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重复序列引物聚合酶链反应追踪金黄色葡萄球菌所致医院感染 被引量:3
1
作者 黄革 董婷 +3 位作者 侯铁英 张莉滟 王媚 荣卡彬 《中国感染与化疗杂志》 CAS 2006年第4期260-262,共3页
目的利用重复序列引物聚合酶链反应(rep-PCR)追踪我院一起由金葡菌所致的医院感染。方法分离得到的50株金葡菌用PHOENIX-100微生物自动鉴定系统鉴定,苯唑西林-盐琼脂筛选MRSA表型;PCR检测其耐药基因mecA;rep- PCR作金葡菌基因分型。结... 目的利用重复序列引物聚合酶链反应(rep-PCR)追踪我院一起由金葡菌所致的医院感染。方法分离得到的50株金葡菌用PHOENIX-100微生物自动鉴定系统鉴定,苯唑西林-盐琼脂筛选MRSA表型;PCR检测其耐药基因mecA;rep- PCR作金葡菌基因分型。结果50株金葡菌中,22株mecA阳性,其中19株分离自患者标本。采用rep-PCR,50株金葡菌均出现9~11条带的电泳图谱,从而可分成11个不同的基因型。结论rep-PCR是一种快速、简便、可靠的基因分型方法,是在分子水平追踪医院感染病原菌较理想的工具。 展开更多
关键词 重复序列引物聚合反应 金黄色葡萄球菌 医院感染
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一种快速聚合酶链式反应方法的探究和法医学应用
2
作者 董会 李彩霞 +2 位作者 王晶 贾竞 刘超 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期931-937,共7页
目的优化和建立一套快速聚合酶链式反应(PCR)扩增体系和程序,缩短扩增时间,提高短串联重复序列分型的速率和办案效率。方法运用AmpFLSTR?Identifiler?Plus试剂盒和7种快速扩增酶进行筛选和优化,最后对筛选出的酶优化其扩增体系和扩增程... 目的优化和建立一套快速聚合酶链式反应(PCR)扩增体系和程序,缩短扩增时间,提高短串联重复序列分型的速率和办案效率。方法运用AmpFLSTR?Identifiler?Plus试剂盒和7种快速扩增酶进行筛选和优化,最后对筛选出的酶优化其扩增体系和扩增程序,并对几种常规检材中提取的DNA进行扩增和检测,然后对其分型结果进行验证和讨论。结果最终优化的扩增程序由常规的3 h左右缩短至24 min,DNA检验结果与常规方法一致。结论应用优化后的快速PCR扩增体系可以成功准确扩增DNA样本,显著提高DNA分型速率。 展开更多
关键词 法医学 快速聚合反应 复合短串联重复序列
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用Nested聚合酶链反应检测嗜肺军团菌的实验研究
3
作者 张扣兴 唐英春 +7 位作者 张天托 饶宪 龙伟潮 比嘉太 小出道夫 新里敬 草野展周 ■藤厚 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 1993年第3期170-174,共5页
用Nested聚合酶链反应(Nested PCR)法检测嗜肺军团菌种。Nested PCR法所用的两对寡核苷酸引物按编码24 kDa嗜肺军团菌表面抗原的基团片段序列设计的。用此两对引物对实验的军团菌种和非军团菌种细菌DNA进行扩增,只有嗜肺军团菌种DNA被扩... 用Nested聚合酶链反应(Nested PCR)法检测嗜肺军团菌种。Nested PCR法所用的两对寡核苷酸引物按编码24 kDa嗜肺军团菌表面抗原的基团片段序列设计的。用此两对引物对实验的军团菌种和非军团菌种细菌DNA进行扩增,只有嗜肺军团菌种DNA被扩增,而其他军团菌种和非军团菌属细菌没有被扩增。第1步和第2步PCR分别检测到最小量为10pg和10 fg的靶DNA。对不同量的嗜肺军团菌配制成的痰标本进行检测,能检测到0.1cfu/ml的嗜肺军团菌,只需12h。这些结果显示Nested PCR法检测嗜肺军团菌特异性强,敏感性高。此方法为从临床标本和环境材料中早期、快速检测到嗜肺军团菌提供了有效的工具。 展开更多
关键词 嗜肺军团菌 扩增 PCR法 实验研究 痰标本 聚合反应检测 临床标本 DNA PCR) 序列设计
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逆转录聚合酶链反应检测广东地区高危人群庚型肝炎病毒RNA
4
作者 傅涌水 吕凌 +1 位作者 周伯平 罗红涛 《实用医学杂志》 CAS 1998年第10期724-726,共3页
为了解广东地区庚型肝炎病毒(HGV)流行情况,为广东地区庚型肝炎的防治提供客观资料。以DNASIS软件对Genbank收录的3株HGV全序列:U44402、U45966和U36380进行同源性比较,取高度保守的5'非翻译区(5'UTR)设计合成两对套式... 为了解广东地区庚型肝炎病毒(HGV)流行情况,为广东地区庚型肝炎的防治提供客观资料。以DNASIS软件对Genbank收录的3株HGV全序列:U44402、U45966和U36380进行同源性比较,取高度保守的5'非翻译区(5'UTR)设计合成两对套式引物,建立检测HGVRNA的逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术,并对其中一输血后非甲-戊型肝炎血清PCR产物进行分子克隆与核苷酸序列分析以鉴定其特异性。结果表明,431例肝炎患者,185例静脉吸毒者及106例献血员HGVRNA阳性率分别为10.7%(46/431)、33.5%(62/185)和8.5%(9/106)。提示上述三种易感人群存在不同程度HGV感染。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 聚合反应 基因 序列分析
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聚合酶链反应对沙门氏菌肠炎快速诊断的初步应用 被引量:8
5
作者 王军 张为国 +3 位作者 虞爱华 王全立 刘耀清 马立人 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 1999年第1期45-46,共2页
对沙门氏菌肠炎快速诊断,采用聚合酶链反应和DNA序列分析,以沙门氏菌保守序列——侵袭基因A作为靶序列,检测23株沙门氏菌均扩增出284bp特异的DNA片段,提示存在侵袭基因A,20株非沙门氏菌扩增阴性。检测84份粪标... 对沙门氏菌肠炎快速诊断,采用聚合酶链反应和DNA序列分析,以沙门氏菌保守序列——侵袭基因A作为靶序列,检测23株沙门氏菌均扩增出284bp特异的DNA片段,提示存在侵袭基因A,20株非沙门氏菌扩增阴性。检测84份粪标本,13份阳性,其中仅8份大便培养阳性。DNA序列分析证实粪标本扩增出的284bpDNA片段与侵袭基因A序列一致。结果表明聚合酶链反应用于沙门氏菌肠炎诊断,具有简便、快速、敏感等优点。 展开更多
关键词 沙门氏菌 肠炎 聚合反应 序列分析
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通过PCR技术简单扩增奶牛高GC含量的rDNA重复序列 被引量:5
6
作者 王波 唐冬生 +3 位作者 蒋泓 洪亚辉 萧浪涛 周天鸿 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期602-604,共3页
为了探索利用PCR简单扩增高GC含量的长重复序列的方法,经反复摸索后选用LAPCR法即LAPCRTaq酶结合GC缓冲液Ⅱ来扩增奶牛高GC含量的长片段重复序列,成功获得了全长2538bp,GC含量为65.7%的DNA序列,其中ITS1的GC含量高达80%.探索了克隆复杂... 为了探索利用PCR简单扩增高GC含量的长重复序列的方法,经反复摸索后选用LAPCR法即LAPCRTaq酶结合GC缓冲液Ⅱ来扩增奶牛高GC含量的长片段重复序列,成功获得了全长2538bp,GC含量为65.7%的DNA序列,其中ITS1的GC含量高达80%.探索了克隆复杂DNA序列时引物设计的特别规则、反应体系的改进、DNA聚合酶的选用等措施. 展开更多
关键词 高GC含量 重复序列 核糖体DNA 聚合反应 奶牛
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短串联重复序列D7S2201基因座的群体遗传学研究 被引量:6
7
作者 黄代新 张林 +2 位作者 吴梅筠 陈国弟 陈于波 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期107-110,共4页
用扩增片段长度多态性技术分析短串联重复序列D7S2201基因座的遗传多态性,在262个中国成都地区汉族无关个体及119个泰国曼谷地区泰人无关个体中分别发现7个和5个等位基因,首次获得该基因座在两群体中的频率分布,其等位基因片段大小... 用扩增片段长度多态性技术分析短串联重复序列D7S2201基因座的遗传多态性,在262个中国成都地区汉族无关个体及119个泰国曼谷地区泰人无关个体中分别发现7个和5个等位基因,首次获得该基因座在两群体中的频率分布,其等位基因片段大小范围为100~124bp。两群体的基因型频率分布均符合Hardy Weinberg平衡。该基因座在两群体中的个人识别能力(PD)、杂合度(H)、多态性信息含量(CPI)及非父排除率(PE)分别为0.7038、0.5992、0.4789、0.2900和0.7351、0.5882、0.5012、0.2770。家系调查证实了等位基因的传递遵循孟德尔遗传规律。χ2检验表明两群体间等位基因频率分布无显著性差异。 展开更多
关键词 短串联生育序列 聚合反应 D7S2201基因座 多态性 群体遗传
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MEF2A基因CAG三联核苷酸重复序列与冠状动脉粥样硬化性心脏病的相关研究 被引量:8
8
作者 戴大鹏 何青 +4 位作者 周晓阳 肖尧 张志欣 钱贻简 蔡剑平 《中华老年心脑血管病杂志》 CAS 北大核心 2006年第10期671-674,共4页
目的 检测我国汉族人群中肌细胞增强因子2A(MEF2A)基因CAG三联核苷酸重复序列的多态性分布,调查MEF2A基因CAG三联核苷酸重复序列的多态与冠状动脉粥样硬化性心脏病发生的相关性。方法 用聚合酶链反应.单链构象多态性和(或)聚合酶... 目的 检测我国汉族人群中肌细胞增强因子2A(MEF2A)基因CAG三联核苷酸重复序列的多态性分布,调查MEF2A基因CAG三联核苷酸重复序列的多态与冠状动脉粥样硬化性心脏病发生的相关性。方法 用聚合酶链反应.单链构象多态性和(或)聚合酶链反应产物直接测序法对257例冠状动脉粥样硬化性心脏病阳性病例、154例冠状动脉粥样硬化性心脏病阴性对照及232例健康体检者的MEF2A基因编码区和5’非翻译区进行全基因扫描,并用病例-对照方法研究了CAG等位基因与冠状动脉粥样硬化性心脏病发生的相关性。结果 在我国汉族人群中,MEF2A基因第11号外显子中CAG三联核苷酸重复单元的个体携带数目从4~15个不等,存在CAG三联核苷酸的多态分布,4~8个CAG的等位基因与冠状动脉粥样硬化性心脏病的易感性显著相关(P=0.0057,OR=2.73,95%CI:1.25~6.15).结论 MEF2A基因第11号外显子4-8个CAG的等位基因可能与我国汉族人群冠状动脉粥样硬化性心脏病发生相关,提示MEF2A基因第11号外显子4-8个CAG的等位基因可能是冠状动脉粥样硬化性心脏病的易患因素. 展开更多
关键词 冠状动脉疾病 肌细胞增强因子2A 三核苷酸重复 聚合反应 危险因素
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江苏地区汉族人群八个短串联重复序列基因座遗传多态性研究 被引量:3
9
作者 易龙 陈仕林 +6 位作者 许争峰 潘永久 杨驰 应锋 丁卫东 王勇 凌立君 《医学研究生学报》 CAS 2004年第2期117-119,共3页
目的 :了解江苏地区汉族人群D14S30 6、D1S 818、D3S1338、LPL、F13B、F13A0 1、FESFPS和vWA等八个短串联重复序列 (STR)基因座的遗传多态性 ,并获得该群体的遗传学数据。 方法 :采用Chelex 10 0法从江苏地区无亲缘关系的汉族个体血标... 目的 :了解江苏地区汉族人群D14S30 6、D1S 818、D3S1338、LPL、F13B、F13A0 1、FESFPS和vWA等八个短串联重复序列 (STR)基因座的遗传多态性 ,并获得该群体的遗传学数据。 方法 :采用Chelex 10 0法从江苏地区无亲缘关系的汉族个体血标本 12 2份中提取DNA。特异引物聚合酶链反应。产物经 6 %变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 ,银染检测。 结果 :这八个STR基因座在江苏地区汉族人群均具有遗传多态性 ,并符合Hardy Wein berg定律 ,它们的个人识别率范围从F13B的 0 .6 86 9到vWA的 0 .92 85 ,非父排除率范围从F13B的 0 .2 4 99到vWA的 0 .6 0 2 6不等。 结论 展开更多
关键词 聚合反应 遗传多态性 短串联重复序列 江苏地区汉族群体
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中国江苏地区汉人群五个高多态性短串联重复序列(STR)基因座基因频率分布调查 被引量:2
10
作者 易龙 杨驰 +4 位作者 王勇 史冬泉 李志刚 李继周 周晓军 《南京大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期576-584,共9页
为选择有较好基因频率分布的短串联重复序列遗传标记,对中国江苏地区随机汉族人群的D5S818、D19S253、D12S391、D2S1338和D22S684 5个微卫星基因座进行了基因频率分布调查,并评估它们作为法医遗传标记在中国江苏地区汉族群体中的效能。... 为选择有较好基因频率分布的短串联重复序列遗传标记,对中国江苏地区随机汉族人群的D5S818、D19S253、D12S391、D2S1338和D22S684 5个微卫星基因座进行了基因频率分布调查,并评估它们作为法医遗传标记在中国江苏地区汉族群体中的效能。采用Chelex-100法从中国江苏地区无血缘关系汉族个体的血样本105份中提取DNA,特异引物聚合酶链反应,产物经6%变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染检测。这5个STR基因座在中国江苏地区汉人群均显具有高度遗传多态性并符合Hardy-Weinberg定律,它们的个人识别率(DP)范围从D5S818的0.892 8到 D2S1338的 0.952 7,非父排除率(PE)范围从 D5S818的0.538 5到D2S1338的0.690 7不等。5个基因座的联合 DP值和联合 PE分别为0.999 997和0.991 8。在D22S684基因座,首次在汉人群报道的等位基因频率分布与英国Caucasian,Afro-Caribbean和Asian fom the Indian 3个人群相比较,卡方检验有显著差异(P<0.005)。为常规应用这 8个STR遗传标记在中国江苏地区汉人群中进行亲子鉴定和个人识别提供了概率计算依据和群体遗传学数据。 展开更多
关键词 聚合反应 遗传多态性 短串联重复序列 中国江苏地区汉族群体
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重复序列PCR与多位点分型技术在白假丝酵母菌基因分型中的比较 被引量:2
11
作者 魏冰 刘锦燕 +1 位作者 史册 项明洁 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1445-1448,共4页
目的应用多位点序列分型技术(MLST)和重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)对临床分离出的白假丝酵母菌进行分型,并对两种方法作出应用评价。方法收集上海地区医院中真菌性阴道炎分离出的40株白假丝酵母菌,选择合适引物进行扩增,通过电泳比较... 目的应用多位点序列分型技术(MLST)和重复序列聚合酶链反应(REP-PCR)对临床分离出的白假丝酵母菌进行分型,并对两种方法作出应用评价。方法收集上海地区医院中真菌性阴道炎分离出的40株白假丝酵母菌,选择合适引物进行扩增,通过电泳比较分析获得REP-PCR分型。选择7对管家基因进行PCR反应并测序,将测序结果与标准序列进行比对,获得由7对管家基因组成的等位基因谱,最终得到相应的序列分型。结果 REP-PCR中Ca22-Ca22引物对得到电泳条带最优,40株白假丝酵母菌共分成7种REP-PCR型;MLST分型得出29种,且均为新型。结论 MLST分辨率较REP-PCR高,但由于REP-PCR分型方法更为快捷、经济,更适用于实验室大量菌株分型和临床分型。MLST则更客观,更适合用于进化学的研究及全球性流行病学的调查研究。 展开更多
关键词 白假丝酵母菌 多位点序列分型技术 重复序列聚合反应 基因分型
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人蛋白激酶CβⅡ基因开放读码框的克隆及序列分析 被引量:3
12
作者 段炼 周波 李启富 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2008年第1期18-21,共4页
目的:克隆人蛋白激酶CβⅡ基因(PRKCB1)的开放读码框(Open reading frame,ORF),为其进一步的功能研究提供基础。方法:采用逆转录-巢式PCR法,从人脐静脉内皮细胞株中扩增出含PRKCB1基因ORF全长的片段,所得片段经加"A"处理并插... 目的:克隆人蛋白激酶CβⅡ基因(PRKCB1)的开放读码框(Open reading frame,ORF),为其进一步的功能研究提供基础。方法:采用逆转录-巢式PCR法,从人脐静脉内皮细胞株中扩增出含PRKCB1基因ORF全长的片段,所得片段经加"A"处理并插入T载体。经蓝白筛选,用特异引物扩增阳性重组子,得到编码人蛋白激酶CβⅡ(Protein kinase CβⅡ,PKCβⅡ)基因的ORF,并与T载体相连,测序鉴定。结果:通过巢式RT-PCR及T/A克隆获取了PRKCB1基因的ORF,测序结果与GenBank报道序列一致。结论:成功克隆了PRKCB1基因的ORF,在技术路线上可以为某些难克隆的基因提供参考。 展开更多
关键词 鹰白激Cβ基因 聚合反应 T/A克隆 序列分析
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短串联重复序列位点CYP19、LPL、TH的多态性研究 被引量:3
13
作者 余纯应 杨庆恩 +1 位作者 陈慧 杨荣芝 《同济医科大学学报》 CSCD 1997年第6期430-433,共4页
应用PCR及PAG电泳技术研究了CYP19、LPL和TH3个STR位点的多态性。调查武汉地区200名汉族无亲缘关系个体,首次获得汉族人群基因频率分布。3位点基因型频率分布与Hardy-weinberg平衡吻合。家系调查证实了等位基因具孟德尔遗传特征,观... 应用PCR及PAG电泳技术研究了CYP19、LPL和TH3个STR位点的多态性。调查武汉地区200名汉族无亲缘关系个体,首次获得汉族人群基因频率分布。3位点基因型频率分布与Hardy-weinberg平衡吻合。家系调查证实了等位基因具孟德尔遗传特征,观察46次减数分裂未发现突变基因。分别计算了汉族人群CYP19、LPL和TH位点的杂合度(H)、个人识别能力(DP)、多态性信息总量(PIC)和非父排除率(PE),为法医学应用提供了基础数据。 展开更多
关键词 短串联重复序列 基因频率 聚合反应
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人单拷贝及重复DNA序列的原位PCR
14
作者 马琦 张锡元 +2 位作者 刘汀 杨建琪 徐耀先 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第4期348-352,共5页
在培养的人小肠癌转移腹水细胞系细胞中进行了Y染色体特异的重复序列及单拷贝序列的原位扩增与检测 .结果显示原位PCR法的灵敏度比直接的原位杂交法明显提高 .
关键词 DNA 单拷贝 重复序列 原位 聚合反应
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粘质沙雷菌中SHV型β-内酰胺酶编码基因的克隆及序列分析
15
作者 陈勇川 朱卫民 钱元恕 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第9期549-551,580,共4页
目的研究重庆地区临床分离的粘质沙雷菌E 121编码超广谱β-内酰胺酶(ESBL s)的基因。方法PCR扩增ESBL s编码基因片段,克隆入pUCm-T载体,双脱氧链终止法测定核苷酸序列并确定亚型,等电聚焦测定β-内酰胺酶的等电点(pI)。结果PCR扩增结果... 目的研究重庆地区临床分离的粘质沙雷菌E 121编码超广谱β-内酰胺酶(ESBL s)的基因。方法PCR扩增ESBL s编码基因片段,克隆入pUCm-T载体,双脱氧链终止法测定核苷酸序列并确定亚型,等电聚焦测定β-内酰胺酶的等电点(pI)。结果PCR扩增结果显示粘质沙雷菌E 121产生的ESBL s为SHV型,其基因片段含756个核苷酸,G enB ank查询其核苷酸序列与SHV-28型ESBL s完全相同。该耐药株至少含有等电点pI约为5.4和8.2的两种β-内酰胺酶。结论重庆地区粘质沙雷菌E 121所产ESBL s亚型为SHV-28。 展开更多
关键词 超广谱Β-内酰胺 聚合反应 序列分析
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抗乳腺癌人单抗CM-1重链可变区基因的序列测定与分析 被引量:1
16
作者 陈力真 王树蕙 张云 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第2期150-153,共4页
为存留抗乳腺癌人单抗CM-1的可变区编码基因,从CM-1杂交瘤细胞中提出总RNA,经逆转录生成cDNA,PCR后得到一400hP左右的基因扩增片段。用一条内引物直接对PCR产物进行基因序列测定,测得344个碱基序列,与已知人抗体重链可变区的读码... 为存留抗乳腺癌人单抗CM-1的可变区编码基因,从CM-1杂交瘤细胞中提出总RNA,经逆转录生成cDNA,PCR后得到一400hP左右的基因扩增片段。用一条内引物直接对PCR产物进行基因序列测定,测得344个碱基序列,与已知人抗体重链可变区的读码框架相符,其对应的氨基酸序列属人抗体可变区“典范结构”的1~3类,从而进一步验证了CM-1单抗的人源性,并为人抗体编码基因的研究提供了新资料,也为制备CM-1小分子抗体作了准备。 展开更多
关键词 人源 单克隆抗体 聚合反应 基因序列 乳腺癌
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PCR检测结核分枝杆菌复合群IS_(986)DNA重复序列 被引量:1
17
作者 朱诗应 杨毓华 邵海枫 《医学研究生学报》 CAS 1994年第3期29-32,共4页
用PCR检测MTBC特异的IS986DNA重复序列。IS986DNA重复序列全长1358bp,特异地存在于MTBC细菌染色体DNA中,并且多次重复出现。作者参照文献,在此序列内合成一对引物,扩增出188bp的MTBC... 用PCR检测MTBC特异的IS986DNA重复序列。IS986DNA重复序列全长1358bp,特异地存在于MTBC细菌染色体DNA中,并且多次重复出现。作者参照文献,在此序列内合成一对引物,扩增出188bp的MTBC特异的DNA片段。实验证明具有高度的特异性和敏感性。与其它的分枝杆菌和人血细胞DNA无交叉反应。最小检出极限为10fgDNA或10个菌体/ml。对PCR反应体系中有关实验条件如引物浓度、TaqDNA聚合酶用量、循环程序等进行了优化选择。在临床标本细菌DNA抽提中首次采用了简便的TE-Triton煮沸法,节省了成本,使整个检测时间缩短至6~8h。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌复合群 聚合反应 DNA重复序列
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产金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的相关整合子和同源性分析 被引量:2
18
作者 周蓉 朱卫民 奉婷 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期776-782,共7页
目的调查我院2010年1月—2010年12月临床分离的产金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的耐药性、同源性、金属酶基因型及相关整合子。方法收集我院住院患者临床分离非重复对碳青霉烯类抗生素不敏感的肺炎克雷伯菌16株;乙二胺四乙酸(EDTA)协同... 目的调查我院2010年1月—2010年12月临床分离的产金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌的耐药性、同源性、金属酶基因型及相关整合子。方法收集我院住院患者临床分离非重复对碳青霉烯类抗生素不敏感的肺炎克雷伯菌16株;乙二胺四乙酸(EDTA)协同实验筛选产金属β-内酰胺酶菌株;采用PCR法扩增金属酶和3类整合子基因,测序确定金属酶基因型;应用肠杆菌基因间重复一致序列聚合酶链反应(ERIC-PCR)分析产酶菌株间的同源性;琼脂倍比稀释法进行常用抗菌药物敏感性实验。结果 16株对碳青霉烯类不敏感的肺炎克雷伯菌中EDTA协同实验阳性的有5株,PCR扩增测序有4株产IMP-8型金属β-内酰胺酶,其中3株携带的IMP-8基因位于I类整合子上;未检测到II、III类整合子和VIM、GIM、SIM、SPM、NDM金属酶基因。ERIC-PCR结果显示产酶株分为2种基因型,A型3株,均分离于呼吸内科重症监护病房患者的痰标本;B型1株。药敏实验结果显示:A型的3株对青霉素类、头孢菌素类抗生素、氨曲南及环丙沙星完全耐药,其中K2菌株对亚胺培南、美罗培南中介,但对阿米卡星敏感;K1、K4菌株对亚胺培南、美罗培南及阿米卡星耐药。B型的K3菌株除氨曲南外对其他β-内酰胺类抗生素均高水平耐药,但对阿米卡星及环丙沙星均敏感。结论该院呼吸内科重症监护病房存在产IMP-8型金属β-内酰胺酶肺炎克雷伯菌克隆传播,且耐药基因位于I类整合子上,医护人员应予以高度关注,注意进行临床检测和监控,并及时采取有效措施。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 金属Β-内酰胺 重复一致序列聚合酶链反应 整合子
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石蒜属植物种质资源ISSR-PCR反应体系的建立 被引量:14
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作者 张雷凡 高燕会 +3 位作者 朱玉球 刘志高 童再康 黄华宏 《浙江林学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期156-161,共6页
为进一步开展石蒜属Lycoris植物种质资源遗传多样性研究,利用正交试验设计的方法,从Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物等5因素4水平,对石蒜属植物ISSR(intersimple sequence repeats)反应体系进行优化,确立了石蒜属植物ISSR的最佳反应体... 为进一步开展石蒜属Lycoris植物种质资源遗传多样性研究,利用正交试验设计的方法,从Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP和引物等5因素4水平,对石蒜属植物ISSR(intersimple sequence repeats)反应体系进行优化,确立了石蒜属植物ISSR的最佳反应体系:在20μL反应体系中,含1×Buffer,模板DNA 50 ng,2.5 mmol.L-1氯化镁(MgCl2),0.15 mmol.L-1dNTP,25.05 nkatTaq聚合酶,0.5μmol.L-1引物。进一步进行梯度退火试验,确定最适宜退火温度为57℃。 展开更多
关键词 植物学 石蒜属 简单序列重复区间(ISSR) 正交设计 PCR聚合反应体系
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重复片段引物PCR用于鲍曼不动杆菌分型研究 被引量:11
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作者 练向群 林亚蕾 +2 位作者 刘丁 俞志海 陈伟 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第4期437-438,共2页
目的 运用重复片段引物PCR的分析方法对鲍曼不动杆菌进行分子分型研究。方法 选用肠杆菌科基因间的的重复序列 (ERIC)为引物进行PCR扩增 ,对 2 2株鲍曼不动杆菌进行分型研究 ,并与生物学分型及抗生素耐药结果进行比较。结果 经重复... 目的 运用重复片段引物PCR的分析方法对鲍曼不动杆菌进行分子分型研究。方法 选用肠杆菌科基因间的的重复序列 (ERIC)为引物进行PCR扩增 ,对 2 2株鲍曼不动杆菌进行分型研究 ,并与生物学分型及抗生素耐药结果进行比较。结果 经重复片段引物PCR的方法 ,分离出 6种不同基因型的鲍曼不动杆菌 ,而生物学分型只有 2种 ,且与抗生素谱较为相关。结论 该方法简便易行 ,且重复性好 ,适合于医院感染流行病学研究。 展开更多
关键词 聚合反应 重复片段 鲍曼不动杆菌 医院内感染 PCR 基因分型
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