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蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体
被引量：
2
1
作者
吴怡颖
张炜
孔德志
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期3151-3162,共12页
可变剪接使同一个基因产生多种不同的转录本和蛋白质,增加蛋白质多样性和功能复杂性。转录组学和蛋白质组学是鉴定可变剪接的两种主要途径,分别通过分析RNA测序数据和蛋白质测序数据来鉴定可变剪接事件和相应蛋白质产物。尽管RNA水平的...
可变剪接使同一个基因产生多种不同的转录本和蛋白质,增加蛋白质多样性和功能复杂性。转录组学和蛋白质组学是鉴定可变剪接的两种主要途径,分别通过分析RNA测序数据和蛋白质测序数据来鉴定可变剪接事件和相应蛋白质产物。尽管RNA水平的可变剪接研究已经取得了一定的进展,但是对于剪接蛋白亚型的检测和区分仍然不足。本文综述了近年来对可变剪接及其生物功能,可变剪接在不同水平检测的研究进展,详细介绍利用“自下而上”的蛋白质组学数据鉴定可变剪接蛋白质变体的两种主要方法,序列数据库构建和蛋白质鉴定算法开发。鉴定不同的可变剪接蛋白质有利于认识更全面的蛋白质功能,对发现相关生物标志物和关键药物靶点具有重要意义。
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关键词
可变剪接
质谱数据分析
蛋白质鉴定算法
蛋白质
序列数据库
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职称材料
题名
蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体
被引量：
2
1
作者
吴怡颖
张炜
孔德志
机构
河北医科大学中西医结合研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第12期3151-3162,共12页
基金
国家自然科学基金(82174004)
河北省自然科学基金(H2022206211,H2022206387)资助项目。
文摘
可变剪接使同一个基因产生多种不同的转录本和蛋白质,增加蛋白质多样性和功能复杂性。转录组学和蛋白质组学是鉴定可变剪接的两种主要途径,分别通过分析RNA测序数据和蛋白质测序数据来鉴定可变剪接事件和相应蛋白质产物。尽管RNA水平的可变剪接研究已经取得了一定的进展,但是对于剪接蛋白亚型的检测和区分仍然不足。本文综述了近年来对可变剪接及其生物功能,可变剪接在不同水平检测的研究进展,详细介绍利用“自下而上”的蛋白质组学数据鉴定可变剪接蛋白质变体的两种主要方法,序列数据库构建和蛋白质鉴定算法开发。鉴定不同的可变剪接蛋白质有利于认识更全面的蛋白质功能,对发现相关生物标志物和关键药物靶点具有重要意义。
关键词
可变剪接
质谱数据分析
蛋白质鉴定算法
蛋白质
序列数据库
Keywords
alternative splicing
mass spectrometry data analysis
protein identification algorithm
protein sequence database
分类号
Q51 [生物学—生物化学]
R917 [医药卫生—药物分析学]
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作者
出处
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被引量
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1
蛋白质组学数据揭示可变剪接蛋白质变体
吴怡颖
张炜
孔德志
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
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