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表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术研究神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质谱改变规律 被引量:1
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作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期220-224,共5页
目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有... 目的探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术在筛选神经管缺陷胎儿母亲尿液中蛋白质标志物的应用。方法经超声确诊为神经管缺陷胎儿的孕妇20例和正常孕妇15例。神经管缺陷包括脊柱裂10例,无脑儿5例,脑积水5例。所有孕妇均取清晨空腹尿5ml,离心后取上清,选用CM10芯片检测。采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据。设定优化相对分子质量范围1000~30000Da。数据分析使用Ciphergen protein chip 3.1.1软件。结果共检测到39个尿液差异蛋白质峰,有统计学意义的差异蛋白质峰5个。病例组中有4种蛋白质高表达,相对分子质量分别为8320,8209,9099,10567;1种蛋白质低表达,相对分子质量3458。建立决策分类树,得到带有3个终结点的决策分类树,获得2个标志性蛋白质,分子量为9096,8244。进行留一法交叉验证后,神经管缺陷诊断模型的灵敏度为80.0%,特异度为93.3%。结论应用SELDI-TOF-MS技术可以在孕妇尿液中筛查出神经管缺陷的特异性蛋白质标志物,进一步可用于神经管缺陷产前早期无创诊断。 展开更多
关键词 神经管缺陷 表面增强激光离子化飞行时间质谱 产前诊断 蛋白质标志物
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表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术筛选蕈样肉芽肿血清生物标志物
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作者 刘洁 郑燕华 +1 位作者 张建中 王宝玺 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期13-16,共4页
目的应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选蕈样肉芽肿患者血清中的生物标志物。方法采用CM10蛋白质芯片捕获14例蕈样肉芽肿患者(研究组)和17例对照者(对照组)血清中的蛋白质,结合Biomarker Wizard软件进行分... 目的应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选蕈样肉芽肿患者血清中的生物标志物。方法采用CM10蛋白质芯片捕获14例蕈样肉芽肿患者(研究组)和17例对照者(对照组)血清中的蛋白质,结合Biomarker Wizard软件进行分析。结果所有标本在相对分子质量0~50 000范围内均能检测出131个左右的蛋白峰。两组血清样本的蛋白质指纹图谱存在14个差异表达蛋白质峰,其中相对分子质量为7 670的蛋白质峰与C-C基序趋化因子22相符。结论SELDI-TOF-MS可用于蕈样肉芽肿患者血清生物标志物的筛选。 展开更多
关键词 表面增强激光离子化飞行时间质谱 蕈样肉芽肿 血清 生物标志物
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表面增强激光解析电离光谱技术分析人卵泡发育过程中蛋白质组学变化 被引量:2
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作者 李黎 邢福祺 +2 位作者 陈士岭 孙玲 李红 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期275-278,共4页
目的应用蛋白质芯片和质谱技术,建立人成熟卵泡液及窦卵泡液的蛋白质表达指纹图谱,寻找在卵泡生长发育过程中起关键作用的蛋白质。方法采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白质芯片检测48例人成熟卵泡液、21例窦... 目的应用蛋白质芯片和质谱技术,建立人成熟卵泡液及窦卵泡液的蛋白质表达指纹图谱,寻找在卵泡生长发育过程中起关键作用的蛋白质。方法采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白质芯片检测48例人成熟卵泡液、21例窦卵泡液中的蛋白质变化,使用PBSⅡ-C型蛋白质芯片阅读机读取数据,获得的结果采用Ciphergen公司的Biomarker wizard和Biomarker Patterns System软件进行分析。结果成熟卵泡液组与窦卵泡液组蛋白质谱相比,有4种蛋白质在含量上有显著差异,2种蛋白质在成熟卵泡液组表达上调,2种蛋白质表达下降。结论成熟卵泡液与窦卵泡液蛋白质谱存在显著差异,差异蛋白可能与卵泡发育、卵子受精密切相关。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱 蛋白质芯片 人卵泡液
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SELDI飞行质谱技术检测结直肠癌患者血清肿瘤转移相关蛋白 被引量:3
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作者 赵艇 高春芳 魏东 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期662-663,共2页
关键词 结直肠肿瘤 蛋白质组学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱
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基于小分子化合物分析的MALDI-TOF MS新型基质研究进展 被引量:3
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作者 杨迎晨 陈企发 夏炎 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1381-1387,共7页
基质辅助激光解吸附离子化-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种新型的软电离生物质谱,近十年来得到了快速发展,在小分子化合物的分析检测中发挥了重要作用。其基质的选择一直是关注的重点,目前,研究者们已开发出多种新型MALDI-TOF MS基质... 基质辅助激光解吸附离子化-飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种新型的软电离生物质谱,近十年来得到了快速发展,在小分子化合物的分析检测中发挥了重要作用。其基质的选择一直是关注的重点,目前,研究者们已开发出多种新型MALDI-TOF MS基质,主要分为纳米材料和新型有机化合物两大类,基质性能的完善与提高使得MALDI-TOF MS的检测结果有了更高的准确度和灵敏度,更小的背景噪音,更干净的谱图,但目前尚处于研究阶段,现阶段仍无法替代传统有机基质。该文通过对新型基质的研究进展进行整理,总结出不同种类基质的优点、特性及适用对象,并对未来的MALDI-TOF MS基质研究作出了展望。 展开更多
关键词 基质辅助激光吸附离子化-飞行时间质谱 小分子化合物 新型基质 综述
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胃癌患者血清比较蛋白质组学研究 被引量:20
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作者 高春芳 李冬晖 +3 位作者 赵光 郑国宝 王秀丽 许红兵 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期457-459,共3页
目的应用蛋白质质谱分析方法寻找胃癌鉴定的生物标志物.方法应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测38例胃癌患者、82例正常人血清中的蛋白质相对含量.结果 38例胃癌患者与82例正常人在质荷比为1 723~14 048Da... 目的应用蛋白质质谱分析方法寻找胃癌鉴定的生物标志物.方法应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测38例胃癌患者、82例正常人血清中的蛋白质相对含量.结果 38例胃癌患者与82例正常人在质荷比为1 723~14 048Da间有18种血清蛋白质含量有显著差异.在学习模式下38例胃癌患者及82例正常人均被正确分组,准确率为100%(120/120),灵敏度和特异性分别为100%(38/38)、100%(82/82);在检测模式下38例胃癌患者中有31例被正确论断,82例正常人中有81例被正确分组,灵敏度和特异性分别为81.6% (31/38)、98.8%(81/82).结论该方法可快速、准确检测胃癌,灵敏度、特异性高. 展开更多
关键词 胃肿瘤 肿瘤标记 生物学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)
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利用血清中蛋白质组构型鉴定Dukes A期结直肠癌 被引量:11
7
作者 高春芳 赵光 +2 位作者 郑国宝 李冬晖 王秀丽 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期460-462,共3页
目的 通过对血清蛋白质组的质谱分析,寻找用于Dukes A期结直肠癌鉴定的蛋白质组构型。方法 随机取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为预备组,另取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为... 目的 通过对血清蛋白质组的质谱分析,寻找用于Dukes A期结直肠癌鉴定的蛋白质组构型。方法 随机取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为预备组,另取10例Dukes A期及68例Dukes B、C、D期结直肠癌患者的血清作为检测组。预备组血清与金属亲和表面(IMAC3)芯片结合后,用蛋白芯片仪读取数据,分析可得到用于区分Dukes A期和Dukes B、C、D期结直肠癌患者的树状分类规则,并用双盲法测试检测组以证实其准确性。结果 预备组中两类血清蛋白质在质荷比为8 320、8 604、8 867、15 872Da等4处含量有显著差异,得到树状分类规则,其分类准确率为97 4%(76/78),灵敏度为100%(10/10),特异性为97 1%(66/68);对检测组进行双盲检测,结果显示准确率为94 9%(74/78),灵敏度和特异性分别为100%(10/10)、94 1%(64/68)。结论 该方法可快速、准确检测Dukes A期结直肠癌,灵敏度、特异性高。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 肿瘤标记 生物学 蛋白质组学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)
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急性心肌梗死病程不同时期患者血清蛋白质组学分析 被引量:9
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作者 高春芳 郑国宝 +7 位作者 赵光 魏晓真 孟雪 王秀丽 李冬晖 许红兵 王全晖 宋国英 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期465-466,共2页
目的 探讨蛋白质质谱分析对急性心肌梗死病程不同时期的鉴别意义。方法 应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测153例心肌梗死患者血清标本(其中刚入院45例,3h标本12例,6h标本22例,9h标本24例,12h标本24例,24... 目的 探讨蛋白质质谱分析对急性心肌梗死病程不同时期的鉴别意义。方法 应用美国CipherGen公司金属亲和表面(IMAC3)芯片和蛋白芯片仪检测153例心肌梗死患者血清标本(其中刚入院45例,3h标本12例,6h标本22例,9h标本24例,12h标本24例,24h标本16例,48h标本10例)中的蛋白质相对含量。结果 不同时期急性心肌梗死患者在质荷比为4kD^12kD间有10种血清蛋白质含量有显著差异。不同时期的患者均被正确判断,准确率为100%(153/153),灵敏度和特异性分别为100%(45/45)和100%(108/108)。结论 该方法可快速、准确检测各期急性心肌梗死,灵敏度、特异性高。 展开更多
关键词 心肌梗死 蛋白质组学 表面增强激光解吸附离子化时间飞行质谱(SELDI-TOF-MS)
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食管贲门双源癌与单发食管癌和贲门癌基因组与蛋白质组对比 被引量:3
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作者 王立东 郭军辉 +15 位作者 宋昕 冯笑山 郭涛 申秋 袁翎 李学民 刘卫娜 李苹娟 常扶保 李吉林 焦新英 范宗民 尹艳春 杜娴娟 樊慧 王苒 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2009年第1期24-28,共5页
目的:对食管贲门双源癌和单发食管癌及单发贲门癌患者血清蛋白质组和癌组织基因变化差异进行分析,筛选食管癌、贲门癌关键候选蛋白和基因。方法:采用表面增强激光解析离子化-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)与比较基因组杂交(CGH)技术分析... 目的:对食管贲门双源癌和单发食管癌及单发贲门癌患者血清蛋白质组和癌组织基因变化差异进行分析,筛选食管癌、贲门癌关键候选蛋白和基因。方法:采用表面增强激光解析离子化-飞行时间-质谱(SELDI-TOF-MS)与比较基因组杂交(CGH)技术分析比较食管贲门双源癌(4例)和单发食管癌(107例)、单发贲门癌(86例)患者血清蛋白质组和癌组织全基因组。结果:根据SELDI-TOF-MS蛋白质组所筛选的候选蛋白与CGH所筛选的基因进行一致性对比分析发现:双源癌中食管癌血清蛋白质组和癌组织CGH变异基因位点相一致的蛋白有14种(52%,11/21);双源癌中贲门癌与单发贲门癌位点相一致的蛋白有2种(Beta-defensin 123,GARP);双源癌、单发贲门癌和单发食管癌3者相一致的蛋白有1种(sPLA2-ⅡA)。结论:所发现的基因变异位点与蛋白质组候选蛋白对比相一致的17种蛋白可能是食管和贲门癌变关键候选蛋白和基因。 展开更多
关键词 食管贲门双源癌 蛋白质组 比较基因组杂交 表面增强激光离子化-飞行时间-质谱
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SELDI技术对开放性脊柱裂胎鼠羊水蛋白质组学的初步分析 被引量:1
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作者 刘振江 袁正伟 赵群 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期26-30,33,共6页
目的利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对脊柱裂胎鼠模型的羊水进行初步的蛋白质组学分析。方法将25只雌性Wistar大鼠随机分为脊柱裂组(n=15)和对照组(n=10)。于妊娠第10日(E10)8时,脊柱裂组孕鼠经胃管注入全... 目的利用表面增强激光解析/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对脊柱裂胎鼠模型的羊水进行初步的蛋白质组学分析。方法将25只雌性Wistar大鼠随机分为脊柱裂组(n=15)和对照组(n=10)。于妊娠第10日(E10)8时,脊柱裂组孕鼠经胃管注入全反式维甲酸与矿物油的混合物(140 mg/kg);对照组孕鼠给予等量的橄榄油。于妊娠第17日(E17)取胎鼠,立体显微镜下抽取羊水(0.2 mL/只)并确定开放性脊柱裂胎鼠。选取60只脊柱裂胎鼠和55只对照组胎鼠的羊水离心取上清。采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据。采用Ciphergen protein chip 3.1.1软件对数据进行统计分析。SELDI数据结果采用分类与回归树分析建立诊断模型,用于区分脊柱裂组胎鼠与对照组胎鼠。结果脊柱裂胎鼠羊水中共检测到55个差异蛋白峰,有统计学意义的差异蛋白峰有9个。包括5种蛋白峰高表达,优化相对分子质量(m/z)分别为11 658,27 387,7 898,11 603,13 831 Da;4种蛋白峰低表达,m/z分别为5 124,14 702,5 403,13 626 Da。选取m/z 13 831 Da和m/z 17 798 Da用于建立决策分类树诊断模型,诊断灵敏度93.33%,特异度96.36%,阳性预测值96.55%,阴性预测值96.36%。结论 SELDI技术可初步筛选出脊柱裂胎鼠羊水中的差异蛋白峰,这些蛋白可能是脊柱裂胎鼠羊水中的特异性羊水标志物。 展开更多
关键词 神经管缺陷 脊柱裂 表面增强激光 离子化飞行时间质谱 羊水 蛋白标志物
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用参数Z表征疏水色谱中脲变α-糜蛋白酶及其折叠中间体的分子构象变化 被引量:1
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作者 耿信笃 刘振岭 +1 位作者 柯从玉 李建军 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期879-885,共7页
目的用参数Z表征疏水色谱中脲变α-糜蛋白酶(α-Chy)及其折叠中间体的分子构象变化。方法用疏水色谱法对不同脲变条件下的α-Chy进行分离,对收集的不同馏分用基质辅助激光解吸附离子化飞行时间质谱(HPHIE-MALDI-TOF-MS)进行检测,... 目的用参数Z表征疏水色谱中脲变α-糜蛋白酶(α-Chy)及其折叠中间体的分子构象变化。方法用疏水色谱法对不同脲变条件下的α-Chy进行分离,对收集的不同馏分用基质辅助激光解吸附离子化飞行时间质谱(HPHIE-MALDI-TOF-MS)进行检测,并用紫外和荧光光谱对其分子构象变化进行了验证。结果确认了脲变α-Chy中仅有一个稳定的折叠中间体存在,发现二者的z值均随脲浓度的增加而减小。在脲浓度范围为0~3.0mol·L^-1时,α-Chy折叠中间体的Z值远小于天然α-Chy的Z值,而脲浓度为4.0mol·L^-1和5.0mol·L^-1时,折叠中间体的Z值稍大于天然α-Chy的Z值。结论α-Chy折叠中间体的分子构象随脲浓度改变基本呈连续性变化。而天然α-Chy的分子构象随脲浓度呈不连续性变化。进一步发现α-Chy的Z值与其复性回收率之间存在着相似的变化规律。中间体的保留机理服从计量置换保留理论(SDT-R),且得到的参数Z可用来表征天然α-Chy和其折叠中间体的分子构象变化。 展开更多
关键词 蛋白折叠 分子构象 疏水相互作用色谱 基质辅助激光吸附离子化飞行时间质谱 (MALDI-TOF-MS) 计量置换 α-糜蛋白酶(α-Chy) 折叠中间体
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应用SELDI-TOF-MS技术筛选肾细胞癌患者血清标志物 被引量:2
12
作者 郝强 赵继懋 杜林栋 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2008年第8期596-599,共4页
背景与目的:表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有助于筛选肾细胞癌相关的分子变化。本研究探讨人肾细胞癌患者血清和正常人血清之间蛋白质表达的差异,筛选特异性生物标志物。方法:采用SELDI-TOF-MS技术,选用WCX2蛋... 背景与目的:表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有助于筛选肾细胞癌相关的分子变化。本研究探讨人肾细胞癌患者血清和正常人血清之间蛋白质表达的差异,筛选特异性生物标志物。方法:采用SELDI-TOF-MS技术,选用WCX2蛋白质芯片对28例肾透明细胞癌及28例正常对照组血清标本进行检测以筛选肾癌患者血清中差异表达蛋白质。结果:在分子量1.5×103~30×103(1.5~30kD)范围内,检测出170个差异蛋白峰。肾透明细胞癌差异表达明显的蛋白峰7个(P<0.01),其中低表达的3个,相对分子量分别为4.098×103、5.917×103、6.643×103,高表达的4个,相对分子质量为5.572×103、6.344×103、6.529×103、8.518×103。结论:人肾肿瘤血清中特异性蛋白质的发现,对肿瘤临床特异性生物标志物的检测及进一步研究肿瘤发生机制等具有重要意义。 展开更多
关键词 肾细胞癌 标志物 蛋白质芯片 表面增强激光离子化飞行时间质谱
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SELDI筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株耐药相关蛋白 被引量:1
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作者 杨晓丹 李巨 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期45-47,共3页
目的应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选人绒毛癌细胞株JAR及其与人绒毛癌耐氨甲喋呤细胞株JAR/MTX之间的蛋白质表达差异,寻找出绒癌耐药的相关蛋白。方法采用体外细胞培养来提取两种细胞的胞浆蛋白和分泌蛋白,应用SELDI-TOF-MS... 目的应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选人绒毛癌细胞株JAR及其与人绒毛癌耐氨甲喋呤细胞株JAR/MTX之间的蛋白质表达差异,寻找出绒癌耐药的相关蛋白。方法采用体外细胞培养来提取两种细胞的胞浆蛋白和分泌蛋白,应用SELDI-TOF-MS技术检测各细胞株提取的胞浆蛋白和分泌蛋白,采用CM-10型弱阳离子交换芯片检测。结果经SELDI技术检测发现质荷比(m/z)为8132.043,10738.36的胞浆蛋白在JAR/MTX细胞中呈高表达;质荷比(m/z)为11555.09的分泌蛋白及m/z为4896.68的胞浆蛋白在JAR细胞中高表达,在JAR/MTX中呈低表达。结论应用飞行时间质谱技术结合弱阳离子交换芯片,可有效筛选绒癌耐氨甲喋呤细胞株中的特异性表达蛋白;寻找到的差异蛋白与绒癌耐药密切相关,并可能成为本病耐药的标志物。 展开更多
关键词 滋养细胞肿瘤 JAR细胞株 JAR/MTX细胞株 蛋白芯片 差异蛋白 飞行时间质谱 表面增强激光离子化
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