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tRF Prospect:基于神经网络学习的tRNA衍生片段靶标预测算法: 1; 作者任黛西易健勇 +4 位作者莫勇真杨梅熊炜曾朝阳石磊《生物化学与生物物理进展》北大核心 2025年第9期2428-2438,共11页; 目的转运核糖核酸衍生片段(transfer RNA derived fragment,tRF)是一种新型的长度介于13~50 nt的非编码RNA,最近被发现可能通过靶向结合mRNA,促进mRNA降解,抑制蛋白质翻译,从而在细胞中发挥特定的生物学功能,但预测其靶基因的生物信息... 展开更多; 关键词转运核糖核酸衍生片段数据库神经网络学习; 在线阅读下载PDF 职称材料

转运RNA衍生的小RNA研究概述: 2; 作者骆雅鑫胡雪峰《生物学教学》北大核心 2024年第1期2-5,共4页; 转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能... 展开更多; 关键词非编码RNA 转运RNA 衍生片段转运RNA半分子; 在线阅读下载PDF 职称材料

转运RNA衍生片段在心血管疾病中的研究进展被引量：2: 3; 作者崔楠张俊哲 +2 位作者马群 Muisha B MBIKYO 李昭《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第9期843-846,共4页; 心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运RNA衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研... 展开更多; 关键词转运RNA衍生片段生物学功能心血管疾病; 在线阅读下载PDF 职称材料

转运RNA的表观遗传修饰及其异常对神经退行性变性疾病的影响: 4; 作者唐明敏毕洪运 +1 位作者董子敬曾玲晖《浙江大学学报(医学版)》北大核心 2025年第1期58-69,共12页; 神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运RNA(tRNA)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影... 展开更多; 关键词神经退行性变性疾病转运RNA 表观遗传修饰转运RNA衍生片段综述; 在线阅读下载PDF 职称材料

转运RNA衍生的小RNA功能及其研究方法被引量：2: 5; 作者马剑峰甘麦邻 +1 位作者朱砺沈林園《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1107-1120,共14页; 转运RNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs,tsRNA)是近年来发现的一类由成熟tRNA或tRNA前体通过特殊的作用机制加工产生的非编码RNA。根据其产生方式的不同,主要分为tRNA半分子(tRNA halves)和tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragmen... 展开更多; 关键词非编码RNA 转运RNA衍生片段 tsRNA tRFs; 在线阅读下载PDF 职称材料

胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tiRNA的差异表达及功能分析: 6; 作者陈代奕文宇琪 +4 位作者何彩林胡恩杨曌宇熊新贵杨波《中国免疫学杂志》北大核心 2025年第5期1041-1047,共7页; 目的:探究胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠血浆转运RNA衍生片段(tRF)和转运RNA半分子(tiRNA)的差异表达,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析,为类风湿关节炎(RA)的诊断和治疗寻找新的靶点。方法:皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型,通... 展开更多; 关键词类风湿关节炎胶原诱导性关节炎转运RNA衍生片段转运RNA半分子; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名tRF Prospect:基于神经网络学习的tRNA衍生片段靶标预测算法: 1; 作者任黛西易健勇莫勇真杨梅熊炜曾朝阳石磊; 机构中南大学湘雅基础医学院中南大学湘雅二医院病理科复旦大学脑科学研究所; 出处《生物化学与生物物理进展》北大核心 2025年第9期2428-2438,共11页; 基金国家自然科学基金(82472789) 湖南省自然科学基金(2025JJ50590) +1 种基金长沙市自然科学基金(kq2208329) 中南大学研究生科研创新项目(1053320242771)资助。; 文摘目的转运核糖核酸衍生片段(transfer RNA derived fragment,tRF)是一种新型的长度介于13~50 nt的非编码RNA,最近被发现可能通过靶向结合mRNA,促进mRNA降解,抑制蛋白质翻译,从而在细胞中发挥特定的生物学功能,但预测其靶基因的生物信息学方法尚且有限。为了研究这一种新型分子在基因网络调控中发挥的作用,开发一种更全面地预测tRF靶标的算法具有重要意义。方法使用多层感知机神经网络深度学习算法,以确认结合的38687对tRF∶mRNA为训练数据,将已知的tRF和靶标结合的特征用于模型学习,并扩大收录的tRF和靶标的范围。结果将该基于神经网络学习的tRF靶标预测算法命名为tRF Prospect,算法AUC达93.4%,经与过表达tRF后的转录组高通量测序数据进行比对,具有良好的预测性能,证实该算法具有较高准确度。结论tRF Prospect主要预测tRF发挥生物学功能可能作用的靶向mRNA,对现有的tRF靶标预测平台在收录tRF种类、靶标范围和预测模型上进行了补充,为研究tRF在生物中的新作用提供了基础。; 关键词转运核糖核酸衍生片段数据库神经网络学习; Keywords tRF database neural network learnin; 分类号 R34 [医药卫生—基础医学] N20 [自然科学总论]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名转运RNA衍生的小RNA研究概述: 2; 作者骆雅鑫胡雪峰; 机构福建师范大学生命科学学院; 出处《生物学教学》北大核心 2024年第1期2-5,共4页; 基金 2022年福建省本科高校教育教学研究项目“指向科学思维的高中生物学试题命制与评价研究”,No.FBJG20230016。; 文摘转运RNA(tRNA)衍生的小RNA(tsRNAs)是由成熟tRNA或前体tRNA在应激条件下经特定核酸酶切割后所产生的一类小非编码RNA,具有高保守性、组织特异性和疾病相关性等特点,可作为生物标志物及治疗靶点。本文从tsRNAs的发现、分类、生物学功能及其在疾病中的作用等方面对其研究现状进行综述,以期为表观遗传学相关内容的教学提供参考信息。; 关键词非编码RNA 转运RNA 衍生片段转运RNA半分子; Keywords Non-coding RNA tRNA-derived fragments transfer RNA semimolecule; 分类号 G642 [文化科学—高等教育学] Q522-4 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名转运RNA衍生片段在心血管疾病中的研究进展被引量：2: 3; 作者崔楠张俊哲马群 Muisha B MBIKYO 李昭; 机构中国医科大学附属第一医院心血管内科; 出处《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第9期843-846,共4页; 基金国家自然科学基金(81970254) 中华心血管病发展专项基金(Z-2019-42-1908)。; 文摘心血管疾病是影响人类健康、导致死亡的重要原因之一。转运RNA衍生片段(tRFs)在心血管疾病的发生、发展中起重要作用,包括参与心肌肥厚的代际遗传,调节血管平滑肌的增殖、迁移和表型转换等。但tRFs的很多作用机制仍不明确,需要大量的研究验证。本文主要概述了tRFs的分类、生物学功能,并对tRFs在心肌肥厚、主动脉夹层、血管平滑肌细胞表型转换中的研究进展进行总结、分析。; 关键词转运RNA衍生片段生物学功能心血管疾病; Keywords transfer RNA derived fragments biological function cardiovascular disease; 分类号 R54 [医药卫生—心血管疾病]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名转运RNA的表观遗传修饰及其异常对神经退行性变性疾病的影响: 4; 作者唐明敏毕洪运董子敬曾玲晖; 机构浙大城市学院医学院浙江大学医学院附属第二医院神经内科浙江大学良渚实验室浙江大学医学院脑科学与脑医学学院; 出处《浙江大学学报(医学版)》北大核心 2025年第1期58-69,共12页; 基金国家自然科学基金(82304472) 浙大城市学院科研培育基金(X-202103,J-202105)。; 文摘神经退行性变性疾病是一组以中枢或周围神经系统神经元的功能和结构完整性逐渐丧失为特征的神经系统疾病。这类疾病的病因复杂,致病机制及药物靶点的研究仍面临诸多难题。转运RNA(tRNA)修饰在调节密码子识别、维持分子结构稳定性以及影响tRNA衍生片段(tRF)产生等方面发挥着关键作用,对神经发育和神经系统的生理功能具有重要作用。异常的tRNA修饰与多种神经退行性变性疾病的发病机制密切相关,特别是延伸因子复合物依赖的tRNA修饰和甲基化修饰异常能导致翻译过程和tRF水平变化,进而干扰蛋白质稳态和细胞应激反应,影响神经元存活。此外,神经退行性变性疾病患者体内tRF水平也显示出显著变化,特定tRF对神经退行性变性疾病有着不同的影响。本文从tRNA表观遗传修饰的生物学功能出发,深入探讨其异常在神经退行性变性疾病中的作用,包括经典的密码子识别功能和非经典的tRF生成机制,最后讨论了tRNA修饰可以作为治疗神经退行性变性疾病的潜在靶点。; 关键词神经退行性变性疾病转运RNA 表观遗传修饰转运RNA衍生片段综述; Keywords Neurodegenerative diseases Transfer RNA Epigenetics modifications transfer RNA-derived fragments Review; 分类号 R394 [医药卫生—医学遗传学] R741.02 [医药卫生—神经病学与精神病学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名转运RNA衍生的小RNA功能及其研究方法被引量：2: 5; 作者马剑峰甘麦邻朱砺沈林園; 机构四川农业大学动物科技学院四川农业大学; 出处《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2021年第12期1107-1120,共14页; 基金国家自然科学基金项目(编号:31902135,31972524) 四川省科技厅基础研究项目(编号:2021YJ0265,2021YFYZ0007,2020YFN0147)资助。; 文摘转运RNA衍生的小RNA(tRNA-derived small RNAs,tsRNA)是近年来发现的一类由成熟tRNA或tRNA前体通过特殊的作用机制加工产生的非编码RNA。根据其产生方式的不同,主要分为tRNA半分子(tRNA halves)和tRNA衍生片段(tRNA-derived RNA fragments,tRFs)两种类型。tsRNA广泛存在于各种生物体中,具有高度保守、结构稳定和组织表达特异性等特点。大量研究表明,多种细胞应激反应中tsRNA的表达显著上升,其参与应激反应的调控是一种保守的生物现象。tsRNA可通过调控转录本稳定性、调节翻译和作为表观遗传调控因子等方式在多种生物学过程中发挥重要作用,此外,tsRNA具有作为疾病生物标志物和治疗靶点的潜力,逐渐成为生物医学领域中的研究热点。本文从tsRNA的生物发生、功能和研究方法3个方面,对其研究现状进行了综述,以期为后续研究提供参考。; 关键词非编码RNA 转运RNA衍生片段 tsRNA tRFs; Keywords non-coding RNA tRNA-derived fragments tsRNA tRFs; 分类号 Q522 [生物学—生物化学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

题名胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tiRNA的差异表达及功能分析: 6; 作者陈代奕文宇琪何彩林胡恩杨曌宇熊新贵杨波; 机构中南大学湘雅医院中西医结合科; 出处《中国免疫学杂志》北大核心 2025年第5期1041-1047,共7页; 基金国家自然科学基金(81874407) 湖南省自然科学基金(2021JJ31117,2024JJ5566)。; 文摘目的:探究胶原诱导性关节炎(CIA)大鼠血浆转运RNA衍生片段(tRF)和转运RNA半分子(tiRNA)的差异表达,并对其靶基因进行生物学功能及通路的富集分析,为类风湿关节炎(RA)的诊断和治疗寻找新的靶点。方法:皮下注射Ⅱ型胶原建立RA大鼠模型,通过关节炎指数(AI)积分、HE染色评价疾病模型;利用Illumina平台测序获取tRF和tiRNA表达谱,RT-qPCR用于tRF和tiRNA表达量的验证;结合miRanda和TargetScan数据库预测差异表达tRF和tiRNA的靶基因;GO和KEGG富集分析对靶基因功能进行注释。结果:CIA模型大鼠血浆共有25个差异表达的tRFs和tiRNAs,其中23个上调,2个下调;筛选出6个CIA大鼠特异性表达tRFs和tiRNAs,分别为Other-36:73-tRNA-Arg-CCT-4、Other-57:70-tRNA-Glu-CTC-1-M3、tRF-1:32-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:31-Gly-CCC-1-M2、tRF-1:32-Pro-AGG-1-M4和tRF-1:32-Glu-TTC-2-M2,其靶基因GO分析主要涉及细胞器相关条目,KEGG分析富集到多条与RA相关的经典信号通路。结论:差异表达tRFs和tiRNAs的靶基因可能参与调控RA的重要病理生理过程及药物治疗的作用靶点。; 关键词类风湿关节炎胶原诱导性关节炎转运RNA衍生片段转运RNA半分子; Keywords Rheumatoid arthritis Collagen-induced arthritis tRNA-derived RNA fragment tRNA halves; 分类号 R593.2 [医药卫生—内科学]; 在线阅读下载PDF 职称材料

	题名	作者	出处	发文年	被引量	操作
1	tRF Prospect:基于神经网络学习的tRNA衍生片段靶标预测算法	任黛西易健勇莫勇真杨梅熊炜曾朝阳石磊	《生物化学与生物物理进展》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
2	转运RNA衍生的小RNA研究概述	骆雅鑫胡雪峰	《生物学教学》北大核心	2024	0	在线阅读下载PDF 职称材料
3	转运RNA衍生片段在心血管疾病中的研究进展	崔楠张俊哲马群 Muisha B MBIKYO 李昭	《中国医科大学学报》 CAS 北大核心	2023	2	在线阅读下载PDF 职称材料
4	转运RNA的表观遗传修饰及其异常对神经退行性变性疾病的影响	唐明敏毕洪运董子敬曾玲晖	《浙江大学学报(医学版)》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料
5	转运RNA衍生的小RNA功能及其研究方法	马剑峰甘麦邻朱砺沈林園	《遗传》 CAS CSCD 北大核心	2021	2	在线阅读下载PDF 职称材料
6	胶原诱导性关节炎大鼠血浆tRF和tiRNA的差异表达及功能分析	陈代奕文宇琪何彩林胡恩杨曌宇熊新贵杨波	《中国免疫学杂志》北大核心	2025	0	在线阅读下载PDF 职称材料