉狭窄性AIS患者预后关系密切。模型B(出血转化+脑卒中病灶数+LncRNA CRNDE)评估颈动脉狭窄性AIS患者预后的效能,高于LncRNA CRNDE、模型A(出血转化+脑卒中病灶数)(Z=2.603,P=0.009;Z=2.945,P=0.003)。结论LncRNA CRNDE与颈动脉狭窄性AIS患者支架植入术后预后关系密切,检测血清LncRNA CRNDE表达有助于评估患者预后。 展开更多
关键词 颈动脉支架植入术 长链非编码rna结直肠肿瘤差异表达基因 预后
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长链非编码RNA MALAT1调控Rac1b表达与结直肠癌侵袭和转移的关系 被引量:8
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作者 杨孜欢 冯杏芝 +2 位作者 方乐堃 黄丹丹 汪建平 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1417-1421,共5页
目的:探讨MALAT1调控Rac1b的表达与结直肠癌侵袭和转移的关系。方法:结直肠癌患者组织样本手术切除后30 min内于-80℃保存;实时荧光定量PCR检测肿瘤组织和配对正常组织中MALAT1和Rac1b mRNA的表达;RNA干扰沉默结直肠癌细胞MALAT1表达,通... 目的:探讨MALAT1调控Rac1b的表达与结直肠癌侵袭和转移的关系。方法:结直肠癌患者组织样本手术切除后30 min内于-80℃保存;实时荧光定量PCR检测肿瘤组织和配对正常组织中MALAT1和Rac1b mRNA的表达;RNA干扰沉默结直肠癌细胞MALAT1表达,通过Western blot检测Rac1b和上皮间质化标志物的表达,Ed U实验检测其对细胞增殖的影响;Transwell小室实验检测MALAT1低表达后对细胞迁移和侵袭的影响。结果:MALAT1在结直肠癌中低表达;干扰MALAT1表达后,Rac1b的表达升高,细胞增殖加快,且上皮间质化标志物E-cadherin和β-catenin表达升高。干扰MALAT1的表达可明显促进结直肠癌侵袭和细胞的迁移和侵袭。结论:MALAT1低表达与结直肠癌侵袭和转移密切相关,并且这一相关性是通过调控Rac1b的表达实现的。 展开更多
关键词 编码rna 肺腺癌转移相关转录本1 直肠 肿瘤转移 Rac1b
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长链非编码RNA母系表达基因3对结直肠癌细胞侵袭和迁移能力的影响 被引量:19
3
作者 朱栋良 尹小平 王芳元 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期296-300,共5页
目的:检测长链非编码RNA母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)在结直肠癌细胞中的表达,并观察过表达MEG3对结直肠癌细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:检测人正常结肠细胞NCM460及结直肠癌细胞SW48、Lo Vo中MEG3的水平,在SW4... 目的:检测长链非编码RNA母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)在结直肠癌细胞中的表达,并观察过表达MEG3对结直肠癌细胞侵袭和迁移能力的影响。方法:检测人正常结肠细胞NCM460及结直肠癌细胞SW48、Lo Vo中MEG3的水平,在SW48细胞和Lo Vo细胞中转染MEG3过表达质粒,利用Transwell小室及划痕实验观察过表达MEG3对细胞侵袭和迁移能力的影响,通过Western blotting检测基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinase,MMP)家族相关蛋白的变化。结果:结直肠癌细胞SW48和Lo Vo中MEG3的水平明显低于人正常结肠细胞NCM460;在SW48和Lo Vo细胞中过表达MEG3后能够明显抑制细胞的侵袭和迁移能力;Transwell侵袭实验和迁移实验显示MEG3表达组SW48细胞的穿膜数及Lo Vo细胞的穿膜数与对照组比较明显减少。划痕实验中过表达MEG3后细胞间距较对照组明显增大,提示细胞运动能力减弱。同时过表达MEG3可明显降低细胞中MMP-2及MMP-9的表达,增高金属蛋白酶组织抑制物2(tissue inhibitor of metalloproteinase-2,TIMP-2)的表达。结论:结直肠癌细胞中MEG3水平较正常结直肠细胞明显降低;在结直肠癌中过表达MEG3可抑制细胞的侵袭、迁移运动能力,并且可能通过影响TIMP-2、MMP-2及MMP-9的表达发挥上述功能。 展开更多
关键词 编码rna 母系表达基因3 直肠肿瘤 肿瘤侵袭 细胞迁移 基质金属蛋白酶
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长链非编码RNA在结肠癌组织与癌旁组织中的表达研究 被引量:14
4
作者 王婧 孙妍 +2 位作者 廖昆玲 谭华根 李远奇 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期75-80,共6页
目的:筛选出结肠癌差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),并分析其在结肠癌组织和相应癌旁组织中的差异表达情况。方法:从lncRNAtor数据库下载结肠癌组织中差异表达的lncRNA数据(Colon adenocarcinoma:Person neoplasm cancer status),包含3... 目的:筛选出结肠癌差异表达的长链非编码RNA(lncRNA),并分析其在结肠癌组织和相应癌旁组织中的差异表达情况。方法:从lncRNAtor数据库下载结肠癌组织中差异表达的lncRNA数据(Colon adenocarcinoma:Person neoplasm cancer status),包含36例结肠癌组织及29例正常结肠组织,以P<0.01且差异表达倍数大于2或小于0.5的条件筛选出lncRNA,并用real-time PCR进一步验证其在60对结肠癌组织及癌旁组织中的表达情况。结果:分析结肠癌lncRNA数据发现,与正常组织相比,结肠癌组织共有50个lncRNA差异表达,其中28个高表达,22个低表达(P<0.01)。筛选的4个lncRNA在60对结肠癌及癌旁组织标本中的验证结果为:HNF1AAS1和ZDHHC8P1的表达均上调(P<0.01),SUZ12P表达下调(P<0.05)。临床Ⅰ-Ⅱ期结肠癌组织中HNF1AAS1的表达水平明显低于Ⅲ-Ⅳ期(P<0.05),ROC曲线分析显示,HNF1A-AS1、ZDHHC8P1和SUZ12P诊断结肠癌的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.729(敏感性为78%,特异性为67%)、0.617(敏感性为68%,特异性为55%)和0.689(敏感性为65%,特异性为55%)。结论:长链非编码HNF1A-AS1和ZDHHC8P1在结直肠癌组织中表达上调,SUZ12P在结直肠癌组织中表达下调,其表达水平可能与结肠癌的发生存在关联。 展开更多
关键词 编码rna 肠癌 差异表达
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长链非编码RNA在结直肠癌中的作用 被引量:14
5
作者 孙跃胜 屈强 +3 位作者 潘江华 童晓春 陈恩德 屈健 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2017年第2期222-227,共6页
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)是一类长度大于200个核苷酸,不被翻译成蛋白但起着重要调控作用的RNA。近期的研究显示lncRNA在肿瘤的发生发展、转移侵袭、早期诊断、预后评价、放化疗疗效等方面起着重要作用。结直肠癌是... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)是一类长度大于200个核苷酸,不被翻译成蛋白但起着重要调控作用的RNA。近期的研究显示lncRNA在肿瘤的发生发展、转移侵袭、早期诊断、预后评价、放化疗疗效等方面起着重要作用。结直肠癌是一种常见的消化道肿瘤,其发病率和死亡率高。目前lncRNA对结直肠癌的发生发展及放化疗疗效等方面的研究取得一定进展。本文就此方面的国际最新研究进展作一综述。 展开更多
关键词 直肠 编码rna 肿瘤
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长链非编码RNA在结直肠癌中的研究进展 被引量:14
6
作者 林洋 许利剑 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2016年第5期556-560,共5页
长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是指一类转录本长度大于200核苷但不具有蛋白质编码功能的长链RNA分子,其种类繁多,结构各异,在染色体修饰、转录及转录后、表观遗传等多种层面上调控相关基因的表达,广泛参与机体生理和病理... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是指一类转录本长度大于200核苷但不具有蛋白质编码功能的长链RNA分子,其种类繁多,结构各异,在染色体修饰、转录及转录后、表观遗传等多种层面上调控相关基因的表达,广泛参与机体生理和病理过程。近年来大量研究发现,LncRNA的异常表达与肿瘤的发生发展、侵袭、转移等过程密切相关。在结直肠癌中,LncRNA的异常表达亦扮演着重要角色。文中就LncRNA在结直肠癌中的作用进行综述,为其在临床研究结直肠癌的诊断和治疗应用中提供理论依据。 展开更多
关键词 编码rna 直肠 表达水平
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长链非编码RNA在结直肠癌中的研究进展 被引量:19
7
作者 何祖坤 苏丹 +1 位作者 珏宁君 白松 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第4期665-668,共4页
长链非编码RNA(lnc RNA)是长度超过200 nt的序列,是RNA聚合酶Ⅱ的转录物,其基因片段缺少开放阅读框,不能编码蛋白质。但是广泛参与表观遗传转录和转录后水平的基因表达网络的调节,近年来发现其在多种肿瘤中异常表达,影响肿瘤的预后和转... 长链非编码RNA(lnc RNA)是长度超过200 nt的序列,是RNA聚合酶Ⅱ的转录物,其基因片段缺少开放阅读框,不能编码蛋白质。但是广泛参与表观遗传转录和转录后水平的基因表达网络的调节,近年来发现其在多种肿瘤中异常表达,影响肿瘤的预后和转归。其中一部分lnc RNA在肿瘤组织中异常表达可以在人体体液中检测到,具有较高的特异性和灵敏度,因此有望成为结直肠癌诊断和预后的新型潜在生物标志物及治疗靶点。 展开更多
关键词 编码rna 直肠 基因表达调控
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长链非编码RNA在肿瘤中的研究进展 被引量:4
8
作者 何冬梅 吴红 +1 位作者 高杨军 胡小毛 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期121-126,共6页
长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt(核苷酸)的非编码RNA分子,可在遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因的表达,广泛参与机体的生理和病理过程,在恶性肿瘤的发生和发展中起着重要作用。本文简单综述了几个与肿瘤密切... 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt(核苷酸)的非编码RNA分子,可在遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因的表达,广泛参与机体的生理和病理过程,在恶性肿瘤的发生和发展中起着重要作用。本文简单综述了几个与肿瘤密切相关的长链非编码RNA的研究进展。 展开更多
关键词 编码rna 基因表达 基因调控 肿瘤
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长链非编码RNA CRNDE通过下调miR-136-5p表达并上调MCM5表达促进U937细胞增殖并抑制其凋亡 被引量:1
9
作者 刘晨 刘北忠 +8 位作者 沈陈兰 楚璇 罗栩 余莉华 叶娇 熊玲 但文冉 李健 钟梁 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期987-995,共9页
目的 探究长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)对U937细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响及其作用机制。方法 首先通过基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析CRNDE在急性髓系白血病(AML)患者骨髓细胞中的表达水平;实时荧光定量PCR检... 目的 探究长链非编码RNA结直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE)对U937细胞增殖、凋亡和细胞周期的影响及其作用机制。方法 首先通过基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析CRNDE在急性髓系白血病(AML)患者骨髓细胞中的表达水平;实时荧光定量PCR检测AML细胞系miR-136-5p、 CRNDE及微小染色体维持蛋白5(MCM5)的mRNA表达水平。构建敲低CRNDE的慢病毒载体并转染U937细胞,设为敲低CRNDE组(sh-CRNDE组)和阴性对照组(sh-NC组);分别转染miR-136-5p模拟物(miR-136-5p mimic)和miR-136-5p抑制物(miR-136-5p inhibitor)对U937细胞中的miR-136-5p进行过表达和敲低,设为miR-136-5p过表达组(miR-136-5p-mimic)、过表达阴性对照组(NC-mimic)、 miR-136-5p敲低组(miR-136-5p-inhibitor)和敲低阴性对照组(NC-inhibitor)。CCK-8法和细胞计数试验检测CRNDE和miR-136-5p对细胞增殖的影响,流式细胞术检测CRNDE和miR-136-5p对细胞周期和凋亡的影响。实时荧光定量PCR检测miR-136-5p、 CRNDE及MCM5的mRNA表达,Western blot法检测MCM5、 P53、 B细胞淋巴瘤因子2(Bcl2)、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)和细胞周期蛋白A2(cyclin A2)的蛋白表达水平。结果 CRNDE在AML患者骨髓和细胞系中高表达。敲低CRNDE可以上调miR-136-5p,抑制MCM5 mRNA和蛋白表达,抑制细胞增殖,促进凋亡并使细胞周期阻滞在G1期。过表达miR-136-5p也可抑制MCM5核酸和蛋白水平表达。而敲低miR-136-5p则可以逆转以上作用。结论 CRNDE通过下调miR-136-5p和上调MCM5表达,进而促进U937细胞增殖并抑制其凋亡。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 编码rna(lncrna) 直肠肿瘤差异表达基因(CRNDE) miR-136-5p 微小染色体维持蛋白5(MCM5)
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长链非编码RNA在泌尿系统肿瘤中的研究进展 被引量:1
10
作者 朱一平(综述) 叶定伟(审校) 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期117-120,共4页
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个的核苷酸,并不具备编码蛋白质功能的基因转录产物。它最初被认为是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,并不具有任何生物学功能。但最近的研究表明,lnc RNA可以在多个层面参与人体... 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度大于200个的核苷酸,并不具备编码蛋白质功能的基因转录产物。它最初被认为是RNA聚合酶Ⅱ转录的副产物,并不具有任何生物学功能。但最近的研究表明,lnc RNA可以在多个层面参与人体内多种重要的调控过程,并且与肿瘤的发生、发展及预后密切相关。本研究对在泌尿系统肿瘤中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 编码rna 泌尿系统肿瘤 基因表达
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长链非编码RNA MIAT与肿瘤关系的研究进展 被引量:5
11
作者 孙程 黄立宁 +3 位作者 李景林 李正龙 姜兴明 崔云甫 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第8期124-128,共5页
长链非编码RNAs是人类正常功能活动的调节因子,也是不同肿瘤发展过程的控制因子。研究表明,lncRNAs的失调涉及细胞的不同行为,包括增殖,凋亡,迁移,侵袭和上皮间质转化等。作为明星分子的lncRNA之一,MIAT的异常表达存在于不同的肿瘤中,... 长链非编码RNAs是人类正常功能活动的调节因子,也是不同肿瘤发展过程的控制因子。研究表明,lncRNAs的失调涉及细胞的不同行为,包括增殖,凋亡,迁移,侵袭和上皮间质转化等。作为明星分子的lncRNA之一,MIAT的异常表达存在于不同的肿瘤中,包括肺癌、乳腺癌、胃癌、肝癌和前列腺癌等。MIAT是一种新型肿瘤相关lncRNA,其临床应用的潜在价值巨大,有望成为新的肿瘤生物标志物和治疗靶点。本文总结了目前关于MIAT在肿瘤发生发展过程中的生物功能和相关机制。 展开更多
关键词 编码rna MIAT 肿瘤 基因 表达调控
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长链非编码RNAs在肿瘤中研究进展 被引量:6
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作者 施雪霏 宋勇 《医学研究生学报》 CAS 北大核心 2013年第9期997-1000,共4页
人类基因组中存在大量的非编码RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs),其中转录本大于200nt的ncRNAs称之为长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)。越来越多的研究显示,lncRNAs可在染色体重塑、转录和转录后水平调控基因的表达,参与细... 人类基因组中存在大量的非编码RNAs(non-coding RNAs,ncRNAs),其中转录本大于200nt的ncRNAs称之为长链非编码RNAs(long non-coding RNAs,lncRNAs)。越来越多的研究显示,lncRNAs可在染色体重塑、转录和转录后水平调控基因的表达,参与细胞多个生物学过程。它的表达或者调控异常可引起众多疾病的产生,特别是与肿瘤的发生、发展、转移密切相关。一些lncRNAs在特定的肿瘤中表达水平升高或者降低,因此lncRNAs不仅可以作为肿瘤诊断、预后的标志物,还可作为新的特异性治疗靶点,文中就lncRNAs在肿瘤中的研究进展作一综述。 展开更多
关键词 编码rnas 肿瘤 基因表达
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转移性喉鳞状细胞癌组织中长链非编码RNA的筛选及鉴定 被引量:1
13
作者 蒋新霞 池伟伟 +2 位作者 曹欢 杨建旺 王宝山 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期163-169,共7页
目的:应用高通量基因芯片技术进行转移性喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的筛选及鉴定,寻找有价值的LSCC相关候选基因和分子标志物。方法:4例LSCC组织标本均... 目的:应用高通量基因芯片技术进行转移性喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中差异表达长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)的筛选及鉴定,寻找有价值的LSCC相关候选基因和分子标志物。方法:4例LSCC组织标本均来自河北医科大学耳鼻咽喉头颈外科生物样本库,病理证实为淋巴结转移的LSCC组织及癌旁黏膜组织。提取标本组织总RNA后,应用SBC-lncRNA基因芯片检测差异表达的lncRNA及mRNA,采用差异倍数以及Student's t法对差异表达基因进行筛选,将差异倍数(linear)≤0.5或者≥2.0和P<0.05判断为差异表达基因。选取特定的差异表达lncRNA,应用qRTPCR技术验证芯片结果的可靠性。结果:通过对转移性LSCC组织和癌旁组织的lncRNA表达谱分析显示,转移性LSCC组织与癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,差异表达的lncRNA 3 073个,其中癌组织中表达上调1 967个、下调1 106个;差异表达的mRNA 2 809个,其中癌组织中表达上调1 791个、下调1 018个。差异表达的lncRNA主要参与细胞增殖、凋亡及免疫应答等生物学过程,涉及细胞因子及其受体的相互作用、趋化因子信号通路、细胞周期调节、P53信号通路等。选取其中10条具有显著差异表达的lncRNA,在25例LSCC标本组织中进行qRT-PCR验证,发现表达趋势与芯片检测结果一致。结论:转移性LSCC组织及癌旁组织的lncRNA表达谱存在明显差异,深入分析这些差异表达lncRNA的分子作用机制对阐明转移性LSCC的侵袭转移机制有重要的意义,可为LSCC特异性肿瘤标志物的筛选及有效的靶向治疗提供实验依据。 展开更多
关键词 转移性喉鳞状细胞癌 编码rna 差异表达 基因芯片
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长链非编码RNA与肺癌 被引量:3
14
作者 陈杰 朱成杰 +2 位作者 商艳 白冲 李强 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1115-1120,共6页
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,其数量众多,但缺少蛋白质编码功能。研究发现,lncRNA能在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因的表达,在各类生物过程中起着重要的调节作用... 长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA分子,其数量众多,但缺少蛋白质编码功能。研究发现,lncRNA能在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因的表达,在各类生物过程中起着重要的调节作用,并与多种疾病相关,已经成为现代遗传学的研究热点。近期研究证据显示,肺癌中有多种lncRNA的表达水平发生了变化,并在肺癌的发生、发展及预后中起着重要的调控作用。本文就lncRNA的定义、功能机制及与肺癌的相关性研究作一综述。 展开更多
关键词 编码rna 肿瘤 基因表达调控
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LncRNA MEG8通过靶向miR-15a-5p调控MICA/B介导结直肠癌细胞免疫逃逸
15
作者 李鸷 吴迪 +2 位作者 田飞 刘洁 谢兴明 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1217-1221,1127,共6页
目的:探究长链非编码RNA母系表达基因8(LncRNA MEG8)通过靶向miR-15a-5p调控MHCⅠ类相关蛋白A/B(MICA/B)介导的结直肠癌(CRC)细胞免疫逃逸机制。方法:RT-qPCR、Western blot检测CRC组织和细胞系MEG8、miR-15a-5p、MICA、MICB、NKG2D蛋... 目的:探究长链非编码RNA母系表达基因8(LncRNA MEG8)通过靶向miR-15a-5p调控MHCⅠ类相关蛋白A/B(MICA/B)介导的结直肠癌(CRC)细胞免疫逃逸机制。方法:RT-qPCR、Western blot检测CRC组织和细胞系MEG8、miR-15a-5p、MICA、MICB、NKG2D蛋白水平;双荧光素酶实验验证MEG8对miR-15a-5p的调控关系;采用脂质体转染法将NC、MEG8、miR-NC、miR-15a-5p分别或共转染至SW480、SW620细胞,记为NC组、MEG8组、MEG8+miR-NC组、MEG8+miR-15a-5p组;将NK细胞分别与SW480、SW620细胞共培养;ELISA检测共培养液中TNF-α、IFN-γ水平;CCK-8、EdU染色、Transwell实验检测细胞增殖、迁移和侵袭能力;RT-qPCR、Western blot检测细胞MEG8、miR-15a-5p、MICA、MICB、NKG2D蛋白水平。结果:与癌旁组织或正常结肠上皮细胞相比,CRC组织和细胞系中MEG8、MICA、MICB、NKG2D mRNA和蛋白水平降低,miR-15a-5p水平升高(P<0.05)。MEG8靶向调控miR-15a-5p。共培养体系中,与NC组相比,MEG8组细胞MICA、MICB、NKG2D蛋白水平、共培养上清液中TNF-α、IFN-γ水平明显升高,培养1 d、2 d、3 d后,OD值、EdU阳性率、迁移和侵袭细胞数明显降低(P<0.05);过表达miR-15a-5p能部分逆转过表达MEG8对细胞MICA、MICB、NKG2D、TNF-α、IFN-γ水平和增殖、侵袭转移能力的影响(P<0.05)。结论:MEG8通过靶向miR-15a-5p调控MICA、MICB表达,促进NK细胞活性,抑制CRC细胞免疫逃逸。 展开更多
关键词 编码rna母系表达基因8 miR-15a-5p 直肠 免疫逃逸 MHCⅠ类相关蛋白A/B
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LncRNA SNHG5/miR-26a-5p/MTDH信号轴促进结直肠癌转移的机制研究 被引量:3
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作者 冶俊玲 郑小影 +4 位作者 郭新建 陈瑞慧 杨柳 苟笑丹 蒋汉梅 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期673-685,共13页
背景与目的:长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因5(long non-coding RNA small nucleolar RNA host gene 5,lncRNA SNHG5)在多种癌症中发挥促癌作用,但其对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的影响和调节机制尚不清楚。本研究旨在探究lncRNA ... 背景与目的:长链非编码RNA小核仁RNA宿主基因5(long non-coding RNA small nucleolar RNA host gene 5,lncRNA SNHG5)在多种癌症中发挥促癌作用,但其对结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的影响和调节机制尚不清楚。本研究旨在探究lncRNA SNHG5/miR-26a-5p/异粘蛋白(metadherin,MTDH)信号轴促进CRC转移的机制。方法:分析癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中的数据,探索CRC中异常表达的lncRNA并进行生存分析。收集2020年10月—2021年10月经手术切除的100例CRC、癌旁组织样本及患者的完整临床资料,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)检测lncRNA SNHG5、miR-26a-5p表达水平,采用免疫组织化学法检测MTDH的表达水平,分析lncRNA SNHG5在CRC中的相对表达水平与临床病理学特征及生存期的关系。通过细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)检测、克隆形成、划痕、transwell实验及体内异种移植实验检测lncRNA SNHG5对CRC细胞增殖、迁移及侵袭的影响,通过蛋白质印迹法(Western blot)和免疫组织化学检测CRC细胞转移、上皮-间充质转化相关分子表达水平与lncRNA SNHG5表达水平的关系。通过RNA下拉实验、双荧光素酶报告基因检测、RNA免疫共沉淀实验探究SNHG5与miR-26a-5p、MTDH与miR-26a-5p在物理上的相互作用,通过CCK-8、EdU、transwell实验验证三者在功能上的相互关系,采用Western blot检测分析SNHG5、miR-26a-5p、MTDH表达对迁移、侵袭相关分子的影响。结果:TCGA数据库分析结果显示,lncRNA SNHG5在CRC中显著上调。RTFQ-PCR和免疫组织化学检测结果显示,CRC组织中lncRNA SNHG5、MTDH水平显著上调(P<0.05),miR-26a-5p水平下降(P<0.05),SNHG5高表达的样本中MTDH水平也较高。浆膜及浆膜外浸润、远处转移、淋巴结转移、TNMⅢ期的CRC组织lncRNA SNHG5表达量高于浆膜下浸润、无远处转移、无淋巴结转移、TNMⅠ~Ⅱ期的组织,差异有统计学意义(P<0.05)。生存分析结果显示,lncRNA SNHG5高表达与总生存率显著相关(P<0.05)。过表达lncRNA SNHG5能够提升CRC细胞增殖、克隆形成、迁移及侵袭能力,促进移植瘤生长和肺转移,提高Ki-67增殖指数和波形蛋白(vimentin)的相对表达水平(P<0.05),降低E钙粘蛋白(E-cadherin)的相对表达水平(P<0.05),而抑制lncRNA SNHG5表达后CRC细胞的发展受到抑制。RNA下拉实验、双荧光素酶报告基因检测、RNA免疫共沉淀实验证实SNHG5与miR-26a-5p、MTDH及miR-26a-5p存在物理上的相互作用,在lncRNA SNHG5过表达细胞中上调miR-26a-5p或下调MTDH表达可部分逆转lncRNA SNHG5对CRC细胞增殖、迁移、侵袭及相关分子表达水平的影响。结论:LncRNA SNHG5在CRC组织和细胞中表达上调,其高表达与肿瘤进展及生存不良有关,可作为miR-26a-5p的分子海绵调节MTDH表达促进SW620细胞增殖和转移。 展开更多
关键词 编码rna小核仁rna宿主基因5 miR-26a-5p 异黏蛋白 直肠 转移
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基因组不稳定相关LncRNA模型预测结肠癌患者预后和顺铂药物敏感性 被引量:1
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作者 童曈 杨阳 +1 位作者 余昌俊 方昌义 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第9期1480-1488,共9页
目的探索结肠癌基因组不稳定性相关的长链非编码RNA(LncRNA)和其预测临床预后及治疗的潜力。方法差异分析采用R包“limma”,使用单因素Cox分析和多变量Cox比例风险回归分析构建预后风险模型。预后差异采用Kaplan-Meier法评价,log-rank... 目的探索结肠癌基因组不稳定性相关的长链非编码RNA(LncRNA)和其预测临床预后及治疗的潜力。方法差异分析采用R包“limma”,使用单因素Cox分析和多变量Cox比例风险回归分析构建预后风险模型。预后差异采用Kaplan-Meier法评价,log-rank检验差异显著性。预后模型能效通过时间依赖的受试者工作特征曲线下面积(AUC)进行评价。使用R包“pRRophetic”对患者进行抗癌药物敏感性预测。使用R软件包rms建立了列线图,并计算列线图总体的一致性指数。应用实时荧光定量PCR法检测预后保护因素表达水平差异。结果共获得22个与患者预后基因组不稳定相关LncRNAs,2个为结肠癌患者预后的保护因素,20个为预后危险因素。构建了一个基因组不稳定相关LncRNAs构成的预后模型,高风险评分的患者的AUC更低,中位生存期更短。该模型预测五年生存的AUC在训练集中为0.823,在验证集中为0.722,在总体TCGA结肠癌患者中为0.759。低风险评分的患者顺铂的半数抑制浓度(IC 50)更低,敏感性更高(P<0.0001)。结肠癌组织中预后保护因素的表达显著低于结肠癌旁组织。结论构建一个由8个基因组不稳定相关LncRNAs组成的预后预测风险模型,并加以验证。此外,该模型还可以预测顺铂药物的敏感性。结合肿瘤分期(stage)和该预后模型构建一个列线图。该列线图对于结肠癌患者五年生存的预后预测能力要优于传统的组织病理学特征和前人所构建的预后模型。 展开更多
关键词 肠癌 生物信息学 肿瘤预后 基因组不稳定 编码rna
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缺血性心肌病差异表达基因的生物信息学分析
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作者 张鹏 常争艳 +2 位作者 杨磊 薛松 连锋 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第7期698-705,共8页
目的·应用生物信息学方法探讨缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)中差异表达的相关基因,构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络.方法·从基因表达数据库中下载数据集,筛选出ICM样本与正常样本差... 目的·应用生物信息学方法探讨缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)中差异表达的相关基因,构建竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络.方法·从基因表达数据库中下载数据集,筛选出ICM样本与正常样本差异表达的mRNA和长链非编码RNA(lncRNA),并进行GO(Gene Ontology)功能分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析.分析差异表达的mRNA和lncRNA,运用生物信息学方法进行miRNA预测分析,构建ceRNA调控网络.结果 ·GO功能分析和KEGG通路分析结果表明,差异表达基因在代谢途径、氧化磷酸化、细胞外基质受体相互作用等通路显著富集,并与内质网应激、纤维化、胶原的分解代谢过程、炎症反应功能密切相关.构建了ICM lncRNA相关的ceRNA调控网络,包含26个mRNA、2个lncRNA和15个miRNA.结论·采用生物信息学方法能够有效分析ICM差异表达的基因,并成功构建了缺血性心肌病ceRNA调控网络. 展开更多
关键词 缺血性心肌病 差异表达基因 编码rna 生物信息学 竞争性内源rna
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lncRNA TDRG1通过调节miR-101-3p促进结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移 被引量:4
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作者 王帅奇 孙浩 +3 位作者 张寿儒 陈利辉 陈秀峰 李卫 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期879-884,共6页
目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)睾丸发育相关基因1(TDRG1)对结直肠癌(CRC)细胞增殖、侵袭和迁移的影响,并探讨其作用机制是否与微小RNA-1010-3p(miR-101-3p)相互作用有关。方法:收集40对CRC组织及相应的癌旁组织。采用RT-qPCR方法检测T... 目的:研究长链非编码RNA(lncRNA)睾丸发育相关基因1(TDRG1)对结直肠癌(CRC)细胞增殖、侵袭和迁移的影响,并探讨其作用机制是否与微小RNA-1010-3p(miR-101-3p)相互作用有关。方法:收集40对CRC组织及相应的癌旁组织。采用RT-qPCR方法检测TDRG1和miR-101-3p在CRC组织及CRC细胞系中的表达。采用CCK-8法、集落形成实验和Transwell法评价TDRG1的体外功能。采用生物信息学和双萤光素酶报告分析方法探讨TDRG1和miR-101-3p之间关系。将shRNA和miRNA抑制剂转染CRC细胞,探讨其作用机制。结果:与匹配的癌旁组织相比,在CRC组织中观察到TDRG1的表达水平显著增加(P<0.05),而miR-101-3p的表达水平显著降低(P<0.05)。Pearson相关分析显示,CRC组织中TDRG1与miR-101-3p呈负相关(r=0.624,P<0.01)。使用萤光素酶测定法确认了miR-101-3p作为TDRG1的靶点结合。与人正常结肠细胞NCM460相比,TDRG1在CRC细胞系(HT-29、SW480和LoVo)中明显上调(P<0.05)。敲减TDRG1的表达抑制了SW480细胞的活力和集落能力(P<0.05),并且迁移和侵袭细胞数量显著减少(P<0.05),而转染miR-101-3p抑制剂可减轻敲减TDRG1表达引起的改变。结论:TDRG1通过调节miR-101-3p促进CRC细胞的增殖、侵袭和迁移,提示TDRG1可能是CRC治疗的一个潜在靶点。 展开更多
关键词 编码rna 睾丸发育相关基因1 微小rna-101-3p 直肠
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lncRNA PAX8-AS1对结直肠癌细胞增殖、凋亡和侵袭的作用及其机制
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作者 闫圣玉 刘昌化 +4 位作者 许志杰 丁雅婷 谢亚锋 张侨 刘菀莹 《吉林大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期656-664,共9页
目的:探讨长链非编码RNA配对盒8反义RNA 1(PAX8-AS1)在人结直肠癌(CRC)组织中的表达水平及其对CRC细胞增殖、凋亡及侵袭的作用,并阐明其作用机制。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测94例CRC患者癌组织和癌细胞中PAX8-AS1 mRNA和m... 目的:探讨长链非编码RNA配对盒8反义RNA 1(PAX8-AS1)在人结直肠癌(CRC)组织中的表达水平及其对CRC细胞增殖、凋亡及侵袭的作用,并阐明其作用机制。方法:采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测94例CRC患者癌组织和癌细胞中PAX8-AS1 mRNA和miR-22-3p表达水平。将PAX8-AS10 siRNA小分子序列与miR-22-3p inhibitors分别转染或共转染至CRC细胞中,转染后细胞分为si-NC组(转染阴性序列)、si-PAX8-AS1组(转染PAX8-AS1 siRNA)、si-PAX8-AS1+inhibitors NC组(共转染PAX8-AS1 siRNA和inhibitors NC)和si-PAX8-AS1+inhibitors组(共转染PAX8-AS1 siRNA和miR-22-3p inhibitors),另取未经任何转染的SW480细胞作为对照组。RTqPCR法检测转染后各组细胞中PAX8-AS1 mRNA和miR-22-3p表达水平,MTT法检测各组细胞增殖活性,流式细胞术检测各组细胞凋亡率,Transwell小室实验检测各组细胞迁移和侵袭率,Western blotting法检测各组细胞中B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)和cleaved Caspase-3蛋白表达水平,双荧光素酶报告基因实验验证PAX8-AS1与miR-22-3p的靶向关系。结果:RT-qPCR法检测,与癌旁组织比较,癌组织中PAX8-AS1 mRNA表达水平明显升高(P<0.01),miR-22-3p表达水平明显降低(P<0.01);与人正常结肠上皮细胞NCM460比较,SW480、SW620、HT-29和LoVo细胞中PAX8-AS1 mRNA表达水平均明显升高(P<0.05或P<0.01),miR-22-3p表达水平均明显降低(P<0.05或P<0.01)。与对照组和si-NC组比较,si-PAX8-AS1组细胞中PAX8-AS1 mRNA表达水平明显降低(P<0.01),miR-22-3p表达水平明显升高(P<0.01);与si-NC组比较,si-PAX8-AS1+inhibitors NC组细胞中miR-22-3p表达水平明显升高(P<0.01)。MTT法检测,与对照组比较,si-PAX8-AS1组、si-PAX8-AS1+inhibitors NC组和si-PAX8-AS1+inhibitors组细胞培养48和72 h时细胞增殖活性均明显降低(P<0.01);与si-NC组比较,si-PAX8-AS1+inhibitors NC组细胞培养48和72 h时细胞增殖活性均明显降低(P<0.01)。流式细胞术检测,与对照组比较,si-PAX8-AS1组细胞凋亡率明显升高(P<0.01);与si-NC组比较,si-PAX8-AS1组和si-PAX8-AS1+inhibitors NC组细胞凋亡率明显升高(P<0.01)。Transwell小室实验检测,与对照组比较,si-PAX8-AS1组细胞迁移和侵袭率明显降低(P<0.01);与si-NC组比较,si-PAX8-AS1组和si-PAX8-AS1+inhibitors NC组细胞迁移和侵袭率明显降低(P<0.01)。Western blotting法检测,与对照组和si-NC组比较,si-PAX8-AS1组细胞中Bax和cleaved Caspase-3蛋白表达水平明显升高(P<0.01),Bcl-2蛋白表达水平降低(P<0.05)。TargetScan预测PAX8-AS1与miR22-3p存在靶向结合位点。双荧光素酶报告基因实验,与共转染mimics NC的细胞比较,miR-22-3p mimics共转染后PAX8-AS1-WT细胞中荧光素酶活性明显降低(P<0.01)。结论:PAX8-AS1在人CRC组织中高表达,沉默PAX8-AS1可抑制CRC细胞增殖、迁移和侵袭,并诱导细胞凋亡,其机制可能与上调miR22-3p表达有关。 展开更多
关键词 编码rna 配对盒8反义rna 1 微小rna-22-3p 直肠肿瘤 细胞凋亡
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