表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术在白血病诊断中的应用 被引量：1

1

作者 黄华 陈林兴 +1 位作者 林美册 黄靖宇 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期1273-1277,共5页

本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Bi... 本研究对白血病患者及健康对照者的血清样本进行检测分析,筛选新的生物标记物并建立白血病的蛋白质指纹图谱诊断模型。应用SELDI-TOF-MS技术检测40例白血病标本及37例健康对照标本,用Biomarker Wizard软件分析筛选新的生物标记物,使用Biomarker Patterns 5.0软件进行标记物的比较判别,建立白血病决策树诊断模型。结果表明,蛋白质指纹图谱分析发现有22个差异显著的蛋白峰(P<0.05);由m/z为4650,8609及11660建立的决策树诊断模型对白血病的诊断灵敏度为97.5%(39/40),特异性为91.9%(34/37)。结论:由3个蛋白标记物构成的白血病蛋白质指纹图谱诊断模型为白血病的诊断提供了新的借鉴和参考。 展开更多

关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 白血病 蛋白质指纹图谱

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表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术及其在器官移植领域中的应用 被引量：1

2

作者 陈雅斌 赵猛 兰小鹏 《医学研究生学报》 CAS 2010年第5期547-550,共4页

表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传... 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术是较有效的蛋白质组学研究手段,虽然目前尚未应用于临床常规实验室诊断,但已广泛应用于肿瘤、传染病、心血管病和神经系统疾病的研究。近年来,SELDI-TOF-MS技术试用于器官移植领域,如急性移植排斥反应的早期诊断、移植相关疾病的诊断、疾病相关蛋白的鉴定,探讨疾病的发生机制,展现了该技术在器官移植中的广阔应用前景。 展开更多

关键词 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 诊断 器官移植

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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱联合磁珠技术寻找肺癌血清蛋白标志物 被引量：1

3

作者 谢静 朱乾坤 +5 位作者 朱莉思 肖刻 朱威 诸葛斯亮 朱朝晖 吴志宏 《协和医学杂志》 2016年第6期416-420,共5页

目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（surface-enhanced lase... 目的 建立肺癌蛋白质指纹图谱诊断模型,探讨用于肺癌早期诊断及手术疗效评估的血清蛋白标志物。方法 收集38例肺癌患者、12例肺部良性肿瘤患者及32名正常对照者的血清标本,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱（surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS）联合磁珠技术,获得蛋白质指纹图谱,采用BPS分析软件对数据分组及相关性进行分析,初步建立肺癌的血清蛋白质指纹图谱诊断模型,并验证其诊断效率;同时对比肺癌患者手术前后的差异蛋白质谱,结合肺癌的诊断模型,选取合适的蛋白作为肺癌手术疗效的观察指标。结果 在质荷比为1000-50 000范围内,肺癌患者、肺部良性肿瘤患者和正常对照者之间共检测到215个蛋白质峰。其中,质荷比为1115.37、1929.70、3217.57、3246.34、3318.57、11 508.90的6个蛋白质峰表达差异具有统计学意义（P〈0.05）。决策树模型对肺癌的原始判别敏感性为92.11%（35/38）,特异性为90.91%（40/44）;交叉验证敏感性为86.67%（13/15）,特异性为86.67%（13/15）。其中质荷比为1115.37、1929.70、3246.34和11 508.90的蛋白质峰在肺癌患者中明显升高（P〈0.05）,当肺癌患者手术治疗后表达量较术前明显降低（P〈0.01）,表明这4个蛋白质峰对肺癌的诊断及疗效判定具有潜在应用价值。结论 应用SELDI-TOF-MS技术建立的肺癌血清蛋白质指纹图谱诊断模型具有较高的敏感性和特异性,为发现肺癌早期生物标志物并判断疗效奠定基础。 展开更多

关键词 肺癌 肿瘤标志物 诊断 蛋白质组学 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱

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表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱在甲状腺癌诊断及临床分期中的应用 被引量：1

4

作者 张静 卢秀波 +2 位作者 刘洋 徐桂安 李振宇 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2008年第1期123-125,共3页

目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标... 目的:用表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析正常人和甲状腺癌患者血清蛋白指纹图谱的变化,建立能鉴别正常人和甲状腺癌及Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型。方法:应用SELDI-TOF-MS技术检测72例血清标本的蛋白质质谱,其中甲状腺癌40例(Ⅰ-Ⅱ期26例,Ⅲ-Ⅳ期14例),正常人32例。应用支持向量机和判别分析的方法分析质谱数据,建立甲状腺癌诊断模型并留一法交叉验证。结果:区分甲状腺癌和正常人的诊断模型交叉检验敏感性为100%,特异性为86%,总的符合率为93%;区分Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌和Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌患者的诊断模型对Ⅰ-Ⅱ期甲状腺癌检出的敏感性为77%,特异性为86%,对Ⅲ-Ⅳ期甲状腺癌检出的敏感性为86%,特异性为77%,总的符合率为80%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术平台和生物信息技术建立的诊断模型为甲状腺癌的早期诊断及临床分期提供了新的手段。 展开更多

关键词 甲状腺癌 表面增强激光解吸电离-飞行时间质谱 蛋白芯片 肿瘤标志物

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应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱筛选大肠癌血清特异标志物

5

作者 马明 宋鉴清 欧阳金鸣 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期209-211,共3页

目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大... 目的采用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测大肠癌患者与健康对照者血清中蛋白的差异,为大肠癌的早期诊断提供理论依据。方法应用SELDI-TOF-MS技术及弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)检测36例健康成人(对照组)和36例大肠癌患者(大肠组)血清中蛋白含量。结果在质荷比为2000Da～30000Da的范围内,两组样本检测到了对照组82个蛋白峰。其中3604.240Da蛋白峰大肠癌组明显高于对照组(P<0.05),而12861.368Da的蛋白峰对照组明显高于大肠癌组(P<0.05)。利用这两个蛋白筛查大肠癌的特异度为86.11%(31/36),敏感度为77.78%(28/36),阳性预测值为87.5%。结论质荷比为3604.240Da与12861.368Da的两个蛋白峰可以作为大肠癌早期诊断的备选标志物。 展开更多

关键词 大肠癌 表面增强激光解吸电离 飞行时间 质谱技术 弱阳离子蛋白质芯片 标志物

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表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术筛选蕈样肉芽肿血清生物标志物

6

作者 刘洁 郑燕华 +1 位作者 张建中 王宝玺 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期13-16,共4页

目的应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选蕈样肉芽肿患者血清中的生物标志物。方法采用CM10蛋白质芯片捕获14例蕈样肉芽肿患者(研究组)和17例对照者(对照组)血清中的蛋白质,结合Biomarker Wizard软件进行分... 目的应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)筛选蕈样肉芽肿患者血清中的生物标志物。方法采用CM10蛋白质芯片捕获14例蕈样肉芽肿患者(研究组)和17例对照者(对照组)血清中的蛋白质,结合Biomarker Wizard软件进行分析。结果所有标本在相对分子质量0~50 000范围内均能检测出131个左右的蛋白峰。两组血清样本的蛋白质指纹图谱存在14个差异表达蛋白质峰,其中相对分子质量为7 670的蛋白质峰与C-C基序趋化因子22相符。结论SELDI-TOF-MS可用于蕈样肉芽肿患者血清生物标志物的筛选。 展开更多

关键词 表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱 蕈样肉芽肿 血清 生物标志物

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表面增强激光解析电离飞行时间质谱的质量控制 被引量：1

7

作者 陈蓉艳 兰小鹏 《医学研究生学报》 CAS 2009年第7期770-773,共4页

表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF MS)是快速、高通量的蛋白质组学分析技术;应用于临床的关键是必须具有可重复性,使其结果具有可信度。文中综述SELDI-TOF MS质量控制的相关问题。

关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 质量控制 蛋白质组学

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基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱检测支气管肺泡灌洗液对非结核分枝杆菌肺病的诊断价值 被引量：3

8

作者 张新宝 张妍蓓 +2 位作者 姚超 王华 刘盛盛 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期729-733,共5页

目的 探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测支气管肺泡灌洗液(BALF)对非结核分枝杆菌(NTM)肺病的诊断价值。方法 收集2020年1月—2021年12月安徽省胸科医院收治的112例疑似NTM肺病患者。对患者BALF行MALDI-TOF MS检... 目的 探讨基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)检测支气管肺泡灌洗液(BALF)对非结核分枝杆菌(NTM)肺病的诊断价值。方法 收集2020年1月—2021年12月安徽省胸科医院收治的112例疑似NTM肺病患者。对患者BALF行MALDI-TOF MS检测、PCR荧光探针检测、BACTEC MGIT 960分枝杆菌全自动快速液体培养(BD960法)检测,并对三种检测技术诊断效能进行比较。结果 依据NTM的诊断标准,112例患者最终诊断为NTM肺病78例,MALDI-TOF MS、PCR荧光探针法、BD960法检测NTM的灵敏度分别为:85.9%(67/78)、56.4%(44/78)、28.2%(22/78),MALDI-TOF MS分别与PCR荧光探针、BD960比较,χ^(2)分别为:16.52、52.98,P均<0.05,差异有统计学意义。三种检测技术阳性预计值分别为:98.5%、93.6%、100%,阴性预计值为:75.0%、47.7%、37.8%。MALDI-TOF MS检测诊断NTM肺病时间明显短于液体培养法,差异有统计学意义(Z=8.168,P<0.001)。结论 MALDI-TOF MS检测技术对NTM肺病的诊断具有较高的临床应用价值。 展开更多

关键词 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 非结核分枝杆菌 支气管肺泡灌洗液 诊断技术

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应用激光捕获显微切割和蛋白质组学技术筛选鼻咽癌的差异表达蛋白质 被引量：5

9

作者 易红 程爱兰 +7 位作者 黄卫国 张鹏飞 李茂玉 彭芳 李峰 李萃 陈主初 肖志强 《中南大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期375-383,共9页

目的:筛选鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)的差异表达蛋白质,为寻找NPC的分子标志物提供科学依据。方法:采用激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)分别从NPC组织和正常鼻咽上皮组织(normal nasopharyngeal ep... 目的:筛选鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)的差异表达蛋白质,为寻找NPC的分子标志物提供科学依据。方法:采用激光捕获显微切割技术(laser capture microdissection,LCM)分别从NPC组织和正常鼻咽上皮组织(normal nasopharyngeal epithelial tissue,NNET)中纯化NPC细胞和正常鼻咽上皮细胞(normal nasopharyngeal epithelial cells,NNEC),应用二维凝胶电泳(2-DE)分离LCM纯化细胞的蛋白质,图像分析识别差异表达的蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾电离串联质谱(ESI-Q-TOF-MS)鉴定差异蛋白质点,Western印迹和组织芯片(tissue microarray,TMA)免疫组织化学验证差异蛋白鳞状细胞癌抗原1(SCCA1)在两种组织中的表达水平。结果:建立了LCM纯化的NPC细胞和NNEC的2-DE图谱,质谱鉴定了36个差异蛋白质,其中20个蛋白只在NPC表达或表达上调,16个蛋白在NPC中表达下调或缺失。Western印迹和组织芯片免疫组织化学结果显示:SCCA1在NPC中的表达水平较NNET明显下调,与比较蛋白质组学结果一致。结论:36个差异蛋白可能与NPC的发病有关,为筛选NPC分子标志物奠定了基础。 展开更多

关键词 鼻咽癌 激光捕获显微切割技术 蛋白质组学 二维凝胶电泳 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 电喷雾电离串联质谱 免疫印迹 组织芯片

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SELDI-TOF-MS技术筛查预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物 被引量：3

10

作者 郑弘宇 陈慧菁 +3 位作者 吴凡 黄伟炜 陈强 叶韵斌 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期368-373,共6页

目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌... 目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的标志蛋白。方法:选择福建省肿瘤医院2008年1月至2009年10月曲妥珠单抗治疗的乳腺癌患者35例,以临床界定标准将患者分为耐药组(11例)和非耐药组(24例)。应用SELDI-TOF-MS技术检测两组患者外周血蛋白质表达谱的差异,以差异蛋白峰值比1.5为耐药的蛋白界定标准,以此标准判定患者耐药与否。分析该蛋白界定标准评判曲妥珠单抗耐药的灵敏度、特异度以及阳性预测值、阴性预测值。结果:以临床界定标准评判的曲妥珠单抗耐药的发生与患者年龄、分期、腋窝淋巴结转移和ER/PR双阴无关。临床耐药组和非耐药组患者外周血蛋白质表达谱比较显示,耐药患者的蛋白质峰7971Da、9284Da显著降低(P<0.05)。以蛋白界定标准评判患者曲妥单抗耐药与非耐药,7971Da评判时的灵敏度为81.82%(9/11)、特异度为83.33%(20/24)、阳性预测值为69.23%(9/13)、阴性预测值为90.91%(20/22);以9284Da评判时的灵敏度为72.73%(8/11)、特异度为79.17%(19/24)、阳性预测值为61.54%(8/13)、阴性预测值为86.36%(19/22)。结论:应用SELDI-TOF-MS技术检测的差异蛋白质峰7971Da、9284Da似可作为预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物。 展开更多

关键词 表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术 乳腺肿瘤 曲妥珠单抗 耐药 生物标志物

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SELDI-TOF-MS技术在口腔黏膜癌前病变和口腔鳞癌的唾液诊断模型中的应用 被引量：4

11

作者 平飞云 孙钢 何虹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期203-208,共6页

目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志... 目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志愿者的唾液蛋白质指纹图谱进行比较,并采用整合性生物信息学方法建立诊断模型。结果:得到唾液诊断模型Ⅰ,为原发性口腔鳞癌患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5797、2902、3883和4951的4个蛋白质峰。其中5797、2902和3883在原发性口腔鳞癌患者唾液中低表达。4951在原发性口腔鳞癌患者唾液中高表达。敏感性为93.33%,特异性为88.24%,总准确率为90.63%。唾液诊断模型Ⅱ,为OSCC区域性转移患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5446、4934、4968、3296、4800和2901的6个蛋白质峰。其中5446、4934和3296在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中高表达。4968、4800和2901在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中低表达,敏感性为100.00%,特异性为85.71%,总准确率为95.45%。唾液诊断模型Ⅲ,为白斑患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为9515、2230、2238、5694和2646的5个蛋白质峰。其中9515和5694在白斑患者唾液中高表达。2230、2238和2646在白斑患者唾液中低表达,敏感性为93.33%,特异性为85.71%,总准确率为86.96%。结论:结合SELDI-TOF-MS和生物信息学方法,唾液对肿瘤的诊断意义将进一步发挥其价值。本研究根据口腔粘膜上皮癌前病变、癌变、转移的唾液蛋白质组的变化,初步建立了3个早期诊断模型。 展开更多

关键词 口腔肿瘤 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 唾液 蛋白质组

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SELDI-TOF-MS技术检测心绞痛患者血浆蛋白指纹图谱的研究 被引量：2

12

作者 何文娟 胡豫 +4 位作者 张小平 余捷凯 洪梅 郭涛 宋善俊 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期389-391,共3页

目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样... 目的:采用表面增强激光解析/电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测心绞痛患者血浆蛋白质指纹图谱,从中筛选出特异的分子标志物。方法:应用SELDI-TOF-MS技术及金属离子螯合(IMAC-3)蛋白质芯片对20例心绞痛患者和29例正常对照者血浆样本进行检测,借助生物信息学工具(非线性的支持向量机,SVM)提出心绞痛的诊断模型,并运用留一交叉验证法来评估该模型的判别效能。结果:用SELDI-TOF-MS技术筛选出由3个有显著差异的蛋白质峰[质荷比(m/z)分别为2667.3、5914.0和6890.5]组合构建的诊断模型,可将20例心绞痛患者和29例正常人全部正确分组,诊断特异性和灵敏度均为100%。结论:SELDI-TOF-MS技术在心绞痛的诊断中具有较高灵敏度和特异性,发现的蛋白质峰可能在心绞痛的发病中起一定作用,血浆中分子标志物的发现有助于心绞痛的早期诊断。 展开更多

关键词 心绞痛 表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱 蛋白质组

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不同结核病患者群血清蛋白质谱分析与比较 被引量：2

13

作者 黄业伦 刘玉美 +5 位作者 谭守勇 刘健雄 李昕洁 罗强生 曹翌明 刘志辉 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2012年第23期4001-4003,共3页

目的:比较分析菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者的血清蛋白质谱,从蛋白质组学层面了解不同结核病患者群血清蛋白质谱的特征,为结核病诊断标志物的筛选提供指导。方法:应用表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS... 目的:比较分析菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者的血清蛋白质谱,从蛋白质组学层面了解不同结核病患者群血清蛋白质谱的特征,为结核病诊断标志物的筛选提供指导。方法:应用表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片系统,采用弱阳离子交换蛋白质芯片(WCX)对54例菌阳肺结核、45例菌阴肺结核、18例肺外结核患者的血清蛋白质进行检测;应用ClinProTools分析软件依据各蛋白质的质谱峰面积计算相对强度表示该血清蛋白质的丰度,采用t检验(对Anderson-Darling检验P>0.05的正态分布者)或Wilcoxon检验(对Anderson-Darling检验P<0.05的非正态分布者)分析比较菌阳肺结核与菌阴肺结核、肺结核与肺外结核患者各血清蛋白质的平均丰度。结果:(1)在3种不同结核病患者人群中均捕获到102种相对分子质量在1011.41～9435.07的不同血清蛋白质,经Anderson-Darling检验,在菌阳肺结核、菌阴肺结核、肺外结核患者人群中分别有31、23和29种血清蛋白质呈正态分布。(2)正态分布的血清蛋白质在不同结核病患者人群间其水平未见显著差异。(3)非正态分布的血清蛋白质:在菌阳肺结核与菌阴肺结核患者人群间其水平未见显著差异;在肺结核与肺外结核患者人群间发现1个差异血清蛋白质(P=0.0251),其相对分子质量为5753.76,在肺结核与肺外结核患者人群血清中的平均丰度分别为15.42±4.86和28.29±14.08。结论:不同结核病患者群的血清蛋白质谱具有同质性,为普遍适用性结核病血清学诊断标志物的筛选提供了科学依据。 展开更多

关键词 结核 血清蛋白质 表面增强激光解吸-电离飞行时间质谱 弱阳离子交换蛋白质芯片

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基于ACO-SVM的质谱数据分析 被引量：3

14

作者 张蓉 冯斌 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期158-160,共3页

生物信息学应用领域存在高维小样本和内部空间疏散的特性,因而数据分析面临着巨大的挑战。基于此,在蚁群算法的搜索过程中将特征的信噪比作为先验信息,结合支撑向量用于筛选血清蛋白相关生物标记物,实验结果表明,该方法建立的癌症诊断... 生物信息学应用领域存在高维小样本和内部空间疏散的特性,因而数据分析面临着巨大的挑战。基于此,在蚁群算法的搜索过程中将特征的信噪比作为先验信息,结合支撑向量用于筛选血清蛋白相关生物标记物,实验结果表明,该方法建立的癌症诊断模型取得了较好的分类性能测试仿真结果,敏感度和特异度分别达到94%和92.4%。 展开更多

关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 蛋白质组学 蚁群优化算法 特征选择技术 生物标记物

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MALDI-TOF-MS测定溶菌酶的相对分子质量中在线纯化技术的应用 被引量：1

15

作者 孙淑清 杜萍 +2 位作者 陈代梅 季怡萍 刘淑莹 《分析测试学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期87-88,91,共3页

用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF -MS)测定溶菌酶的相对分子质量 ,采用硝酸纤维素膜作为溶菌酶的固相载体 ,在质谱仪上进行在线纯化溶菌酶样品 ,在测试前尽可能除去样品中的添加剂 ,以消除一些盐和蛋白质变性剂抑制样品... 用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF -MS)测定溶菌酶的相对分子质量 ,采用硝酸纤维素膜作为溶菌酶的固相载体 ,在质谱仪上进行在线纯化溶菌酶样品 ,在测试前尽可能除去样品中的添加剂 ,以消除一些盐和蛋白质变性剂抑制样品峰的情形 ;此法简单、快速 ,并可明显增强离子峰的强度 ,提高测试的灵敏度。 展开更多

关键词 溶菌酶 相对分子质量 在线纯化技术 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 硝酸纤维素膜

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应用SELDI-TOF-MS技术结合WCX纳米磁珠筛选原发性胆囊癌患者血清蛋白指纹图谱的变化 被引量：1

16

作者 邢人伟 牟永华 刘池波 《中华中医药学刊》 CAS 2012年第11期2486-2488,共3页

目的:应用蛋白质组学技术分析筛选胆囊癌患者外周血清中生物标记蛋白,初步探讨其对胆囊癌早期诊断的意义。方法:应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对45例胆囊癌患者及50例对照者(健康体检者)外周血清蛋白质进行... 目的:应用蛋白质组学技术分析筛选胆囊癌患者外周血清中生物标记蛋白,初步探讨其对胆囊癌早期诊断的意义。方法:应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对45例胆囊癌患者及50例对照者(健康体检者)外周血清蛋白质进行检测,应用蛋白质芯片软件对蛋白质谱进行分析,建立诊断模型,并进行模型验证。结果:胆囊癌患者外周血清蛋白质表达谱与对照组相比,(5913Da,6181Da,13752Da)3个蛋白质荷比峰(M/Z)具有显著性差异,结果表明,该方法的灵敏度为86.7%,特异性为93.3%,这3个蛋白质峰数据建立蛋白质谱模型,用样本进行盲法测试。其敏感性为80%,特异性为90%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可有效筛选胆囊癌患者血清中特异性蛋白标记物,为胆囊癌患者的诊断提供了一条可靠的高灵敏度及特异性的方法。 展开更多

关键词 表面加强激光解吸电离飞行时间质谱技术 胆囊癌 生物标记 蛋白

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基于人工神经网络的血浆蛋白质谱在卵巢癌诊断中的应用性研究 被引量：2

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作者 王伟 储洪娟 陶国仙 《中华中医药学刊》 CAS 2010年第12期2595-2597,共3页

目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结... 目的:建立应用蛋白质芯片技术检测血浆蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌诊断中的应用价值。方法:应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱仪测定卵巢癌和健康人血浆标本的蛋白质指纹图谱,并结合人工神经网络进行数据分析。将160例标本随机分成训练组120例(卵巢癌40例,健康人80例)和盲法测试组40例(卵巢癌20例,健康人20例)。利用从训练组得出的基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型,对40例未知血浆标本进行检测,并与CA125检测结果进行比较。结果:应用该方法对卵巢癌进行诊断的敏感性和特异性分别为95%(19/20),100%(20/20),明显高于CA125检测结果。结论:基于人工神经网络的血浆蛋白质指纹图谱模型在卵巢癌的诊断中较传统方法具有更高的敏感性和特异性,值得进一步研究与应用。 展开更多

关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 卵巢癌

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基于QPSO-SVM算法的SELDI-TOF质谱数据分析 被引量：1

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作者 张蓉 冯斌 孙俊 《计算机应用与软件》 CSCD 2011年第1期57-60,共4页

生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(... 生物信息学领域的微阵列分析、质谱数据分析等大规模机器学习问题的不断涌现,对已有的特征选择算法提出了严峻的挑战,迫切需要研究适应于高维小样本特征的、准确性和运行效率等综合性能较好的、新的特征选择算法。将基于量子粒子群算法(QPSO)与SVM结合,并将建立的诊断模型用于生物标记物的选择。实验结果表明,新的基于量子粒子群算法建立的模型不仅具有良好的预测精度,而且在速度上有大幅的提高。 展开更多

关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 粒子群优化算法(PSO) 量子粒子群算法(QPSO) 特征选择技术 生物标记物

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SELDI-TOF-MS技术在贲门癌诊断中的初步研究 被引量：1

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作者 靳小可 杨瑞红 +2 位作者 郭素堂 张旭东 胡春松 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2012年第9期1103-1107,共5页

目的寻找贲门癌肿瘤标记物并建立诊断模型。筛选提示发生淋巴转移的差异蛋白,为临床早期诊断贲门癌及判断预后提供新方法。方法 CM10蛋白芯片结合表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测101例贲门癌患者及118例正常对照者... 目的寻找贲门癌肿瘤标记物并建立诊断模型。筛选提示发生淋巴转移的差异蛋白,为临床早期诊断贲门癌及判断预后提供新方法。方法 CM10蛋白芯片结合表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测101例贲门癌患者及118例正常对照者血清蛋白,Biomarker Wizard软件和Biomarker Patterns System(BPS)分析得差异蛋白并建立贲门癌诊断分类树,双盲法验证其准确性。进一步分析对比有、无淋巴转移的贲门癌患者血清蛋白指纹图谱,得到差异蛋白。结果对照分析贲门癌患者和正常对照组的血清蛋白指纹图谱得56个差异蛋白(P<0.05),经BPS软件筛选,以质荷比为5 480.49(P<10-8)的蛋白为主根结点建立贲门癌诊断模型,其灵敏度为95.05%,特异度为95.76%。得到可提示淋巴转移的差异蛋白3 820.87(P<0.05),其灵敏度为84.4%,特异度为82.1%。结论 SELDI-TOF-MS技术可建立有较高灵敏度和特异度的贲门癌诊断模型,筛选出能够提示发生淋巴转移的差异蛋白,有助于贲门癌的早期筛查、诊断和预后判断。 展开更多

关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术 血清蛋 白指纹图谱 贲门癌 诊断模型

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应用SELDI-TOF-MS技术筛选肾细胞癌患者血清标志物 被引量：2

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作者 郝强 赵继懋 杜林栋 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2008年第8期596-599,共4页

背景与目的:表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有助于筛选肾细胞癌相关的分子变化。本研究探讨人肾细胞癌患者血清和正常人血清之间蛋白质表达的差异,筛选特异性生物标志物。方法:采用SELDI-TOF-MS技术,选用WCX2蛋... 背景与目的:表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术有助于筛选肾细胞癌相关的分子变化。本研究探讨人肾细胞癌患者血清和正常人血清之间蛋白质表达的差异,筛选特异性生物标志物。方法:采用SELDI-TOF-MS技术,选用WCX2蛋白质芯片对28例肾透明细胞癌及28例正常对照组血清标本进行检测以筛选肾癌患者血清中差异表达蛋白质。结果:在分子量1.5×103～30×103(1.5～30kD)范围内,检测出170个差异蛋白峰。肾透明细胞癌差异表达明显的蛋白峰7个(P<0.01),其中低表达的3个,相对分子量分别为4.098×103、5.917×103、6.643×103,高表达的4个,相对分子质量为5.572×103、6.344×103、6.529×103、8.518×103。结论:人肾肿瘤血清中特异性蛋白质的发现,对肿瘤临床特异性生物标志物的检测及进一步研究肿瘤发生机制等具有重要意义。 展开更多

关键词 肾细胞癌 标志物 蛋白质芯片 表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱

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